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2020-2023年大连地区诺如病毒胃肠炎疫情分子流行特征分析

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病毒学报 2024年第4期 857-861页

作者：王越郎兴莹于蕾薄志坚栾明春大连市疾病预防控制中心微生物检验科

本研究分析了2020-2023年大连市16起急性胃肠炎疫情中诺如病毒的基因型特征。收集2020-2023年大连市16起急性胃肠炎病例的粪便标本154份。采用实时荧光定量反转录PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ分型，并对阳性样本进行RNA依赖的RNA聚合酶... 详细信息

本研究分析了2020-2023年大连市16起急性胃肠炎疫情中诺如病毒的基因型特征。收集2020-2023年大连市16起急性胃肠炎病例的粪便标本154份。采用实时荧光定量反转录PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ分型，并对阳性样本进行RNA依赖的RNA聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分序列进行RT-PCR扩增和测序，通过诺如病毒在线分型工具和人类杯状病毒分型工具进行比对确定诺如病毒分型，利用MEGA软件构建系统进化树。结果显示全部154份样品中，检测诺如病毒阳性106份，其中诺如病毒GⅠ组检出率3.77%(4/106),GⅡ组检出率96.23%(102/106)。16起疫情中15起由GⅡ型引起，1起由GⅠ型引起，无GⅠGⅡ混合感染，疫情以GⅡ型为主。2020/2021流行季和2022/2023流行季的主要流行株是GⅡ.2[P16]，并且该基因型在不同年份变异不大。2021/2022流行季存在多种型别共存，无优势流行株。2020-2023年大连市诺如病毒胃肠炎疫情主要发生在11月至次年4月，场所主要是幼儿园和中小学。

关键词：诺如病毒基因分型分子进化

昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 241-248页

作者：刘艳艳古文鹏段忠文王钰龚娇茶琦雁吴林蔚侯敏昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022 昆明市呈贡区疾病预防控制中心检验科昆明650500 玉溪市疾病预防控制中心卫生监测检验科玉溪678400

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 详细信息

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。

关键词：人腺病毒3型五邻体基座蛋白六邻体蛋白纤维蛋白遗传进化

腹泻患者粪便分离出厄班纳沙门菌ST512型1例

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中华检验医学杂志 2024年第6期47卷 698-700页

作者：曹健刘玥王熙庄海武肖建伟许学斌上海市杨浦区疾病预防控制中心微生物检验科上海200090 上海市疾病预防控制中心病原生物检定所上海200336

患者男,19岁,2023年9月因连续腹泻3 d就诊上海市杨浦区某社区医院,发病前1天夜晚有烧烤店就餐史,病例符合腹泻病监测定义、采集患者粪便拭子运送公共卫生实验室分离病原为“非A~F群沙门菌”,菌株经参比实验室血清分型、耐药表型、全基... 详细信息

患者男,19岁,2023年9月因连续腹泻3 d就诊上海市杨浦区某社区医院,发病前1天夜晚有烧烤店就餐史,病例符合腹泻病监测定义、采集患者粪便拭子运送公共卫生实验室分离病原为“非A~F群沙门菌”,菌株经参比实验室血清分型、耐药表型、全基因组测序和中国沙门菌区域血清型数据库比对鉴定为厄班纳沙门菌ST512型。患者口服左氧氟沙星3 d后康复。

关键词：腹泻沙门菌属工血清分型基因组

数字化服务提高预防接种管理水平的思考与建议

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中华预防医学杂志 2024年第2期58卷 159-165页

作者：栾琳刘娜郑本锋张琢玉宋祎凡李力甘明曹雷黄卓英叶家楷张肇南刘晓雪陈俊磊王长双蔡碧余文周苏州市疾病预防控制中心免疫规划科苏州215004 南京医科大学公共卫生学院南京211112 中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 广西壮族自治区疾病预防控制中心免疫规划所南宁530028 上海市疾病预防控制中心免疫规划所上海200336 山东省济南市疾病预防控制中心免疫预防所济南250021 福建省疾病预防控制中心免疫规划所福州350012 河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所郑州450016 湖北省疾病预防控制中心传防所免疫预防部武汉430079

随着信息技术发展和人民群众预防接种服务需求的提高,通过数字化提高预防接种服务质量已是必然趋势。本文从明确预防接种数字化服务概念入手,介绍当前国内外发展现况,分析先行地区现有模式的优势及存在的不足,借鉴总结并提出针对性解决... 详细信息

随着信息技术发展和人民群众预防接种服务需求的提高,通过数字化提高预防接种服务质量已是必然趋势。本文从明确预防接种数字化服务概念入手,介绍当前国内外发展现况,分析先行地区现有模式的优势及存在的不足,借鉴总结并提出针对性解决建议,指出应建立数据互通共享的部门协调机制、制定数据标准及功能性规范、完善免疫规划信息系统功能、加强数据收集与分析利用、强化预约管理和科普教育,为后期全国各地预防接种数字化服务的建设提供专家指引。

关键词：免疫规划数字化预防接种服务

医疗机构卫生人员结核分枝杆菌感染的危险因素研究

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中华劳动卫生职业病杂志 2024年第2期42卷 96-101页

作者：何琳戚巍唐诗邈曹宏伟蒋轶文辽宁省疾病预防控制中心结核病预防控制所沈阳110000

目的了解结核病定点医疗机构卫生人员结核分枝杆菌的感染状况,探讨引发感染的风险因素。方法 2021年9月至2022年6月通过整群分层抽样的方法对4家结核病定点医疗机构相关科室的卫生人员进行问卷调查,内容包含医疗机构院内感染控制措施的... 详细信息

目的了解结核病定点医疗机构卫生人员结核分枝杆菌的感染状况,探讨引发感染的风险因素。方法 2021年9月至2022年6月通过整群分层抽样的方法对4家结核病定点医疗机构相关科室的卫生人员进行问卷调查,内容包含医疗机构院内感染控制措施的实施、医务人员结核分枝杆菌职业暴露情况,同时行外周血γ-干扰素释放试验(interferon gamma release assays,IGRAs)和肺部影像学检查,判定结核分枝杆菌感染情况。将单因素分析有统计学意义的因素纳入多因素logistic回归,分析结核分枝杆菌感染的风险因素。结果共有657人完成肺部影像学检查和调查问卷,其中654人行外周血IGRAs检测,结核病潜伏感染率为39.45%(258/654)。单因素分析显示,基本情况方面年龄、性别、婚姻状况、经济收入、职业类别、职称等级、工龄等变量卫生人员结核病潜伏感染情况差异均有统计学意义(P控制工作的管理,开展定期筛查,提升卫生人员的自我防护意识,降低卫生人员的结核分枝杆菌暴露及感染风险。

关键词：职业暴露结核病卫生人员潜伏性感染潜伏性结核病感染控制

2019—2022年河南省肾综合征出血热宿主动物监测情况分析

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中华预防医学杂志 2024年第1期58卷 18-24页

作者：李东晓范威朱琳胡晓李懿马红霞王海峰叶莹苏佳黄学勇河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所郑州450016

目的分析2019—2022年河南省肾综合征出血热(HFRS)宿主动物分布及携带汉坦病毒(HV)情况。方法在河南省HFRS监测点开展宿主动物监测,采用实时荧光定量PCR法检测鼠肺HV,分析河南省鼠类动物携带HV型别,对阳性样本进行测序,分析核苷酸序列... 详细信息

目的分析2019—2022年河南省肾综合征出血热(HFRS)宿主动物分布及携带汉坦病毒(HV)情况。方法在河南省HFRS监测点开展宿主动物监测,采用实时荧光定量PCR法检测鼠肺HV,分析河南省鼠类动物携带HV型别,对阳性样本进行测序,分析核苷酸序列的同源性及变异情况。结果2019—2022年共捕鼠1308只,16份鼠肺HV核酸阳性,鼠HV阳性率为1.22%(16/1308)。按种类,黑线姬鼠HV阳性率最高(68.75%,11/16)。按分布地,野外鼠HV阳性率最高(2.50%,12/480),居民区鼠HV阳性率为0.53%(4/759)。16份阳性样本分型结果显示,所携带的病毒均属于Ⅰ型汉滩病毒。阳性样本测序后获得8条S基因片段(OQ681444~OQ681451)和6条M基因片段(OQ681438~OQ681443);S和M基因片段与陕西84FLi株、四川SN7株相似性较高。S和M基因片段系统进化分析显示,均为汉滩病毒H5基因亚型。氨基酸序列分析显示,与汉滩病毒疫苗株84FLi相比,8条S片段编码氨基酸第74位由天冬酰胺替换为丝氨酸;XC2022047株在Gn区第14位由色氨酸替换为甘氨酸,XC2022022和XC2022024第359位由异亮氨酸替换为丙氨酸。结论2019—2022年河南省宿主动物携带HV属于Ⅰ型汉滩病毒,黑线姬鼠仍然是汉滩病毒的优势宿主。同疫苗株比较,S和M基因片段的免疫表位区均有氨基酸位点替换。

关键词：肾综合征出血热监测汉坦病毒黑线姬鼠汉滩病毒

甘肃省2012-2022年肾综合征出血热自然疫源地特征分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 117-122页

作者：魏孔福刘新凤苟发香王旭霞姜中毅李治平张晓曙甘肃省疾病预防控制中心传染病预防控制所兰州730000

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在... 详细信息

目的探讨甘肃省肾综合征出血热(HFRS)自然疫源地现状特征。方法收集2012-2022年甘肃省HFRS病例数据和啮齿类动物(鼠类)密度监测资料,应用流行病学方法分析调查疫源地特征。结果2012-2022年甘肃省共报告HFRS病例869例,死亡4例,年发病率在0.05/10万~1.21/10万之间,病例主要分布于甘肃省东部的平凉市、东南部的天水市、南部的甘南藏族自治州(甘南州),以及中部以南的定西市;20~60岁年龄组居多,男女性别比为1.85∶1(564∶305),职业以农民(61.80%,537/869)、牧民(19.79%,172/869)和学生(6.33%,55/869)为主。野鼠型发病以每年11月至次年1月为高峰。啮齿类宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,汉滩病毒携带率分别为2.79%(21/754)、0.42%(5/1179)和0.31%(2/643)。甘肃省目前确定了3个疫源地,其中2个分别是平凉市和甘南州的新发疫源地,另1个为定西市的老疫源地。结论甘肃省南部、中部以南和东部地区是目前主要的HFRS疫源地,宿主动物以褐家鼠、黑线姬鼠和小家鼠为主,病毒基因型为汉滩病毒。病例报告地区应加强疫情的监测,疫情重点地区应强化和落实各项预防和控制措施,以减少HFRS带来的危害。

关键词：肾综合征出血热疫源地特征

山东省居民急性心肌梗死发病流行特征及空间聚集性分析

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中华流行病学杂志 2024年第6期45卷 844-851页

作者：张丙银徐春晓陈先献唐俊利董静任杰鹿子龙郭晓雷马吉祥山东省疾病预防控制中心慢性非传染性疾病防制所济南250014 山东省疾病预防控制中心济南250014

目的了解山东省居民急性心肌梗死(AMI)发病特征和流行趋势,为制定防控策略提供科学依据。方法资料源自2012-2021年山东省慢性病监测信息管理系统上报的AMI发病数据。以粗发病率和标化发病率为指标描述AMI发病水平,采用Joinpoint回归分... 详细信息

目的了解山东省居民急性心肌梗死(AMI)发病特征和流行趋势,为制定防控策略提供科学依据。方法资料源自2012-2021年山东省慢性病监测信息管理系统上报的AMI发病数据。以粗发病率和标化发病率为指标描述AMI发病水平,采用Joinpoint回归分析发病率和发病年龄随年份的变化趋势。应用率的差别分解法评估人口老龄化对AMI发病率上升的贡献度。采用ArcGIS 10.8软件对山东省各区(县)发病率进行地图可视化展示,采用DeoDa 1.12软件进行全局和局部空间自相关分析。结果2012-2021年,山东省19个省级监测点共报告AMI发病198233人次,男性占53.13%,≥45岁人群占97.12%。报告粗发病率从2012年的90.12/10万上升至2021年的176.54/10万,年均上升7.01%(Z=7.35,P省西北地区的聊城市、德州市以及西南地区菏泽市。结论山东省居民AMI发病率呈上升趋势,且具有空间聚集性和季节聚集性,≥45岁、男性和农村居民是发病高危人群,男性发病呈一定的年轻化趋势。应针对高发季节、高危人群和山东省西北地区高发聚集区域采取重点防控措施。

关键词：急性心肌梗死发病率流行趋势空间分布

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苏州市沙门氏菌血清型、耐药及分子分型分析

微生物学通报 2024年

作者：王小龙邹文燕朱莉勤张梦寒沈强苏州市疾病预防控制中心病原微生物与生物检验科

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST... 详细信息

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST分型采用全基因组测序，测序结果与PubMLST数据库进行比对得出菌株的ST型别。【结果】176株沙门氏菌共鉴定出了42种血清型分属于9个血清群。血清型以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis，26.70%）和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium，18.75%），为优势血清型。176株菌对氨苄西林的耐药率最高(60.23%)，其次是链霉素(47.16%)。所有菌株均对头孢他啶/阿维巴坦、美罗培南、厄他培南和阿米卡星敏感。多重耐药率达到57.39%，多重耐药模式达到51种，其中包含青霉素类+β-内酰胺/β-内酰胺抑制剂复合物+头孢类的多重耐药模式有18种。176株菌共检出43种ST型别，检出率前三的ST型别分别为ST11、ST34和ST19，检出率分别为27.27%、10.80%和7.95%。【结论】苏州市沙门氏菌的血清型和ST型别种类多，血清型以肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌为优势型别，ST型以ST11为优势型别。多重耐药现象严重，应加强监测。

关键词：沙门氏菌血清型耐药 ST型别