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藏波罗花叶绿体基因组分析

生物工程学报 2023年第7期39卷 2954-2964页

作者：张亚颖焦琬尧焦文睿乔天乐苏志扬益西卓玛封烁青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海西宁810016

藏波罗花(Incarvillea younghusbandii Sprague)是一种传统的补益类中药。其根作草药使用,用于滋补强壮,治产后少乳、久病虚弱、头晕、贫血等症。但目前关于藏波罗花分子遗传信息的研究很少。本研究基于高通量测序技术对藏波罗花叶绿体... 详细信息

藏波罗花(Incarvillea younghusbandii Sprague)是一种传统的补益类中药。其根作草药使用,用于滋补强壮,治产后少乳、久病虚弱、头晕、贫血等症。但目前关于藏波罗花分子遗传信息的研究很少。本研究基于高通量测序技术对藏波罗花叶绿体基因组进行测序、组装和注释,并对其序列特征、密码子偏好性、重复序列、系统发育和分化时间进行分析。结果表明,藏波罗花叶绿体基因组全长为159323 bp,包含1个大单拷贝区(80197 bp)、1个小单拷贝区(9030 bp)和2个反向重复区(35048 bp);共注释出120个基因,包括77个蛋白编码基因、8个rRNA基因和35个tRNA基因;密码子偏好性分析显示,AAA是藏波罗花叶绿体基因组中使用最频繁的密码子;从藏波罗花叶绿体基因组中共检测到42个简单重复序列(simple sequence repeats,SSR);系统发育分析表明,藏波罗花与密生波罗花(Incarvillea compacta)的亲缘关系最近,且在大概466万年前产生分化。本研究对藏波罗花相关资源的科学保护和开发具有重要的现实意义,也可以为后续角蒿属(Incarvillea)的物种鉴定、紫葳科(Bignoniaceae)的种群遗传多样性研究提供基本的遗传资源。

关键词：藏波罗花叶绿体基因组密码子偏好性简单重复序列系统发育分析分化时间估计

黄河源区高寒湿地土壤团聚体有机碳矿化特征及其温度敏感性

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草地学报 2024年

作者：宋娴柴瑜徐文印益西卓玛于金峰马昀峤李希来青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海大学农牧学院

探索土壤碳固存与全球气候变暖的关系是当前环境科学研究的热点问题。为厘清黄河源区高寒湿地土壤团聚体有机碳矿化特征，本研究利用碱液吸收法测定不同温度(5℃， 15℃， 25℃)条件下湿地土壤各粒径(>2 mm， 2 ～ 0.25mm和2 mm，2 ～ 0... 详细信息

探索土壤碳固存与全球气候变暖的关系是当前环境科学研究的热点问题。为厘清黄河源区高寒湿地土壤团聚体有机碳矿化特征，本研究利用碱液吸收法测定不同温度(5℃， 15℃， 25℃)条件下湿地土壤各粒径(>2 mm， 2 ～ 0.25mm和2 mm，2 ～ 0.25 mm)有机碳矿化速率显著高于微团聚体(P(>2 mm)>(<0.25 mm)。温度、粒径及其交互作用显著影响高寒湿地土壤团聚体有机碳矿化速率、累积矿化量和Q10(P<0.05)；研究表明温度升高降低了黄河源区高寒湿地土壤团聚体的固碳能力。

关键词：黄河源区温度团聚体有机碳矿化 Q

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藜麦WRI1基因家族鉴定与分析

分子植物育种 2022年

作者：万薇武学霞焦琬尧韩清硕封烁青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室

WRINKLED1 (WRI1)是一种APETALA2 (AP2)型转录因子，只存在于植物中，调控植物油脂的生物合成。藜麦作为世界上最古老的栽培作物之一，营养价值丰富，且脂肪含量较高。本研究利用生物信息学方法，在藜麦中鉴定出了15个具有两个AP2保守...

WRINKLED1 (WRI1)是一种APETALA2 (AP2)型转录因子，只存在于植物中，调控植物油脂的生物合成。藜麦作为世界上最古老的栽培作物之一，营养价值丰富，且脂肪含量较高。本研究利用生物信息学方法，在藜麦中鉴定出了15个具有两个AP2保守结构域的WRI1蛋白(CqWRI1-1～CqWRI1-15)，其氨基酸数目为244～567个，分子量为27.20～62.45 kD，为不稳定的亲水性蛋白。基于WRI1蛋白序列进行系统发育分析结果显示藜麦与大豆的WRI1亲缘关系最近。表达图谱结果显示，WRI1基因在干种子中的表达量高于其他组织，说明它们主要在藜麦干种子中发挥作用。因此WRI1基因与藜麦干种子脂肪含量密切相关。本研究对藜麦WRI1基因的主要功能以及在不同组织中的表达水平进行了探究，为藜麦油脂合成机制的研究提供重要的理论依据。

关键词：

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高寒地区栽培牧草化感效应缓解初探

草地学报 2022年第12期30卷 3326-3333页

作者：全小龙陈梦词段中华梁军乔有明青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海西宁810016

为研究探讨土壤微生物对化感效应的潜在作用,以高寒草地生态修复常用牧草为研究对象,通过室内生物学实验,测定种子发芽率及幼苗的苗高、根长和干重,计算分析化感综合效应。结果显示:以未灭菌土壤U100为基质的5种牧草种子发芽率均为最高... 详细信息

为研究探讨土壤微生物对化感效应的潜在作用,以高寒草地生态修复常用牧草为研究对象,通过室内生物学实验,测定种子发芽率及幼苗的苗高、根长和干重,计算分析化感综合效应。结果显示:以未灭菌土壤U100为基质的5种牧草种子发芽率均为最高,完全灭菌土壤U0的均为最低,不同比例未灭菌土壤U75,U50和U25则因牧草种子的不同而表现出不同差异;幼苗生长方面,‘青海’垂穗披碱草(Elymus nutans‘Qinghai’)、‘同德’老芒麦(Elymus sibiricus‘Tongde’)和‘青海’中华羊茅(Festuca sinensis Qinghai)幼苗苗高随灭菌土壤增加而减小;5种牧草幼苗的根长均在U100处理下最长;幼苗干重的变化趋势同苗高相似。未灭菌土壤对5种牧草的影响主要表现在根系生长和干重方面。研究证明在幼苗生长阶段土壤微生物对根系生长至关重要,土壤微生物能缓解化感效应提高种子发芽率,但对不同物种的影响存在差异。

关键词：人工草地种子发芽幼苗生长草地退化化感效应

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青海茄参光合相关抗寒基因的初步筛选

西南农业学报 2023年

作者：王成赵艳艳青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海大学农牧学院

【目的】为挖掘高海拔、低温度下生长的青海茄参(Mandragora chinghaiensis Kuang et A. M. Lu)中的光合相关抗寒基因。【方法】以0 ℃低温胁迫青海茄参为试验材料，通过光合生理试验寻找关键时间点，进而进行转录组学分析，筛选光合相... 详细信息

【目的】为挖掘高海拔、低温度下生长的青海茄参(Mandragora chinghaiensis Kuang et A. M. Lu)中的光合相关抗寒基因。【方法】以0 ℃低温胁迫青海茄参为试验材料，通过光合生理试验寻找关键时间点，进而进行转录组学分析，筛选光合相关抗寒基因并进行实时荧光定量(qRT-PCR)分析。【结果】净光合速率、气孔导度、蒸腾速率、最大荧光、光系统II最大光化学效率、光化学猝灭系数以及电子传递速率呈逐渐下降趋势，胞间CO2浓度、初始荧光和非光化学猝灭系数呈上升趋势，且根据光合参数及叶绿素荧光参数的变化综合分析出关键时间节点为12 h，根据转录组分析筛选出7个基因，通过qRT-PCR分析表明，CP43基因表达先上调后下调，整体呈上调趋势；CAB-8、CAB-11、CP24-10B、CH-02、FD-C2与PSI-D2基因表达先下调后上调，整体呈下调趋势。【结论】本研究结果为青海茄参筛选光合相关抗寒基因以及后续的转基因验证提供了理论支持，达到了筛选基因的主要目的。

关键词：青海茄参低温胁迫转录组学分析实时荧光定量

三江源国家级自然保护区森林型大型真菌物种多样性研究

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干旱区资源与环境 2022年第4期36卷 149-154页

作者：强婷婷白露超省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室西宁810016 青海大学农牧学院西宁810016

利用随机踩踏法采集三江源国家级自然保护区森林型大型真菌标本700余份,结合形态学和分子生物学的方法对该保护区内大型真菌资源进行鉴定。结果表明:该保护区内大型真菌共计2门5纲13目45科74属124种,其中子囊菌门3纲4目6科9属14种,担子... 详细信息

利用随机踩踏法采集三江源国家级自然保护区森林型大型真菌标本700余份,结合形态学和分子生物学的方法对该保护区内大型真菌资源进行鉴定。结果表明:该保护区内大型真菌共计2门5纲13目45科74属124种,其中子囊菌门3纲4目6科9属14种,担子菌门2纲9目39科65属110种;优势科3个,共35种,优势属3个,共25种;有毒菌31种,可食用真菌44种,食药用真菌资源7种,药用真菌19种,经济价值不明真菌资源23种。该研究为三江源国家级自然保护区森林型大型真菌资源分布和开发利用提供基础数据。

关键词：大型真菌物种多样性三江源

2株萎缩芽孢杆菌的生物活性测定及对高寒牧草的促生效应

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分子植物育种 2024年

作者：王添谢永丽陈兰杨雪高英杨杰青海大学农牧学院青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室

利用适应高原生境的根际促生菌促进牧草生长、提高牧草生物量是高寒草地可持续发展的有效途径之一。本研究以分离自青海海西州柴旦湖盐碱地芨芨草(Achnatherum splendens)和乌兰县柯柯盐湖盐碱地白刺(Nitraria tangutorum)根际的萎缩芽... 详细信息

利用适应高原生境的根际促生菌促进牧草生长、提高牧草生物量是高寒草地可持续发展的有效途径之一。本研究以分离自青海海西州柴旦湖盐碱地芨芨草(Achnatherum splendens)和乌兰县柯柯盐湖盐碱地白刺(Nitraria tangutorum)根际的萎缩芽孢杆菌(Bacillus atrophyticus)菌株CDHF2和KKBC1为实验菌株，测定菌株对高寒牧草的促生效应；平板对峙法测定菌株拮抗病原真菌活性；阿须贝(Ashby)无氮培养基检测菌株固氮活性；CMC法检测菌株解纤维素活性；测定菌株耐逆性。结果表明：菌株CDHF2对燕麦幼苗具有促生效应，与对照相比，平均株高、根长、鲜重分别增加69.91%、36.65%、40.74%；菌株KKBC1可促进垂穗披碱草幼苗生长，与对照相比，平均株高、根长、鲜重分别增加37.54%、62.75%、66.67%。2株菌株均对锐顶镰孢菌(Fusarium acuminatum)表现出显著拮抗活性(抑菌圈直径>10 mm)；可在Ashby无氮培养基上正常生长，表明有固氮活性；在CMC平板上形成透明圈，具有降解纤维素活性；均能在含NaCl浓度为13%的LB固体培养基中生长，在pH值7～11范围内出现菌落，在14 ℃和10 ℃的低温条件下可产生少量菌落，具有耐盐碱及耐低温能力。菌株CDHF2和KKBC1在高寒草地植被恢复、饲草料加工生产中具有一定的应用潜力。

关键词：萎缩芽孢杆菌燕麦垂穗披碱草生物活性

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蚕豆耐旱机制研究进展

分子植物育种 2023年第4期21卷 1206-1216页

作者：武学霞李兰平刘玉皎青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室西宁810000

蚕豆因其蛋白质含量高,是人类和动物的重要植物蛋白来源。降水不均和全球气候变暖导致世界各地干旱频发,严重影响蚕豆生长发育并导致其产量下降、品质降低。因此,耐旱蚕豆品种的培育已成为当前亟待解决的问题,而蚕豆耐旱机制的研究尤其... 详细信息

蚕豆因其蛋白质含量高,是人类和动物的重要植物蛋白来源。降水不均和全球气候变暖导致世界各地干旱频发,严重影响蚕豆生长发育并导致其产量下降、品质降低。因此,耐旱蚕豆品种的培育已成为当前亟待解决的问题,而蚕豆耐旱机制的研究尤其是耐旱基因的挖掘将为耐旱品种的培育奠定基础。因此,通过对蚕豆干旱胁迫下形态、生理生化、转录组及蛋白质组变化的研究展开讨论,可为蚕豆抗旱基因鉴定及抗旱遗传育种工作提供理论依据。

关键词：蚕豆(Vicia faba L.) 干旱胁迫生理生化转录组蛋白组

乐都紫皮大蒜4种病毒多重RT-PCR检测技术的建立

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2023年第1期51卷 120-129页

作者：张超董怡衡岳苗卫唯张谦王乐尹卫王煜伟梁健青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海西宁810016

【目的】建立乐都紫皮大蒜4种病毒的多重RT-PCR快速检测方法,为大蒜病毒病病原鉴定、脱毒效果验证等提供技术支撑。【方法】根据乐都紫皮大蒜RNA全长转录组测序结果,分别设计洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus,OYDV)、大蒜潜隐病毒... 详细信息

【目的】建立乐都紫皮大蒜4种病毒的多重RT-PCR快速检测方法,为大蒜病毒病病原鉴定、脱毒效果验证等提供技术支撑。【方法】根据乐都紫皮大蒜RNA全长转录组测序结果,分别设计洋葱黄矮病毒(onion yellow dwarf virus,OYDV)、大蒜潜隐病毒(garlic latent virus,GLV)、大蒜D病毒(garlic virus D,GarVD)和大蒜X病毒(garlic virus X,GarVX)4种病毒的外壳蛋白特异性引物,筛选不同引物,优化引物用量、模板用量、退火温度等条件,并进行了多重RT-PCR的灵敏度检测和12份引进栽培大蒜种质资源的病毒检测。【结果】通过优化筛选,在一个PCR反应体系中实现了OYDV(1232 bp)、GLV(831 bp)、GarVD(506 bp)和GarVX(116 bp)4种病毒的多重检测,最优反应条件为退火温度55℃,模板用量2.5μL,混合引物用量1.0μL。多重RT-PCR的灵敏度略低于单一RT-PCR。对引进的12份栽培大蒜资源进行4种病毒的多重RT-PCR检测发现,有5份资源存在4种病毒,4份资源存在2种病毒,3份资源存在1种病毒。对7份资源中经多重PCR未检测到的病毒,使用单一RT-PCR进行检测和验证发现,除1份内蒙古资源(NMG)的1种病毒(GarVX)外,多重RT-PCR结果与单一RT-PCR检测结果一致。【结论】本研究建立的大蒜多重RT-PCR体系可靠性强,可用于大蒜病毒的检测与防控。

关键词：乐都紫皮大蒜病毒检测多重RT-PCR 洋葱黄矮病毒大蒜潜隐病毒大蒜D病毒大蒜X病毒