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生物序列比对动态规划算法的统一形式化构造与Isabelle验证

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计算机研究与发展 2025年第1期62卷 119-131页

作者：石海鹤蓝孙文刘日明石海鹏王岚钟林辉江西师范大学计算机信息工程学院南昌330022 江西师范大学软件学院南昌330022

序列比对是生物序列分析中的一个经典问题,旨在找出序列之间的相似性,它对于发现生物序列中的功能、结构和进化信息都具有重要的意义.该问题可分为双序列比对和多序列比对2类,现有工作多针对特定算法展开,没有设计通用的求解方法;此外,... 详细信息

序列比对是生物序列分析中的一个经典问题,旨在找出序列之间的相似性,它对于发现生物序列中的功能、结构和进化信息都具有重要的意义.该问题可分为双序列比对和多序列比对2类,现有工作多针对特定算法展开,没有设计通用的求解方法;此外,甚少涉及算法可信性的研究.从生物序列比对问题的形式化规约出发,通过深入分析问题的性质,刻画问题求解的本质特征,借助形式化方法PAR(partition andrecursion)设计了序列比对动态规划算法的统一构造框架seqAlign;展示了应用该框架构造序列数为3的多序列比对算法的过程,并使用Isabelle定理证明器对构造结果进行形式化验证;利用PAR平台生成了该算法的C++可执行程序,进一步分析了由seqAlign框架机械化构造其他类型序列比对算法的过程.通过严密的规约精化和形式验证,有效地保证了生成算法的可信性;开发的seqAlign框架提供了序列比对问题类的通用求解方案,显著提高了序列比对算法族生成的效率.研究结果在生物序列分析中序列比对问题上的成功应用,从方法学和实践上可为复杂生物信息学领域高可靠算法的构造提供参考.

关键词：序列比对 PAR方法形式构造 Isabelle定理证明器

鳕鱼明胶抗冻多肽的制备及其在鱼糜冻融中的应用

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食品工业科技 2025年第3期46卷 269-277页

作者：张金袁涛沙小梅徐玥伦邝雅婷胡姿姿江西师范大学健康学院江西南昌330022 江西师范大学生命科学学院江西南昌330022 江西师范大学化学与材料学院江西南昌330022

为优化高活性鳕鱼明胶抗冻多肽(DcAFPs)的制备方法,明确鳕鱼明胶多肽对鱼糜的冷冻保护效果,本研究将鳕鱼明胶多肽添加至鱼糜中,以冷冻后鱼糜肌原纤维蛋白含量为考察指标,通过单因素和正交试验进行工艺优化。通过测定DcAFPs分子量分布和... 详细信息

为优化高活性鳕鱼明胶抗冻多肽(DcAFPs)的制备方法,明确鳕鱼明胶多肽对鱼糜的冷冻保护效果,本研究将鳕鱼明胶多肽添加至鱼糜中,以冷冻后鱼糜肌原纤维蛋白含量为考察指标,通过单因素和正交试验进行工艺优化。通过测定DcAFPs分子量分布和氨基酸组成,分析其基本性质;通过测定鱼糜肌原纤维蛋白含量,并运用内源荧光光谱和SDS-PAGE凝胶电泳技术,评估DcAFPs对反复冻融循环后鱼糜的保护效果。结果表明,DcAFPs的最优制备工艺是:使用复合蛋白酶、底物浓度为3.5%(w/v)、酶底比为5%(w/w)、水解p H为8、水解温度为55℃、水解时间为2 h。DcAFPs分子量主要集中在185~3081 Da,Gly、Ala和Glu的含量最高。DcAFPs能有效防止鱼糜在冻融过程中肌原纤维蛋白含量的减少,抑制肌原纤维蛋白结构和组成的变化,延缓蛋白变性,其总体效果优于商业抗冻剂。综上所述,DcAFPs对反复冻融的鱼糜显示出显著的冷冻保护效果。

关键词：鳕鱼明胶抗冻多肽鱼糜肌原纤维蛋白抗冻活性

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现代汉语反预期信息结构及其认知语用机制研究

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外语教学 2025年第1期46卷 28-33页

作者：李勇忠白黎江西师范大学国际教育学院江西师范大学文学院

本文重点探讨了现代汉语反预期信息结构的内部单元关系和外部模型变体,并对相关现象进行了认知语用阐释。首先,反预期信息结构的核心单元包括条件、预期和反预期,其中条件与预期是因果关系和类推关系,预期与反预期是否定关系,条件与反... 详细信息

本文重点探讨了现代汉语反预期信息结构的内部单元关系和外部模型变体,并对相关现象进行了认知语用阐释。首先,反预期信息结构的核心单元包括条件、预期和反预期,其中条件与预期是因果关系和类推关系,预期与反预期是否定关系,条件与反预期是架桥关系,分别体现了完形心理原则中的邻近性、相似性、突显性和闭合性。其次,基于CNKI数据和VOSviewer软件分析,本文发现反预期信息结构模型最为常见的变体是条件—反预期式和反预期独立式。这两种变体都能省略预期,这是常规关系、转喻、数量象似性和语言经济性协作的结果。

关键词：反预期信息结构信息单元认知语用机制

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“境遇剧”中的视听之辨及其美学意义

江西社会科学 2025年第02期 93-101页

作者：刘亚律江西师范大学叙事学研究院江西师范大学文学院

“境遇剧”是萨特存在主义美学与“介入”理论“合谋”的文学实践。起初，其倚重视觉以确证主体意识，随后对其能力心生怀疑，转而寻求通过听觉来确证主体身份，发掘身份认同中的听觉机制。萨特存在主义美学潜藏着由重“视”向重“听”... 详细信息

“境遇剧”是萨特存在主义美学与“介入”理论“合谋”的文学实践。起初，其倚重视觉以确证主体意识，随后对其能力心生怀疑，转而寻求通过听觉来确证主体身份，发掘身份认同中的听觉机制。萨特存在主义美学潜藏着由重“视”向重“听”转变的观念潜流。“想象”在主体意识进行选择时发挥决定作用，其中必然卷入各种声音的激荡碰撞。存在主义否定先在本质与决定论的实质是要求主体倾听内心的召唤，提升自己鉴别他者声音的能力。

关键词： “境遇剧” 视觉听觉主体意识

氮氧锚定的单原子铜掺杂石墨烯作为碱离子电池负极的理论预测研究

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物理学报 2025年第3期74卷 79-89页

作者：胡军平梁丝思段惠贤田俊程陈硕戴柏杨黄春来刘宇吕营万利佳欧阳楚英南昌工程学院南昌市光电转换与储能材料重点实验室南昌330099 南昌工程学院理学院南昌330099 江西师范大学物理系计算材料物理实验室南昌330022

合理设计高容量的新型电极材料是进一步提高离子电池能量密度的关键.石墨烯曾被认为是离子电池负极材料最有前景的候选者之一,然而因纯的石墨烯与相应离子的相互作用较弱,导致其理论比容量都不高.基于此,本文通过第一性原理评估氮氧(N,O... 详细信息

合理设计高容量的新型电极材料是进一步提高离子电池能量密度的关键.石墨烯曾被认为是离子电池负极材料最有前景的候选者之一,然而因纯的石墨烯与相应离子的相互作用较弱,导致其理论比容量都不高.基于此,本文通过第一性原理评估氮氧(N,O)锚定的单原子铜掺杂石墨烯的二维材料Cu/NO_(2)G作为锂/钠/钾离子电池负极的可行性.计算结果显示,Cu/NO_(2)G在热力学和动力学上都是稳定的,在吸附Li/Na/K前后均保持良好导电性,并且Cu/NO_(2)G储存Li/Na/K的理论比容量分别高达1639.9 mAh/g,2025.8 mAh/g,1157.6 mAh/g,在Li/Na/K嵌入的过程中,其晶格常数变化微小(<1%),这预示着其循环稳定性能佳.此外,Li,Na,K在Cu/NO_(2)G表面上的迁移势垒分别为0.339 eV,0.209 eV和0.098 eV,表明其具有优异的倍率性能.综上所述,本文结果为合理设计金属单原子掺杂石墨烯作为碱金属离子电池的新型负极材料奠定了坚实的理论基础.本文数据集可在https://***/10.57760/sciencedb.j00213.00063中访问获取.

关键词：第一性原理离子电池石墨烯掺杂

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链格孢菌Alternaria alternata化学成分及其下调TMSB10活性研究

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中国中药杂志 2025年第1期50卷 139-145页

作者：王兰张暖袁涛江西师范大学健康学院江西南昌330022 江西师范大学生命科学学院江西南昌330022

该文对链格孢菌Alternaria alternata大米发酵的次级代谢产物及下调胸腺素β10(thymosin beta 10,TMSB10)蛋白表达活性进行研究。采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20柱色谱和半制备高效液相色谱等多种色谱分离技术对***的次级代谢产物进行... 详细信息

该文对链格孢菌Alternaria alternata大米发酵的次级代谢产物及下调胸腺素β10(thymosin beta 10,TMSB10)蛋白表达活性进行研究。采用硅胶柱色谱、Sephadex LH-20柱色谱和半制备高效液相色谱等多种色谱分离技术对***的次级代谢产物进行分离纯化,并通过核磁共振波谱(NMR)、红外光谱(IR)和高分辨电喷雾电离质谱(HR-ESI-MS)等波谱技术及文献数据比对方法,共鉴定出10个化合物,包括2个新化合物:(1S,3S)-2,3-dihydro-3,6-dihydroxy-8-methoxy-1-methylcyclopenta[c][2]benzopyran-5(1H)-one(1)、3,3a,6-trihydroxy-8-methoxy-1-methyl-2,3,3a,9b-tetrahydrocyclopenta[c]isochromen-5(1H)-one(2)和8个已知化合物:alternariol 9-methyl ether(3)、1-deoxyrubralactone(4)、(3aR)-3,3a-dihydro-1,6-dihydroxy-8-methoxy-3a-methylcyclopenta[c][2]benzopyran-2,5-dione(5)、altechromone A(6)、alternariol(7)、altenuene(8)、altenusin(9)、3′-hydroxyalternariol 5-O-methyl ether(10)。对分离得到的化合物进行TMSB10蛋白表达影响实验,发现化合物7对TMSB10蛋白表达有明显的下调作用,抑制率达40.5%。结果表明***中的苯并吡喃酮类化合物具有下调TMSB10蛋白表达的活性,为抗非小细胞肺癌的研究提供了一定的理论依据和科研价值。

关键词：链格孢菌苯并吡喃酮 TMSB10 非小细胞肺癌

加入区域贸易协定能提升我国制造业产业链韧性吗?——基于中国—东盟自贸区的实证研究

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经济社会体制比较 2025年第1期 41-53页

作者：黄信灶万水梦龚美欣江西师范大学区域发展研究院江西师范大学国际教育学院

我国通过加入各类区域贸易协定以分散欧美等国家对我国制造业产业链的影响,这种战略举措是否有效提升我国制造业产业链韧性呢?文章以中国—东盟自贸区为例,研究其对我国制造业产业链韧性的影响及其作用机制。研究发现:中国—东盟自贸区... 详细信息

我国通过加入各类区域贸易协定以分散欧美等国家对我国制造业产业链的影响,这种战略举措是否有效提升我国制造业产业链韧性呢?文章以中国—东盟自贸区为例,研究其对我国制造业产业链韧性的影响及其作用机制。研究发现:中国—东盟自贸区是提升我国制造业产业链韧性的有效途径,主要体现在产业链的创新能力、抗波动能力和控制能力的提升上。从国别异质性来看,东盟内经济发展水平较高的国家对我国制造业产业链韧性的提升作用更强;从产业技术强度来看,无论是低技术强度产业链,抑或是中高技术强度产业链的韧性均受到自贸区的正向影响,即具有全产业效应。中介机制表明自贸区通过贸易自由化提升我国制造业产业链韧性,目前主要表现在非关税减让方面,关税减让的作用未得到验证。

关键词：区域贸易协定中国—东盟自贸区产业链韧性贸易自由化关税减让

α-三氟甲基酮的合成及其脱氟转化反应研究进展（英文）

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有机化学 2025年第01期 86-103页

作者：曹素芳刘云云万结平江西师范大学化学与材料学院

α-三氟甲基酮是一类重要且功能多样的化合物.该类化合物通过碳-氟键官能化在有机合成中具有独特而有趣的应用,可用于合成具有结构多样的有机分子.综述了α-三氟甲基酮的合成及其脱氟官能化转化反应的研究进展.对于典型的反应,进行了反... 详细信息

α-三氟甲基酮是一类重要且功能多样的化合物.该类化合物通过碳-氟键官能化在有机合成中具有独特而有趣的应用,可用于合成具有结构多样的有机分子.综述了α-三氟甲基酮的合成及其脱氟官能化转化反应的研究进展.对于典型的反应,进行了反应机理方面的讨论,旨在为α-三氟甲基酮化学,包括它们本身以及由此衍生的产物合成提供参考.

关键词： α-三氟甲基酮合成方法合成应用脱氟串联反应

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鄱阳湖消落区湿地土壤磷形态分布特征及其影响因素

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环境科学学报 2025年第1期45卷 313-323页

作者：陈红梅张华曾欢程莉瑶熊佳欣江西师范大学地理与环境学院南昌330022 江西师范大学鄱阳湖湿地与流域研究教育部重点实验室南昌330022

消落区是水陆生态系统中物质、能量输移和转化的活跃地带.本文在鄱阳湖典型消落区湿地选择不同景观带(泥滩带、苔草带和南荻带),评价消落区不同景观带土壤磷形态与土壤理化性质的关系.结果表明,不同湿地土壤中各磷形态含量整体表现为***... 详细信息

消落区是水陆生态系统中物质、能量输移和转化的活跃地带.本文在鄱阳湖典型消落区湿地选择不同景观带(泥滩带、苔草带和南荻带),评价消落区不同景观带土壤磷形态与土壤理化性质的关系.结果表明,不同湿地土壤中各磷形态含量整体表现为***-Pi>NaOH-Pi>NaOH-Po>***-Pi>NaHCO_(3)-Pi>NaHCO_(3)-Po>***-Po>Residual-P>H_(2)O-Pi.消落区泥滩带中有机磷形态显著低于植被带,而无机磷形态则相反,这可能与植被生长对无机磷(Pi)的吸收,以及凋落物输入导致有机磷(Po)的积累有关.除***-Pi外,消落区南荻带和苔草带土壤磷形态并未表现出显著的差异.RDA结果表明,植被带土壤磷形态主要受土壤pH影响,其中全氮、有机质和pH与NaHCO_(3)-Po和NaOH-Po呈负相关关系;而泥滩带则主要受土壤全氮水平的影响,其中全氮、有机质与NaHCO_(3)-Pi和***-Pi呈正相关关系.相关分析表明Fe、Mn金属元素含量与NaOH-Pi呈显著正相关.消落区湿地土壤磷形态含量变化是景观差异、金属元素含量和土壤理化性质共同作用的结果.此外,相较于泥滩带,植被带提高了湿地土壤中等活性磷的含量,降低了稳定性磷含量,这表明湿地植被的存在促进了湿地土壤磷的循环.研究结果有助于明晰干湿交替控制下淡水湿地土壤磷转化过程,为淡水湿地保护和水环境治理提供依据.

关键词：鄱阳湖消落区磷形态分布驱动因子