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基于检验数据和机器学习构建并验证术前肝细胞癌微血管浸润的预测模型

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中华检验医学杂志 2025年第1期48卷 65-75页

作者：于洲林丽金陈雅芝林天生欧启水黄金兰福建医科大学附属第一医院检验科、福建省检验医学重点实验室、福建医科大学基因诊断研究中心、福建省临床免疫学检验临床医学研究中心福州350005 福建医科大学第一临床医学院福州350005 福建医科大学附属第一医院滨海院区国家区域医疗中心检验科福州350212 福建医科大学省立临床医学院、福建省立医院、福州大学附属省立医院肝胆外科福州350001

目的利用机器学习方法,基于检验指标建立并验证术前肝细胞癌(HCC)微血管浸润(MVI)的预测模型。方法纳入2019年1月至2023年12月在福建医科大学附属第一医院经术后病理确诊为HCC的患者629例,将2019年1月至2022年12月患者纳入至训练集(n=46... 详细信息

目的利用机器学习方法,基于检验指标建立并验证术前肝细胞癌(HCC)微血管浸润(MVI)的预测模型。方法纳入2019年1月至2023年12月在福建医科大学附属第一医院经术后病理确诊为HCC的患者629例,将2019年1月至2022年12月患者纳入至训练集(n=464),将2023年1—12月患者纳入内部验证集(n=165)。2023年1—12月在福建省立医院经术后病理确诊为HCC的患者190例作为外部验证集。收集所有患者年龄、性别、肿瘤大小及术前检验指标,根据术后病理是否存在MVI分为MVI阳性组和MVI阴性组。在训练集中利用Boruta算法和LASSO回归筛选出2组间与结局变量相关的指标,随后应用多因素逻辑回归、决策树(DT)、随机森林(RF)、极度梯度提升(XGboost)、K近邻(KNN)、支持向量机(SVM)、轻量梯度提升(LGBM)和朴素贝叶斯(Naive Bayes)等8种机器学习算法构建模型,在训练集和内部验证集中通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线,筛选出曲线下面积(AUC)最佳的模型,并在外部验证集中进一步验证预测效能。通过校准曲线和临床决策曲线分别评估模型预测值与真实值的符合程度及模型的临床受益程度。结果经过筛选最终纳入肿瘤大小、甲胎蛋白、异常凝血酶原、嗜酸性粒细胞数、中性粒细胞数、肌酐、载脂蛋白A1、总胆红素共8个指标用于构建HCC术前MVI预测模型。在应用8种机器学习方法在训练集中构建模型时,XGboost算法构建的模型预测MVI的AUC为0.820,内部验证集中AUC为0.803,外部验证集中为0.758。此外,XGboost模型预测乙型肝炎表面抗原阳性HCC患者术前MVI的AUC为0.817,预测男性、高龄患者术前MVI的AUC分别为0.779和0.790。校准曲线可见预概率值曲线与实际发生概率曲线较为接近,临床决策曲线说明其在0.3~0.8的阈值概率范围内应用,可获得净收益。结论基于XGboost方法联合8个检验指标构建了HCC患者术前MVI预测模型,具有较好的预测效能。

关键词：肝肿瘤肝细胞癌微血管浸润预测模型极度梯度提升机器学习

基于高通量测序分析甲状腺癌基因变异和临床病理特征相关性的单中心回顾性队列研究

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临床与实验病理学杂志 2025年第1期41卷 74-80页

作者：陈灵锋林洁俞训彬吴义娟福州大学附属省立医院/福建省立医院病理科福州350001 福建医科大学省立临床医学院福州350001

目的分析甲状腺癌患者基因变异与临床病理特征的相关性。方法结合高通量测序检测甲状腺肿瘤基因变异的结果与临床病理特征进行相关性分析。结果 238例甲状腺癌中93.7%存在Ⅰ类或Ⅱ类变异。与癌症基因组图谱(TCGA)相比,本中心队列甲状... 详细信息

目的分析甲状腺癌患者基因变异与临床病理特征的相关性。方法结合高通量测序检测甲状腺肿瘤基因变异的结果与临床病理特征进行相关性分析。结果 238例甲状腺癌中93.7%存在Ⅰ类或Ⅱ类变异。与癌症基因组图谱(TCGA)相比,本中心队列甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer, PTC)患者的平均年龄较小(44.4±12.4岁vs 46.8±15.5岁,P=0.043),淋巴结转移率较高(57.5%vs 49.2%;P=0.046),BRAF突变的发生率较高(82.4%vs 59.7%,P临床病理特征。

关键词：甲状腺肿瘤甲状腺乳头状癌基因变异高通量测序临床病理特征

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过表达Trim72减轻急性病毒性心肌炎小鼠的心肌炎症及细胞凋亡

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中华急诊医学杂志 2025年第2期34卷 193-199页

作者：王均祎徐尚华薛贻敏柯俊章九云谢辉李珊周晓芬福建医科大学附属南平第一医院重症医学科南平353000 福建医科大学附属南平第一医院心血管内科南平353000 福建医科大学省立临床医学院重症医学四科福建省立医院福州大学附属省立医院福建省急诊医学重点实验室福州350001 福建医科大学省立临床医学院急诊科福建省立医院福州大学附属省立医院福建省急诊医学重点实验室福州350001

目的探讨三基序蛋白72(Trim72)在小鼠急性病毒性心肌炎(AVMC)中的作用及可能的机制。方法通过腹腔注射柯萨奇B3病毒(CVB3,2.0×105 PFU/只)法建立AVMC小鼠模型。40只小鼠按照随机数字表法分为阴性对照+磷酸缓冲盐溶液组(NC+PBS组)、过表... 详细信息

目的探讨三基序蛋白72(Trim72)在小鼠急性病毒性心肌炎(AVMC)中的作用及可能的机制。方法通过腹腔注射柯萨奇B3病毒(CVB3,2.0×105 PFU/只)法建立AVMC小鼠模型。40只小鼠按照随机数字表法分为阴性对照+磷酸缓冲盐溶液组(NC+PBS组)、过表达Trim72+PBS组(Trim72+PBS组)、NC+CVB3组和Trim72+CVB3组,每组10只。造模前14 d,各组小鼠分别经尾静脉注射阴性对照或过表达Trim72的9型腺相关病毒载体(5.0×1011 VG/只),后PBS组和CVB3组再分别经腹腔注射PBS或CVB3,7 d后处死存活小鼠并收集心脏和血清。HE染色观察心肌病理改变,TUNEL染色检查心肌细胞凋亡;RT-qPCR检测各组心肌组织Trim72和促炎细胞因子TNF-α、IL-6和IL-1β的mRNA表达;ELISA检测血清中cTnI、TNF-α、IL-6和IL-1β的蛋白水平;Western blot检测心肌组织Trim72、凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2、Cleaved caspase-3、Caspase-3及TLR4、p-p65、p65的蛋白表达。结果与NC+PBS组相比,NC+CVB3组小鼠心肌组织中Trim72的蛋白及mRNA表达水平显著下调(P0.05)。结论Trim72过表达通过抑制心肌炎症损伤和凋亡失衡减轻小鼠AVMC,其机制可能与负调控TLR4/NF-κB信号通路有关。

关键词： Trim72 柯萨奇B3病毒急性病毒性心肌炎炎症凋亡 TLR4/NF-κB

用户画像在老年慢性病患者健康管理中应用的范围综述

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中华护理杂志 2025年第2期60卷 244-250页

作者：施艳鸿颜缘娇林榕黄晨杉李红福建医科大学护理学院福州市350004 福建省立医院护理部

目的对用户画像在老年慢性病患者健康管理中应用的相关研究进行范围综述,为老年慢性病患者的健康管理提供参考。方法按照范围综述方法学,系统检索万方数据库、中国知网、维普数据库、中国生物医学文献服务系统、PubMed、Embase、Web of ... 详细信息

目的对用户画像在老年慢性病患者健康管理中应用的相关研究进行范围综述,为老年慢性病患者的健康管理提供参考。方法按照范围综述方法学,系统检索万方数据库、中国知网、维普数据库、中国生物医学文献服务系统、PubMed、Embase、Web of Science、CINAHL、Cochrane Library共9个数据库,检索时限为建库至2024年1月,根据纳入和排除标准筛选文献,由2名研究者独立提取并归纳文献中的信息。结果共纳入10篇文献。构建用户画像的过程主要包括数据采集、用户特征提取及画像生成与可视化。用户画像在老年慢性病健康管理中应用范围较为广泛,常用于糖尿病、心力衰竭等老年慢性病患者的健康管理,包括制订个性化干预计划、提供个性化健康教育和信息、调整健康管理策略等内容。在老年慢性病患者中应用用户画像,可提升健康信息传递和健康服务的精准度、优化用户使用体验、提高老年慢性病患者自我管理能力和生活质量,优化医疗服务的可及性。结论用户画像作为一种新兴的健康信息整合手段,可以分析多维度的健康数据,为老年慢性病患者提供个性化、精准的健康管理,改善健康管理效果,降低医疗成本,提高其满意度和参与度,在老年慢性病患者健康管理中具有较好的应用前景。

关键词：用户画像慢性病老年人范围综述健康管理护理

基于微流控芯片式数字PCR乙型肝炎病毒RNA检测方法的构建与评价

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中华检验医学杂志 2025年第1期48卷 103-109页

作者：黄群芳谢如冰兰艳平荀振刘灿欧启水福建医科大学附属第一医院检验科、福建省检验医学重点实验室、福建医科大学基因诊断研究中心、福建省临床免疫学检验临床医学研究中心福州350005 福建医科大学第一临床医学院福州350005 福建医科大学附属第一医院滨海院区国家区域医疗中心检验科福州350212

目的建立基于微流控芯片式数字PCR(cdPCR)的乙型肝炎病毒(HBV)RNA检测方法,并评估其在慢性HBV感染者中的应用。方法选取福建医科大学附属第一医院的135例慢性HBV感染者,根据HBV DNA含量分为HBV DNA>100 IU/ml组(85例)和HBV DNA≤100 IU... 详细信息

目的建立基于微流控芯片式数字PCR(cdPCR)的乙型肝炎病毒(HBV)RNA检测方法,并评估其在慢性HBV感染者中的应用。方法选取福建医科大学附属第一医院的135例慢性HBV感染者,根据HBV DNA含量分为HBV DNA>100 IU/ml组(85例)和HBV DNA≤100 IU/ml组(50例),同时选取健康体检者及其他病毒感染者作为对照组(15例)。设计HBV前C/C区特异性引物和探针,优化微流控cdPCR检测方法,并评估其线性范围、检出限、特异性及精密度。使用自建方法和2种市售试剂盒分别检测患者血清HBV RNA含量。采用Pearson相关性分析对HBV RNA与其他HBV标志物的关系进行评估。结果优化后自建微流控cdPCR方法的变性时间为10 s,退火/延伸温度为62℃,引物和探针浓度分别为0.3和0.2μmol/L。其线性范围为10^(3)~10^(7)拷贝/ml,检出限为10^(2)拷贝/ml,10^(4)和10^(7)拷贝/ml质粒标准品的批内变异系数(CV)分别为1.06%和0.82%,批间CV分别为0.75%和0.44%。特异性实验显示,其他病原体感染者和健康体检者的血清中均未检出阳性信号。自建微流控cdPCR方法在HBV DNA>100 IU/ml组的检出率为81.18%(69/85),高于市售试剂盒B的64.71%(55/85)(P0.05)。HBV RNA与HBV DNA、乙型肝炎表面抗原及乙型肝炎e抗原均呈正相关(r=0.67、0.53、0.44,P均<0.001)。结论成功建立了微流控cdPCR定量检测HBV RNA的方法,该方法灵敏、特异,且在低浓度病毒载量样本中也具有良好的检测能力。

关键词：聚合酶链反应微流控芯片式数字PCR 乙型肝炎病毒 RNA

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儿童及青少年躯体症状障碍诊疗进展

中国儿童保健杂志 2025年第2期33卷 208-213页

作者：赖乾坤王艳霞欧萍余秋娟李银枝郭敬民黄欣欣福建省妇幼保健院(福建医科大学妇儿临床医学院)儿保科福建福州350001 福建省妇幼保健院(福建医科大学妇儿临床医学院)保健部

儿童及青少年躯体症状障碍(SSD)是一种常见的心理障碍,可表现为腹痛、头痛、恶心等症状,影响患者的生活、学习和日常功能。该病的早期诊断依赖于详细的病史采集、体格检查和排除其他潜在的疾病。究其病因,可能与生物心理社会影响因素有... 详细信息

儿童及青少年躯体症状障碍(SSD)是一种常见的心理障碍,可表现为腹痛、头痛、恶心等症状,影响患者的生活、学习和日常功能。该病的早期诊断依赖于详细的病史采集、体格检查和排除其他潜在的疾病。究其病因,可能与生物心理社会影响因素有关。在干预及治疗中,学校与家庭参与的认知行为疗法是重要的治疗手段。

关键词：躯体症状障碍认知行为疗法儿童青少年

第三代测序技术实现肿瘤患者类孟买血型深入鉴定

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细胞与分子免疫学杂志 2025年第02期 148-153页

作者：王娜余秀蓉陈玉娟福建医科大学肿瘤临床医学院福建省肿瘤医院输血科

目的对本院肿瘤患者类孟买血型进行精准鉴定，促进本实验室的疑难血型鉴定体系的建立，为实现患者精准输血提供基础。方法回顾性分析本院2019-01-01/2023-12-31的91 874例肿瘤患者血型结果，采用常规血清学检测血型，检出疑似类孟买... 详细信息

目的对本院肿瘤患者类孟买血型进行精准鉴定，促进本实验室的疑难血型鉴定体系的建立，为实现患者精准输血提供基础。方法回顾性分析本院2019-01-01/2023-12-31的91 874例肿瘤患者血型结果，采用常规血清学检测血型，检出疑似类孟买血型，进一步采用Pacific Biosciences（PacBio）单分子实时测序与Sanger测序分析ABO、 FUT1和FUT2基因型。结果血清学和分子生物学方法证实8例类孟买血型，FUT1基因型分别是：5例h1h1（551＿552delAG纯合突变）、 3例h1h2（551＿552delAG和880＿882delTT杂合突变）; FUT2基因型分别是：2例Se357/Se357, 716, 4例Se357/Se357。其中1例样本ABO基因第7外显子中发现818C>T是杂合新变异，PacBio测序确认显示该突变位于O单倍体上。结论 PacBio测序技术突显其在分析类孟买血型基因单倍体上的优势，将有利于疑难血型鉴定体系，为肿瘤患者精准输血提供新依据。

关键词：类孟买血型 PacBio测序 FUT1基因

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基于边扰动的链接预测解释方法

计算机应用研究 2025年第2期42卷 425-430页

作者：陈耿靖郭躬德林世水福建师范大学计算机与网络空间安全学院福州350117 福建医科大学省立临床医学院福州大学附属省立医院骨科福州350001

多数链接预测模型是解释性较差的黑盒模型,因此不少学者提出了针对链接预测的解释方法,但这些方法存在着解释的目标模型单一、缺乏泛化能力、解释结果准确率不足等缺陷。为弥补这些不足,提出一种基于边扰动的链接预测的解释方法。首先... 详细信息

多数链接预测模型是解释性较差的黑盒模型,因此不少学者提出了针对链接预测的解释方法,但这些方法存在着解释的目标模型单一、缺乏泛化能力、解释结果准确率不足等缺陷。为弥补这些不足,提出一种基于边扰动的链接预测的解释方法。首先利用广度优先搜索得到从头实体到尾实体的所有路径,随后搜索路径所经过实体的邻居节点,形成待解释三元组的训练子图;然后采用边扰动的方式在训练子图上重新训练嵌入模型,计算每条边对预测结果的影响程度;最后通过双向的束搜索得到对预测结果影响程度最大的路径,作为待解释三元组的解释路径。实验表明,该方法在公共数据集上的性能超过了大多数的链接预测解释方法,ACC相较于最先进的方法提升了2.3%,AUPR提升了1.9%。同时在生物医学数据集上针对使用链接预测技术的药物重定位任务进行结果的解释实验,其解释体现了良好的可理解性、启发性。提出了一种不依赖于特定模型且有效的解释方法,该方法通过边扰动和路径搜索得到解释路径,使结果的解释更加直观和易于理解,同时能够为不同领域的知识图谱应用提供支持。

关键词：知识图谱链接预测可解释性模型无关性

基于GA-RF的利奈唑胺血药浓度分类预测模型

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中国医院药学杂志 2025年第3期45卷 325-330+336页

作者：连毅荣欧阳华严晓鹭林小青江国才福建医科大学药学院厦门大学附属中山医院药学部

目的：探索利奈唑胺发生不良反应的血药浓度临界值，建立利奈唑胺血药浓度分类预测模型。方法：收集2023年7月至2024年2月厦门大学附属中山医院98例使用利奈唑胺治疗患者的163次血药浓度监测数据，按8∶2将数据集随机划分为130份训练集... 详细信息

目的：探索利奈唑胺发生不良反应的血药浓度临界值，建立利奈唑胺血药浓度分类预测模型。方法：收集2023年7月至2024年2月厦门大学附属中山医院98例使用利奈唑胺治疗患者的163次血药浓度监测数据，按8∶2将数据集随机划分为130份训练集和33份测试集，利用训练集建立基于遗传算法优化的随机森林（GA-RF）分类模型，用于预测血药浓度分类情况，通过测试集进行模型性能验证。结果：发生不良反应组的患者血药浓度显著高于未发生不良反应组（P临床个体化用药提供参考依据。

关键词：利奈唑胺血药浓度监测不良反应随机森林分类模型