检索结果-南通市图书馆

一种基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法的建立

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中华预防医学杂志 2024年第4期58卷 489-496页

作者：苏文哲李岩陆维智谢华萍李魁彪狄飚聂凯王环宇张周斌许松涛广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 山东省疾病预防控制中心传染病防制所济南250000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份C... 详细信息

目的:建立基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法。方法:通过NCBI网站检索和下载CHIKV的各基因型序列,经序列比对筛选出备选参考序列,使用Primalscheme和Geneious Prime等软件进行引物方案的设计、筛选和人工优化,并使用7份CHIKV阳性样品对实验流程进行评估。结果:本研究所设计的引物方案可对各阳性样品进行成功扩增;在样品Ct值小于33时,可获得完整编码区序列;样品Ct值达到35时,可获得99.38%的编码区序列;使用多次迭代,逐步校正的拼接策略可将拼接成功率提高5.70%~25.43%。结论:建立的基于多重PCR的基孔肯雅病毒全基因组高通量测序方法操作简单,对多个浓度的基孔肯雅病毒阳性临床样品均表现良好。

关键词：基孔肯雅病毒全基因组测序多重PCR 高通量测序

新冠疫情大流行期间广州市H3N2流感病毒分子流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 351-357页

作者：曹蓝周腾飞陈艺韵马蒙蒙夏丹刘艳慧李魁彪狄飚秦鹏哲张周斌广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 广州市疾病预防控制中心传染病预防控制部广州510440 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰... 详细信息

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰(阳性率为52.23%),流行强度和持续时间均高于2019年H3N2流感流行期。2022年流行株HA基因和NA基因均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与2019年冬季的H3N2流行株进化分支(Group-3 毒株3C.2a1b.1a)不同。2022年流行株抗原位点变异主要发生在C区I48T位,HA蛋白受体结合位点与疫苗株一致。大部分流行株在HA蛋白上带有13个糖基化位点,一起暴发疫情分离株发生24-NST处糖基化位点的缺失。综上,新冠疫情大流行期间,引起广州市2022年H3N2流感流行的病毒株属于新衍生进化分支,进化起源上并非由2019年广州市毒株直接传播进化而来。

关键词： H3N2流感病毒分子变异遗传特征新型冠状病毒监测

2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病检测能力现状调查分析

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疾病监测 2024年

作者：王平贵何爱伟牛丽霞周晓艳赵琦马明辉关宏冯宇甘肃省疾病预防控制中心

目的调查分析2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病（布病）实验室检测能力现状，以及其对布病监测系统敏感性的影响，为制定布病防控对策提供科学依据。方法采用分层随机抽样方法选取甘肃省7个市（州）11个县（区）作为调查点... 详细信息

目的调查分析2018—2022年甘肃省医疗卫生机构布鲁氏菌病（布病）实验室检测能力现状，以及其对布病监测系统敏感性的影响，为制定布病防控对策提供科学依据。方法采用分层随机抽样方法选取甘肃省7个市（州）11个县（区）作为调查点，现场调查医疗卫生机构布病实验室检测能力，回顾性调查2018—2022年县级医疗卫生机构布病检测情况，收集传染病报告系统人间布病报告发病数和发病率数据，分析县级医疗机构布病实验室检测数量与全省布病报告发病率的相关性。结果调查的市、县疾病预防控制中心均具备布病初筛和确诊实验检测能力，具备病原学检验能力机构比例分别为57.14%、9.09%。市级医院有60.00%的综合性医院和16.67%的专科医院具备布病确诊实验和病原学检验能力，县级医院有45.45%的具备布病血清学初筛和确诊实验能力。只有4.55%的乡镇卫生院有布病初筛检验能力。市、县级疾病预防控制中心参控实验室盲样检测结果正确率均在95.24%以上。2018—2022年，调查地区县级医疗机构开展布病确诊实验检测的机构比例从8.70%增加到了43.48%，年检测数量从55份增加到了13465份，检测阳性数从39份增加到了3220份，检测阳性率从70.91%下降到了23.92%。全省布病监测系统敏感性升高，报告发病率从2018年的5.77/10万增加到了2022年的20.03/10万。近5年实验室布病检测数量与全省布病报告发病率存在强相关性（r=0.981，P＜0.01），为正相关关系。结论甘肃省开展布病实验室检测的县级及以下医疗机构比例低，近几年甘肃省人间布病疫情实际流行程度比监测系统报告情况严重。建议进一步提升基层医疗机构布病实验室检测能力，加强疫情源头防控工作。

关键词：布鲁氏菌病检测能力监测

中国内地进口冷链食品关联新型冠状病毒疫情调查

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中国食品卫生杂志 2024年第4期36卷 496-506页

作者：李颖陆润泽张丽杰马会来中国疾病预防控制中心现场流行病学培训项目北京100050 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 青岛市疾病预防控制中心山东青岛266033

目的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全球大流行以来,中国内地报道了多起SARS-CoV-2污染进口冷链食品引起的本土新冠疫情,分析此类疫情的特点和传播概况,可以为今后类似疫情防控提出相应建议。方法收集SARS-CoV-2污染进口冷链食品引起本土新... 详细信息

目的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)全球大流行以来,中国内地报道了多起SARS-CoV-2污染进口冷链食品引起的本土新冠疫情,分析此类疫情的特点和传播概况,可以为今后类似疫情防控提出相应建议。方法收集SARS-CoV-2污染进口冷链食品引起本土新冠疫情文献、官方新闻报道等信息,整理和分析相应数据。结果2020年6月至2022年11月,共检索到此类疫情20起,包含1646例病例,涉及9个省(自治区、直辖市)。其中,2020年10起,2021年3起,2022年7起;病例数规模在200例及以上共3起。结论新冠全球大流行以来中国内地检索到的20起进口冷链食品相关本土新冠疫情均为冷链从业人员接触进口冷链食品或其外包装感染引起,且大部分(75%)引起了后续社区传播,但是在中国内地集中监管仓建设等各种有力控制措施下,此类疫情数量和持续时间均呈下降趋势。

关键词：新型冠状病毒进口冷链食品集中监管仓

2022—2023年贵州省呼吸道病毒病原谱及流感A(H1N1)pdm亚型病毒基因特征分析

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中国公共卫生 2024年第9期 1045-1051页

作者：庄丽柯倩郑菊吴萍蒋维佳贵州省疾病预防控制中心实验中心病毒科

目的了解贵州省2022—2023年流感样病例呼吸道病毒病原谱的构成情况，进一步分析流感A(H1N1)pdm亚型病毒的基因特征及变化规律。方法收集贵州省2022—2023年流感样病例591份，采用多重荧光定量PCR方法对常见呼吸道病原体进行检测，检... 详细信息

目的了解贵州省2022—2023年流感样病例呼吸道病毒病原谱的构成情况，进一步分析流感A(H1N1)pdm亚型病毒的基因特征及变化规律。方法收集贵州省2022—2023年流感样病例591份，采用多重荧光定量PCR方法对常见呼吸道病原体进行检测，检测项目包括流感病毒（IFV）、副流感病毒（HPIV）、冠状病毒（HCoV）、呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒（ADV）、偏肺病毒（HMPV）、鼻病毒（HRV）和博卡病毒（HBoV）8种病毒及其分型，检测结果采用SPSS 22.0统计软件进行数据分析；通过高通量测序技术进行流感A(H1N1)pdm亚型病毒全基因组序列测定，采用Nextclade、MEGA7等进行血凝素（HA）基因序列分析及糖基化位点、抗原决定簇、受体结合位点突变情况分析。结果共检测出呼吸道病毒阳性样本363份，总阳性率为61.42%，检出率前3位的分别是IFV-A(H1N1)pdm亚型病毒（阳性率15.06%,89份）、IFV-A(H3N2)亚型病毒（阳性率13.71%,81份）和新冠病毒（SARS-CoV-2）（阳性率13.37%,79份）。不同性别和不同年龄组呼吸道病原体检出率差异无统计学意义；不同季节呼吸道病原体检出率差异有统计学意义（P 病毒的混合感染检出最多（17份，占比47.22%）。共获得16株贵州省流感A(H1N1)pdm09亚型病毒全基因组序列，均为6B.1A.5a.2a进化分支。Sb抗原决定簇发生A186T、Q189E氨基酸替换；受体结合位点发生190位螺旋（184-191）:A186T、Q189E及220位环E224A突变；未发现糖基化位点改变。结论呼吸道病毒是流感样病例的重要病原体，以流感病毒最为常见，混合感染占比较高。IFV及HMPV检出率有明显季节性差异。2022—2023年贵州省IFV-A(H1N1)pdm09亚型病毒分子结构与功能尚未发生大的变化，与疫苗株匹配性良好，流感疫苗的抗体保护性较好。

关键词：流感样病例呼吸道病毒病原体流感A(H1N1)pdm亚型病毒基因特征分析贵州省

甘肃省2012-2022年肾综合征出血热自然疫源地特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 117-122页

作者：魏孔福刘新凤苟发香王旭霞姜中毅李治平张晓曙甘肃省疾病预防控制中心传染病预防控制所兰州730000

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在... 详细信息

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在0.05/10万~1.21/10万之间,病例主要分布于甘肃省东部的平凉市、东南部的天水市、南部的甘南藏族自治州(甘南州),以及中部以南的定西市;20~60岁年龄组居多,男女性别比为1.85∶1(564∶305),职业以农民(61.80%,537/869)、牧民(19.79%,172/869)和学生(6.33%,55/869)为主。野鼠型发病以每年11月至次年1月为高峰。啮齿类宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,汉滩病毒携带率分别为2.79%(21/754)、0.42%(5/1179)和0.31%(2/643)。甘肃省目前确定了3个疫源地,其中2个分别是平凉市和甘南州的新发疫源地,另1个为定西市的老疫源地。结论甘肃省南部、中部以南和东部地区是目前主要的HFRS疫源地,宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,病毒基因型为汉滩病毒。病例报告地区应加强疫情的监测,疫情重点地区应强化和落实各项预防和控制措施,以减少HFRS带来的危害。

关键词：肾综合征出血热疫源地特征

甘肃省孕妇妊娠期疫苗接种与早产关联性的真实世界数据配对病例对照研究

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中国疫苗和免疫 2024年第5期 526-530页

作者：梁雪枫刘舒瑜彭娟霞孙迪张秉玲安婧唐宇张晓曙甘肃省疾病预防控制中心

目的探讨孕妇妊娠期疫苗接种与早产的关联性。方法采用1∶2匹配病例对照研究，通过甘肃省电子病历系统和预防接种信息管理系统收集2018-2023年分娩孕妇的早产和妊娠期疫苗接种信息，以早产孕妇为病例组，选择分娩年龄、户籍和文化程... 详细信息

目的探讨孕妇妊娠期疫苗接种与早产的关联性。方法采用1∶2匹配病例对照研究，通过甘肃省电子病历系统和预防接种信息管理系统收集2018-2023年分娩孕妇的早产和妊娠期疫苗接种信息，以早产孕妇为病例组，选择分娩年龄、户籍和文化程度相同的足月分娩孕妇为对照组，采用Logistic回归模型分析疫苗接种与早产之间的调整比值比(Odds ratio, OR)及其95%置信区间(Confidence interval,CI)。结果在40 849例病例组和81 698例对照组研究对象中，乙型肝炎疫苗、流感疫苗、人乳头瘤病毒疫苗、肾综合征出血热疫苗、狂犬病疫苗接种比例分别为0.26%vs 0.23%、0.24%vs 0.27%、0.14%vs 0.10%、0.01%vs 0.02%、0.11%vs 0.11%,相应疫苗接种与早产之间的调整OR(95%CI)分别为1.15(0.91-1.47)、0.86(0.68-1.10)、1.40(1.00-1.96)、0.63(0.23-1.73)、1.01(0.70-1.46)。结论本研究提示孕妇妊娠期相关疫苗接种未增加早产的发生风险。

关键词：妊娠期疫苗接种早产孕妇配对病例对照研究

2018—2022年中国内地老年人群食源性疾病主动监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第5期36卷 613-620页

作者：范鹏辉章荣华霍翔林黎蒋玉艳马晓晨刘弘刘志涛褚遵华梁进军胡晴文刘继开韩海红李薇薇国家食品安全风险评估中心北京100022 浙江省疾病预防控制中心浙江杭州310051 江苏省疾病预防控制中心江苏南京210009 四川省疾病预防控制中心四川成都610041 广西壮族自治区疾病预防控制中心广西南宁530028 北京市疾病预防控制中心北京100013 上海市疾病预防控制中心上海200336 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022 山东省疾病预防控制中心山东济南250014 湖南省疾病预防控制中心湖南长沙410005

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧... 详细信息

目的了解我国老年人群食源性疾病流行病学特征,为老年人食源性疾病预防和控制提供科学依据。方法通过我国“食源性疾病病例监测系统”,收集2018—2022年65岁以上老年人群主动监测病例信息,采集粪便标本,开展沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌和诺如病毒的检测,进行流行病学特征分析。结果老年人群急性胃肠炎病例粪便标本总体检出率为9.15%(7218/78904,95%CI:8.95%,9.35%),以沙门菌最高(3860/78699,4.90%,95%CI:4.75%,5.06%),其次为诺如病毒(1517/73173,2.07%,95%CI:1.97%,2.18%)、致泻大肠埃希菌(1.39%,1015/72763,95%CI:1.31%,1.48%)、副溶血性弧菌(1.00%,782/78386,95%CI:0.93%,1.07%)和志贺菌(0.19%,147/78611,95%CI:0.16%,0.22%)。老年人群男性沙门菌检出率高于女性,而女性副溶血性弧菌检出率高于男性,且年龄越大,检出率越低。老年人群各监测病原检出率具有明显季节性,沙门菌、志贺菌、副溶血性弧菌、致泻大肠埃希菌检出率在7、8月达到高峰,诺如病毒则在2、3月达到高峰,各地区监测病原检出率有所不同,差异具有统计学意义(χ^(2)=546.85,P预防老年人食源性疾病发生。

关键词：食源性疾病急性胃肠炎主动监测老年人沙门菌诺如病毒副溶血性弧菌致泻大肠埃希菌志贺菌

浙江省2022年儿童致死性溺水流行病学特征及相关因素分析

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 963-968页

作者：赵鸣邓晓尤柳青郭丽花李娜钟节鸣周晓燕浙江省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制所杭州310051 中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心伤害防控室北京100050

目的了解浙江省2022年儿童致死性溺水流行特征,为开展针对性干预提供依据。方法采用中国CDC慢性非传染性疾病预防控制中心设计的《儿童溺水死亡调查表》,通过病史/死亡调查记录查询、电话调查、入户调查等方式收集2022年浙江省因溺水死... 详细信息

目的了解浙江省2022年儿童致死性溺水流行特征,为开展针对性干预提供依据。方法采用中国CDC慢性非传染性疾病预防控制中心设计的《儿童溺水死亡调查表》,通过病史/死亡调查记录查询、电话调查、入户调查等方式收集2022年浙江省因溺水死亡的0~17岁儿童个案信息。结果2022年浙江省共发生儿童致死性溺水341名,完成调查330名,完成率为96.77%,男女性别比为2.33∶1,年龄以15~17岁和0~4岁为主,外省户籍儿童占54.24%。83.33%儿童致死性溺水为非故意溺水,随着年龄增长,儿童自己故意溺水死亡比例呈上升趋势。低年龄组儿童溺水死亡主要发生在公共蓄水设施,高年龄组儿童主要发生在开放自然水域。275名儿童非故意致死性溺水中,73.09%不会游泳;现场有成年人看护且看护距离在一臂之内、看护时不间断且未做其他事情的比例仅为1.09%。溺水现场明确有第一急救人员在场者占47.63%,以医务人员、成年看护人和路人为主,第一时间获得急救措施为心肺复苏且发生溺水到获得心肺复苏间隔时间≤5 min者占2.18%。结论浙江省2022年不同年龄组溺水死亡儿童的溺水意图、溺水发生场所等存在差异。应将提高儿童游泳技能、重视成年人有效看护、提高现场急救技术普及率等作为干预重点,不断降低儿童溺水的发生及所致死亡。

关键词：溺水致命性伤害儿童流行特征