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基于遗传算法的色谱指纹峰配对识别方法

分析化学 2003年第5期31卷 513-517页

作者：陈闽军程翼宇浙江大学药物信息学研究所浙江大学药物信息学研究所杭州 310027

指纹峰配对识别是色谱指纹图谱分析中的关键环节之一,本文提出一种基于遗传算法的色谱指纹峰配对识别方法。该法根据对照色谱指纹图谱的峰分布特性初选出若干标定峰,将其存入一个候选标定峰库;同时根据这些候选标定峰从待测指纹图谱中... 详细信息

指纹峰配对识别是色谱指纹图谱分析中的关键环节之一,本文提出一种基于遗传算法的色谱指纹峰配对识别方法。该法根据对照色谱指纹图谱的峰分布特性初选出若干标定峰,将其存入一个候选标定峰库;同时根据这些候选标定峰从待测指纹图谱中选出相应的候选标定峰,也存入候选标定峰库;再用遗传算法从库中选取一组标定峰用于校正待测指纹图谱中各峰的峰位,并自动识别出与对照色谱指纹图谱相对应的各指纹峰。仿真实验及实际分析实验结果均表明,该法识别指纹峰准确可靠,可用于色谱指纹图谱相似度的快速自动计算。

关键词：色谱指纹图谱中药质量分析遗传算法谱峰识别

近红外漫反射光谱法测定黄连浸膏粉中生物碱含量

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分析化学 2004年第4期32卷 477-480页

作者：瞿海斌刘全程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310027 浙江大学药物信息学研究所

采用近红外漫反射光谱法对黄连浸膏粉中小檗碱、巴马亭、药根碱和总生物碱含量进行快速无损检测。以HPLC分析值作参比 ,采用偏最小二乘回归算法建立二阶导数光谱信息与各组分含量间的定量校正模型 ,并对未知样品中各组分含量进行预测。... 详细信息

采用近红外漫反射光谱法对黄连浸膏粉中小檗碱、巴马亭、药根碱和总生物碱含量进行快速无损检测。以HPLC分析值作参比 ,采用偏最小二乘回归算法建立二阶导数光谱信息与各组分含量间的定量校正模型 ,并对未知样品中各组分含量进行预测。小檗碱、巴马亭、药根碱和总生物碱的预测均方差 (RMSEP)分别为0 .1 84、0 .1 0 9、0 .0 5 4和 0 .32 5 ;加样回收率分别为 97.6 7%～ 99.5 9%、96 .6 3%～ 1 0 0 .70 %、95 .1 5 %～ 1 0 1 1 5 %和 97.4 1 %～ 99.89% ,重现性实验相对标准偏差 (RSD)分别为 0 .3%、0 .6 %、1 .8%和 0 .3%。该方法结果准确可靠 ,重现性、稳定性均良好 ,适用于工业现场的原位和在线检测

关键词：近红外漫反射光谱黄连浸膏粉偏最小二乘回归在线检测

基于气相气谱-质谱的代谢组学方法研究四氯化碳致小鼠急性肝损伤

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分析化学 2007年第12期35卷 1736-1740页

作者：黄欣龚益飞虞科程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310058 浙江大学药物信息学研究所

建立了一种基于气相色谱-质谱(GC-MS)技术的代谢组学分析方法。以CCl4致小鼠肝损伤模型为研究对象,检测了染毒小鼠肝组织和血浆中内源性代谢物随时间的变化情况,并运用主成分分析方法对这一变化过程进行模式识别。研究发现,随着染毒时... 详细信息

建立了一种基于气相色谱-质谱(GC-MS)技术的代谢组学分析方法。以CCl4致小鼠肝损伤模型为研究对象,检测了染毒小鼠肝组织和血浆中内源性代谢物随时间的变化情况,并运用主成分分析方法对这一变化过程进行模式识别。研究发现,随着染毒时间的推移,小鼠的整体代谢物谱存在着一定的变化规律。肝组织中苹果酸和部分游离脂肪酸含量升高;血浆中柠檬酸和部分氨基酸含量有所上升。这些代谢物的变化都与肝损程度密切相关,且变化趋势与肝组织病理检查结果一致。研究结果表明:GC-MS技术在代谢物谱的获取和代谢物鉴定方面具有优势,可作为核磁共振(NMR)技术的补充工具用于代谢组学研究。

关键词：气相色谱-质谱代谢组学四氯化碳急性肝损伤主成分分析法

一种基于最小二乘支持向量机算法的近红外光谱判别分析方法

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分析化学 2006年第4期34卷 561-564页

作者：虞科程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310027 浙江大学药物信息学研究所

将最小二乘支持向量机(LSSVM)用于近红外(NIR)光谱分析,建立一种新型的NIR光谱快速鉴别方法。以丹参药材道地性鉴别为例,对其NIR漫反射光谱进行主成分分析后,运用LSSVM法建立NIR光谱非线性分类模型,对丹参药材道地性进行快速鉴别。将本... 详细信息

将最小二乘支持向量机(LSSVM)用于近红外(NIR)光谱分析,建立一种新型的NIR光谱快速鉴别方法。以丹参药材道地性鉴别为例,对其NIR漫反射光谱进行主成分分析后,运用LSSVM法建立NIR光谱非线性分类模型,对丹参药材道地性进行快速鉴别。将本方法与经典SVM和BP神经网络法相比较,结果表明,本法判别准确率高,计算时间少,可推广应用于中药等天然产物质量快速鉴别。

关键词：最小二乘支持向量机近红外光谱药材道地性判别分析丹参

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中药色谱指纹图谱的小波变换及分形表达方法

分析化学 2003年第7期31卷 774-778页

作者：陈闽军吴永江程翼宇浙江大学药物信息学研究所浙江大学药物信息学研究所杭州310027

提出一种基于小波变换的色谱指纹图谱分形表达方法。该法运用小波变换将色谱谱线分解至不同分辨尺度 ,然后计算各尺度分量的分形维数 ,用色谱的小波基分形参量替代色谱指纹图谱的采样值。仿真实验结果表明 ,色谱小波基分形参量对谱峰保... 详细信息

提出一种基于小波变换的色谱指纹图谱分形表达方法。该法运用小波变换将色谱谱线分解至不同分辨尺度 ,然后计算各尺度分量的分形维数 ,用色谱的小波基分形参量替代色谱指纹图谱的采样值。仿真实验结果表明 ,色谱小波基分形参量对谱峰保留时间漂移具有较好的抗干扰能力。以当归和川芎两种中药材的品种及道地性鉴别分类问题为实例 ,比较研究色谱采样值与小波基分形参量 ,k 近邻法的交叉验证计算结果表明 ,小波基分形参量的分类效果优于色谱采样值。

关键词：色谱指纹图谱中药质量分析小波变换分形维数

代谢组学方法研究水飞蓟宾对四氯化碳致小鼠肝损伤的保护作用

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高等学校化学学报 2008年第4期29卷 714-719页

作者：黄欣龚益飞王毅瞿海斌程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310058

运用代谢组学方法研究四氯化碳(CCl4)致小鼠肝损及水飞蓟宾肝保护作用的机理.通过气相色谱-质谱(GC-MS)技术分析CCl4及水飞蓟宾作用下的小鼠肝组织匀浆及血浆代谢物谱.使用正交偏最小二乘判别分析法研究正常组与CCl4模型组之间的代谢物... 详细信息

运用代谢组学方法研究四氯化碳(CCl4)致小鼠肝损及水飞蓟宾肝保护作用的机理.通过气相色谱-质谱(GC-MS)技术分析CCl4及水飞蓟宾作用下的小鼠肝组织匀浆及血浆代谢物谱.使用正交偏最小二乘判别分析法研究正常组与CCl4模型组之间的代谢物谱差异,并通过变量重要性投影(VIP)选取肝组织与血浆中各12种标志性代谢物.使用主成分分析法研究水飞蓟宾预防性及治疗性给药对CCl4肝损的干预效果.通过比较选取的标志性代谢物的含量的差异,探讨了水飞蓟宾对CCl4致小鼠肝损的保护机理.结果表明,CCl4作用后,小鼠机体能量代谢、氨基酸代谢及脂类代谢都受到不同程度的影响.水飞蓟宾能有效地缓解CCl4所造成的体内线粒体功能及氨基酸代谢紊乱.采用代谢组学方法能较全面地反应生物体的生理及代谢状态,并可应用于物质毒性和药效评价研究.

关键词：代谢组学气相色谱-质谱变量重要性投影四氯化碳水飞蓟宾肝损伤

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中药复杂组效关系的变结构神经网络辨识方法

高等学校化学学报 2004年第11期25卷 2004-2009页

作者：范骁辉程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310027

针对中药复杂组效关系的辨识问题 ,研究了变结构多层前馈神经网络 ,推导出一种新型的变结构网络学习算法 ,成功地应用于中药川芎药效活性预测计算 .该方法从一个规模较小的网络出发 ,当网络无法达到预定的学习精度时 ,自动增加隐含层神... 详细信息

针对中药复杂组效关系的辨识问题 ,研究了变结构多层前馈神经网络 ,推导出一种新型的变结构网络学习算法 ,成功地应用于中药川芎药效活性预测计算 .该方法从一个规模较小的网络出发 ,当网络无法达到预定的学习精度时 ,自动增加隐含层神经元个数 ,并在原有学习结果的基础上确定新的网络参数 ,自适应地确定前馈神经网络结构 ,可用于处理复杂化学模式信息 .计算机仿真实验结果表明 ,该方法能有效地确定多层前馈神经网络的最佳结构 ,提高网络学习效率和函数逼近精度 ,解决复杂非线性函数映射关系准确建模问题 .

关键词：神经网络网络结构定量组效关系药效预测中药

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近红外漫反射光谱法快速无损鉴别阿胶真伪

光谱学与光谱分析 2006年第1期26卷 60-62页

作者：瞿海斌杨海雷程翼宇浙江大学药物信息学研究所浙江杭州310027

采用近红外光谱漫反射光谱技术和模式识别技术快速鉴别阿胶真伪。收集来源不同的阿胶(真品8个,伪品6个),采集其近红外漫反射光谱,使用多重散射校正和小波变换对光谱进行预处理后,分别应用相似度匹配和马氏距离方法建立质量鉴别模型。相... 详细信息

采用近红外光谱漫反射光谱技术和模式识别技术快速鉴别阿胶真伪。收集来源不同的阿胶(真品8个,伪品6个),采集其近红外漫反射光谱,使用多重散射校正和小波变换对光谱进行预处理后,分别应用相似度匹配和马氏距离方法建立质量鉴别模型。相似度法使用真品谱图作为标准谱图,用样品谱图与标准谱图的相似度值来鉴别阿胶质量;对阿胶样品进行重复扫描得到28张谱图,随机分为3组后应用马氏距离法建立交叉验证鉴别模型。两种模式识别方法均能准确无误的鉴别阿胶真伪,表明近红外光谱和模式识别技术结合可快速、准确、客观地进行阿胶质量鉴别,可推广到其他中成药的质量鉴别。

关键词：近红外光谱阿胶真伪鉴别模式识别

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一类用化学指纹特征鉴别中药材真伪的方法

高等学校化学学报 2003年第12期24卷 2181-2185页

作者：陈闽军瞿海斌程翼宇浙江大学药物信息学研究所杭州310027

提出用 Fisher因子表征中药材质量模式 ,根据类间距离最大、类内距离最小原则 ,计算色谱图中各峰的权值 ,并以各峰权值为变换向量从各峰面积值中计算出 Fisher因子 ,用于中药材质量模式分类 .以红参主根的真伪鉴别为实例 ,从定量评价、... 详细信息

提出用 Fisher因子表征中药材质量模式 ,根据类间距离最大、类内距离最小原则 ,计算色谱图中各峰的权值 ,并以各峰权值为变换向量从各峰面积值中计算出 Fisher因子 ,用于中药材质量模式分类 .以红参主根的真伪鉴别为实例 ,从定量评价、目视比较和聚类分析等方面将 Fisher因子、主成分及指纹峰进行分类效果对比研究 .结果表明 ,Fisher因子能更好地表征红参化学模式特征 ,分类准确性最高 .因此 ,用本文方法提取的 Fisher因子是一类能表征中药材质量模式的化学指纹特征参量 ,适宜用作鉴别中药材真伪 .

关键词：指纹特征鉴别中药材化学指纹图谱分析质量评价化学组分生物活性