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基于干性指数模型对肉瘤预后、免疫浸润和铁死亡调控的分析

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中国组织工程研究 2025年第19期29卷 4151-4160页

作者：魏婧娴孟莲孙皓张田田刘春霞石河子大学医学院病理学系/石河子大学第一附属医院病理科新疆维吾尔自治区石河子市832000 广州医科大学附属第二医院病理科广东省广州市510260

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测... 详细信息

背景:干性指数可能与肉瘤预后、免疫浸润有关,但具体调控机制与特征基因尚不清楚。目的:利用基因干性指数模型探究肉瘤干细胞与患者预后和免疫浸润的关系,并识别肉瘤干细胞铁死亡特征基因。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)中获取肉瘤RNA测序数据及相关临床信息。利用肉瘤干性指数,对获取的肉瘤RNA测序数据进行分组。利用生存数据进行组间预后情况分析,获取组间差异表达基因后进行通路富集和免疫浸润分析。获得铁死亡相关差异基因,构建蛋白互作网络并进行预后相关性分析。培养横纹肌肉瘤细胞系,分为贴壁细胞组和干细胞组,贴壁细胞组不予任何干预,干细胞组通过无血清培养处理以诱导横纹肌肉瘤干细胞富集,qRT-PCR验证干细胞相关标志物、铁死亡相关差异基因以及铁死亡相关标志物的mRNA表达。结果与结论:①以干性指数中位数为界将患者分成高干性指数组和低干性指数组,通过患病风险预测显示高干性指数组患者的无进展生存期低于低干性指数组,提示预后不佳;②GO、KEGG分析显示肉瘤高、低干性指数组差异表达基因参与不同的细胞通路;高干性指数组和低干性指数组之间免疫浸润存在差异;差异基因中有23个铁死亡相关基因,其中9个可构成相关性较强的蛋白互作网络,其中IDO1、IFNG、AQP5高表达的肉瘤患者预后更好,CA9高表达的肉瘤患者预后不佳;③qRT-PCR结果显示,与贴壁细胞组相比,干细胞组干细胞相关标志物NANOG、SOX2和OCT4 mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组铁死亡相关标志物SLC7A11的mRNA表达显著降低(P<0.05),ACSL4、GPX4、FTH1和COX2的mRNA表达显著升高(P<0.05);与贴壁细胞组相比,干细胞组差异基因CA9的mRNA表达显著降低,IDO1、IFNG、AQP5的mRNA表达显著升高(P<0.05)。经上述生物信息学分析与实验验证,干细胞与肉瘤生存、铁死亡过程密切相关,CA9、IDO1、IFNG、AQP5在肉瘤干细胞中异常表达,可能成为肉瘤诊断标志物和治疗新靶点。

关键词：肉瘤干细胞干性指数铁死亡生存预后免疫浸润

新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响

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中国组织工程研究 2025年第13期29卷 2655-2660页

作者：石晨曦朱卫东李三恩李秀明师逢丁亚云苏州大学附属第一医院病理科江苏省苏州市215000 苏州市立医院本部皮肤科江苏省苏州市215000

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 详细信息

背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。

关键词：超声处理存储年限 DNA质量片段完整性降解程度二代测序

华支睾吸虫ESP刺激胆管上皮细胞产生IL-17A促进肝纤维化的机制研究

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中国病原生物学杂志 2025年第2期 190-194+200页

作者：刘桐彤朱浩王楠王新月胡凤爱曹璋高洪莲刘乃国柏雪莲滨州医学院附属医院医学研究中心滨州医学院附属医院病理科

目的探讨华支睾吸虫感染刺激胆管上皮细胞产生IL-17A激活HSC导致肝纤维化的机制。方法从流行区获取华支睾吸虫感染的患者血清，ELISA法检测IL-17A的表达。人工消化麦穗鱼，分离华支睾吸虫囊蚴，分别灌胃感染新西兰大白兔和BALB/c小鼠... 详细信息

目的探讨华支睾吸虫感染刺激胆管上皮细胞产生IL-17A激活HSC导致肝纤维化的机制。方法从流行区获取华支睾吸虫感染的患者血清，ELISA法检测IL-17A的表达。人工消化麦穗鱼，分离华支睾吸虫囊蚴，分别灌胃感染新西兰大白兔和BALB/c小鼠，无菌分离小鼠肝脏和血清。ELISA法、Western blot和免疫组化法检测小鼠血清和肝脏中IL-17A的表达；ESP刺激人胆管癌细胞RBE,分别应用qRT-PCR和Western blot检测RBE细胞IL-17A的表达。收集RBE细胞培养上清加入LX-2细胞培养体系，qRT-PCR和Western blot检测LX-2细胞的α-SMA和Collagen-I的表达。结果华支睾吸虫感染患者血清IL-17A水平显著高于健康体检者(t=6.536,P<0.01)。被感染的小鼠血清和肝脏中IL-17A的表达水平显著高于正常对照组(t=12.98,P<0.01;t=4.155,P<0.05)。免疫组化结果显示，感染小鼠的肝胆管上皮中IL-17A表达量增多(t=10.80,P<0.01)。ESP刺激后，RBE细胞的IL-17A表达水平显著升高(均P<0.01)。RBE细胞培养上清加入LX-2细胞培养体系后，α-SMA和Collagen-I的表达水平显著高于对照组(均P<0.01)。结论华支睾吸虫可以刺激胆管上皮细胞产生IL-17A,进一步促进炎症并激活HSC产生胶原沉积，从而促进肝纤维化的进展。

关键词：华支睾吸虫分泌代谢产物白介素17A 肝纤维化

河南林州食管癌家族史阳性患者比较基因组杂交特征

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南方医科大学学报 2009年第6期29卷 1166-1169页

作者：常志伟王立东秦艳茹李苹娟范宗民郭涛宋昕王苒李吉林常志军何欣河南省食管癌重点开放实验室郑州大学第一附属医院郑州大学基础医学院河南郑州450052 林州市姚村食管癌医院病理科河南林州456592 林州市中心医院胸外科河南林州450092

目的探讨河南食管癌高发区食管癌家族史阳性患者基因组变化特征。方法应用比较基因组杂交技术分析13例食管癌家族史阳性和32例食管癌家族史阴性患者染色体基因组变化。结果10q染色体部位DNA拷贝数扩增在食管癌家族史阳性患者为23%(3/13... 详细信息

目的探讨河南食管癌高发区食管癌家族史阳性患者基因组变化特征。方法应用比较基因组杂交技术分析13例食管癌家族史阳性和32例食管癌家族史阴性患者染色体基因组变化。结果10q染色体部位DNA拷贝数扩增在食管癌家族史阳性患者为23%(3/13)而食管癌家族史阴性患者中无发生(P食管癌家族史阳性为38%(5/13),明显高于食管癌家族史阴性的6%(2/32)(P食管癌家族史阳性和阴性患者中发生率均超过20%(P>0.05)。结论10q、15q可能存在与食管癌遗传高易感性相关的关键基因,而3q、8q、7p、5p、3p、19q、9q等可能存在与环境因素相关的食管癌关键基因。

关键词：食管癌比较基因组杂交遗传易感性家族史

葛根汤干预脊髓型颈椎病模型大鼠神经炎症反应和凋亡的作用

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中国组织工程研究 2025年第20期29卷 4249-4257页

作者：吴迪友黄家俊陶广义赵宇黄俊卿杨彬薛云河南中医药大学河南省郑州市450000 河南省中医院/河南中医药大学第二附属医院河南省郑州市450000

背景:炎症和细胞凋亡在脊髓型颈椎病病理过程中起着关键作用。既往研究表明葛根汤对脊髓型颈椎病有着良好的治疗效果。目的:探讨葛根汤对脊髓型颈椎病大鼠神经炎症反应和细胞凋亡的影响及作用机制。方法:60只SD大鼠随机分为正常组、假... 详细信息

背景:炎症和细胞凋亡在脊髓型颈椎病病理过程中起着关键作用。既往研究表明葛根汤对脊髓型颈椎病有着良好的治疗效果。目的:探讨葛根汤对脊髓型颈椎病大鼠神经炎症反应和细胞凋亡的影响及作用机制。方法:60只SD大鼠随机分为正常组、假手术组、模型组、葛根汤低、中、高剂量组,采用吸水膨胀材料压迫脊髓的方法构建脊髓型颈椎病模型,术后2周给予4.86,9.72,19.44 g/kg葛根汤灌胃,其余组则灌胃生理盐水,每日1次,持续4周。在给药后第1,7,14,21,28天对大鼠进行运动功能评价(BBB评分);在给药4周后采用苏木精-伊红染色观察脊髓组织病理形态变化,免疫荧光双染检测脊髓组织小胶质细胞极化情况,荧光定量PCR检测脊髓组织中白细胞介素6和白细胞介素1β mRNA表达,Western blot法检测脊髓组织中p-NF-κB p65、NF-κB p65、NLRP3、ASC、Cleaved Caspase-1、Bax、Bcl-2、Cleaved Caspase-3、NOX4、p-Drp1、Drp1和Mfn2蛋白表达,TUNEL法检脊髓组织细胞凋亡情况,DHE染色检测脊髓组织中活性氧水平。结果与结论:(1)与正常组、假手术组比较,模型组大鼠BBB评分降低(P <0.05),脊髓神经元皱缩畸形,呈空泡样改变;与模型组比较,葛根汤低、中、高剂量组大鼠BBB评分升高(P <0.05),且脊髓神经元损伤明显改善;(2)与正常组、假手术组比较,模型组脊髓组织中Iba-1和诱导型一氧化氮合酶蛋白表达升高(P <0.05),白细胞介素6和白细胞介素1β mRNA表达升高(P <0.05);与模型组比较,葛根汤低、中、高剂量组脊髓组织中Iba-1、诱导型一氧化氮合酶、p-NF-κB、NLRP3、ASC和cleaved Caspase-1蛋白表达以及白细胞介素6和白细胞介素1βmRNA表达降低(P <0.05);(3)与正常组、假手术组比较,模型组脊髓组织中TUNEL阳性细胞率以及Bax、Cleaved Caspase-3蛋白表达升高(P <0.05),而Bcl-2蛋白表达降低(P <0.05);与模型组比较,葛根汤低、中、高剂量组上述指标显著改善;(4)与正常组、假手术组比较,模型组大鼠脊髓组织中活性氧水平以及NOX4和p-Drp1蛋白表达升高(P <0.05),Mfn2蛋白表达降低(P <0.05);与模型组比较,葛根汤低、中、高剂量组脊髓组织中活性氧水平以及NOX4和p-Drp1蛋白表达降低(P <0.05),Mfn2蛋白表达升高(P <0.05)。结果表明,葛根汤能抑制脊髓型颈椎病模型大鼠的神经炎症反应和神经元细胞凋亡,其作用机制可能与调节NOX4/活性氧/DRP1信号通路有关。

关键词：葛根汤脊髓型颈椎病脊髓组织小胶质细胞细胞凋亡炎症 NOX4 活性氧 Drp1 工程化组织构建

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贲门癌组织Ras相关区域家族1A基因启动子区甲基化检测

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郑州大学学报（医学版） 2007年第3期42卷 407-408页

作者：邵珊王立东李苹娟吴会芳宋昕焦新英李吉林樊慧申秋张彦霞范宗民李琮宇高珊珊郭花芹尹艳春吴爱群邢国兰河南省食管癌重点开放实验室郑州大学基础医学院郑州450052 林州市姚村食管癌医院病理科林州456592

目的探讨贲门腺癌(GCA)发生中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区异常甲基化的作用。方法采用甲基化特异性PCR法检测81例贲门腺癌及其中20例癌旁正常组织RASSF1A基因启动子区甲基化变化特征,并分析RASSF1A基因启动子区甲基化与肿... 详细信息

目的探讨贲门腺癌(GCA)发生中Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区异常甲基化的作用。方法采用甲基化特异性PCR法检测81例贲门腺癌及其中20例癌旁正常组织RASSF1A基因启动子区甲基化变化特征,并分析RASSF1A基因启动子区甲基化与肿瘤大体分型、分化程度、淋巴结转移、TNM分期等临床病理特征的关系。结果GCA组织中RASSF1A基因甲基化阳性率(72%,58/81)显著高于癌旁正常组织(5%,1/20)(P病理特征无关。结论RASSF1A基因甲基化是GCA癌变过程中频发的分子事件,可能在GCA发生中起一定作用。

关键词：贲门肿瘤腺癌 Ras相关区域家族1A 甲基化

食管癌组织Ras相关区域家族1A基因启动子区甲基化检测

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郑州大学学报（医学版） 2007年第3期42卷 411-414页

作者：张彦霞王立东吴会芳邵珊范宗民李琮宇李苹娟何欣高珊珊焦新英李吉林宋昕郭涛申秋樊慧刘保池吴爱群河南省食管癌重点开放实验室郑州大学基础医学院郑州450052 林州市姚村食管癌医院病理科林州456592

目的检测食管癌和癌旁正常组织Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区甲基化变化。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测79例食管鳞癌患者癌组织及对应的20例癌旁正常组织RASSF1A基因启动子区甲基化,并观察食管癌组织RASSF1A基... 详细信息

目的检测食管癌和癌旁正常组织Ras相关区域家族1A(RASSF1A)基因启动子区甲基化变化。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测79例食管鳞癌患者癌组织及对应的20例癌旁正常组织RASSF1A基因启动子区甲基化,并观察食管癌组织RASSF1A基因启动子区甲基化与临床病理变化的关系。结果79例食管鳞癌组织RASSF1A基因启动子区甲基化阳性率(67%,53/79)明显高于癌旁正常组织(15%,3/20)。食管癌组织中不同年龄、分化程度的RASSF1A基因启动子区甲基化阳性率差异有统计学意义(P癌组织甲基化阳性率明显高于癌旁正常组织(50%(10/20)vs15%(3/20))(P食管鳞癌频发的分子事件。食管鳞癌组织RASSF1A基因甲基化明显高于癌旁正常组织,并且和年龄、分化程度有关。

关键词：食管肿瘤鳞状细胞癌 RASSF1A 甲基化

贲门癌家族史阳性患者比较基因组杂交变化特征

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第三军医大学学报 2009年第9期31卷 847-849页

作者：常志伟王立东秦艳茹李苹娟郭涛李吉林常志军范宗民何欣王苒宋昕河南省食管癌重点开放实验室郑州大学第一附属医院郑州大学基础医学院郑州450052 林州市姚村食管癌医院病理科河南林州456592 林州市中心医院胸外科河南林州450092

目的探讨河南食管贲门癌高发区贲门癌肿瘤家族史阳性/阴性患者基因组变化特征。方法应用比较基因组杂交技术分析14例贲门癌家族史阳性和28例贲门癌肿瘤家族史阴性患者染色体基因组变化。结果贲门癌家族史阳性患者DNA拷贝数扩增高于阴性(... 详细信息

目的探讨河南食管贲门癌高发区贲门癌肿瘤家族史阳性/阴性患者基因组变化特征。方法应用比较基因组杂交技术分析14例贲门癌家族史阳性和28例贲门癌肿瘤家族史阴性患者染色体基因组变化。结果贲门癌家族史阳性患者DNA拷贝数扩增高于阴性(>20%)者的染色体部位为20p(FH+50%与FH-21%),5p(FH+50%与FH-18%),6q(FH+43%与FH-18%),16q(FH+36%与FH-14%);贲门癌家族史阳性患者DNA拷贝数丢失高于阴性(>20%)者为4q(FH+43%与FH-14%)(P>0.05)。1q、3q、6q/p、7p、8q、13q/p、20q/p染色体部位DNA拷贝数扩增和1p、17q/p、19p染色体部位DNA拷贝数丢失在贲门癌家族史阳性和阴性患者中均超过20%(P>0.05)。结论20p、5p、6q、16q、4q、17q、18q、9p、22q可能存在与贲门癌遗传高易感性相关的关键基因;而1q/p、3q、6q/p、7p、8q、13q/p、20q/p、17q/p、19p可能存在与环境因素相关的贲门癌关键基因。

关键词：贲门癌比较基因组杂交遗传易感性家族史

坚持党的领导下的林州肿瘤防治模式的创建和推广

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中国肿瘤 2021年第7期30卷 481-486页

作者：刘志才河南省林州市肿瘤医院/食管癌防治研究所河南林州456550

文章回顾了60多年来在党的领导下,林州肿瘤防治工作逐步形成了"领导—专家—群众"相结合的模式,防治工作卓有成效。

关键词：肿瘤防治食管癌河南