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光照、温度对黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子代受精卵孵化效果的影响

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海洋科学 2018年第5期42卷 108-115页

作者：刘海林张志勇张志伟许津陈淑吟贾超峰祝斐孟乾江苏省海洋水产研究所江苏省鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

为了研究不同光照强度、温度对黑鲷(Acantho pagrusschlegelii)(♀)×真鲷(Pagrosomus major)(♂)杂交F1代受精卵孵化效果及仔鱼存活的影响,作者采用试验生态学的方法比较不同温度(16、18、20、22、24、26℃)下杂交鲷受精卵的孵化率、... 详细信息

为了研究不同光照强度、温度对黑鲷(Acantho pagrusschlegelii)(♀)×真鲷(Pagrosomus major)(♂)杂交F1代受精卵孵化效果及仔鱼存活的影响,作者采用试验生态学的方法比较不同温度(16、18、20、22、24、26℃)下杂交鲷受精卵的孵化率、畸形率、孵化时间、7日龄仔鱼的存活率;比较不同光照强度下(10、100、300、800、1500、4 000、10 000 lx)受精卵孵化率、畸形率、孵化时间;比较不同光照强度下(200、1 000、2 000、5 000、10 000、15 000、20 000 lx)7日龄仔鱼的存活率。结果表明:在盐度为22条件下,受精卵最高孵化率(34.00%)和最低畸形率(16.65%)的孵化温度为20℃;在16～26℃范围内,温度与孵化时间呈负相关,与7日龄仔鱼存活率也呈负相关。不同的光照强度对受精卵孵化率和孵化时间的影响不显著,孵化率为65.88%～71.88%;但大于800lx的光照会令畸形率上升(大于15.21%);另外,5000～10000lx的光照强度更适宜仔鱼生存,7日龄仔鱼存活率达到38%～40.75%。黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子代最佳孵化温度为20℃,最适光照强度为5 000～10 000 lx。

关键词：杂交鲷(Acantho pagrusschlegelii)(♀)×(Pagrosomus major)(♂) 受精卵光照温度

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斑石鲷和条石鲷线粒体基因组密码子使用分析

水产科学 2020年第5期39卷 702-709页

作者：孟乾张志勇张志伟张曹进陈淑吟祝斐贾超峰曹广勇江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

为研究石鲷科中斑石鲷和条石鲷线粒体基因编码序列密码子的使用模式和特性,进而探讨这2种鱼与其他水生动物的亲缘关系,以期为探讨2种鱼类间的近缘杂交育种、种质资源等研究提供理论依据。在美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中搜... 详细信息

为研究石鲷科中斑石鲷和条石鲷线粒体基因编码序列密码子的使用模式和特性,进而探讨这2种鱼与其他水生动物的亲缘关系,以期为探讨2种鱼类间的近缘杂交育种、种质资源等研究提供理论依据。在美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中搜索并下载斑石鲷、条石鲷、斑马鱼、金鼓鱼、黑鲷和真鲷6种鱼线粒体基因序列,以CodonW、SPSS等软件采用生物信息学方法对斑石鲷和条石鲷线粒体DNA编码蛋白质的基因序列进行分析,通过相对密码子使用度以及对密码子的偏好性和基因序列进行相关性和聚类分析,进而探讨其亲缘关系。研究结果表明,斑石鲷和条石鲷线粒体DNA编码蛋白质的基因偏爱使用AC结尾的密码子,UUC、ACC等密码子为斑石鲷和条石鲷线粒体DNA编码蛋白质基因的偏好性密码子。在基因序列及偏好密码子聚类中,斑石鲷与条石鲷、黑鲷与真鲷均首先聚为一类,亲缘关系最近,这与传统分类学一致;斑石鲷和条石鲷与斑马鱼的遗传距离最远,亲缘关系最远。

关键词：斑石鲷条石鲷线粒体DNA 密码子偏好性聚类分析

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池养黑鲷性逆转组织学观察

海洋科学 2017年第7期41卷 51-58页

作者：陈淑吟张志勇刘海林许津祝斐贾超峰张志伟任忠宏江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

黑鲷(Acanthopagrus schlegeli)为具性逆转的珍贵海产鱼类,其个体在第3龄期雄性转为雌性,但性逆转发生的详细过程尚不清楚。为了解黑鲷性腺逆转发生的过程,作者通过对池塘养殖黑鲷3~4龄期个体进行定期跟踪取样观察,结合组织切片显微检... 详细信息

黑鲷(Acanthopagrus schlegeli)为具性逆转的珍贵海产鱼类,其个体在第3龄期雄性转为雌性,但性逆转发生的详细过程尚不清楚。为了解黑鲷性腺逆转发生的过程,作者通过对池塘养殖黑鲷3~4龄期个体进行定期跟踪取样观察,结合组织切片显微检测性腺变化过程。结果显示:黑鲷性腺在繁殖前后变化趋势不同;繁殖期雌性个体约占15%;繁殖后至7月份是性腺由雄逆转为雌主要时期;8月份全部个体性腺外观表现为卵巢形式;到9月底,个别性腺的精巢组织又开始发育;到12月底样本性腺有雄性、雌性及雌雄同体同时发育3种形式。此外,分析了黑鲷性腺成熟系数与肝质量系数的周年变化趋势。研究获得了详细的3~4龄黑鲷性逆转发生过程及性逆转结果,并针对与先前报道的有关研究结果差异展开分析,为掌握不同海区黑鲷性逆转特性及育种研究提供了更多资料,也为雌雄同体鱼类资源利用研究提供新的参考依据。

关键词：黑鲷(Acanthopagrus schlegeli) 雌雄同体性逆转性腺系数肝脏系数

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大黄鱼种质遗传多样性研究进展

海洋通报 2017年第1期36卷 12-18页

作者：贾超峰刘海林许津张志勇张志伟陈淑吟祝斐江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

遗传多样性能有效反映大黄鱼的遗传变异,是评判其进化和适应能力的重要标志。目前有关大黄鱼种质遗传多样性的研究已取得丰富的成果;形态学、同工酶和DNA分子等相关研究的结果显示:大黄鱼遗传多样性较低,各群体间的遗传差异较小。综述... 详细信息

遗传多样性能有效反映大黄鱼的遗传变异,是评判其进化和适应能力的重要标志。目前有关大黄鱼种质遗传多样性的研究已取得丰富的成果;形态学、同工酶和DNA分子等相关研究的结果显示:大黄鱼遗传多样性较低,各群体间的遗传差异较小。综述了有关大黄鱼遗传多样性的研究进展,并就大黄鱼种群的划分、种质资源的管理和恢复问题作了探讨,以期为大黄鱼遗传育种和种质保护工作提供参考。

关键词：大黄鱼遗传多样性种群划分资源恢复

黑鲷、真鲷及其杂交子代基因编码区微卫星序列及密码子偏好性分析

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海洋与湖沼 2019年第5期50卷 1108-1115页

作者：曹广勇张志勇张志伟陈淑吟祝斐贾超峰陈自强曾海峰汤晓建上海海洋大学水产与生命学院上海201306 江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室南通226007

本研究采用生物信息学方法分析比较了黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区(Codingsequence,CDS)中微卫星序列(简单重复序列,SSR)的分布规律及密码子偏好性。结果表明:(1)黑鲷、真鲷及其两种杂交子代微卫星序列均以三碱基重复类型为主... 详细信息

本研究采用生物信息学方法分析比较了黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区(Codingsequence,CDS)中微卫星序列(简单重复序列,SSR)的分布规律及密码子偏好性。结果表明:(1)黑鲷、真鲷及其两种杂交子代微卫星序列均以三碱基重复类型为主,其次为二碱基重复,片段长度大多数在12 20bp之间。(2)黑鲷与反交(黑鲷♀×真鲷♂)在三、五碱基中优势基元类型相同,真鲷与正交(真鲷♀×黑鲷♂)在三碱基中优势基元类型相同,而黑鲷与正交在四碱基中优势基元类型相同。(3)UUC、UAC等28个密码子为黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区的偏好性密码子,偏爱使用以C或G结尾的密码子,且第三位密码子碱基的GC含量(GC3s)均高于基因编码区平均GC含量。(4)真鲷与正交的密码子使用的偏好性相似,一定程度上说明黑鲷、真鲷杂交子代偏母系遗传。分析结果将为研究鲷科鱼类微卫星标记、研究其群体遗传多样性、构建转基因表达系统和开展分子遗传育种提供理论基础。

关键词：黑鲷真鲷 CDS序列微卫星密码子偏好性

黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子二代仔鱼早期发育及饥饿不可逆点

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南方水产科学 2018年第4期14卷 122-128页

作者：陈淑吟张志勇许津吉红九吴国均贾超峰祝斐孟乾江苏省海洋水产研究所江苏南通226007 江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

以黑鲷(Acanthopagrus schlegelii♀)×真鲷(Pagrus major♂)杂交子一代为亲鱼,于2017年4月在水温(21.8±0.4)℃条件下,对自然受精、人工孵化获得的杂交子二代(F_2)早期仔鱼进行发育观察,并就饥饿对仔鱼早期生长与存活的影响及不可逆点(... 详细信息

以黑鲷(Acanthopagrus schlegelii♀)×真鲷(Pagrus major♂)杂交子一代为亲鱼,于2017年4月在水温(21.8±0.4)℃条件下,对自然受精、人工孵化获得的杂交子二代(F_2)早期仔鱼进行发育观察,并就饥饿对仔鱼早期生长与存活的影响及不可逆点(point of no return,PNR)进行研究。结果表明,杂交F_2初孵仔鱼全长(2.40±0.15)mm,仔鱼3日龄开口摄食,混合营养期4~5 d,7日龄全长增长到(3.95±0.04)mm,生长态势正常;杂交F_2仔鱼开始摄食的初次摄食率及最高摄食率分别为45.8%及77.21%,6日龄时初次摄食率下降为29.83%,抵达PNR时间;饥饿仔鱼5日龄时负生长,全长与对照组有显著差异(P研究表明杂交F2早期仔鱼具有较好的生长态势;其开始投饵的最适时机应于仔鱼开口后的3 d内。

关键词：黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子二代仔鱼初次摄食率不可逆点

黑鲷 ×真鲷杂交子代回交繁育及子代早期发育观察

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水产科学 2017年第6期36卷 693-699页

作者：陈淑吟张志勇刘海林贾超峰许津祝斐张志伟任忠宏江苏省海洋水产研究所江苏南通226007 江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

为筛选获得类型丰富、具杂交优势的海水养殖新品种,在黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子代养殖成功的基础上,于2016年4—5月,挑选经强化培育的杂交子代(♂)及黑鲷(♀)为亲鱼(雌雄配比1∶1),养于室内同一水泥池,水温16~20℃,盐度23~25,收集同步... 详细信息

为筛选获得类型丰富、具杂交优势的海水养殖新品种,在黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子代养殖成功的基础上,于2016年4—5月,挑选经强化培育的杂交子代(♂)及黑鲷(♀)为亲鱼(雌雄配比1∶1),养于室内同一水泥池,水温16~20℃,盐度23~25,收集同步发育的自然受精卵进行孵化,采用显微摄像观察,记录回交子代胚胎和早期仔鱼的发育时序与形态特征。试验结果显示,回交子代的受精卵孵化、胚胎及仔鱼发育正常;在水温18~20.2℃、盐度25、微充气的条件下,受精卵历时42.5h完成胚胎发育,仔鱼孵化出膜;初孵仔鱼全长为2.08~2.45mm;在水温18~21.8℃、盐度23~25的条件下,经过约4d时间,仔鱼卵黄囊消失,完成早期仔鱼发育阶段。试验表明,黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交子代的可育性,也为进一步的鲷科优良品种选育提供更多基础资料。

关键词：黑鲷(♀)×真鲷(♂)杂交回交胚胎发育早期仔鱼

鲈形目TLR1和TLR9基因的选择压力分析

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南京师大学报（自然科学版） 2022年第3期45卷 68-78页

作者：刘兴高波吉红九贾超峰祝斐孟乾陈淑吟张志勇徐士霞南京师范大学生命科学学院江苏省生物多样性重点实验室江苏南京210023 江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

鲈形目(Perciformes)是鱼类中物种丰富度最高的一个目,分布在多个水域,在渔业经济发展中占据着重要地位.然而,高密度的养殖模式加剧了病原微生物引起的鱼类病害.Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是先天免疫中的重要蛋白质分子,在... 详细信息

鲈形目(Perciformes)是鱼类中物种丰富度最高的一个目,分布在多个水域,在渔业经济发展中占据着重要地位.然而,高密度的养殖模式加剧了病原微生物引起的鱼类病害.Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是先天免疫中的重要蛋白质分子,在病毒以及细菌防御中起重要作用.本文以TLR1和LTR9为候选基因,共下载了鲈形目17个代表物种的同源序列,通过进化分析探讨该目物种先天性免疫的分子进化基础.选择压力分析发现TLR1、TLR9基因中分别有16和8个正选择位点被两种方法同时检测到,且86%的位点位于蛋白质富含亮氨酸重复序列(Leucine rich repeat,LRR)结构域.上述结果提示鲈形目物种面临较高的病原微生物感染的挑战,而这些正选择位点可能导致基因进化出重要的功能改变以抵抗病原体的侵袭.另外,Free-ratio以及Branch-site模型检测发现基因的正选择具有物种特异性,如TLR1在鲷科的最近共同祖先支以及鲈科最近共同祖先支等受到显著正选择,TLR9也在鲷科的最近共同祖先支受到显著正选择,且这些谱系被报道经常受到病原体的威胁,因此,鲈形目多个谱系受到正选择可能是在长期抵抗病原微生物侵袭中进化的结果.以上研究结果表明,在长期抵御病原微生物过程中,鲈形目物种的TLR1、TLR9基因可能发生了适应性功能改变.

关键词：鲈形目 TLR1 TLR9 适应性进化先天性免疫

黑鲷ELO基因编码蛋白结构与功能的生物信息学分析

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生物技术进展 2021年第3期11卷 344-352页

作者：许广平张志勇任忠宏张志伟江苏省海洋水产研究所江苏省海水鱼类遗传育种重点实验室江苏南通226007

黑鲷是一种抗逆性强的海水经济鱼类,但在长江以北无法在室外自然越冬,每年进行室内越冬又耗时耗力。为了培育黑鲷耐低温品系,探究黑鲷低温耐受的分子机制,研究了黑鲷脂肪酸延长酶(fatty acid elongase,ELO)基因编码蛋白的结构和功能。首... 详细信息

黑鲷是一种抗逆性强的海水经济鱼类,但在长江以北无法在室外自然越冬,每年进行室内越冬又耗时耗力。为了培育黑鲷耐低温品系,探究黑鲷低温耐受的分子机制,研究了黑鲷脂肪酸延长酶(fatty acid elongase,ELO)基因编码蛋白的结构和功能。首先,运用DNAman 8软件对黑鲷、金头鲷、鱖鱼、斜带石斑鱼、鲤鱼等5种鱼类的ELO蛋白进行氨基酸序列比对,分析其同源性和进化关系;随后,利用生物信息学工具对黑鲷ELO蛋白的理化性质、亚细胞定位、信号肽、跨膜区、剪切位点、蛋白磷酸化、糖基化、二级结构、结构域、分子功能及蛋白质相互作用等进行分析,并进行同源建模与三维结构预测。氨基酸序列比对结果显示,黑鲷与其他鱼类之间序列的同源性较高,在所分析的5种鱼类中,黑鲷与金头鲷亲缘关系最近,与鲤科鱼类亲缘关系最远。生物信息学分析结果表明,ELO蛋白为碱性、小分子、稳定、非分泌型亲水蛋白质,亚细胞定位于细胞质、细胞核和线粒体;该蛋白质中存在22个剪切位点、19个磷酸化位点和9个赖氨酸糖化作用位点,没有糖基化位点和信号肽;其包含多种二级结构,其中以α-螺旋为主,存在1个结构域及7个跨膜区域;ELO蛋白与其他10个蛋白质可能存在直接的相互作用关系,有可能影响雌激素合成。通过对黑鲷ELO基因编码蛋白结构与功能的生物信息学分析,初步判定其与低温耐受相关。研究结果为黑鲷耐低温品系选育提供了基础理论依据。

关键词：黑鲷脂肪酸延长酶基因生物信息学