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单细胞多组学技术和应用

海军军医大学学报 2024年第2期45卷 161-167页

作者：张静江燕訾晓渊江苏省单细胞测序工程技术研究中心南京市高通量单细胞测序工程技术研究中心南京210016

单细胞多组学技术是指结合多种不同的生物学技术,对单个细胞进行多方面的分析和研究,从而获得更全面、更准确的单细胞数据。该技术包括单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、单细胞表观组学等。单细胞多组学技术的发展为... 详细信息

单细胞多组学技术是指结合多种不同的生物学技术,对单个细胞进行多方面的分析和研究,从而获得更全面、更准确的单细胞数据。该技术包括单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、单细胞表观组学等。单细胞多组学技术的发展为我们提供了一种更加精确理解生物体内复杂的细胞类型和功能的方式,尤其是对于异质性细胞群体中少数的特殊细胞类型如干细胞或罕见癌细胞,具有非常重要的应用价值。通过融合不同技术获得的信息,单细胞多组学可以更准确地描述单个细胞在多个生命事件和过程中的状态与变化,为生命科学的研究提供更加全面和深入的视角。本文系统概述了目前代表性单细胞多组学技术的发展现状,总结了其在生物学研究中的重要应用和巨大潜力。

关键词：单细胞测序单细胞多组学基因组学转录组学蛋白质组学表观组学异质性

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刑事诉讼程序的必要迟延

暨南学报(哲学社会科学版) 2024年第5期 57-69页

作者：程绍燕北京市应用法学研究中心

诉讼进程的“妥速”包括了快速审判和必要迟延两个方面，然而理论界和实务界都对快速审判给予了高度关注，却忽视了必要迟延的价值。必要迟延来源于公正审判，并可进一步细分为权力推进型、权利保障型、合意型三类。我国刑事诉讼法中的... 详细信息

诉讼进程的“妥速”包括了快速审判和必要迟延两个方面，然而理论界和实务界都对快速审判给予了高度关注，却忽视了必要迟延的价值。必要迟延来源于公正审判，并可进一步细分为权力推进型、权利保障型、合意型三类。我国刑事诉讼法中的必要迟延存在着权力主导型迟延必要性不足、缺乏迟延的权利保障意识、合意型迟延的价值未被充分挖掘等问题。相应地，应从规制、确权、扩容三个方面进行制度完善，包括修改完善非必要迟延条文、规定明确的迟延条件和迟延时间、赋予当事人申请复议复核的救济权利，重建正当事由型迟延制度、明确规定最短诉讼期间、建立必要迟延权利实现的保障制度，扩大附条件不起诉的适用范围、增加暂缓判决制度。

关键词：必要迟延必要迟延权权力主导型权利保障型合意型

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肌肉骨骼减少症发病机制及其运动防治效果

生物化学与生物物理进展 2024年第5期51卷 1105-1118页

作者：靳丹代新宇刘淼衣雪洁高海宁沈阳体育学院运动健康学院沈阳110102 沈阳体育学院运动与健康研究中心沈阳110102

肌肉骨骼减少症(osteosarcopenia,OS)是一种多因素、多病因的退行性代谢综合征,其影响因素可能与衰老导致的机械、遗传、炎症因子、内分泌紊乱以及生活方式不规律相关。OS患者具有更高跌倒、骨折、活动障碍和死亡的风险,随着中国全球老... 详细信息

肌肉骨骼减少症(osteosarcopenia,OS)是一种多因素、多病因的退行性代谢综合征,其影响因素可能与衰老导致的机械、遗传、炎症因子、内分泌紊乱以及生活方式不规律相关。OS患者具有更高跌倒、骨折、活动障碍和死亡的风险,随着中国全球老龄化进程的加快,OS已经成为不容忽视的公共健康问题。近年来,国内外学者针对OS开展了大量的研究,但其发病机制仍不清楚。了解与OS相关的信号通路对进一步研究其发病机制和寻找治疗的新靶点具有重要意义。而运动作为现有效果强、持续性好的非药物治疗方式,能够增加老年人肌肉质量、提高骨密度、改善生活质量等,从而有效地预防和改善OS。本文主要就OS的流行病学、诊断标准、共同参与调节肌细胞与骨骼细胞代谢过程的相关信号通路(PI3K/Akt通路、Wnt/β-catenin通路、Notch通路、NF-κB通路),以及不同运动方式对OS的干预效果等方面进行综述,以期为临床治疗OS提供理论依据,提高老年疾病的预防能力。

关键词：肌少症骨质疏松症肌肉骨骼减少症信号通路运动防治

枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序及其抑菌物质预测分析

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食品科学 2024年第2期45卷 57-63页

作者：纪帅奇乌日娜张淘崴娄梦雪丁瑞雪马颖武俊瑞沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁省食品发酵技术工程研究中心辽宁沈阳110866 沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室辽宁沈阳110866

为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能注释及... 详细信息

为了详细解析枯草芽孢杆菌SNBS-3的基因组特征,本研究在前期研究基础上,采用Illumina二代测序技术和第三代高通量Pacbio测序平台,对从传统豆酱中筛选得到的枯草芽孢杆菌SNBS-3进行全基因组测序,获得菌株基因组特征信息、基因功能注释及分类、系统发育进化和次级代谢产物等关键信息。结果表明:SNBS-3的基因组为一条环状闭合DNA,大小为4076387 bp,共有4000个蛋白质编码基因,在直系同源集、基因本体论、京都基因与基因组百科全书、碳水化合物活性酶、抗生素耐药性数据库和致病毒力因子数据库分别注释到3209、2824、2560、147、12个和4个功能基因。应用在线软件AntiSMASH和Bagel4发现其除具有合成Surfactin、Mycosubtilin、Plipastatin、Bacilysin和Bacillaene等多种抑菌物质的相关基因外,还具有一条完整的细菌素Subtilosin A合成基因簇,结合抑菌实验和蛋白酶K实验结果推测枯草芽孢杆菌SNBS-3具有合成细菌素SubtilosinA的能力。综上,枯草芽孢杆菌SNBS-3全基因组测序结果表明其本身可产生多种抑菌物质,是1株具有生防潜力的微生物,相关分析结果可为包括细菌素SubtilosinA在内的多种抑菌物质的进一步开发应用提供理论基础。

关键词：枯草芽孢杆菌全基因组细菌素合成基因簇

番茄SlNRT2基因家族鉴定、启动子克隆及表达分析

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植物生理学报 2024年第1期60卷 97-107页

作者：李文静张新业张智研冯恰刘薇李红敬张艳霞赵金萍王聪艳赵楠楠朱姝廊坊师范学院生命科学学院河北廊坊065000 廊坊市细胞工程与应用研究重点实验室河北廊坊065000

硝酸盐转运蛋白2(Nitrate transporter 2,NRT2),是一种高亲和硝酸盐转运蛋白,在植物对硝酸盐的吸收和转运过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法对番茄(Solanum lycopersicum)NRT2(SlNRT2)家族基因进行鉴定,利用热图分析SlNRT2... 详细信息

硝酸盐转运蛋白2(Nitrate transporter 2,NRT2),是一种高亲和硝酸盐转运蛋白,在植物对硝酸盐的吸收和转运过程中发挥重要作用。本研究通过生物信息学方法对番茄(Solanum lycopersicum)NRT2(SlNRT2)家族基因进行鉴定,利用热图分析SlNRT2家族成员基因表达模式,并利用启动子嵌合GUS报告基因转化拟南芥对SlNRT2启动子活性进行分析。结果表明番茄基因组中鉴定到5个NRT2基因,定位于细胞膜,氨基酸序列长度介于458~531 aa,等电点介于9.05~9.33,不稳定性指数介于31.84~40.70。基因结构分析表明,该基因家族由3~4个外显子构成。染色体定位分析显示,SlNRT2基因分布于3条染色体上。系统进化和保守结构域分析显示,SlNRT2分别归属于I和II两个类群,具有10种保守基序,蛋白保守性很高。番茄不同组织热图分析表明SlNRT2.1和SlNRT2.2呈组成型表达;SlNRT2.3~SlNRT2.5主要在根部表达。启动子顺式作用元件及GUS组织化学染色分析结果表明,SlNRT2.4启动子驱动GUS基因在拟南芥根部特异性表达,而SlNRT2.3和SlNRT2.5除驱动GUS基因在拟南芥根部表达,叶片也有表达。本研究为后续开展SlNRT2基因的功能研究提供依据,同时为培育氮素高效利用型转基因番茄奠定了基础。

关键词：番茄硝酸盐转运蛋白基因家族启动子 GUS组织化学染色

滁州市一次持续性臭氧污染过程气象与传输特征分析

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中国环境监测 2024年第1期40卷 107-117页

作者：王雷周颖龚年祖池州学院地理与规划学院自然资源遥感应用研究中心安徽池州247000 滁州市气象局安徽滁州239000

2019年6月8日至17日,安徽省滁州市发生一次持续性臭氧(O_(3))污染过程,O_(3)浓度值超过国家二级标准浓度限值3%~45%。基于滁州市老年大学监测站点空气质量数据、滁州市气象站及全球资料同化系统(GDAS)气象数据,运用HYSPLIT后向轨迹模型... 详细信息

2019年6月8日至17日,安徽省滁州市发生一次持续性臭氧(O_(3))污染过程,O_(3)浓度值超过国家二级标准浓度限值3%~45%。基于滁州市老年大学监测站点空气质量数据、滁州市气象站及全球资料同化系统(GDAS)气象数据,运用HYSPLIT后向轨迹模型、潜在源贡献因子(PSCF)和浓度权重轨迹(CWT)分析方法,研究污染发生时段的气象和区域传输特征。结果表明:①在此次O_(3)污染过程中,日最高温度的变化范围为25.5~34.7℃,风速整体小于4 m/s,风向以偏东风为主,午后的相对湿度在40%左右。在该时段内,滁州市基本处于均压场的控制之中,且受到锋面气旋外围下沉气流的影响,大气层结稳定。②O_(3)污染发生期间,滁州市主要受东南方向气流的影响,但来自山东省、安徽省北部和江苏省北部的气流的影响也不容忽视。6月9日夜间至10日上午的O_(3)浓度异常高值,与9日下午的气压异常低值及9日夜间的大气边界层高度异常高值密切相关。上述气压及大气边界层高度异常值的出现使得上风向高浓度O3被输送至滁州。③此次污染过程的潜在贡献源区主要分布于安徽省东南部、江苏省中西部和浙江省北部等地。上述区域的加权潜在源贡献因子(WPSCF)值大于0.4,加权浓度权重轨迹(WCWT)值超过了100μg/m^(3)。今后,滁州市在O3污染防控工作中应加强与上述区域的联防联控。

关键词：臭氧气象污染输送潜在贡献源区滁州

豆酱源枯草芽孢杆菌S1-2产细菌素分离鉴定及其稳定性研究

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食品工业科技 2024年第8期45卷 158-164页

作者：张淘崴乌日娜纪帅奇娄梦雪马颖武俊瑞沈阳农业大学食品学院辽宁沈阳110866 辽宁省食品发酵技术工程研究中心辽宁沈阳110161 沈阳市微生物发酵技术创新重点实验室辽宁沈阳110866

本研究首先从东北传统豆酱中分离筛选出一株具有良好抑菌作用的菌株,结合16S rDNA与持家基因gyrA测序分析等方法对菌株鉴定。其次,利用乙酸乙酯萃取法对其所产细菌素进行粗提,使用葡聚糖凝胶Sephadex-G50和高效液相色谱(HPLC)技术进一... 详细信息

本研究首先从东北传统豆酱中分离筛选出一株具有良好抑菌作用的菌株,结合16S rDNA与持家基因gyrA测序分析等方法对菌株鉴定。其次,利用乙酸乙酯萃取法对其所产细菌素进行粗提,使用葡聚糖凝胶Sephadex-G50和高效液相色谱(HPLC)技术进一步纯化,结合SDS-PAGE和液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术进行鉴定。最后通过最小浓度实验与生长抑制曲线分析了细菌素对金黄色葡萄球菌的抑制效果,并探究了细菌素对热、酸碱和蛋白酶的稳定性。结果表明,枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)菌株S1-2对金黄色葡萄球菌和单增李斯特氏菌抑菌效果最好,该菌株产生的细菌素经分离纯化鉴定为subtilosin A,分子量约为3 kDa,对金黄色葡萄球菌和单增李斯特氏菌有明显的抑制效果,对金黄色葡萄球菌的最小抑制浓度为0.625 mg/mL。该细菌素在20~80℃抑菌活性稳定,且在100~120℃仍表现出抑菌活性;对酸碱耐受性较高,经过pH为1、10的强酸强碱处理后仍表现出抑菌活性,在pH6.0~8.0的范围内表现出最高的抑菌活性;能够被蛋白酶K、胃蛋白酶、胰蛋白酶水解。综上,枯草芽孢杆菌S1-2与其产生的细菌素subtilosin A在食品生物防腐中具有较强的研究和应用潜力。

关键词：枯草芽孢杆菌细菌素分离纯化抑菌

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脉冲电磁场在骨科相关疾病中的应用

中国组织工程研究 2024年第12期28卷 1944-1949页

作者：梁海瑞蔡振存张赫段思宇陈北北沈阳医学院附属中心医院辽宁省沈阳市110000

背景:脉冲电磁场是一种无创、无辐射的治疗方法,临床利用脉冲电磁场治疗骨科疾病已经取得了一定的疗效。目的:综述脉冲电磁场参与治疗骨科疾病的临床应用现状,为骨科疾病的临床治疗提供科学的理论依据。方法:由第一作者运用计算机检索Pu... 详细信息

背景:脉冲电磁场是一种无创、无辐射的治疗方法,临床利用脉冲电磁场治疗骨科疾病已经取得了一定的疗效。目的:综述脉冲电磁场参与治疗骨科疾病的临床应用现状,为骨科疾病的临床治疗提供科学的理论依据。方法:由第一作者运用计算机检索PubMed、中国生物医学文献服务系统(CBM)、Cochrane Library、中国期刊全文数据库(CNKI)以及万方数据资源系统中脉冲电磁场治疗骨科疾病的相关研究,以“脉冲电磁场,骨科,骨关节炎,骨质疏松,骨愈合,电磁导航”为中文检索词,以“pulsed electromagnetic field,orthopedics,osteoarthritis,osteoporosis,bone healing,electromagnetic navigation”为英文检索词,同内容相关文献则选择近期发表文献,从检索结果中选择了69篇文献进行综述。结果与结论:脉冲电磁场对骨折愈合疗效确切,通过抑菌、杀菌、抗炎及促进骨愈合等途径治疗骨髓炎,可抑制骨质疏松及其进展,又通过多种途径治疗早期骨关节炎、股骨头坏死及晚期关节置换术后康复。但脉冲电磁场治疗多种骨科疾病的机制仍不明确,多数研究仍处于初级阶段,今后依然需要从高质量的研究和临床试验中获得更可靠的证据,为骨科疾病的临床治疗提供更完善的依据。

关键词：脉冲电磁场骨关节炎骨质疏松骨愈合电磁导航骨科内植物

维生素C在老年肌少症中的作用机制及防治潜力

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中国组织工程研究 2024年第27期28卷 4405-4412页

作者：刘旭陈博宁可陈晓虹沈阳体育学院辽宁省沈阳市110102 辽宁省金秋医院辽宁省沈阳市110016

背景:维生素C作为人体所必需的营养物质,具有广泛的生物学效应并存在多种与肌少症发病机制相关的生物学功能,研究维生素C的补充应用有望成为肌少症的一种新型防治措施。目的:综述近年来有关维生素C在肌少症发病机制和治疗中应用的最新... 详细信息

背景:维生素C作为人体所必需的营养物质,具有广泛的生物学效应并存在多种与肌少症发病机制相关的生物学功能,研究维生素C的补充应用有望成为肌少症的一种新型防治措施。目的:综述近年来有关维生素C在肌少症发病机制和治疗中应用的最新研究进展,并基于已发表的证据探讨维生素C在肌少症预防和治疗中的潜在作用及可能的机制途径。方法:由第一作者应用计算机在PubMed、Web of Science和中国知网数据库检索涉及维生素C在肌少症中的相关文献。英文检索词:“vitamin C,ascorbic acid,L-ascorbic acid,ascorbate,antioxidants,oxidative stress,sarcopenia,muscular atrophy,muscle weakness,muscle development,skeletal muscle regenerate,muscles,skeletal muscle”;中文检索词:“维生素C,抗坏血酸,L-抗坏血酸,抗坏血酸盐,抗氧化剂,氧化应激,肌少症,肌肉萎缩,肌肉无力,肌肉发育,骨骼肌再生,肌肉,骨骼肌”。检索时限为各数据库建库至2023年7月,经过筛选后纳入85篇文献进行综述分析。结果与结论:①保证充足的膳食维生素C摄入或维持血液循环中正常的维生素C水平将有助于减少与年龄相关的肌肉损失,降低肌少症的患病率,此外,补充维生素C对于改善骨骼肌肌肉质量、力量和躯体功能也有一定作用,并可能在肌少症患者的运动策略中发挥协同效应。②维生素C对肌少症的作用可能经由以下生物学机制:维生素C主要通过抑制骨骼肌氧化应激和炎症反应来限制泛素-蛋白酶体途径的激活,从而积极调控蛋白质代谢稳态,并可通过其抗氧化作用增强线粒体抗氧化防御能力,维持线粒体的健康功能。另外,维生素C可以影响肌细胞增殖、分化和肌管大小,主要通过增加生肌调节因子的表达和激活蛋白质合成信号通路来实现,这有助于促进肌肉发育以及修复和再生受损的肌肉组织。③对于维生素C干预肌少症所发挥的积极作用尚需开展大样本及对一些重要影响因素进行优化设计的研究,如补充剂量和补充时间的选择、维生素C联合运动干预时的运动处方设计以及对个体的氧化还原状态评估等,建议未来的研究应以维生素C状态不佳的老年肌少症患者(研究对象,探讨长期补充1000 mg/d维生素C(6个月或更长时间)与至少两种以上多类型综合运动的联合干预效果,补充时间选择在运动结束后的1 h进行,并对运动期间产生的氧化损伤标志物如丙二醛或蛋白质羟基水平进行监测。总之,对于肌少症老年人最佳的维生素C补充剂量和时间选择还需更多探讨,同时合适的运动处方设计(特别是运动类型和强度)亦需要进一步研究确定。

关键词：维生素C 抗坏血酸肌少症肌肉萎缩肌肉发育骨骼肌再生氧化应激营养疗法