检索结果-南通市图书馆

急性缺血性脑卒中预后预测研究中的应用进展：以机器学习预测模型为例

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国全科医学 2024年

作者：杜慧杰刘星雨徐明欢杨学智张慧琴莫佳丽卢依况杰南昌大学公共卫生学院流行病学教研室江西省预防医学重点实验室

急性缺血性卒中（AIS）具有高致残率、高致死率及高复发率等特点，给患者及社会造成沉重的负担。随着大数据时代的到来，预测模型在患者的诊治决策、预后管理以及卫生资源配置等方面的应用越来越多，其价值也愈发重要。机器学习方法是预... 详细信息

急性缺血性卒中（AIS）具有高致残率、高致死率及高复发率等特点，给患者及社会造成沉重的负担。随着大数据时代的到来，预测模型在患者的诊治决策、预后管理以及卫生资源配置等方面的应用越来越多，其价值也愈发重要。机器学习方法是预测AIS患者预后的重要方法之一，且已广泛应用。本文以机器学习方法为重点，就AIS预后预测研究的最新进展予以综述，并提出机器学习预测模型目前所面临的问题与挑战，为AIS患者预后结局早期评估与预测在方法上提供新的思路和参考。

关键词：缺血性卒中预后预测机器学习预测模型综述

炎性标志物与缺血性脑卒中患者预后关系的研究进展

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中华老年心脑血管病杂志 2024年第1期26卷 113-115页

作者：刘星雨卢依蔺冬梅刘金严淳饶庆雨况杰南昌大学公共卫生学院流行病学教研室、江西省预防医学重点实验室 330006

脑卒中是全球第二大死亡原因和主要残疾原因,具有高发病率、高致死率、高致残率和高复发率的特点,是全球范围的重大健康问题[1]。缺血性脑卒中(IS)是最常见的脑卒中类型,约占脑卒中病例的80%[2]。IS常见的不良预后结局包括功能残疾、死... 详细信息

脑卒中是全球第二大死亡原因和主要残疾原因,具有高发病率、高致死率、高致残率和高复发率的特点,是全球范围的重大健康问题[1]。缺血性脑卒中(IS)是最常见的脑卒中类型,约占脑卒中病例的80%[2]。IS常见的不良预后结局包括功能残疾、死亡、脑卒中再发和心血管事件,给患者及社会造成沉重的疾病负担。

关键词：卒中预后白细胞介素类基质金属蛋白酶类半乳糖凝集素3 生长分化因子15 轴突生长导向因子

临床流行病学研究中多因素分析时的变量选择方法

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华内科杂志 2024年第5期63卷 462-467页

作者：聂朦邬娜袁志权夏婷婷向颖李亚斐陆军军医大学(第三军医大学)军事预防医学系军队流行病学教研室临床流行病学和循证医学中心重庆400038 贵州医科大学公共卫生与健康学院环境污染与疾病监控教育部重点实验室贵阳561113

变量选择是多因素分析时必不可少的环节,在控制混杂因素或者使模型达到高预测性能方面起着至关重要的作用。目前常用的变量筛选方法主要分为数据驱动和知识驱动两大类别,不同的变量筛选方法在识别混杂因素的作用、适用条件方面各不相同... 详细信息

变量选择是多因素分析时必不可少的环节,在控制混杂因素或者使模型达到高预测性能方面起着至关重要的作用。目前常用的变量筛选方法主要分为数据驱动和知识驱动两大类别,不同的变量筛选方法在识别混杂因素的作用、适用条件方面各不相同。本文介绍了临床流行病学中常用的变量筛选方法,并分析了这些方法优势和局限性,尤其是详细介绍了基于“知识驱动”的变量筛选方法在因果推断的临床研究中识别混杂变量的重要性,是当前国际上提高多因素分析结果的准确性和因果推断有效性的重要手段之一。本文也指出了国内研究者采用的变量筛选方法和国际上高质量研究的差别,并对不同临床研究情况下的变量筛选方法提出了合理的建议,旨在帮助临床研究者更好地了解和选择合适的变量筛选方法,提高临床研究的质量。

关键词：变量选择混杂因素有向无环图效应改变法

肺腺癌ceRNA调控网络构建及AFAP1-AS1功能验证

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国胸心血管外科临床杂志 2024年第4期31卷 576-584页

作者：王会新李倩侯晓雯史新竹冯旭沈阳医学院公共卫生学院统计教研室沈阳110034 沈阳医学院公共卫生学院流行病学教研室沈阳110034

目的基于生物信息学方法构建肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)特异性长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,并分析肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1(actinfilament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1)在LUAD中的功能机制,以期为LUAD治疗靶点研究提供新的方向。方法从基因表达综合性基因库(GEO)中下载LUAD的基因芯片,并使用GEO2R在线软件筛选LUAD与正常组织之间具有差异表达的lncRNA和mRNA,并通过在线数据库预测其靶基因,构建ceRNA网络,并进行富集分析。在细胞实验中,对AFAP1-AS1进行基因敲除并构建siRNA,通过细胞转染法转染LUAD细胞A549。用CCK8、Transwell、划痕实验和流式细胞术实验检测细胞增殖、侵袭、迁移和凋亡的能力。结果在LUAD的芯片中共鉴定出6个差异表达lncRNA和494个差异表达的mRNA。ceRNA网络共涉及6个lncRNA、22个miRNA和55个mRNA。富集分析发现mRNA与癌症相关通路有关。在细胞实验中,敲除AFAP1-AS1可抑制细胞增殖、侵袭和迁移,且AFAP1-AS1促进细胞凋亡。结论本研究构建了一个lncRNA介导的ceRNA网络,这可能有助于进一步研究LUAD的作用机制。此外,通过细胞实验,本研究发现AFAP1-AS1有潜力作为LUAD的治疗靶点。

关键词：生物信息学肺腺癌竞争性内源RNA 长链非编码RNA 肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1

外周血炎症指标对晚期非小细胞肺癌合并慢性阻塞性肺疾病患者免疫治疗疗效的影响

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华医学杂志 2024年第18期104卷 1601-1609页

作者：毕周奎徐瑜郭亮张文静游雅婷李锦炜赵才林单亦凡夏婷婷李亚斐徐智范晔白莉陆军军医大学新桥医院呼吸与危重症医学科重庆陆军军医大学陆军特色医学中心肿瘤科重庆陆军军医大学军事预防医学系流行病学教研室重庆

目的探讨外周血炎症指标对晚期非小细胞肺癌合并慢性阻塞性肺疾病(NSCLC-COPD)患者免疫治疗疗效的影响。方法回顾性分析2019年1月至2021年8月在陆军军医大学新桥医院接受至少2次免疫治疗的178例Ⅲ、Ⅳ期NSCLC-COPD患者资料, 收集治疗前... 详细信息

目的探讨外周血炎症指标对晚期非小细胞肺癌合并慢性阻塞性肺疾病(NSCLC-COPD)患者免疫治疗疗效的影响。方法回顾性分析2019年1月至2021年8月在陆军军医大学新桥医院接受至少2次免疫治疗的178例Ⅲ、Ⅳ期NSCLC-COPD患者资料, 收集治疗前2周内白细胞介素6(IL-6)、IL-8、肿瘤坏死因子α(TNF-α)等基线血液检测指标。随访截至2022年2月7日。应用X-tile软件确定外周血炎症指标的cut-off值, 采用多因素Cox回归模型分析无进展生存时间(PFS)和总生存时间(OS)的影响因素。结果 178例患者中, 男174例(97.8%), 女4例(2.2%);年龄42～86(64.3±8.3)岁;免疫单药治疗30例(16.9%), 免疫联合化疗治疗114例(64.0%), 免疫联合抗血管治疗21例(11.8%), 免疫联合放疗13例(7.3%)。中位随访时间为14.5个月(95%CI:13.6～15.3个月)。客观缓解率(ORR)为44.9%(80/178), 疾病控制率(DCR)为90.4%(161/178), 中位PFS为14.6个月(95%CI:11.6～17.6个月), 中位OS为25.7个月(95%CI:18.0～33.4个月)。多因素Cox风险模型分析结果显示, IL-6>9.9 ng/L(HR=5.885, 95%CI:2.558～13.543, P8.8 ng/L(HR=3.213, 95%CI:1.468～7.032, P=0.003)、IL-8>202 ng/L(HR=2.614, 95%CI:1.054～6.482, P=0.038)、全身免疫炎症指数(SII)>2 003.95(HR=2.976, 95%CI:1.647～5.379, P171.15是PFS的保护因素(HR=0.545, 95%CI:0.344～0.863, P=0.010);IL-6>9.9 ng/L(HR=6.124, 95%CI:1.950～19.228, P190.7 U/L(HR=2.776, 95%CI:1.020～7.556, P=0.046)、SII>2 003.95(HR=4.521, 95%CI:2.241～9.120, P171.15是OS的保护因素(HR=0.434, 95%CI:0.243～0.778, P=0.005)。结论基线高水平IL-6、TNF-α、IL-8、SII、LDH和低水平ALI是接受免疫治疗晚期NSCLC-COPD患者预后不良的危险因素。

关键词：癌, 非小细胞肺慢性阻塞性肺疾病免疫检查点抑制剂白细胞介素6 回顾性队列研究

基于肠道菌群的帕金森病早期预测模型建立及生物信息分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中华疾病控制杂志 2024年第9期28卷 1096-1103页

作者：何长颖韦雨婷陈佳陆军军医大学军事预防医学系军队卫生统计学教研室重庆400038

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准... 详细信息

目的探究基于肠道菌群对人群未来患帕金森症(parkinson′s disease,PD)的早期预测模型进行构建与评价,并对肠道菌群宏基因KO组进行功能分析,探讨PD的潜在治疗靶点。方法基于Zenodo数据库,一方面对肠道菌群相对丰度数据进行标准分数标准化及ZicoSeq降维,采用基于自适应最小绝对收缩和选择算法(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)变量选择的logistic回归算法建立预测模型,使用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评价模型预测效能,采用临床决策曲线(decision curve analysis,DCA)进行临床使用价值的评价;另一方面,对肠道菌群宏基因KO组数据使用limma包鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析。通过结合蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction networks,PPI)、支持向量机-递归特征消除(support vector machine-recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)对DEGs进行筛选。结果基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型的ROC曲线以及校准曲线显示模型预测效果良好。DCA结果显示模型净收益较大。通过PPI网络分析及机器学习方法,最终筛选出6个核心DEGs,即阿拉伯糖转运系统渗透蛋白(L-arabinose operon Q,araQ)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶,Ⅱ型、dCTP脱氨酶(dCTP deaminase,dcd)、颗粒19 kDa蛋白(signal recognition particle 19,SRP19)、加工前体5,核糖核酸酶P/MRP亚基(芽殖酵母)[processing of precursor 5,ribonuclease P/MRP subunit(***),POP5]、肌醇-3-磷酸合酶1(inositol-3-phosphate synthase 1,ISYNA1)。结论基于自适应LASSO变量选择的logistic回归分析模型对PD的预测具有优势,从而实现对PD患者的早发现、早干预、早治疗;相关核心基因的发现为PD的治疗提供科学指导和帮助。

关键词：帕金森病肠道菌群机器学习生物信息学分析

前列腺癌早期筛查风险预测模型的建立与验证研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国全科医学 2024年第20期27卷 2483-2490页

作者：李宏基赵晓龙胡伟韩东晖王安辉秦卫军空军军医大学第一附属医院泌尿外科陕西省西安市710032 空军军医大学军事预防医学系流行病学教研室陕西省西安市710032

背景前列腺癌作为常见的恶性肿瘤,威胁中老年男性生命健康,其预后与初诊时肿瘤级别与分期密切相关。前列腺特异性抗原(PSA)是前列腺癌早期筛查的重要分子,但非肿瘤负荷的前列腺良性疾病或操作也会引起PSA升高,盲目穿刺常导致过度诊疗。... 详细信息

背景前列腺癌作为常见的恶性肿瘤,威胁中老年男性生命健康,其预后与初诊时肿瘤级别与分期密切相关。前列腺特异性抗原(PSA)是前列腺癌早期筛查的重要分子,但非肿瘤负荷的前列腺良性疾病或操作也会引起PSA升高,盲目穿刺常导致过度诊疗。依据患者穿刺活检前的临床指标构建前列腺癌风险预测模型,可以为早筛可疑患者是否进行穿刺活检提供重要参考。目的寻找前列腺穿刺活检阳性的独立危险因素,构建前列腺癌发生的风险预测模型,预测前列腺癌发生风险。方法选取2011年1月—2023年6月于空军军医大学第一附属医院泌尿外科住院并进行前列腺穿刺活检的患者1138例,排除351例临床数据不完整病例后,剩余787例病例通过R语言split函数随机分为训练集(n=548)与验证集(n=239)(划分比例为7∶3)。收集患者的基本信息以及穿刺活检前生化检查指标,依据患者穿刺活检病理结果判断是否发生前列腺癌。应用LASSO回归筛选前列腺癌发生的独立危险因素,对独立危险因素进行多因素Logistic回归分析,利用分析结果构建前列腺癌早期筛查的风险预测模型并绘制列线图。依据训练集与验证集数据对模型进行验证。结果使用LASSO回归分析筛选出6个预测变量,包括年龄、总PSA(tPSA)、碱性磷酸酶、总蛋白、钙、尿素。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄≥60岁(OR=3.769,95%CI=2.393~5.937)、tPSA≥10μg/L(OR=2.259,95%CI=1.419~3.596)、碱性磷酸酶≥45 U/L[45~学差异的6个预测变量绘制列线图,建立预测模型。预测模型预测训练集前列腺癌发生的ROC曲线下面积(AUC)为0.778(95%CI=0.740~0.816),灵敏度为53.2%,特异度为85.5%,验证集前列腺癌发生的AUC为0.770(95%CI=0.708~0.832),灵敏度为61.2%,特异度为80.0%。拟合优度检验显示训练集P=0.543,验证集P=0.372,具有较好的拟合度。决策曲线分析(DCA)显示训练集高风险阈值<10%,验证集的高风险阈值约为15%,在临床实践中有一定的指导意义。结论本研究建立了包含年龄、tPSA、碱性磷酸酶、总蛋白、钙、尿素共6项穿刺前指标的前列腺癌列线图风险预测模型,可用于预测早期筛查可疑患者的前列腺癌发生风险。

关键词：前列腺肿瘤前列腺增生筛查危险因素列线图

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

线粒体自噬影响胰岛素抵抗的作用及机制

生物化学与生物物理进展 2024年第4期51卷 772-784页

作者：陈玉华郑标成迪何玉林莫中成桂林医学院基础医学院组织学与胚胎学教研室广西糖尿病系统医学重点实验室桂林541199 桂林医学院-明舜制药慢性病防治研究联合实验室邵东422800 桂林医学院基础医学院微生物学教研室桂林541199

胰岛素抵抗(IR)是诱发许多代谢疾病的关键因素,包括代谢综合征、非酒精性脂肪性肝病、动脉粥样硬化和2型糖尿病(T2DM)。随着相关代谢疾病日益增多,寻找新的治疗靶点迫在眉睫。线粒体自噬是一种选择性自噬,其通过清除受损和功能失调的线... 详细信息

胰岛素抵抗(IR)是诱发许多代谢疾病的关键因素,包括代谢综合征、非酒精性脂肪性肝病、动脉粥样硬化和2型糖尿病(T2DM)。随着相关代谢疾病日益增多,寻找新的治疗靶点迫在眉睫。线粒体自噬是一种选择性自噬,其通过清除受损和功能失调的线粒体以维持正常线粒体功能和能量代谢。研究发现,线粒体自噬在代谢疾病中有积极作用,线粒体自噬受到各种信号通路与信号分子调控而改善代谢疾病,如AMPK/ULK1、PINK1/Parkin信号通路以及BNIP3/Nix和FUNDC1等信号分子。本文阐述了线粒体自噬在胰岛素抵抗中的作用及调控机制,综述了近年的相关研究进展。

关键词：胰岛素抵抗线粒体自噬细胞信号分子

NLRP3炎症小体在感染性疾病中的作用研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国病原生物学杂志 2024年第11期19卷 1371-1376页

作者：高雪涵卫麟娜董品志陈晋柯源张浪浪王海燕覃明罗军敏遵义医科大学基础医学院免疫学教研室贵州遵义563000 遵义医科大学流行病学与卫生统计学教研室

核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(Nucleotide-bindingoligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)是一类存在于胞浆中的大分子蛋白复合物,作为炎症反应的核心,能够感知外源性病原体和内源性危险信号,在多种感染性疾病的... 详细信息

核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3(Nucleotide-bindingoligomerization domain-like receptor protein 3,NLRP3)是一类存在于胞浆中的大分子蛋白复合物,作为炎症反应的核心,能够感知外源性病原体和内源性危险信号,在多种感染性疾病的发生发展中发挥重要作用。因此,本文对NLRP3炎症小体的激活机制以及NLRP3炎症小体在感染性疾病中的研究进展予以综述,旨在为感染性疾病的治疗提供新的靶点。

关键词：固有免疫模式识别受体 NLRP3炎症小体感染性疾病综述