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肺栓塞患者DNA甲基化联合基因表达差异分析

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中华急诊医学杂志 2024年第2期33卷 242-247页

作者：曹嘉芮李伟曹国磊何丽丽牛海文李晓晗罗琴新疆医科大学附属肿瘤医院重症医学科乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院日间病房二病区乌鲁木齐830011 新疆医科大学附属肿瘤医院呼吸神经内科乌鲁木齐830011 惠州市第六人民医院消化内科惠州516200

目的通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象,利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和... 详细信息

目的通过整合生物信息学分析筛选与肺栓塞相关的遗传和表观遗传表达差异。方法以2019年就诊与新疆医科大学第三附属医院肺栓塞患者及健康体检者4例作为研究对象,利用高通量测序技术及甲基化芯片技术检测、筛选并整合外周血差异基因组和表观基因组数据来识别致肺栓塞发病的甲基化驱动基因及差异表达基因,行GO及KEGG富集分析。结果将肺栓塞组和健康对照组间DNA甲基化和基因表达数据进行共表达分析,基因上游区域差异甲基化与基因表达呈负相关,其中共筛选出基因上游区域显著甲基化基因有8个,采用独立样本的T检验及Pearson相关性分析,肺栓塞组中TSS1500显著甲基化基因有6个,分别为TSPO2、C1QA、AQP1、TNFSF9、MIA、STAB1,对应基因的差异表达倍数log2FC分别是1.298,1.629,1.024,2.746,2.539,1.060,基因表达与基因甲基化之间的相关度分别是-0.908,-0.900,-0.824,-0.784,-0.783,-0.779,两组间甲基化差异分别是-0.049,-0.053,-0.048,-0.057,-0.050,-0.053(P免疫反应、激活蛋白级联等得到显著富集。在KEGG信号通路中,免疫系统、细菌感染以及信号分子及相互作用方面得到显著富集,从而调控肺栓塞的发生。结论基于DNA甲基化和基因表达的联合分析,发现了肺栓塞发生发展的新思路,后续可进行更加深入的研究。

关键词：肺栓塞 DNA甲基化基因表达联合分析

中国HIV-1临床分离株感染性假病毒的构建及其中和特征分析

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病毒学报 2024年第3期40卷 508-518页

作者：冯家敏郭慧敏刘聪聪程林汪海燕孙丽琴鞠斌张政西南医科大学附属医院普通外科肝胆胰外科泸州646000 深圳市第三人民医院肝病研究所深圳518112 深圳市第三人民医院感染与免疫科深圳518112

本研究从中国人类免疫缺陷病毒1型(Human immunodeficiency virus-1, HIV-1)感染者血浆样本中分离和构建HIV-1 Envelope(Env)感染性假病毒,并分析其对单克隆广谱中和抗体的敏感性。采用逆转录和巢式PCR方法从感染者样本中扩增HIV-1 env... 详细信息

本研究从中国人类免疫缺陷病毒1型(Human immunodeficiency virus-1, HIV-1)感染者血浆样本中分离和构建HIV-1 Envelope(Env)感染性假病毒,并分析其对单克隆广谱中和抗体的敏感性。采用逆转录和巢式PCR方法从感染者样本中扩增HIV-1 env基因,利用同源重组方法将env基因克隆至真核表达载体pVAX1中,包装HIV-1Env假病毒后使用TZM-bl/假病毒中和实验方法检测单克隆广谱中和抗体的中和能力,基于已有抗体的结构数据分析病毒逃逸中和抗体的关键突变位点。本研究从两个HIV-1感染者donor A和donor B中分别获得了8株和3株携带CRF07_BC亚型env基因的感染性假病毒;序列分析显示两组假病毒Env氨基酸同源性仅为83.2%~85.2%,存在一定的差异;11株假病毒对于VRC01和10E8中和抗体依旧敏感,而对于35O22和VRC34.01耐受;donor B来源的假病毒存在N133D和R170E突变而可能影响了PG16抗体的中和能力,donor A来源的假病毒可能由于携带了S291F和E336K突变而逃逸了VRC-PG05抗体,donorA来源的假病毒还可能通过G324E突变进一步影响PGT121中和抗体的活性。本研究成功获得了11株中国HIV-1 CRF07_BC亚型的Env假病毒,评估了临床分离株病毒对已有中和抗体的敏感性,揭示了病毒逃逸中和抗体的关键突变位点,为中国HIV-1感染者应用单克隆中和抗体治疗提供了选择依据,同时也丰富了HIV-1假病毒与中和抗体领域的研究。

关键词：人类免疫缺陷病毒1型假病毒单克隆广谱中和抗体中和活性突变逃逸

睡眠集束化干预模式在提高ICU机械通气患者睡眠质量中的作用

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海军医学杂志 2024年第3期45卷 306-310页

作者：凌莉张林丽龚凌雁上海大学附属南通医院(南通市第六人民医院)重症医学科江苏南通226001

目的分析睡眠集束化(SLEEP⁃MAD)干预模式在提高重症监护病房(ICU)机械通气患者睡眠质量中的作用。方法选择2020年1月至2022年12月南通市第六人民医院ICU收治的100例机械通气患者作为研究对象,随机将其均分为对照组、观察组,每组各50例... 详细信息

目的分析睡眠集束化(SLEEP⁃MAD)干预模式在提高重症监护病房(ICU)机械通气患者睡眠质量中的作用。方法选择2020年1月至2022年12月南通市第六人民医院ICU收治的100例机械通气患者作为研究对象,随机将其均分为对照组、观察组,每组各50例。对照组给予常规ICU护理,观察组给予SLEEP⁃MAD干预护理。对比分析2组患者ICU环境压力源量表(ICUESS)评分、免疫功能相关指标水平及理查兹⁃坎贝尔睡眠量表(RCSQ)评分。结果护理前,ICUESS评分、免疫功能相关指标水平、RCSQ评分组间比较差异无统计学意义(P>0.05);护理后,2组患者ICUESS评分均降低且观察组低于对照组,免疫功能相关指标水平、RCSQ评分均升高且观察组高于对照组(P免疫功能,有利于提高患者预后水平。

关键词： SLEEP⁃MAD干预模式重症监护病房机械通气睡眠质量

结核特异性QFT⁃TB在结核患者不同类型标本中的检测价值

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实用医学杂志 2024年第7期40卷 1002-1005页

作者：陈骑张雅曦张明霞张洁云杨倩婷深圳市第三人民医院肝病研究所广东深圳518112

目的比较结核诊断实验室特异性细胞免疫IGRAs体外检测QuantiFERON-TB Gold(QFTTB)方法对肺结核、肺外结核和特殊人群样本的诊断效能,为临床诊疗提供依据。方法收集2023年1-7月实验室检查细菌学检测结核患者546例[痰涂片阳性(AFB+)146例... 详细信息

目的比较结核诊断实验室特异性细胞免疫IGRAs体外检测QuantiFERON-TB Gold(QFTTB)方法对肺结核、肺外结核和特殊人群样本的诊断效能,为临床诊疗提供依据。方法收集2023年1-7月实验室检查细菌学检测结核患者546例[痰涂片阳性(AFB+)146例,痰涂片阳性(AFB-)247例],分子生物学阳性结核患者117例(Xpert 69例,TB-DNA 48例),病理组织学阳性患者36例。肺外结核患者72例,特殊样本胸水276例,腹水25例。采用QFT-TB方法进行检测,利用χ^(2)检验进行组间比较,对比其阳性率和符合率的方法学评估。结果肺结核、肺外结核和结核密切接触者QFT-TB检测阳性率为83.69%、69.44%和32.41%。在AFB+、GeneXpert、TB-DNA和病理证实确诊为结核病患者QFT-TB方法的符合率为91.09%、88.40%、81.25%和72.22%。结核性胸膜炎患者胸水检测阳性率为60.50%、腹水阳性率为44.00%。结论QFT-TB检测在辅助诊断肺结核有较好价值,对于基于胸、腹水的检测用于肺外结核的诊断有一定的参考意义。

关键词：肺结核 IGRAs QuantiFERON-TB Gold GeneXpert

基于外周血可溶性T细胞免疫球蛋白黏蛋白3构建重症急性胰腺炎预测模型

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中华危重病急救医学 2024年第1期36卷 67-72页

作者：朱明慧王大明王文龙孟瑶林敏常州市第一人民医院急诊医学科江苏常州213000 常州市第二人民医院消化内科江苏常州213000

目的探讨基于可溶性T细胞免疫球蛋白黏蛋白3(sTIM3)构建的模型对急性胰腺炎(AP)患者进展为重症急性胰腺炎(SAP)的预测价值。方法采用回顾性队列研究方法,选择2020年6月1日至2022年6月30日常州市第一人民医院和常州市第二人民医院收治的A... 详细信息

目的探讨基于可溶性T细胞免疫球蛋白黏蛋白3(sTIM3)构建的模型对急性胰腺炎(AP)患者进展为重症急性胰腺炎(SAP)的预测价值。方法采用回顾性队列研究方法,选择2020年6月1日至2022年6月30日常州市第一人民医院和常州市第二人民医院收治的AP患者作为观察主体。根据AP患者住院期间病情进展情况,将轻症AP(MAP)及中度重症AP(MSAP)患者列为非SAP组,SAP患者列为SAP组。收集患者基本资料,入院48 h内血液生物学指标、外周血sTIM3水平、急性胰腺炎严重程度床旁指数(BISAP)评分、急性生理学与慢性健康状况评分Ⅱ(APACHEⅡ)、修正CT严重指数(MCTSI)评分,以及预后指标。采用多因素Logistic回归分析筛选AP患者住院期间进展为SAP的独立危险因素,并基于多因素分析结果及最小赤池信息标准(AIC)筛选出的最佳参数,构建基于sTIM3的SAP预测模型;绘制受试者工作特征曲线(ROC曲线),分析模型的预测效能。结果最终纳入99例AP患者,其中非SAP组80例,SAP组19例。与非SAP组比较,SAP组患者体质量指数(BMI)、饮酒史比例、心率(HR)、呼吸频率(RR)、白细胞计数(WBC)、红细胞计数(RBC)、C-反应蛋白(CRP)、丙氨酸转氨酶(ALT)、血肌酐(SCr)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)、sTIM3、BISAP评分、APACHEⅡ评分、MCTSI评分均明显升高,脉搏血氧饱和度(SpO_(2))、直接胆红素(DBil)、IL-10均明显下降;且SAP组患者重症监护病房(ICU)住院时间及总住院时间均较非SAP组明显延长〔ICU住院时间(d):1.0(0,1.5)比0(0,0),总住院时间(d):17.11±9.39比8.40±3.08,均P<0.01〕。多因素Logistic回归分析显示,HR〔优势比(OR)=1.059,95%可信区间(95%CI)为1.010~1.110,P=0.017〕、DBil(OR=0.981,95%CI为0.950~0.997,P=0.043)、sTIM3(OR=1.002,95%CI为1.001~1.003,P=0.027)是AP患者住院期间进展为SAP的独立危险因素;构建基于sTIM3的SAP预测模型:Logit(P)=-14.602+0.187×BMI+0.057×HR+0.006×CRP-0.020×DBil+0.002×sTIM3;ROC曲线分析显示,单因素定量指标中以IL-6预测AP患者住院期间进展为SAP的效能最佳,但基于sTIM3模型的预测效能明显优于IL-6〔ROC曲线下面积(AUC)及95%CI:0.957(0.913~1.000)比0.902(0.845~0.958),P<0.05〕。结论基于sTIM3构建的模型对于AP患者住院期间进展为SAP有较好的预测价值。

关键词：急性胰腺炎白细胞介素-6 预测模型可溶性T细胞免疫球蛋白黏蛋白3

HIV感染合并自身免疫性肝炎-原发性胆汁性胆管炎重叠综合征1例

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中国艾滋病性病 2024年第10期 1082-1084页

作者：李艳冯伟广郭付全刘慧敏孙秀娟淮安市第四人民医院感染科淮安市第四人民医院病理科

HIV/AIDS患者的肝功能异常可由多种因素引起[1-2]，包括HIV本身导致、合并病毒性肝炎、药物性肝损伤、非酒精性脂肪性肝病以及上述因素的综合作用等[3-4]。近年来我国自身免疫性肝病（autoimmune liver diseases,AILD）的病例报道越来... 详细信息

HIV/AIDS患者的肝功能异常可由多种因素引起[1-2]，包括HIV本身导致、合并病毒性肝炎、药物性肝损伤、非酒精性脂肪性肝病以及上述因素的综合作用等[3-4]。近年来我国自身免疫性肝病（autoimmune liver diseases,AILD）的病例报道越来越多，自身免疫性肝炎（autoimmune hepatitis,AIH）和原发性胆汁性胆管炎（primary biliary cholangitis,PBC，旧称原发性胆汁性肝硬化）是两个独立的AILD，若共存于同一患者，称为AIH-PBC重叠综合征（AIH-PBC overlap syndrome,AIH-PBC OS），本质是机体自身免疫反应介导的肝细胞和毛细胆管损伤[5]，鲜有报道为HIV/AIDS患者肝功能异常的病因。

关键词：艾滋病病毒感染自身免疫性肝炎原发性胆汁性胆管炎重叠综合征诊治

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细胞焦亡在肝脏疾病中的研究进展

中华肝脏病杂志 2024年第3期32卷 284-288页

作者：靳睿王晓晓刘峰饶慧瑛北京大学人民医院、北京大学肝病研究所、丙型肝炎和肝病免疫治疗北京市重点实验室、非酒精性脂肪性肝病诊断北京市国际科技合作基地北京100044

细胞焦亡是一种新发现的细胞死亡形式。由于与固有免疫相关,焦亡在宿主抵抗感染时细胞溶解和炎症细胞因子释放方面起着至关重要的作用。近年来研究表明,细胞焦亡在肝病疾病的发生发展过程中起着重要作用。本文在介绍细胞焦亡的形态特征... 详细信息

细胞焦亡是一种新发现的细胞死亡形式。由于与固有免疫相关,焦亡在宿主抵抗感染时细胞溶解和炎症细胞因子释放方面起着至关重要的作用。近年来研究表明,细胞焦亡在肝病疾病的发生发展过程中起着重要作用。本文在介绍细胞焦亡的形态特征、分子和病理生理机制的基础上,着重阐述其在肝脏疾病中的最新研究进展。

关键词：细胞焦亡非酒精性脂肪性肝病肝脏疾病

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乙型肝炎表面抗原泛素化修饰的研究进展

世界华人消化杂志 2024年第5期32卷 333-338页

作者：牛安行刘锦朱传武苏州市第五人民医院苏州大学附属传染病医院感染、肝病科江苏省苏州市215131

慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者体内存在的大量亚病毒颗粒可以诱导免疫耐受,导致乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的持续感染.患者要实现功能性治愈的目标,则需要获得血清乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen... 详细信息

慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者体内存在的大量亚病毒颗粒可以诱导免疫耐受,导致乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)的持续感染.患者要实现功能性治愈的目标,则需要获得血清乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)的消失,但目前临床上尚缺乏有效抑制HBV共价闭合环状DNA的有效药物,因此HBsAg很难被清除.蛋白质的泛素化修饰是HBsAg降解的一条潜在路径,这将有可能改变HBV的生存和免疫环境.本文重点对有关HBsAg的泛素化,包括类泛素化和去泛素化的研究进行综述,以期为CHB抗病毒治疗探索新的途径提供参考.

关键词：乙型肝炎表面抗原泛素化类泛素化去泛素化

GM试验联合血清白蛋白构建肺曲霉菌病预测诊断模型

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国际检验医学杂志 2024年

作者：翟云霞胥萍赵静薛婧郦芳华李晋苏州市第五人民医院检验中心苏州市第五人民医院肝病科

目的通过对肺曲霉菌病(PA)患者和其他肺部疾病患者的生化指标、营养状况和免疫水平进行评估,构建PA的预测模型,提高临床PA的诊断效能。方法回顾性分析2020年1月至2022年8月就诊于该院的40例PA患者和39例其他肺部疾病患者,分析血清1,3-... 详细信息

目的通过对肺曲霉菌病(PA)患者和其他肺部疾病患者的生化指标、营养状况和免疫水平进行评估,构建PA的预测模型,提高临床PA的诊断效能。方法回顾性分析2020年1月至2022年8月就诊于该院的40例PA患者和39例其他肺部疾病患者,分析血清1,3-β-D葡聚糖试验(G试验)和半乳甘露聚糖检测(GM试验)、生化指标、血常规指标和细胞亚群的表达趋势及组间差异,并采用受试者工作特征(ROC)曲线和二元Logistic回归方法联合临床检验指标构建PA预测诊断模型。结果在PA患者和其他肺部疾病患者组间比较发现,血清GM试验、G试验、白蛋白、血红蛋白、红细胞压积、淋巴细胞、B淋巴细胞、CD4+T淋巴细胞和CD4/CD8比值差异均有统计学意义(P<0.05)。PA组患者的肺泡灌洗液GM试验水平显著高于血清GM试验水平,差异有统计学意义(P<0.05)。经ROC曲线分析曲线下面积(AUC)发现,GM试验作为PA诊断独立预测因子具有很好的预测准确度(0.85

关键词：肺曲霉菌病 1,3-β-D葡聚糖试验半乳甘露聚糖检测白蛋白预测模型