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机器学习识别LRRC15和MICB为类风湿关节炎的免疫诊断标志物

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中国组织工程研究 2025年第11期29卷 2411-2420页

作者：田彦虎黄心岸郭桐桐如斯坦木·阿合坦木罗江淼肖遥王超王维山石河子大学医学院新疆维吾尔自治区石河子市832008 石河子大学第一附属医院骨科新疆维吾尔自治区石河子市832008

背景:类风湿关节炎是一种慢性的自身免疫性疾病,早期诊断对于预防疾病进展和治疗至关重要。因此探究类风湿关节炎的诊断特征和免疫细胞浸润具有重要意义。目的:基于Gene Expression Omnibus(GEO)数据库,通过机器学习算法,筛选类风湿关... 详细信息

背景:类风湿关节炎是一种慢性的自身免疫性疾病,早期诊断对于预防疾病进展和治疗至关重要。因此探究类风湿关节炎的诊断特征和免疫细胞浸润具有重要意义。目的:基于Gene Expression Omnibus(GEO)数据库,通过机器学习算法,筛选类风湿关节炎潜在重要的诊断标记物,并探讨类风湿关节炎的诊断特征与免疫细胞浸润的关系。方法:从GEO数据库获取类风湿关节炎相关的滑膜组织的基因表达数据集,采用批量效应去除法对数据集进行合并,采用R软件进行差异表达基因的鉴定和功能相关性分析,通过生物信息学分析和3种机器学习算法进行疾病特征基因的提取,筛选出类风湿关节炎相关的关键基因。此外,对所有差异表达基因进行免疫细胞浸润分析,分析类风湿关节炎的炎症状态,并对其诊断特征与浸润性免疫细胞的关系进行研究。结果与结论:(1)在类风湿关节炎和正常滑膜组织中,获得了179个差异表达基因,其中124个基因表达上调,55个基因表达下调;(2)富集分析显示类风湿关节炎和免疫反应之间存在良好的相关性;(3)通过3种机器学习算法分析发现,LRRC15和MICB可能是类风湿关节炎潜在的标记物;(4)LRRC15(曲线下面积=0.964,95%CI:0.924-0.992)和MICB(曲线下面积=0.961,95%CI:0.923-0.990)在验证数据集上有着较强的诊断能力;(5)13种免疫细胞浸润发生改变,以巨噬细胞为主;(6)在类风湿关节炎中,免疫细胞功能的多数促炎途径被激活;(7)免疫相关性分析发现LRRC15和MICB与M1型巨噬细胞的相关性最强;(8)结果发现LRRC15和MICB被确定为类风湿关节炎潜在的诊断标记物,具有较强的诊断性能并且与免疫细胞浸润具有显著的相关性;通过机器学习及生物信息学分析加深了对类风湿关节炎免疫浸润的理解,为类风湿关节炎的诊断和治疗提供新的思路。

关键词：类风湿关节炎机器学习免疫浸润诊断标记物差异表达基因

基于干性指数模型对肉瘤预后、免疫浸润和铁死亡调控的分析

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中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4151-4160页

作者：魏婧娴孟莲孙皓张田田刘春霞石河子大学医学院病理学系/石河子大学第一附属医院病理科新疆维吾尔自治区石河子市832000 广州医科大学附属第二医院病理科广东省广州市510260

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测... 详细信息

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测序数据及相关临床信息。利用肉瘤干性指数,对获取的肉瘤RNA测序数据进行分组。利用生存数据进行组间预后情况分析,获取组间差异表达基因后进行通路富集和免疫浸润分析。获得铁死亡相关差异基因,构建蛋白互作网络并进行预后相关性分析。培养横纹肌肉瘤细胞系,分为贴壁细胞组和干细胞组,贴壁细胞组不予任何干预,干细胞组通过无血清培养处理以诱导横纹肌肉瘤干细胞富集,qRT-PCR验证干细胞相关标志物、铁死亡相关差异基因以及铁死亡相关标志物的mRNA表达。结果与结论:①以干性指数中位数为界将患者分成高干性指数组和低干性指数组,通过患病风险预测显示高干性指数组患者的无进展生存期低于低干性指数组,提示预后不佳;②GO、KEGG分析显示肉瘤高、低干性指数组差异表达基因参与不同的细胞通路;高干性指数组和低干性指数组之间免疫浸润存在差异;差异基因中有23个铁死亡相关基因,其中9个可构成相关性较强的蛋白互作网络,其中IDO1、IFNG、AQP5高表达的肉瘤患者预后更好,CA9高表达的肉瘤患者预后不佳;③qRT-PCR结果显示,与贴壁细胞组相比,干细胞组干细胞相关标志物NANOG、SOX2和OCT4 mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组铁死亡相关标志物SLC7A11的mRNA表达显著降低(P<0.05),ACSL4、GPX4、FTH1和COX2的mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组差异基因CA9的mRNA表达显著降低,IDO1、IFNG、AQP5的mRNA表达显著升高(P<0.05)。经上述生物信息学分析与实验验证,干细胞与肉瘤生存、铁死亡过程密切相关,CA9、IDO1、IFNG、AQP5在肉瘤干细胞中异常表达,可能成为肉瘤诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肉瘤干细胞干性指数铁死亡生存预后免疫浸润

FOCAD基因复合杂合变异致儿童重型先天性肝病1例

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中华儿科杂志 2025年第1期63卷 90-91页

作者：李艺佩郭张妍王义西安交通大学附属儿童医院重症医学科西安

患儿, 女, 2月6日龄, 以"皮肤黄染10 d"入院。家系全外显组测序结果提示FOCAD基因存在NM001375567.1:c.4203C>G（***1401*）和c.2303dupC（***769Phefs*54）复合杂合变异。诊断为FOCAD基因变异致儿童重型先天性肝病。以保肝降酶对症支...

患儿, 女, 2月6日龄, 以"皮肤黄染10 d"入院。家系全外显组测序结果提示FOCAD基因存在NM001375567.1:c.4203C>G（***1401*）和c.2303dupC（***769Phefs*54）复合杂合变异。诊断为FOCAD基因变异致儿童重型先天性肝病。以保肝降酶对症支持治疗为主, 经治疗16 d, 好转出院, 出院后继续口服药物治疗。19 d后因凝血功能异常再次入院, 治疗4 d, 基因结果回报异常, 家属放弃治疗, 2个月后死亡。

关键词：

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非结核分枝杆菌肺病并发肺曲霉菌病一例

中国防痨杂志 2025年第1期47卷 116-120页

作者：柳晓蕾王海慧张汝姣崔蓉王凯田高清清华大学第一附属医院呼吸与危重症医学科北京100016 潍坊市第二人民医院呼吸与危重症医学科潍坊261000 潍坊市第二人民医院药剂科潍坊261000

非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacterial,NTM)肺病易出现曲霉菌定植,在机体免疫状态下降及长期服用抗NTM药物后会导致定植曲霉菌致病,且不同的宿主免疫状态及对肺曲霉菌感染治疗的时机均会导致出现不同的肺曲霉菌病临床表型。本... 详细信息

非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacterial,NTM)肺病易出现曲霉菌定植,在机体免疫状态下降及长期服用抗NTM药物后会导致定植曲霉菌致病,且不同的宿主免疫状态及对肺曲霉菌感染治疗的时机均会导致出现不同的肺曲霉菌病临床表型。本文报道1例持续管理的中年男性患者,因咳嗽、咳痰、发热反复住院,于2017—2019年相继诊断为“肺结核、NTM肺病、肺曲菌球、亚急性侵袭性肺曲霉菌病”,病程曲折,经积极诊治后预后良好,为临床了解NTM肺病、曲霉菌、肺曲霉菌病之间的相互关系,以及亚急性肺曲霉菌病的不同分型及病程演变特点提供了完整详尽的参考。

关键词：非典型性细菌分枝杆菌属肺疾病曲霉菌病共病现象

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口服远处靶向纳米递送系统的研究进展

药学学报 2025年第1期 72-81页

作者：孙敏黄川生王立萍阮徐莉赵云丽王新春石河子大学第一附属医院石河子大学药学院

由于患者的依从性和方便性,口服给药可能是最常用和最可接受的给药途径。然而,传统的给药剂型,如片剂或胶囊制剂,可能导致药物的生物利用度低和治疗效率差。因此,随着材料科学和微纳米制造技术的发展,各种载体被开发出来以保护和提高药... 详细信息

由于患者的依从性和方便性,口服给药可能是最常用和最可接受的给药途径。然而,传统的给药剂型,如片剂或胶囊制剂,可能导致药物的生物利用度低和治疗效率差。因此,随着材料科学和微纳米制造技术的发展,各种载体被开发出来以保护和提高药物在胃肠道的吸收。在此,首先讨论了阻碍药物运输和吸收的主要生理因素(各种解剖学因素、物理因素和生化因素);在此基础上,综述了近年来提高药物生物利用度和靶向性的传统和新型口服给药途径的研究进展;最后,展望了口服药物输送系统的未来前景及临床转化的潜在挑战。

关键词：口服给药系统胃肠道生理障碍口服靶向口服纳米药物

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脐膨出的临床特征及其不良结局危险因素分析

中华儿科杂志 2025年第1期63卷 43-49页

作者：石巍韩铭玉陈正程晓英陈军津王鹏钭金法施丽萍马晓路浙江大学医学院附属儿童医院新生儿重症监护室杭州浙江大学医学院附属儿童医院新生儿内科杭州浙江大学医学院附属儿童医院医院质量管理办公室杭州浙江大学医学院附属儿童医院新生儿外科杭州

目的探讨脐膨出的临床特征, 评估脐膨出不良结局的相关危险因素。方法回顾性队列研究, 收集2013年1月至2022年12月在浙江大学医学院附属儿童医院因脐膨出住院治疗的224例患儿临床资料。根据患儿出院时状况分为预后良好及预后不良2组, ... 详细信息

目的探讨脐膨出的临床特征, 评估脐膨出不良结局的相关危险因素。方法回顾性队列研究, 收集2013年1月至2022年12月在浙江大学医学院附属儿童医院因脐膨出住院治疗的224例患儿临床资料。根据患儿出院时状况分为预后良好及预后不良2组, 采用χ2检验或χ2连续校正检验或Fisher确切概率法、Mann-WhitneyU 检验比较两组患儿的疾病特点及诊治情况。通过Logistic回归分析寻找与脐膨出不良结局相关的危险因素。结果 224例脐膨出患儿中男126例, 208例(92.9%)预后良好, 16例(7.1%)预后不良。预后不良组患儿中巨型脐膨出14例, 预后良好组患儿中巨型脐膨出100例。预后不良组疝囊中疝入2个以上腹腔脏器、合并心脏畸形、动脉导管未闭、肺动脉高压、败血症、疝囊表面感染的比例均高于预后良好组(均P<0.05)。预后不良组患儿有创机械通气、氧疗应用、静脉营养应用和总住院时间均长于预后良好组, 出现静脉营养相关胆汁淤积的比例高于预后良好组(均P<0.01)。多因素Logistic回归分析显示, 肺动脉高压(OR=9.39, 95%CI 1.20～73.32)、败血症(OR=8.59, 95%CI 1.32～55.86)、合并心脏畸形(OR=6.55, 95%CI 1.11～38.73)均为脐膨出不良结局的独立危险因素(均P<0.05)。结论脐膨出易合并心脏畸形、败血症、肺动脉高压等, 不良结局的危险因素包括肺动脉高压、败血症及合并心脏畸形相关。

关键词：先天畸形预后危险因素脐膨出

急性呼吸衰竭经ECMO治疗幸存者认知功能损害状况及影响因素分析

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临床肺科杂志 2025年第1期 70-73+82页

作者：王红梅刘艳马晶宋蓓宋云林新疆医科大学第一附属医院重症医学科新疆医科大学第一附属医院护理部

目的调查急性呼吸衰竭(ARF)经体外膜肺氧合(ECMO)治疗幸存者的认知功能损害状况并分析影响因素，为筛查ARF经ECMO治疗幸存者认知功能损害高危人群及防治提供参考。方法收集136例ARF经ECMO治疗幸存者，评估其认知功能，调查认知功能障... 详细信息

目的调查急性呼吸衰竭(ARF)经体外膜肺氧合(ECMO)治疗幸存者的认知功能损害状况并分析影响因素，为筛查ARF经ECMO治疗幸存者认知功能损害高危人群及防治提供参考。方法收集136例ARF经ECMO治疗幸存者，评估其认知功能，调查认知功能障碍发生情况。采用Logistic回归分析ARF经ECMO治疗幸存者认知功能障碍的影响因素。结果 ARF经ECMO治疗幸存者出院时、出院3个月、出院6个月和出院1年时认知功能障碍比例分别为64.7%、50.7%、44.1%和38.2%。Logistic回归分析显示，急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ评分，OR=1.782)、序贯器官衰竭评分(SOFA评分，OR=1.665)、ECMO治疗时间(OR=2.321)和谵妄(OR=5.876)是ARF经ECMO治疗幸存者出院1年时认知功能障碍的危险因素(P<0.05)。结论 ARF经ECMO治疗幸存者出院后1年内认知功能障碍比例逐渐降低，但仍有较大比例的幸存者面临长时间的认知功能障碍。APACHEⅡ评分、SOFA评分、ECMO治疗时间和谵妄是该部分幸存者面临长期认知功能障碍的危险因素，临床上可以筛选出具备这些特征的高危人群，并予以针对性干预。

关键词：急性呼吸衰竭体外膜肺氧合幸存者认知功能障碍影响因素

人脐带间充质干细胞抑制脓毒症小鼠肺组织细胞的焦亡

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中国组织工程研究 2025年第31期29卷 6642-6648页

作者：何长良王炎罗玲刘坚中山市古镇人民医院呼吸与危重症医学科广东省中山市528400 湘潭市中心医院/湖南大学附属医院综合ICU 湖南省湘潭市411100

背景:急性肺损伤是脓毒症患者的常见严重并发症,其发病机制复杂,目前尚无有效的药物治疗方案。人脐带间充质干细胞通过抑制细胞过度焦亡从而改善脓毒症急性肺损伤的作用机制愈发受到重视。目的:探索人脐带间充质干细胞对脓毒症所致急性... 详细信息

背景:急性肺损伤是脓毒症患者的常见严重并发症,其发病机制复杂,目前尚无有效的药物治疗方案。人脐带间充质干细胞通过抑制细胞过度焦亡从而改善脓毒症急性肺损伤的作用机制愈发受到重视。目的:探索人脐带间充质干细胞对脓毒症所致急性肺损伤小鼠肺组织细胞焦亡的影响及机制。方法:48只Balb/c雄性小鼠按随机数字法分为假手术组、模型组、治疗组(n=16)。模型组、治疗组行盲肠结扎穿孔建立脓毒症所致急性肺损伤模型,假手术组仅开腹后缝合。治疗组术后6 h尾静脉注射200μL人脐带间充质干细胞悬液(5×105个细胞),模型组及假手术组术后6 h尾静脉注射200μL生理盐水。术后28 h,各组随机取5只小鼠予以尾静脉注射伊文思蓝检测肺血管通透性;收集各组剩余小鼠肺泡灌洗液和肺组织,ELISA检测肺泡灌洗液中白细胞介素1β、白细胞介素18水平,计数肺泡灌洗液中细胞总数及巨噬细胞数;苏木精-伊红染色观察肺组织病理学形态,TUNEL染色观察肺组织细胞焦亡情况,RT-PCR、Western blot检测肺组织中Toll样受体4、GSDMD及Caspase-11的mRNA和蛋白表达。结果与结论:与模型组相比,治疗组术后28 h肺血管通透性显著下降(P一定程度上改善脓毒症小鼠肺损伤的严重程度。

关键词：人脐带间充质干细胞 Toll样受体4 Caspase-11 GSDMD 急性肺损伤急性呼吸窘迫综合征细胞焦亡脓毒症工程化干细胞

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单纯性支气管扩张症与支气管扩张症-慢性阻塞性肺疾病重叠综合征患者的病原菌对比研究

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中国全科医学 2025年第6期28卷 729-736页

作者：吴俊张玲顾东伟郑磊赵祝香赵子文安徽省马鞍山市人民医院呼吸与危重症医学科 243000 安徽省马鞍山市人民医院检验科 243000 华南理工大学附属第二医院广州市第一人民医院呼吸与危重症医学科广东省广州市510180

背景我国慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)及支气管扩张症(简称支扩)患者数量庞大,均为高发病率、高病死率的慢性呼吸系统疾病。支气管扩张症-慢性阻塞性肺疾病重叠综合征(BCOS)作为一种特殊临床亚型虽常见但易被忽略。感染常是其急性恶化... 详细信息

背景我国慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)及支气管扩张症(简称支扩)患者数量庞大,均为高发病率、高病死率的慢性呼吸系统疾病。支气管扩张症-慢性阻塞性肺疾病重叠综合征(BCOS)作为一种特殊临床亚型虽常见但易被忽略。感染常是其急性恶化的诱因,但相关病原学研究相对匮乏。目的分析单纯性支气管扩张症(BE)与BCOS患者病原菌分布、耐药性特点,比较两者差异。为临床合理使用抗菌药物提供参考。方法选取2016年1月—2023年1月在马鞍山市人民医院呼吸与危重医学科住院的支扩患者584例为研究对象,根据是否合并慢阻肺将患者分为两组:BE组(未合并慢阻肺,335例)和BCOS组(合并慢阻肺,249例)。回顾性分析患者病原菌构成、药敏结果及变迁,分析两组病原菌分布及耐药性差异。结果584例支扩患者共分离299株病原菌,BE组分离病原菌146株,其中革兰阴性菌87株(59.59%),革兰阳性菌3株(2.05%),分枝杆菌9株(6.16%),真菌47株(32.19%);BCOS组分离病原菌153株,其中革兰阴性菌80株(52.29%),革兰阳性菌1株(0.65%),分枝杆菌2株(1.31%),真菌70株(45.75%);BCOS组患者白色念珠菌构成比高于BE组(χ^(2)=5.274,P=0.022)。两组铜绿假单胞菌耐药率分别为:亚胺培南10.64%、25.53%,哌拉西林他唑巴坦6.98%、15.91%,环丙沙星12.77%、21.28%,阿米卡星2.13%、2.13%;两组肺炎克雷伯菌耐药率分别为:亚胺培南0、14.29%,哌拉西林他唑巴坦0、14.29%,环丙沙星15.38%、35.71%,阿米卡星0、7.14%;BCOS组铜绿假单胞菌对氨苄西林舒巴坦耐药率低于BE组(P=0.026)。BCOS组患者产超广谱β内酰胺酶肠杆菌科(χ^(2)=4.357,P=0.037)及耐碳青霉烯类铜绿假单胞菌分离率均高于BE组(χ^(2)=5.593,P=0.018)。2016—2022年支扩患者分离铜绿假单胞菌株数均最高,呈先降后升趋势;分离肺炎克雷伯菌株数在2021、2022年明显升高,仅次于铜绿假单胞菌;2020—2022年分离分枝杆菌株数及2021—2022年分离曲霉菌株数均呈上升趋势。结论BCOS作为一种特殊表型,其病原菌分布、耐药性有其自身特点,值得关注。铜绿假单胞菌目前是BE及BCOS患者常见分离致病菌,近年来分离肺炎克雷伯菌株数仅次于铜绿假单胞菌。分离分枝杆菌、曲霉菌株数较前亦明显上升,应引起重视,尤其是BE患者。

关键词：支气管扩张症肺疾病,慢性阻塞性支气管扩张症-慢性阻塞性肺疾病重叠综合征铜绿假单胞菌肺炎克雷伯菌抗药性