检索结果-南通市图书馆

自转录活性调节区测序技术在增强子发现研究中的应用

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2024年第8期46卷 589-602页

作者：王纪龙李青战廷正广西医科大学寄生虫学教研室南宁530021 广西医科大学细胞生物学教研室南宁530021 广西高校区域性疾病基础研究重点实验室(广西医科大学) 南宁530021

自转录活性调节区测序(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq)是一种可发现并同时验证全基因组增强子活性的高通量测序方法。其原理为:将待验证序列插入质粒载体并电转入细胞中,该序列在作为增强子提高靶... 详细信息

自转录活性调节区测序(self-transcribing active regulatory region sequencing,STARR-seq)是一种可发现并同时验证全基因组增强子活性的高通量测序方法。其原理为:将待验证序列插入质粒载体并电转入细胞中,该序列在作为增强子提高靶基因转录的同时,其本身也作为靶基因被增强转录。通过对转录组进行测序,并对比未插入片段的测序结果,可获得增强子在基因组位置及活性的信息。在传统增强子研究方法中,通过对染色质开放区域和转录活性区域进行测序以预测增强子,但只能逐一验证预测结果,无法高通量验证增强子活性。STARR-seq技术解决了上述缺陷,可在对全基因组增强子高通量挖掘的同时,对其活性进行可靠的验证。自STARR-seq技术发明以来,已被广泛运用于不同物种与细胞中的增强子发现及活性验证研究。本文对传统增强子预测方法以及STARR-seq技术的基本原理、发展历史和具体运用进行了介绍,并对其发展前景进行展望,以期为后续增强子相关领域研究人员提供参考。

关键词：自转录活性区域测序增强子转录调控单核苷酸多态性

同方期刊数据库

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

乳酸调控巨噬细胞功能促进登革病毒2型感染

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 396-405页

作者：胡欢覃燕春黄贞植周璐吴家红商正玲贵州医科大学基础医学院免疫学教研室安顺550025 贵州医科大学基础医学院寄生虫教研室安顺550025

目的探究外源性乳酸对Raw264.7细胞、小鼠骨髓来源巨噬细胞(mouse bone marrow-derived macrophages,BMDMs)及THP-1细胞中登革病毒2型(dengue virus type 2,DENV-2)复制的影响及乳酸与细胞活化之间的关系。方法培养和诱导BALB/c小鼠骨... 详细信息

目的探究外源性乳酸对Raw264.7细胞、小鼠骨髓来源巨噬细胞(mouse bone marrow-derived macrophages,BMDMs)及THP-1细胞中登革病毒2型(dengue virus type 2,DENV-2)复制的影响及乳酸与细胞活化之间的关系。方法培养和诱导BALB/c小鼠骨髓中的BMDMs,流式细胞术检测F4/80+CD11b+细胞纯度。qRT-PCR检测不同时间点DENV-2感染BMDMs中葡萄糖转运体1(glucose transporter type 1,GLUT1)、己糖激酶2(hexokinase 2,HK2)、乳酸转运体4(monocarboxylate transporters 4,MCT4)的mRNA表达水平,比色法检测细胞上清液中乳酸含量。使用CCK-8法评估不同浓度乳酸对Raw264.7细胞、BMDMs及THP-1细胞活力的影响,qRT-PCR检测不同浓度乳酸对不同MOI DENV-2感染细胞中病毒E基因、CD163、TGF-β、CD86、视黄酸诱导基因Ⅰ(retinoic acid-inducible geneⅠ,RIG-Ⅰ)、IFN-β、干扰素刺激基因15(interferon-stimulated gene 15,ISG15)及ISG56的mRNA表达水平,流式细胞术检测CD86和CD206蛋白的表达。结果BMDMs纯度为(87.53±1.66)%。DENV-2(MOI=3)感染BMDMs后,GLUT1 mRNA转录水平在12 h一过性增高,在24 h降低(P0.05)。结论本研究发现外源性乳酸能促进DENV-2在人源及鼠源巨噬细胞中的感染,该现象与细胞M2型极化有关。

关键词：乳酸巨噬细胞登革病毒病毒复制 M2型极化干扰素信号通路

胆固醇-25-羟化酶对乙脑病毒复制的影响及机制研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国热带医学 2024年第5期24卷 511-518页

作者：邓东青龙启舟聂映吴家红贵州医科大学人体寄生虫学教研室贵州贵阳550025 贵州省现代病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025

目的探究胆固醇-25-羟化酶(cholesterol 25-hydroxylase,CH25H)对流行性乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)复制的影响及其作用机制,为抗JEV药物的研发提供靶标分子及理论支撑。方法通过实时荧光定量PCR验证CH25H能否在人... 详细信息

目的探究胆固醇-25-羟化酶(cholesterol 25-hydroxylase,CH25H)对流行性乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)复制的影响及其作用机制,为抗JEV药物的研发提供靶标分子及理论支撑。方法通过实时荧光定量PCR验证CH25H能否在人的肾细胞HEK293T中被Ⅰ型干扰素及JEV诱导表达。用不同浓度的α干扰素(interferonα,IFN-α)处理HEK293T细胞,12 h后收取细胞,通过实时荧光定量PCR检测CH25H的表达情况;使用不同感染复数(multiplicity of infection,MOI)的JEV感染HEK293T细胞,24 h后收取细胞,通过实时荧光定量PCR检测CH25H mRNA表达水平的变化。利用分子克隆技术构建真核表达质粒pcDNA3.1-CH25H-3×HA,在HEK293T细胞中过表达CH25H,通过实时荧光定量PCR、病毒空斑实验分析CH25H对JEV复制的影响;通过CCK8实验获得CH25H的酶活性产物25-羟基胆固醇(25-hydroxycholesterol,25HC)在HEK293T、BHK21及Vero细胞中的合理使用浓度,并在上述细胞中利用实时荧光定量PCR、病毒空斑实验、免疫荧光实验、病毒吸附实验进一步研究25HC在JEV复制中的作用及其对JEV生命周期的影响;利用点突变的方法构建CH25H酶活性缺失的突变体CH25HM,并转染至HEK293T细胞中,JEV感染24 h后,通过qPCR、病毒空斑实验揭示CH25H影响JEV复制是否依赖于其酶活性。结果CH25H可在HEK293T细胞中被IFN-α诱导表达,但在JEV感染后,细胞中CH25H mRNA表达水平被下调。在HEK293T细胞中过表达CH25H显著的抑制JEV复制。CH25H的酶活性产物25HC在HEK293T、BHK21及Vero细胞中均明显抑制JEV的复制;病毒吸附实验结果显示,25HC可通过影响病毒吸附过程,进而抑制JEV复制;在HEK293T细胞中过表达酶活性缺失的突变体CH25HM,也能显著的抑制JEV复制。结论JEV感染下调干扰素刺激基因CH25H的表达,而CH25H以依赖于酶活性及非酶活性方式发挥抗JEV复制的作用。

关键词：乙型脑炎病毒胆固醇-25-羟化酶 25-羟基胆固醇干扰素刺激基因病毒复制

白纹伊蚊唾液蛋白rAlb-34k2-1诱导的特异性细胞免疫应答对BMDM细胞中DENV-2复制的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国热带医学 2024年第8期24卷 907-913页

作者：覃燕春李莹胡欢周璐黄贞植吴家红商正玲贵州医科大学基础医学院免疫学教研室贵州贵阳561113 贵州医科大学基础医学院寄生虫学教研室贵州贵阳561113

目的体外探究白纹伊蚊唾液蛋白rAlb-34k2-1诱导的小鼠脾淋巴细胞特异性免疫应答对2型登革病毒(dengue virus type 2,DENV-2)感染小鼠骨髓来源巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages,BMDM)的影响。方法采用CCK-8法分析rAlb-34k2-1蛋白对免疫/未免疫小鼠脾细胞的特异性增殖反应;制备荷载蚊唾液蛋白rAlb-34k2-1、rAalb_CTL1蛋白(蚊唾液C型凝集素蛋白)的抗原提呈细胞(antigen presenting cell,APC),与免疫/未免疫小鼠脾淋巴细胞进行混合淋巴细胞培养,取细胞培养上清处理DENV-2感染的BMDM细胞,实时荧光定量逆转录PCR(real-time quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)检测DENV-2的核酸变化,分析rAlb-34k2-1蛋白诱导的特异性T淋巴细胞应答对BMDM内DENV-2复制的影响。将免疫/未免疫小鼠脾淋巴细胞与rAlb-34k2-1蛋白预处理的感染BMDM进行共培养,通过qRT-PCR检测培养48、72 h后DENV-2 E基因的表达,分析免疫/未免疫小鼠淋巴细胞对预处理的BMDM中DENV-2复制的影响。结果小鼠脾细胞体外特异性增殖实验显示,与未免疫组比较,rAlb-34k2-1蛋白能导致免疫小鼠脾细胞特异性增殖,刺激指数(stimulation index,SI)>2,P究蚊唾液蛋白诱导免疫效应在蚊媒病毒致病中的作用提供前期实验基础。

关键词： rAlb-34k2-1蛋白 2型登革病毒细胞免疫应答

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

微小膜壳绦虫对ICR小鼠肠道菌群的影响

黑龙江畜牧兽医 2024年第17期 8-12,108-110页

作者：李小毛赵敬王鸿雁张科牟荣贵州医科大学基础医学院人体寄生虫学教研室贵阳550025 贵州医科大学现代病原生物学特色重点实验室贵阳550025

为了探究微小膜壳绦虫(Hymenolepis nana)对ICR小鼠肠道菌群的影响,试验采用随机分组方式将30只ICR小鼠分为感染组和对照组,每组15只,感染组灌胃感染0.2 mL鉴定和纯化后的微小膜壳绦虫虫卵配制成的虫卵悬浊液(浓度为2500个/mL),对照组... 详细信息

为了探究微小膜壳绦虫(Hymenolepis nana)对ICR小鼠肠道菌群的影响,试验采用随机分组方式将30只ICR小鼠分为感染组和对照组,每组15只,感染组灌胃感染0.2 mL鉴定和纯化后的微小膜壳绦虫虫卵配制成的虫卵悬浊液(浓度为2500个/mL),对照组灌胃等量生理盐水,并于感染后第2,4,6,8,10天采集空肠内容物,采用16S rDNA扩增子测序分析技术检测16S rDNA扩增产物,所得的数据使用多组间方差分析进行两两比较,对肠道菌群的种类、分布和丰度状况进行研究。结果表明:菌群种类繁多,以厚壁菌门(占比为64%)、拟杆菌门(占比为25%)为主,其次是变形菌门(占比为6%)和放线菌门(占比为3%)。感染微小膜壳绦虫后第4,6,8,10天肠道菌群α多样性Sobs值呈现先下降再上升的趋势,第8天显著低于第4,6,10天(P0.05);与对照组相比,感染组相对丰度上调的菌群主要从属厚壁菌门,有紫单胞菌科、毛螺菌科和乳杆菌科;下调的菌群种类较多,主要从属厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门。与对照组相比,感染后第10天感染组小鼠肠道乳杆菌属的相对丰度升高最明显;葡萄球菌属、咸海鲜球菌属和棒杆菌属的相对丰度降低。说明微小膜壳绦虫感染会导致宿主肠道菌群失调,其中乳杆菌属的相对丰度变化最明显。

关键词：微小膜壳绦虫 ICR小鼠肠道菌群菌群失调乳杆菌属

广西来宾市2017—2023年101例粪类圆线虫感染的诊断和分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国热带医学 2024年

作者：韦新艳陆燕韦凤妮阮贵香潘菊花吕佳音石云良刘登宇来宾市兴宾区人民医院广西医科大学基础医学院寄生虫学教研室

目的分析来宾市2017—2023年诊断的101例粪类圆线虫感染患者的临床特征，为粪类圆线虫病防治提供资料。方法收集来宾市兴宾区人民医院2017—2023年确诊感染粪类圆线虫101例患者的临床资料，对患者的年龄、性别、职业、受教育程度和临... 详细信息

目的分析来宾市2017—2023年诊断的101例粪类圆线虫感染患者的临床特征，为粪类圆线虫病防治提供资料。方法收集来宾市兴宾区人民医院2017—2023年确诊感染粪类圆线虫101例患者的临床资料，对患者的年龄、性别、职业、受教育程度和临床症状及贫血情况等进行统计分析。结果 101例粪类圆线虫感染病例中男性79例，女性22例，男女性比为3.6∶1。患者大部分来自农村地区，以务农为主，且文化程度较低，年龄（65.32±12.48）岁，>60岁老年患者67例。首发有消化道腹痛、黑便和血性腹泻症状分别有16、12和6例，合并肺部感染、高血压、痛风和风湿性关节炎、糖尿病和恶性肿瘤分别29、25、18、13和12例。实验室检查显示，出现贫血、大便隐血阳性和嗜酸性粒细胞增高分别59、63和51例。结论来宾市兴宾区的粪类圆线虫感染患者多发于文化程度低的农村老年人，男性多于女性。粪类圆线虫患者中仅部分出现腹痛、腹泻等肠道症状，但大部分患者合并有肺部感染、高血压、痛风性、风湿性关节炎、糖尿病、恶性肿瘤等疾病，合并感染有加快和加剧疾病进程的风险，应加强当地粪类圆线虫的防控。

关键词：粪类圆线虫贫血消化道症状农村地区

基于生物信息学预测儿童轻重症疟疾的潜在生物靶标

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

生物化工 2024年第1期10卷 79-82页

作者：刘鉴贵州医科大学寄生虫学教研室贵州贵阳550001

目的:基于生物信息学方法对儿童轻重症疟疾的基因表达谱(GSE33811)进行潜在生物学靶标的预测。方法:利用R语言和在线分析等生物信息学方法进行差异表达、功能富集及网络互作的分析。结果:获得243个差异的基因,差异基因主要参与NOD样受... 详细信息

目的:基于生物信息学方法对儿童轻重症疟疾的基因表达谱(GSE33811)进行潜在生物学靶标的预测。方法:利用R语言和在线分析等生物信息学方法进行差异表达、功能富集及网络互作的分析。结果:获得243个差异的基因,差异基因主要参与NOD样受体信号通路、对生物刺激反应的调节、参与免疫应答的中性粒细胞激活等。通过Cytoscape筛选出10个核心基因(IL1B、STAT1、OAS1、OAS2、IRF1、DDX58、CD4、GBP1、IFIT3和IFIH1)。结论:该分析将为儿童轻重症疟疾的治疗与预防提供新的靶点及研究思路。

关键词：儿童疟疾差异基因生物信息学

乳酸乳球菌介导的多房棘球绦虫EmⅡ/3疫苗的构建、鉴定及表达

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华地方病学杂志 2024年第7期43卷 517-522页

作者：李文桂欧兴坤何爱琳重庆医科大学附属第一医院传染病寄生虫病研究所重庆400016

目的构建乳酸乳球菌(Lactococcus lactis,LL)介导的多房棘球绦虫EmⅡ/3疫苗,并探讨其表达效率。方法以pCD-EmⅡ/3质粒为模板扩增EmⅡ/3基因,采用XbaⅠ和Hin dⅢ双酶切后插入pMG36e质粒,构建重组质粒pMG36e-EmⅡ/3,转化大肠埃希菌BL21(D... 详细信息

目的构建乳酸乳球菌(Lactococcus lactis,LL)介导的多房棘球绦虫EmⅡ/3疫苗,并探讨其表达效率。方法以pCD-EmⅡ/3质粒为模板扩增EmⅡ/3基因,采用XbaⅠ和Hin dⅢ双酶切后插入pMG36e质粒,构建重组质粒pMG36e-EmⅡ/3,转化大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞,抽提质粒进行双酶切鉴定;电穿孔转化LL MG1363株,构建多房棘球绦虫重组(r)LL-EmⅡ/3疫苗。对rLL菌株进行罗红霉素抗性筛选后,抽提质粒进行PCR鉴定,并采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和免疫印迹(Western blot)进行表达鉴定。结果pMG36e-EmⅡ/3重组质粒双酶切鉴定,出现大小约3600 bp的载体条带和1759 bp的EmⅡ/3基因条带。以具有罗红霉素抗性的rLL菌株中抽提的质粒为模板,PCR可扩增出大小为1759 bp的EmⅡ/3基因;SDS-PAGE显示,rLL-EmⅡ/3疫苗可表达相对分子质量为66×103的EmⅡ/3蛋白,培养3 d的表达蛋白约占菌体总蛋白的20%;Western blot显示,表达蛋白可被泡型棘球蚴感染的鼠血清识别。结论成功构建多房棘球绦虫rLL-EmⅡ/3疫苗,其表达的EmⅡ/3蛋白具有特异的抗原性。

关键词：多房棘球绦虫乳酸乳球菌 EmⅡ/3 疫苗

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

寄主挥发物对冈田绕眼果蝇的引诱效果研究

遵义医科大学学报 2024年第4期47卷 371-375页

作者：董贤凤郑明辉遵义医科大学寄生虫学教研室贵州遵义563006

目的探讨冈田绕眼果蝇(Phortica okadai)对寄主挥发物的偏好性。方法选择发酵梨挥发物的主要组分以及与人体有关的昆虫信息化合物作为引诱剂,利用Y型管对挥发物溶媒进行选择,利用自制四臂管对冈田绕眼果蝇的行为反应进行测定。结果 ... 详细信息

目的探讨冈田绕眼果蝇(Phortica okadai)对寄主挥发物的偏好性。方法选择发酵梨挥发物的主要组分以及与人体有关的昆虫信息化合物作为引诱剂,利用Y型管对挥发物溶媒进行选择,利用自制四臂管对冈田绕眼果蝇的行为反应进行测定。结果行为反应测定发现,共有9种挥发物组分对冈田绕眼果蝇具有引诱效果,其中2,3-丁二酮、苯乙醇、丙酸乙酯、辛酸乙酯、乙酸乙酯、月桂酸乙酯和正癸酸对雌、雄成蝇均具有引诱效应,而乙酸异戊酯只对雌成虫具有引诱作用,2,4-癸二酸-1-醇只对雄成虫具有引诱作用。另外发现了1种趋避剂芳樟醇。其他成分未发现引诱效应。结论 2,3-丁二酮、苯乙醇、丙酸乙酯、辛酸乙酯、乙酸乙酯、月桂酸乙酯和正癸酸能对冈田绕眼果蝇的嗅觉行为进行调控,可为开发针对冈田绕眼果蝇的引诱剂提供理论基础。

关键词：冈田绕眼果蝇挥发物引诱效果化学引诱剂