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基于网络药理学、分子对接和分子动力学研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制

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国际生物医学工程杂志 2024年第4期47卷 364-374页

作者：王敏娟王婷翟西峰李杨曹磊胡佳薇陕西省疾病预防控制中心理化检验所西安西北大学生命科学学院陕西省生物医药重点实验室西安西安医学院药学院西安

目的通过网络药理学、分子对接和分子动力学方法研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制。方法查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和相关文献筛选杜仲-淫羊藿药对的活性成分, 应用TargetNet、SwissTargetPrediction、STITC... 详细信息

目的通过网络药理学、分子对接和分子动力学方法研究杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松的作用机制。方法查询中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和相关文献筛选杜仲-淫羊藿药对的活性成分, 应用TargetNet、SwissTargetPrediction、STITCH数据库筛选活性成分的作用靶点, 应用GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选骨质疏松的相关靶点, 利用Venny 2.1.0在线工具获取交集靶点。应用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析。使用Cytoscape 3.8.2软件构建网络图并进行网络特征分析以确定核心成分和关键靶点。使用R 3.6.3软件进行基因本体(GO)功能注释及京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。使用SYBYL-X 2.1.1软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。使用GROMACS 2021.6软件进行分子动力学模拟。结果筛选出杜仲-淫羊藿药对的活性成分47个, 作用靶点329个, 骨质疏松的相关靶点4 604个, 交集靶点210个。网络特征分析表明木犀草素、槲皮素、山柰酚、咖啡酸、金圣草黄素、松脂素是核心成分, 蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、类固醇受体辅激活因子(Src)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、丝裂原激活蛋白激酶8(MAPK8)、转录因子JUN是关键靶点。GO分析显示生物过程(BP)主要涉及细胞激素代谢过程、细胞内受体信号通路、对氧化应激的反应、激素代谢过程等, 细胞组分(CC)主要涉及膜筏、膜微结构域、膜区、转录因子复合体等, 分子功能(MF)主要涉及核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、激素结合等。KEGG分析表明"杜仲-淫羊藿"药对治疗骨质疏松的信号通路主要有破骨细胞分化相关通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路和MAPK信号通路等。分子对接显示核心成分能够准确结合在关键靶点蛋白的活性位点上, 分子动力学分析进一步验证了核心成分与关键靶点蛋白的结合稳定性。结论杜仲-淫羊藿药对治疗骨质疏松具有多成分、多靶点、多通路的特点, 为其临床用药奠定了理论基础。

关键词：网络药理学分子对接分子动力学杜仲淫羊藿骨质疏松

基于TCGA数据分析NEK2基因在恶性胸膜间皮瘤中的表达及预后意义

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右江医学 2024年第2期52卷 103-111页

作者：李锦松李彬刘如爱普元倩自加吉余敏熊伟大理大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室云南大理671000 云南省昆虫生物医药研发重点实验室云南大理671000 云南省高校临床生物化学检验重点实验室云南大理671000 云南大学生命科学学院生物化学与分子生物学实验室云南昆明650091

目的分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基... 详细信息

目的分析永不有丝分裂基因A相关激酶2(NEK2)基因在恶性胸膜间皮瘤(MPM)中的表达及预后意义。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库MPM基因表达数据、临床病理数据和生存状态数据;使用perl软件和R语言的limma、timeROC等程序包作NEK2基因在MPM中的差异分析、临床病理相关性分析、COX单因素和多因素分析以及基因富集分析,并绘制ROC曲线;利用TIMER2.0数据库分析MPM中NEK2表达与常见的免疫细胞浸润的相关性。选取12例MPM组织和6例非MPM胸膜组织,通过RT-qPCR的方法验证NEK2基因在MPM与非瘤组织中的表达情况。结果与正常肺组织相比,NEK2在MPM组织中高表达(P<0.001)。NEK2基因mRNA表达量与MPM淋巴结分期具有显著相关性(P<0.05);NEK2高表达与MPM患者预后不良相关(P<0.001);NEK2基因表达与MPM中B淋巴细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(P<0.05),并在细胞周期、DNA复制、剪接体、mRNA监测等通路显著富集。在收集到的病例样本中,与非MPM胸膜组织相比,NEK2基因在MPM组织中的表达量显著增高(P<0.01)。结论 NEK2在MPM组织中高表达,且NEK2在MPM中高表达提示预后不良,可能成为治疗MPM的潜在靶点。

关键词：恶性胸膜间皮瘤永不有丝分裂基因A相关激酶2 癌症基因组图谱预后生物信息学

应用组织芯片技术检测胃癌组织中PTEN、Survivin和p21ras蛋白的表达

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华中科技大学学报（医学版） 2006年第3期35卷 284-287页

作者：邓昊吴人亮陈莹周红艳黄萱刘丽江华中科技大学同济医学院基础医学院病理学系武汉430030 江汉大学医学与生命科学学院病理学与病理生理学教研室武汉430056

目的利用组织芯片技术观察胃癌组织Survivin蛋白、PTEN蛋白和p21ras蛋白的表达，探讨三者的相互关系及三者与胃癌病理学指标的相关性。方法收集江汉大学附属医院1988～2003年行胃癌根治性手术切除的、有完整病理学检查资料的标本140... 详细信息

目的利用组织芯片技术观察胃癌组织Survivin蛋白、PTEN蛋白和p21ras蛋白的表达，探讨三者的相互关系及三者与胃癌病理学指标的相关性。方法收集江汉大学附属医院1988～2003年行胃癌根治性手术切除的、有完整病理学检查资料的标本140例。构建胃癌组织芯片，采用免疫组织化学法检测PTEN蛋白（17A）、Survivin蛋白和p21ras蛋白（F132）在胃癌组织中的表达情况。结果构建420点和288点组织芯片2枚，140例胃癌中有118例符合分析要求（组织芯片利用率为84．3％）。PTEN阳性率为76．3％（90／118），Survivin阳性率为52．5％（62／118），p21ras阳性率为78．8％（93／118）。PTEN与患者年龄，肿瘤浸润深度、组织学分型相关（均P〈0.05）。Survivin与UICC淋巴结分期、组织学分型相关（均P〈0．05）。p21ras与年龄相关（P〈0．05）。PTEN与Survivin、PTEN与p21ras、Survivin与p21ras均呈正相关（均P〈0.05）。Cox回归模型多因素分析，UICC淋巴结分期与预后相关（P〈0．05）。结论 PTEN蛋白表达是推测进展期胃癌的分子标志物。Survivin蛋白表达是推测胃癌淋巴结转移及转移程度的分子标志物。PTEN及Survivin蛋白表达与胃癌组织学分型有关。PTEN及p21ras蛋白表达与胃癌患者年龄有关。PTEN蛋白、Survivin蛋白及p21ras蛋白在胃癌中呈正相关关系。UICC胃癌淋巴结分期是重要的预后指标。

关键词： PTEN蛋白 Survivin p21ras蛋白胃癌组织芯片

吉林省648例犬乳腺肿瘤病例的流行病学调查及其诊断

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中国兽医学报 2024年

作者：蔡桦林叶彦刘祥雨谢光洪郑慧华吉林大学动物医学学院谢博士动物医院浙江农林大学动物科技学院/动物医学学院

乳腺肿瘤作为犬常见的肿瘤类型，常发于老年雌性犬中，约50%为恶性。因其复发率高，导致患犬死亡率较高，对犬的生命健康造成了严重的威胁。为了解犬乳腺肿瘤在吉林省的流行情况，本研究在2019—2023年期间，于吉林省6个地区共采集648... 详细信息

乳腺肿瘤作为犬常见的肿瘤类型，常发于老年雌性犬中，约50%为恶性。因其复发率高，导致患犬死亡率较高，对犬的生命健康造成了严重的威胁。为了解犬乳腺肿瘤在吉林省的流行情况，本研究在2019—2023年期间，于吉林省6个地区共采集648例病历资料和信息，其中良性肿瘤280例，恶性肿瘤368例。通过临床检查、实验室诊断以及病理组织学诊断确诊为犬乳腺肿瘤，随后统计分析犬乳腺肿瘤的发病情况以及预后情况，最后分析确定犬的品种、年龄、绝育状态及发情情况、肿瘤大小、肿瘤数量、肿瘤位置与犬乳腺肿瘤的相关性。结果表明，648例犬乳腺肿瘤中，45例存在转移情况，5年内累计复发率为21.3%（138/648），且常见于第四对乳腺处；同时，犬乳腺肿瘤常见于未绝育的老年雌性犬，当犬发情次数超过3次后，发病率为49.54%（321/648），且其与犬的肿瘤大小、数量和位置有显著性关系。因此，作为人乳腺癌的最佳研究模型，本研究深入且全面地剖析导致犬乳腺肿瘤的主要因素，有望为探究其他肿瘤的临床危险因素、优化诊疗策略提供了极具价值的参考依据。

关键词：犬乳腺肿瘤流行病学诊断吉林省

腺样体扁桃体肥大相关B细胞免疫活化调控机制的研究进展

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生物医学转化 2024年第2期5卷 81-90页

作者：陈雯婧高瑞雨黄婧雯叶京英刘万里清华大学附属北京清华长庚医院耳鼻喉头颈外科清华大学临床医学院清华大学精准医学研究院北京102218 清华大学生命科学学院免疫研究所清华北大生命科学联合中心膜生物学全国重点实验室蛋白质科学教育部重点实验室北京市慢性病的免疫学研究重点实验室北京100084

B细胞通过其表面分布的B细胞受体(BCR)识别外界抗原,是机体产生保护性抗体与免疫记忆的关键步骤。B细胞免疫活化调控与诸多上呼吸道疾病是密切相关的。儿童常见疾病腺样体扁桃体肥大(ATH),其特征性病理本质为淋巴滤泡的增生,但其确切机... 详细信息

B细胞通过其表面分布的B细胞受体(BCR)识别外界抗原,是机体产生保护性抗体与免疫记忆的关键步骤。B细胞免疫活化调控与诸多上呼吸道疾病是密切相关的。儿童常见疾病腺样体扁桃体肥大(ATH),其特征性病理本质为淋巴滤泡的增生,但其确切机制尚未明确。本文综述静息态下维持B细胞存活的BCR滋养信号研究,阐述了B细胞免疫活化及产生快速高效免疫记忆的调控机制,尤其是活化早期分子事件,强调mIgG-tail对记忆性抗体应答的相关作用。B细胞活化调控过程出现异常可破坏免疫稳态平衡,导致疾病的发生。本文总结了B细胞免疫活化调控与ATH的机制关联,尝试探讨信号转导通路失调或突变对ATH的可能影响。旨在深入理解ATH的致病机理,以期挖掘潜在研究突破口,寻找ATH新的诊疗靶点。

关键词：腺样体扁桃体肥大 B细胞 B细胞活化 B细胞受体免疫突触

儿童肝移植受者重返重症监护室的危险因素分析

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中国医学科学院学报 2024年

作者：高磊青戚丽婷金晶顾燕芬陆晔峰上海交通大学医学院附属仁济医院护理部上海交通大学医学院附属仁济医院肝脏外科

目的探讨儿童肝移植受者重返重症监护室(ICU)的危险因素,为儿童肝移植术后临床决策提供参考。方法回顾性分析2019至2021年上海交通大学医学院附属仁济医院接受肝移植手术后所有转入ICU患儿的临床资料,统计住院期间重返ICU的情况,以及... 详细信息

目的探讨儿童肝移植受者重返重症监护室(ICU)的危险因素,为儿童肝移植术后临床决策提供参考。方法回顾性分析2019至2021年上海交通大学医学院附属仁济医院接受肝移植手术后所有转入ICU患儿的临床资料,统计住院期间重返ICU的情况,以及重返的原因。以1:3比例匹配未发生重返ICU的患儿作为对照组,比较两组患儿基本信息、移植后转出ICU当天的生命体征及各项实验室指标、免疫抑制剂种类及药物浓度等。采用多因素Logistic回归分析探讨儿童肝移植受者重返ICU的危险因素。结果儿童肝移植术后ICU重返率为4.36%,其中48 h内重返率为16.00%,主要原因包括呼吸系统并发症、腹腔感染和肝血管栓塞。多因素Logistic回归分析显示,术后输注红细胞(OR=4.554,95%CI=1.743～11.901,P=0.002)、高血尿酸(OR=1.005,95%CI=1.001～1.009,P=0.014)是重返ICU的危险因素;高舒张压(OR=0.922,95%CI=0.885～0.960,P<0.001)和高总蛋白水平(OR=0.937,95%CI=0.891～0.986,P=0.012)是重返ICU的保护因素。结论术后输注红细胞、高血尿酸水平是儿童肝移植受者重返ICU的独立危险因素。

关键词：肝移植儿童受者重返重症监护室危险因素

脂磷壁酸激活奶牛乳腺中NUPR1表达及分布研究

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核农学报 2024年第1期38卷 25-32页

作者：贺海健陈艳刘佩雯赵晓萱张勇张全伟董伟韬赵兴绪甘肃农业大学动物医学院甘肃兰州730070 甘肃省动物生殖生理及繁殖调控重点试验室甘肃兰州730070 甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃兰州730070

为了探究NUPR1基因在奶牛乳房炎中的表达及分布规律,通过构建脂磷壁酸(LTA)诱导奶牛乳腺上皮细胞(MAC-T)体外炎症模型,以奶牛核蛋白1(Nucleus Protein 1,NUPR1)基因为研究对象,利用免疫组织化学技术(IHC)测定NUPR1在患病奶牛乳腺组织中... 详细信息

为了探究NUPR1基因在奶牛乳房炎中的表达及分布规律,通过构建脂磷壁酸(LTA)诱导奶牛乳腺上皮细胞(MAC-T)体外炎症模型,以奶牛核蛋白1(Nucleus Protein 1,NUPR1)基因为研究对象,利用免疫组织化学技术(IHC)测定NUPR1在患病奶牛乳腺组织中的分布情况。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)及蛋白免疫印迹(WB)检测炎症相关因子、NUPR1基因及其上下游基因在奶牛乳腺炎组织及乳腺上皮细胞炎症模型中的表达规律。qRT-PCR和WB结果显示,IL-1β、IL-6、IL-8和TNF-α在乳腺病理组织及细胞炎症模型中均极显著上调表达(P病理乳腺组织及乳腺上皮细胞炎症模型中均显著或极显著上调表达(P病理进程中的调控机理提供了试验和理论基础。

关键词：核蛋白1(NUPR1) 奶牛乳房炎白介素脂磷壁酸(LTA)

胎儿性RNA结合蛋白p62在肝细胞癌中表达的意义

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中华病理学杂志 2003年第4期32卷 329-332页

作者：钱洪流陈守慧彭宣宪厦门大学医学院病理学教研室 361005 厦门大学第一临床学院病理科厦门大学生命科学学院

目的　探讨表达p6 2的肝癌组织的病理形态学特点 ,以及 p6 2与癌细胞增殖和转移等生物学特性的关系。方法　用免疫组织化学方法检测 4 0例原发性肝细胞肝癌 p6 2和Ki 6 7的表达。结果　p6 2阳性率是 6 7.5 % (2 7/ 4 0 ) ,其中 p6 2强... 详细信息

目的　探讨表达p6 2的肝癌组织的病理形态学特点 ,以及 p6 2与癌细胞增殖和转移等生物学特性的关系。方法　用免疫组织化学方法检测 4 0例原发性肝细胞肝癌 p6 2和Ki 6 7的表达。结果　p6 2阳性率是 6 7.5 % (2 7/ 4 0 ) ,其中 p6 2强阳性表达的 12例中 9例为肝癌病理学分级为Ⅲ级的病例。p6 2表达强阳性的癌组织往往间质有大量的纤维组织或有大片坏死癌细胞 ,其增殖活性也高 ,Ki 6 7标记指数为 2 8 3%± 15 1% ,与 p6 2表达阴性组 (7 5 %± 9 8% )比较 ,差异具有显著性意义 (t=3 0 87,P =0 0 0 5 ) ;5例有肺转移或腹腔淋巴结转移的病例 ,其中 3例p6 2表达强阳性。结论　p6 2的表达与癌细胞的增殖和转移有一定的关系。

关键词：胎儿 p62 肝细胞癌基因表达肿瘤细胞细胞增殖间质纤维组织

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非医学类专业开设公共卫生课程的调查

现代预防医学 2007年第10期34卷 1847-1848页

作者：刘燕群高莉王平 430056 湖北江汉大学医学与生命科学学院湖北江汉大学医学与生命科学学院武汉

[目的]评价本校在非医学类专业学生开设公共卫生课程的教学效果。[方法]采用问卷方式对非医学类专业的本科生进行了调查。[结果]通过对有效问卷283份的分析,在非医学生中开展公共卫生教育对提高学生预防疾病促进健康具有重要意义(认知达... 详细信息

[目的]评价本校在非医学类专业学生开设公共卫生课程的教学效果。[方法]采用问卷方式对非医学类专业的本科生进行了调查。[结果]通过对有效问卷283份的分析,在非医学生中开展公共卫生教育对提高学生预防疾病促进健康具有重要意义(认知达95.76%),但学生缺乏学习的主动性。[结论]我国高等学校必须强化公共卫生意识,深化教育改革,提高学生的综合素质。

关键词：非医学类公共卫生调查