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基于全基因组测序分析1起产气荚膜梭菌导致的腹泻暴发事件

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中国人兽共患病学报 2024年第8期40卷 758-762,773页

作者：闫爱霞潘艳艳康颖李首飞王苗王洛桐王园园刘雨薇李颖黄振洲北京市顺义区疾病预防控制中心北京101300 杭州市疾病预防控制中心杭州310021

目的对1起产气荚膜梭菌导致腹泻暴发事件进行病原学分析。方法采集病例肛拭子样本和环境涂抹样本,肛拭子样本增菌前后分别进行产气荚膜梭菌plc和cpe基因荧光PCR检测和产气荚膜梭菌分离培养,对分离菌落进行全自动生化鉴定和飞行时间质谱... 详细信息

目的对1起产气荚膜梭菌导致腹泻暴发事件进行病原学分析。方法采集病例肛拭子样本和环境涂抹样本,肛拭子样本增菌前后分别进行产气荚膜梭菌plc和cpe基因荧光PCR检测和产气荚膜梭菌分离培养,对分离菌落进行全自动生化鉴定和飞行时间质谱鉴定。对鉴定为产气荚膜梭菌的分离株进行全基因组测序,分析菌株携带毒力基因和耐药基因情况,基于全部分离株核心基因组单核苷酸多态性进行遗传聚集性分析。结果未增菌的病例肛拭子cpe和plc基因检出率分别为46.15%(6/13)和53.85%(7/13),基于BHI厌氧增菌后病例肛拭子cpe和plc基因检出率分别为38.46%(5/13)和53.85%(7/13);10名病例肛拭子分离到产气荚膜梭菌,均为F生物型(携带毒力基因分布plc+/cpb-/etx-/iA-/cpe+/cpb2+/netB-),10个分离株基于cgSNP构建的聚类树形成2个相互独立且遗传距离较远的分支,Lineage 1仅分布1株,为ST589,携带耐药基因为erm(Q),Lineage 2分布9株,为ST149,携带耐药基因为tetB(P),为一组高度克隆化的菌株。结论本次暴发事件由F型产气荚膜梭菌所导致,且多数病例感染一组cpe+高度克隆化菌株。全基因组测序技术可应用于产气荚膜梭菌暴发事件病原学分析,基于肛拭子样本的产气荚膜梭菌增菌方法和分子筛查方法有待开发和应用。

关键词：产气荚膜梭菌 cpe基因全基因组测序腹泻

宁波市HIV感染者抗病毒治疗医疗保险药物使用情况及相关因素分析

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中华流行病学杂志 2024年第1期45卷 123-127页

作者：叶泽豪姜海波谭诗文史宏博褚堃张丹丹宁波市疾病预防控制中心宁波315010

目的分析宁波市HIV感染者抗病毒治疗(ART)医疗保险(医保)药物使用情况及影响因素。方法资料来源于中国疾病预防控制信息系统截至2023年2月宁波市所有在治HIV感染者与ART相关历史数据。采用logistic回归模型分析HIV感染者ART医保药物使... 详细信息

目的分析宁波市HIV感染者抗病毒治疗(ART)医疗保险(医保)药物使用情况及影响因素。方法资料来源于中国疾病预防控制信息系统截至2023年2月宁波市所有在治HIV感染者与ART相关历史数据。采用logistic回归模型分析HIV感染者ART医保药物使用的相关因素。使用R 4.2.2软件进行统计学分析。结果共收集有ART记录的HIV感染者6433例,其中在治HIV感染者5783例。在治HIV感染者中,医保药物使用比例为24.8%(1435/5783,95%CI:23.7%~25.9%)。ART医保药物使用比例最低的两个区(县)为北仑区(8.7%,43/497)和奉化区(5.7%,14/247)。在治HIV感染者中,ART医保或自费药物组最近1年病毒载量检测≥1次的比例(84.9%,1352/1593)显著低于免费药物组(91.4%,3829/4190)(χ^(2)=52.50,P区差异较明显,应尽快完善HIV感染者随访管理方案,提高HIV感染者随访依从性,调动各区(县)推广ART医保药物积极性。加强对文化程度较低者和延迟治疗者的ART医保药物的科普宣传。

关键词：艾滋病病毒感染者医疗保险药物随访相关因素

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全球内脏利什曼病流行风险因素研究进展

中国血吸虫病防治杂志 2024年第4期36卷 412-421,427页

作者：陈曦师悦周升耿梦杰涂宏宋健东郑灿军孙军玲中国疾病预防控制中心北京102206 山东省济南市天桥区疾病预防控制中心

内脏利什曼病是由趋内脏的利什曼原虫引起、经白蛉叮咬传播的一种人兽共患寄生虫病,主要在印度次大陆、非洲东部和南美洲国家流行,是全球导致死亡的第二大寄生虫病。受气象变化、城市发展和个体状态等影响,媒介白蛉密度及与人接触机会... 详细信息

内脏利什曼病是由趋内脏的利什曼原虫引起、经白蛉叮咬传播的一种人兽共患寄生虫病,主要在印度次大陆、非洲东部和南美洲国家流行,是全球导致死亡的第二大寄生虫病。受气象变化、城市发展和个体状态等影响,媒介白蛉密度及与人接触机会发生变化,内脏利什曼病存在流行范围扩大的风险。本文总结了影响内脏利什曼病流行的自然、社会和生物等相关因素,以期为制定具有针对性的内脏利什曼病防控措施提供参考。

关键词：内脏利什曼病利什曼原虫影响因素白蛉

2015―2021年江苏省未成年人伤害病例分析报告

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中华疾病控制杂志 2024年第5期28卷 516-522,606页

作者：施展黄晓萍张小燕杜文聪南京市浦口区疾病预防控制中心南京211800 江苏省疾病预防控制中心南京210009

目的了解2015―2021年江苏省未成年人伤害发生情况及特点,为制定未成年人伤害预防措施提供依据。方法收集2015―2021年江苏省伤害监测系统中0~17岁未成年人伤害首诊病例资料,内容包括患者的一般信息、伤害事件基本情况、伤害临床信息... 详细信息

目的了解2015―2021年江苏省未成年人伤害发生情况及特点,为制定未成年人伤害预防措施提供依据。方法收集2015―2021年江苏省伤害监测系统中0~17岁未成年人伤害首诊病例资料,内容包括患者的一般信息、伤害事件基本情况、伤害临床信息和填报人信息。采用频数和频率描述伤害发生的分布特征;组间频率的比较采用χ^(2)检验,通过秩和检验比较不同类别间未成年人伤害严重程度的差异。结果 2015―2021年共收集江苏省5个监测点12家哨点医院未成年人伤害病例98 954例次,其中男性60 380例次(61.02%),男女比例为1.57∶1。伤害发生原因构成前3位的是动物伤(35.38%)、跌倒/坠落伤(32.00%)和钝器伤(10.81%)。8―10月是未成年人伤害发生的高峰季节,不同原因所致伤害类型在不同月份的分布也不同。不同年龄组未成年人伤害主要发生在家中,分别占78.13%(0~<4岁组)、68.00%(4~<7岁组)、52.98%(7~<13岁组)和36.27%(13~17岁组),≥7岁组伤害发生于学校与公共场所所占比例较<7岁组显著增加,分别为84.96%和15.04%。未成年人伤害发生时活动主要是休闲活动,占66.88%。结论江苏省未成年人伤害病例以男性居多,以动物伤为主要原因,夏秋季是高峰季节,多发生在家中,应有针对性地开展安全教育和加强保护。

关键词：未成年人伤害监测分析

基于Mann-Kendall检验的安徽省有螺面积变化趋势分析

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中国血吸虫病防治杂志 2024年

作者：高风华张世清丁宋军许晓娟汪天平代波安徽省疾病预防控制中心

目的分析2004—2023年安徽省有螺面积变化趋势，为安徽省推进血吸虫病消除进程提供科学参考。方法收集2004—2023年安徽省有螺面积数据，采用Mann-Kendall检验法分别对全省有螺面积变化趋势和突变、不同类型血吸虫病流行区和不同地级... 详细信息

目的分析2004—2023年安徽省有螺面积变化趋势，为安徽省推进血吸虫病消除进程提供科学参考。方法收集2004—2023年安徽省有螺面积数据，采用Mann-Kendall检验法分别对全省有螺面积变化趋势和突变、不同类型血吸虫病流行区和不同地级市有螺面积变化趋势进行分析。结果 2004—2023年安徽省有螺面积下降12.62%,Mann-Kendall趋势检验发现，2004—2023年全省有螺面积呈下降趋势（Z=-3.926,P U0.05,P 区有螺面积呈下降趋势（Z=-4.899,P 区有螺面积呈上升趋势（Z=2.758,P 区有螺面积平均占比分别为88.19%、11.81%，湖沼型与山丘型血吸虫病流行区有螺面积之比由9.23∶1下降至5.74∶1，比值呈下降趋势（Z=-4.477,P 区有螺面积降低、山丘型血吸虫病流行区有螺面积升高。应根据实际螺情制定有针对性的钉螺控制措施。

关键词：钉螺 Mann-Kendall检验安徽省

吹扫捕集-气相色谱质谱法测定水中2-甲基异莰醇和土臭素

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卫生研究 2024年第2期53卷 316-320,331页

作者：曹芳红陈堃陈晓霞杨玲赵永信吴平谷德清县疾病预防控制中心德清313200 浙江省疾病预防控制中心杭州310051

目的建立吹扫捕集-气相色谱质谱法测定水中两种臭味物质2-甲基异莰醇(2-methylisoborneol,2-MIB)和土臭素(geosmin,GSM)的方法。方法水样经吹扫捕集装置富集解析后,经DB-624(30 m×0.25 mm,1.4μm)色谱柱分离,用气相色谱-质谱法,选择离... 详细信息

目的建立吹扫捕集-气相色谱质谱法测定水中两种臭味物质2-甲基异莰醇(2-methylisoborneol,2-MIB)和土臭素(geosmin,GSM)的方法。方法水样经吹扫捕集装置富集解析后,经DB-624(30 m×0.25 mm,1.4μm)色谱柱分离,用气相色谱-质谱法,选择离子扫描测定,内标法定量。结果2-MIB和GSM在1~100 ng/L范围内线性关系良好,R^(2)均大于0.999。两种物质的方法检出限均为0.33 ng/L,定量限均为1.0 ng/L。对水源水、生活饮用水进行3个浓度水平的加标回收试验,2-MIB的平均回收率为82.0%~111.0%,精密度为1.9%~7.3%,GSM的平均回收率为84.0%~110%,精密度为1.9%~5.0%(n=6)。采集本地多份水源水、出厂水和管网水进行检测,两种臭味物质均有检出。结论相较于国家标准(GB/T 5750.8—2023),该方法实验过程实现上样、检测全自动化,无需水样前处理,具有操作简单、重复性好、准确性高的优点。

关键词： 2-甲基异莰醇土臭素饮用水水源水吹扫捕集-气相色谱质谱法

贵州省一起新型冠状病毒感染家庭聚集性疫情的调查分析

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医学动物防制 2024年第1期40卷 83-87页

作者：黄焦余春刘昭兵陶忠发平凯珂黄荷黄远谋秦政雷明玉黄艳贵州省疾病预防控制中心贵州贵阳550001 遵义市疾病预防控制中心务川县疾病预防控制中心

目的为了追溯2022年3月贵州省遵义市务川县报告的一起新型冠状病毒感染(Corona virus disease 2019,COVID-19,简称“新冠”)家庭聚集性疫情的感染来源和传播方式。方法本研究通过专项调查,收集此次新冠疫情感染者的基本情况、临床表... 详细信息

目的为了追溯2022年3月贵州省遵义市务川县报告的一起新型冠状病毒感染(Corona virus disease 2019,COVID-19,简称“新冠”)家庭聚集性疫情的感染来源和传播方式。方法本研究通过专项调查,收集此次新冠疫情感染者的基本情况、临床表现和诊疗情况、实验室检查、个人暴露史、密切接触史等流行病学调查资料。结果 2022年3月11日至3月17日,务川县共报告新型冠状病毒感染者12例,波及6个家庭,4例感染者(编号分别为3、4、5和9)为同一家庭(编号2)成员。首例病例(病例1)于3月7日从浙江省杭州市返回务川县,3月9日下午病例1在2号家庭居住的小区周围活动并于16:45摘下口罩吐痰。3月9日,2号家庭的孩子(代号N)于17:28踩到了病例1吐的痰液,后穿着被痰液污染的鞋子回到住处,其并未换鞋即在家里活动;3月9日晚上病例3、4、9与孩子N去鞋店买鞋,购鞋期间病例4和9反复帮N和病例3脱鞋穿鞋。测序结果显示,病例1的病毒基因序列与同时期浙江省流行的毒株完全同源,病例3、4和5的病毒基因序列与病例1的毒株序列高度同源。结论本次家庭聚集性疫情系因省外返乡的病例1随地吐痰后,2号家庭的成员N踩到痰液并机械携带引起病毒在其家人间传播导致的聚集性疫情事件。

关键词：新冠病毒感染奥密克戎聚集现场流行病学调查痰液基因序列疫情分析

不同死亡率标准下区域长寿死亡占比指标一致性分析

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中国卫生统计 2024年第4期41卷 491-496页

作者：毛凡张伟伟王黎君周脉耕中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心 100050

目的分析死亡漏报对区域长寿相关死亡占比水平的影响,以期为利用人口死亡登记数据开展区域长寿水平评价提供依据。方法基于2019年全国人口死亡登记数据计算各个区县的粗死亡率。按照不同的粗死亡率标准(粗死亡率≥4.5‰,≥5.0‰,≥6.0... 详细信息

目的分析死亡漏报对区域长寿相关死亡占比水平的影响,以期为利用人口死亡登记数据开展区域长寿水平评价提供依据。方法基于2019年全国人口死亡登记数据计算各个区县的粗死亡率。按照不同的粗死亡率标准(粗死亡率≥4.5‰,≥5.0‰,≥6.0‰,≥7.0‰)分别计算相应纳入标准情况下百岁老人、长寿老人、高龄老人死亡占比等9个指标的全国水平,采用标准差和变异系数评价各个指标的稳定性。在省级和地市水平分别计算纳入全部监测区县和只纳入粗死亡率≥6.0‰区县情况下的9个死亡占比指标,采用基于百分位数法的Bland-Altman散点图法评价两种情况下各个指标的一致性。结果在全国水平,100岁及以上死亡占比指标的标准差最小(0.01~0.02),其次是90岁及以上死亡占比指标(0.13~0.18),80岁及以上死亡占比指标的标准差最大(0.20~0.33);变异系数最小的指标是80+/60+和100+/90+(0.43~0.44),变异系数最大的指标是100+/all和90+/all(1.69~1.80)。在省级水平和地市水平,9个死亡占比指标的95%LoA均超出了相应的专业可接受范围,意味着两种情况下的指标测量结果不可互相替换。结论死亡漏报对全国水平长寿死亡占比指标影响较小,但是对省级水平和地市水平影响较大。在依托人口死亡登记数据报告区域长寿死亡占比指标时须遴选数据完整性较高(粗死亡率≥6.0‰)的区县进行测算,以保证结果的准确性。

关键词：漏报百岁老人长寿老人高龄老人死亡占比一致性分析 Bland-Altman散点图

2012—2022年广东省深圳市腺病毒暴发疫情监测结果分析

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疾病监测 2024年

作者：王昕房师松武伟华刘慧孙颖邹旋唐秀娟深圳市疾病预防控制中心

目的分析2012—2022年广东省深圳市腺病毒暴发疫情监测结果及流行特点，为呼吸道病毒防控提供科学参考。方法收集深圳市2012—2022年腺病毒暴发疫情监测的流行病学资料和实验室检测结果，用描述性统计学方法分析腺病毒疫情监测数据。结... 详细信息

目的分析2012—2022年广东省深圳市腺病毒暴发疫情监测结果及流行特点，为呼吸道病毒防控提供科学参考。方法收集深圳市2012—2022年腺病毒暴发疫情监测的流行病学资料和实验室检测结果，用描述性统计学方法分析腺病毒疫情监测数据。结果：2012—2022年深圳市经实验室检测共确定了39起腺病毒暴发疫情，共采集了241份咽拭子样本，经核酸检测共167份呼吸道病毒阳性，阳性率为69.29%，其中腺病毒阳性147份，其它呼吸道病毒阳性23份（有3份样本腺病毒和鼻病毒均为阳性）。39起腺病毒疫情中有33起由腺病毒单独引起，有6起疫情由腺病毒和其它呼吸道病毒混合感染引起。2019年疫情数最多，为15起，其次是2014年6起，39起腺病毒疫情的发病人数为369例，平均罹患率为18.70％。69.23%的腺病毒疫情发生在中小学校，其余发生在幼儿园。腺病毒疫情报告最多的月份是10月（10起，占25.64%），其次是9月和4月（均为6起，占15.38%）。结论：深圳市2012—2022年每年均报告了腺病毒疫情，2019年报告数较多，高发季节是秋季和春季。

关键词：腺病毒暴发疫情监测