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新冠疫情大流行期间广州市H3N2流感病毒分子流行特征分析

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中华预防医学杂志 2024年第3期58卷 351-357页

作者：曹蓝周腾飞陈艺韵马蒙蒙夏丹刘艳慧李魁彪狄飚秦鹏哲张周斌广州市疾病预防控制中心病毒免疫部广州510440 广州市疾病预防控制中心传染病预防控制部广州510440 广州市疾病预防控制中心主任室广州510440

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰... 详细信息

分析新型冠状病毒疫情(新冠疫情)大流行期间广州市H3N2流感病毒分子变异特征。收集流感监测哨点医院流感样病例样本,进行病毒分离和全基因组高通量测序。结果显示,新冠疫情大流行期间广州市在2022年第二季度出现了一次H3N2流感流行高峰(阳性率为52.23%),流行强度和持续时间均高于2019年H3N2流感流行期。2022年流行株HA基因和NA基因均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与2019年冬季的H3N2流行株进化分支(Group-3 毒株3C.2a1b.1a)不同。2022年流行株抗原位点变异主要发生在C区I48T位,HA蛋白受体结合位点与疫苗株一致。大部分流行株在HA蛋白上带有13个糖基化位点,一起暴发疫情分离株发生24-NST处糖基化位点的缺失。综上,新冠疫情大流行期间,引起广州市2022年H3N2流感流行的病毒株属于新衍生进化分支,进化起源上并非由2019年广州市毒株直接传播进化而来。

关键词： H3N2流感病毒分子变异遗传特征新型冠状病毒监测

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全球脑膜炎球菌多糖结合疫苗研究进展

中华微生物学和免疫学杂志 2024年第4期44卷 304-316页

作者：徐娟严冬山徐丽李杰邵祝军中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

流行性脑脊髓膜炎(流脑)是由脑膜炎球菌感染引起的急性中枢神经系统性疾病,具有发病不确定性、起病急、进展快、致死和致残率均较高等特点,疾病负担重。脑膜炎球菌常定植在人的鼻咽部,国际上通常将脑膜炎球菌引起的一系列疾病,如败血症... 详细信息

流行性脑脊髓膜炎(流脑)是由脑膜炎球菌感染引起的急性中枢神经系统性疾病,具有发病不确定性、起病急、进展快、致死和致残率均较高等特点,疾病负担重。脑膜炎球菌常定植在人的鼻咽部,国际上通常将脑膜炎球菌引起的一系列疾病,如败血症、关节炎、脑膜炎、肺炎和心包炎等疾病统称为脑膜炎球菌病(meningococcal diseases)。至今接种疫苗是控制和预防该病最经济有效的措施之一。脑膜炎球菌分为12种血清群,目前全球均面临多菌群流行和变迁的威胁,为给人群提供更广更全的保护,多联多价脑膜炎球菌疫苗已成为研发和使用主力军。脑膜炎球菌疫苗的研发先后经历从单价到多价,从多糖到多糖结合疫苗的过程。脑膜炎球菌多糖结合疫苗在提升免疫原性、诱导免疫记忆和降低带菌率等方面具有明显优势。国际上首款四价和五价脑膜炎球菌多糖结合疫苗分别于2005年和2023年上市,我国首款四价脑膜炎球菌多糖结合疫苗于2021年底获批上市。本综述将系统梳理脑膜炎球菌多糖结合疫苗的研究进展,以期为我国脑膜炎球菌多糖结合疫苗的应用、脑膜炎球菌病的防控策略制定提供参考。

关键词：脑膜炎球菌病多糖结合疫苗安全性免疫原性持久性

群体感应调控子AphA对河弧菌Ⅵ型分泌系统VflT6SS2的调控研究

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中华流行病学杂志 2024年第4期45卷 566-573页

作者：程倩韩雨黄元铭冀赛森李杰刁保卫梁未丽传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR... 详细信息

目的研究河弧菌群体感应调控子AphA对Ⅵ型分泌系统VflT6SS2功能活性的调控机制。方法采用Western Blot检测河弧菌野生株、aphA缺失株(ΔaphA)和aphA回补株中VflT6SS2标志性组件溶血素共调节蛋白(Hcp)的表达和分泌。采用实时荧光定量PCR和启动子-lux融合冷光系统检测野生株和ΔaphA中VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇代表基因tssB2、hcp(tssD2)和vgrG(tssI2)以及群体感应调控子HapR的mRNA相对表达量和启动子活性。采用定点突变实验结合启动子活性测定确定AphA在tssD2b启动子区的调控结合位点;采用电泳迁移率位移测定(EMSA)确定AphA与hapR启动子的结合。结果ΔaphA中tssB2、hcp(tssD2)、vgrG(tssI2)和hapR的mRNA相对表达量及Hcp蛋白的表达分泌明显高于野生株。VflT6SS2核心基因簇、tssD2a、tssI2a和hapR的启动子活性在ΔaphA中均高于野生株,而tssD2b启动子活性则低于野生株。tssD2a和tssD2b的启动子序列分析显示-335 bp~-229 bp区差异较大,在tssD2b中该区域存在2个潜在AphA结合位点,将其中的保守位点ATG替换为CGA,tssD2b启动子活性明显降低。EMSA结果显示,AphA与hapR启动子直接结合。结论AphA在转录水平直接抑制hapR的表达,间接参与对VflT6SS2核心基因簇和附属基因簇的调控。AphA对tssD2a和tssD2b呈现相反的调控模式,AphA可直接与tssD2b启动子区(-335 bp~-229 bp)结合正向调控tssD2b的表达。

关键词：河弧菌群体感应调控子 Ⅵ型分泌系统转录调控

甘肃省2012-2022年肾综合征出血热自然疫源地特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 117-122页

作者：魏孔福刘新凤苟发香王旭霞姜中毅李治平张晓曙甘肃省疾病预防控制中心传染病预防控制所兰州730000

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在... 详细信息

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在0.05/10万~1.21/10万之间,病例主要分布于甘肃省东部的平凉市、东南部的天水市、南部的甘南藏族自治州(甘南州),以及中部以南的定西市;20~60岁年龄组居多,男女性别比为1.85∶1(564∶305),职业以农民(61.80%,537/869)、牧民(19.79%,172/869)和学生(6.33%,55/869)为主。野鼠型发病以每年11月至次年1月为高峰。啮齿类宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,汉滩病毒携带率分别为2.79%(21/754)、0.42%(5/1179)和0.31%(2/643)。甘肃省目前确定了3个疫源地,其中2个分别是平凉市和甘南州的新发疫源地,另1个为定西市的老疫源地。结论甘肃省南部、中部以南和东部地区是目前主要的HFRS疫源地,宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,病毒基因型为汉滩病毒。病例报告地区应加强疫情的监测,疫情重点地区应强化和落实各项预防和控制措施,以减少HFRS带来的危害。

关键词：肾综合征出血热疫源地特征

中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析基因型多态性

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中华流行病学杂志 2024年第7期45卷 990-996页

作者：张慧娟张恩民贺金荣李伟魏建春传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编... 详细信息

目的分析中国炭疽芽胞杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)基因型多态性,建立中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库。方法收集1947年以来中国不同来源的炭疽芽胞杆菌分离菌株,采用MLVA15分型策略进行基因型鉴定,对基因型进行统一编号和命名,分析不同来源菌株MLVA基因型的分布特征,同时通过Bionumerics软件绘制聚类图,分析不同基因型间的遗传关系。结果MLVA15分型可将533株中国炭疽芽胞杆菌分为4群91个基因型,其中54个基因型为中国独有的基因型。新命名的基因型MLVA15-CHN1~MLVA15-CHN6广泛分布于中国不同地区、不同年代和宿主,其余基因型具有地区和年代特征性。结论本研究建立了中国炭疽芽胞杆菌MLVA基因型数据库,掌握了MLVA基因型分布特征及其遗传多态性,为中国炭疽疫情防控及分子溯源技术提供了参考依据。

关键词：炭疽芽胞杆菌基因分型多位点可变数目串联重复序列分析遗传多态性

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质谱技术在核酸检测分析中的研究进展

中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 98-106页

作者：赵欣肖迪传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

质谱技术是一种基于质谱仪设备检测物质分子量的谱学技术方法。质谱类型众多、功能各异,在各个学科领域中广泛用于科学研究与应用技术开发。近年来,质谱技术在核酸检测分析中显现出巨大的潜力,尤其是基于基质辅助激光解吸电离飞行时间... 详细信息

质谱技术是一种基于质谱仪设备检测物质分子量的谱学技术方法。质谱类型众多、功能各异,在各个学科领域中广泛用于科学研究与应用技术开发。近年来,质谱技术在核酸检测分析中显现出巨大的潜力,尤其是基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱的核酸检测分析技术,因其快速、高通量、准确等特性而成为研究热点。采用质谱技术进行核酸研究,突出表现在对单核苷酸多态性、基因突变、DNA甲基化及DNA拷贝数变异的检测分析。本文对质谱技术在核酸检测中的研究与应用进行阐述,以期为基于质谱的新型核酸检测技术的开发与应用提供参考。

关键词：质谱 DNA甲基化单核苷酸多态性 DNA拷贝数变异多重PCR-质谱微测序

2023年河南省外环境H7N9禽流感病毒的基因组序列分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第5期44卷 377-381页

作者：毋碧聪罗雪卢世栋宋云张白帆卫海燕聂轶飞夏晖万思嘉叶莹黄学勇郭万申马红霞河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室郑州450016 许昌市疾病预防控制中心检验检测中心许昌461000

目的分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征。方法采集禽类粪便、污水,以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本,实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流... 详细信息

目的分析活禽市场相关环境中检出的H7N9禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的遗传进化和分子特征。方法采集禽类粪便、污水,以及脱毛机和案板擦拭拭子等标本,实时荧光定量PCR鉴定甲型流感病毒和H7N9亚型。对于H7N9阳性标本以甲型流感病毒通用引物扩增病毒全基因组并测序,利用BLAST和MEGA X软件进行序列比对、系统进化和分子特征分析。结果2023年2月采集于许昌市活禽市场的7份外环境标本中检出4份H7N9 AIV阳性,3份H7N9 AIV阳性标本测序成功,其各基因核苷酸一致性较高(98.37%~100.00%)。BLAST分析显示主要与我国2020—2021年国内禽中分离的H7N9毒株一致性最高。遗传进化分析显示3株病毒株聚在同一分支,与最近环境分离株相聚较近,而与最近人/禽感染病毒株关系较远。通过与各时期的代表性病毒株序列比对发现,本研究检出的病毒株呈禽高致病性,裂解位点处插入了4个氨基酸KRAA,病毒株血凝素受体结合位点为QSG,属于禽结合受体,血凝素出现G186I位点突变。聚合酶碱性蛋白2未出现哺乳动物适应性E627K突变。未检测到与神经氨酸酶抑制剂(奥司他韦)和聚合酶酸性蛋白抑制剂(巴洛沙韦)耐药相关的R292K和I38T位点突变,提示病毒对上述药物敏感性未降低。M2蛋白出现S31N突变,提示对烷胺类药物耐药。结论从活禽市场检出的3株H7N9病毒株呈禽高致病性,与既往感染人/禽代表株相比,未明显增加人受体结合力、哺乳动物致病性、病毒传播力和耐药相关分子位点。

关键词：禽流感病毒 H7N9 活禽市场遗传进化突变

2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第2期36卷 130-136页

作者：师悦耿梦杰周升陈曦孙军玲田雪莹徐红李昱郑灿军传染病溯源预警与智能决策国家重点实验室、中国疾病预防控制中心北京102206 山东省疾病预防控制中心广西壮族自治区南宁市疾病预防控制中心

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病... 详细信息

目的分析2010—2022年我国钩端螺旋体病流行病学特征,为制订钩端螺旋体病防控策略提供参考依据。方法在中国疾病预防控制信息系统中,收集2010年1月1日至2022年12月31日报告的钩端螺旋体病临床诊断病例和确诊病例信息,采用描述性流行病学方法对病例地区、时间、人群分布及报告和诊断机构进行分析。结果 2010—2022年全国累计报告钩端螺旋体病病例4 559例,年均报告351例;报告病例数从2010年的679例下降至2018年的158例。四川省、云南省、广东省、湖南省、福建省、浙江省、广西壮族自治区、安徽省、江西省和贵州省累计报告钩端螺旋体病病例4 276例,占全国病例总数的93.79%;其中云南省近年病例数大幅下降,浙江省、广东省报告病例数明显增加。2010—2020年河南省无钩端螺旋体病病例报告,但2021、2022年分别报告5例和2例;2010—2017年陕西省仅报告1例病例,但自2018年起连续5年有病例报告。全国全年均有钩端螺旋体病病例报告,以8—10月为发病高峰,各省发病高峰存在差异;男性病例多于女性,男女性别比为2.3∶1;病例中位年龄50岁(四分位间距:23岁),以51~60岁组报告病例数占比最高(23.21%)。2010—2022年我国钩端螺旋体病报告病例中,确诊病例占53.28%,确诊病例占比从2010年的35.05%上升至2022年的61.66%。综合医院、疾病预防控制机构、基层卫生机构和其他卫生机构钩端螺旋体病报告病例数占比分别为67.22%(2 937例)、20.44%(893例)、7.23%(316例)、5.10%(223例)。2010—2022年全国钩端螺旋体病报告病例病死率为1.07%,男性病死率高于女性(1.39%vs.0.36%;χ^(2)=9.52,P=0.002)。结论2010—2022年我国钩端螺旋体病处于低水平流行状态,南方地区为主要流行区,各流行省份病例流行病学特征存在差异。陕西省、河南省等省份近年持续有病例报告,需加强关注。建议各地加强钩端螺旋体病监测,提升病例诊治能力,因地制宜开展防控工作。

关键词：钩端螺旋体病流行病学特征地区分布时间分布人群分布诊断监测中国

2007—2022年山东省百日咳流行特征及临床特点分析

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 33-39页

作者：冯蕾张岩刘新民刘桂芳刘晓冬李漫时张丽徐爱强山东省疾病预防控制中心免疫预防管理所、山东省传染病预防控制重点实验室济南250014 东营市疾病预防控制中心传染病预防控制科东营257091 山东大学预防医学研究院济南250014

目的分析2007—2022年山东省百日咳流行特征及临床特点。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2007—2022年山东省的百日咳病例资料,同时收集2007—2022年山东省百日咳疑似病例个案调查表数据库的部分个案信息,并分析百日咳的三间分布特... 详细信息

目的分析2007—2022年山东省百日咳流行特征及临床特点。方法收集中国疾病预防控制信息系统中2007—2022年山东省的百日咳病例资料,同时收集2007—2022年山东省百日咳疑似病例个案调查表数据库的部分个案信息,并分析百日咳的三间分布特征和临床特点,绘制山东省百日咳病例空间分布地图。结果2007—2022年山东全省共报告百日咳病例26122例,年报告发病率为0.11/10万~5.77/10万。每月均有百日咳病例报告,以春夏季居多,7、8月达到发病高峰。百日咳病例主要分布在中、西部地区,东部地区较少,热点地区由2007—2013年的菏泽、德州转移为2014—2022年的济南、泰安。发病年龄范围为1 d~93岁;≤1岁病例数最多(41.81%,10922/26122),0~6月龄病例占比由2007—2013年的32.21%(67/208)~55.67%(157/282)降低至2014—2022年的16.78%(883/5263)~41.97%(444/1058),趋势检验具有统计学意义(χ^(2)_(趋势)=670.01,P<0.001);百日咳男性病例13682例,女性12440例,男女性别比为1.10∶1.00;2007—2013年男女性别比为1.45∶1.00(806∶556),2014—2022年男女性别比为1.08∶1.00(12876∶11884),女性占比由2007年的42.31%(88/208)升高至2022年的47.84%(2518/5263),趋势检验具有统计学意义(χ^(2)_(趋势)=22.25,P<0.001)。百日咳病例中散居儿童、幼托儿童和学生占比分别为71.38%(18645/26122))、15.13%(3951例)、11.60%(3031例)。百日咳临床症状居前五位的分别为阵发性痉挛性咳嗽[86.33%(21411例)]、面红[39.61%(9824例)]、睡眠不安[34.51%(8558例)]、发热[30.80%(7638例)]和鸡鸣声[27.53%(6829例)]。24802例个案调查病例中,有百白破疫苗免疫史者占62.66%(15542例)。结论2007—2022年山东省百日咳病例发病率呈上升趋势,以低龄幼儿居多;临床症状较为典型。

关键词：博德特菌,百日咳疫苗流行病学研究临床特点监测