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FTA-环介导等温扩增技术直接提取变异链球菌DNA的效果评价

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中国组织工程研究 2025年第5期29卷 1043-1049页

作者：王玥晖尚进杨晨符冬格曹灿张晓东王敬夫北部战区总医院口腔科辽宁省沈阳市110016 空军军医大学第三附属医院颌面外科陕西省西安市710004

背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备... 详细信息

背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备含有ATCC标准菌株变异链球菌的菌悬液,接种于脑心浸出液培养基,充分混匀后按10倍梯度稀释成7种浓度(4.2×10^(7),4.2×10^(6),4.2×10^(5),4.2×10^(4),4.2×10^(3),4.2×10^(2),4.2×10 CFU/mL),每个稀释级做2个平行对照,并增加无菌水作为空白对照;②分别采用FTA卡、常规煮沸法、试剂盒提取及裂解液提取4种方法直接提取菌株DNA,通过LAMP技术进行扩增,并进行特异性试验,比较4种提取方法的差异。结果与结论:①4种方法提取的DNA均满足LAMP扩增的要求;②特异性试验结果显示,只有变异链球菌才可特异扩增出靶基因;③裂解液提取法最低检测限为4.2×10^(3) CFU/mL,FTA卡提取法最低检测限为4.2×10^(4) CFU/mL,试剂盒提取法和常规煮沸法最低检测限分别为4.2×10^(6) CFU/mL和4.2×10^(7) CFU/mL;④4种提取方法其他方面的比较显示,试剂盒提取法的实验成本、步骤数和时间都是最高;其他3种方法步骤数一致,其中FTA卡所需仪器设备最少,常规煮沸法单次成本最低,裂解液提取法所需时间最少;FTA卡和裂解液提取法仅需少量菌即可提取成功,后者在时间方面优于FTA卡,但相较于FTA卡其单次成本高,所需设备多;⑤结果说明,该研究建立的FTA-LAMP技术具有操作简便、特异性强、灵敏度高、结果可视化等优势,有望为高效提取检测变异链球菌提供新途径。

关键词：变异链球菌环介导等温扩增 FTA卡 DNA 可视化

针刀治疗膝骨关节炎大鼠的转录组测序及实验验证

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中国组织工程研究 2025年第20期29卷 4239-4248页

作者：刘彦彤王世轩赵双利魏巍王东海姜宗坤刘洪飞辽宁中医药大学辽宁省沈阳市110032 辽宁中医药大学附属第二医院骨伤一科辽宁省沈阳市110034 辽宁中医药大学附属第二医院骨伤四科辽宁省沈阳市110034 辽宁中医药大学附属第二医院骨伤二科辽宁省沈阳市110034

背景:针刀治疗膝骨关节炎临床疗效确切,但针刀干预膝骨关节炎在转录组水平上的调节机制仍未明确。目的:通过针刀干预骨关节炎大鼠,对软骨样本进行转录组测序和生物信息学分析并加以验证,揭示针刀干预骨关节炎大鼠的作用机制。方法:采用... 详细信息

背景:针刀治疗膝骨关节炎临床疗效确切,但针刀干预膝骨关节炎在转录组水平上的调节机制仍未明确。目的:通过针刀干预骨关节炎大鼠,对软骨样本进行转录组测序和生物信息学分析并加以验证,揭示针刀干预骨关节炎大鼠的作用机制。方法:采用随机数字表法将48只SD大鼠随机分为针刀组、模型组和假手术组,每组16只。针刀组、模型组采用内侧半月板失稳术建立骨关节炎模型,造模6周后针刀组大鼠每周进行1次针刀治疗,共治疗4周。治疗4周后,对各组大鼠膝关节进行Micro CT扫描,对关节软骨进行苏木精-伊红染色、番红O-固绿染色及Mankin评分,采用Elisa法检测血清炎症因子水平,对软骨样本进行转录组测序,采用R软件进行差异基因生物信息学分析,采用蛋白互作网络和Cytoscape软件筛选核心靶点并进行RT-qPCR验证。结果与结论:①相较于假手术组,模型组大鼠关节软骨表面粗糙不平、关节间隙狭窄,关节表层结构破坏,Mankin评分升高,血清白细胞介素6、肿瘤坏死因子α、基质金属蛋白酶13水平显著上升(P科全书分析涉及蛋白分解代谢、自噬、丝裂原活化蛋白激酶、核因子kB及Wnt信号通路等,蛋白互作网络及Cytoscape筛选出共济失调毛细血管扩张突变、类Myb SWIRM和MPN结构域蛋白1、热休克蛋白90α1、NIPBL粘连蛋白负载因子4个关键基因。③模型组大鼠关节软骨中共济失调毛细血管扩张突变、类Myb SWIRM和MPN结构域蛋白1、热休克蛋白90α1、NIPBL粘连蛋白负载因子mRNA表达均低于假手术组(P<0.05),针刀组大鼠关节软骨中共济失调毛细血管扩张突变、类Myb SWIRM和MPN结构域蛋白1、热休克蛋白90α1、NIPBL粘连蛋白负载因子mRNA表达均高于模型组(P<0.05)。④针刀干预可能作用于丝裂原活化蛋白激酶、核因子kB及Wnt等信号通路来促进软骨修复,并与共济失调毛细血管扩张突变、类Myb SWIRM和MPN结构域蛋白1、热休克蛋白90α1、NIPBL粘连蛋白负载因子基因的表达密切相关。

关键词：膝骨关节炎针刀骨关节炎模型内侧半月板韧带失稳术转录组测序差异基因动物实验实验验证工程化组织构建

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单细胞转录组测序技术在骨质疏松症研究中的应用与进展

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中国组织工程研究 2025年第13期29卷 2812-2821页

作者：孙成涛孙广江戚晓楠程茗姚啸生辽宁中医药大学辽宁省沈阳市110847 辽宁中医药大学附属第二医院骨伤一科辽宁省沈阳市110034 辽宁中医药大学附属医院骨伤一科辽宁省沈阳市110032 中国医科大学沈阳市第四人民医院辽宁省沈阳市110031

背景:骨质疏松导致的脆性骨折发病率逐年上升,亟需探索其病理生理、潜在生物标志物、治疗靶点及有效药物。骨微环境中存在多种细胞,对骨代谢的维持至关重要。近几年,单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术被开发用于表征单个细胞的转录组,并逐... 详细信息

背景:骨质疏松导致的脆性骨折发病率逐年上升,亟需探索其病理生理、潜在生物标志物、治疗靶点及有效药物。骨微环境中存在多种细胞,对骨代谢的维持至关重要。近几年,单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术被开发用于表征单个细胞的转录组,并逐步应用到骨质疏松症防治的研究。目的:综述单细胞转录组测序技术在骨质疏松症研究中的应用与进展。方法:由第一作者使用计算机检索Web of Science,PubMed和中国知网数据库中2009-2023年出版的文献,英文检索词为:“single-cell RNA sequencing,bone marrow derived stromal cells,osteoblasts,osteocytes,osteoclasts,immune cells,Bone marrow vascular endothelial cells”;中文检索词为:“单细胞转录组测序,骨髓间充质干细胞,成骨细胞,骨细胞,破骨细胞,免疫细胞,骨髓血管内皮细胞”;通过阅读筛选相关文献,最终纳入89篇文献进行综述分析。结果与结论:①单细胞转录组测序技术能够深入了解细胞发育、增殖、分化的轨迹及其调控机制。②影响骨密度的候选基因主要富集在骨髓间充质干细胞亚群,其中Sox9是关键的转录因子。③成骨细胞不同亚群中差异表达Runx2控制骨髓间充质干细胞向成骨细胞方向分化。④破骨细胞分化过程中RAB38与组蛋白修饰和转录调控动态变化有关。⑤单细胞层面研究证实,骨微环境中存在多种细胞间通讯,破骨细胞可能通过CD160-TNFRSF14配体-受体结合进行细胞间通讯;中性粒/单核细胞与成骨细胞间可能通过RESISTIN通路进行交互;浆样树突状细胞与成骨细胞系通过表皮生长因子通路进行交流;均可以为靶点预测和药物研发提供方向。⑥新的骨髓毛细血管内皮细胞亚群,称为S型内皮细胞,完全起源于骨骺次级骨化中心,甚至比H型血管更具有可塑性。⑦文章从细胞角度总结单细胞转录组测序技术在表征不同骨组织细胞的分化命运和分化轨迹、识别新的细胞亚群、鉴定细胞调控因子及明确细胞间通讯的研究进展,为探讨骨质疏松症的病理机制、筛选潜在诊断标志物、预测治疗靶点及探究药物作用机制提供细胞层面的信息。⑧未来单细胞测序技术将向单细胞多组学(基因组、蛋白组学及代谢组学)方向及结合其他诸如空间转录组技术为骨组织细胞变化提供更有价值的信息。

关键词：单细胞转录组测序骨质疏松骨代谢骨髓间充质干细胞骨细胞破骨细胞骨免疫学骨髓血管内皮细胞

基于机器学习算法构建浸润性肺腺癌预后预测模型

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中国胸心血管外科临床杂志 2025年第1期 80-86页

作者：崔严奇杨鲸蓉倪琳连铎煌叶仕新廖毅张锦灿曾志勇福建医科大学福总临床医学院联勤保障部队第九〇〇医院心胸外科联勤保障部队第九〇〇医院普外科

目的确定肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）预后生物学标志物，并据此建立LUAD预后的预测模型。方法从UCSC数据库获取癌症基因组图谱（TCGA）LUAD基因表达量和临床病理数据，把纳入的数据进行综合生物信息学分析，包括差异表达基因... 详细信息

目的确定肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）预后生物学标志物，并据此建立LUAD预后的预测模型。方法从UCSC数据库获取癌症基因组图谱（TCGA）LUAD基因表达量和临床病理数据，把纳入的数据进行综合生物信息学分析，包括差异表达基因（differentially expressed genes,DEGs）筛选、基因本体（GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析和基因集富集分析（GSEA）。采用Cox分析和最小绝对值收缩和选择算子（least absolute shrinkage and selection operator,LASSO）回归分析构建基因组的风险评估预测模型，并采用列线图预测患者1年、2年、3年、5年和10年生存率。绘制Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线和时间依赖性ROC曲线评价模型的预测能力。在验证组中校验模型。结果浸润性LUAD患者不同级别病理亚型间DEGs富集分析结果显示，280个DEGs主要参与细胞色素P450相关物质代谢、自然杀伤细胞介导的免疫反应、抗原的呈递和酶活性调节等生物学过程，与肿瘤的发生、发展密切相关。构建5个基因（MELTF、MAGEA1、FGF19、DKK4、C14ORF105）组成的风险预测模型，Cox分析和LASSO回归显示，模型的ROC曲线下面积（area under the curve,AUC）值为0.675，时间依赖性ROC曲线1年、3年、5年AUC值分别为0.893、0.713、0.632，表明该预测风险模型具有良好的敏感性和特异性。在验证组中，校准曲线和一致性指数（C指数）也表明构建的列线图预测性能较好。结论 5个基因组成的预测模型可作为LUAD患者生存率实用和可靠的预测工具，这可能有助于制定个体化治疗的临床决策，为患者预后预测提供一种新方法。

关键词：浸润性肺腺癌机器学习生物标志物风险评估模型列线图

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重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的危险因素分析及列线图风险模型构建

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实用临床医药杂志 2025年第01期 94-97+117页

作者：赖燕玲蔡冬梅卓晶晶李浩李文辉中国人民解放军联勤保障部队第九一〇医院神经外科厦门大学附属翔安医院器官移植科厦门大学附属翔安医院健康管理中心

目的探讨重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的危险因素，并构建列线图预测模型。方法选取360例重型颅脑损伤患者作为研究对象，并根据术后继发性脑积水发生情况分为脑积水组(n=34)和非脑积水组(n=326)。采用Logistic回归分析法筛选术... 详细信息

目的探讨重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的危险因素，并构建列线图预测模型。方法选取360例重型颅脑损伤患者作为研究对象，并根据术后继发性脑积水发生情况分为脑积水组(n=34)和非脑积水组(n=326)。采用Logistic回归分析法筛选术后继发性脑积水的危险因素。基于筛选出的危险因素构建重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的列线图模型，并验证其预测效能。结果 360例患者中，术后发生继发性脑积水34例，继发性脑积水发生率为9.44%(34/360)。Logistic回归分析结果显示，颅内感染、脑室出血、中线移位程度≥12 mm、术前格拉斯哥昏迷评分法(GCS)评分3～5分、去骨瓣减压、硬膜敞开是重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的独立危险因素(P<0.05)。基于上述危险因素构建的列线图模型的模型一致性指数为0.874,曲线下面积为0.831。结论本研究基于颅内感染、脑室出血、中线移位程度、术前GCS评分、去骨瓣减压及硬膜敞开因素构建的列线图模型，能够有效预测重型颅脑损伤患者术后继发性脑积水的风险，对早期防治具有临床指导意义。

关键词：重型颅脑损伤脑积水危险因素列线图颅内感染

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向“脑的十年”奋进!再作大贡献!

中风与神经疾病杂志 1995年第2期 3-4页

作者：姬子卿沈阳军区总医院神经科 110015

本文是本刊副主编、原辽宁省医学会神经病学会副主任委员、原沈阳军区总医院姬子卿主任医师在第四届东北三省神经病学术交流会(1994年)上的发言,对发展神经病学提出了十分中肯的意见,希望神经病学的同道们努力提高临床工作质量、重视基... 详细信息

本文是本刊副主编、原辽宁省医学会神经病学会副主任委员、原沈阳军区总医院姬子卿主任医师在第四届东北三省神经病学术交流会(1994年)上的发言,对发展神经病学提出了十分中肯的意见,希望神经病学的同道们努力提高临床工作质量、重视基础研究、争取尸检、加快信息交流、作好防病工作、加强协作。姬子卿同志年迈体衰,肠癌术后5年,仅一眼有残余视力,仍孜孜不倦努力学习,关心神经病学的发展,值得学习。现将全文发表,以餮读者。

关键词：神经病学神经科病理信息交流质量临床医学姬子尸检率