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电子圆二色光谱图的模拟与软件开发

光谱学与光谱分析 2024年第2期44卷 434-438页

作者：许范苏俊奎文燕甘礼社五邑大学生物科技与大健康学院广东江门529020 浙江大学药学院现代中药研究所浙江杭州310058

有机小分子化合物,尤其是天然产物具有复杂和多样的结构,且一般含有多个手性中心,确定其绝对构型一直是结构鉴定的难点之一。电子圆二色光谱(ECD)具有样品无损、曲线简洁等优势,是鉴定绝对构型的强有力的手段之一。利用密度泛函理论(DFT... 详细信息

有机小分子化合物,尤其是天然产物具有复杂和多样的结构,且一般含有多个手性中心,确定其绝对构型一直是结构鉴定的难点之一。电子圆二色光谱(ECD)具有样品无损、曲线简洁等优势,是鉴定绝对构型的强有力的手段之一。利用密度泛函理论(DFT)和含时密度泛函理论(TDDFT)等量子化学理论以及计算机技术,对化合物的理论ECD计算模拟,与实验值对比确定绝对构型是目前主流技术。计算模拟流程如下:首先确定化合物的相对构型,其次运用构象搜索软件对化合物进行构象分析,然后对搜索得到的多个最低能量态构象(如能量阈值在2.0 kcal·mol^(-1)以内)进行几何优化和振动分析,将已经优化完成的优势构象投入ECD计算,计算ECD相关参数,得到电子激发能(eV)和转子强度(10^(-40) erg-esu-cm)等数据,最终根据数据进行多构象谱图拟合。该研究主要对ECD曲线的模拟方法、ECD计算结果的评价标准进行了全面总结。在此基础上,运用Python语言开发了一款自动化处理高斯ECD计算结果、模拟ECD曲线的软件,该软件能够对计算得到的输出文件进行定位,对于化合物几何优化和振动分析得到的输出文件,可以抓取各个构象的吉布斯自由能数据,并且依据此数据进行玻尔兹曼分布的加权,对于计算ECD相关性质的输出文件,可以抓取ECD计算相关的电子激发能和转子强度的数据,依据以上数据得到的ECD计算理论光谱图,能够进行实时模拟参数调节并与实测曲线对比,方便了计算ECD的数据处理和结果评价。

关键词：天然产物电子圆二色光谱(ECD) 曲线模拟 Python语言

骨碎补UPLC指纹图谱与人骨肉瘤细胞MG63中碱性磷酸酶活性的谱效关系研究

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天然产物研究与开发 2024年第2期36卷 293-302页

作者：陈香丽张慧敏张紫佳上海中医药大学中药研究所、中药标准化教育部重点实验室上海201203

建立骨碎补生品和砂烫品提取物的UPLC指纹图谱,并研究骨碎补提取物与人骨肉瘤细胞MG63中碱性磷酸酶(ALP)活性之间的谱效关系。采用UPLC法建立骨碎补生品和烫品的指纹图谱并通过UPLC-Q-TOF MS法对其化学成分进行鉴别;通过测定MG63细胞中... 详细信息

建立骨碎补生品和砂烫品提取物的UPLC指纹图谱,并研究骨碎补提取物与人骨肉瘤细胞MG63中碱性磷酸酶(ALP)活性之间的谱效关系。采用UPLC法建立骨碎补生品和烫品的指纹图谱并通过UPLC-Q-TOF MS法对其化学成分进行鉴别;通过测定MG63细胞中ALP活性检测骨碎补提取物对MG63细胞成骨分化的影响;采用灰色关联度分析、双变量相关性分析以及偏最小二乘回归分析法分析骨碎补生品和烫品的UPLC特征指纹峰与其促ALP活性之间的谱效关系。在标定的12个共有峰中,确定了4、5、12号峰与ALP活性呈正相关,其对应的物质依次是咖啡酸-4-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、儿茶素7-葡糖苷、柚皮苷,为深入研究骨碎补的促成骨分化活性物质基础提供依据。

关键词：骨碎补 UPLC指纹图谱碱性磷酸酶活性谱效关系人骨肉瘤细胞MG63

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尿素包合法制备油茶籽油中油酸的工艺研究

中国粮油学报 2012年第5期27卷 56-59页

作者：许明塔陈剑锋福州大学天然产物与中药现代化研究所福州350108

研究以一种福建产油茶籽油为原料,其中含棕榈酸7.93%,硬脂酸2.01%,油酸80.92%,亚油酸6.74%,不饱和脂肪酸含量约90%,通过尿素包合法油酸进行纯化。结果表明,油茶籽油在碱醇水解,用95%甲醇低温除杂后,采用90%甲醇为包合溶剂,在尿素与脂肪... 详细信息

研究以一种福建产油茶籽油为原料,其中含棕榈酸7.93%,硬脂酸2.01%,油酸80.92%,亚油酸6.74%,不饱和脂肪酸含量约90%,通过尿素包合法油酸进行纯化。结果表明,油茶籽油在碱醇水解,用95%甲醇低温除杂后,采用90%甲醇为包合溶剂,在尿素与脂肪酸重量比为4∶1,脂肪酸浓度为10%的条件下,4℃中保存16 h后,油酸纯度可由80%提高到92%,回收率可达83%,实现了对油酸的分离纯化,为油茶籽油在医药及化妆品中的应用奠定良好的工作基础。

关键词：油茶籽油气相色谱法油酸尿素包合法

氧化石墨烯改性纤维增强水泥基材料的拉伸性能

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建筑材料学报 2024年第5期27卷 400-407页

作者：罗素蓉姚佳敏周恩泉王世杰福州大学土木工程学院福建福州350116 福建省建筑设计研究院有限公司福建福州350001

为了提高聚乙烯醇(PVA)纤维增强水泥基材料的力学性能,将氧化石墨烯(GO)引入PVA纤维增强水泥基材料中,探究GO掺量在0%~0.05%范围内对材料单轴拉伸性能的影响.结果表明:掺入适量的GO能够有效提高材料的单轴拉伸性能,当GO掺量为0.01%时,2... 详细信息

为了提高聚乙烯醇(PVA)纤维增强水泥基材料的力学性能,将氧化石墨烯(GO)引入PVA纤维增强水泥基材料中,探究GO掺量在0%~0.05%范围内对材料单轴拉伸性能的影响.结果表明:掺入适量的GO能够有效提高材料的单轴拉伸性能,当GO掺量为0.01%时,28 d时材料的初裂拉伸强度、极限拉伸强度和极限拉伸应变均达到最大值,与未掺GO的对照组相比分别提高了26.97%、31.28%、23.25%;适量的GO可以优化孔隙结构,减少材料内部缺陷,促进水化产物的生成,使微观结构致密化,增强纤维和基体间的界面结合力,从而改善PVA纤维增强水泥基材料的宏观性能.

关键词：氧化石墨烯水泥基材料单轴拉伸性能微观性能聚乙烯醇(PVA)纤维

23-乙酰泽泻醇B对千里光碱致急性肝损伤小鼠水液失衡的影响

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药学学报 2024年第7期59卷 1982-1992页

作者：唐莹莹贾夏丽王金圆董跨陈岩丁丽丽熊爱珍杨莉王峥涛上海中医药大学中药研究所中药标准化教育部重点实验室暨国家中医药管理局中药新资源与质量评价重点实验室上海201203 上海中药标准化研究中心上海201203

误服误用含吡咯里西啶生物碱(pyrrolizidine alkaloid,PA)的中草药是导致我国临床肝窦阻塞综合征(hepatic sinusoidal obstruction syndrome,HSOS)的主要原因,利尿剂是目前临床上治疗PA致HSOS的常用药物之一。泽泻作为传统利尿中药,但... 详细信息

误服误用含吡咯里西啶生物碱(pyrrolizidine alkaloid,PA)的中草药是导致我国临床肝窦阻塞综合征(hepatic sinusoidal obstruction syndrome,HSOS)的主要原因,利尿剂是目前临床上治疗PA致HSOS的常用药物之一。泽泻作为传统利尿中药,但其利尿机制仍未完全明确,且尚未有从利尿角度阐释泽泻改善PA致HSOS的报道。基于课题组前期研究,本研究以泽泻三萜23-乙酰泽泻醇B(alisol B 23-acetate,AB23A)为代表性药物,评价其对毒性PA千里光碱致小鼠急性肝损伤的保护作用,并进一步考察AB23A对模型小鼠水液失衡的影响。所有动物实验经上海中医药大学实验动物伦理委员会批准(批准号PZSHUTCM220808017),符合实验动物伦理相关规范。小鼠单次灌胃千里光碱(50 mg·kg^(-1))造模(SEN组),并设AB23A(40 mg·kg^(-1))干预组(AB23A+SEN组)、溶剂对照组(Ctrl组)和AB23A对照组(AB23A组)。结果表明,AB23A可明显降低千里光碱致急性肝损伤小鼠血清肝功能生化指标水平,缓解肝细胞凝固性坏死、肝窦淤血等病理状态;此外,AB23A还可改善小鼠血清肾功能指标,改善千里光碱造成的尿液排泄减少、机体电解质紊乱,并降低千里光碱及其代谢产物的含量。进一步测定小鼠水平衡通路相关蛋白和mRNA的表达,AB23A可明显下调千里光碱模型组小鼠水通路蛋白2(aquaporin-2,AQP2)、血管紧张素II 1型受体的蛋白和mRNA表达水平,抑制AQP2向顶端质膜运输,并降低血清血管紧张素II含量。体外研究进一步证实AB23A可调节肾脏内髓集合管细胞AQP2的表达。本研究表明,AB23A可调节千里光碱致急性肝损伤小鼠肾脏髓质AQP2,影响其对水的重吸收,改善水液平衡。研究结果进一步加深了对泽泻传统利尿活性的认识,为临床利用泽泻治疗PA致HSOS提供实验基础和理论依据。

关键词： 23-乙酰泽泻醇B 吡咯里西啶生物碱水通路蛋白2 利尿水液平衡

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基于网络药理学探讨臭灵丹抗炎的作用机制

天然产物研究与开发 2024年第8期36卷 1420-1431页

作者：周永芝舒腾云宋玉莹郑立雄李海舟昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500 国家中药现代化工程研究中心西南分中心云南维和药业股份有限公司玉溪653101

基于LC-MS和网络药理学对臭灵丹乙酸乙酯部位(ethyl acetate fraction of Laggerae Herba,ELH)进行成分和靶点通路分析,并通过LPS(lipopolysaccharides,LPS)诱导RAW 264.7炎症模型探讨ELH抗炎的作用机制。通过Griess实验,比较臭灵丹不同萃取部位的抗炎活性;利用LC-MS对ELH的化学成分进行分析;基于网络药理学预测和筛选ELH发挥抗炎的核心成分,靶基因和主要通路,并用分子对接和蛋白免疫印迹(Western blot)对靶点和通路进行验证。Griess实验结果表明,ELH可显著抑制LPS诱导的RAW 264.7细胞释放NO,抑制率达103.07%,是臭灵丹发挥抗炎作用的活性部位;LC-MS分析得到ELH中23个化学成分,包括21个倍半萜,1个黄酮,1个有机酸体;基于4个数据库,获得66个共同靶点;蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI)分析发现获得白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等degree值大于40的6个核心靶点;GO、KEGG富集分析发现,核心靶点可能通过PI3K-Akt、IL-17、NF-κB和TNF等信号通路发挥抗炎作用;分子对接结果显示23个化学成分与核心靶点具有良好的结合能力;Western blot实验结果显示ELH处理后Akt的磷酸化水平和NF-κB表达显著下降(P化,在一定程度上抑制LPS诱导的RAW 264.7细胞中NF-κB信号通路的激活,从而发挥抗炎作用。

关键词：臭灵丹网络药理学炎症分子对接 LC-MS分析

闭鞘姜7个部位α-葡萄糖苷酶抑制活性及其乙醚提取物的GC-MS分析

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武汉大学学报（理学版） 2024年第2期70卷 164-168页

作者：陈乐瑶王雅丽蔡彩虹郭东昇梅文莉戴好富陈惠琴中国热带农业科学院热带生物技术研究所/海南省黎药资源天然产物研究与利用重点实验室海南海口571101 海南热带农业资源研究院海南海口571101

用乙醚和乙醇对闭鞘姜7个部位进行提取后,用pNPG(4-硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷)法测试α-葡萄糖苷酶体外抑制活性,并通过气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法分析测定其乙醚相中的化学成分。共检出化学成分125个,通过峰面积归一化法确定各化... 详细信息

用乙醚和乙醇对闭鞘姜7个部位进行提取后,用pNPG(4-硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷)法测试α-葡萄糖苷酶体外抑制活性,并通过气相色谱-质谱(GC-MS)联用方法分析测定其乙醚相中的化学成分。共检出化学成分125个,通过峰面积归一化法确定各化学成分的相对含量,结果显示,闭鞘姜7个部位化学成分差异较大。活性测试结果表明:花瓣、花萼和须根的乙醚提取物的酶抑制率均超过70%,茎的乙醚提取物和根茎的乙醇提取物的酶抑制率在50%左右。因此,闭鞘姜不同部位挥发性成分差异较大,花瓣、花萼和须根的乙醚提取物具有相对较强的α-葡萄糖苷酶抑制活性,可为闭鞘姜全株的资源利用提供参考。

关键词：中草药闭鞘姜 α-葡萄糖苷酶气相色谱-质谱(GC-MS)

滇东南荒田钨矿床白钨矿原位U-Pb年代学、Sr同位素组成及成矿启示

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现代地质 2024年

作者：王中良林木森周瑞辉福州大学紫金地质与矿业学院

荒田钨矿床位于滇东南老君山多金属成矿区北缘﹐是近年来新发现的一处大型白钨矿床，前人对矿床地质特征、成矿流体演化等开展了相关的研究，然而其成矿时代的缺失和物质来源的争议，制约着人们对其成矿机制的认识。在详细钻孔岩心编录... 详细信息

荒田钨矿床位于滇东南老君山多金属成矿区北缘﹐是近年来新发现的一处大型白钨矿床，前人对矿床地质特征、成矿流体演化等开展了相关的研究，然而其成矿时代的缺失和物质来源的争议，制约着人们对其成矿机制的认识。在详细钻孔岩心编录和矿物显微组构研究的基础上﹐本文对荒田钨矿床主成矿期I阶段白钨矿进行原位U-Pb定年、原位Sr同位素研究。结果表明，荒田白钨矿U-Pb年龄为64.6±3.7 Ma（n=35，MSWD=1.6），在古新世初期发生成矿作用，与矿段南段的深部隐伏花岗岩体密切相关，可能是区域隐伏岩浆活动的产物。荒田白钨矿87Sr/86Sr值（0.72025～0.72840）明显高于大陆地幔，显示明显壳源特征；荒田白钨矿与老君山花岗岩Sr同位素初始比值的一致性，指示了二者成矿热液可能为同一热液系统（长寿命岩浆房）的产物；荒田白钨矿中的高Ca浓度主要来自花岗岩类中的斜长石的绢云母化，并以“正岩浆成矿模式”从花岗岩浆中提取W。对荒田白钨矿成矿时代的厘定和对其成矿物质来源的界定为进一步分析该矿床成矿机制奠定基础，丰富了对滇东南多金属成矿带的认识，并为该区域进一步找矿提供借鉴。

关键词：滇东南白钨矿原位U-Pb定年原位Sr同位素成矿指示

基于肠道菌群和代谢组学研究桦褐孔菌多糖对急性肺损伤小鼠的保护作用

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中国实验方剂学杂志 2024年第13期30卷 86-94页

作者：俞莉叶苗云陈少丹白光剑张慧楠杨明王雅琪江西中医药大学现代中药制剂教育部重点实验室南昌330004 广东省科学院微生物研究所广州510070

目的:探讨桦褐孔菌多糖(IOP)治疗脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)的保护作用。方法:40只雄性C57BL/6小鼠随机分为正常组、模型组、地塞米松组、IOP高、低剂量组,每组8只。IOP高、低剂量组分别按20、10 mg·kg^(-1)灌胃给药,正常... 详细信息

目的:探讨桦褐孔菌多糖(IOP)治疗脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)的保护作用。方法:40只雄性C57BL/6小鼠随机分为正常组、模型组、地塞米松组、IOP高、低剂量组,每组8只。IOP高、低剂量组分别按20、10 mg·kg^(-1)灌胃给药,正常组和模型组灌胃等体积生理盐水,地塞米松组腹腔注射磷酸地塞米松注射液30 mg·kg^(-1),连续给药21 d。构建LPS诱导的ALI小鼠模型,采用苏木素-伊红(HE)染色、免疫荧光染色和血常规检测肺组织病理损伤及血细胞含量。酶联免疫吸附测定法(ELISA)和实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测各炎症因子表达水平。16S rRNA测序和超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱(UPLC-Q-TOF-MS)分别检测小鼠肠道菌群及血浆差异代谢物变化。结果:与模型组比较,IOP给药后明显改善ALI小鼠肺组织病变,其脾脏和胸腺指数明显升高(P化合物-醌生物合成、淀粉和蔗糖代谢等与线粒体、糖、氨基酸代谢相关的通路。结论:IOP改善ALI小鼠肺组织病变、降低炎症反应,可能与维持肠道微生态平衡,调节线粒体电子氧化呼吸链及糖、氨基酸代谢途径,影响相关菌群代谢产物和三羧酸循环代谢产物的产生有关。

关键词：桦褐孔菌多糖(IOP) 急性肺损伤(ALI) 肠道菌群代谢组学