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甘蔗类钙调素CML13与SCMV运动蛋白P3N-PIPO的互作研究

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作物学报 2024年

作者：玉泉馨杨宗桃张海程光远焦文迪曾康罗廷绪黄国强王璐徐景升福建农林大学/农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗工程技术研究中心/教育部作物遗传育种与综合利用重点实验室

类钙调素(Calmodulin-like， CML)是植物特有的钙信号感受器蛋白之一，参与植物生长发育和响应外界环境信号转导。甘蔗(Saccharum spp. hybrid)中CML应答甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus， SCMV)侵染尚未见报道。本研究从甘蔗热带... 详细信息

类钙调素(Calmodulin-like， CML)是植物特有的钙信号感受器蛋白之一，参与植物生长发育和响应外界环境信号转导。甘蔗(Saccharum spp. hybrid)中CML应答甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus， SCMV)侵染尚未见报道。本研究从甘蔗热带种Badila (S. officinarum)中克隆了一个CML基因，命名为ScCML13。该基因开放读码框(open reading frame， ORF)长度为519 bp，编码172 aa。生物信息学分析表明，ScCML13属于稳定的亲水脂溶蛋白，无跨膜结构域，有4个结合Ca2+的EF-hand结构域；系统进化树分析表明，该蛋白在单子叶和双子叶植物中及单子叶C3和C4植物中具有明显分化；酵母双杂交(yeast two-hybrid， Y2H)和双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation， BiFC)试验表明，ScCML13与SCMV的运动蛋白P3N-PIPO互作。亚细胞定位试验表明ScCML13定位于内质网和细胞核。共定位试验发现ScCML13会干扰SCMV-P3N-PIPO的质膜(plasma membrane)或胞间连丝(plasmodesmata)定位。实时荧光定量PCR (Real Time Quantitative PCR， RT-qPCR)分析发现，ScCML13基因主要在甘蔗叶片中表达，在节间和根中的相对表达量低；ScCML13基因在感染SCMV后2 h显著上调，随后下调至与对照组相比的水平，而在感染后期上调。

关键词：类钙调素甘蔗花叶病毒 P3N-PIPO 蛋白互作

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数字乡村建设下三维资本与农村居民创业选择

资源开发与市场 2024年第6期40卷 907-916页

作者：周子渭魏远竹陈鎏鹏林俊杰福建农林大学经济与管理学院福建福州350002 宁德师范学院经济管理学院福建宁德352100 福建农林大学乡村振兴学院福建福州350002

创业是帮助农民实现就业和增加收入的有效途径,数字乡村建设为农村居民创业带来了新的契机。基于数字乡村赋能的环境异质性视角,利用中国家庭追踪调查微观数据与《县域数字乡村指数》,论证了数字乡村建设下三维资本对农村居民创业选择... 详细信息

创业是帮助农民实现就业和增加收入的有效途径,数字乡村建设为农村居民创业带来了新的契机。基于数字乡村赋能的环境异质性视角,利用中国家庭追踪调查微观数据与《县域数字乡村指数》,论证了数字乡村建设下三维资本对农村居民创业选择的乘数效应。结果表明:(1)数字乡村建设放松了自有资金对农村居民创业选择的约束,降低了创业对经济资本的需求门槛,即与经济资本呈现“替代”关系;数字乡村建设扩大了人力资本与社会资本对农村居民创业选择的积极影响,激活了人力资本更具优势的群体,弥补了社会资本信息密度不足的短板,即与人力资本和社会资本呈现“互补”关系;(2)数字乡村建设更有利于发挥农村女性及青年人力资本对创业选择的作用,突出农村男性、壮年与西部地区社会资本对于创业的积极影响;(3)数字乡村建设更容易降低创业对农村男性、生存型创业及东部地区经济资本的门槛,放大中部地区经济资本的作用,发挥农村居民人力资本在机会型创业选择中的作用,降低劳动密集型行业创业者对经济资本的依赖。

关键词：数字乡村三维资本农民创业

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福州村落河流廊道植物的生境及物种多样性——以白眉溪流域为例

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现代农业研究 2024年第1期30卷 113-118页

作者：曾宇轩吴晓佩吴晨虹谢祥财福建农林大学风景园林与艺术学院福建福州350108 国家水利风景区研究中心福建福州350002

河流廊道是植物生长的一个重要环境,但关于村落河流廊道的研究却相对缺乏。本研究以福州村落白眉溪流域为研究样段,运用均匀布样法,通过分析白眉溪流域的驳岸类型、植物的生境类型,并探索河流廊道植物组成特征,以期为河道植物生境及植... 详细信息

河流廊道是植物生长的一个重要环境,但关于村落河流廊道的研究却相对缺乏。本研究以福州村落白眉溪流域为研究样段,运用均匀布样法,通过分析白眉溪流域的驳岸类型、植物的生境类型,并探索河流廊道植物组成特征,以期为河道植物生境及植物景观营造提供相关经验。

关键词：村落河流廊道植物景观物种多样性

基于多花黄精转录组的HIPPs/HPPs基因家族鉴定与表达调控

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应用与环境生物学报 2024年第1期30卷 133-143页

作者：李小利朱田圆班景洁王庆爽陈翠蓉张慧朱建明叶炜赖钟雄林玉玲陈裕坤福建农林大学园艺植物生物工程研究所福州350002 现代设施农业福建省高等学校工程研究中心福清350300 福建金湖源生态农业有限公司邵武354099 三明市农业科学研究院药用植物研究所三明365509

PcHIPPs/PcHPPs是一类细胞内可溶性金属结合蛋白,在调节植物重金属稳态、解毒机制、重金属耐受等方面发挥重要作用,目前关于HIPPs/HPPs基因家族在多花黄精中还未有人研究.基于多花黄精不同转录组数据,采用生物信息学进行理化性质分析、... 详细信息

PcHIPPs/PcHPPs是一类细胞内可溶性金属结合蛋白,在调节植物重金属稳态、解毒机制、重金属耐受等方面发挥重要作用,目前关于HIPPs/HPPs基因家族在多花黄精中还未有人研究.基于多花黄精不同转录组数据,采用生物信息学进行理化性质分析、亚细胞定位和保守基序及系统进化树分析,并对其功能进行初步分析,研究HIPPs/HPPs基因在不同铅处理下的表达情况.结果表明:从多花黄精中鉴定出68个PcHIPPs和43个PcHPPs基因;PcHIPPs基因家族的氨基酸数为134-501,分子量介于15.53-53.09 ku之间,等电点介于5.12-9.88;PcHPPs基因的氨基酸数为101-352,分子量介于11.46-38.23 ku,等电点介于5.58-10.41;亚细胞定位预测表明,PcHIPPs/PcHPPs基因有73个分布在细胞核内;通过KEGG分析发现PcHPP3、PcHIPP28-5、PcHIPP28-6、PcHPP1-5参与到代谢过程;PcHIPPs/PcHPPs基因在多花黄精根状茎中主要发挥作用,在盐胁迫处理48 h下大部分PcHIPPs/PcHPPs基因表现出明显的下调现象;多花黄精组培苗在铅处理中叶片萎缩、枯黄逐渐加重,并且低浓度的铅胁迫对植物叶绿素含量具有一定的促进作用,而高浓度的铅胁迫对植物叶绿素含量具有抑制作用;此外,PcHIPPs/PcHPPs基因总体上随着铅浓度的增加呈现出先升高后降低的表达趋势.本研究表明PcHIPPs/PcHPPs基因在多花黄精铅胁迫中起重要调控作用,为PcHIPPs/PcHPPs基因在重金属胁迫响应中的功能奠定基础.(图7表3参43)

关键词：多花黄精 HIPPs基因 HPPs基因生物信息学分析表达分析

福建大嵛山岛常绿阔叶林木本植物优势种的生态位和种间联结

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植物资源与环境学报 2024年第4期33卷 92-100页

作者：邓清雅温瑞龙王迎雪邓传远郑俊鸣张琳婷福建农林大学风景园林与艺术学院福建福州350002 莆田学院土木工程学院福建莆田351100 福建省海岛资源生态监测与保护利用重点实验室福建平潭350400 自然资源部海岛研究中心福建平潭350400

采用典型样地调查法对福建大嵛山岛常绿阔叶林木本植物进行群落调查,采用Levins指数、Shannon-Wiener指数、Pianka指数、Schoener指数对木本植物优势种(重要值大于1.5%)的生态位宽度、生态位重叠、生态位相似性进行分析,并采用方差比率... 详细信息

采用典型样地调查法对福建大嵛山岛常绿阔叶林木本植物进行群落调查,采用Levins指数、Shannon-Wiener指数、Pianka指数、Schoener指数对木本植物优势种(重要值大于1.5%)的生态位宽度、生态位重叠、生态位相似性进行分析,并采用方差比率、χ^(2)检验、种间联结系数、Jaccard指数分析联结性特征。结果显示:在福建大嵛山岛常绿阔叶林木本植物中筛选出16个优势种,其中,樟(Camphora officinarum Nees)的重要值和生态位宽度最大。木本植物优势种的120个种对中,Pianka指数和Schoener指数在[0.0,0.5)范围内的种对分别有78和91对,占总种对数的65.0%和75.8%,表明多数种对生态位重叠程度和生态位相似性较低,即优势种分布相对独立,种间关系较稳定。优势种间的方差比率为2.37,统计量为37.89,表明总体联结性为显著正联结。χ^(2)检验结果显示:75个种对呈正联结,41个种对呈负联结,4个种对无联结。联结系数分析结果显示:79个种对呈正联结,42个种对呈负联结。80个种对的Jaccard指数在[0.43,1.00]范围内,表明多数种对的联结性较强。回归分析结果显示:联结系数和Jaccard指数与Pianka指数和Schoener指数均在0.001水平上显著正相关。综上所述,福建大嵛山岛常绿阔叶林木本植物优势种间的生态位重叠程度和生态位相似性较低,多数种对呈正联结,且联结性较强;目前大嵛山岛常绿阔叶林接近群落演替发展的中后期阶段,物种组成和群落结构较为稳定。

关键词：大嵛山岛常绿阔叶林木本植物生态位种间联结

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森林人家可持续发展评价指标体系构建及应用

林业经济问题 2022年第5期42卷 550-560页

作者：白君亭黄莉林润泽兰思仁李霄鹤福建农林大学园林学院福州350002 福建农林大学海峡美丽乡村人居环境研究中心福州350002

引入DPSIR模型,使用层次分析法构建了由5个一级指标、10个二级指标、26个三级指标构成的森林人家可持续发展评价指标体系,并以福建省漳平市九鹏溪森林人家、泰宁县水际村森林人家为典型案例论证该评价指标体系的科学性和有效性。结果表... 详细信息

引入DPSIR模型,使用层次分析法构建了由5个一级指标、10个二级指标、26个三级指标构成的森林人家可持续发展评价指标体系,并以福建省漳平市九鹏溪森林人家、泰宁县水际村森林人家为典型案例论证该评价指标体系的科学性和有效性。结果表明:在驱动力、压力、状态、影响、响应5个一级指标中响应和状态的权重较高,森林人家将原有粗放型经营模式调整为生态旅游模式,并推进产业优化升级;九鹏溪与水际村森林人家虽同处基本可持续发展阶段,但九鹏溪森林人家凭借森林资源资产、重点龙头企业、品牌文化项目更具可持续发展优势。因此,森林人家在借鉴使用典型发展模式的同时还需要因地制宜构建多元生态产业体系和产业链、深挖森林人家地域文化背景资源、强化从业人员职业素养、完善生态环境治理体系、平衡公共与经济利益关系,从而探索更加科学的可持续发展道路。

关键词：可持续发展森林人家 DPSIR模型福建

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黔西南露天煤矿废弃地重金属污染特征研究

西南林业大学学报（自然科学） 2024年第2期44卷 101-110页

作者：杨帆喻君保武欣怡韩雪洁翟林曹树一孟维彩侯晓龙福建农林大学林学院福建福州350002 南方红壤区水土保持国家林业和草原局重点实验室福建福州350002 海峡两岸红壤区水土保持协同创新中心福建福州350002

以黔西南某典型露天煤矿为研究对象,采集弃渣区、覆土区、植物修复区及矿区周边对照区的土壤样品,测定土壤pH值、重金属含量及其形态,采用静置淋溶方法分析重金属污染扩散过程。结果表明:废弃地弃渣区、覆土区和植物修复区土壤的pH值分... 详细信息

以黔西南某典型露天煤矿为研究对象,采集弃渣区、覆土区、植物修复区及矿区周边对照区的土壤样品,测定土壤pH值、重金属含量及其形态,采用静置淋溶方法分析重金属污染扩散过程。结果表明:废弃地弃渣区、覆土区和植物修复区土壤的pH值分别为2.86、3.49和4.90,均小于未开采对照区(6.48),废弃地土壤严重酸化;弃渣区土壤重金属Cu和Cd含量分别超过贵州省土壤背景值的4.57倍和3倍,超过土壤污染风险筛选值的1.86倍和0.73倍,弃渣区重金属Cr含量超过贵州省土壤背景值的1.14倍,超过土壤污染风险筛选值的0.37倍。弃渣区重金属Cu和Cd达中度及以上污染,重金属Cr和Pb为中度污染,植物修复区Pb、Zn、Cr污染程度与对照区无显著差异;内梅罗污染指数、土壤污染负荷指数、土壤综合潜在生态危害指数表明植物修复区、覆土区污染等级为轻度污染,弃渣区为重度污染;弃渣区、覆土区土壤Cu、Cr和Cd弱酸可提取态占比明显高于植物修复区和对照区;弃渣区土壤重金属淋溶释放速率及释放量均高于其他区域。土壤pH值与重金属Cr、Cu和Pb形态特征存在显著相关性,pH值降低显著提升了重金属弱酸可提取态占比,土壤酸化明显促进了重金属元素的迁移释放及生物有效性的提升,淋溶加剧了土壤酸化及重金属污染的扩散。

关键词：土壤酸化露天煤矿重金属污染生物有效性淋溶扩散

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万里茶道起点下梅古村落景观基因信息链构建及特征分析

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中国园林 2023年第2期39卷 96-102页

作者：邹诚玄锦杨钧宁黄柳菁李霄鹤福建农林大学风景园林与艺术学院福建农林大学海峡美丽乡村人居环境研究中心福州350002

传统村落承载着农耕文明和民族文化的精髓。识别传统村落景观特征并掌握其内在肌理,有利于从村落整体视角实现对村落景观的有效保护与传承。以万里茶道第一站下梅村为例,引入景观基因信息链理论,对其景观结构和潜在文化特征进行评估与... 详细信息

传统村落承载着农耕文明和民族文化的精髓。识别传统村落景观特征并掌握其内在肌理,有利于从村落整体视角实现对村落景观的有效保护与传承。以万里茶道第一站下梅村为例,引入景观基因信息链理论,对其景观结构和潜在文化特征进行评估与解析。结果表明:1)受地理位置影响,下梅村整体景观形态保存较为完好,布局充分结合自然山水,形成“三山鼎峙,一水环流”的中国传统风水格局,历史研究和保护价值较高;2)下梅村景观信息元种类繁多、内涵丰富、技艺精湛,但三者传承度较低,原真性现状有待提升;3)下梅村景观信息点数量较多、结构精巧、风格独特,村落自然景观保存程度要劣于人文景观;4)下梅村景观信息廊道为“一字型”商业街、“并列型”滨水观光道及“网络型”巷道,部分道路材质开始出现断裂、拼接与松动等现象,但保存度较为完整;5)下梅村景观信息网络整体性较强,由于大量建筑局部装饰受损度严重,主体结构存在塌毁、残缺等问题,保存度一般,急需有效修缮。未来研究需结合GIS技术、数理分析模型等,增加其可视化分析,为传统村落景观保护性利用提供精准化修复方案,防止再遭破坏。

关键词：风景园林万里茶道下梅村传统村落景观基因信息链特征分析

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基于近红外光谱技术的六大茶类快速识别

食品与生物技术学报 2024年第1期43卷 48-59页

作者：张灵枝黄艳于英杰林刚孙威江福建农林大学园艺学院福建福州350002 福建农林大学安溪茶学院福建泉州362400 中国茶叶流通协会北京100801 福建融韵通生态科技有限公司福建福州350025 福建农林大学福建省茶产业工程技术研究中心福建福州350002 福建农林大学海峡两岸特色作物安全生产省部共建协同创新中心福建福州350002

为构建高质量的六大茶类识别模型,本研究中收集了370份样品,通过采集其近红外光谱(near-infrared spectroscopy,NIRS),结合光谱预处理、特征提取以及数据挖掘分类器算法,建立六大茶类快速识别模型。结果表明:1)支持向量机(support vecto... 详细信息

为构建高质量的六大茶类识别模型,本研究中收集了370份样品,通过采集其近红外光谱(near-infrared spectroscopy,NIRS),结合光谱预处理、特征提取以及数据挖掘分类器算法,建立六大茶类快速识别模型。结果表明:1)支持向量机(support vector machine,SVM)与随机森林(random forest,RF)分类器皆适于六大茶类快速识别模型的构建;2)SVM分类器更适于结合原始光谱(original spectrum,OS)建模,预处理易使基于该分类器建立的模型鉴别性能减弱;3)随机森林(RF)分类器更适用于预处理后光谱建模,所得模型较OS模型在识别正确率(recognition accuracy,RA)及受试者工作特征曲线下面积(area under the curve,AUC)均得到明显提升;4)特征提取中线性判别分析(linear discriminant analysis,LDA)算法表现最好,所得模型的RA较OS模型明显提升,其中最佳模型OS-LDA-SVM的RA为100.00%,AUC为1.00,识别正确率高、泛化能力强、模型性能优异,可产业化应用。综上所述,近红外光谱结合预处理、特征提取算法及分类器建立模型,进行六大茶类识别的可行性强,模型的识别正确率高、性能优异,可为茶叶贸易的茶类快速识别提供科学、准确、高效的技术支撑,为国际茶类识别模型的产业化应用奠定基础。

关键词：近红外光谱茶类识别支持向量机随机森林线性判别分析

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