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病原微生物宏基因组测序生物信息分析及报告质量控制专家共识

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中华检验医学杂志 2025年第1期48卷 28-37页

作者：中华医学会检验医学分会李莉王成彬王传新陈崴李少川韩东升不详上海交通大学医学院附属第一人民医院检验医学中心解放军总医院第一医学中心检验科山东大学第二医院检验医学中心西安交通大学医学院第一附属医院检验科广州市瑞因生命科学研究院浙江大学医学院附属第一医院检验科

病原微生物宏基因组测序(mNGS)对临床感染性疾病的诊断和治疗具有重要作用。近年,国内外多项关于mNGS技术标准化与临床实施的专家共识从不同的角度对该技术的临床实践起到了规范作用。但复杂的生物信息分析和非标准化的报告审核依然是m... 详细信息

病原微生物宏基因组测序(mNGS)对临床感染性疾病的诊断和治疗具有重要作用。近年,国内外多项关于mNGS技术标准化与临床实施的专家共识从不同的角度对该技术的临床实践起到了规范作用。但复杂的生物信息分析和非标准化的报告审核依然是mNGS在向临床转化过程中面临的重要挑战。为提高测序后生物信息分析方法的规范和质量以及报告的临床可靠性和诊断价值,中华医学会检验医学分会组织相关专家在系统性复习文献的基础上,结合临床实践需求,通过德尔菲专家函询及专家论证会,最终形成《病原微生物宏基因组测序生物信息分析及报告质量控制中国专家共识》(以下简称《共识》)。共识规定了临床疑似感染标本宏基因组测序后病原微生物生物信息分析的内容、方法和结果报告的规则与要求,为临床实验室规范使用该方法检测临床感染性病原微生物提供支持。

关键词：病原微生物宏基因组高通量测序质量控制生物信息

基于单分类支持向量机的煤矿防爆电气设备振动故障自动检测

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工矿自动化 2025年第02期 106-112页

作者：郑铁华王飞赵格兰杜春晖国家能源集团神东煤炭集团有限责任公司中国煤炭科工集团信息技术有限公司山西天地煤机装备有限公司

煤矿防爆电气设备在运行过程中产生的振动会损害其机械完整性，导致紧固件松动、零部件磨损，并改变设备的结构与振动模态，进而引发信号特征的复杂变化，使得正常振动频率与故障引发的新频率成分相互混淆，模糊了正常信号与故障信号之... 详细信息

煤矿防爆电气设备在运行过程中产生的振动会损害其机械完整性，导致紧固件松动、零部件磨损，并改变设备的结构与振动模态，进而引发信号特征的复杂变化，使得正常振动频率与故障引发的新频率成分相互混淆，模糊了正常信号与故障信号之间的界限，从而降低传统检测方法在故障检测中的准确性。针对上述问题，提出一种基于单分类支持向量机（OCSVM）的煤矿防爆电气设备振动故障自动检测方法。首先，构造设备的正常状态特征和振动故障状态特征，根据OCSVM的特性，将正常状态特征序列设定为OCSVM核函数的决策边界学习目标。考虑煤矿防爆电气设备振动故障信号呈现非线性和高维特征，选定多项式核作为OCSVM的核函数。然后，采用网格搜索和K-交叉验证相结合的方式对OCSVM进行参数调优，以使OCSVM达到更好的性能。最后，通过求取OCSVM目标函数的最优解，确定最优决策边界，以此实现煤矿防爆电气设备振动故障的自动检测。实验结果显示：(1)在迭代次数为20时，OCSVM算法算法可完成收敛，达到稳定。(2)基于OCSVM的电气设备信号划分实验中，借助多项式核函数能精准划分样本实现检测。(3)振动故障自动检测性能分析中，所提方法在各样本量下准确率均显著高于红外热成像技术检测方法、基于灰狼优化支持向量机模型检测方法，小样本量时准确率达98.25%且稳定性好。

关键词：煤矿防爆电气设备振动故障检测单分类支持向量机变分模态分解熵矩阵

系统性硬化症合并干燥综合征的临床特征分析及危险因素研究

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中国全科医学 2025年第6期28卷 737-741,750页

作者：邹松炎张日伊李孝东穆银玉浙江省宁波市医疗中心李惠利医院检验科 315040

背景系统性硬化症(SSc)是异质性疾病,常同时合并干燥综合征(SS),SSc患者部分症状与SS相似,临床诊治过程中容易漏诊SS。目的探讨SSc合并SS患者的临床和实验室特点及重叠发病的危险因素。方法回顾性纳入2019—2023年在宁波市医疗中心李惠... 详细信息

背景系统性硬化症(SSc)是异质性疾病,常同时合并干燥综合征(SS),SSc患者部分症状与SS相似,临床诊治过程中容易漏诊SS。目的探讨SSc合并SS患者的临床和实验室特点及重叠发病的危险因素。方法回顾性纳入2019—2023年在宁波市医疗中心李惠利医院住院治疗的SSc患者为研究对象,收集患者基线资料和实验室检查结果。依据是否合并SS将患者分为SSc组(n=91)和SSc合并SS组(n=36)。采用多因素Logistic回归分析探究SSc合并SS的危险因素。结果SSc合并SS组患者女性比例、病程、血液受累、局限性皮肤型SSc(lcSSc)、自身免疫性肝病比例高于SSc组,肺部受累比例、环磷酰胺使用比例低于SSc组(P<0.05)。SSc合并SS组患者血小板分布宽度、补体C4、抗硬皮病70抗体检出率低于SSc组,碱性磷酸酶、谷氨酰转肽酶、免疫球蛋白M(IgM)、抗着丝点蛋白B抗体(抗CENP-B抗体)、抗干燥综合征A/Ro52抗体(抗SSA/Ro52抗体)、抗干燥综合征A/Ro60抗体(抗SSA/Ro60抗体)、抗干燥综合征B抗体(抗SSB抗体)、抗线粒体M2抗体(AMA-M2)检出率高于SSc组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,IgM升高(OR=3.796,95%CI=1.021~14.115)、抗SSA/Ro52抗体阳性(OR=15.099,95%CI=1.750~130.264)、抗CENP-B抗体阳性(OR=11.681,95%CI=1.662~82.097)是SSc合并SS的独立危险因素(P<0.05)。结论SSc合并SS患者同时具备两者的特点,当SSc患者IgM偏高,抗SSA/Ro52抗体、抗CENP-B抗体阳性并出现相应临床症状时,应进行唇腺活检等系统全面的检查,以防漏诊。

关键词：硬皮病,系统性系统性硬化症干燥综合征临床特点实验室特点危险因素

湖州市某三甲医院住院患者艰难梭菌毒素基因检测及其分子流行病学分析

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中国抗生素杂志 2025年第2期 129-136页

作者：郑莉莉强鑫华嵇龙飞湖州市第一人民医院检验科

目的研究地市级医院住院患者艰难梭菌感染的发生情况，并分析艰难梭菌的分子流行病学特征。方法收集湖州市第一人民医院2023年11月—2023年12月住院腹泻患者粪便标本，培养分离艰难梭菌后，采用核酸扩增技术检测毒素基因，菌株经全基... 详细信息

目的研究地市级医院住院患者艰难梭菌感染的发生情况，并分析艰难梭菌的分子流行病学特征。方法收集湖州市第一人民医院2023年11月—2023年12月住院腹泻患者粪便标本，培养分离艰难梭菌后，采用核酸扩增技术检测毒素基因，菌株经全基因测序后(Whole Genome Sequencing, WGS)进行分子流行病学分析。结果从500份住院患者腹泻样本中分离得到49株艰难梭菌，其中产毒型艰难梭菌40株，艰难梭菌感染(Clostridium difficile infections, CDI)阳性率为8.00%;PCR检测的毒素基因主要为tcdA(+)/tcdB(+)，双毒素基因阴性(A+B+CDT-)，占97.50%(39/40),1株携带双毒素基因(A+B+CDT+);CDI阳性率最高的科室是消化内科，其次为ICU;MLST分型中，共有13种ST型别，其中ST2型为优势型别，占30.00%；结合WGS数据分析，未发现艰难梭菌菌株在研究期间发生流行和传播。结论本院CDI在住院腹泻患者中的发生率较低，未发生院内感染传播和暴发流行现象，但不排除存在未知感染源可能性，应重点关注重点科室，如ICU患者发生CDI情况。

关键词：住院患者腹泻艰难梭菌毒素基因分子分型

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利用临床特征与生化指标建立细菌性脑膜炎转归不良的风险预测模型

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国际医药卫生导报 2025年第4期31卷 663-668页

作者：李博迟洁高蒙陕西省人民医院检验科西安710068 兵器工业总医院检验科西安710068

目的分析细菌性脑膜炎患儿的临床特征与生化指标,构建转归不良的风险预测模型。方法对陕西省人民医院2020年9月至2024年5月收治的274例细菌性脑膜炎患儿的临床资料展开回顾性分析,其中男156例、女118例,年龄范围0~18岁。根据患儿院内治... 详细信息

目的分析细菌性脑膜炎患儿的临床特征与生化指标,构建转归不良的风险预测模型。方法对陕西省人民医院2020年9月至2024年5月收治的274例细菌性脑膜炎患儿的临床资料展开回顾性分析,其中男156例、女118例,年龄范围0~18岁。根据患儿院内治疗结局将其分为转归不良组和转归良好组,分析其转归不良的危险因素。利用临床特征与生化指标建立细菌性脑膜炎转归不良的风险预测列线图模型,并进一步评价模型的区分度、预测性能及实用性。采用Mann-Whitney U、t、χ^(2)检验进行统计比较,模型的区分度、预测性能、实用性分别采用受试者操作特征曲线(ROC)及曲线下面积(AUC)、校准曲线及Hosmer-Lemeshow检验、决策分析曲线进行评价。结果274例细菌性脑膜炎患儿转归不良65例(23.72%)。反复惊厥发作、脑脊液蛋白>1 g/L、脑脊液葡萄糖/血糖降低、血/脑脊液细菌培养阳性是细菌性脑膜炎转归不良的危险因素(均P检验显示,模型预测转归不良概率与实际转归不良概率接近(P=0.394);决策分析曲线显示,当高风险阈值在0.06~0.77时应用模型预测具有较好价值。结论基于反复惊厥发作、脑脊液蛋白、脑脊液葡萄糖/血糖、血/脑脊液细菌培养4个危险因素构建细菌性脑膜炎转归不良的风险预测列线图模型具有良好的应用价值。

关键词：细菌性脑膜炎儿童临床特征生化指标病情转归列线图模型

激活miR-33/TRAF3信号通路探究BMSCs对ICU-获得性肌无力大鼠炎性抑制及TH细胞的影响

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中国老年学杂志 2025年第05期 1238-1242页

作者：卢焱坤张晓磊刘建辉沧州市中心医院检验科唐山市开滦总医院沧州市中心医院神经内科

目的基于微小RNA(miR)-33/肿瘤坏死因子(TNF)受体相关因子(TRAF)3信号通路探究骨髓间充质干细胞(BMSCs)对重症加强护理病房(ICU)-获得性肌无力大鼠炎性因子及TH细胞的影响。方法选取50只SPF级SD雄性大鼠，随机分为正常(CO)组、模型(MO... 详细信息

目的基于微小RNA(miR)-33/肿瘤坏死因子(TNF)受体相关因子(TRAF)3信号通路探究骨髓间充质干细胞(BMSCs)对重症加强护理病房(ICU)-获得性肌无力大鼠炎性因子及TH细胞的影响。方法选取50只SPF级SD雄性大鼠，随机分为正常(CO)组、模型(MO)组、BMSCs(BS)组、miR-33 mimics(MM)组、BMSCs+miR-33 mimics(BM)组各10只，MO、BS、MM、BM组采用脓毒症+固定法建立ICU-获得性肌无力模型，CO组不建立该模型，建模成功后，BS组肌肉注射10μl BMSCs, MM组肌肉注射1×10～5/ml miR-33 mimics, BM组注射BMSCs和miR-33 mimics, CO组、MO组同期注射同体积生理盐水，苏木素-伊红(HE)法检测肌肉组织病理形态，实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法检测肌肉组织中miR-33及TRAF3的mRNA相对表达，酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中相关炎性因子水平，Western印迹法检测辅助性T细胞相关因子蛋白表达。结果 CO组肌肉组织完整且横纹清晰，肌纤维排列规则，肌细胞结构正常，MO组可见肌肉正常结构及部分横纹消失，横纹肌细胞间隙增宽，可见明显肌纤维萎缩，且肌核内移并染色加深，肌质染色变浅区域明显增大，与MO组相比，BS组、MM组、BM组可见不同程度的恢复，病理症状明显改善，且BM组改善最明显。与CO组比较，MO组肌肉组织中miR-33及TRAF3 mRNA、IL-4蛋白表达明显降低，血清TNF-α、IL-2、IL-6水平、肌肉组织中INF-γ蛋白表达明显升高(P0.05)。miR-33与TRAF3呈正相关(r=0.964,P<0.001)。结论 BMSCs可显著降低ICU-获得性肌无力大鼠炎性因子水平，可能调节TH细胞分化，其作用机制可能与激活miR-33/TRAF3信号通路有关。

关键词：骨髓间充质干细胞(BMSCs) 重症加强护理病房(ICU)-获得性肌无力炎性因子辅助性T(Th)细胞 miRNA-33/肿瘤坏死因子(TNF)受体相关因子(TRAF)3信号通路

人类免疫缺陷病毒感染检测与诊断管理的专家共识

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中华预防医学杂志 2025年第2期59卷 127-137页

作者：无李伯安李一荣中国医疗保健国际交流促进会基层检验技术标准化分会中国人民解放军总医院第五医学中心检验科北京100039 武汉大学中南医院检验科武汉430071

艾滋病(AIDS)在全球范围内仍然是一个严重的公共卫生问题,本共识由中国医疗保健国际交流促进会基层检验技术标准化分会组织,汇集了全国AIDS相关领域的检验、公共卫生和传染病学专家经过三轮集体讨论生成。共识制订过程中,专家们结合国... 详细信息

艾滋病(AIDS)在全球范围内仍然是一个严重的公共卫生问题,本共识由中国医疗保健国际交流促进会基层检验技术标准化分会组织,汇集了全国AIDS相关领域的检验、公共卫生和传染病学专家经过三轮集体讨论生成。共识制订过程中,专家们结合国内外最新人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)相关指南和研究,通过文献回顾、专家讨论、证据分级和共识形成的方法流程,确保共识的科学性和实用性。本共识主要对HIV感染的检测技术及规范更新、HIV感染的诊断与防治策略、重点人群接受HIV感染检测的建议以及HIV感染检测面临的挑战和发展方向进行了相关阐述。旨在实现全球2030年终结AIDS流行的目标,促进重点人群尽早进行HIV筛查、早诊断和早治疗,为医疗工作者提供科学、规范的指导,提高HIV感染的检测率、诊断准确性和管理水平,从而改善患者的生活质量和预后,推动公共卫生事业的发展,最终实现有效的HIV病毒抑制。

关键词：人类免疫缺陷病毒艾滋病检测诊断专家共识

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1株高毒力肺炎克雷伯菌外膜囊泡特征鉴定

中华医院感染学杂志 2025年 2-6页

作者：郭娜王丽凤邱雪梅叶丽艳杨继勇解放军医学院解放军总医院第一医学中心检验科

目的分析1株高毒力肺炎克雷伯菌(hvK p)11492外膜囊泡(OMVs)的特征。方法选取解放军总医院第一医学中心血流分离的hvK p的1株主要克隆株hvK p11492,经基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪和全基因组测序进行菌株鉴定。采用高速离心与聚合... 详细信息

目的分析1株高毒力肺炎克雷伯菌(hvK p)11492外膜囊泡(OMVs)的特征。方法选取解放军总医院第一医学中心血流分离的hvK p的1株主要克隆株hvK p11492,经基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪和全基因组测序进行菌株鉴定。采用高速离心与聚合物沉淀相结合的方法分离纯化hvK p11492-OMVs,透射电子显微镜(TEM)和纳米颗粒追踪技术(NTA)鉴定其形态及大小,二喹啉甲酸(BCA)法及液相色谱-质谱(LC/MS)串联技术分析其蛋白组学特征,PCR技术检测其携带的毒力基因。结果 TEM观察hvK p11492-OMVs为大小不一、圆形或椭圆形、具有完整双层膜的囊泡状结构;NTA结果显示hvK p11492-OMVs平均粒径为270 nm。hvK p11492-OMVs携带的蛋白质含量为(2.448±0.975)μg/μl,亚细胞定位结果发现其包括胞浆蛋白、细胞内膜蛋白、细胞周质蛋白、细胞外膜蛋白、核区蛋白和细胞外蛋白,通过GO数据库注释发现其参与氧化还原、翻译和代谢等生物过程。其中,hvK p11492-OMVs含有GDP-L-岩藻糖合成酶、铁离子转运蛋白、铁蛋白等与致病性相关的多种蛋白质。除此之外,hvK p11492-OMVs携带iutA、iroN、iucA和rmpA毒力基因。结论本研究鉴定了hvK p11492-OMVs的形态、大小、蛋白组学等特征,发现hvK p11492-OMVs携带多种与毒力和致病性相关的蛋白质和基因。

关键词：外膜囊泡高毒力肺炎克雷伯菌形态学蛋白组学致病性

Sneathia sanguinegens在女性不明原因复发性流产不良妊娠结局中的价值初探

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复旦学报(医学版) 2025年第1期52卷 99-106,138页

作者：赵付菊胡贤洋刘璐黄茜茜王菲菲高晶杜美蓉应春妹复旦大学附属华东医院检验科上海200040 复旦大学附属妇产科医院研究所上海200090 复旦大学附属妇产科医院检验科上海200011

目的本研究探讨Sneathia sanguinegens(***)在女性不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)不良妊娠结局中的价值。方法利用16S rRNA测序技术分析比较65例URSA患者与18例健康对照女性的阴道菌群特征;细胞... 详细信息

目的本研究探讨Sneathia sanguinegens(***)在女性不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)不良妊娠结局中的价值。方法利用16S rRNA测序技术分析比较65例URSA患者与18例健康对照女性的阴道菌群特征;细胞水平分析***对人子宫颈表皮癌细胞ME-180、人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cell,HUVEC)及人胎盘绒毛膜癌细胞JEG-3的毒性特征,以评估其在不良妊娠结局中的作用机制;在动物水平分析***感染C57BL/6J小鼠后对机体的毒性反应。结果与健康对照组相比,URSA患者阴道的Sneathia相对丰度显著升高,与流产次数呈正相关,种水平发现组间差异是由***引起。在细胞水平发现***可破坏ME-180、JEG-3和HUVEC细胞,细胞损伤程度与细胞中的菌浓度呈正相关。在动物水平发现,静脉感染***后可引发小鼠多个脏器炎症性损伤,脾脏出现髓外造血现象。结论***与URSA密切相关,当患者阴道该菌高载量时应引起重视。

关键词： Sneathia sanguinegens(S.sanguinegens) 不明原因复发性流产(URSA) 不良妊娠致病机制

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