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基于转录组学和机器学习算法的肺结核铁死亡相关关键基因的研究

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中国防痨杂志 2024年第1期46卷 92-99页

作者：叶江娥方雪晖熊延军刘盛盛安徽省胸科医院结核一科合肥230022 安徽省胸科医院办公室合肥230022 安徽省胸科医院结核八科合肥230022 安徽省胸科医院结核七科合肥230022

目的:运用转录组学和机器学习方法探索铁死亡关键基因与肺结核发病机制的相关性。方法:以“pulmonary tuberculosis”为关键词,以测序类型(转录组学)和物种(HOMO sapiens)等为条件从公共存储库NCBI GEO(http://***/geo)中进行搜索和筛选... 详细信息

目的:运用转录组学和机器学习方法探索铁死亡关键基因与肺结核发病机制的相关性。方法:以“pulmonary tuberculosis”为关键词,以测序类型(转录组学)和物种(HOMO sapiens)等为条件从公共存储库NCBI GEO(http://***/geo)中进行搜索和筛选,得到GSE153326和GSE67589两套转录组数据集。将GSE153326作为训练组数据[包含健康人群血液样本8份,结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)阳性血液样本52份]、GSE67589作为验证组数据(包含健康人群血液样本30份,MTB阳性27份);使用R脚本对数据进行矫正和注释,对两转录组的差异表达基因鉴定后,筛选出GSE153326训练组差异基因中与铁死亡相关基因(TBFerDEG)的表达情况,并对TBFerDEG的基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行富集分析;利用LASSO回归分析和SVM算法,从TBFerDEG中获得与铁死亡有明显差异的关键基因,并对其进行ROC分析,探索与关键基因相关的药物调控网络;最后将关键基因导入GSE67589验证组中,以验证训练组筛选出的铁死亡关键基因的诊断意义。结果:通过生物信息学分析,共筛选得到416个TBFerDEG,剔除不符合入选要求的基因,最终得到56个TBFerDEG差异基因。GO富集分析发现,肺结核中与铁死亡相关的生物学进程有细胞对化学应激的反应自噬调节、线粒体自噬、线粒体解体等;参与的通路有AMPK信号通路和铁死亡等。通过LASSO回归分析和SVM算法,最终得到5个与铁死亡相关的关键基因,分别为BID、AR、STK11、ALOX12和SRC,AUC分别为0.807、0.858、0.734、0.840和0.880;验证关键基因结果表明,AR和SRC基因在验证组(GSE67589)中MTB阳性与健康人群中的表达差异均有统计学意义(P值分别为0.004和0.017)。结论:AR和SRC是肺结核中与铁死亡相关的关键基因,可能为今后的基础研究奠定一定的借鉴和参考。

关键词：结核,肺铁死亡基因表达机器学习

含德拉马尼方案治疗我国耐多药和利福平耐药肺结核患者的阶段性不良反应临床分析

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中华结核和呼吸杂志 2024年第7期47卷 638-646页

作者：高孟秋高静韬马晓格舒薇杜鹃梁瑞霞吴桂辉裴异严晓峰蔡青山吕康言蔡翠吴于青李秀杰刘群群金龙仵倩红熊瑜李明武周莹荃邝浩斌王霞芳任斐陈晓红耿书军周勇沙巍杨国立王华占颖刘宇红李亮首都医科大学附属北京胸科医院结核二科北京101149 首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所中国疾病预防控制中心结核病防治临床中心北京101149 山东大学齐鲁医学院公共卫生学院流行病学系济南250012 武汉市肺科医院结核IV病区武汉430030 河南省胸科医院结核内科郑州450008 成都市公共卫生临床医疗中心结核科成都610066 长沙市中心医院耐药结核科长沙410028 重庆市公共卫生医疗救治中心重庆400030 杭州市红十字会医院结核科杭州310005 广西壮族自治区胸科医院结核科南宁530116 贵阳市公共卫生救治中心结核病质控中心贵阳550001 江西省胸科医院结核科南昌330008 佳木斯市结核病防治院结核科佳木斯1540007 太原市第四人民医院耐药结核科太原030053 黑龙江省传染病防治院结核内科哈尔滨150599 陕西省结核病防治院结核内科西安710105 山东省公共卫生临床中心结核科济南250013 昆明市第三人民医院耐药与重症结核病科昆明650041 兰州市肺科医院感染科兰州730030 广州市胸科医院结核内科广州510095 苏州市第五人民医院肺科苏州215505 西安市胸科医院结核科西安710018 福州肺科医院结核科福州350008 河北省胸科医院结核科石家庄050047 武汉市金银潭医院呼吸科武汉430048 上海市肺科医院结核科上海200433 吉林省结核病医院耐药科长春130062 安徽省胸科医院结核科合肥230022 北京结核病诊疗技术创新联盟北京101149

目的探讨含德拉马尼方案治疗耐多药和利福平耐药肺结核(MDR/RR-PTB)患者24周治疗过程中药物不良反应发生的特点。方法前瞻性多中心研究。2020年6月至2023年6月,在全国26家结核病医疗机构纳入符合条件的MDR/RR-PTB患者608例,其中男364例,... 详细信息

目的探讨含德拉马尼方案治疗耐多药和利福平耐药肺结核(MDR/RR-PTB)患者24周治疗过程中药物不良反应发生的特点。方法前瞻性多中心研究。2020年6月至2023年6月,在全国26家结核病医疗机构纳入符合条件的MDR/RR-PTB患者608例,其中男364例,女244例,年龄39.6(19.0~68.0)岁。给予含德拉马尼的化疗方案进行治疗,全程密切督导患者服药,监测并记录治疗过程中发生的所有不良反应,通过描述性分析评价不良反应发生的临床特点,用χ^(2)检验及多因素logistic回归分析QTcF(采用Fridericia公式校正的QT值)间期延长的相关影响因素。结果纳入本研究的608例患者在24周治疗期间内共有325例(53.5%)报告了710例次不良反应。发生频率最高的前6位依次是血液系统损害(143例,23.5%)、心电图QT间期延长(114例,18.8%)、肝毒性(85例,14.0%)、胃肠道反应(41例,6.7%)、周围神经病(25例,4.1%)、精神障碍(21例,3.5%)。心电图QT间期延长大多发生在距首次服药的第12周,其中严重不良反应21例(3.5%)。精神障碍患者7例(1.2%),其中严重精神障碍者有2例(0.3%)。结论含德拉马尼方案阶段性治疗MDR/RR-PTB患者的安全性总体良好,不良反应发生率与国外研究相当。研究发现我国患者人群中QT间期延长的发生率高于国外的相关报道,提示在使用含德拉马尼等可能引起QT间期延长的药物时要加强心电图的监测。

关键词：结核,肺结核,抗多种药物性抗结核药德拉马尼不良反应

单细胞测序揭示自然杀伤细胞在青年和老年重症肺结核患者中的差异

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中国防痨杂志 2024年第9期46卷 1030-1036页

作者：唐蜜李瑶胡艳梅文新民唐志冈黄晟张勇罗丹霖易恒仲湖南省胸科医院耐药结核病科长沙410013

目的:探讨青年和老年重症肺结核患者中的免疫细胞亚群差异,重点关注自然杀伤细胞(NK细胞)亚群相关功能和通路。方法:通过与公开研究文献的通信作者联系,获取4例重症肺结核患者[其中,2例青年患者(年龄≤40岁),2例老年患者(年龄≥65岁)]... 详细信息

目的:探讨青年和老年重症肺结核患者中的免疫细胞亚群差异,重点关注自然杀伤细胞(NK细胞)亚群相关功能和通路。方法:通过与公开研究文献的通信作者联系,获取4例重症肺结核患者[其中,2例青年患者(年龄≤40岁),2例老年患者(年龄≥65岁)]的单细胞测序数据和其他临床相关指标。对研究对象单细胞RNA测序数据进行质控、统计,去除不合格的细胞后,进一步进行非线性降维和聚类。利用公认的细胞标志物对相关免疫细胞进行注释,统计各样本和分组中的细胞类型百分比,比较各细胞亚型在不同分组中的变化趋势。同时,比较不同细胞类型之间的差异基因,通过京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome,KEGG)富集分析探索这些基因在生物过程和通路中的作用。结果:对来源于重症肺结核青年患者中的15359个细胞和老年患者的9571个细胞进行注释,共鉴定到11个细胞亚群,占比最多的细胞类型分别是单核细胞(61%)、CD4^(+)T细胞(17%)、CD8^(+)T细胞(8%)、巨核细胞(5%)、B细胞(4%)及NK细胞(3%)。分析发现,青年患者NK细胞百分比[中位数(四分位数):4.339%(3.955%,4.722%)]高于老年患者[中位数(四分位数):0.822%(0.813%,0.831%)],但差异未见统计学意义(Z=-0.431,P=0.667);利用观察到的细胞数与期望细胞数的比值(Ro/e)统计学方法分析同样显示NK细胞在青年组中呈现增多趋势。进一步对NK细胞聚类分析揭示了3种不同NK细胞亚群,青年患者中高表达CD16的NK细胞百分比[中位数(四分位数)]为44.409%(41.672%,47.147%),略高于老年患者[中位数(四分位数):35.172%(32.169%,38.174%)],但差异未见统计学意义(Z=-0.431,P=0.667)。对比CD16高表达的NK细胞和中表达的NK细胞发现存在435个明显变化的基因,其中高表达的基因388个,低表达的基因47个。KEGG结果显示差异表达基因主要集中作用在细胞感知、细胞因子、B细胞受体、抗原加工提呈等信号通路。结论:本研究通过分析青年和老年重症肺结核患者外周血免疫细胞之间的差异,揭示了青年重症肺结核患者中NK细胞百分比,以及CD16^(+)NK细胞百分比增多,为肺结核患者的分级临床治疗提供了新的理论依据和潜在治疗靶点。

关键词：序列分析 RNA 结核肺淋巴细胞

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多配体蛋白聚糖1和不对称二甲基精氨酸在2型糖尿病肾病早期诊断及病程监测的临床价值

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中华检验医学杂志 2024年第7期47卷 789-797页

作者：刘丽杨红梅张巧玲杨宏秀刘蕾李超袁宝军开滦总医院检验科唐山063100

目的:探讨内皮损伤指标多配体蛋白聚糖1(SDC1)、不对称二甲基精氨酸(ADMA)对2型糖尿病肾病(DKD)患者早期诊断及病程监测的临床价值。方法:横断面研究。选取2020年12月至2021年12月开滦总医院内分泌科住院的2型糖尿病患者232例进行回顾... 详细信息

目的:探讨内皮损伤指标多配体蛋白聚糖1(SDC1)、不对称二甲基精氨酸(ADMA)对2型糖尿病肾病(DKD)患者早期诊断及病程监测的临床价值。方法:横断面研究。选取2020年12月至2021年12月开滦总医院内分泌科住院的2型糖尿病患者232例进行回顾性分析,根据尿白蛋白/尿肌酐比值(UACR)和估算的肾小球滤过率(eGFR)分为单纯糖尿病组(50例)和DKD组(182例),其中DKD组根据DKD进展风险进一步分为低进展风险糖尿病肾病(LDKD)亚组90例、中进展风险糖尿病肾病(MDKD)亚组55例、高进展风险糖尿病肾病(HDKD)亚组37例。以同期体检中心40名健康者为健康对照组。根据N-乙酰-β-D-氨基葡萄糖苷酶/尿肌酐(NAG/Ucr)水平四分位数值,将DKD组患者分为Q1~Q4亚组,分别为45、45、46和46例。检测各组一般生化指标、SDC1和ADMA水平。采用Spearman相关法分析DKD患者SDC1、ADMA与肾小球、肾小管损伤指标相关性。多因素有序Logistic回归分析DKD进展风险及肾小管损伤的影响因素,受试者工作特征(ROC)曲线评价SDC1、ADMA对DKD的诊断性能。结果:DKD组收缩压、舒张压、甘油三酯(TG)、血肌酐(Scr)、尿酸(UA)、NAG/Ucr、SDC1、ADMA水平高于SDM组和健康对照组(P均<0.05),总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、载脂蛋白B(AporB)、糖化血红蛋白(HbA 1c)水平高于健康对照组,高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平低于健康对照组(P均<0.05)。HDKD亚组SDC1水平高于SDM组和LDKD亚组,ADMA水平高于SDM组,低于LDKD亚组(P均<0.05);MDKD亚组SDC1水平高于SDM组和LDKD亚组,ADMA水平高于SDM组,低于LDKD亚组(P均<0.05);LDKD亚组SDC1、ADMA水平高于SDM组(P均<0.05)。NAG/Ucr水平Q4亚组TC、AporB、HbA 1c、Scr、UACR、SDC1水平高于Q1亚组,Scr、UACR、SDC1水平高于Q2亚组,Q3亚组HbA 1c、Scr、UACR、SDC1水平高于Q1亚组(P均<0.05)。Spearman相关分析显示,SDC1与UACR、NAG/Ucr呈正相关(r=0.757、0.566,P均<0.05),与eGFR呈负相关(r=-0.337,P<0.05);ADMA与UACR、NAG/Ucr呈正相关(r=0.197、0.142,P均<0.05)。多因素有序Logistic回归分析显示,SDC1、NAG/Ucr、Scr是DKD进展的独立影响因素(OR=2.043、1.067、1.047,P均<0.05),SDC1、HbA 1c、UACR是DKD肾小管损伤的独立影响因素(OR=1.177、1.193、1.002,P均<0.05)。ROC曲线显示,SDC1诊断DKD的曲线下面积(AUC)为0.979,敏感度为92.31%,特异度为92.22%,ADMA诊断DKD的AUC为0.745,敏感度为81.32%,特异度为60.00%,两者联合诊断DKD的AUC为0.981、敏感度为90.66%、特异度为95.66%。结论:SDC1是DKD进展和肾小管损伤的独立影响因素,可用于诊断早期DKD,并可用于监测DKD进展;ADMA可用于DKD的早期筛查。

关键词：糖尿病,2型糖尿病肾病多配体蛋白聚糖1 不对称二甲基精氨酸

144例老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素分析

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中国防痨杂志 2024年第7期46卷 799-807页

作者：高磊梁雅雪刘盛盛王华安徽省胸科医院耐药结核科合肥230022 安徽医科大学胸科临床学院合肥230022 安徽省胸科医院结核科合肥230022

目的:分析老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素。方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2020年9月至2023年9月安徽省胸科医院收治的144例老年利福平耐药肺结核患者相关临床资料,分析患者治疗转归情况及影响因素。结果:144... 详细信息

目的:分析老年利福平耐药肺结核患者治疗转归及影响因素。方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2020年9月至2023年9月安徽省胸科医院收治的144例老年利福平耐药肺结核患者相关临床资料,分析患者治疗转归情况及影响因素。结果:144例老年利福平耐药肺结核患者中,治疗结局良好者65例(45.14%),包括治愈51例(35.42%)、完成疗程14例(9.72%);不良结局者79例(54.86%),包括失败7例(4.86%)、失访57例(39.58%)、死亡15例(10.42%),其中因结核病死亡7例。多因素logistic回归分析显示,体质量指数≥18.5(OR=0.131,95%CI:0.040~0.429,P局的保护因素,而合并糖尿病(OR=3.266,95%CI:1.074~9.936,P=0.037)和发生胃肠道反应(OR=8.976,95%CI:2.582~31.205,P局的危险因素。结论:安徽省老年利福平耐药肺结核患者治愈率较低,应重点关注合并糖尿病、营养状况欠佳、无长期督导服药管理及发生药物不良反应的老年患者,做到积极控制血糖水平、处理不良反应,加强营养支持和督导管理,进一步提高治愈率。

关键词：老年结核肺抗药性细菌治疗结果因素分析统计学

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瑞马唑仑和丙泊酚对高龄衰弱患者内镜下逆行胰胆管造影术中血流动力学和术后早期恢复质量的比较

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中华医学杂志 2024年第31期104卷 2936-2942页

作者：辛文帝崔波许兆柱刁玉刚宋丹丹北部战区总医院麻醉科沈阳110016

目的比较瑞马唑仑和丙泊酚对高龄衰弱患者内镜下逆行胰胆管造影术(ERCP)中血流动力学和术后早期恢复质量的影响。方法前瞻性纳入2022年11月至2023年5月北部战区总医院择期行ERCP的高龄(年龄≥75岁)衰弱患者108例,根据使用的不同麻醉药物... 详细信息

目的比较瑞马唑仑和丙泊酚对高龄衰弱患者内镜下逆行胰胆管造影术(ERCP)中血流动力学和术后早期恢复质量的影响。方法前瞻性纳入2022年11月至2023年5月北部战区总医院择期行ERCP的高龄(年龄≥75岁)衰弱患者108例,根据使用的不同麻醉药物,采用随机数字表法将患者分为两组:瑞马唑仑组(R组)和丙泊酚组(P组)。R组麻醉诱导静脉注射瑞马唑仑0.15~0.20 mg/kg和阿芬太尼5.0μg/kg,麻醉维持静脉泵注瑞马唑仑0.4~0.8 mg·kg^(-1)·h^(-1)和阿芬太尼0.5μg·kg^(-1)·min^(-1);P组麻醉诱导静脉注射丙泊酚1.0~1.5 mg/kg和阿芬太尼5.0μg/kg,麻醉维持泵注丙泊酚2.0~6.0 mg·kg^(-1)·h^(-1)和阿芬太尼0.5μg·kg^(-1)·min^(-1)。主要观察指标为两组患者术中低血压[平均动脉压(MAP)20%]、严重低血压(MAP0.05);R组患者苏醒时间为(11.8±3.0)min,长于P组的(10.3±3.3)min(P=0.016),苏醒期躁动发生率为3.8%(2/53),低于P组的16.4%(9/55)(P=0.031)。两组患者麻醉后恢复室停留时间、术后恶心呕吐的发生率差异均无统计学意义(均P>0.05)。两组患者术后1 d的QoR-15评分分别为(131.9±4.7)和(129.3±5.7)分,差异有统计学意义(P=0.010),术后3 d的QoR-15评分分别为(134.8±4.3)和(133.6±5.0)分,差异无统计学意义(P=0.205)。结论与丙泊酚比较,瑞马唑仑可以降低高龄衰弱患者ERCP术中低血压、心动过缓、注射痛的发生率,减少术中血管活性药物的使用量,具有相对稳定的血流动力学,虽延长了患者的苏醒时间,但未影响术后早期恢复质量。

关键词：胰胆管造影术,内窥镜逆行瑞马唑仑阿芬太尼高龄衰弱血流动力学

难治性催乳素瘤的临床应对：石以砥焉，化钝为利

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解放军医学杂志 2024年

作者：王瑞风叶小珍李建瑞李静李家亮丛子翔陆燕吴楠戈一峰马驰原邵加庆东部战区总医院内分泌科东部战区总医院垂体瘤协作组东部战区总医院影像科东部战区总医院放疗科东部战区总医院中心检验科东部战区总医院神经外科东部战区总医院眼科东部战区总医院病理科东部战区总医院生殖医学科

垂体催乳素瘤是最常见的垂体神经内分泌肿瘤，一般首选药物治疗，主要为多巴胺受体激动剂(DA)。大部分催乳素瘤患者对DA反应良好，然而，仍有少数患者对DA表现出抵抗性、耐药性。DA抵抗型难治性催乳素瘤临床少见，但其治疗极其困难，即... 详细信息

垂体催乳素瘤是最常见的垂体神经内分泌肿瘤，一般首选药物治疗，主要为多巴胺受体激动剂(DA)。大部分催乳素瘤患者对DA反应良好，然而，仍有少数患者对DA表现出抵抗性、耐药性。DA抵抗型难治性催乳素瘤临床少见，但其治疗极其困难，即便是药物治疗联合多次手术和放疗，也不能达到满意的疗效。因此，规范难治性催乳素瘤的诊疗流程和路径、探索更为有效的多学科协作治疗策略是目前亟待解决的难题。在难治性催乳素瘤的临床应对中常常需要综合患者情况，更换其他种类的DA，或考虑手术、放疗以及免疫治疗等，此过程需要多学科联合诊治。本文综合国内外最新文献，系统论述了难治性催乳素瘤的药物、手术及放射治疗的最新进展，以期为难治性催乳素瘤的临床诊治和基础研究提供新的思路。

关键词：难治性垂体瘤催乳素瘤临床治疗

非结核分枝杆菌与其他呼吸道病原微生物合并感染的研究进展

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中国防痨杂志 2024年

作者：杜姗姗沙巍王丽同济大学附属上海市肺科医院结核科

随着人口老龄化程度逐年上升，结构性肺病患者不断增多，非结核分枝杆菌肺病（non-tuberculous mycobacteria pulmonary disease， NTM-PD）的发病率呈现增高趋势。大多数NTM-PD患者发病时已存在基础肺病，常同时合并感染多种病原微生... 详细信息

随着人口老龄化程度逐年上升，结构性肺病患者不断增多，非结核分枝杆菌肺病（non-tuberculous mycobacteria pulmonary disease， NTM-PD）的发病率呈现增高趋势。大多数NTM-PD患者发病时已存在基础肺病，常同时合并感染多种病原微生物，进一步增加了NTM病诊治和疗效判定的难度，合并感染成为导致NTM-PD治疗成功率低，复发率高的重要原因之一。作者通过检索相关文献，对NTM合并感染的研究进展进行综述，以丰富临床工作者对NTM-PD患者肺部合并感染的认识，研究临床干预策略。

关键词：分枝杆菌感染非典型性细菌呼吸道感染研究

复治耐多药/利福平耐药肺结核患者的治疗转归影响因素分析——全国多中心、回顾性队列研究

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中国防痨杂志 2024年第7期46卷 778-784页

作者：叶智腾任斐王华杨铭陈禹陈晓红王芸范琳贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵阳561113 同济大学附属上海市肺科医院结核科结核病临床研究中心上海市结核(肺)重点实验室上海200433 西安市胸科医院耐药结核科西安710100 安徽省胸科医院耐药结核病科合肥230022 成都市公共卫生临床医疗中心结核科成都610061 沈阳市胸科医院儿童结核科沈阳110044 福建省福州肺科医院福州350008

目的:分析耐多药/利福平耐药肺结核(multidrug/rifampicin-resistant pulmonary tuberculosis,MDR/RR-PTB)复治患者治疗转归的影响因素。方法:采用多中心、回顾性队列研究方法,纳入2018年1月1日至2020年12月31日期间在全国六家省级结核... 详细信息

目的:分析耐多药/利福平耐药肺结核(multidrug/rifampicin-resistant pulmonary tuberculosis,MDR/RR-PTB)复治患者治疗转归的影响因素。方法:采用多中心、回顾性队列研究方法,纳入2018年1月1日至2020年12月31日期间在全国六家省级结核病专科医院收治的2291例MDR/RR-PTB患者,随访患者的治疗信息,记录患者的临床特征,采用单因素、多因素logistic回归分析方法,分析影响复治MDR/RR-PTB患者治疗转归的因素。结果:2291例患者的治愈率为56.44%(1293/2291),完成疗程率为16.28%(373/2291),成功治疗率为72.72%(1666/2291);治疗失败率为11.39%(261/2291),死亡率为1.44%(33/2291),失访率为14.45%(331/2291)。多因素logistic回归分析结果显示,合并糖尿病[OR(95%CI)=1.739(1.315~2.301)]、合并肝脏疾病[OR(95%CI)=2.230(1.213~4.099)]及出现肺部空洞[OR(95%CI)=1.531(1.244~1.885)]是导致复治MDR/RR-PTB患者治疗失败的危险因素,方案中含贝达喹啉药物[OR(95%CI)=0.163(0.097~0.274)]和性别为女性[OR(95%CI)=0.713(0.571~0.890)]是患者成功治疗的保护因素。结论:复治MDR/RR-PTB患者的分类及治疗方案复杂,不同类型的复治患者治疗转归存在差异,应充分判断影响治疗转归的不利因素和有利因素,对患者实施个体化治疗。

关键词：结核抗多种药物性治疗结果因素分析统计学多中心研究(主题) 队列研究