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昆虫图像分割方法及其应用

昆虫学报 2011年第2期54卷 211-217页

作者：王江宁纪力强中国科学院动物研究所生物多样性信息学研究组北京100101

昆虫图像自动鉴定是一种快速鉴定昆虫的方法,图像分割则是其中关键步骤。通过搜集和整理国内外近年来针对昆虫图像的分割方法和研究,发现对昆虫图像分割的研究日趋增多。随着计算机图像技术的发展,昆虫图像分割方法吸收了许多图像分割... 详细信息

昆虫图像自动鉴定是一种快速鉴定昆虫的方法,图像分割则是其中关键步骤。通过搜集和整理国内外近年来针对昆虫图像的分割方法和研究,发现对昆虫图像分割的研究日趋增多。随着计算机图像技术的发展,昆虫图像分割方法吸收了许多图像分割领域中新兴的方法,诸如采用水平集、边缘流以及结合形状、纹理、色彩等多种要素的智能分割(如JSEG方法)等。虽然大量的图像分割方法被引入到昆虫图像研究中,但是目前分割技术依然是阻碍昆虫图像广泛应用的关键。本文经过总结和分析,发现目前昆虫图像分割研究的往往在各自的测试集上有良好表现,但是缺乏统一的评价标准,因此很多方法在昆虫图像中应用难以推广。针对研究中的存在的这些问题,需建立良好的昆虫图像分割评价体系,本文建议通过建立统一的昆虫图像库以及对昆虫图像分割的评价方法深入研究,并且这些工作是当前昆虫图像分割研究亟待完善任务。

关键词：昆虫图像处理图像分割图像识别自动鉴定形态分类学

IPBES框架下生物多样性和生态系统服务情景和模型方法评估及对我国的影响

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生物多样性 2018年第1期26卷 89-95页

作者：潘玉雪田瑜徐靖张博雅李俊生中国环境科学研究院生物多样性研究中心北京100012

随着国际社会对生物多样性保护关注度的提升,生物多样性和生态系统服务情景和模型方法逐渐成为国际进程和条约关注的焦点问题。生物多样性和生态系统服务政府间科学–政策平台(Intergovernmental Science–Policy Platform on Biodivers... 详细信息

随着国际社会对生物多样性保护关注度的提升,生物多样性和生态系统服务情景和模型方法逐渐成为国际进程和条约关注的焦点问题。生物多样性和生态系统服务政府间科学–政策平台(Intergovernmental Science–Policy Platform on Biodiversity and Ecosystem Services,IPBES)将"生物多样性和生态系统服务情景和模型方法评估"列入2014–2018年工作方案,作为IPBES首批评估活动之一,其评估报告及决策者摘要已在IPBES第四次全体会议上获得通过。本文概述了该评估报告的主要内容和结论,探讨了报告与其他国际进程的关系及其可能对中国的影响。该报告梳理了国际上现有的生物多样性和生态系统服务相关情景和模型方法,综合分析了它们的优缺点、适用范围和限制条件,提出了使用过程中应对数据和知识空缺的方法,为制定、使用及优化情景和模型提供了指导。IPBES的一系列评估报告将引领生物多样性和生态系统服务相关科学领域的发展,为各国在生物多样性领域进行对话、权衡与博弈,实现本国利益最大化提供一个高效的平台。中国作为一个发展中的生物多样性大国,积极参与、发声必然是应对IPBES未来发展的最优方式。

关键词：生物多样性生态系统服务情景模型 IPBES

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城市绿地系统生物多样性保护的特点和任务

城市绿地系统生物多样性保护的特点和任务

作者：王秉洛中国履行《生物多样性公约》工作协调组

改善城市的人类生存环境,改善城市的自然生态,保护城市环境中的生物多样性,是一项关系城市可持续发展的急切任务。实施城市和风景名胜区生物多样性保护是生物多样性保护总任务中的一个部分。本文论述了此部分的6项特点及6项急需要做的... 详细信息

改善城市的人类生存环境,改善城市的自然生态,保护城市环境中的生物多样性,是一项关系城市可持续发展的急切任务。实施城市和风景名胜区生物多样性保护是生物多样性保护总任务中的一个部分。本文论述了此部分的6项特点及6项急需要做的基础工作。

关键词：城市绿地系统生物多样性鲜明特点任务艰巨

来源： cnki会议评论

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台湾生物多样性资料整合之经验与策略

生物多样性 2010年第5期18卷 444-453页

作者：邵广昭赖昆祺林永昌柯智仁李瀚洪铃雅陈岳智陈丽西台湾中研院生物多样性研究中心台北市南港区11529

台湾生物多样性数据库之整合从2001年开始,是因为数位典藏计划、生物多样性推动方案,及台湾加入全球生物多样性信息网络(Global Biodiversity Information Facility,GBIF),均在这一年启动。2002年"中研院"开始建置台湾物种名录数据库(Ta... 详细信息

台湾生物多样性数据库之整合从2001年开始,是因为数位典藏计划、生物多样性推动方案,及台湾加入全球生物多样性信息网络(Global Biodiversity Information Facility,GBIF),均在这一年启动。2002年"中研院"开始建置台湾物种名录数据库(TaiBNET),GBIF之台湾入口网TaiBIF则是在2004年时建置,用来整合台湾生物多样性的资料并与国际接轨。所采用之方法及格式均依循GBIF所发展的交换标准,一来可以整合台湾的数据,二来可及时与国际交换数据。虽然TaiBNET及TaiBIF已突破智慧财产权(知识产权)的障碍,可搜集整合数位典藏各子计划逐年累积的资料,但跨部门间及非数位典藏计划所产生的数据,仍因各单位及个人的本位主义而难以整合分享,特别是生态分布原始数据。因此2008年在"中研院"成立了跨主管部门的委员会,制订可行之资料搜集、整合与公开的政策,并要求各主管部门在委办合约中纳入。无人否认数据库整合的重要,但在现行对研究人员考评制度下,研究人员大多不愿投入数据库建置的学术服务工作,所获得的人力与经费亦日益短缺而难以永续经营。亟需相关部门的重视与支持。TaiBIF在过去6年来的推动成果虽未臻理想,但所获的经验和心得仍有可供外界参考与借镜之处。

关键词：生物多样性信息学 GBIF TaiBNET TaiBIF 数据库

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基因组学与非线性分子进化

自然杂志 2001年第3期23卷 131-134页

作者：吕宝忠复旦大学生物多样性研究所

在宏观层次 ,达尔文开创的演化理论近年来受到学术界的猛烈抨击 ,濒临危机 .一个非线性演化理论正在形成 ,但是还未得到微观水平的支持证据 .

关键词：比较基因组学非线性分子进化达尔文主义新达尔文主义直源同源群集内共生理论原生生物演化生物学

国产杜鹃花属马银花亚属(杜鹃花科)五个新异名

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植物分类学报 2006年第5期44卷 604-607页

作者：高连明李德铢中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室昆明650204

将杜鹃花属马银花亚属***的凯里杜鹃***&***和线萼杜鹃***处理为南海杜鹃***.的异名,鹿角杜鹃***.处理为西施花***.的异名,***évl.处理为长蕊杜鹃***.的异名,山荷桃***处理为刺毛杜鹃***的异名,并作了相应的讨论。

关键词：杜鹃花属马银花亚属新异名

基于ITS序列探讨杜鹃花属马银花组的系统发育

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植物分类学报 2003年第2期41卷 173-179页

作者：高连明李德铢张长芹中国科学院昆明植物研究所生物多样性和生物地理开放实验室昆明650204

以杜鹃花属叶状苞亚属Rhododendronsubg .Therorhodion (Maxim .)Gray的叶状苞杜鹃R .re dowskianumMaxim .为外类群 ,使用PAUP4.0b8软件对马银花亚属subg .AzaleastrumPlanch .的马银花组*** (Planch.)Maxim .7种 1变种和长蕊杜鹃组*** .2种及 2个相关的单型亚属 (异蕊杜鹃亚属subg .MumeazaleaMaxim .和纯白杜鹃亚属*** (Sleumer)Philip .&Philip.)进行了系统发育分析。采用最大简约法分析获得 6个最简约树 ,步长为 6 0 ,一致性指数 (CI)和维持性指数 (RI)值分别为 0 .91 7和 0 .898,利用 6个最简约树获取严格一致树。用最大似然法获得的系统树与严格一致树完全相同 ,只是支持率略有不同。结果表明纯白杜鹃亚属位于系统树的基部 ;马银花亚属不是一个单系类群 ,但马银花组和长蕊杜鹃组分别构成单系 ,支持率分别为 81 %和 1 0 0 % ;在马银花组内形成两个分支 ,内部支持率分别为 93 %和 6 2 %。

关键词：杜鹃花属马银花组 ITS 系统发育

籼稻93-11和粳稻日本晴DNA插入缺失差异片段揭示的水稻籼-粳分化

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复旦学报（自然科学版） 2006年第3期45卷 309-315页

作者：蔡星星刘晶仇吟秋赵伟宋志平卢宝荣复旦大学生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433

碱基的插入/缺失(InDel)引起DNA序列变化并形成了DNA片段长度多态,可以用作遗传标记.为了评价基于籼稻93-11和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的差异片段而设计的InDel引物在鉴定籼稻和粳稻两种生态型以及研究稻属不同物种之间亲缘关系... 详细信息

碱基的插入/缺失(InDel)引起DNA序列变化并形成了DNA片段长度多态,可以用作遗传标记.为了评价基于籼稻93-11和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的差异片段而设计的InDel引物在鉴定籼稻和粳稻两种生态型以及研究稻属不同物种之间亲缘关系的意义,采用45对InDel引物,对来自亚洲10个国家的49份籼稻、43份粳稻品种和24份野生稻进行了检验.结果表明,其中41对InDel引物鉴定籼稻或粳稻品种的准确率高于80%.主成分分析散点图显示:籼稻与粳稻存在明显的遗传分化;含AA基因组的野生稻物种与籼稻品种存在较近的亲缘关系;非AA基因组的野生稻物种不存在明显的籼-粳分化.并且证明了基于籼稻93-11和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的InDel差异片段设计的引物可以用于栽培稻籼稻和粳稻品种的鉴定以及籼-粳分化问题的研究,及探索稻属不同物种间的亲缘关系.

关键词：亚洲栽培稻 InDel引物籼-粳分化品种鉴定

生态系统碳通量估算中耦合涡度协方差与遥感技术研究进展

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地球科学进展 2008年第8期23卷 884-894页

作者：严燕儿赵斌郭海强吴千红复旦大学生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433

陆地生态系统CO2和水热通量的长期观测研究一直是国际上关注的热点问题。截止目前,利用微气象学原理的涡度协方差技术是唯一能直接测定生物圈与大气间物质与能量通量的标准方法,成为国际通量观测网络的主要技术。但是涡度协方差技术的... 详细信息

陆地生态系统CO2和水热通量的长期观测研究一直是国际上关注的热点问题。截止目前,利用微气象学原理的涡度协方差技术是唯一能直接测定生物圈与大气间物质与能量通量的标准方法,成为国际通量观测网络的主要技术。但是涡度协方差技术的测定仍然是一种小尺度观测方法,其观测结果难于直接外推到更大尺度。同时,缺乏区域、跨尺度生态系统及其时空动态观测数据一直是限制碳循环研究的主要障碍,而遥感技术的发展可望在不远的将来使大尺度、高分辨生态系统变化的长期定量观测成为可能。这些问题在当今集中体现在如何建立通量—遥感的跨尺度观测体系,并有效地将有限的通量站点测量数据与大尺度遥感资料以及生态模型有机地结合。总结过去耦合涡度协方差技术与遥感技术的工作,主要在以下3个层面展开:①涡度协方差技术与遥感技术对碳通量估算的相互验证;②涡度协方差技术为遥感反演提供地面参数;③遥感观测解译辅助分析通量贡献区(footprint)。集中在这3个方面进行探讨,通过总结各方面的研究特点与进展,可望为未来在这个领域开展工作理顺思路。

关键词：碳通量涡度协方差 MODIS 生态模型贡献区分析