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养殖海湾淤泥质海岸沉积物微塑料污染特征

环境科学 2024年第5期45卷 3078-3087页

作者：宋可心贺金成李昌文解思琦刘宝堃黄伟冯志华江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏海洋大学江苏省海洋生物产业技术联合创新中心江苏海洋大学自然资源部滨海盐沼湿地生态与资源重点实验室自然资源部第二海洋研究所海洋生态系统与生物地球化学重点实验室

微塑料污染是当前环境领域广泛关注的前沿问题,海洋环境介质微塑料污染广为报道,但深层沉积物中微塑料污染特征如何却鲜见报道.基于此,在典型养殖海域海州湾附近淤泥质海岸设置3个采样点,分析沉积物柱状样中微塑料污染特征.结果表明,该... 详细信息

微塑料污染是当前环境领域广泛关注的前沿问题,海洋环境介质微塑料污染广为报道,但深层沉积物中微塑料污染特征如何却鲜见报道.基于此,在典型养殖海域海州湾附近淤泥质海岸设置3个采样点,分析沉积物柱状样中微塑料污染特征.结果表明,该研究区域沉积物中微塑料丰度为(0.12±0.07)n·g^(-1),处于中等污染水平.沉积物柱状样中微塑料总和是表层5 cm沉积物中微塑料丰度的3.43~6.00倍.沉积物柱状样中微塑料丰度展现区域差异性,不同深度的沉积物中微塑料丰度不存在显著性差异,但随深度增加呈指数减少.沉积物含水率、深度和微塑料之间的关系表明,沉积物中微塑料丰度与沉积物物理性质有关.透明和黑色微塑料在各站位占比均最高,纤维是沉积物中最常见的微塑料形态,粒径小的微塑料占主体,微塑料材质的密度均不妨碍其出现在沉积物中.微塑料污染特征在不同深度沉积物中变化较大.

关键词：微塑料(MPs) 沉积物柱状样淤泥质海岸海州湾养殖海湾

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青蛤不同壳色个体间的生长及营养差异

水产学报 2022年第8期46卷 1458-1465页

作者：魏敏吴雨晨陈东张明月王亦我仉佳文仇攀宋杰董志国江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与生态环境重点实验室江苏省海洋生物技术重点实验室江苏海洋大学江苏省海洋生物产业技术协同创新中心

为了探究青蛤壳色性状与其生长和营养成分之间的关系，实验对青蛤不同壳色个体的生长指标及营养组分进行了测定分析。结果显示，青蛤紫壳个体(整体)的湿重、壳长、水管和鳃组织湿重占比显著高于白壳个体，青蛤紫壳个体(整体)的壳宽和外... 详细信息

为了探究青蛤壳色性状与其生长和营养成分之间的关系，实验对青蛤不同壳色个体的生长指标及营养组分进行了测定分析。结果显示，青蛤紫壳个体(整体)的湿重、壳长、水管和鳃组织湿重占比显著高于白壳个体，青蛤紫壳个体(整体)的壳宽和外套膜组织湿重占比极显著高于白壳个体。青蛤紫壳个体可食部分的粗脂肪和粗蛋白含量极显著高于白壳个体。紫/白壳个体的必需氨基酸与总氨基酸比值分别为37.46%和37.02%，且紫壳个体显著高于白壳个体；必需氨基酸与非必需氨基酸比值分别为67.72%和66.60%，且紫壳个体显著高于白壳个体，表明紫壳个体氨基酸平衡效果优于白壳个体，且均属于优质蛋白。紫壳个体和白壳个体中的单不饱和脂肪酸主要以棕榈酸为主，分别占可食部分脂肪酸总量的9.97%和9.85%，多不饱和脂肪酸主要以EPA和DHA为主，其中EPA分别占脂肪酸总量的6.64%和6.54%,DHA分别占脂肪酸总量的8.00%和8.51%。研究表明，紫/白壳个体间在生长和营养上均存在一定差异，且紫壳性状与其生长和营养存在一定正向关联关系，为利用紫壳性状作为遗传标记进行青蛤良种选育提供了理论依据。

关键词：青蛤壳色生长营养

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两侧对称动物左右不对称发生机制研究进展

遗传 2023年第6期45卷 488-500页

作者：邢超凡王闽涛王磊申欣江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室/江苏省海洋生物技术重点实验室连云港222005 江苏海洋大学江苏省海洋生物产业技术协同创新中心连云港222005

左右不对称是两侧对称动物的重要特征,其形成机制一直是发育生物学领域备受关注的科学问题之一。脊椎动物的左右不对称发生经过3个重要阶段:左右对称性的打破,左右不对称信号的建立和维持,以及左右不对称器官的形态发生。多数脊椎动物... 详细信息

左右不对称是两侧对称动物的重要特征,其形成机制一直是发育生物学领域备受关注的科学问题之一。脊椎动物的左右不对称发生经过3个重要阶段:左右对称性的打破,左右不对称信号的建立和维持,以及左右不对称器官的形态发生。多数脊椎动物在胚胎发育阶段依赖纤毛产生定向液流打破胚胎的左右对称性,随后建立Nodal-Pitx2左右不对称信号,最后由Pitx2等基因指导左右不对称器官的形态发生过程。无脊椎动物中存在不依赖纤毛介导的Nodal-Pitx不对称信号表达机制,甚至具有完全独立的左右不对称发育机制。本文结合最新的左右不对称器官发育机制的研究进展,综述了脊椎动物和无脊椎动物胚胎左右不对称的发生过程及相关基因和信号通路,有助于深入理解左右不对称器官发育的过程,以期为追溯左右不对称器官发育机制的起源演化提供参考。

关键词：两侧对称动物左右不对称发育起源演化

异育银鲫血清蛋白质图谱的构建及生物信息学分析

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水产科学 2023年第2期42卷 185-194页

作者：皮乔木王倩楠刘有华王伟霞安贤惠李福后江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏连云港222005

异育银鲫是国内淡水养殖的优良品种之一,近年来,其病害问题日趋严重,极大影响了养殖效益。鱼类在感染病害后,可引起血清中某些蛋白质的表达水平发生变化,因此通过筛选某些特异蛋白质,将其作为生物标记物,有助于鱼类病害的识别及防治。... 详细信息

异育银鲫是国内淡水养殖的优良品种之一,近年来,其病害问题日趋严重,极大影响了养殖效益。鱼类在感染病害后,可引起血清中某些蛋白质的表达水平发生变化,因此通过筛选某些特异蛋白质,将其作为生物标记物,有助于鱼类病害的识别及防治。利用蓝绿温和胶电泳结合色谱-质谱联用技术对异育银鲫血清蛋白质进行分离和鉴定,共鉴定成功721个血清蛋白质。生物信息学分析表明,这些蛋白质主要参与补体和凝血级联、代谢途径以及细菌感染途径等。本试验鉴定出多种非特异性免疫相关蛋白质,其中包含C3蛋白和α2-巨球蛋白,基于强度的绝对蛋白质定量分析表明,不同种类的补体C3蛋白和α2-巨球蛋白具有不同的表达量。部分潜在的血清标记物如血清转铁蛋白、肌酸激酶、α2-烯醇化酶以及补体因子Hf等在血清中均被成功鉴定。本试验结果可为异育银鲫血清蛋白质功能研究、蛋白质相互作用以及血清标记物筛选提供新的研究手段和方法,对于鱼类的疾病预防工作具有重要意义。

关键词：异育银鲫血清蛋白质组生物信息学

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海州湾潮间带沙蚕对沉积物微塑料的指示作用

环境科学 2021年第9期42卷 4341-4349页

作者：王嘉旋宋可心孙一鑫方涛李瑾祯张涛冯志华江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室连云港222005 江苏海洋大学江苏省海洋生物产业技术协同创新中心连云港222005 江苏海洋大学江苏省海洋生物技术重点实验室连云港222005

2018年7月于海州湾潮滩设置3个断面共9个站位,通过对海州湾潮滩沉积物中以及沙蚕体内微塑料的丰度和形态特征的研究,探讨了沙蚕体内微塑料的来源,以及沙蚕对潮滩沉积物微塑料的指示作用.结果表明,潮滩沉积物中微塑料的平均丰度为(0.49±... 详细信息

2018年7月于海州湾潮滩设置3个断面共9个站位,通过对海州湾潮滩沉积物中以及沙蚕体内微塑料的丰度和形态特征的研究,探讨了沙蚕体内微塑料的来源,以及沙蚕对潮滩沉积物微塑料的指示作用.结果表明,潮滩沉积物中微塑料的平均丰度为(0.49±0.17)n·g^(-1),处于国内近岸环境研究的较高水平.所有检测到的微塑料中,最为丰富的形态和颜色类型分别为纤维和黑灰色,材质以聚乙烯(polyethylene,PE)、聚酯纤维(polyester,PET)和聚苯乙烯(polystyrene,PS)为主.沙蚕中微塑料检出率为77.78%~86.67%,平均丰度为(6.68±2.21)n·ind^(-1),其丰度与个体质量显著正相关(r=0.42,P=0.002),个体质量1.5 g以上的沙蚕中微塑料丰度显著高于环境中的微塑料,存在与沉积物之间的微塑料交换,沙蚕作为沉积物中微塑料污染指示生物物种是可行的.

关键词：微塑料沙蚕潮滩沉积物海州湾指示生物

产高聚合度IMOs右旋糖酐酶菌株Cellulosimicrobium sp.Y1的筛选及酶学性质研究

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食品科技 2023年第3期48卷 8-16页

作者：徐颖颖张岩王焕宇林倩如苗庆珍卢静吕明生王淑军江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏省海洋生物技术重点实验室江苏海洋大学江苏连云港222005

右旋糖酐酶在制糖、医药、材料制备和生物技术等领域应用广泛。该研究从连云港羊山岛海域海泥样品中筛选分离出一株产右旋糖酐酶的菌株Cellulosimicrobium sp.Y1,对其生长、产酶条件、酶学性质以及酶解产物进行了研究:在pH7.0、温度30... 详细信息

右旋糖酐酶在制糖、医药、材料制备和生物技术等领域应用广泛。该研究从连云港羊山岛海域海泥样品中筛选分离出一株产右旋糖酐酶的菌株Cellulosimicrobium sp.Y1,对其生长、产酶条件、酶学性质以及酶解产物进行了研究:在pH7.0、温度30℃条件下生长最优。在10 g/L右旋糖酐T20、pH9.0、温度35℃条件下发酵36 h产酶量最高。该酶的最适作用温度和pH值分别为40℃和7.5。金属离子Mg^(2+)、Sr^(2+)、NH4+及低浓度的Li^(+)、Ca^(2+)、Mn^(2+)可以提高酶的活力,而Ni^(2+)、Zn^(2+)、K^(+)、Na+对该酶有不同程度的抑制作用。同时,吐温、乙醇、二甲基亚砜和尿素等有机溶剂对该酶的活力影响较小。右旋糖酐酶的分子质量约为55 ku,可以特异性地水解α-1,6糖苷键,其酶解产物中主要为异麦芽三糖和异麦芽五糖,酶解1 h的产物中,高聚合度的异麦芽五糖达到52.61%以上。该酶在食品加工和益生元的制备中具有应用前景。

关键词：右旋糖酐酶 Cellulosimicrobium sp 酶学性质聚合度异麦芽寡糖

石莼类菌孢素氨基酸的提取工艺及对副溶血弧菌的抑菌机理

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食品工业科技 2024年

作者：胡晓琪徐沈晨王思宇浦孟宣胥珍红马骁孙颖颖江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏省海洋生物产业技术协同创新中心江苏海洋大学

为探明石莼类菌孢素氨基酸（MAAs）的提取工艺及对副溶血弧菌的抑菌机理，本研究采用单因素和响应面优化试验，分析了液固比、提取温度和提取时间对石莼MAAs得率的影响，并对MAAs进行了硅胶柱层析分离以及HPLC和ESI-MS鉴定。通过扫描、... 详细信息

为探明石莼类菌孢素氨基酸（MAAs）的提取工艺及对副溶血弧菌的抑菌机理，本研究采用单因素和响应面优化试验，分析了液固比、提取温度和提取时间对石莼MAAs得率的影响，并对MAAs进行了硅胶柱层析分离以及HPLC和ESI-MS鉴定。通过扫描、荧光显微镜观察胞内核酸、蛋白质的泄露及DNA分解等分析MAAs对副溶血弧菌的抑菌机理。结果表明，石莼MAAs的最佳提取参数为液固比25:1 mL/g、提取温度40 ℃和提取时间118 min，制备到的MAAs得率为（179.34±3.91）mg/g。石莼MAAs明显破坏了副溶血弧菌的细胞膜，导致了胞内核酸和蛋白质泄露，并促使菌体内DNA发生分解。MAAs经硅胶柱层析分离获得2个组分，经鉴定组分H2为shinorine，其在石莼干粉末中含量可达10.32 mg/g。本研究为石莼MAAs的制备和副溶血弧菌的生物防治提供了技术参考。

关键词：石莼类菌孢素氨基酸提取工艺副溶血弧菌抑菌机制

利用核酸适配体封闭Tth DNA聚合酶突变体实现温启动一步法RT-qPCR

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中国生物工程杂志 2023年第4期43卷 51-58页

作者：张雅琪张建唐雨婷黄庆媛季璐卢辰罗志丹江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏省海洋生物产业技术协同创新中心连云港222005

目的:Tth DNA聚合酶是一种同时具备DNA聚合酶和逆转录酶活性的耐热型工具酶。为消除其在一步法逆转录-实时荧光定量PCR(reverse transcription-quantitative real-time PCR,RT-qPCR)反应时的非特异性扩增,筛选可在较低温度下抑制其活性... 详细信息

目的:Tth DNA聚合酶是一种同时具备DNA聚合酶和逆转录酶活性的耐热型工具酶。为消除其在一步法逆转录-实时荧光定量PCR(reverse transcription-quantitative real-time PCR,RT-qPCR)反应时的非特异性扩增,筛选可在较低温度下抑制其活性的核酸适配体,从而实现温启动一步法RT-qPCR。方法:在前期获得不依赖Mn2+的Tth DNA聚合酶突变体的基础上,检验四种DNA适配体及其对应的RNA适配体对Tth DNA聚合酶突变体的DNA聚合酶活性和逆转录酶活性的封闭效果以及解离温度,并通过分子对接模拟适配体与聚合酶的结合模式。结果:TQ21-11和TQ21-11-RNA两种适配体在40℃可有效抑制Tth DNA聚合酶的DNA聚合酶活性和逆转录酶活性,抑制率达到97%以上;两种适配体在50℃可几乎完全解离。这两种适配体均可用于温启动一步法RT-qPCR,其中TQ21-11-RNA的非特异性扩增更低。结论:利用TQ21-11和TQ21-11-RNA两种适配体在室温下封闭Tth DNA聚合酶突变体活性,可以实现温启动一步法RT-qPCR。

关键词：核酸适配体 Tth DNA聚合酶突变体温启动一步法RT-qPCR

日本囊对虾两种表型差异类型线粒体的全基因组比较

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水产学报 2023年第3期47卷 49-65页

作者：王攀攀谢姝敏于世豪陈昊邢超凡高焕阎斌伦江苏海洋大学江苏省海洋生物资源与环境重点实验室江苏省海洋生物技术重点实验室江苏海洋大学江苏省海洋生物产业技术协同创新中心江苏省海洋资源开发研究院(连云港) 江苏省农业种质资源保护与利用平台

为了分析日本囊对虾两种表型差异类型的系统发育关系，实验系统比较了两种类型线粒体全基因组的基因结构、遗传距离和密码子偏好性等特征。结果显示，两种类型线粒体基因组的基因重叠区、基因间隔和密码子等方面均存在差异。两种类型的... 详细信息

为了分析日本囊对虾两种表型差异类型的系统发育关系，实验系统比较了两种类型线粒体全基因组的基因结构、遗传距离和密码子偏好性等特征。结果显示，两种类型线粒体基因组的基因重叠区、基因间隔和密码子等方面均存在差异。两种类型的线粒体蛋白编码基因核苷酸序列的相似度为91.10%～95.00%，氨基酸序列的相似度为96.15%～100%。两种类型的A+T富集区的同源性只有82.60%，分歧度为15.40%，呈现高度遗传分化。日本囊对虾两种类型蛋白编码基因的核苷酸序列分歧度大于明对虾属和叉肢螯虾属，但氨基酸序列的分歧度小于后者。研究发现，基于cytb基因的种间遗传距离大于种内遗传距离的10倍；基于cox1基因的种间遗传距离分别为类型Ⅰ和类型Ⅱ的种内遗传距离的14.6倍和5.2倍。两种类型的nd1、nd4和nd5基因的Ka/Ks值大于1，表明受到正向选择。基于20种隶属9属的对虾线粒体基因组蛋白编码序列构建系统发育树，结果显示能有效区分各属对虾，其中日本囊对虾的两种类型首先聚类，再与宽沟对虾聚类。研究表明，日本囊对虾的两种表型差异类型基本达到物种水平，有必要进一步评估更多的性状差异，以提高两种囊对虾的特异性养殖技术。

关键词：日本囊对虾表型差异线粒体基因组序列分歧系统发育