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红叶李叶色转录组测序及分析

分子植物育种 2024年

作者：吴玲徐秋霞黄欣郭聪李玉娟江苏沿江地区农业科学研究所

红叶李是当今中国园林绿化中应用较为广泛的一种彩叶苗木，为了探索红叶李突变体转色期叶色相关的关键调控基因和分子调控机制。本研究以红叶李突变体L0630转色期3种不同颜色叶片为实验材料，利用高通量测序对叶片进行测序和数据组装，... 详细信息

红叶李是当今中国园林绿化中应用较为广泛的一种彩叶苗木，为了探索红叶李突变体转色期叶色相关的关键调控基因和分子调控机制。本研究以红叶李突变体L0630转色期3种不同颜色叶片为实验材料，利用高通量测序对叶片进行测序和数据组装，对拼接所得unigene进行功能注释和分类，对不同叶色中差异表达的基因进行分析。通过测序拼接获得unigenes 35 811个，功能注释到29 879个unigenes，功能未知的有5 932个。测序共计获得DEGs 7 097个，其中RL vs PL比较组有6 639个，RL vs GL比较组3 601个。通过GO和KEGG富集分析对DEGs进行功能探究，结果表明DEGs富集到细胞壁、胞质溶胶和染色体等位置，参与了碳水化合物代谢过程和脂质代谢过程，主要的分子功能是氧化还原酶活性和激酶活性方面，参与的最主要的是次生代谢物的生物合成途径。DEGs中筛选出与花青素和叶绿素代谢相关差异表达基因共计有148个，其中与花青素合成代谢相关的DEGs有112个，与叶绿素代谢相关的DEGs有36个。进一步分析筛选得到20个在RL和PL中均高倍数上调表达且与花青素合成代谢相关的DEGs，4个在RL和PL中高倍数下调表达且叶绿素代谢合成相关的基因。表达量排名在前的分别是与花青素合成代谢相关的bHLH086转录因子和PAL结构基因，与叶绿素合成降解有关的WRKY 49和GATA 18转录因子，进而推测其可能参与红叶李叶色变化调控。本研究提供了红叶李转色期的转录组信息并分析了其变化情况，为后续研究叶色变化的分子机制、色素合成代谢通路及关键基因克隆验证提供进一步理论参考。

关键词：红叶李转录组转色期差异表达

基于转录组测序的薄皮甜瓜果实含糖量差异基因分析

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分子植物育种 2024年

作者：王曼曼闫洪朗冯路路王奎山王康江苏沿江地区农业科学研究所

为了更好地挖掘甜瓜的基因组信息，解析甜瓜果实糖代谢的相关分子机制，本研究以高糖度的薄皮甜瓜高代自交系1503为材料，借助Illumina HiSeq测序平台对糖分积累不同时期(授粉后16 d和32 d)的甜瓜果实进行高通量的转录组测序，并利用生... 详细信息

为了更好地挖掘甜瓜的基因组信息，解析甜瓜果实糖代谢的相关分子机制，本研究以高糖度的薄皮甜瓜高代自交系1503为材料，借助Illumina HiSeq测序平台对糖分积累不同时期(授粉后16 d和32 d)的甜瓜果实进行高通量的转录组测序，并利用生物信息学等知识对其进行了分析。对测序数据进行从头组装和严格的质控，共获得270 291 330个clean reads和40.53 Gb高质量碱基，并筛选出5 657个差异表达基因(DEGs)，其中有2 288个基因上调表达，3 369个基因下调表达。GO富集结果显示，差异基因与细胞糖代谢和生物合成等功能显著相关。KEGG富集分析显示，5 657个DEGs共关联到135条代谢通路，在其中富集程度较高的淀粉蔗糖代谢通路中，筛选出4个和蔗糖代谢直接相关的差异基因MELO03035、MELO10423、MELO28069和MELO04606，它们在一定程度上可以调控果实发育过程中蔗糖的合成和积累。本研究结果为进一步解析薄皮甜瓜糖代谢分子机制以及甜瓜种质资源创新提供了科学依据。

关键词：薄皮甜瓜转录组测序糖代谢差异表达基因

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乡土植物蜀葵的应用价值研究进展

分子植物育种 2024年

作者：徐秋霞吴玲黄欣曹凡王莹郭聪柯裴蓓陈燕谷青青李玉娟江苏沿江地区农业科学研究所

蜀葵(Alcea rosea)为锦葵科多年生草本植物，原产于中国西南地区，具有突出的药食用价值、观赏性、生态适应性，是极具开发潜力的中国乡土植物之一。蜀葵在中国种质资源虽然比较丰富，但对其深入研究仍相对较少，主要集中于应用价值方... 详细信息

蜀葵(Alcea rosea)为锦葵科多年生草本植物，原产于中国西南地区，具有突出的药食用价值、观赏性、生态适应性，是极具开发潜力的中国乡土植物之一。蜀葵在中国种质资源虽然比较丰富，但对其深入研究仍相对较少，主要集中于应用价值方面，作为药食同源植物的蜀葵在食品、药品开发中应用程度也不高。基于此，本研究从蜀葵的应用价值方面着手，对蜀葵的药用价值(抗氧化，抑菌，抗炎等作用)、食用价值、观赏价值(园林应用，插花应用)、生态价值(耐重金属性，耐盐性)等多方面展开文献梳理，分析了蜀葵多方面的推广利用价值，对蜀葵观赏价值和药食用价值方面提出了需要深化研究的建议，为今后深入研究蜀葵植物，促进蜀葵的药用、食用、观赏、生态价值的开发利用提供一定参考。

关键词：蜀葵观赏价值药用价值生态价值食用价值

基于全长转录组的蚕豆WRKY基因家族分析及耐盐胁迫相关候选基因挖掘

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江苏农业学报 2024年第1期40卷 14-30页

作者：周恩强周瑶姚梦楠王学军赵娜缪亚梅王永强薛冬李波汪凯华顾春燕魏利斌江苏沿江地区农业科学研究所江苏南通226012

WRKY基因是植物特有的转录因子基因,能够调控植物的生长发育和胁迫响应。为了鉴定蚕豆WRKY基因家族成员,揭示其进化关系并挖掘与盐胁迫相关的候选WRKY基因,本研究在完成蚕豆全长转录组测序(9个样品)和二代转录组测序(27个样品)的基础上... 详细信息

WRKY基因是植物特有的转录因子基因,能够调控植物的生长发育和胁迫响应。为了鉴定蚕豆WRKY基因家族成员,揭示其进化关系并挖掘与盐胁迫相关的候选WRKY基因,本研究在完成蚕豆全长转录组测序(9个样品)和二代转录组测序(27个样品)的基础上,利用生物信息学方法对WRKY转录因子基因进行鉴定与分析,并通过拟南芥同源基因比对挖掘盐胁迫相关的候选VfWRKY基因。结果表明,蚕豆全长转录组测序共获得53.84 Gb数据量,通过比对和校正最终获得58885条转录本序列信息;基于蚕豆全长转录组共鉴定出113个WRKY家族成员,氨基酸数目为153~737 aa,等电点为4.84~9.87,113个WRKY家族蛋白质全部定位于细胞核中;根据拟南芥WRKY家族系统发育特征,VfWRKY基因家族可分为3组,分别为group 1(38个VfWRKY)、group 2(61个VfWRKY)、group 3(14个VfWRKY);Motif 1和Motif 3是VfWRKY基因家族的特征基序,并对应WRKY保守结构域,在进化过程中较为保守;VfWRKY基因家族主要富集在植物MAPK信号通路、植物与病原菌相互作用和剪接体3个通路中;通过同源比对,在蚕豆中发现14个盐胁迫相关候选WRKY基因,且主要在根中高表达。该研究结果为蚕豆的遗传学研究提供了丰富的参考数据,也为创制耐盐蚕豆新品种提供了基因信息。

关键词： WRKY基因蚕豆全长转录组盐胁迫进化分析

不同干燥方式对羊肚菌品质特性及复水性能的影响

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农业工程学报 2024年

作者：马佳佳董明辉全鑫瑶邵千朔金梅娟王毓宁江苏太湖地区农业科学研究所

为探究羊肚菌在不同干燥方式及复水后的品质变化与成因，以六妹羊肚菌为试材，采用自然干燥（natural drying,ND），恒温干燥（constant temperature drying,CTD），真空冷冻干燥方式（vacuum freeze-drying,VFD）对羊肚菌进行干制，探... 详细信息

为探究羊肚菌在不同干燥方式及复水后的品质变化与成因，以六妹羊肚菌为试材，采用自然干燥（natural drying,ND），恒温干燥（constant temperature drying,CTD），真空冷冻干燥方式（vacuum freeze-drying,VFD）对羊肚菌进行干制，探讨3种干燥方式对微观结构、滋味、营养品质及复水性能的影响，并研究羊肚菌复水前后质地、色泽、风味的差异分析，分析判断不同方式的干燥特性。结果表明：VFD羊肚菌氨基酸、粗多糖与甜味值分别为944 mg/100 g、6.26 g/100 g、19.73，显著（P地区分。VFD由于其孔隙均匀分布的疏松状微观结构保持最佳的复水比，低场核磁共振(low-field nuclearmagnetic resonance,LF-NMR)结合核磁共振成像(magnetic resonance imaging,MRI)分析结果显示VFD羊肚菌在复水20 min内不易流动水显著增加，复水速率快速上升，复水均匀性最好。VFD复水后菌柄与菌盖色差（△E）分别为12.28和11.47，显著（P研究结果为羊肚菌干制品加工方式优选提供参考。

关键词：羊肚菌干燥方式复水性能感官品质营养品质

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甘薯抗性淀粉研究进展

中国粮油学报 2024年第3期39卷 201-208页

作者：赵凌霄赵冬兰戴习彬周志林曹清河江苏徐淮地区徐州农业科学研究所徐州221131

甘薯是重要的淀粉作物,其块根中抗性淀粉(RS)含量较高,具备良好的产品开发潜力。要进一步促进甘薯RS的应用和推广,不仅需要筛选或培育出RS含量更高的甘薯品种,还需要加大开发甘薯深加工淀粉产品。除调控淀粉合成相关基因的表达外,生产... 详细信息

甘薯是重要的淀粉作物,其块根中抗性淀粉(RS)含量较高,具备良好的产品开发潜力。要进一步促进甘薯RS的应用和推广,不仅需要筛选或培育出RS含量更高的甘薯品种,还需要加大开发甘薯深加工淀粉产品。除调控淀粉合成相关基因的表达外,生产实际中还可通过调整栽培措施等方式提高甘薯RS的含量。通过化学修饰法、物理法和酶解法等方法可制备甘薯RS产品,也能提高产品中RS的含量。本文系统综述了近年来甘薯淀粉的保健效果、RS含量的测定方法、影响甘薯淀粉中RS含量的因素、RS的制备方法及其特性等方面的进展,为未来甘薯中RS的制备、产量提高、产品开发和推广提供参考。

关键词：甘薯抗性淀粉含量测定淀粉特性制备方法

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黑水虻油的饲用价值及其在饲料中的应用研究进展

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饲料研究 2024年第7期47卷 157-162页

作者：黄欣徐秋霞吴玲谷青青曹凡江苏沿江地区农业科学研究所江苏南通226002

黑水虻(Hermetia illucens L.)作为一种腐食性昆虫,可将动物粪便、厨余垃圾、植物残体等有机废弃物转化为自身营养,从而实现资源的绿色高效转化。黑水虻幼虫尤其是脱脂虫粉是优质的饲料蛋白来源,目前有关黑水虻饲料化的研究大多集中在... 详细信息

黑水虻(Hermetia illucens L.)作为一种腐食性昆虫,可将动物粪便、厨余垃圾、植物残体等有机废弃物转化为自身营养,从而实现资源的绿色高效转化。黑水虻幼虫尤其是脱脂虫粉是优质的饲料蛋白来源,目前有关黑水虻饲料化的研究大多集中在蛋白质营养上,而对黑水虻油脂的相关研究较少。文章阐述了黑水虻油的主要组成,分析其作为饲料的营养价值,总结了影响黑水虻油品质的主要因素,综述了国内外利用黑水虻油代替传统饲料在畜禽、水产及其他动物养殖中的研究进展,提出了一些黑水虻油作为饲料的不足和改进方式,为充分挖掘黑水虻油的应用潜力提供参考。

关键词：黑水虻黑水虻油饲料畜禽养殖

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播期对黑塌菜主要农艺和品质性状的影响

北方园艺 2024年第5期 48-52页

作者：仇亮程玉静葛礼姣翟彩娇王小秋刘水东江苏沿江地区农业科学研究所江苏南通226541

以黑塌菜为试材,从9月5日开始每5 d设置一个播期处理,共设置7个,研究了不同播期对黑塌菜主要农艺和品质性状的影响,以期为黑塌菜标准化种植生产以及供应期延长提供参考依据。结果表明:播期对黑塌菜开展度、单株质量等主要农艺性状以及... 详细信息

以黑塌菜为试材,从9月5日开始每5 d设置一个播期处理,共设置7个,研究了不同播期对黑塌菜主要农艺和品质性状的影响,以期为黑塌菜标准化种植生产以及供应期延长提供参考依据。结果表明:播期对黑塌菜开展度、单株质量等主要农艺性状以及可溶性糖和叶绿素含量均有显著影响,对纤维素和粗蛋白含量影响较小。9月10日播期处理黑塌菜开展度与单株质量显著高于其他处理,9月15日播期处理黑塌菜叶柄长最长,9月20日播期处理黑塌菜叶片数最多,播期为9月5日和9月30日的黑塌菜生长指标显著低于9月10—20日,10月5日播期处理的黑塌菜单株质量低于100 g,已不符合产品标准。随着黑塌菜播期的推后,黑塌菜叶片和叶柄可溶性糖含量整体呈先下降后上升的趋势,9月20日播期处理的黑塌菜叶片和9月25日播期处理黑塌菜叶柄可溶性糖含量显著降低,9月30日播期处理黑塌菜叶片和10月5日播期处理黑塌菜叶柄可溶性糖含量显著升高。随着播种日期的推后,黑塌菜叶片叶绿素整体呈现先上升后下降的趋势,9月10日播期处理黑塌菜叶片叶绿素a、叶绿素b和叶绿素总量均最高,10月5日播期处理黑塌菜叶片叶绿素a、叶绿素b和叶绿素总量均最低。该试验表明,长江中下游地区黑塌菜适宜播期为9月中上旬至下旬,最迟播期为9月底。

关键词：黑塌菜播期农艺性状品质性状

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生物有机肥与生物质灰渣配施对连作甜瓜生长及土壤性质的影响

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土壤通报 2024年第5期 1386-1394页

作者：李青李其胜谢昶琰张苗陈川章安康孙春梅江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所

【目的】针对甜瓜连作障碍问题，探索绿色可持续且经济有效的缓解连作障碍策略与措施。【方法】设置化肥处理（NPK）、普通有机肥处理（OF）、生物有机肥处理（BIO）、含生物质灰渣的生物有机肥处理（BIOS）及生物有机肥与生物质灰渣配... 详细信息

【目的】针对甜瓜连作障碍问题，探索绿色可持续且经济有效的缓解连作障碍策略与措施。【方法】设置化肥处理（NPK）、普通有机肥处理（OF）、生物有机肥处理（BIO）、含生物质灰渣的生物有机肥处理（BIOS）及生物有机肥与生物质灰渣配施处理（BIO+S），通过盆栽试验研究不同施肥处理连续施用2季后对甜瓜生长以及连作土壤理化性状和酶活性的影响。【结果】与NPK和OF相比，连续施用生物有机肥（BIO）及其与灰渣配施处理（BIO+S）都能显著提高连作甜瓜植株的株高、最大叶片面积、鲜重和干重。与BIO相比，BIO+S处理不仅能够显著提高连作甜瓜植株的茎粗、鲜重和干重，还能明显提升连作土壤的有机质、速效钾含量和碱性磷酸酶活性。相关性分析和主成分分析表明土壤有机质、速效钾含量和碱性磷酸酶活性分别与甜瓜的鲜重、干重、茎粗等生长指标呈显著正相关，生物有机肥与灰渣配施处理在促进连作甜瓜生长和改良土壤性质方面的效果优于单施生物有机肥。【结论】生物有机肥配施灰渣能够有效促进连作甜瓜的生长，改善连作土壤养分含量状况和酶活性，从而缓解甜瓜连作障碍。

关键词：生物有机肥生物质灰渣甜瓜连作土壤理化性状土壤酶活性