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结核分枝杆菌潜伏相关蛋白Rv2204c的生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2024年第1期19卷 32-35,41页

作者：王文涛姜吉亮王晓强隽中乾付玉荣伊正君潍坊医学院医学检验学院山东潍坊261053 潍坊医学院基础医学院

目的应用生物信息学方法分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)潜伏相关蛋白Rv2204c的结构及功能。方法从NCBI数据库中搜索Rv2204c蛋白的氨基酸序列,运用ProtParam, Signal 6.0 Server, ProtScale, TMHMM Server v.2.0,ProtCompB,NetNGlyc-1.0及NetPhos-3.1预测蛋白的理化性质、疏水性、信号肽、跨膜螺旋区、亚细胞定位及糖基化和磷酸化位点;运用SOPMA、SWISS-MODEL预测蛋白的二、三级结构;运用IEDB预测蛋白的B细胞抗原表位;采用SYFPEITHI,RANKPEP,NetMHC和NetCTL预测其细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位;采用SYFPEITHI、RANKPEP预测其辅助性T(Th)淋巴细胞表位;利用MEGA构建Rv2204c蛋白进化树;运用STRING蛋白相互作用数据库预测Rv2204c相互作用蛋白。结果 Rv2204c蛋白氨基酸总数为118,为亲水性稳定蛋白;该蛋白无信号肽,无跨膜螺旋区;亚细胞定位主要为细胞质;无糖基化位点,含5个磷酸化位点;二级结构中α-螺旋(Hh)占23.73%,β-转角(Tt)占10.17%,无规则卷曲(Cc)占39.83%;含多个优势T、B细胞表位;其互作蛋白为Rv0398c, Rv0883c, pyrD(Rv2139),Rv1465,Rv1463,Rv2205c, ppiA(Rv0009),mmsA(Rv0753c),kgd(Rv1248c)和lipA(Rv2218),参与固氮、脂酸盐合成等多个生物过程。结论 Rv2204c为亲水性稳定蛋白,具有多个T、B细胞抗原表位,可能在潜伏结核感染过程中发挥重要作用,可作为结核病诊断的候选蛋白和治疗新靶点。

关键词：结核分枝杆菌结核潜伏感染 Rv2204c 生物信息学

附子理中丸联合美沙拉嗪通过影响AMPK/NF-κB信号通路治疗脾肾阳虚型溃疡性结肠炎

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中药药理与临床 2024年

作者：谷金华李文文代洪生李光彩史立宏张小茜潍坊医学院附属医院消化内一科潍坊医学院临床医学院潍坊医学院康复医学院

目的：观察附子理中丸联合美沙拉嗪肠溶片对脾肾阳虚型溃疡性结肠炎（UC）的疗效并探究其作用机制。方法：将潍坊医学院附属医院消化内科于2020年12月-2022年6月收治的70例脾肾阳虚型UC患者随机分成治疗组（36例）和对照组（34例）。对... 详细信息

目的：观察附子理中丸联合美沙拉嗪肠溶片对脾肾阳虚型溃疡性结肠炎（UC）的疗效并探究其作用机制。方法：将潍坊医学院附属医院消化内科于2020年12月-2022年6月收治的70例脾肾阳虚型UC患者随机分成治疗组（36例）和对照组（34例）。对照组予美沙拉嗪肠溶片进行治疗，治疗组在美沙拉嗪基础上联合附子理中丸治疗，疗程均为3月。观察两组患者治疗前后中医证候积分、改良Mayo评分、IBDQ量表积分变化并对比远期复发率。酶联免疫吸附法（ELISA）检测治疗前后血清白细胞介素-6（IL-6）、IL-1β、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、IL-10含量的变化。免疫组化与蛋白质免疫印迹法（Western blot）检测治疗前后两组患者溃疡性结肠炎组织样本磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶（p-AMPK）、磷酸化UNC-51样激酶（p-ULK1）、磷酸化P65（p-P65）的表达情况。结果：治疗组的总有效率为97.2％，对照组为79.4％，治疗组的疗效显著优于对照组（P＜0.05）。两组血清IL-6、IL-1β、TNF-α含量较治疗前明显降低，IL-10含量明显升高，且治疗组降低/升高水平显著优于对照组（P＜0.05）。治疗后，与对照组比较，治疗组p-AMPK、p-ULK1表达水平明显上调，p-P65表达明显下调（P＜0.05），且治疗组远期复发率明显降低（P＜0.05）。结论：附子理中丸联合美沙拉嗪肠溶片对脾肾阳虚型UC的疗效显著优于单纯使用美沙拉嗪肠溶片。附子理中丸联合美沙拉嗪能明显改善临床症状和预后，同时抑制炎症因子表达，潜在的机制可能与激活腺苷酸活化蛋白激酶（AMPK）、抑制核因子κB（NF-κB）有关。

关键词：附子理中丸溃疡性结肠炎脾肾阳虚腺苷酸活化蛋白激酶核因子κB

人类精子代谢和表观遗传调控通过影响精子活力导致男性不育的研究进展

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中华生殖与避孕杂志 2024年第5期44卷 548-555页

作者：孙非凡张茂翔姜昱王纳任发乔鹏云潍坊医学院附属医院(临床医学院) 潍坊261042 潍坊医学院附属医院生殖医学中心潍坊261041

精子作为男性体内高度分化的单倍体生殖细胞,是生命遗传信息传递的重要载体,其结构完整是正常受精的条件,也是正常代谢产生能量和完成表观遗传的基础。精子代谢被认为是精子运动的“供能站”,保证精子发生、成熟、过活化和精卵结合等生... 详细信息

精子作为男性体内高度分化的单倍体生殖细胞,是生命遗传信息传递的重要载体,其结构完整是正常受精的条件,也是正常代谢产生能量和完成表观遗传的基础。精子代谢被认为是精子运动的“供能站”,保证精子发生、成熟、过活化和精卵结合等生命活动正常进行,代谢异常会直接影响精子活力造成男性不育。而精子表观遗传是一种通过父系遗传来影响后代胚胎发育和繁殖的过程,包括DNA甲基化、染色质重塑和精子携带的小RNA等多种调控方式,它们可在一定程度上影响能量产生,进而导致精子活力和男性生育力下降。因此,精子代谢和表观遗传在维持精子活力方面有着不可分割的联系,本文就人类精子结构、代谢和表观遗传调控方面进行综述,以期为与它们相关的精子活力异常导致的男性不育症相关研究提供理论参考。

关键词：氧化磷酸化活性氧组蛋白 DNA甲基化精子代谢

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脐带来源间充质干细胞抑制巨噬细胞M1极化

中国免疫学杂志 2024年第4期40卷 673-679页

作者：王晓旭李超然王惠杨春娟刘凤霞徐栋花潍坊医学院临床医学院潍坊261053 潍坊医学院第一附属医院中心实验室潍坊261041 潍坊医学院第一附属医院过敏反应科潍坊261041 潍坊医学院第一附属医院风湿免疫科潍坊261041

目的:探究人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)对巨噬细胞M1/M2极化的作用。方法:将hUC-MSCs与佛波酯(PMA)诱导分化的巨噬细胞样细胞(pTHP-1巨噬细胞)共培养后进行转录组测序分析,筛选差异表达基因,进一步进行GO及KEGG富集分析。细胞增殖实验(... 详细信息

目的:探究人脐带间充质干细胞(hUC-MSCs)对巨噬细胞M1/M2极化的作用。方法:将hUC-MSCs与佛波酯(PMA)诱导分化的巨噬细胞样细胞(pTHP-1巨噬细胞)共培养后进行转录组测序分析,筛选差异表达基因,进一步进行GO及KEGG富集分析。细胞增殖实验(CCK-8和EdU)分析hUC-MSCs对pTHP-1细胞增殖的影响。流式细胞术检测hUC-MSCs对LPS刺激的pTHP-1巨噬细胞炎症因子TNF-α表达及抑炎因子IL-10表达的影响。qRT-PCR及流式细胞术探究hUC-MSCs对pTHP-1巨噬细胞M1/M2相关分子表型的作用。结果:转录组测序数据分析发现hUC-MSCs与pTHP-1细胞共培养后M1相关基因TNF-α(P<0.05)、HLA-DRA(P<0.01)明显下调,M2相关基因ARG1(P<0.05)明显上调,提示hUC-MSCs抑制巨噬细胞向M1表型极化。GO和KEGG富集分析提示这些表达失调的基因参与调控炎症与免疫应答。hUC-MSCs抑制pTHP-1巨噬细胞增殖,且抑制TNF-α表达(P<0.001),促进IL-10表达(P<0.001)。qRT-PCR及流式细胞术分析发现,hUC-MSCs共培养后,pTHP-1细胞HLA-DRA(P<0.05)和CD68(P<0.01)mRNA表达明显下调,且CD14+CD11c+M1型细胞比例下调,而CD163(P<0.001)和CD206(P<0.001)mRNA表达及CD14+CD163+M2型细胞比例明显上调。结论:hUC-MSCs体外抑制巨噬细胞向M1促炎表型极化,诱导向M2抗炎表型极化。

关键词：脐带间充质干细胞 pTHP-1 转录组测序巨噬细胞极化

2018-2022年山东省潍坊市某医院发热伴血小板减少综合征患者神经系统受累临床危险因素研究

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疾病监测 2024年第7期39卷 929-933页

作者：张美刚赵娜娜吴翠萍潍坊医学院临床医学院潍坊医学院山东潍坊261053 潍坊市益都中心医院感染科山东潍坊262500

目的探讨影响发热伴血小板减少综合症(SFTS)患者神经系统受累的危险因素。方法选取2018—2022年山东省潍坊市益都中心医院收治的SFTS患者。分析两组患者临床资料及实验室检查,并对影响神经系统受累的危险因素进行logistic回归分析。结果... 详细信息

目的探讨影响发热伴血小板减少综合症(SFTS)患者神经系统受累的危险因素。方法选取2018—2022年山东省潍坊市益都中心医院收治的SFTS患者。分析两组患者临床资料及实验室检查,并对影响神经系统受累的危险因素进行logistic回归分析。结果106例患者分为单纯SFTS组(对照组,51例)和神经系统受累组(实验组,55例),实验组发热≥38.5℃、年龄≥65岁、尿蛋白≥2+、恶心呕吐方面的例数明显多于对照组(χ^(2)=21.668、3.883、18.603、7.338,P<0.05);实验组血小板计数平均值低于对照组(t=6.770,P<0.001);实验组丙氨酸氨基转移酶、天冬氨酸氨基转移酶、肌酸激酶、肌酸激酶同工酶、乳酸脱氢酶、降钙素原等较对照组明显升高,且两组之间的差异有统计学意义(Z=−1.970、−3.614、−3.048、−3.386、−4.091、−2.586,P<0.05)。logistic回归分析结果显示:年龄≥65岁、尿蛋白≥2+及低水平的PLT是SFTS患者神经系统受累的独立危险因素。年龄≥65岁,神经系统受累风险增加4.32倍;尿蛋白≥2+,神经系统受累的风险增加5.32倍;PLT每升高1个单位(1×10^(9)/L),神经系统受累的风险就降低6.00%。结论年龄≥65岁、尿蛋白≥2+、血小板是SFTS患者神经系统受累的独立临床危险因素。因此,临床工作中应注意筛查上述指标,指导临床诊疗。

关键词：危重疾病发热伴血小板减少综合征神经系统受累独立临床危险因素

基于免疫信息学的猴痘病毒多表位疫苗设计及免疫效果评价

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中国病原生物学杂志 2024年第8期19卷 869-874,879页

作者：宋浩然辛继莹王亚孙艳丽潍坊医学院医学检验学院山东潍坊261053

目的构建一种以猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)优势保护性抗原为基础的多表位疫苗。方法从NCBI网站获取9种MPXV蛋白的GenBank登录ID及其氨基酸序列;通过ABCpred、NetCTL 1.2和IEDB的MHC-I Immunogenicity模块分别预测9种MPXV蛋白的B、... 详细信息

目的构建一种以猴痘病毒(monkeypox virus,MPXV)优势保护性抗原为基础的多表位疫苗。方法从NCBI网站获取9种MPXV蛋白的GenBank登录ID及其氨基酸序列;通过ABCpred、NetCTL 1.2和IEDB的MHC-I Immunogenicity模块分别预测9种MPXV蛋白的B、CTL及Th细胞(HTL)表位;采用IEDB的MHC I Binding模块预测各CTL表位与特定MHC-I类分子的亲和力;使用VaxiJen v2.0、ToxinPred、AllerTOP v.2.0分别预测所得表位的抗原性、毒性及致敏性,从中筛选出具有最高抗原性但无细胞毒性和致敏性的表位,其中,CTL表位选择IC_(50)值<30 nmol/L者,HTL表位选择IFN-γ预测值最好者;将上述各表位与RS09、PADRE、Pam2Cys三种佐剂随机连接并添加6×H(组蛋白)尾巴以构建多表位疫苗,从各连接组合中筛选出具有最高抗原性但无细胞毒性和致敏性的组合;通过ExPASy的Protparam与ProtScale模块分析其理化性质;通过PSIPRED预测其二级结构;使用I-TASSER进行多表位疫苗的三级结构模拟,然后使用ModeRefiner和GalaxyRefiner将模拟出的三级结构进行优化;使用ZDOCK serves将优化后的多表位疫苗与TLR2、TLR4受体进行分子对接处理,以观察其相互作用情况与对接位点;采用C-ImmSim行免疫模拟对疫苗的免疫效果进行评估。结果该MPXV疫苗包括9个B细胞表位、23个CTL细胞表位和9个HTL表位,组合方式为RS09-PADRE-B-Pam2Cys-HTL-CTL-6×H,其抗原性得分为0.6828,共包含675个氨基酸残基,相对分子质量(M_r)为74431.30,理论pI值9.36,分子式为C_(3473)H_(5267)N_(867)O_(920)S_(17),热稳定性好,亲水性强;二级结构中α螺旋占46.82%,β折叠占18.37%,无规则卷曲占34.81%;可与TLR2、TLR4分子稳定结合,还可诱导较强的体液与细胞免疫应答。结论运用免疫信息学方法成功构建一种含多个优势抗原表位的MPXV疫苗,可能对猴痘病毒感染有预防作用。

关键词：猴痘病毒(MPXV) 免疫信息学多表位疫苗保护性抗原免疫效果

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右美托咪定的中枢神经作用机制研究进展

上海交通大学学报（医学版） 2024年第5期44卷 626-634页

作者：宋一凡江林昊杨谦梓罗艳潍坊医学院麻醉学院潍坊261053 上海交通大学医学院附属瑞金医院麻醉科上海200025

右美托咪定是一种α_(2)肾上腺素受体激动剂,具有镇静、镇痛、抗焦虑、抗交感神经的作用,目前已经成为临床麻醉和重症监护室广泛应用的药物。相比于麻醉科其他药物,右美托咪定没有明显的呼吸抑制作用且没有明显的血流动力学改变,且与其... 详细信息

右美托咪定是一种α_(2)肾上腺素受体激动剂,具有镇静、镇痛、抗焦虑、抗交感神经的作用,目前已经成为临床麻醉和重症监护室广泛应用的药物。相比于麻醉科其他药物,右美托咪定没有明显的呼吸抑制作用且没有明显的血流动力学改变,且与其他麻醉药配伍可明显减少镇静镇痛药物的用量。在临床应用中发现,右美托咪定可以介导可唤醒的镇静效应。传统认为右美托咪定通过α_(2)肾上腺素受体发挥作用,可以发挥降低血压、舒张血管和降低心率的作用,但对于其如何影响脑内神经环路尚不清楚。近年来关于右美托咪定作用机制的研究逐渐增多,证实下丘脑腹外侧视前区(ventrolateral preoptic nucleus,VLPO)、蓝斑核(locus coeruleus,LC)、中脑腹侧被盖区(ventral tegmental area,VTA)等核团参与其介导的镇静作用,背根神经节(dorsal root ganglion,DRG)、颈上神经节(superior cervical ganglion,SCG)参与其介导的镇痛作用,下丘脑视前区(preoptic area,PO)和下丘脑室旁核(paraventricular nucleus,PVN)参与其介导的体温和水电解质平衡的变化,为理解右美托咪定在中枢神经系统的作用机制提供了新的方向。

关键词：右美托咪定 α_(2)肾上腺素受体镇静镇痛神经机制

基于静息态功能磁共振成像的紧张性头痛度中心度研究

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磁共振成像 2024年第5期15卷 19-23页

作者：张淑娴巩平徐芹艳王吉丽王锡臻王超孙西河潍坊医学院附属医院影像中心潍坊261031 寿光市人民医院影像科潍坊262700 潍坊医学院附属医院基础保障部潍坊261031

目的采用静息态功能MRI(resting state functional MRI,rs-fMRI)度中心度(degree centrality,DC)探讨紧张性头痛(tension-type headache,TTH)患者在slow-4(0.027~0.073 Hz)和slow-5(0.010~0.027 Hz)频段的全脑网络节点中心性的改变及其与临床特征的相关性。材料与方法纳入自2018年5月~2019年7月到潍坊医学院附属医院神经内科就诊的TTH患者33例及与之匹配的健康对照38例,进行rs-fMRI扫描,利用DC的方法分析TTH组及健康对照组在slow-4(0.027~0.073 Hz)和slow-5(0.010~0.027 Hz)频段的DC值的差异,分析DC值的改变与疼痛程度、病程、疼痛发作频率的相关性。结果与健康对照组相比,在slow-5(0.010~0.027 Hz)频段,TTH组右侧额中回、右侧背外侧额上回的DC值显著增高;在slow-4(0.027~0.073 Hz)频段,TTH组与健康对照组的DC值差异无统计学意义[基于高斯随机场(Gaussian random field,GRF)校正,体素水平P<0.001,簇水平P<0.05]。另外,相关性分析的结果显示DC异常脑区与TTH患者的视觉模拟评分法(Visual Analog Scale,VAS)得分、病程、疼痛发作频率之间无显著相关性。结论额中回和额上回参与TTH疼痛信号的整合与处理,可能是TTH的关键中枢;slow-5(0.010~0.027 Hz)频段较slow-4(0.027~0.073 Hz)频段在探测TTH患者DC方面更敏感。

关键词：紧张性头痛度中心度静息态功能磁共振成像磁共振成像频段特异性

俯卧位在重症监护病房重症肺炎患者治疗中的应用和意义

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中华危重病急救医学 2024年第4期36卷 364-368页

作者：于慧艳关纯谢伟峰李庆淑曲彦罗玉胡丹潍坊医学院临床医学院潍坊医学院山东潍坊261053 康复大学青岛医院(青岛市市立医院)重症医学科山东青岛266071

目的探讨俯卧位治疗对重症监护病房(ICU)重症肺炎患者预后的影响。方法采用回顾性队列研究方法,选择2022年5月至2023年8月青岛市市立医院重症医学科收治的重症肺炎患者作为研究对象。收集患者一般资料、病因、基础疾病、入ICU时生命体... 详细信息

目的探讨俯卧位治疗对重症监护病房(ICU)重症肺炎患者预后的影响。方法采用回顾性队列研究方法,选择2022年5月至2023年8月青岛市市立医院重症医学科收治的重症肺炎患者作为研究对象。收集患者一般资料、病因、基础疾病、入ICU时生命体征和实验室指标、ICU住院期间临床治疗手段及预后。比较不同预后患者上述临床资料的差异;采用多因素Logistic回归分析筛选重症肺炎患者ICU住院期间存活的影响因素。于首次俯卧位前1 h、首次俯卧位1 h及首次俯卧位结束后1 h观察重症肺炎患者氧合指数(PaO_(2)/FiO_(2))变化,分析俯卧位对重症肺炎患者氧合的影响;采用Spearman相关性分析探究重症肺炎患者首次俯卧位时间与俯卧位前后PaO_(2)/FiO_(2)变化的相关性。结果最终纳入144例重症肺炎患者,ICU住院期间存活45例,死亡99例,病死率68.8%。与存活组比较,死亡组患者年龄更大〔岁:81.00(70.75,86.00)比71.00(60.50,81.50),P<0.01〕,既往存在肺部疾病比例、心率(HR)、呼吸频率(RR)、血乳酸(Lac)及连续性肾脏替代治疗(CRRT)比例更高〔既往存在肺部疾病比例:23.2%(23/99)比8.9%(4/45),HR(次/min):99.61±22.47比91.49±18.76,RR(次/min):22.50(19.75,29.25)比20.00(17.50,24.50),Lac(mmol/L):2.00(1.55,3.25)比1.60(1.20,1.95),CRRT比例:25.3%(25/99)比6.7%(3/45),均P<0.05〕,俯卧位比例更低〔41.4%(41/99)比68.9%(31/45),P<0.01〕。多因素Logistic回归分析显示,年龄〔优势比(OR)=0.946,95%可信区间(95%CI)为0.912~0.980,P=0.002〕和Lac(OR=0.563,95%CI为0.340~0.930,P=0.025)与重症肺炎患者ICU住院期间存活存在负相关关系,而俯卧位与存活存在正相关关系(OR=2.551,95%CI为1.067~6.095,P=0.035),说明俯卧位有利于改善重症肺炎患者ICU住院期间预后。俯卧位不同时间点PaO_(2)/FiO_(2)观察结果显示,重症肺炎患者首次俯卧位1 h PaO_(2)/FiO_(2)即较首次俯卧位前1 h明显升高〔mmHg(1 mmHg≈0.133 kPa):146.69(113.92,257.25)比111.75(70.15,212.20),P<0.01〕,说明俯卧位对患者氧合改善具有相关影响。Spearman相关性分析显示,重症肺炎患者首次俯卧位时间与首次俯卧位1 h氧合改善程度呈显著正相关(r=0.565,P<0.001)。结论俯卧位是可以独立影响重症肺炎患者ICU住院期间预后的治疗措施;俯卧位可以有效改善重症肺炎患者氧合,且患者首次氧合改善与俯卧位时间有关。

关键词：重症肺炎俯卧位预后