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凡纳滨对虾HMIT基因的克隆与表达分析

海洋渔业 2023年第1期45卷 14-25页

作者：刘洪涛杨明秋汪坤何玉贵海南省热带海水养殖技术重点实验室海南省海洋与渔业科学院海水渔业研究所海口571126

为了解H+/肌醇转运蛋白(H+/myoinositol transporter,HMIT)基因在肌醇跨膜转运中发挥的作用,克隆了凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)的HMIT基因,命名为Lv-HMIT,并分析了Lv-HMIT的结构和表达特征。Lv-HMIT的开放阅读框为1 650 bp,编码549个氨基酸。物理性质显示,它是一种不稳定的亲水性蛋白质,二级结构与三级结构预测都显示其主要由α螺旋和无规则卷曲为主;跨膜结构分析显示,Lv-HMIT存在11个跨膜螺旋结构;亚细胞定位显示,它分布于质膜、内质网和线粒体。多重比对发现,Lv-HMIT的跨膜结构和糖基化位点都比较保守。系统进化显示,Lv-HMIT与雪蟹(Chionoecetes opilio)的HMIT先聚为一支,再与其他节肢动物聚类。实时荧光定量PCR结果显示,Lv-HMIT mRNA在肝胰腺中表达量最高,其次是鳃,在心、胃、眼柄、肠、肌肉和血细胞等组织中有少量表达。Lv-HMIT mRNA从无节幼体期检测到表达,在变态至蚤状幼体、糠虾幼体和仔虾各阶段时都呈现上调表达,说明它可能与幼体变态发育过程有关。十足目虹彩病毒(decapod iridescent virus 1, DIV1)感染24 h后,Lv-HMIT mRNA在肝胰腺中表达显著下调,而鳃中表达量显著上调,显示它参与了对虾对病毒的免疫响应过程。研究结果可为深入了解凡纳滨对虾HMIT的结构功能及在对虾幼体发育、病毒免疫的调控机制提供基础数据。

关键词：凡纳滨对虾 HMIT 组织表达发育表达十足目虹彩病毒

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星斑篮子鱼幼鱼的听觉阈值

中国水产科学 2023年第7期30卷 813-820页

作者：张旭光张沈威唐贤明章守宇上海海洋大学海洋牧场工程技术研究中心海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖技术重点实验室

为了开发一种可行的声音威慑的鱼类行为控制方法以减少篮子鱼对藻类的啃食，需测定鱼类对声音的感知能力。本研究通过测定听觉诱发电位(auditoryevokedpotential,AEP),研究了14尾不同体长星斑篮子鱼(Siganus guttatus)幼鱼在声音刺激下... 详细信息

为了开发一种可行的声音威慑的鱼类行为控制方法以减少篮子鱼对藻类的啃食，需测定鱼类对声音的感知能力。本研究通过测定听觉诱发电位(auditoryevokedpotential,AEP),研究了14尾不同体长星斑篮子鱼(Siganus guttatus)幼鱼在声音刺激下的脑电反应模式,基于脑电反应特征确定了星斑篮子鱼幼鱼听觉频率敏感性和对应阈值。结果表明:星斑篮子鱼幼鱼在频率范围100～800 Hz的声音刺激下均表现出明显的听觉诱发电位,其AEP波形幅值随着刺激声音强度的增加而增加;听觉阈值也随着频率增加而增加,且对100～300Hz的低频声音较为敏感,听觉最敏感频率为200Hz,平均听觉阈值为104dB;不同体长个体的听觉敏感性在200～300 Hz内出现明显差异,其中体长大于4.5 cm的篮子鱼听觉阈值要明显小于体长小于4.5 cm的个体。这表明随着个体发育,较大体长的鱼听觉阈值也较低,这可能与它们的听觉器官的发育完善程度有关。总体而言,星斑篮子鱼幼鱼的听觉较敏感,听觉阈值低至100dB左右,与环境背景噪声的强度相接近。因此,利用声音威慑星斑篮子鱼的声源强度需求低,可行性强,可以减少海藻类被啃食的概率,从而降低海藻养殖的经济损失。

关键词：星斑篮子鱼声音威慑听觉诱发电位行为控制

拟穴青蟹对急性低盐胁迫的神经内分泌-免疫响应

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海洋湖沼通报 2023年第4期45卷 63-72页

作者：张岩吴翔宇陈钦胜唐贤明赵群李二超海南大学海洋学院海南海口570228 海南省热带海水养殖技术重点实验室海南省海洋与渔业科学院海南海口571126

本文以拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)原生盐度15为对照,以低盐度5为处理,在实验周期192h内,初步研究了急性低盐胁迫对甲壳动物神经内分泌-免疫调控机制的影响。结果发现:低盐处理组中的促肾上腺皮质激素释放激素和促肾上腺皮质激素浓度... 详细信息

本文以拟穴青蟹(Scyllaparamamosain)原生盐度15为对照,以低盐度5为处理,在实验周期192h内,初步研究了急性低盐胁迫对甲壳动物神经内分泌-免疫调控机制的影响。结果发现:低盐处理组中的促肾上腺皮质激素释放激素和促肾上腺皮质激素浓度在12h内显著升高(P实验时间内呈峰值变化,至12h达到最小值并保持稳定,与对照组呈显著差异(P<0.05);血细胞酚氧化酶原激活因子和酚氧化酶原基因表达及其活性均在0~48h内呈峰值变化,12h至最小值(P<0.05);酚氧化酶活性在12h内显著升高(P<0.05);随后以上指标均在48h基本恢复至对照组水平;吞噬率在12h内显著下降(P<0.05),48h后恢复至对照组水平;类甲壳肽基因表达量及抗菌活性均在0~96h内呈峰值变化,至12h达到最小值(P<0.05),96h恢复至对照组水平;C-型凝集素基因表达量和凝集活性在12h内显著下降(P<0.05),48h时逐渐恢复至对照组水平。结果提示,低盐胁迫下,拟穴青蟹通过激素、生物胺等神经内分泌因子调控机体免疫响应,造成短时间内的免疫抑制,调控路径为CRH➝ACTH➝生物胺➝血细胞免疫响应。

关键词：拟穴青蟹急性低盐胁迫激素生物胺免疫调控机制

基于转录组测序的波纹唇鱼SSR和SNP多态特征分析

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基因组学与应用生物学 2020年第6期39卷 2451-2461页

作者：刘洪涛刘金叶杨明秋何玉贵王永波海南省海洋与渔业科学院海口571126 海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖技术重点实验室海口571126 海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖工程技术研究中心琼海571429

波纹唇鱼是一种极度濒危的珍贵观赏鱼和高价值食用鱼,全面了解其转录组中SSR和SNP位点的分布及序列特征,可有助于开展波纹唇鱼遗传资源的保存和合理开发利用。利用二代高通量RNA-seq测序技术对波纹唇鱼进行转录组测序,通过MISA和Samtool... 详细信息

波纹唇鱼是一种极度濒危的珍贵观赏鱼和高价值食用鱼,全面了解其转录组中SSR和SNP位点的分布及序列特征,可有助于开展波纹唇鱼遗传资源的保存和合理开发利用。利用二代高通量RNA-seq测序技术对波纹唇鱼进行转录组测序,通过MISA和Samtools对所得Unigene进行SSR与SNP位点的发掘与分析。结果显示,在150218条Unigene序列中共发现22428个SSR,出现频率为14.93%,平均约5.35 kb出现1个SSR。波纹唇鱼SSR的主要重复单元类型为单碱基和二碱基重复,分别占SSR总数的61.32%和19.12%,除复合类型以外,所有重复基元共65种,其中(A/T)n所占比例最高(55.64%),(AG/CT)n和(AC/GT)n分别占8.31%和6.80%。22427个SSR处于CDS中,其中1773个位于编码区。SSR重复次数集中在5~15次,序列平均长度为13.3 bp。3438个SSR位点共获得669对候选引物。随机选取50对验证,发现21对可扩增出与预期产物长度大小一致的特异性条带,其中5对在4个波纹唇鱼个体间具有多态性。在Unigene中共发现245373个SNP位点,发生频率为1/490 bp,其中转换类型发生频率显著高于颠换类型,转换类型中A/G(33.61%)和C/T(32.51%)发生频率最高,颠换类型中则是A/T的最高(11.12%)。波纹唇鱼转录组中SSR和SNP位点非常丰富,可为波纹唇鱼遗传多样性分析、亲缘关系鉴定与遗传资源开发利用等方面提供丰富的基础数据信息。

关键词：波纹唇鱼转录组 SSR SNP

盐度对珍珠龙胆石斑鱼幼鱼渗透调节与耗氧率的影响

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中国水产科学 2020年第6期27卷 692-700页

作者：刘龙龙罗鸣陈傅晓谭围刘金叶王永波符书源刘洪涛海南省海洋与渔业科学院海南热带海洋学院热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖技术重点实验室

为研究盐度对珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus lanceolatus♂×Epinephelus fuscoguttatus♀)渗透调节与耗氧率的影响,设计实验一,将(162.5±12.1) g珍珠龙胆石斑鱼置于不同盐度(6、12、18、24、30)下养殖10 d,测定血清渗透压及Na~+、Cl~-、... 详细信息

为研究盐度对珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus lanceolatus♂×Epinephelus fuscoguttatus♀)渗透调节与耗氧率的影响,设计实验一,将(162.5±12.1) g珍珠龙胆石斑鱼置于不同盐度(6、12、18、24、30)下养殖10 d,测定血清渗透压及Na~+、Cl~-、 K~+离子浓度。实验结果表明,随盐度的升高血清渗透压及Na~+、Cl~-、K~+离子浓度也随着升高,各组[Na~+]:[Cl~-]比值无显著差异(P>0.05);经回归分析得到血清等渗点渗透压为365.95 mOsm/kg,所对应盐度为12.75。实验二,将(26.4±2.7)g幼鱼置于不同盐度(6、12、18、24、30)下养殖30 d,测定在开始暴露后0h、3h、24 h、72 h鳃Na~+/K~+-ATPase活性及表达和第30天耗氧率,结果表明鳃Na~+/K~+-ATPase活性随盐度的增大呈"U"形变化;鳃Na~+/K~+-ATPaseα1基因表达量波动较大,在72 h后随盐度增大先降低后增加,变化趋势与酶活性一致;第30天耗氧率随盐度的增加先降低后增加又降低。综上所述,珍珠龙胆石斑鱼幼鱼10 d内能够完全适应6～30盐度急性变化,耗氧率除了受离子渗透调节的影响,还可能与其生活史阶段有关。

关键词：珍珠龙胆石斑鱼幼鱼盐度渗透调节 Na~+/K~+-ATPase 耗氧率

斑节对虾3个野生群体遗传多样性的微卫星标记分析

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热带海洋学报 2018年第3期37卷 65-72页

作者：赵志英梁丽运白丽蓉海南省海洋与渔业科学院海南海口571126 海南省热带海水养殖技术重点实验室海南琼海571429

为探究不同地理条件下斑节对虾天然群体的遗传多样性和遗传分化水平,选用14对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)特异引物对广东湛江、海南三亚、海南琼海的斑节对虾天然群体共计90尾个体进行微卫星标记分析,每对引物检测出的等... 详细信息

为探究不同地理条件下斑节对虾天然群体的遗传多样性和遗传分化水平,选用14对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)特异引物对广东湛江、海南三亚、海南琼海的斑节对虾天然群体共计90尾个体进行微卫星标记分析,每对引物检测出的等位基因数为2~4不等,平均2.7。3个群体(湛江、三亚、琼海)平均有效等位基因分别为1.9081、1.9715和2.0185,平均多态信息含量分别为0.3864、0.3926和0.4078,总的平均期望杂合度(0.4605)明显高于观测杂合度(0.4046),表明3个群体遗传多样性水平为中等,且存在杂合度缺失的现象。种群分化指数和遗传距离分析表明,在不同群体间已产生了遗传分化,但是分化较小;三亚群体和琼海群体之间的亲缘关系最近,而与湛江群体的亲缘关系最远。分子方差分析表明,群体间的遗传变异指数为8%,群体内个体间的遗传变异指数为92%,基因分化主要发生在群体内,而不是群体之间。

关键词：斑节对虾微卫星标记群体遗传多样性遗传分化

中国南海海洋链霉菌Streptomyces sp.rssa1的化学成分研究

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天然产物研究与开发 2022年第6期34卷 975-980页

作者：王蓉郭志凯程芬冯全英詹夏菲海南省海洋与渔业科学院海南省热带海水养殖技术重点实验室海口571126 海南热带农业资源研究院海南省热带农业生物资源保护与利用重点实验室中国热带农业科学院热带生物技术研究所海南省热带微生物资源重点实验室海口571101

对中国南海珊瑚样品来源的链霉菌Streptomyces sp.rssa1代谢产物进行研究。采用正相硅胶柱、ODS反相硅胶柱、Sephadex LH-20凝胶柱以及半制备高效液相色谱等分离方法,从该菌株的大米固体培养基发酵产物中分离得到10个化合物,通过NMR、M... 详细信息

对中国南海珊瑚样品来源的链霉菌Streptomyces sp.rssa1代谢产物进行研究。采用正相硅胶柱、ODS反相硅胶柱、Sephadex LH-20凝胶柱以及半制备高效液相色谱等分离方法,从该菌株的大米固体培养基发酵产物中分离得到10个化合物,通过NMR、MS等波谱数据,将化合物结构分别鉴定为四霉素A(1)、四霉素B(2)、kanglemycin M(3)、tryptophandehydrobutyrine diketopiperazine(4)、3-吲哚乙酰胺(5)、N-乙酰基色氨酸(6)、苯乙酸(7)、N-乙酰基酪胺(8)、苯甲酰胺(9)、苯乙酰胺(10)。抗菌活性筛选显示,化合物4对溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)的生长具有弱抑制活性。细胞毒活性测试结果显示,化合物3对巨噬细胞RAW 264.7具有细胞毒活性。环化核苷酸磷酸二酯酶PDE4水解抑制活性筛选未发现化合物在测试浓度下具有抑制活性。

关键词：珊瑚链霉菌四烯大环内酯四霉素二酮哌嗪类化合物

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两株海绵放线菌产生的抗菌活性产物研究

深圳大学学报（理工版） 2022年第5期39卷 550-558页

作者：郭志凯王蓉吴炜城黎明何汪桂周石林海南省热带微生物资源重点实验室中国热带农业科学院热带生物技术研究所海南海口571101 海南省热带农业生物资源保护与利用重点实验室中国热带农业科学院海南热带农业资源研究院海南海口571101 海南省热带海水养殖技术重点实验室海南省海洋与渔业科学院海南海口571126 海南热带海洋学院水产与生命学院海南三亚572022

海洋放线菌是一类具有重要价值的药用微生物,能够产生结构类型多样的生物活性物质.对中国南海海洋生物中分离出的海洋放线菌进行抗农业病原菌活性筛选,发现两株海绵链霉菌Streptomyces sp.HMH1和Streptomyces sp.HML1对农业病原菌具有... 详细信息

海洋放线菌是一类具有重要价值的药用微生物,能够产生结构类型多样的生物活性物质.对中国南海海洋生物中分离出的海洋放线菌进行抗农业病原菌活性筛选,发现两株海绵链霉菌Streptomyces sp.HMH1和Streptomyces sp.HML1对农业病原菌具有较强的拮抗活性.为研究菌株HMH1和HML1产生的活性代谢产物,采用正相/反相硅胶柱和Sephadex LH-20凝胶柱色谱等分离方法对代谢产物进行分离纯化,通过核磁共振波谱、高分辨电喷雾质谱等波谱数据和文献数据鉴定化合物结构,测定化合物的抗菌活性.结果显示,从链霉菌Streptomyces sp.HMH1的大米固体发酵产物中分离鉴定出3种放线菌素类化合物,分别为放线菌素D、放线菌素X2和放线菌素Xoβ;从链霉菌Streptomyces sp.HML1的大米固体发酵产物中分离得到1个吲哚咔唑生物碱类化合物,鉴定为K-252d.化合物抗农业病原菌活性测试结果显示,放线菌素D的抗菌谱广,对供试的10种植物病原真菌和2种植物病原细菌的生长具有抑制活性.其中,对木瓜可可毛色二孢霉、木瓜拟茎点霉、小麦赤霉和辣椒疫霉等病原真菌具有较强的抑制作用,抑制率分别为(60.09±0.66)%、(48.82±0.66)%、(46.47±1.14)%和(44.13±0.66)%;对水稻白叶枯病菌、茄青枯劳尔氏菌等病原细菌也显示抑菌活性,抑菌直径分别为(36.00±0.82)mm和(15.00±0.47)mm.研究结果可为相关农业病害高效生防菌剂研发提供新的化合物和菌种资源.

关键词：海洋放线菌生物农药链霉菌抗生素放线菌素D 吲哚咔唑生物碱抗农业病原菌

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豹纹鳃棘鲈差异流速下肝脏转录组分析

南方水产科学 2022年第1期18卷 107-117页

作者：高进王永波刘金叶郭一兰符书源海南热带海洋学院/热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室海南三亚572022 海南省海洋与渔业科学院海南海口571126 海南省热带海水养殖工程技术研究中心海南海口571126

水流速度是影响鱼类生长的重要环境因子之一。为探究豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)在不同流速条件下相关基因的功能和表达情况,利用RNA-Seq技术对差异流速下的豹纹鳃棘鲈肝脏组织进行了转录组分析。挑选相同繁育批次中规格一致的... 详细信息

水流速度是影响鱼类生长的重要环境因子之一。为探究豹纹鳃棘鲈(Plectropomus leopardus)在不同流速条件下相关基因的功能和表达情况,利用RNA-Seq技术对差异流速下的豹纹鳃棘鲈肝脏组织进行了转录组分析。挑选相同繁育批次中规格一致的豹纹鳃棘鲈幼苗,分别在正常流速(0.1 m·s^(-1), Low flow velocity, LFV)和高流速(0.4 m·s^(-1), High flow velocity, HFV)实验组中养殖150 d后进行肝脏转录组测序分析,探究豹纹鳃棘鲈在差异流速下个体间的基因表达模式差异。结果显示,经筛选后共获得1 977个LFV-HFV显著性差异表达基因(Differentially expressed genes, DGE),其中上调基因999个,下调基因978个。GO功能注释分类发现,共有1 124个DEGs被GO数据库注释到并归属为56个功能类别。KEGG富集分析结果显示,573个DEGs参与了154条KEGG通路,其中富集最显著的为PPAR信号通路。LFV和HFV两组鱼的肝脏组织学观察结果显示,两者之间脂肪含量差异明显,LFV组肝脏中的脂肪含量显著高于HFV组(P技术支撑。

关键词：豹纹鳃棘鲈差异流速转录组分析