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基于铜死亡相关基因构建结肠腺癌临床预后模型并验证

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牡丹江医学院学报 2024年第3期45卷 31-42页

作者：林昕乐钱格格杨亚雯卢广涛王俊杰章雯陶香香陈麒霖赵森陈冰皖南医学院病理教研室安徽医学高等专科学校基础医学院安徽芜湖241002

目的旨在构建结肠腺癌(colonic adenocarcinoma,COAD)中铜死亡相关基因(Cuproptosis-related genes,CRGs)的预后模型,探讨CRGs在COAD中的表达与预后的关系。方法从TCGA数据库下载了正常和COAD患者的转录组和临床数据,并从GEO数据库下载... 详细信息

目的旨在构建结肠腺癌(colonic adenocarcinoma,COAD)中铜死亡相关基因(Cuproptosis-related genes,CRGs)的预后模型,探讨CRGs在COAD中的表达与预后的关系。方法从TCGA数据库下载了正常和COAD患者的转录组和临床数据,并从GEO数据库下载数据集GSE39582作为外部验证集。基于铜死亡相关基因表达量,对TCGA数据进行共识聚类以确定新的肿瘤亚型。采用单因素Cox回归分析、LASSO回归分析筛选预后基因并构建预后风险模型。并通过Kaplan-Meier生存分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)和一致性指数(concordance index,C-index)对模型进行评价。用GSE44001数据集对模型进行外部验证。基于风险评分及临床因素构建列线图,预测患者的生存率。并进行免疫浸润、GSEA分析、免疫检查点、药敏分析、肿瘤微环境和干细胞指数的研究,系统地阐述COAD中CRGs和免疫的相关性。结果21个CRGs在COAD组织及正常组织中差异表达。单变量Cox回归及Lasso回归分析确定了五个预后相关基因(SDHB,CCS,DLAT,FDX1,CP)并构建模型。Kaplan-Meier分析表明,高风险患者OS显著低于低风险患者(P学意义,模型具有一定的准确性。一致性分析和ROC结果表明,列线图模型有较好的预后预测准确性。这5个CRGs主要参与线粒体、免疫应答和代谢途径,是COAD预后的独立因素,并与免疫细胞浸润、免疫检查点以及肿瘤微环境和干细胞指数密切相关。结论构建了5个铜死亡相关基因的结肠腺癌预后模型,有可能作为未来临床实践中有效的预后标志物。

关键词：铜死亡结肠腺癌预后列线图免疫浸润药物敏感性

水疱性口炎病毒对小鼠乳腺癌4T1细胞荷瘤小鼠抗肿瘤免疫、移植瘤生长与肺转移的影响

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中国肿瘤生物治疗杂志 2024年第5期31卷 452-461页

作者：李玉迁徐庆胜魏洪王皞王硕石蒋立娜袁心怡贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州医科大学基础医学国家级实验教学中心贵州省人民医院急诊外科贵州中医药大学第二附属医院红岩院区中心实验室贵州医科大学临床医学院

目的：探究野生型水疱性口炎病毒印第安纳株(VSV-IN)对小鼠三阴性乳腺癌4T1细胞移植模型小鼠的免疫调节及肿瘤转移的影响。方法：VSV以MOI=1、MOI=10、MOI=100感染4T1细胞12、24、48 h后，CCK-8法检测4T1细胞死亡率，划痕愈合实验检测... 详细信息

目的：探究野生型水疱性口炎病毒印第安纳株(VSV-IN)对小鼠三阴性乳腺癌4T1细胞移植模型小鼠的免疫调节及肿瘤转移的影响。方法：VSV以MOI=1、MOI=10、MOI=100感染4T1细胞12、24、48 h后，CCK-8法检测4T1细胞死亡率，划痕愈合实验检测细胞迁移能力，qPCR检测细胞中E-cadherin、MMP-2、MMP-9 mRNA的表达。于雌性BALB/c小鼠脂肪垫接种1×106个/mL的4T1细胞0.1 m L，构建4T1细胞荷瘤小鼠模型，待小鼠肿瘤体积达200 mm3，分别向移植瘤内注射PBS、紫杉醇(TAX)(15 mg/kg)、VSV-IN(1×106 pfu/只)，每周1次。给药4次后，处死小鼠、剥离完整移植瘤组织，测量肿瘤体积及质量，肺组织病理切片经H-E染色后观察肿瘤肺部转移结节，流式细胞术检测脾组织中T细胞亚群比例，ELISA法检测小鼠血清IL-6及TNF-α水平，利用GEPIA在线分析乳腺肿中迁移相关蛋白mRNA的表达，免疫组化法检测肿瘤中MMP-2、MMP-9与E-cadherin的表达，利用蛋白-蛋白对接技术预测VSV-IN的G蛋白、M蛋白与ERK2、E-cadherin的亲和力。结果：经MOI=10、100的VSV-IN处理48 h后，4T1细胞死亡率显著高于对照组(均P免疫及调控迁移相关蛋白表达有关。

关键词：野生型水疱性口炎病毒三阴性乳腺癌 4T1细胞迁移蛋白-蛋白对接

子宫内膜癌肿瘤微环境中预后相关基因的生物信息学分析及表达谱分析

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包头医学院学报 2024年第7期40卷 1-8页

作者：丁彩云马强丁锦王海华李晶孙丽皖南医学院基础医学院安徽芜湖241002 皖南医学院弋矶山医院超声医学科皖南医学院弋矶山医院妇产科

目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因。方法:下载获取TCGA数据库中552例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基... 详细信息

目的:结合生物信息学分析和PCR表达验证,探索子宫内膜癌(endometrial carcinoma,EC)肿瘤微环境中的预后关键基因。方法:下载获取TCGA数据库中552例EC患者的基因表达数据,应用R软件ESTIMATE算法进行免疫评分和基质评分,筛选表达差异基因。多种算法对差异基因的预后情况和相关通路进一步探索。PCR实验分析差异基因在细胞系中的表达相关性。结果:Cox回归分析和KM生存分析提示CCR4(C-C motif chemokine receptor 4,CCR4)为潜在预后相关基因。GSEA(gene set enrichment analysis,GSEA)、KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析结果发现,CCR4在免疫应答-激活细胞表面受体信号通路中显著富集。RT-qPCR结果表明,在细胞水平,CCR4在肿瘤组的表达显著高于非肿瘤组。结论:子宫内膜癌的肿瘤微环境中存在免疫浸润,CCR4有望成为新的子宫内膜癌诊断标记物。

关键词：肿瘤微环境子宫内膜癌生物信息学分析预后基因

T细胞免疫反应载体疫苗在人类疾病预防和治疗中的应用

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合成生物学 2024年第2期5卷 294-309页

作者：江莎莎王晨路冉刘俸君李俊王斌青岛大学基础医学院病原生物学系山东青岛266000 北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科北京100021 青岛大学基础医学院特种医学系山东青岛266000

人类疾病,特别是传染病和癌症,对公共卫生安全和全球经济构成前所未有的挑战。预防和治疗性疫苗的开发是应对人类疾病的优先对策。本文综述了疫苗载体的免疫学原理、T细胞载体疫苗设计策略及疫苗研究进展,为新型疫苗的设计提供新的思路... 详细信息

人类疾病,特别是传染病和癌症,对公共卫生安全和全球经济构成前所未有的挑战。预防和治疗性疫苗的开发是应对人类疾病的优先对策。本文综述了疫苗载体的免疫学原理、T细胞载体疫苗设计策略及疫苗研究进展,为新型疫苗的设计提供新的思路。T细胞可以在机体发生感染后分化成不同的效应T细胞群,它们可以起到清除病原体的作用,关于效应T细胞功能和机制的研究对于设计能够引发基于T细胞免疫的疫苗至关重要。目前很多病毒(例如HIV、HCMV感染)和肿瘤疫苗的研发都侧重于T细胞类疫苗,在所有疫苗种类中,激活T细胞免疫反应的载体疫苗具有显著优势。许多来源的载体,包括病毒载体、细菌载体和核酸载体,它们在抗原提呈能力、免疫原性和保护效力方面都有良好的表现。此外,还总结了T细胞载体疫苗设计的策略,包括确定适当的抗原提呈途径和载体递送途径、确保生物安全性、如何选择合适的疫苗的载体、各种载体疫苗的优缺点等,尤其是mRNA疫苗在应对新冠疫情中发挥了重要的作用。疫苗载体的技术进步将会加速新型疫苗的研发,并且能促进人们对突发公共卫生事件的应对。

关键词： T细胞疫苗载体免疫抗原提呈传染病肿瘤

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人体微生态在医学微生物学教学中的应用

基础医学教育 2024年第4期26卷 275-280页

作者：刘婧方文娟刘毅王翠平孙文文聂志妍上海健康医学院医学技术学院微生物与免疫教研室上海201318

我国面临着创新型医学人才培养的迫切需求。随着微生物组学、代谢组及转录组等微生态学领域新技术的出现,人们对微生态系统的研究有了新的进展。微生态学的发展对医学微生物学的教学提出了更高的要求。教师在医学微生物学的教学中融合... 详细信息

我国面临着创新型医学人才培养的迫切需求。随着微生物组学、代谢组及转录组等微生态学领域新技术的出现,人们对微生态系统的研究有了新的进展。微生态学的发展对医学微生物学的教学提出了更高的要求。教师在医学微生物学的教学中融合微生态教育可以使医学生更全面地了解感染性疾病的病因、菌群与宿主的互相作用以及深入探索病原菌的致病机制,旨在为教学改革开辟新的思路。

关键词：医学微生物学人体微生态肠道菌群教学改革疾病防治

猪弓形虫病阻断ELISA方法的建立及初步应用

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中国动物传染病学报 2024年第3期32卷 79-87页

作者：潘珂张静莫心宇申邦方瑞胡敏赵俊龙周艳琴华中农业大学动物医学院农业微生物学国家重点实验室武汉430070 湖北省预防兽医学重点实验室武汉430070

本研究利用制备的GRA7单克隆抗体为基础建立猪弓形虫病的阻断ELISA方法。以rGRA7重组蛋白免疫小鼠,取脾细胞进行细胞融合,筛选出4株能够稳定产生单克隆抗体的阳性单克隆细胞株。经对此单克隆抗体进行IFA和Western blot检测确认成功制备G... 详细信息

本研究利用制备的GRA7单克隆抗体为基础建立猪弓形虫病的阻断ELISA方法。以rGRA7重组蛋白免疫小鼠,取脾细胞进行细胞融合,筛选出4株能够稳定产生单克隆抗体的阳性单克隆细胞株。经对此单克隆抗体进行IFA和Western blot检测确认成功制备GRA7蛋白的单克隆抗体后,以重组蛋白为包被抗原对阻断ELISA方法进行优化后,经过重复性、交叉性、符合性实验验证本方法具有可重复性,与MAT符合性高。初步应用于288份临床样品检测,检出率为11.46%,与MAT检测结果重合率为84.8%。本研究成功制备弓形虫GRA7蛋白的单克隆抗体,并建立了一种猪弓形虫病的阻断ELISA方法,为弓形虫病的检测提出了新的方案。

关键词：弓形虫 GRA7蛋白单克隆抗体阻断ELISA

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β-羟基丁酸改善β淀粉样蛋白1-42诱导小鼠海马神经元HT22细胞的能量障碍

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中国组织工程研究 2025年第13期29卷 2713-2719页

作者：叶育采付朝晶李燕李欣儒柴世凡蔡红艳王昭君山西医科大学基础医学院生理学系细胞生理学教育部重点实验室山西省太原市030000 山西医科大学医学科学院山西省太原市030000 山西医科大学基础医学院微生物与免疫学教研室山西省太原市030000

背景:阿尔茨海默病患者存在严重的脑能量障碍,近年来基于酮体干预的脑能量拯救策略在阿尔茨海默病的治疗中越来越受到重视。目的:探讨β-羟基丁酸能否改善β淀粉样蛋白1-42(β-amyloid protein 1-42,Aβ_(1-42))诱导的小鼠海马神经元HT2... 详细信息

背景:阿尔茨海默病患者存在严重的脑能量障碍,近年来基于酮体干预的脑能量拯救策略在阿尔茨海默病的治疗中越来越受到重视。目的:探讨β-羟基丁酸能否改善β淀粉样蛋白1-42(β-amyloid protein 1-42,Aβ_(1-42))诱导的小鼠海马神经元HT22细胞能量障碍。方法:将HT22细胞分为4组,分别为对照组、β-羟基丁酸组、Aβ_(1-42)组、Aβ_(1-42)+β-羟基丁酸组。使用相应试剂盒检测HT22细胞的存活率、ATP水平、α-酮戊二酸脱氢酶活性、Na^(+)K^(+)-ATP酶活性、线粒体膜电位及活性氧水平。结果与结论:与对照组相比,Aβ_(1-42)组HT22细胞的存活率、ATP水平、α-酮戊二酸脱氢酶活性、Na^(+)K^(+)-ATP酶活性、线粒体膜电位均显著降低(P生物能量功能和细胞存活率,最终改善了Aβ_(1-42)诱导的HT22细胞能量障碍。

关键词：阿尔茨海默病 HT22细胞 β-羟基丁酸线粒体生物能量功能能量障碍三磷酸腺苷

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通过基于功能微生物的项目式学习来提升本科生科研素养

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微生物学通报 2024年第4期51卷 1355-1362页

作者：崔泽林姚玉峰刘畅李擎天郭晓奎冯婷婷上海交通大学医学院附属第一人民医院检验医学中心上海201620 上海交通大学医学院免疫学与微生物学系上海200025 上海交通大学医学院附属瑞金医院检验系上海200025 上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院上海200025 上海交通大学医学院附属第一人民医院临床药学科上海201620

本科生科研素养的养成对其继续深造具有重要意义,如何有效培养学生的科研能力并使其养成良好的科研素养成为当下高等教育亟须探究的重要议题。本研究尝试通过基于学生的兴趣爱好对具有一定知识背景的本科生进行分组,以小组形式分别对某... 详细信息

本科生科研素养的养成对其继续深造具有重要意义,如何有效培养学生的科研能力并使其养成良好的科研素养成为当下高等教育亟须探究的重要议题。本研究尝试通过基于学生的兴趣爱好对具有一定知识背景的本科生进行分组,以小组形式分别对某特定生境来源微生物的分离、筛选、鉴定及其功能进行项目式研究来培养学生的科研素养。这种以学生为主体的自主研究能够激发学生主动学习热情,培养学生学习的自主性和科研素养。研究发现对该类项目的研究首先能涵盖传统实验课程所涉及的基础实验内容,有助于微生物实验基本操作的系统掌握;其次,以小组的方式使得学生的主观能动性和团队协作能力得到发挥,各小组均能分离到相关目标微生物,并能完成对目标微生物基本特性和功能的研究;最后,能就目标微生物相关领域某主题发表综述论文,有效培养学生的科研素养。由此可见,特殊生境功能微生物分离、筛选及鉴定的项目式研究不失为高校本科生科研素养培养的重要题材。

关键词：功能微生物分离和鉴定项目式学习科研素养

内体分选转运复合体:确保有丝分裂正确进行的分子机器

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中国医学科学院学报 2024年第2期46卷 287-292页

作者：高吴陆怡杨玉张鹏霞商宇佳木斯大学基础医学院微生态-免疫调节网络与相关疾病重点实验室黑龙江佳木斯154007

有丝分裂是真核细胞增殖的重要环节。内体分选转运复合体是与膜剪切过程密切相关的多蛋白复合体,其功能涉及内体成熟、病毒出芽、自噬等过程,其结构和功能异常与癌症等疾病发生发展密切相关。本文总结了内体分选转运复合体在细胞有丝分... 详细信息

有丝分裂是真核细胞增殖的重要环节。内体分选转运复合体是与膜剪切过程密切相关的多蛋白复合体,其功能涉及内体成熟、病毒出芽、自噬等过程,其结构和功能异常与癌症等疾病发生发展密切相关。本文总结了内体分选转运复合体在细胞有丝分裂不同阶段所发挥的作用,以及内体分选转运复合体调控有丝分裂作用在疾病方面的研究进展。

关键词：有丝分裂内体分选转运复合体纺锤体检查点癌症

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