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基于SNP芯片的固原鸡遗传结构与保种效果分析

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浙江农业学报 2024年

作者：张海洋黄宣周薇向鑫马玉芳尹兆正浙江大学动物科学学院宁夏好水川食品有限公司

为了解固原鸡的保种效果，为更好地保护和利用固原鸡这一重要地方种质资源提供参考和帮助。从固原鸡群体中随机采集公鸡、母鸡各30只血样，采用“京芯一号”55K芯片技术对固原鸡进行保种分析。结果显示，固原鸡有效群体含量为8.9，多态... 详细信息

为了解固原鸡的保种效果，为更好地保护和利用固原鸡这一重要地方种质资源提供参考和帮助。从固原鸡群体中随机采集公鸡、母鸡各30只血样，采用“京芯一号”55K芯片技术对固原鸡进行保种分析。结果显示，固原鸡有效群体含量为8.9，多态标记比例为0.828，期望杂合度为0.360，观测杂合度为0.359，说明该群体遗传变异较小，整齐度较高；G矩阵表明该群体中存在近亲交配的趋势；在检测到的1 431个长纯合片段（runs of homozygosity， ROH）片段中，ROH长度在50～100 Mb的个体数量最多，占比达36.67%，该群体平均近交系数为0.11。结合基因组亲缘关系分析和聚类分析结果，现有30只公鸡样本可以划分为10个家系，其中25只母鸡分别划入不同家系，另外有5只母鸡和所检测的公鸡亲缘关系系数均小于0.1，亲缘关系都比较远，因此将其归入了“其他”分类中。综上所述，该保种固原鸡群体遗传变异较小，选育程度较高；为降低群体的近交增量，后期的保种过程中需考虑亲缘关系再进行配种。

关键词：固原鸡保种分析 SNP芯片亲缘关系

摇枝式加工型苹果采摘振动参数仿真优化与试验

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农业机械学报 2024年第5期55卷 28-39页

作者：杨欣姜尊豪李建平谢金燕顾浩源边永亮河北农业大学机电工程学院保定071001 河北省智慧农业装备技术创新中心保定071001 浙江大学生物系统工程与食品科学学院杭州310058

为探究不同振动参数组合对苹果采摘效果的影响,建立苹果树二级树枝振动力学模型,解析分析得到影响苹果脱落的主要因素为振动频率、振幅及夹持位置。测量苹果树形态特征并基于矮砧密植整形原理建立纺锤形苹果树三维模型,利用ANSYS软件对... 详细信息

为探究不同振动参数组合对苹果采摘效果的影响,建立苹果树二级树枝振动力学模型,解析分析得到影响苹果脱落的主要因素为振动频率、振幅及夹持位置。测量苹果树形态特征并基于矮砧密植整形原理建立纺锤形苹果树三维模型,利用ANSYS软件对苹果树模型进行有限元仿真分析,仿真结果表明,振动频率4~8 Hz、振幅20~30 mm、夹持位置0.35l~0.65l(l为二级树枝长度)时,对果树损伤较小且苹果易脱落。设计四因素三水平振动采摘试验,以确定苹果树不同位置树枝最佳的振动参数组合,利用Design-Expert软件对试验数据进行分析和响应面优化,参数优化结果为:采摘苹果树上层苹果时,振动频率为5 Hz,振幅为28 mm,夹持位置为0.40l;采摘苹果树中层苹果时,振动频率为4 Hz,振幅为30 mm,夹持位置为0.43l;采摘苹果树下层苹果时,振动频率为8 Hz,振幅为20 mm,夹持位置为0.65l;通过验证试验得到苹果树上层、中层、下层摘净率为96.4%、94.8%、93.2%,与优化值相近,表明优化模型可靠。

关键词：加工型苹果振动采摘参数优化有限元仿真

加工型/鲜食型辣椒不同成熟期果实比较代谢组学分析

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中国农业科学 2024年第12期57卷 2424-2438页

作者：高成安万红建叶青静程远刘晨旭何勇浙江农林大学园艺学院浙江省农业科学院蔬菜研究所

【目的】辣椒是我国广泛栽培的蔬菜作物，根据栽培类型可分为加工型与鲜食型。本研究鉴定并比较加工型和鲜食型辣椒在绿熟期和红熟期果实中的代谢物，为阐明加工型和鲜食型辣椒果实之间的代谢和品质差异提供理论基础。【方法】以加工型... 详细信息

【目的】辣椒是我国广泛栽培的蔬菜作物，根据栽培类型可分为加工型与鲜食型。本研究鉴定并比较加工型和鲜食型辣椒在绿熟期和红熟期果实中的代谢物，为阐明加工型和鲜食型辣椒果实之间的代谢和品质差异提供理论基础。【方法】以加工型辣椒P059和鲜食型辣椒F270两个品种的绿熟期和红熟期果实为样本，通过液相色谱质谱联用技术（LC-MS）和多元统计学等方法鉴定并比较差异代谢物。【结果】加工型辣椒P059和鲜食型辣椒F270的绿熟期和红熟期果实中共检测到1 465种代谢物，这些代谢物被分为多种类别，包括脂类、氨基酸和萜类等。对两种类型辣椒相同成熟期的代谢物进行比较分析，发现P059红熟期和绿熟期果实中的脂类物质都显著高于相同成熟阶段的F270，如亚油酸通路（map00591）的亚油酸和9,10-二羟基-12-十八碳烯酸在P059中的含量是F270的两倍多。两种类型辣椒的绿熟期果实中，P059中亚精胺含量更高，是F270的2倍多；而F270高香草酸含量更高，是P059的2.93倍。对于红熟期果实，P059的辣椒素含量是F270的5.74倍；而F270中脯氨酸含量是P059的2.47倍。此外，对两种类型辣椒成熟过程中的差异代谢物进行比较分析，发现精氨酸和脯氨酸代谢通路（map00330）中的N-氨甲酰腐胺仅在P059成熟过程中存在差异，红熟期含量是绿熟期的2倍以上，而在F270中无显著差异；维生素A含量则仅在F270成熟过程中存在显著差异，其含量在红熟期上升幅度达277%。柠檬酸和脱落酸在P059和F270成熟过程中均显著上调（P059红熟期分别是绿熟期的1.7倍和8.4倍；F270红熟期中分别是绿熟期的1.7倍和12倍），而13-羟基-9,11-十八碳二烯酸在两种类型辣椒成熟过程中的变化趋势不同，其在P059中上调约300%，而在F270中显著降低。【结论】根据脂类、氨基酸类、维生素和有机酸等多种差异代谢物可以区分两种类型辣椒。此外，本研究还揭示了柠檬酸、脱落酸、13-羟基-9,11-十八碳二烯酸等特定代谢产物在两种类型辣椒果实成熟过程中的变化趋势。

关键词：加工型辣椒鲜食型辣椒代谢物比较代谢组果实品质

植物miR396及其靶基因进化、功能与应用研究进展

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核农学报 2024年第3期38卷 472-480页

作者：童嘉琳楼姝坪徐云敏朱祝军何勇浙江农林大学园艺科学学院浙江杭州311300 农业农村部亚热带果品蔬菜质量安全控制重点实验室浙江杭州311300

miR396是植物中一类保守的miRNA,通过切割/翻译抑制负调控靶基因,在植物生长发育、信号响应等过程起重要作用。本研究对miR396和靶基因的功能进行总结,重点阐述了miR396的进化及其在农业生产上的应用,以期为深入探究miR396调控植物发育... 详细信息

miR396是植物中一类保守的miRNA,通过切割/翻译抑制负调控靶基因,在植物生长发育、信号响应等过程起重要作用。本研究对miR396和靶基因的功能进行总结,重点阐述了miR396的进化及其在农业生产上的应用,以期为深入探究miR396调控植物发育、提高作物产量和养分利用效率等提供参考。

关键词： miR396 靶基因进化功能 GRF

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滩涂土壤离散元接触模型优化与现场铲削试验

农业工程学报 2024年第8期40卷 107-115页

作者：梁喜凤胡泽郑立文王永维中国计量大学机电工程学院杭州310000 朝阳师范高等专科学校朝阳122000 浙江大学生物系统工程与食品科学学院杭州310000

为解决现有离散元接触模型对滩涂土壤特性表征准确性差的问题,该研究基于离散元仿真软件EDEM的API二次开发功能,以Hertz-Mindlin接触模型为基础,通过增加塑性、粘附特征并更改切向滑动摩擦力,得到优化后的高湿黏弹塑性(moist elasto-pla... 详细信息

为解决现有离散元接触模型对滩涂土壤特性表征准确性差的问题,该研究基于离散元仿真软件EDEM的API二次开发功能,以Hertz-Mindlin接触模型为基础,通过增加塑性、粘附特征并更改切向滑动摩擦力,得到优化后的高湿黏弹塑性(moist elasto-plastic adhesion,MEPA)模型。通过模拟活塞拔出试验,结合Plackett-Burman试验筛选出影响标定指标的显著参数,完成接触模型参数标定。搭建了铲削试验平台进行现场铲削试验,对比分析了MEPA模型、JKR模型、EEPA模型以及Bonding模型的土壤特性表征效果。试验结果表明,在铲削阻力方面,MEPA模型较JKR模型、EEPA模型和Bonding模型的仿真精度分别提升约65.957%、74.206%和59.326%;相较于现场试验结果,MEPA模型的堆积厚度与侧边距相对误差分别为5.598%和6.362%,两者均保持在10%以内,能够较好地模拟滩涂土壤,对滩涂工作装置的工况模拟和优化设计具有重要意义。

关键词：土壤模型试验离散元法 EDEM二次开发铲削阻力

蜜蜂气味结合蛋白与外源性化合物互作机制研究进展

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农药学学报 2024年第2期26卷 257-265页

作者：陈沛彤鄢茹朱国念陈梦丽郭逸蓉浙江大学农业与生物技术学院农药与环境毒理研究所杭州310058 浙江大学生命科学学院杭州310058 浙江农林大学现代农学院杭州311300

嗅觉是蜜蜂赖以生存和繁殖的主要感官方式,可为蜜蜂外出觅食、躲避天敌、交配等行为提供重要信息,而气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)在其嗅觉感知中发挥着关键作用。探究外界环境中各种化学物质与蜜蜂OBPs之间的相互作用,... 详细信息

嗅觉是蜜蜂赖以生存和繁殖的主要感官方式,可为蜜蜂外出觅食、躲避天敌、交配等行为提供重要信息,而气味结合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)在其嗅觉感知中发挥着关键作用。探究外界环境中各种化学物质与蜜蜂OBPs之间的相互作用,对于揭示蜜蜂OBPs对不同外源性化合物的结合特性和结合机制具有重要意义。外源性化合物主要包括化学信息物质(信息素和蜜源开花植物挥发物)以及杀虫剂等农用化学品。一方面,化学信息物质与蜜蜂OBPs结合,在维持蜂群稳定、繁殖、觅食、授粉等生理功能中发挥着重要作用;另一方面,杀虫剂与蜜蜂OBPs结合则可能危害蜜蜂嗅觉系统,影响或干扰蜜蜂对环境气味分子的识别。本文综述了蜜蜂OBPs的种类、功能及其与外源性化合物互作机制的研究进展,以期为深入探究蜜蜂OBPs的生理功能、保护蜜蜂免受杀虫剂等化学物质的危害提供参考。

关键词：蜜蜂气味结合蛋白嗅觉感受器互作机制杀虫剂昆虫信息素植物挥发性物质

挤压处理对全谷物理化和功能特性影响研究进展

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中国粮油学报 2024年第1期39卷 218-225页

作者：胡薇薇张治国杨开步婷婷吴卫成浙江省农业科学院食品科学研究所杭州310021 浙江工业大学食品科学与工程学院杭州310014

全谷物富含多种生物活性成分,但其适口性差、消费者接受度低。挤压是一种高效、低耗及功能多样化的加工技术,通常用于开发具有高营养和感官质量的食品。本文综述了国内外挤压技术在全谷物方向的研究进展。介绍了全谷物、挤压技术,并分... 详细信息

全谷物富含多种生物活性成分,但其适口性差、消费者接受度低。挤压是一种高效、低耗及功能多样化的加工技术,通常用于开发具有高营养和感官质量的食品。本文综述了国内外挤压技术在全谷物方向的研究进展。介绍了全谷物、挤压技术,并分析总结了挤压技术对其物理化学性质的影响。挤压全谷物制品还体现出抑制糖尿病和肥胖症等慢性疾病的潜力。

关键词：挤压全谷物理化特性功能

黄瓜R2R3-MYB亚家族鉴定及生物信息学分析

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浙江农林大学学报 2024年第2期41卷 286-296页

作者：郭玉婷杜长霞浙江农林大学园艺科学学院浙江省山区农业高效绿色生产协同创新中心浙江杭州311300 浙江农林大学农业农村部亚热带果品蔬菜质量安全控制重点实验室浙江杭州311300

【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质... 详细信息

【目的】深入研究黄瓜Cucumis sativus R2R3-MYB亚家族成员的相关功能。【方法】利用生物信息学手段分析黄瓜全基因组,鉴定R2R3-MYB亚家族成员,对其系统进化关系、蛋白理化性质、染色体定位、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白质互作进行分析。【结果】黄瓜全基因组中含99个具有典型结构域的R2R3-MYB转录因子,蛋白序列含195~552个氨基酸,有保守基序及氨基酸位点;基因在染色体上分布不均匀;大部分亚家族成员蛋白质的不稳定指数大于40,属于不稳定蛋白。顺式作用调控元件分析发现:大部分基因启动子区所含元件与激素调节、MYB结合位点、胁迫密切相关。【结论】通过黄瓜全基因组鉴定,获得黄瓜基因组99个R2R3-MYB家族成员,分为30个亚组,映射于7条染色体上,该家族成员的上游启动子区含逆境相关作用元件。

关键词：黄瓜 R2R3-MYB 转录因子全基因组鉴定

制备工艺对高直链玉米淀粉—硬脂酸复合物性质的影响

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食品与机械 2024年第6期 25-33页

作者：张雯刘步瑜吴卫成袁高峰张治国浙江海洋大学食品与药学学院浙江省农业科学院食品科学研究所

[目的]优化高抗性淀粉(RS)含量的淀粉—脂质复合物制备工艺，探究工艺参数对复合物抗消化性的影响。[方法]采用单因素试验和正交设计研究了高直链玉米淀粉(HA)预处理及其与硬脂酸(SA)络合过程中温度和时间参数对复合物RS含量的影响，分... 详细信息

[目的]优化高抗性淀粉(RS)含量的淀粉—脂质复合物制备工艺，探究工艺参数对复合物抗消化性的影响。[方法]采用单因素试验和正交设计研究了高直链玉米淀粉(HA)预处理及其与硬脂酸(SA)络合过程中温度和时间参数对复合物RS含量的影响，分析最优工艺制备的HA-SA复合物的理化性质、抗消化性及水合特性。[结果]在糊化温区继续升高预处理温度、延长预处理时间、络合温度高于75℃均导致RS含量显著降低(P<0.05);HA-SA复合物最优制备工艺为：HA经85℃的退火温度预处理12 h后，在75℃与SA络合90 min;所制备的HA-SA具有V型晶体特征、完整的淀粉颗粒，为Ⅰ型淀粉—脂质复合物；与HA相比，其热稳定性、抗消化性显著升高，但膨胀力显著降低(P<0.05)。[结论]退火温度预处理和适宜的络合温度有利于HA-SA中RS组分的形成；预处理过程中加热强度的增加使淀粉过度糊化，阻碍了直链淀粉与脂质的络合，络合过程中过高的温度也导致复合物中RS组分的解离，使RS含量降低；退火预处理使HA保留了完整的颗粒结构，是HA-SA抗消化性高的原因之一。

关键词：高直链玉米淀粉硬脂酸淀粉—脂质复合物热稳定性抗消化性