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基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异

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菌物学报 2021年第12期40卷 3246-3255页

作者：杨驰马璐肖冬来江晓凌刘晓瑜林衍铨福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福建福州350012

广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求。绣球菌新品种‘SP-A’是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究。本研究... 详细信息

广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求。绣球菌新品种‘SP-A’是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究。本研究利用高通量测序技术,对‘SP-A’全基因组进行测序,获得了1.58Gb高质量测序数据,Q30达到95.55%。与‘闽绣1号’参考基因组平均比对率为76.86%,平均覆盖深度为28X,基因组覆盖度为93.51%,共检测到273587个单核苷酸多态位点,40772个小片段插入缺失位点,这些变异共导致了7954个基因变异。研究初步揭示了‘SP-A’的基因组特征,为相关分子标记筛选及辅助育种、遗传分析和功能基因克隆提供了重要的分子标记资源。

关键词：绣球菌基因组测序单核苷酸多态位点小片段插入缺失

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双孢蘑菇新品种‘福蘑52’

园艺学报 2022年第S01期49卷 97-98页

作者：陈美元廖剑华蔡志欣郭仲杰卢园萍王泽生福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福州350012

双孢蘑菇‘福蘑52’是W192和A15分离的不育单孢杂交获得的新品种。菌落形态为贴生型,菌丝在10~32℃下均能生长,最适24~28℃。结菇温度10~22℃,最适16~18℃。采收时间比W192早2~3 d。子实体基本散生,品质优良,朵型圆整,组织较结实。菌盖... 详细信息

双孢蘑菇‘福蘑52’是W192和A15分离的不育单孢杂交获得的新品种。菌落形态为贴生型,菌丝在10~32℃下均能生长,最适24~28℃。结菇温度10~22℃,最适16~18℃。采收时间比W192早2~3 d。子实体基本散生,品质优良,朵型圆整,组织较结实。菌盖扁半球形,洁白、光滑、无鳞片,抗褐变能力显著强于W192。适用于周年工厂化栽培模式,鲜菇适合鲜销。

关键词：双孢蘑菇不育单孢杂交育种品种

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双孢蘑菇野生种质资源营养成分分析与评价

生物技术通报 2021年第11期37卷 109-118页

作者：郑惠清郭仲杰蔡志欣卢园萍廖剑华陈美元福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福州350012

为了评价双孢蘑菇野生种质资源的营养成分,筛选具有较好或特殊营养成分的种质,为双孢蘑菇育种提供科学的参考依据。以3份主栽品种为对照,分析评价了93份双孢蘑菇野生种质材料的蛋白质、氨基酸和脂肪酸的营养成分含量,并以营养成分含量... 详细信息

为了评价双孢蘑菇野生种质资源的营养成分,筛选具有较好或特殊营养成分的种质,为双孢蘑菇育种提供科学的参考依据。以3份主栽品种为对照,分析评价了93份双孢蘑菇野生种质材料的蛋白质、氨基酸和脂肪酸的营养成分含量,并以营养成分含量均高于均值为依据筛选营养高效均衡的种质资源。结果表明,双孢蘑菇野生种质的蛋白质含量为29.50-37.60 g/100g,必需氨基酸含量为4.51-8.89 g/100g,必需氨基酸的比例为24.69%-40.59%,亚油酸含量为4086.55-14190.28 mg/kg,不饱和脂肪酸的比例为77.63%-87.47%。氨基酸的平均变异系数21.05%,亚油酸的变异系数22.93%。93份双孢蘑菇野生种质资源中氨基酸、脂肪酸含量存在丰富的变异,基于实验结果筛选到14份营养高效均衡的种质资源,可为双孢蘑菇品质提升定向育种提供亲本材料。

关键词：食用菌种质资源蛋白质氨基酸脂肪酸

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硅肥施入对人参生长及品质的影响

分子植物育种 2024年

作者：张岂源许永华代鸣涛苏德悦董兴敏刘子瑶吉林农业大学新品种与开发国家地方联合工程研究中心

目前硅肥广泛用于水稻、玉米等农作物中，其可以促进其生长发育且效果显著，为了探讨硅肥施入对人参生长及品质的影响，本研究以三年生农田栽培人参为试验材料，在吉林农业大学开展人参栽培施肥试验，于盆栽条件下分别设置5个施硅肥水... 详细信息

目前硅肥广泛用于水稻、玉米等农作物中，其可以促进其生长发育且效果显著，为了探讨硅肥施入对人参生长及品质的影响，本研究以三年生农田栽培人参为试验材料，在吉林农业大学开展人参栽培施肥试验，于盆栽条件下分别设置5个施硅肥水平处理：0、0.02、0.04、0.06、0.08、0.1g/L，共设两种施肥方式：基质施肥(J-1， J-2， J-3， J-4， J-5， J-6)和叶面施肥(Y-1， Y-2， Y-3， Y-4， Y-5， Y-6)，分析人参农艺性状、叶绿素含量、硅含量、纤维素含量、产量和皂苷含量。通过比较分析发现，基质施入硅肥后，J-3 (0.04g/L)的各项农艺性状指标和叶绿素含量达到最大值，硅含量、纤维素含量随着硅肥浓度增加先上升后下降，最佳浓度为J-5 (0.08g/L)，人参的产量和皂苷含量有明显增加，最大增产量可达到45.75%，人参皂苷积累量以J-5 (0.08g/L)组最高；叶面施入硅肥后，Y-4 (0.06g/L)的各项农艺性状指标和叶绿素含量达到最大值，硅含量、纤维素含量随着硅肥浓度增加先上升后下降，最佳浓度为Y-5 (0.08g/L)，人参的产量和皂苷含量有明显增加，最大增产量可达到22.26%，人参皂苷积累量以Y-5 (0.08g/L)组最高。综上所述，无论是基质施硅还是叶面施硅，都可以促进人参的生长，增强人参的品质，两种施肥方式最佳的施肥浓度均为0.08g/L。

关键词：硅肥人参基质施肥叶面施肥

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双孢蘑菇新品种‘福蘑48’

园艺学报 2023年第S01期50卷 83-84页

作者：陈美元廖剑华郭仲杰蔡志欣卢园萍吴少聪王泽生福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福州350012 福建金明食品有限公司福建漳州363602

双孢蘑菇‘福蘑48’是由As2796和A15分离的不育单孢杂交获得的高产短周期工厂化专用新品种。菌落形态为贴生型,菌丝在10~32℃下均能生长,最适24~28℃。出菇温度12~20℃,最适16~18℃。采收时间比As2796早2~3 d。子实体基本单生,直径3.0~5... 详细信息

双孢蘑菇‘福蘑48’是由As2796和A15分离的不育单孢杂交获得的高产短周期工厂化专用新品种。菌落形态为贴生型,菌丝在10~32℃下均能生长,最适24~28℃。出菇温度12~20℃,最适16~18℃。采收时间比As2796早2~3 d。子实体基本单生,直径3.0~5.0 cm,朵形圆整,组织较紧实,品质优良。菌盖洁白、稍有鳞片,抗褐变能力显著强于W192和As2796。在适宜栽培条件下,产量比亲本As2796提高20%~25%,与国外主栽品种A15相当。适用于周年工厂化栽培模式,鲜销。

关键词：双孢蘑菇品种不育单孢杂交育种工厂化栽培

双孢蘑菇As2796菌株气生与贴生菌丝遗传差异的转录组分析

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福建农业学报 2024年第9期39卷 1023-1034页

作者：戴建清陈文智曾志恒蔡志欣陈美元福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福建福州350013

【目的】挖掘双孢蘑菌落形态变化可能涉及的重要基因,为双孢蘑菇种质资源评价、新品种选育提供科学依据。【方法】以双孢蘑菇主栽品种As2796为试验菌株,收集同一平板上生长的贴生与气生菌丝,提取样品的RNA进行转录组测序分析。【结果】... 详细信息

【目的】挖掘双孢蘑菌落形态变化可能涉及的重要基因,为双孢蘑菇种质资源评价、新品种选育提供科学依据。【方法】以双孢蘑菇主栽品种As2796为试验菌株,收集同一平板上生长的贴生与气生菌丝,提取样品的RNA进行转录组测序分析。【结果】通过转录组分析,A601(As2796气生组)与A602(As2796贴生组)共鉴定出965个差异表达基因(DEGs)。GO富集分析结果表明,在真菌细胞壁组成方面有疏水蛋白相关的DEGs富集,其中AGABI2DRAFT_13655、AGABI2DRAFT_136569、AGABI2DRAFT_193057属于ABH3蛋白基因家族,在气生菌丝的表达水平显著高于贴生菌丝,可能与气生菌丝的产生有关。研究还发现了疏水表面结合蛋白A(HsbA)相关基因AGABI2DRAFT_194662在气生菌丝中FPKM表达水平为0,在贴生菌丝中为10.24。通过对DEGs进一步分析,富集到8个可能与脂酶同工酶相关的DEGs,气生菌丝中这些基因的表达水平显著高于贴生菌丝。SNP/InDel分析结果表明,As2796气生组SNP数为110601,贴生组SNP数为111188,单核苷酸变异中,C:G>T:A的变异次数较多,共筛选出2374个共同InDel。【结论】成功获得双孢蘑菇不同形态菌丝的转录组数据,并从中挖掘出潜在的相关基因和SNP位点,为双孢蘑菇相关分子标记开发及辅助育种提供参考。

关键词：双孢蘑菇 As2796 贴生菌丝气生菌丝转录组测序差异表达基因

双孢蘑菇9个杂交菌株的蛋白质营养评价与分析

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福建农业学报 2023年第11期38卷 1285-1292页

作者：郭仲杰郑惠清蔡志欣卢园萍曾志恒廖剑华陈美元福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心福建福州350012

【目的】分析评价双孢蘑菇野生种质创新杂交菌株的蛋白质和氨基酸营养成分,为利用野生种质选育营养价值更高的双孢蘑菇新菌株提供参考。【方法】以3个主栽品种为对照,测定分析了6个杂交新菌株的蛋白质与氨基酸含量,并参照WHO(World Heal... 详细信息

【目的】分析评价双孢蘑菇野生种质创新杂交菌株的蛋白质和氨基酸营养成分,为利用野生种质选育营养价值更高的双孢蘑菇新菌株提供参考。【方法】以3个主栽品种为对照,测定分析了6个杂交新菌株的蛋白质与氨基酸含量,并参照WHO(World Health Organization,世界卫生组织)/FAO(Food and Agriculture Organization of the UnitedNations,联合国粮食及农业组织)/UNU(UnitedNationsUniversity,联合国大学)、 IOM(Instituteof Medicine,美国医学研究所)、全鸡蛋蛋白3种氨基酸平衡模式谱,采用IOM模式评分、氨基酸评分、氨基酸比值系数、氨基酸比值系数分、化学评分等多种指标进行综合评价。【结果】野生种质创新杂交白色菌株福蘑63每百克蛋白质的必需氨基酸含量46.76 g、必需氨基酸指数94.45、必需氨基酸比例41.72%、消化率校正氨基酸得分86.73,在9个菌株中都是最高的。而野生种质创新杂交棕色菌株的蛋白质、总氨基酸、必需氨基酸、药用氨基酸、甜味氨基酸、碱性氨基酸、支链氨基酸以及多种氨基酸的含量均显著高于主栽品种。【结论】现有双孢蘑菇白色主栽品种的蛋白质、氨基酸等营养成分仍有提升的空间,可以引入营养价值相对较高的野生种质资源,基于营养成分评价开展营养品质定向杂交育种。

关键词：双孢蘑菇野生种质创新杂交新菌株营养评价

甘蔗栽培种单倍体基因组SSR位点的发掘与应用

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作物学报 2020年第4期46卷 631-642页

作者：王恒波祁舒婷陈姝琦郭晋隆阙友雄福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室/国家甘蔗工程技术研究中心

甘蔗是世界上最重要的糖料作物之一,由于尚未完全破译栽培种基因组,导致SSR标记匮乏,难以覆盖全基因组,限制了甘蔗遗传研究的进展。本研究以栽培种R570的4660个BAC文库片段序列(累计总长为382 Mb,预测到25,316个编码蛋白基因)组装成的... 详细信息

甘蔗是世界上最重要的糖料作物之一,由于尚未完全破译栽培种基因组,导致SSR标记匮乏,难以覆盖全基因组,限制了甘蔗遗传研究的进展。本研究以栽培种R570的4660个BAC文库片段序列(累计总长为382 Mb,预测到25,316个编码蛋白基因)组装成的一套甘蔗单倍体基因组的模板,利用MISA (Microsatellite identification tool)软件,发掘SSR位点;并综合分析其与4种禾本科植物(高粱、玉米、水稻和二岁短柄草)SSR位点的分布特征;选取50对以TG和AG重复基序的SSR引物,分别利用4个甘蔗属材料(R570、ROC1、LA purple和SES208)和24个重要甘蔗亲本,对SSR引物进行扩增效率验证和多态性分析。共发掘到27,241个SSR位点,平均每个BAC片段有6.29个SSR位点,平均密度为71.33个SSR Mb?1,远低于高粱的平均密度(350.00个SSR Mb?1)。在重复基序中,占比前2位的分别为单核苷酸基序(11,079个)和三核苷酸重复基序(6447个),合计占总SSR位点数的64.33%。与甘蔗不同的是, 4种禾本科植物中的三核苷酸基序类型数量最多、占比最大。此外,在单核苷酸重复基序中, A/T所占比例最高,为84.8%, C/G所占比例最低,为15.2%;在三核苷酸重复基序中, TGT/ACA所占比例最高,为16.04%。总之,禾本科植物基因组富含A/T的基序。在50对SSR引物(TG基序41对和AG基序9对)的多态性验证中,共有45对(90%)能够扩增出清晰的条带,其中35对(70%)在4个甘蔗材料上呈现多态性。进一步利用20对多态性较高的SSR引物对24个甘蔗重要亲本材料进行分析,共扩增到95个等位基因,平均每对引物扩增4.75个,验证了这些引物应用于甘蔗遗传多样性研究的可行性。本研究鉴定的甘蔗栽培种单倍体基因组SSR标记,有效增加了甘蔗遗传研究中可用的分子标记数量,可直接用于甘蔗群体遗传多样性分析和重要性状遗传机制的解析,为甘蔗分子育种的深入研究奠定了基础。

关键词：甘蔗栽培种 BAC文库 SSR 标记开发多态性

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广西发展农作物间套种技术的意义与建议

现代农业科技 2012年第1期 119-120,123页

作者：朱秋珍李杨瑞刘晓燕广西农业科学院甘蔗研究所/中国农业科学院甘蔗研究中心/甘蔗育种与栽培技术国家地方联合工程研究中心/广西甘蔗工程技术研究中心广西南宁530007

介绍了国内外农作物间套种概况,阐述广西发展农作物间套种的意义、原则及现状,并对发展广西农作物间套种提出建议。

关键词：农作物间套种意义原则现状建议广西壮族自治区