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河北省2013-2022年百日咳流行特征及时空聚集性

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中华流行病学杂志 2024年第2期45卷 213-219页

作者：郑飞孙印旗张海霞张洪斌何宝花贾肇一李琦华北理工大学公共卫生学院唐山063210 河北省疾病预防控制中心河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室石家庄050021

目的分析2013-2022年河北省百日咳流行特征及时空聚集性,为完善百日咳防控措施提供参考依据。方法基于2013-2022年河北省报告的百日咳数据分析流行特征。应用ArcGIS 10.8软件进行空间自相关分析以及环形地图制作;运用SaTScan 10.1软件... 详细信息

目的分析2013-2022年河北省百日咳流行特征及时空聚集性,为完善百日咳防控措施提供参考依据。方法基于2013-2022年河北省报告的百日咳数据分析流行特征。应用ArcGIS 10.8软件进行空间自相关分析以及环形地图制作;运用SaTScan 10.1软件进行时空扫描分析。结果河北省2013-2022年累计报告百日咳6715例,无死亡病例,年均报告发病率为0.90/10万。2013-2019年发病率总体呈上升趋势,2020-2021年呈大幅下降趋势,但2022年呈骤增趋势。夏、秋两季为流行的高发季节,发病占比最高的年龄组为病率高于女性。空间自相关分析表明,百日咳的发病具有空间聚集性,并且高-高聚集区存在于报告发病率前3位的廊坊市、保定市和沧州市。低-低聚集区与本研究对应疾病低发地区的分布基本一致。时空扫描探测出5个差异有统计学意义的区域,并且有3个聚集区集中在2022年。结论河北省2013-2022年百日咳发病具有明显的人群、地区、季节差异,且存在明显的时空聚集性,须加强对重点区域的监测并采取针对性防治措施。

关键词：百日咳流行特征时空聚集性

我国布鲁氏菌病重点地区高风险职业人群个人防护用品使用及影响因素分析

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中华流行病学杂志 2024年第3期45卷 379-384页

作者：王哲林胜红刘新荣于爱枝木合塔·艾山杰恩斯·巴衣到列提李瑞卿梁新望侯碧桥王艺菲刘才兄张翠红王丽萍杭州市疾病预防控制中心传染病防制所杭州310021 微生物流行病研究所病原与生物安全国家重点实验室北京100071 大同市疾病预防控制中心大同037056 霍城县疾病预防控制中心伊犁835299 新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心乌鲁木齐830002 伊犁哈萨克自治州疾病预防控制中心伊犁835099 大同市阳高县疾病预防控制中心大同038199 大同市左云县疾病预防控制中心大同037599 大同市浑源县疾病预防控制中心大同037499 中国疾病预防控制中心传染病管理处/传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室北京102206

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调... 详细信息

目的了解我国布鲁氏菌病(布病)高风险职业人群个人防护行为现状,为评估我国布病防治计划实施效果提供科学依据。方法选择山西省和新疆维吾尔自治区的4个县,采用横断面调查方法,于2019年12月至2020年7月对布病高风险职业人群开展问卷调查。结果共调查高风险职业人群2384人,个人防护用品规范使用率为20.13%(480/2384),手套、口罩、胶鞋和工作服4种主要个人防护用品的使用率分别为38.26%(912/2384)、31.80%(758/2384)、32.01%(763/2384)和30.87%(736/2384)。不同年龄、职业、文化程度、地区的人群不同防护用品的使用率和规范使用率的差异有统计学意义(均P分析结果显示,职业和地区是布病个人防护用品规范使用的影响因素,牧民和兽医的个人防护用品规范使用率更高;阳高县和霍城县的高风险职业人群的个人防护用品规范使用率明显高于左云县和浑源县。结论我国布病重点地区高风险职业人群4种主要个人防护用品使用率均不高,规范使用率低,不同地区差异很大,与防治计划目标差距较大,亟需向高风险职业人群发放防护用品,并开展易于接受的个人防护使用的宣教活动,加强各地经验交流和沟通。

关键词：布鲁氏菌病高风险职业人群个人防护用品规范使用健康教育

江苏省2011-2021年病原学阳性肺结核时空分布特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第4期45卷 513-519页

作者：陈可虞浩竺丽梅刘巧王蓓东南大学公共卫生学院南京210009 江苏省疾病预防控制中心慢性传染病防治所南京210009

目的以县(市/区)为单位,分析2011-2021年江苏省病原学阳性肺结核时空分布特征,为江苏省肺结核防控策略的实施和调整提供科学依据。方法利用中国疾病预防控制信息系统中的结核病管理信息系统收集2011-2021年江苏省病原学阳性肺结核患者... 详细信息

目的以县(市/区)为单位,分析2011-2021年江苏省病原学阳性肺结核时空分布特征,为江苏省肺结核防控策略的实施和调整提供科学依据。方法利用中国疾病预防控制信息系统中的结核病管理信息系统收集2011-2021年江苏省病原学阳性肺结核患者登记数据。各县(市/区)常住人口数据来自于各设区(市)各年份江苏省统计年鉴。通过Geoda 1.18.0软件进行全局、局部空间自相关分析,探索其空间聚集性。采用SaTScan 10.1软件进行时空扫描统计分析探讨时空聚集性,利用ArcGIS 10.7软件进行可视化作图。结果2011-2021年江苏省共登记病原学阳性肺结核病例128240人,年均登记率为13.99/10万,2017年后登记率整体呈上升趋势(趋势χ^(2)=63.49,P病原学阳性率整体呈上升趋势(趋势χ^(2)=3710.86,P分析结果显示,江苏省病原学阳性肺结核登记率各年均存在“高-高”聚集区,呈动态分布,多分布在江苏省中部及南部地区,其中2015年最多(7个),2011年最少(1个)。时空扫描分析共探索到4个时空聚集区域(均P省中、北部区域;三级聚集区覆盖26个县(市/区),四级聚集区为南京市高淳区,聚集时间为2017-2021年。结论江苏省2011-2021年病原学阳性肺结核登记率在县(市/区)水平整体存在明显时空聚集特征,聚集区域不仅包含经济相对落后的苏北地区,也包含经济发展较好的苏南地区,应根据不同地区具体情况,多措并举,采取针对性肺结核防控措施。

关键词：病原学阳性结核,肺时空分布

2017-2022年河南省漯河市急性呼吸道感染病例中鼻病毒感染状况及其分子分型研究

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中华预防医学杂志 2024年第4期58卷 466-473页

作者：王雅各夏百成谢智博徐瑾张瑶张智博孙馨王浩然王慧玲孔振宋金华张一丁张燕安徽理工大学医学院淮南232001 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所郑州450016 漯河市疾病预防控制中心卫生检测检验科漯河462000 漯河市中心医院心血管病研究所漯河462000 漯河市中心医院疾病预防控制科漯河462000

目的:了解河南省漯河市2017-2022年急性呼吸道感染(ARIs)病例中鼻病毒(RV)的感染状况及其分子型别组成。方法:于2017年10月至2022年6月,收集河南省漯河市中心医院2 270例ARIs病例的临床和流行病学资料,并采集病例咽拭子标本,采用实时荧... 详细信息

目的:了解河南省漯河市2017-2022年急性呼吸道感染(ARIs)病例中鼻病毒(RV)的感染状况及其分子型别组成。方法:于2017年10月至2022年6月,收集河南省漯河市中心医院2 270例ARIs病例的临床和流行病学资料,并采集病例咽拭子标本,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)筛选RV阳性标本,随后对阳性标本使用巢式逆转录聚合酶链式反应(nested RT-PCR)扩增VP1区全长,并使用MEGA软件结合国际病毒分类委员会推荐的169条RV参考株序列构建系统进化树以确定RV分型。结果:2 270例ARIs病例中,男性病例1 283例(56.52%);年龄 M( Q_(1), Q_(3))为3(1,6)岁,5岁以下人群占68.59%(1 557/2 270);137例病例(6.04%)检出RV,其中68例病例(49.64%)与其他病毒合并检出,与肠道病毒的合并检出最常见,占14.60%(20/137)。0~4岁、5~14岁、15~59岁和≥60岁年龄组中RV检出率分别为6.42%(100/1 557)、4.69%(21/448)、3.80%(6/158)和9.35%(10/107),差异无统计学意义( χ^(2)=5.310, P=0.150)。新型冠状病毒感染疫情前(2017-2019年)和期间(2020-2022年),RV总体检出率差异无统计学意义( χ^(2)=1.823, P=0.177)。共获得109条VP1序列,包含62个型别,其中RV-A、RV-B和RV-C三个种分别检出42、3和17个型别。结论:RV为2017-2022年河南省漯河市ARIs病例中主要流行的病原体之一,存在多个RV型别共流行,无明显优势型别。

关键词：呼吸道感染鼻病毒分子分型

上海市普陀区病原学阳性敏感肺结核患者家庭内密切接触者结核感染筛查情况及发病影响因素分析

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中国防痨杂志 2024年第1期46卷 54-61页

作者：孙嘉轩刘艳梁鹏飞郑亦慧胡屹陈静徐飚复旦大学公共卫生学院流行病学教研室上海200032 上海市普陀区疾病预防控制中心慢性传染病预防控制科上海200333 上海市疾病预防控制中心结核病与艾滋病防治所上海200336

目的:分析上海市普陀区病原学阳性敏感肺结核患者家庭内密切接触者结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)发病情况及其影响因素。方法:采用前瞻性研究方法,以2018—2021年上海市普陀区确诊的病原学阳性敏感肺结核... 详细信息

目的:分析上海市普陀区病原学阳性敏感肺结核患者家庭内密切接触者结核分枝杆菌潜伏感染(latent tuberculosis infection,LTBI)发病情况及其影响因素。方法:采用前瞻性研究方法,以2018—2021年上海市普陀区确诊的病原学阳性敏感肺结核患者及其家庭内密切接触者为研究对象,采用γ-干扰素释放试验对密切接触者开展结核感染筛查,并在首次调查后的3、6、12个月内向密切接触者提供自愿的LTBI检测,计算LTBI累计感染率;采用二分类logistic回归方法分析指示病例特征对家庭内密切接触者发生LTBI的影响,并通过结核病登记报告系统随访识别密切接触者中活动性肺结核发病情况,计算其近期(截至2022年12月31日)的人年发病密度。结果:2018—2021年共纳入确诊肺结核患者168例,识别家庭内密切接触者284名,首次筛查LTBI感染率为26.8%(76/284),一年内累计感染率为34.5%(98/284)。多因素分析结果显示,在第2个月末痰检结果仍为阳性的指示病例是家庭内密切接触者发生LTBI的危险因素(OR=7.167,95%CI:2.399~26.587,P=0.001)。284名家庭内密切接触者共观察了720.17人年,5例新发现肺结核患者近期发病密度为6.94/1000人年(5/720.17人年),LTBI阳性肺结核近期发病密度[15.76/1000人年(4/253.83人年)]与LTBI阴性肺结核[2.14/1000人年(1/466.34人年)]差异无统计学意义(χ^(2)=2.607,P=0.106)。结论:结核病患者家庭内密切接触者结核病感染风险高,尤其是第2个月末痰检结果仍为阳性的指示病例家庭内密切接触者发生LTBI的风险更高,应加强涂阳结核病患者的及时诊断和有效治疗,有效预防结核病在家庭内密切接触者中的传播。

关键词：结核,肺潜伏性结核病家庭接触者追踪多相筛查流行病学研究

2019-2020年海南省登革病毒E基因序列分析

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中国病原生物学杂志 2024年第4期19卷 389-394页

作者：王如敏杜珊珊陈菁菁李丹丹马焱崔蕾孙初阳李建东任莉娜海南省疾病预防控制中心微生物检验室海南海口570203 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室卫生部医学病毒和病毒病重点实验室

目的了解2019-2020年海南省登革病毒(Dengue virus,DENV)E基因序列分子特征,探讨病毒可能的输入来源。方法收集登革热疑似病例血清样本,采用RT-PCR法进行核酸检测并分型,阳性样本进行登革病毒包膜(envelope,E)蛋白基因扩增及测序,应用... 详细信息

目的了解2019-2020年海南省登革病毒(Dengue virus,DENV)E基因序列分子特征,探讨病毒可能的输入来源。方法收集登革热疑似病例血清样本,采用RT-PCR法进行核酸检测并分型,阳性样本进行登革病毒包膜(envelope,E)蛋白基因扩增及测序,应用生物信息软件进行同源性和系统进化分析。结果从49例DENV阳性样本中获得14条DENV E基因序列。进化分析显示,11条DENV1型E基因序列间核苷酸同源性为97.2%~100.0.0%,均属于基因Ⅰ型,其中2条E基因序列(HNLS-8和HNCM-14)与2019年广州流行株(Guangzhou/19XN24503/2019)的核苷酸同源性为100.0%;2条DENV2型E基因序列分别属于Asian 1基因型和Cosmopolitan基因型,其中1条(HNLS-10)与2019-2020年广州流行株(Guangzhou/19XN22111/2019、Guangzhou/19XN50506/2020)同源性为99.6%,另1条(HNLD-2)与2019年昆明2株流行株(Kunming/HNQY20180091/2019、Kunming/HNQY2018005/2019)核苷酸同源性为100.0%。1条DENV3型E基因序列属于基因Ⅲ型,与2018年广州流行株(Guangzhou/18XN61927/2018)和2017年新加坡流行株(Singapore/15095Y15/2017)同源性较高,分别为99.6%和99.5%。结论2019-2020年,海南省检出输入引发的本地传播DENV1、DENV2和DENV3多型病毒,以DENV1为主,显示了加强流动人群中登革热监测与管理,及时防控登革热跨省、跨境传播的重要性。

关键词：登革病毒包膜蛋白基因基因型同源性

河北省一起新冠病毒感染疫情病毒全基因组特征及溯源分析

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中国国境卫生检疫杂志 2024年第2期47卷 179-182页

作者：李岩刘世友苏通姜彩肖耿明浩刘兰芬韩旭李琦韩光跃河北省疾病预防控制中心河北省传染病病原鉴定分析与流行病学重点实验室河北石家庄050021

目的分析河北省本土新冠病毒感染(COVID-19)疫情病例新冠病毒(SARS-CoV-2)全基因组特征,结合流行病学开展溯源调查,为疫情的精准防控提供技术支撑。方法对河北省2021年10-11月发生的一起本土疫情的部分COVID-19确诊病例,采集咽拭子标本... 详细信息

目的分析河北省本土新冠病毒感染(COVID-19)疫情病例新冠病毒(SARS-CoV-2)全基因组特征,结合流行病学开展溯源调查,为疫情的精准防控提供技术支撑。方法对河北省2021年10-11月发生的一起本土疫情的部分COVID-19确诊病例,采集咽拭子标本,利用高通量测序技术开展病毒全基因组测序,分析病毒核苷酸和氨基酸序列变异特征。结果共获得本起疫情相关的68条高质量病毒全基因组序列,均为Delta变异株AY.126进化分支。经比对,首发病例与同期内蒙古额济纳旗疫情病毒序列高度同源,仅有两个碱基存在差异,68条序列与武汉参考株(NC_045512)相比,核苷酸突变总数有44~48个,核苷酸突变类型以T转换为主;在S蛋白上发现D614G、L452R、T478K、P681R等10个氨基酸变异及2个氨基酸缺失。结论对疫情早期病例、关键病例开展SARS-CoV-2全基因组测序,能指明流行病学调查方向,跟踪病毒基因变异特征,为疫情防控提供有力技术支撑。

关键词：新冠病毒全基因组测序溯源变异特征

引起2017年兰州市一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的CV-A2的基因特征分析

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病毒学报 2024年第3期40卷 574-579页

作者：陈建华于德山武海卓赵哲赵晓虹张勇张晓曙甘肃省疾病预防控制中心甘肃省传染病病原学重点实验室兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法... 详细信息

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定。根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序,获取全基因组序列。使用MEGA软件(版本号11.0)进行病毒的核苷酸,氨基酸相似性分析,VP1区的氨基酸突变位点分析,并构建系统发育树,使用Simplot(版本号3.5.1)软件进行病毒重组分析。本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型(Coxsackievirus A 2, CV-A2),分子分型显示属于D基因型,且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸(A102G)的突变,与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同。重组分析发现,病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件。本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组,需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究,以提升预警能力。

关键词：疱疹性咽峡炎柯萨奇病毒A2型基因组特征性突变重组变异分子流行病学

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卢龙县5岁以下婴幼儿病毒性腹泻病原学分析

医学动物防制 2024年第3期40卷 234-239页

作者：闫晓凤于秋丽刘莹莹谢赟赵文娜邸学渊郝玉军河北省卢龙县疾病预防控制中心河北秦皇岛066400 河北省疾病预防控制中心

目的了解河北省卢龙县5岁以下儿童病毒性腹泻的病原组成及变化趋势,为婴幼儿病毒性腹泻防治提供科学依据。方法收集卢龙县某医院和某妇幼保健院2016年1月1日-2021年12月31日共832份5岁以下住院患儿粪便标本,并填写流行病学个案调查表... 详细信息

目的了解河北省卢龙县5岁以下儿童病毒性腹泻的病原组成及变化趋势,为婴幼儿病毒性腹泻防治提供科学依据。方法收集卢龙县某医院和某妇幼保健院2016年1月1日-2021年12月31日共832份5岁以下住院患儿粪便标本,并填写流行病学个案调查表。轮状病毒(Rotavirus, RV)抗原及其阳性标本G/P进一步分型检测分别用酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay, ELISA)和逆转录聚合酶链式反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)。人类杯状病毒(Human calicivirus, HuC V)、肠道腺病毒(Enteric adenovirus, EAdV)、星状病毒(Astrovirus,AstV)用RT-PCR或实时荧光定量PCR方法检测,诺如病毒(Norovirus, NV)阳性样本经RT-PCR扩增后测序分型。结果 832份标本共检出4种病毒576份,总阳性检出率为69.23%, RV、 HuC V、 EAdV和AstV检出率分别为38.22%、 31.01%、 6.01%和5.17%,单一病原体感染检出率为58.41%,混合感染检出率为10.82%,其中2种病毒合并感染的样本87份, 3种病毒合并感染的样本3份。不同性别间各病毒及混合感染阳性检出率差异无统计学意义(χ^(2)_(RV)=0.811,PRV=0.368;χ^(2)_(HuCV)=0.286,PHuCV=0.593;χ^(2)_(EAdV)=0.156,PEAdV=0.693;χ^(2)AstV=0.035,PAstV=0.852;χ混合感染2=0.617,P混合感染=0.432)。RV和HuC V以18~病毒性腹泻在1~3月和11、 12月为高发季, RV在2月阳性检出率最高(59.51%), HuC V在11月阳性检出率最高(62.90%), HuC V和EAdV性腹泻全年均有发病。RV中G9P[8]型占90.25%, HuC V中GⅡ型占67.05%。结论卢龙县5岁以下婴幼儿病毒性腹泻病原以RV和HuC V为主,HuC V阳性检出率增幅较大。RV以G9P[8]型、 HuC V以GⅡ型为主要流行株。

关键词：卢龙县婴幼儿病毒性腹泻病原分析