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秸秆还田和添加生物炭对热带地区稻菜轮作体系中淹水后土壤温室气体排放的影响

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环境科学 2024年第3期45卷 1692-1701页

作者：胡天怡车佳玥胡煜杰陈绮琦张冬明雷菲曾建华汤水荣伍延正孟磊海南大学热带作物学院海口570228 海南省农业科学院农业环境与土壤研究所海口571100 农业农村部海南耕地保育科学观测试验站海口571100 海南省耕地保育重点实验室海口571100

热区稻菜轮作系统瓜菜季施肥后大量硝态氮积累,导致后续的水稻季淹水后硝态氮的淋失以及大量N_(2)O排放,使氮素损失以及温室效应加剧.如何提高硝态氮利用率,减少N_(2)O排放成为了亟待解决的问题.试验共设置6个处理:添加200 mg·kg^(-1)(... 详细信息

热区稻菜轮作系统瓜菜季施肥后大量硝态氮积累,导致后续的水稻季淹水后硝态氮的淋失以及大量N_(2)O排放,使氮素损失以及温室效应加剧.如何提高硝态氮利用率,减少N_(2)O排放成为了亟待解决的问题.试验共设置6个处理:添加200 mg·kg^(-1)(以N计,下同)KNO_(3)(CK);添加200 mg·kg^(-1)KNO_(3)+2%生物炭(B);添加200 mg·kg^(-1)KNO_(3)和1%花生秸秆(P);添加200 mg·kg^(-1)KNO_(3)+2%生物炭+1%花生秸秆(P+B);添加200 mg·kg^(-1)KNO_(3)+1%水稻秸秆(R);添加200 mg·kg^(-1)KNO_(3)+2%生物炭+1%水稻秸秆(R+B),进行114 d的25℃恒温淹水培养,来探究有机物料添加对土壤淹水后温室气体排放和氮素利用的影响.结果表明,与CK相比,添加秸秆或秸秆和生物炭配施显著增加了土壤pH(P海南瓜菜季后充分利用氮肥,减少氮素损失,减缓N_(2)O排放的一种合理措施.

关键词：生物炭秸秆氧化亚氮(N_(2)O) 土壤微生物量碳氮硝态氮

全基因关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记

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中国农业科学 2024年第10期57卷 2046-2060页

作者：骆娜安炳星魏立民文杰赵桂苹海南省农业科学院三亚研究院(海南省实验动物研究中心) 海南省农业科学院畜牧兽医研究所中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室

【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标，通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因，为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代（n=2 024）群体作为研究对象，测定每只鸡在... 详细信息

【目的】体尺是评价禽类生长特性的主要指标，通过筛选与文昌鸡体尺性状相关的分子标记及候选基因，为解析体尺性状的遗传机制及分子育种提供理论支撑。【方法】利用海南省文昌鸡品系3个世代（n=2 024）群体作为研究对象，测定每只鸡在上市日龄的胫长、胫围、体斜长、龙骨长及胸宽等5个体尺性状。采集血液进行鸡“京芯一号”55 K芯片测序及基因分型，使用GEMMA软件与PLINK软件进行全基因组关联分析，鉴定与体尺性状相关的SNP位点和候选基因，通过LD分析鉴定与体尺性状显著相关的单倍型。【结果】表型结果显示，113日龄文昌鸡公鸡平均胫长8.64 cm，胫围0.46 cm，体斜长19.73 cm，龙骨长12.32 cm，胸宽6.81 cm；母鸡平均胫长6.98 cm，胫围0.40 cm，体斜长17.79 cm，龙骨长10.45 cm，胸宽6.24 cm。经过质控后，共保留42 206个SNPs和2 024个个体用于后续研究。使用Plink软件进行PCA主成分分析，结果发现3个世代群体存在一定的分散情况，因此在GWAS关联分析中加入了前3个主成分作为协变量，以校正群体结构对关联分析的影响。GWAS结果研究共鉴定出19个SNPs位点与胫长性状显著或建议性显著相关（P值分别为2.17789E-06和4.35578E-05）,23个SNPs位点与胫围性状显著或建议性显著相关，7个SNPs位点与体斜长性状显著或建议性显著相关，2个SNPs位点与龙骨长性状显著或建议性显著相关，未鉴定出与胸宽性状或建议性显著相关的SNPs位点。通过对显著性位点进行注释，结果共鉴定到16个体尺性状相关的候选基因，包括羧基末端LIM结构域结合蛋白2(LIM domain binding 2,LDB2)、染色体缩合蛋白G(non-SMC condensin I complex subunit G,NCAPG)、序列相似家族184成员B基因（family with sequence similarity 184 member B,FAM184B）、A型钾离子通道调节蛋白4(potassium voltage-gated channel interacting protein 4,KCNIP4)等。通过LD单倍型分析结果显示，GGA4存在3个显著关联的单倍型，对于胫长性状，rs316943436和rs313978573两个位点位于单倍型区块中；对于胫围性状，rs313196946AA、rs316242963、rs315796839、rs313978573、rs734365522共5个位点位于单倍型区块中；对于体斜长性状，只有1个位点（rs313978573）位于单倍型区块中，其中候选基因LDB2和NCAPG在显著的block区块中被注释到。【结论】经GWAS方法筛选出SEPSECS、LGI2、DHX15、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、LDB2、CC2D2A作为胫长性状潜在的候选基因；FH、TBC1D1、DTHD1、SEPSECS、LGI2、SOD3、PPARGC1A、KCNIP4、NCAPG、FAM184B、CLRN2、LDB2、TAPT1、CC2D2A作为胫围性状潜在的候选基因，KCNIP4、LDB2、TAPT1、NRXN3作为体斜长性状潜在的候选基因，FAM184B作为龙骨长性状潜在的候选基因。总之，本文确定了LDB2、NCAPG和FAM184B等作为胫长、胫围、体斜长和龙骨长等体尺性状的潜在功能基因。为文昌鸡体尺性能的分子标记辅助选择育种提供理论支撑。

关键词：全基因组关联分析鸡体尺性状胫长胫围

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基于多元相似度融合的中文命名实体消歧方法

数据分析与知识发现 2024年第2期8卷 56-64页

作者：石水倩金晶沈耕宇王宝佳任妮江苏省农业科学院农业信息研究所南京210014

【目的】解决文本中多个不同含义的同名实体在映射到知识库时产生的歧义问题,提高实体消歧的准确率。【方法】提出一种多元相似度融合方法,考虑实体上下文的语义相似度、实体属性的背景相似度和主题词的主题相似度,对实体进行刻画。【... 详细信息

【目的】解决文本中多个不同含义的同名实体在映射到知识库时产生的歧义问题,提高实体消歧的准确率。【方法】提出一种多元相似度融合方法,考虑实体上下文的语义相似度、实体属性的背景相似度和主题词的主题相似度,对实体进行刻画。【结果】在维基百科农业方向数据集上的实验结果表明,本文所提方法准确率为89.7%,优于传统方法。【局限】方法仅在特定领域适用。【结论】本文所提多元相似度融合方法较传统方法和主流消歧方法具有更高的实体消歧准确率,能够解决特定领域的实体消歧问题,未来可将其应用于更广泛的实体消歧场景中。

关键词：实体消歧相似度上下文词向量实体属性主题词向量

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冬瓜响应高温胁迫的转录组测序及分析

分子植物育种 2024年

作者：朱白婢王静张文胡艳平李雪峤海南省农业科学院蔬菜研究所海南省蔬菜生物学重点实验室海南省农业科学院蔬菜研究所海南省瓜菜育种工程技术研究中心海南省农业科学院土壤与肥料研究所

为了挖掘冬瓜响应高温胁迫的基因，本研究以42 ℃处理的‘四季粉皮’冬瓜为试验材料，分别对处理0、2、4、6和8 h后的冬瓜幼苗叶片进行转录组测序，分析冬瓜在高温胁迫下的差异表达基因种类及其表达模式差异。结果表明，与对照高温处理... 详细信息

为了挖掘冬瓜响应高温胁迫的基因，本研究以42 ℃处理的‘四季粉皮’冬瓜为试验材料，分别对处理0、2、4、6和8 h后的冬瓜幼苗叶片进行转录组测序，分析冬瓜在高温胁迫下的差异表达基因种类及其表达模式差异。结果表明，与对照高温处理0 h相比，在高温处理2 h、4 h、6 h和8 h后共鉴定到5 069个共同差异表达的基因，其中有2 809个上调，2 260个下调。GO和KEGG富集分析结果表明，这些差异表达基因在高温胁迫时主要在内质网的蛋白质加工途径中富集，参与有关热激蛋白的合成。此外，还发现32个热激蛋白(Hsp)家族基因，其中7个Hsp17、8个Hsp18、8个Hsp70和3个Hsp83基因在遭遇高温时表达水平明显升高，推测其在冬瓜响应高温胁迫过程中发挥积极作用。本研究对高温胁迫下冬瓜的转录水平进行了初步分析，挖掘出了与冬瓜耐热有关的基因，这对进一步研究冬瓜的耐热分子机制有重要意义。

关键词：冬瓜高温胁迫热胁迫转录组分析耐热基因

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海南普通野生稻稻瘟病抗性鉴定与评价

植物遗传资源学报 2024年第1期25卷 39-51页

作者：翟李楠唐清杰周世圳周帮纪云勇王惠艰韩义胜邢福能严小微海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室海口571100 海南省农业科学院三亚研究院三亚572025

为了对海南普通野生稻稻瘟病叶瘟、穗颈瘟的抗性进行综合鉴定与评价,2022-2023年连续两年对来自海南省11个不同市县的2002份普通野生稻材料进行苗期叶瘟人工接种和田间自然抗病鉴定,并对995份已经抽穗的普通野生稻材料进行穗颈瘟人工接... 详细信息

为了对海南普通野生稻稻瘟病叶瘟、穗颈瘟的抗性进行综合鉴定与评价,2022-2023年连续两年对来自海南省11个不同市县的2002份普通野生稻材料进行苗期叶瘟人工接种和田间自然抗病鉴定,并对995份已经抽穗的普通野生稻材料进行穗颈瘟人工接种抗性鉴定。结果表明:2002份叶瘟鉴定材料中,人工接种抗叶瘟材料为494份(占24.68%),其中免疫7份,高抗17份;田间自然状态下抗叶瘟材料1160份(占57.94%),其中免疫24份,高抗233份。995份穗颈瘟人工接种鉴定材料中,抗穗颈瘟材料506份(占50.85%),其中免疫23份,高抗136份。由结果可知,海南普通野生稻普遍抗叶瘟或穗颈瘟,这些抗性资源的生长习性大多为半直立型或倾斜型,少数为直立型或匍匐型;高抗叶瘟的材料在抽穗后也普遍抗穗颈瘟,免疫或高抗穗颈瘟的材料也普遍抗叶瘟。经过鉴定和评价,筛选出双抗叶瘟、穗颈瘟的普通野生稻材料共有128份。本研究为海南普通野生稻资源抗稻瘟病研究和育种利用提供参考。

关键词：海南普通野生稻稻瘟病抗性鉴定分析

PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析

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新疆农业科学 2024年第5期 1292-1300页

作者：范悦轩马佳镁黄春媛郑佳馨陈素贞张艳刘光亮曹宗喜新疆农业大学动物医学学院海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心

【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品，分离出PRRSV HNHK3-2021毒株，并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列，采用Lasergene 7.1进行序列比对分析，用M... 详细信息

【目的】研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。【方法】采集海南省海口市及周边地区样品，分离出PRRSV HNHK3-2021毒株，并测定NSP2基因以及ORF5和ORF7基因序列，采用Lasergene 7.1进行序列比对分析，用MEGA-X进行遗传演化分析。【结果】分离出的PRRSV HNHK3-2021株为美洲型毒株，PRRSV HNHK3-2021株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5和ORF7的核苷酸相似性较高，分别为99.2%～99.3%和99.5%～100%,推导氨基酸相似性为99%～99.5%和100%;PRRSV HNHK3-2021株和EU864232 SHB、AY262352＿HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为87.1%～96.4%和91.4%～97.3%,推导氨基酸的相似性为86.6%～93%和91.9%～97.6%;PRRSV HNHK3-2021株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1的ORF5和ORF7的核苷酸相似性为85.4%～87.1%和89%～91.4%。氨基酸的相似性为86.1%～87.1%和89.5%～91.9%。【结论】RRSV HNHK3-2021毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征遗传进化 ORF5 ORF7

台湾甲腹茧蜂触角行为反应及其感受器数量观察

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热带作物学报 2024年

作者：蔡秋旧贾静静黄伟康林珠凤冯青姚其吉训聪海南省农业科学院植物保护研究所/海南省农业科学院农产品质量安全与标准研究中心/海南省植物病虫害防控重点实验室海南大学植物保护学院

台湾甲腹茧蜂Chelonus formosanus是鳞翅目夜蛾科害虫重要的寄生性天敌。为明确不同处理触角对台湾甲腹茧蜂行为反应的影响以及触角不同感器数量。本文利用行为学观察切除不同比例触角对台湾甲腹茧蜂寻找蜜源、寄主、雌雄蜂寿命、雌蜂... 详细信息

台湾甲腹茧蜂Chelonus formosanus是鳞翅目夜蛾科害虫重要的寄生性天敌。为明确不同处理触角对台湾甲腹茧蜂行为反应的影响以及触角不同感器数量。本文利用行为学观察切除不同比例触角对台湾甲腹茧蜂寻找蜜源、寄主、雌雄蜂寿命、雌蜂寄生率和寄主子代孵化率的影响，再结合扫描电镜观察比较不同处理雌雄蜂触角感受器数量。结果表明雌雄蜂对蜜源的搜寻时间均是切除1/3鞭节处理组最快（雌蜂为79.59±23.22 s，雄蜂为106.52±26.71 s）；而雌蜂对寄主的搜寻时间则是对照组最快，为204.38±24.01 s；而完整切除触角和完整切除鞭节处理组均无法找到寄主；切除不同比例触角对雌雄蜂寿命以及雌蜂寄生率和子代孵化率均与对照组一样无显著影响。同时扫描电镜结果显示不同处理组的雌雄蜂触角的毛形感受器、板形感受器、锥形感受器、鳞形感受器之间存在显著性的差异。研究证实了切除触角比例越高，对雌雄蜂找到蜜源以及雌蜂找到寄主的影响越大，说明触角感受器在台湾甲腹茧蜂搜寻蜜源和寄主的过程中发挥重要作用。

关键词：台湾甲腹茧蜂触角行为观察感受器

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植物转化酶家族基因鉴定及序列进化分析

分子植物育种 2024年第2期22卷 421-432页

作者：白蓓蓓林义开陈黎明王锋肖楚妍杨春王丁符书贤林尤珍海南省农业科学院南繁育种研究中心海口571100 海南省农业科学院三亚研究院三亚572000 四川大学化学工程学院成都610065 海南省农业科学院海口571100

转化酶CWIN(Cell wall invertase)、VIN(Vacuolar invertase)和CIN(Cytoplasmic invertases)是蔗糖代谢途径中蔗糖转化成葡萄糖和果糖的关键酶,直接参与了植物蔗糖代谢的生物合成。为了系统梳理转化酶相关基因在植物基因组中的状况,实... 详细信息

转化酶CWIN(Cell wall invertase)、VIN(Vacuolar invertase)和CIN(Cytoplasmic invertases)是蔗糖代谢途径中蔗糖转化成葡萄糖和果糖的关键酶,直接参与了植物蔗糖代谢的生物合成。为了系统梳理转化酶相关基因在植物基因组中的状况,实验室对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察植物在拟南芥和番茄中的表达。首先,实验室针对CWIN、VIN和CIN的基因序列,鉴定得到其保守结构域,在此基础上对相关基因进行了全面鉴定,从而构建了其进化树;其次,将拟南芥(Arabidopsis thaliana)和番茄(Solanum lycopersicum)CDS序列比对到各探针,从而从数据库中提取组织中的表达数据;最后,通过结构域鉴定、进化树和表达量的分析,得出CWIN、VIN和CIN在植物中的生物合成的机理。本研究为转化酶相关基因提供了基因信息,为植物中蔗糖代谢生物合成途径的作用机理及对蔗糖代谢影响相关基因进化机制的研究提供帮助。

关键词：转化酶基因鉴定进化表达量

不同着色火龙果成熟过程中花青素代谢途径相关酶活分析

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分子植物育种 2024年

作者：白蓓蓓郑燕萍陈黎明肖楚妍王锋王丁陈华蕊林尤珍庄光辉海南省农业科学院南繁育种研究中心海南省农业科学院粮食作物研究所海南省农作物遗传育种重点实验室中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所海南省农业科学院三亚研究院

为深入了解花青素代谢机制，本研究针对4个不同着色火龙果品种‘白玉龙’、‘大红2号’、‘青玉龙’和‘燕窝果’分析花青素含量、相关合成酶活性及相关性分析。通过酶标仪测定果皮和果肉的青熟期、转色期、完熟期3个时期的花青素含量... 详细信息

为深入了解花青素代谢机制，本研究针对4个不同着色火龙果品种‘白玉龙’、‘大红2号’、‘青玉龙’和‘燕窝果’分析花青素含量、相关合成酶活性及相关性分析。通过酶标仪测定果皮和果肉的青熟期、转色期、完熟期3个时期的花青素含量及主要酶活性变化。结果显示：‘白玉龙’和‘大红2号’红色果皮和果肉中均富含较多的花青素，其果肉高于果皮。‘燕窝果’青熟期果皮和果肉均富含较多的花青素，其果肉高于果皮，而其他时期果皮均高于果肉。‘青玉龙’成熟期花青素含量果皮高于果肉，而其他时期果肉均高于果皮。4个品种3个时期的CHI活性较高，其‘燕窝果’果肉约252.05 U/g，‘大红2号’果皮约166.53U/g；PAL次之，‘燕窝果’果肉和果皮分别约37.24和16.01 U/g；4CL活性差异较小；‘白玉龙’果皮和果肉青熟期C4H活性较高；‘大红2号’果肉在三个时期的DFR活性较高；‘燕窝果’果皮和果肉三个时期UFGT酶活性较高，‘青玉龙’青熟期酶活性较低。‘燕窝果’果皮和果肉花青素含量与ANR和4CL活性呈极显著的线性正相关；在果皮花青素含量中，‘青玉龙’和‘燕窝果’与PAL活性呈极显著的线性正相关；‘燕窝果’与CHI和UFGT活性呈极显著的线性正相关；‘大红2号’与CHI和UFGT活性呈显著的线性正相关；在果肉花青素含量中，‘大红2号’和‘青玉龙’与C4H活性呈极显著的线性正相关，‘青玉龙’与UFGT活性呈极显著的线性正相关，‘大红2号’与PAL活性呈极显著的线性正相关，与4CL活性呈显著的线性正相关，‘白玉龙’花青素含量与PAL、DFR、ANR 活性呈显著的线性正相关。本研究拟通过对不同着色火龙果品种的花青素含量与相关合成酶活性相关分析，解析花青素影响不同着色品种形成的差异性及控制花青素形成的关键酶，这将为全面了解花青素形成的分子机制迈出重要一步，并为未来针对品质性状的火龙果分子育种提供理论依据。

关键词：火龙果花青素含量相关酶活性相关性分析