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基于机器学习转移性鼻咽癌关键特征基因的筛选及其免疫细胞浸润分析

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解剖学报 2024年第3期55卷 311-318页

作者：陆进陈云帆张浩轩黄学应安徽医科大学人体解剖学教研室合肥230032 蚌埠医学院人体解剖学教研室安徽蚌埠233030 数字医学与智慧健康安徽省重点实验室安徽蚌埠233030

目的利用机器学习算法筛选转移性鼻咽癌(mNPC)的关键特征基因,并分析其肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况。方法首先,通过GEO数据库下载训练集GSE103611数据,并对数据进行差异表达基因(DEGs)筛选、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书... 详细信息

目的利用机器学习算法筛选转移性鼻咽癌(mNPC)的关键特征基因,并分析其肿瘤微环境中免疫细胞浸润情况。方法首先,通过GEO数据库下载训练集GSE103611数据,并对数据进行差异表达基因(DEGs)筛选、基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)以及免疫细胞浸润分析。其次,通过最小绝对收缩和选择器操作(LASSO)回归筛选DEGs中的预测基因,并利用预测基因的表达水平和受试者工作特征曲线(ROC)筛选特征基因。再次,进一步分析特征基因与免疫细胞的相关性,从而判断关键特征基因。最后,利用反向验证集GSE1245数据,对关键特征基因的表达水平和ROC进行验证。结果共获得136个DEGs,其KEGG主要富集在细胞色素P450、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、朊病毒疾病以及EB病毒感染等通路。GO主要富集在肽基酪氨酸磷酸化修饰、病毒基因表达以及B细胞和白细胞活化的负调节过程。22种免疫细胞在鼻咽癌(NPC)和mNPC中的浸润程度差异不明显。LASSO回归最终得到2个mNPC的关键特征基因无精子蛋白1缺失(DAZ1)和酵母氨酸脱氢酶(SCCPDH),且两者与mNPC微环境中的免疫细胞显著相关(P0.05),且两者ROC的曲线下面积(AUC)值均<0.6。结论DAZ1和SCCPDH是mNPC的关键特征基因,可作为mNPC及其免疫治疗的重要标志物。

关键词：转移性鼻咽癌免疫细胞浸润生物信息学机器学习

ANLN在肾透明细胞癌中的表达及其与预后和免疫浸润相关性的生物信息学分析

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中国免疫学杂志 2024年第8期40卷 1726-1734页

作者：刘东洋张楠李海玲王昱锜苏俞菠高玉敏内蒙古医科大学公共卫生学院呼和浩特010110 内蒙古医科大学慢性病分子流行病学重点实验室呼和浩特010110

目的:探讨肌动蛋白结合蛋白ANLN在肾透明细胞癌(ccRCC)中的诊断和预后价值及其与肿瘤微环境的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC基因表达数据和临床数据。Wilcoxon秩和检验和Logistic回归评估ANLN表达与临床病理特征的... 详细信息

目的:探讨肌动蛋白结合蛋白ANLN在肾透明细胞癌(ccRCC)中的诊断和预后价值及其与肿瘤微环境的关系。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载ccRCC基因表达数据和临床数据。Wilcoxon秩和检验和Logistic回归评估ANLN表达与临床病理特征的关系。受试者工作特征(ROC)曲线评估ANLN表达在ccRCC中的诊断价值。Kaplan-Meier和Cox回归分析研究ANLN表达对总生存期的影响。基因集富集分析(GSEA)识别ccRCC中ANLN相关信号通路。ESTIMATE算法、肿瘤免疫估计资源(TIMER)数据库和CIBERSORT算法分析ANLN表达与免疫浸润的关系。CellMiner数据库计算ANLN与药物敏感性的关系。结果:ANLN在ccRCC组织中表达明显上调。ccRCC中ANLN表达与临床病理特征显著相关。ROC分析显示,ANLN在ccRCC中具有较高的诊断价值。ANLN高表达与预后不良显著相关。多变量Cox回归分析显示ANLN高表达是ccRCC患者总生存期的独立危险因素。GSEA显示ANLN与多种信号通路有关。在免疫方面,ANLN与ccRCC肿瘤微环境、免疫浸润和免疫检查点分子密切相关。ANLN表达与多数抗肿瘤药物敏感性呈负相关。结论:ANLN是ccRCC潜在的诊断和预后生物标志物和免疫治疗靶点。

关键词： ANLN 肾透明细胞癌预后生物标志物免疫浸润

46例肺多形性癌PD-L1表达免疫细胞浸润密度与预后的关系

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中国肿瘤临床 2024年第14期51卷 716-721页

作者：宝鲁日施琳内蒙古医科大学基础医学院病理教研室呼和浩特市010010 内蒙古医科大学附属医院病理科呼和浩特市010010

目的:探讨肺多形性癌(pleomorphic carcinoma,PC)不同病理亚型的临床病理特征、肿瘤免疫微环境(tumor immune microenvironment,TIME)及其预后差异,为肺PC患者的分层管理和精准治疗提供依据。方法:回顾性分析内蒙古医科大学附属医院2016... 详细信息

目的:探讨肺多形性癌(pleomorphic carcinoma,PC)不同病理亚型的临床病理特征、肿瘤免疫微环境(tumor immune microenvironment,TIME)及其预后差异,为肺PC患者的分层管理和精准治疗提供依据。方法:回顾性分析内蒙古医科大学附属医院2016年6月至2022年12月收治的46例肺PC患者的临床病理资料,分别对其性别、年龄、肿瘤大小、临床分期、上皮标记物和组织学亚型(混合型和单纯型)等因素进行总生存期(overall survival,OS)的单因素和多因素Cox比例风险回归分析,观察混合型和单纯型组PD-L1表达与免疫细胞浸润特点以及TIME类型。结果:单因素分析显示临床分期(P=0.019)是影响患者OS的危险因素,病理亚型(P=0.048)和中性粒细胞浸润(P=0.007)是影响患者OS的保护因素,多因素分析显示临床分期(P=0.044)和中性粒细胞浸润(P=0.003)是影响患者生存的2个独立因素。肿瘤细胞PD-L1表达和肿瘤免疫微环境分析显示,混合型组CD4+T淋巴细胞浸润密度比单纯型组高(P=0.009),单纯型组PD-L1表达和CD163+M2型肿瘤相关巨噬细胞(tumorassociated macrophages,TAM)浸润密度比混合型组高(P=0.002),混合型组以Ⅱ型和Ⅲ型TIME为主,单纯型组以Ⅰ型和Ⅲ型TIME为主。结论:肺PC具有异质性的形态学和独特的TIME,肺PC应根据形态学和TIME进行分层管理才能提高免疫治疗效果。

关键词：多形性癌临床病理特征肿瘤免疫微环境 PD-L1

新疆维吾尔自治区某医学高校临床医学定向生包虫病防治知识情况调查分析

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中国健康教育 2024年第1期40卷 90-95页

作者：古丽巴旦·托汗何桂香李雪莲新疆特殊环境与健康研究重点实验室新疆医科大学公共卫生学院新疆乌鲁木齐831100

目的了解新疆维吾尔自治区某医学高校临床医学定向生对包虫病相关政策、预防及医学救治知识的知晓情况,为提高地方病防治技能及开展精细化健康教育提供依据。方法采用分层随机抽样法,共抽取392名临床医学定向专业学生进行问卷调查,运用... 详细信息

目的了解新疆维吾尔自治区某医学高校临床医学定向生对包虫病相关政策、预防及医学救治知识的知晓情况,为提高地方病防治技能及开展精细化健康教育提供依据。方法采用分层随机抽样法,共抽取392名临床医学定向专业学生进行问卷调查,运用多因素方差分析调查对象不同人口学特征与包虫病防治知识总得分的关系,以P学意义。结果包虫病相关政策知识平均知晓率为61.08%,平均得分为(4.27±0.41)分;包虫病预防知识平均知晓率为65.56%,平均得分为(4.59±0.44)分;包虫病医疗救治知识平均知率为51.62%,平均得分为(3.10±0.48)分;包虫病防治知识总知晓率为59.42%,平均得分为(11.97±3.44)。变量专业、年级、民族,对防治知识总得分有显著性影响。结论新疆维吾尔自治区某医学高校临床医学定向生包虫病防治知识总体知晓率偏低,应加强医疗救治方面的知识,并侧重相关政策知识的普及。

关键词：包虫病临床医学定向生防治知识调查

尘肺病胸部CT重建图像圆形小阴影密集度评价方法的研究

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中华劳动卫生职业病杂志 2024年第5期42卷 359-369页

作者：刘畅杨明王强白净段铮董会台河北医科大学劳动卫生与环境卫生学教研室石家庄050011 石家庄市第五医院放射科石家庄050019 石家庄市妇幼保健院医学影像科石家庄050090 石家庄市疾病预防控制中心职业卫生科石家庄050011

目的遴选尘肺病诊断用胸部CT图像模式,建立尘肺病胸部CT圆形小阴影密集度判定方法。方法于2021年4月,选择以圆形小阴影为主要表现的、具有同期数字化X线摄影技术(DR)胸片和胸部CT影像学资料的66例职业性尘肺病患者作为研究对象。采用1.5... 详细信息

目的遴选尘肺病诊断用胸部CT图像模式,建立尘肺病胸部CT圆形小阴影密集度判定方法。方法于2021年4月,选择以圆形小阴影为主要表现的、具有同期数字化X线摄影技术(DR)胸片和胸部CT影像学资料的66例职业性尘肺病患者作为研究对象。采用1.5 mm、5 mm胸部CT轴位图像,1 mm、5 mm胸部CT冠状位多平面重组(MPR)图像,5 mm胸部CT冠状位最大密度投影(MIP)图像,观察尘肺病患者不同影像特征,并同DR胸片进行影像学比较分析,建立实验用胸部CT标准。对实验用胸部CT标准与GBZ 70-2015《职业性尘肺病的诊断》的密集度判定结果进行一致性验证。结果66例研究对象均为男性,尘肺壹期33例、尘肺贰期17例、尘肺叁期16例。观察66例研究对象五种胸部CT图像发现,不同模式胸部CT图像均能清晰显示和辨识圆形小阴影、大阴影、小阴影聚集、蜂窝状磨玻璃影、片状磨玻璃影、全肺均匀性低密度磨玻璃影、网格状磨玻璃影、索条状影、线状影、胸膜下棘突状影、胸膜下结节、各种肺气肿及肺纹理扭曲断裂等异常影像;小阴影聚集多伴有大阴影的出现;5 mm CT图像血管影延展性好,小结节影较易区分;5 mm胸部CT冠状位MIP图像使用了边缘增强技术,容易出现小阴影融合和纤维化影融合现象;5 mm胸部CT冠状位MPR图像在阅片的整体性上与DR胸片存在高度一致性。用GBZ 70-2015标准,对66例研究对象DR胸片与5 mm胸部CT冠状位MPR图像总体密集度进行比较,一致性检验Kappa值=0.64。用GBZ 70-2015标准和实验用胸部CT标准,分别对66例研究对象DR胸片和5 mm胸部CT冠状位MPR图像总体密集度判定结果进行比较,一致性检验Kappa值=0.80,具有高度一致性。结论5 mm冠状位MPR图像作为尘肺病诊断的胸部CT图像模式是适宜的;沿用GBZ 70-2015密集度判断标准片遴选路径和方法,建立的实验用胸部CT标准对尘肺病5 mm胸部CT冠状位MPR图像圆形小阴影总体密集度判定结果与GBZ 70-2015标准具有高度一致性。

关键词：尘肺病计算机断层扫描技术胸部CT 5 mm冠状位多平面重组(MPR) 圆形小阴影密集度

基于生物信息学构建宫颈癌预后相关ceRNA网络

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中国医科大学学报 2024年第5期53卷 385-391页

作者：任敬秦周常慧刘成清娜孜拉·赛提尼亚孜杨楠李榕新疆医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健学教研室乌鲁木齐830000 新疆特殊环境与健康研究重点实验室乌鲁木齐830000 中亚高发病成因与防治国家重点实验室乌鲁木齐830000

目的分析宫颈癌中环状RNA(circRNA)-长链非编码RNA(lncRNA)-微RNA(miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据,通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、L... 详细信息

目的分析宫颈癌中环状RNA(circRNA)-长链非编码RNA(lncRNA)-微RNA(miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据,通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、LASSO和多变量Cox回归分析建立预后mRNA模型,并使用GEO数据库进行验证。利用R包及Cystoscape软件构建Nomogram模型及宫颈癌circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络。结果通过单变量、LASSO和多变量Cox回归分析,构建了包含5个mRNA的预后模型,该模型的1、2、3年受试者操作特征曲线下面积分别为0.71、0.71、0.70。同时,在GSE44001中验证预测结果,该预后模型的Nomogram模型C-index为0.707。本研究共构建了包含39个circRNA、27个lncRNA、12个miRNA和5个mRNA的ceRNA网络。结论本研究揭示的网络有助于探讨宫颈癌ceRNA的机制,构建预后模型及Nomogram模型可以预测患者预后。

关键词：竞争性内源RNA 环状RNA 长链非编码RNA 宫颈癌

孕期主要持久性有机污染物暴露对儿童神经系统功能发育影响的研究进展

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中华预防医学杂志 2024年第6期58卷 917-923页

作者：吴舒琪刘博蕊杨喆郑璐王小川杨昕悦贾丽红胡嘉晋辽宁省肥胖与糖脂代谢性疾病重点实验室中国医科大学健康科学研究院沈阳110122 中国医科大学公共卫生学院沈阳110122

持久性有机污染物(POPs)具有抵抗环境降解性、生物蓄积性和远距离迁移潜力等特点,母亲孕期POPs暴露可通过胎盘屏障进入胎儿血液循环,对子代的神经系统功能发育产生潜在影响,进而导致成人期神经系统功能缺陷和疾病的发生发展。本文旨在... 详细信息

持久性有机污染物(POPs)具有抵抗环境降解性、生物蓄积性和远距离迁移潜力等特点,母亲孕期POPs暴露可通过胎盘屏障进入胎儿血液循环,对子代的神经系统功能发育产生潜在影响,进而导致成人期神经系统功能缺陷和疾病的发生发展。本文旨在阐明孕期暴露于3种主要POPs(有机氯化合物、全氟及多氟烷基物质和多溴联苯醚)对儿童神经系统功能发育(社会情绪、认知、语言、运动和适应性)的影响,为后续相关研究提供参考依据。

关键词：持久性有机污染物神经系统功能儿童发育宫内暴露综述

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中国骨科临床实践指南及共识的质量评价

中国循证医学杂志 2024年第7期24卷 832-837页

作者：樊子娟李帝均闫磊邢丹周奇王斌山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001 山西医科大学第二医院骨科太原030001 北京大学人民医院骨关节疾病诊疗中心北京100044 兰州大学基础医学院循证医学中心兰州730000 STAR秘书处兰州730000 浙江大学医学院附属第一医院骨科杭州310006

目的了解近年我国骨科已发表的指南与共识的评级现状,帮助使用者遴选临床指南和共识,指导临床实践,并推动我国骨科指南和共识质量的针对性提升。方法计算机检索CNKI、WanFang Data、SinoMed数据库,搜集相关的中国骨科临床实践指南与共识... 详细信息

目的了解近年我国骨科已发表的指南与共识的评级现状,帮助使用者遴选临床指南和共识,指导临床实践,并推动我国骨科指南和共识质量的针对性提升。方法计算机检索CNKI、WanFang Data、SinoMed数据库,搜集相关的中国骨科临床实践指南与共识,检索时限为2016年1月至2023年10月。由2位评价员独立筛选文献、提取资料后,采用指南科学性、透明性和适用性的评级工具(scientific,transparent and applicable rankings,STAR)对2016年后在中国医学期刊发表的中国骨科指南和共识进行了综合评级。若两位评价员存在争议,则由第三位评价员裁定。采用Kappa值评估两位评价员的结果一致性。结果共获得191篇骨科相关指南和共识,其中指南74篇,共识117篇。纳入评价的指南平均得分为34.4分,共识平均得分为21.7分。纳入指南在注册、计划书、工作组、临床问题、证据、共识方法、推荐意见、可及性及其他领域得分均高于共识。Kappa值检验结果为0.684。结论近年来国内已发表的骨科临床实践指南与共识虽然方法学评分逐年增加,但是总体质量有待进步。未来的指南需要在资助透明、推荐意见形成、指南发布与传播方面进一步提高。

关键词：骨科临床实践指南专家共识指南评价

孕早期增塑剂DEHP亚急性暴露影响蜕膜反应并增加流产风险

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浙江大学学报（医学版） 2024年第3期53卷 331-341页

作者：刘秋菊谭丽萍袁柳陈雪梅李方方何俊琳高茹菲重庆医科大学公共卫生学院生殖生物学研究室生殖与发育教育部国际合作联合实验室重庆400016

目的:探究邻苯二甲酸酯类增塑剂邻苯二甲酸二(2-乙基)己酯(DEHP)亚急性暴露对小鼠子宫内膜蜕膜反应和流产风险的影响。方法:分别选取300、1000、3000 mg·kg^(-1)·d^(-1)三个浓度梯度的DEHP对CD1小鼠进行经口亚急性暴露28 d。建立DEHP... 详细信息

目的:探究邻苯二甲酸酯类增塑剂邻苯二甲酸二(2-乙基)己酯(DEHP)亚急性暴露对小鼠子宫内膜蜕膜反应和流产风险的影响。方法:分别选取300、1000、3000 mg·kg^(-1)·d^(-1)三个浓度梯度的DEHP对CD1小鼠进行经口亚急性暴露28 d。建立DEHP亚急性暴露小鼠早期自然妊娠模型和人工诱导假孕小鼠蜕膜反应模型,分别取自然妊娠第7天子宫组织和人工诱导蜕膜反应小鼠妊娠第8天诱导侧子宫组织,通过苏木精-伊红染色(HE染色)、Masson染色、TUNEL检测、蛋白质印迹法检测DEHP亚急性暴露对小鼠蜕膜反应的影响。构建300 mg·kg^(-1)·d^(-1) DEHP亚急性暴露小鼠自然流产模型,观察妊娠第10天的妊娠结局,探究蜕膜反应受损对小鼠妊娠的影响。结果:与空白对照组比较,DEHP大剂量组受孕率显著性降低(P<0.05);HE染色显示DEHP小剂量组和中剂量组蜕膜基质细胞排列杂乱、细胞核形态不规则、胞浆染色不均、多核细胞数显著降低;Masson染色显示DEHP小剂量组和中剂量组蜕膜组织的胶原纤维分布更多、数量增多、排列杂乱;TUNEL检测显示暴露组蜕膜组织细胞凋亡增加;蛋白质印迹法检测显示暴露组子宫内膜蜕膜反应标志分子BMP2蛋白表达水平显著降低(P<0.05或P<0.01);在米非司酮流产刺激下DEHP小剂量组小鼠流产率、胚胎吸收率显著升高,胚胎数、子宫湿重、子宫面积、胎盘湿重显著减少(P<0.05或P<0.01)。结论:DEHP亚急性暴露导致小鼠子宫内膜蜕膜反应受损加重小鼠妊娠流产风险。

关键词：邻苯二甲酸二(2-乙基)己酯蜕膜反应米非司酮流产小鼠