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黄瓜叶片蛋白质双向电泳样品分级优化

西北植物学报 2011年第8期31卷 1706-1710页

作者：任丽萍范海延王珊珊郝宇涵宫玉洁朱延姝沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110866

以‘津研4号’苗期叶片为材料,采用聚乙二醇(PEG)分级沉淀法对黄瓜叶片蛋白质样品进行分级分离,将黄瓜叶片中存在的高丰度蛋白1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶特异性地集中于一个组分之中,以提高对黄瓜叶片蛋白质双向电泳中低丰度蛋白质... 详细信息

以‘津研4号’苗期叶片为材料,采用聚乙二醇(PEG)分级沉淀法对黄瓜叶片蛋白质样品进行分级分离,将黄瓜叶片中存在的高丰度蛋白1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶特异性地集中于一个组分之中,以提高对黄瓜叶片蛋白质双向电泳中低丰度蛋白质的检测率。结果表明:(1)分级后各组分和全蛋白在SDS-PAGE谱带中差异显著,全蛋白得到了有效的分离。(2)二维电泳图谱上点的分辨率有很大的提高,所有组分的点数是未分级前的3倍之多。(3)浓度为24%的PEG-4000富集高丰度蛋白Rubisco的效果最好。该方法可推广应用于黄瓜叶片蛋白质组分析的样品制备。

关键词：黄瓜叶片 1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶聚乙二醇双向电泳

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辽宁省八种兰科植物根内生真菌多样性

生态学杂志 2018年第10期37卷 3001-3009页

作者：蒋玉玲苗青陈旭辉曲波沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省全球变化与生物入侵重点实验室沈阳110161

兰科植物的生存强烈依赖菌根真菌,研究兰科菌根真菌对兰科植物的保护有重要作用。本研究以辽宁省的无柱兰(Amitostigma gracile)、二叶舌唇兰(Platanthera chlorantha)、小斑叶兰(Goodyera repens)、蜻蜓兰(Tulotis fuscescens)、山兰(O... 详细信息

兰科植物的生存强烈依赖菌根真菌,研究兰科菌根真菌对兰科植物的保护有重要作用。本研究以辽宁省的无柱兰(Amitostigma gracile)、二叶舌唇兰(Platanthera chlorantha)、小斑叶兰(Goodyera repens)、蜻蜓兰(Tulotis fuscescens)、山兰(Oreorchis patens)、羊耳蒜(Liparis japonica)、长苞头蕊兰(Cephalanthera longibracteata)和绶草(Spiranthes sinensis) 8种属于极小种群的野生兰科植物为例,利用第二代测序技术对其根内生真菌多样性进行了研究。结果表明:无柱兰、二叶舌唇兰、小斑叶兰和山兰都偏好与角担菌科(Ceratobasidiaceae)真菌共生,羊耳蒜偏好与胶膜菌科(Tulasnellaceae)真菌共生;长苞头蕊兰主要与革菌科(Thelephoraceae)和蜡壳耳科(Sebacinaceae)真菌共生;绶草不仅能与丝核菌属(Rhizoctonia)真菌共生,还能与蜡壳耳科真菌共生;同种兰科植物的不同植株在同一生境下所选择的菌根真菌有差异,而同一地点的不同兰科植物的菌根真菌群落各不相同。由此可见,兰科植物根中菌根真菌的组成并非完全受植物自身控制,但主要菌根真菌仍取决于兰科植物的选择;这8种兰科植物根中的真菌绝大多数为非菌根真菌,而菌根真菌的丰度通常很低,这可能是辽宁地区兰科植物稀少的原因之一。

关键词：兰科植物菌根真菌多样性 ITS

不同氮水平下瘤突苍耳、苍耳及其杂交种形态、光合及生长特征比较

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生物多样性 2018年第6期26卷 554-563页

作者：薛晨阳许玉凤曲波沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省全球变化与生物入侵重点实验室沈阳110161

入侵种与本地种杂交可能会改变其入侵性。为探讨入侵种与本地种杂交是否能促进植物入侵,我们通过盆栽实验比较了高、中和低3种氮水平下入侵植物瘤突苍耳(Xanthium strumarium)、本地近缘种苍耳(***)及两者杂交种(***♀×***♂)的形态、... 详细信息

入侵种与本地种杂交可能会改变其入侵性。为探讨入侵种与本地种杂交是否能促进植物入侵,我们通过盆栽实验比较了高、中和低3种氮水平下入侵植物瘤突苍耳(Xanthium strumarium)、本地近缘种苍耳(***)及两者杂交种(***♀×***♂)的形态、光合及生长特征的差异。结果表明,杂交种的总生物量在中氮和高氮水平下显著低于瘤突苍耳而高于苍耳。然而,杂交种的茎粗在低氮水平下显著高于两个亲本,叶绿素总含量和蒸腾速率在高氮水平下显著高于瘤突苍耳,相对生长速率在低氮和高氮水平下显著高于两个亲本。此外,在3种氮水平下瘤突苍耳的株高均显著小于苍耳,而杂交种的株高在中氮和高氮水平下均与苍耳无显著差异。这些特性有可能提高了杂交种对资源的捕获和利用能力,使其不仅能适应贫瘠的养分环境,还能在有利条件下扩大自身优势。杂交带来较高的生长速率可能与瘤突苍耳的入侵性相关。

关键词：瘤突苍耳苍耳入侵植物杂交

镉胁迫对瘤突苍耳、苍耳及其杂合体种子萌发与幼苗生长的影响

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生态学报 2020年第1期40卷 345-355页

作者：薛晨阳高英美曲波沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省全球变化与生物入侵重点实验室沈阳110161

入侵种与本地种杂交可能会改变其某些性状,影响其生理生化过程,增强其对一些重金属的耐受性。镉是目前造成土壤污染的主要重金属元素之一,为探讨杂交是否能够增强植物对重金属镉的耐受性,采用培养皿滤纸法比较了不同浓度镉(0,10,40,80和... 详细信息

入侵种与本地种杂交可能会改变其某些性状,影响其生理生化过程,增强其对一些重金属的耐受性。镉是目前造成土壤污染的主要重金属元素之一,为探讨杂交是否能够增强植物对重金属镉的耐受性,采用培养皿滤纸法比较了不同浓度镉(0,10,40,80和120 mg/L)处理下瘤突苍耳(Xanthium strumarium)、苍耳(Xanthium sibiricum)及二者杂合体(***♀×***♂,***♀×***♂)种子萌发与幼苗生长情况。结果表明:1、入侵种瘤突苍耳与本地种苍耳之间存在杂交现象;2、镉促进了杂交瘤突苍耳(***♀×***♂)种子的萌发,当镉浓度为80 mg/L时,其萌发率、发芽势、发芽指数最高;3、杂交瘤突苍耳在80、120 mg/L镉处理下根长和叶绿素含量低于瘤突苍耳,但子叶受到的氧化胁迫并未高于瘤突苍耳。研究结果显示,杂交有可能提高了瘤突苍耳在高浓度镉胁迫时对重金属镉的转运能力,幼苗根系吸收大量的镉并向上运输给子叶,导致根系生长受到抑制、子叶叶绿素含量下降,抗氧化酶系统可能在降低子叶氧化程度上发挥了作用。

关键词：瘤突苍耳苍耳杂交镉胁迫

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杓兰叶绿体基因组密码子偏好性分析

林业科学研究 2021年第5期34卷 177-185页

作者：丁锐胡兵宗小雁韩辰阳张丽杰陈旭辉沈阳农业大学土地与环境学院辽宁沈阳110866 沈阳农业大学生物科学技术学院辽宁沈阳110866 沈阳农业大学林学院辽宁沈阳110866

[目的]分析杓兰叶绿体基因组密码子的使用偏好性,探究影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素,为兰科叶绿体基因组学研究提供参考。[方法]从NCBI数据库中下载完整的杓兰叶绿体基因组序列并进行蛋白编码序列筛选,利用EMBOSS在... 详细信息

[目的]分析杓兰叶绿体基因组密码子的使用偏好性,探究影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素,为兰科叶绿体基因组学研究提供参考。[方法]从NCBI数据库中下载完整的杓兰叶绿体基因组序列并进行蛋白编码序列筛选,利用EMBOSS在线程序计算各基因及密码子的GC含量,利用CodonW软件计算各基因的氨基酸长度(Laa)、有效密码子数(ENC)、同义密码子相对使用度(RSCU)、最优密码子使用频率(FOP)及各基因密码子的第3核苷酸碱基含量,利用SPSS软件分析各指标之间的相关性,利用Origin软件绘图。[结果]杓兰叶绿体基因组编码序列的密码子第3位碱基富含A和T,GC含量仅为29%,ENC值介于37.92~61.00之间,密码子偏好性不强,ENC与GC_(2)及GC_(3)均呈极显著相关。RSCU值大于1的密码子有34个,其中,29个以U或A结尾。ENC-plot分析、PR2-plot分析及中性绘图分析表明:影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素为自然选择。对应性分析结果表明:编码光合系统蛋白基因的密码子具有相似的使用模式,编码其它类型基因的密码子则具有不同的使用模式,并最终筛选出最优密码子16个。[结论]本研究明确了自然选择是影响杓兰叶绿体基因组密码子使用偏好性的主要因素,并筛选出杓兰叶绿体基因的最优密码子,研究结果能够对兰科系统发育及叶绿体基因组密码子进化研究提供参考。

关键词：杓兰叶绿体基因组密码子偏好性兰科

辽宁省9种兰科植物根内与根际土壤中真菌群落结构的差异

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植物生态学报 2019年第12期43卷 1079-1090页

作者：蒋玉玲陈旭辉苗青曲波沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110161 辽宁省全球变化与生物入侵重点实验室沈阳110161

兰科植物的生存及生长高度依赖其根中的共生真菌,其中的菌根真菌更是对兰科植物的种子萌发与后续生长有着非常重要的作用,研究兰科植物根中的真菌,尤其是菌根真菌,对兰科植物的保护有重要作用。该研究利用第二代测序技术,对中国辽宁省... 详细信息

兰科植物的生存及生长高度依赖其根中的共生真菌,其中的菌根真菌更是对兰科植物的种子萌发与后续生长有着非常重要的作用,研究兰科植物根中的真菌,尤其是菌根真菌,对兰科植物的保护有重要作用。该研究利用第二代测序技术,对中国辽宁省境内的9种属于极小种群的兰科植物的根、根际土和根围土中的真菌群落和菌根真菌组成进行了研究。结果显示,兰科植物根中的真菌群落和根际土、根围土中的真菌群落具有显著差异。兰科植物根中的总操作分类单元(OTU)数目远小于根际土和根围土中的总OTU数目。同时,兰科植物根中菌根真菌的种类和丰度与根际土、根围土中菌根真菌的种类与丰度没有明显联系。FunGuild分析结果显示,丛枝菌根真菌在根际土与根围土中的丰度非常高,但在兰科植物的根中却数量极少。这些结果表明,兰科植物根中的真菌群落与土壤中的真菌群落在一定程度上是相互独立的。

关键词：兰科植物菌根真菌土壤内转录间隔区(ITS) 高通量测序

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柞树基因组研究进展

蚕业科学 2019年第3期45卷 431-440页

作者：胡花蕾杨健李鹏刘彦群秦利沈阳农业大学生物科学技术学院

柞树(QuercusL.)有450个种,广泛分布在亚洲、欧洲、非洲和北美洲,具有重要的经济、生态、文化、科学研究价值。由于存在大量杂交造成的种间形态特征和种内形态变异,使得柞树的分类非常困难。柞树基因组的解析可以为该属植物的分类、遗... 详细信息

柞树(QuercusL.)有450个种,广泛分布在亚洲、欧洲、非洲和北美洲,具有重要的经济、生态、文化、科学研究价值。由于存在大量杂交造成的种间形态特征和种内形态变异,使得柞树的分类非常困难。柞树基因组的解析可以为该属植物的分类、遗传与进化、育种等研究提供基本的遗传信息。核基因组方面,科学家近期完成了夏栎(Q. robur)、加利福尼亚白栎(Q. lobata)和欧洲栓皮栎(Q. suber)的基因组测序;细胞器基因组方面,共有25种柞树的叶绿体基因组被解析。本文总结了柞树基因组的研究现状,并对该领域今后的研究进行了展望,以期能为柞树资源的收集、评价、保护和有效利用提供有价值的信息。

关键词：柞树栎属核基因组叶绿体基因组

埃勒斯致病杆菌SN22发酵液中Xenorhabic acid的分离

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农药学学报 2017年第1期19卷 32-36页

作者：陈东升汪钰于志国沈阳农业大学植物保护学院沈阳110866 辽宁省生物农药工程技术研究中心沈阳110866

从土壤中分离得到一株抗菌活性菌株,通过16Sr DNA基因序列相似性和系统发育分析,发现该菌株为埃勒斯致病杆菌,并将其命名为埃勒斯致病杆菌SN22(Xenorhabdus ehlersii SN22)。利用硅胶柱层析结合凝胶柱层析技术,从埃勒斯致病杆菌SN22(***... 详细信息

从土壤中分离得到一株抗菌活性菌株,通过16Sr DNA基因序列相似性和系统发育分析,发现该菌株为埃勒斯致病杆菌,并将其命名为埃勒斯致病杆菌SN22(Xenorhabdus ehlersii SN22)。利用硅胶柱层析结合凝胶柱层析技术,从埃勒斯致病杆菌SN22(*** SN22)发酵液中分离得到化合物1,通过核磁共振波谱、质谱及X-光单晶衍射技术分析,鉴定其为3-(环己-2-烯)丙烯酸。文献调研发现,该化合物为新的天然产物,命名为Xenorhabic acid。采用菌丝生长速率法测定了该化合物对植物病原真菌的抑菌活性;采用微量稀释法测定了其对病原细菌的最小抑制浓度。结果表明:其对向日葵菌核病菌Sclerotinia sclerotiorum和瓜果腐霉病菌Pythium aphanidermatum菌丝生长具有明显抑制作用,其EC_(50)值分别为27.99和29.55μg/mL;对大肠埃希杆菌Escherichia coli的最小抑制浓度(MIC)为62.5μg/mL。

关键词：埃勒斯致病杆菌次生代谢产物抑菌作用 Xenorhabic acid

木霉REMI突变株主要生防酶活性改变及其基因部分序列差异的研究

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植物保护 2013年第1期39卷 14-20页

作者：刘限孙淑清高增贵黄哲沈阳农业大学生物科学技术学院沈阳110866 沈阳农业大学植物保护学院植物免疫研究所沈阳110866

本文探讨了来源于同一出发菌株木霉T21的不同木霉REMI突变株的主要生防酶活性的改变及其基因部分序列的差异,利用生化技术测定了木霉几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶酶活性,并对这两种酶的基因部分序列进行了分析。结果表明,木霉REMI突变株... 详细信息

本文探讨了来源于同一出发菌株木霉T21的不同木霉REMI突变株的主要生防酶活性的改变及其基因部分序列的差异,利用生化技术测定了木霉几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶酶活性,并对这两种酶的基因部分序列进行了分析。结果表明,木霉REMI突变株几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶活性变化较大;相对于出发菌株T21,菌株Ttrm68和Ttrm31酶活性极显著高于出发菌株T21,而Ttrm94则极显著低于T21。采用简并引物克隆几丁质酶和β-1,3-葡聚糖酶基因的部分序列,发现菌株Ttrm68、Ttrm31在几丁质酶基因中插入了GGTATCGATATCGAC片段,菌株Ttrm94在β-1,3-葡聚糖酶基因中插入了GTC片段。

关键词：木霉REMI突变株生防酶活性改变基因序列差异