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福尔马林致痛对大鼠脊髓背角神经元神经肽CCK表达的影响

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中国应用生理学杂志 2009年第2期25卷 217-220页

作者：李丽李洪安蒋金芳梁伟华司军强石河子大学医学院生理教研室新疆石河子832002 石河子大学民族高发病和地方病教育部重点实验室新疆石河子832002

目的:本实验观察胆囊收缩素(CCK)在福尔马林致痛大鼠感觉信息传递中的作用。方法:用免疫组织化学技术,分别观察阴性对照、生理盐水、福尔马林致痛后1 h和福尔马林致痛后3 h大鼠脊髓背角的感觉神经元神经肽CCK表达的变化。结果:大鼠足底... 详细信息

目的:本实验观察胆囊收缩素(CCK)在福尔马林致痛大鼠感觉信息传递中的作用。方法:用免疫组织化学技术,分别观察阴性对照、生理盐水、福尔马林致痛后1 h和福尔马林致痛后3 h大鼠脊髓背角的感觉神经元神经肽CCK表达的变化。结果:大鼠足底注射福尔马林1 h后,脊髓背角Ⅰ、Ⅱ层神经元CCK表达阳性细胞数明显增加(P<0.01),且注射侧阳性细胞数明显高于非注射侧。注射福尔马林1 h后,注射侧和非注射侧CCK表达阳性细胞的半定量光密度均值分别是0.397±0.014和0.295±0.007,差异有显著性(P<0.01);注射福尔马林3 h后,注射侧和非注射侧脊髓背角CCK表达阳性细胞的半定量光密度均值分别是0.366±0.009和0.303±0.005,差异仍有显著性(P<0.01)。结论:福尔马林致痛大鼠脊髓CCK表达阳性细胞的半定量光密度均值增加,进一步证实CCK在炎性痛信息传递通路的多个环节中参与了痛觉调制。

关键词： CCK 免疫组织化学脊髓背角大鼠

大鼠大脑中动脉阻塞模型皮层mRNAome、lncRNAome结构变异与表达分析

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山东大学学报（医学版） 2023年第11期61卷 27-37页

作者：袁珊杨玉莹许梅梅胡广泽唐娟高蕊石河子大学医学院生物化学教研室新疆地方与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832000

目的通过深度测序技术获得响应脑缺氧、缺血应激的mRNAome与lncRNAome结构变异与基因表达的基础数据,为缺血性脑卒中临床应用研究提供可用的靶标基因以及分子标志物。方法采用线栓法构建大鼠缺氧、缺血以及再灌注损伤模型,脑切片TTC染... 详细信息

目的通过深度测序技术获得响应脑缺氧、缺血应激的mRNAome与lncRNAome结构变异与基因表达的基础数据,为缺血性脑卒中临床应用研究提供可用的靶标基因以及分子标志物。方法采用线栓法构建大鼠缺氧、缺血以及再灌注损伤模型,脑切片TTC染色以及行为学评分法评估模型。采用深度测序技术对皮层样本全转录组进行测序,采用生物信息学方法分别鉴定与筛选转录本、转录本结构变异以及差异表达的基因,采用qRT⁃PCR方法验证差异基因的表达。结果应用Longa法构建大鼠MCAO模型。缺血缺氧处的脑组织在TTC染色后呈现苍白色,与非梗死区域的红润颜色形成鲜明的对比。高通量测序共产生108.54 G大小的测序数据,分别鉴定出30829个mRNA和31183个lncRNA转录本。MCAO组全转录组所产生的SNP、Indel总数显著低于对照Sham组,而mRNA的Indel数目则相对保守,在两组间差异并无统计学意义。mRNA可变剪切体数目显著多于ln⁃cRNA,但mRNA和lncRNA转录本的可变剪切体总数目在两组间差异无统计学意义。本研究筛选出2608个mRNA和551个lncRNA在两组间表达差异存在统计学意义,挑选了9个已被证明响应缺血缺氧而表达上升的已知基因作为双盲测试子,经检索后发现该9个上调基因全部落在2608个差异表达的基因数据集中,qRT⁃PCR结果进一步证实该9个基因表达量趋势亦同测序数据表达趋势,说明测序数据较为准确、可靠。结论一部分影响转录本加工与剪切的mRNA与lncRNA在缺氧缺血以及再灌注损伤后活化,可能抑制了部分转录本的转录以及RNA编辑与加工的能力,进而影响了缺血性脑卒中关键靶基因的表达。

关键词：大脑中动脉阻塞 mRNA lncRNA 结构变异可变剪切

一氧化氮对鱼藤酮诱导神经细胞损伤的调节作用

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石河子大学学报（自然科学版） 2021年第2期39卷 225-233页

作者：孙悦赵艳春张婷葛文文王铁鹏石河子大学医学院生物化学教研室/新疆地方与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832000

目的基于SH-SY5Y细胞,建立并优化鱼藤酮诱导的帕金森氏症细胞模型。方法一氧化氮是介导PD病变过程中多巴胺能神经元退变的主要影响因素之一,但采用试剂盒检测鱼藤酮刺激的细胞模型中并未检测到NO的明显改变,使用通用型及神经特异型一氧... 详细信息

目的基于SH-SY5Y细胞,建立并优化鱼藤酮诱导的帕金森氏症细胞模型。方法一氧化氮是介导PD病变过程中多巴胺能神经元退变的主要影响因素之一,但采用试剂盒检测鱼藤酮刺激的细胞模型中并未检测到NO的明显改变,使用通用型及神经特异型一氧化氮合酶抑制剂L-NAME及7-NI,均未对鱼藤酮的毒性作用产生任何调节作用。为了研究NO对于鱼藤酮神经损伤模型的调节作用,我们加入了NO供体GSNO与鱼藤酮共处理细胞。结果NO的加入使SH-SY5Y神经细胞转为坏死样死亡形态。GSNO与鱼藤酮共处理与单纯鱼藤酮刺激相比,SHSY5Y细胞中的酪氨酸羟化酶蛋白含量及多巴胺水平降低更显著,细胞线粒体膜电位下调幅度更大,α-突触核蛋白有更显著的增加。结论GSNO的加入能更有效的模拟帕金森氏症中神经元退变的主要特征,是对鱼藤酮诱导模型的有益补充。

关键词：一氧化氮鱼藤酮 SH-SY5Y细胞帕金森氏症神经细胞死亡

新疆哈萨克族原发性高血压患者外周血淋巴细胞微小RNA表达谱的生物信息学分析

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生理学报 2022年第5期74卷 751-762页

作者：王彦张亮杨瑞单莉娅王璐张莹莹李新芝马克涛石河子大学医学院新疆地方与民族高发病教育部重点实验室石河子832000 石河子大学医学院国家卫健委中亚高发病防治重点实验室石河子832000 石河子大学医学院生理学教研室石河子832000 石河子大学医学院病理生理学教研室石河子832000

本研究旨在探讨新疆哈萨克族原发性高血压患者和健康者外周血淋巴细胞中微小RNA(microRNA,miRNA)差异表达谱,为高血压的发生机制研究提供理论基础。将2016年4月至2019年5月新疆石河子大学医学院第一附属医院心内科住院部及门诊就诊的30... 详细信息

本研究旨在探讨新疆哈萨克族原发性高血压患者和健康者外周血淋巴细胞中微小RNA(microRNA,miRNA)差异表达谱,为高血压的发生机制研究提供理论基础。将2016年4月至2019年5月新疆石河子大学医学院第一附属医院心内科住院部及门诊就诊的30例哈萨克族原发性高血压患者作为高血压组,将30例哈萨克族健康者作为对照组。比较6个哈萨克族高血压患者与6个配对的正常血压者外周血淋巴细胞中miRNA表达谱,对差异表达的miRNA进行聚类、GSEA富集、靶基因预测和靶基因注释等生物信息学分析,并进行qRT-PCR验证。结果显示,与对照组相比,高血压组筛选出73个差异表达miRNA,其中39个miRNA表达上调,34个miRNA表达下调;通过GSEA富集分析共筛选出11个与高血压相关的miRNA,分别是hsamiR-100-5p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-299-5p、hsa-miR-299-3p、hsa-miR-296-5p、hsa-miR-196b-5p、hsa-miR-503-5p、hsamiR-628-5p、hsa-miR-874-3p、hsa-miR-543、hsa-miR-940。通过qRT-PCR检验发现,与对照组相比,高血压组hsa-miR-100-5p、hsa-miR-299-5p、hsa-miR-299-3p、hsa-miR-196b-5p、hsa-miR-503-5p、hsa-miR-628-5p、hsa-miR-543表达上调,hsamiR-150-5p、hsa-miR-296-5p、hsa-miR-874-3p、hsa-miR-940表达下调。基因芯片中的表达趋势和qRT-PCR验证结果一致。利用在线数据库对11个与高血压相关的miRNA进行预测,共预测出1647个靶基因;GO功能富集分析显示,在生物过程方面,高血压相关靶基因主要与神经系统发育、细胞定位、细胞代谢过程的调节、神经元的产生以及生物过程的正调控等方面相关;在细胞组成方面,主要与膜界细胞器、细胞质、细胞内膜结合的细胞器、突触部分、神经元部分、核质等相关;在分子功能方面,主要与蛋白质结合、转录调控区DNA结合、RNA聚合酶II调节区DNA结合、转录调节活性、离子结合等方面相关;KEGG富集分析显示p53信号通路、心肌细胞中的肾上腺素能信号、cAMP信号通路、内分泌和其他因子调节的钙重吸收、mTOR信号通路、醛固酮调节的钠重吸收、TGF-β信号通路可能与高血压的发生和发展相关。以上结果提示,哈萨克族原发性高血压患者与健康者外周血淋巴细胞中miRNA表达存在差异,筛选出的miRNA可能与哈萨克族原发性高血压的发生和发展相关,其在高血压中的作用机制有待进一步探索验证。

关键词：高血压哈萨克族淋巴细胞 microRNA 表达谱生物信息学分析

新疆贫困地区维吾尔族农民肥胖与血脂异常相关性

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中国生物化学与分子生物学报 2020年第1期36卷 71-78页

作者：孙珂许梦情王晓军曹冲尹启航王莉杰陶林赵娟黄瑾张文杰石河子大学医学院病理系新疆石河子832002 石河子大学新疆地方与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832002

肥胖及血脂异常研究很少涉及低收入地区。本研究分析了新疆低收入地区维吾尔族农民体质指数(BMI)、超重及肥胖与多种血脂分子异常的关系,探讨贫困地区筛查高危人群的适宜策略。在新疆喀什农村对3286名年龄≥18岁个体(男1585人,女1701人... 详细信息

肥胖及血脂异常研究很少涉及低收入地区。本研究分析了新疆低收入地区维吾尔族农民体质指数(BMI)、超重及肥胖与多种血脂分子异常的关系,探讨贫困地区筛查高危人群的适宜策略。在新疆喀什农村对3286名年龄≥18岁个体(男1585人,女1701人)进行问卷检查、体格检查及多项血脂分子的检测。数据采用Pearson相关性、ROC、Logistic回归等统计学分析。结果显示,在男女性中,随着BMI的增加,甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)的血浓度呈现递增趋势(P<0.01);男/女性TG、LDLC、TC血浓度均与BMI有显著相关性(P<0.01)。单项或多项血脂异常率均随BMI增加而上升;同一个体2个血脂指标同时异常的高危组合分别是TG+HDLC(高密度脂蛋白胆固醇)和TC+TG。Logistic联合多变量ROC曲线分析表明,单项指标HDLC(AUC=0.89)在血脂异常诊断中的权重最高;而组合指标TG+HDLC(AUC=0.95)的权重高于其它任何组合。单因素Logistic回归分析发现,超重和肥胖是代谢综合征相关血脂指标TG、TC和HDLC异常的危险因素(P<0.05)。上述结果表明,在南疆农村贫困维吾尔族人群中,男女性超重与肥胖者均与血脂指标异常升高相关;HDLC、TG和TC任意两个指标同时异常,为血脂异常的高危状态。肥胖伴有"TG+HDLC"异常升高可能是血脂异常相关疾病的"集合危险因素",在贫困地区具有临床筛查参考价值。

关键词：血脂身体质量指数低收入肥胖维吾尔族

基于网络药理学的罗布麻叶抗败血症作用及其机制研究

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西安交通大学学报（医学版） 2021年第3期42卷 484-490页

作者：欧阳远朔王艳明秦叙青蒋涵刘鲁倩何文君李新芝马克涛石河子大学医学院新疆地方与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832000 石河子大学医学院国家卫健委中亚高发病防治重点实验室新疆石河子832000 石河子大学医学院生理学教研室新疆石河子832000 石河子大学医学院病理生理学教研室新疆石河子832000

目的采用网络药理学方法研究罗布麻叶防治败血症(sepsis)的作用机制,探讨新疆民族医药治疗感染性疾病的多维研究方法,并对临床用药提供科学理论依据。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP数据库)及文献挖掘筛选罗布麻叶主要活性成分,通... 详细信息

目的采用网络药理学方法研究罗布麻叶防治败血症(sepsis)的作用机制,探讨新疆民族医药治疗感染性疾病的多维研究方法,并对临床用药提供科学理论依据。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP数据库)及文献挖掘筛选罗布麻叶主要活性成分,通过SwissTarget Prediction数据库进行靶点预测分析。通过Genecards疾病基因数据库筛选败血症相关靶点,Omicshare计算出交集靶点韦恩图,STRING蛋白相互作用数据库中构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,Ensembl基因名称转换对存在交集的蛋白靶点进行名称转化,再输入omicshare服务器进行基因本体论(GO)功能和京都基因和基因组数据库(KEGG)通路的动态富集分析,最后采用Cytoscape 3.6.0软件构建“罗布麻叶-活性成分-靶点-GO-KEGG”网络,探索罗布麻抗败血症的作用机制。结果罗布麻叶中的山柰酚、木犀草素、原花青素B1和谷甾醇可能通过AKT1、VEGFA、MAPK3、EGFR、SRC、PTGS2这些预测性生物靶标控制信号转导、调节激素水平、抗感染,进而治疗败血症;可以通过VEGF、EGFR、ErbB、HIF-1、Ras等富集通路发挥重要作用。结论罗布麻叶的多个活性成分可以通过多靶点、多通路抗败血症。

关键词：网络药理学罗布麻叶败血症靶点预测作用机制

2020年新疆生产建设兵团第八师女性HPV感染亚型分析

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中国艾滋病性病 2023年第6期29卷 719-720页

作者：妥静程豪政吴肇滏杨斌郑江沙文国邓文飞张庆黎潘泽民新疆地方与民族高发病教育部重点实验室、石河子大学医学院生物化学教研室新疆石河子832002 石河子大学医学院临床医学新疆石河子832002

宫颈癌(cervical cancer,CC)是一种严重危害女性身体健康的常见恶性肿瘤[1]。高危型人乳头瘤病毒(high risk human papilloma virus,hr HPV)是宫颈癌的主要病原体,子宫颈持续性hrHPV感染是发生宫颈癌的主要原因[2-3]。早期发现和预防已... 详细信息

宫颈癌(cervical cancer,CC)是一种严重危害女性身体健康的常见恶性肿瘤[1]。高危型人乳头瘤病毒(high risk human papilloma virus,hr HPV)是宫颈癌的主要病原体,子宫颈持续性hrHPV感染是发生宫颈癌的主要原因[2-3]。早期发现和预防已被证明可以成功地减缓宫颈癌前病变的进展[4]。

关键词：人乳头瘤病毒感染宫颈癌基因分型

Hcy及其代谢酶MTHFRC677T基因多态性与新疆汉族原发性高血压的相关性研究

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西安交通大学学报（医学版） 2014年第1期35卷 59-63,98页

作者：杨芳蔡伟娟胡娜宋雪王绍亮程江石河子大学医学院生物化学教研室新疆石河子832000 石河子大学新疆地方与民族高发病教育部重点实验室新疆石河子832000 石河子大学医学院第一附属医院检验科新疆石河子832000

目的探讨新疆石河子地区汉族人群原发性高血压(EH)与血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平及其代谢酶N5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因多态性的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的分析方法,检测了新疆汉族... 详细信息

目的探讨新疆石河子地区汉族人群原发性高血压(EH)与血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平及其代谢酶N5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因多态性的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的分析方法,检测了新疆汉族人群无血缘关系的200例EH患者(EH组)和200例对照者(NT组)Hcy代谢酶MTHFR C677T基因位点多态性,并进行基因分型;同时用全自动生化分析仪检测Hcy水平及相关生化指标。结果 Hcy水平在EH组和NT组差异有统计学意义(P0.05)。EH组和NT组中CC、CT、TT三种基因型的频率分别为19.5%、49.5%、31.0%和30.5%、44.5%、25.0%,其中以CT基因型突变频率最高;EH组中C和T等位基因为44.25%和55.75%,NT组中为52.75%和47.25%。两组中3种基因型总体频率分布差异有统计学意义(χ2=6.658,P=0.036);两组中等位基因频率比较差异有统计学意义(χ2=5.785,P=0.016)。在EH人群中MTHFR C677T基因型中CT型及TT型的Hcy水平显著高于CC型,差异有统计学意义。结论 Hcy水平升高可能是新疆汉族EH疾病发病的危险因素之一,其对EH的预测、诊断和治疗有一定的临床意义。Hcy代谢酶MTHFR C677T基因多态性可能与EH的发生发展相关,T等位基因可能是新疆汉族人群EH的遗传易感基因。

关键词： Hcy MTHFR C677T基因基因表达原发性高血压基因多态性新疆汉族

卡波氏肉瘤组织中差异表达miRNA靶基因预测及生物信息学分析

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病毒学报 2022年第4期38卷 880-888页

作者：罗婷赵娟潘洋洋袁武梅曾妍石河子大学医学院新疆地方与民族高发病教育部重点实验室石河子832000

卡波氏肉瘤(Kaposi sarcoma,KS)在全球范围内是人免疫缺陷病毒感染者第二易患的肿瘤。本研究旨在确定KS中差异表达的关键微小RNA(microRNA,miRNA)及其靶基因和相关途径,为深入了解该疾病的分子机制提供理论基础。本研究通过测序获得KS... 详细信息

卡波氏肉瘤(Kaposi sarcoma,KS)在全球范围内是人免疫缺陷病毒感染者第二易患的肿瘤。本研究旨在确定KS中差异表达的关键微小RNA(microRNA,miRNA)及其靶基因和相关途径,为深入了解该疾病的分子机制提供理论基础。本研究通过测序获得KS组织及瘤旁组织中的差异miRNA,借助starBase数据库预测差异表达miRNA的靶基因,同时用基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)、Reactome通路富集和转录因子注释分析差异miRNA的靶基因,最后用实时荧光定量PCR(Quantitative Real⁃time PCR,qRT⁃PCR)验证下调最明显的三个miRNA。结果显示,上、下调差异miRNA分别为39个和67个。GO和KEGG富集分析显示,上调的差异miRNA靶基因主要富集在组蛋白修饰、核染色质、DNA−结合转录激活因子活性等生物学功能,主要通过cAMP信号通路和长时程增效等通路参与KS的疾病进程;下调的差异miRNA主要与组蛋白修饰、细胞前沿和蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶的活性有关,主要通过FoxO及Hippo等信号通路参与KS的疾病进程。Reactome富集显示,差异miRNA多集中在受体酪氨酸激酶信号、信号转导疾病和PI3K⁃Akt等信号通路。转录因子注释结果显示,肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、叉头框转录因子O亚族1(Forkhead Box Protein O1,FOXO1)和叉头框转录因子O亚族3(Forkhead Box Protein O3,FOXO3)等转录因子可能和KS的发生发展密切相关。qRT⁃PCR结果显示,测序中下调最明显的三个miRNA在KSHV感染细胞中均显著下调。总之,本研究筛选出了KS组织中差异表达的miRNA,对其靶基因进行了一系列生物信息学分析,并初步发现miR⁃651⁃3p,miR⁃223⁃3p及miR⁃186⁃5p通过Hippo、FoxO及PI3K⁃AKT信号通路可能在KS的疾病进程中发挥重要作用。这些研究均为探寻KS的发病机制和靶向干预提供了有力的理论基础。

关键词：卡波氏肉瘤(KS) 肿瘤差异表达 miRNA 靶基因生物信息学