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沙葱总黄酮物质提取工艺优化及其生物活性研究

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中国调味品 2024年第4期49卷 182-185,200页

作者：贺新平田存章钱保陆谢一鸣新乡医学院三全学院生物与基础医学实验教学中心河南新乡453003 新乡医学院三全学院生命科学技术学院河南新乡453003

沙葱广泛栽培于我国高寒地区,富含氨基酸、微量元素和多种生物活性物质。黄酮是一种天然活性成分,与生姜和草果等调味料中黄酮类物质提取工艺的研究相比,沙葱总黄酮提取工艺的研究相对较迟,为使沙葱中活性成分得到全面研究和开发,该研... 详细信息

沙葱广泛栽培于我国高寒地区,富含氨基酸、微量元素和多种生物活性物质。黄酮是一种天然活性成分,与生姜和草果等调味料中黄酮类物质提取工艺的研究相比,沙葱总黄酮提取工艺的研究相对较迟,为使沙葱中活性成分得到全面研究和开发,该研究通过单因素试验和正交试验对沙葱中总黄酮提取工艺进行研究和优化。结果表明,沙葱总黄酮提取的最佳加工工艺为料液比例1∶30、提取时间15 min、乙醇浓度75%、提取温度90℃、超声波功率70 W,此时沙葱总黄酮得率为13.241%。此外,将沙葱总黄酮和BHT(2,6-二叔丁基对甲酚)在还原能力方面进行比较研究,发现沙葱总黄酮具有还原能力,但还原能力低于BHT。

关键词：沙葱黄酮提取工艺活性物质

转抗草甘膦基因甘蓝型油菜根际土壤理化性质及真菌群落多样性

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生态学杂志 2024年第4期43卷 1082-1091页

作者：杜坤李金萍王婷张晶晶王明王幼平扬州大学生命科学基础实验教学中心江苏扬州225009 扬州大学生物科学与技术学院江苏扬州225009

在转基因作物环境安全评价研究中,对外源基因的导入是否会影响土壤微生物群体的生态平衡以及非靶标生物方面一直存在较大的争议。本研究以转抗草甘膦mEPSPS基因甘蓝型油菜JHX6(转基因油菜,GMO)和受体材料J9707(非转基因油菜,GMO-free)... 详细信息

在转基因作物环境安全评价研究中,对外源基因的导入是否会影响土壤微生物群体的生态平衡以及非靶标生物方面一直存在较大的争议。本研究以转抗草甘膦mEPSPS基因甘蓝型油菜JHX6(转基因油菜,GMO)和受体材料J9707(非转基因油菜,GMO-free)为对象,比较了两材料不同发育时期根际土壤理化性质,并利用IonS5TMXL的ITS高通量测序技术,对大田和盆栽试验中的根际土壤进行真菌群落特征分析。结果显示,两材料同一发育时期根际土壤理化性质均不存在显著性差异。甘蓝型油菜根际富集的主要真菌门为油壶菌门和子囊菌门,两材料在相同发育时期根际土壤中真菌的Alpha多样性指数、群落结构均没有显著差异。但是,无论盆栽还是大田试验,两材料根际土壤中油壶菌门的相对丰度均存在显著差异。因此,我们推测,在甘蓝型油菜中导入mEPSPS基因并不会显著改变根际土壤的功能、真菌群落结构和多样性,但会影响个别真菌物种的相对丰度。

关键词： mEPSPS基因甘蓝型油菜根际真菌多样性群落结构

应用型人才培养导向的医学寄生虫学课程建设路径探索

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创新创业理论研究与实践 2024年第9期7卷 98-100页

作者：曹得萍李大宇蒋莉萍陈根彭小红莫刚桂林医学院基础医学院寄生虫学教研室桂林医学院基础医学院实验教学中心

为适应医学寄生虫学方向硕士研究生人才培养目标，笔者所在教学团队对医学寄生虫学课程从课程体系、提升师资教学水平等方面进行了有目的的建设，同时对医学寄生虫学理论与实验教学内容、授课模式及方法进行了相应的改革，通过此轮课程... 详细信息

为适应医学寄生虫学方向硕士研究生人才培养目标，笔者所在教学团队对医学寄生虫学课程从课程体系、提升师资教学水平等方面进行了有目的的建设，同时对医学寄生虫学理论与实验教学内容、授课模式及方法进行了相应的改革，通过此轮课程建设，为培养学生科研思辨能力、实事求是的科学精神及岗位胜任力奠定良好的基础。

关键词：应用型人才培养导向医学寄生虫学课程建设路径探索

基于CNKI期刊的分子生物学教学研究文献计量与可视化分析

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同方期刊数据库

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华夏医学 2024年第2期37卷 231-237页

作者：高进涛莫之婧陈莉李贤成桂林医学院智能医学与生物技术学院桂林541199

采用CiteSpace文献计量软件对2003—2022年中国知网(CNKI)收录的分子生物学教学研究文献1683篇进行可视化知识图谱分析,探究国内分子生物学教学研究的发展现状、研究热点及未来趋势。研究结果表明,分子生物教学研究整体呈上升趋势;研究... 详细信息

采用CiteSpace文献计量软件对2003—2022年中国知网(CNKI)收录的分子生物学教学研究文献1683篇进行可视化知识图谱分析,探究国内分子生物学教学研究的发展现状、研究热点及未来趋势。研究结果表明,分子生物教学研究整体呈上升趋势;研究者和机构已初具规模,有核心作者群出现,但相互之间合作仍需加强;研究热点主题主要集中在教学改革、实验教学和教学质量等方面;翻转课堂、虚拟仿真、雨课堂、课程思政是近年来研究的重要热点,并有望成为近期持续关注的热点。研究结果有助于了解此领域的研究现状和未来趋势,对我国分子生物学教学研究与实践探索具有借鉴意义。

关键词：分子生物学文献计量发展现状研究热点未来趋势

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科研项目成果在通识课程中的教学实践与探索

生物学杂志 2024年第2期41卷 126-130页

作者：阎臻杨健熊莉樊佳张大伟林宏辉刘唤唤四川大学生命科学学院生物科学国家级实验教学示范中心生物科学与技术虚拟仿真实验教学中心成都610064

以“众里寻他千百度——核酸检测的应用”实验项目为例,探索将科研项目的部分内容应用于高校生物类通识课程的实践经验。该项目以拟南芥T-DNA插入突变体为材料,通过基因组DNA的提取、PCR检测和条带分析等,探讨核酸检测技术在科学研究和... 详细信息

以“众里寻他千百度——核酸检测的应用”实验项目为例,探索将科研项目的部分内容应用于高校生物类通识课程的实践经验。该项目以拟南芥T-DNA插入突变体为材料,通过基因组DNA的提取、PCR检测和条带分析等,探讨核酸检测技术在科学研究和医学检验中的应用,涵盖一个完整的富含生物学特色的科研过程。该项目在通识课程中的实践,使非生物专业的学生在获得生物学核酸提取相关知识点和实验技能点的同时,了解生物学科研项目的实施过程;同时,通过鼓励学生思考核酸检测技术手段发展的背景、过程和意义,培养学生的发散性思维和创新实践能力,为培养新时代全面创新型人才奠定基础。

关键词：科研项目转化通识课程实验教学核酸检测

“以学生为中心”的细胞工程实验课程教学改革探索

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华夏医学 2024年第1期37卷 225-229页

作者：王自布王凛岳鹏鹏刘启亮桂林医学院智能医学与生物技术学院桂林541199

生物技术专业致力于培养具有自主科研能力、实践能力强的应用型高素质人才,以满足现代生物医药产业发展需求。“细胞工程”是生物技术专业的必修课程,该科目所涉及的实验技术被广泛应用于医学、药学以及农业等领域。传统的细胞工程实验... 详细信息

生物技术专业致力于培养具有自主科研能力、实践能力强的应用型高素质人才,以满足现代生物医药产业发展需求。“细胞工程”是生物技术专业的必修课程,该科目所涉及的实验技术被广泛应用于医学、药学以及农业等领域。传统的细胞工程实验课程教学已经无法满足培养科研型、应用型人才的需要。本文主要阐述桂林医学院智能医学与生物技术学院生物技术教研室细胞工程实验课程教学团队的教学改革实践与探索经验。本教学改革遵循“以学生为中心”的理念,以生物技术产业与医药产业发展和需求为导向,进行课程内容改革、教学方法改革、实验平台管理改革与评价体系改革,体现理论与实践的有机融合,增加课程的系统性和挑战性,有效提升学生的创新能力以及运用基础知识分析问题、解决问题的能力,并为本专业其他实验课程的教学改革提供借鉴。

关键词：以学生为中心细胞工程实验教学教学改革

肌源性细胞分化的单细胞转录谱变化及细胞间通讯分析

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生物技术通报 2024年第6期40卷 330-342页

作者：秦健李振月何浪李俊玲张昊杜荣山西农业大学动物医学学院太谷030801 山西农业大学实验教学中心太谷030801

【目的】基于单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)揭示牛肌源性细胞分化中的基因表达谱变化,并探究介导细胞间通讯的配体-受体互作机制,为构建成肌分化的动态调控网络奠定基础。【方法】利用Seurat、ClusterProfile... 详细信息

【目的】基于单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)揭示牛肌源性细胞分化中的基因表达谱变化,并探究介导细胞间通讯的配体-受体互作机制,为构建成肌分化的动态调控网络奠定基础。【方法】利用Seurat、ClusterProfiler、STRING、Cytoscape、CellChatDB和Monocle2等数据库或软件,对NCBI-GEO公共数据库中牛肌源性细胞单细胞转录组测序的原始数据进行了深入分析,包括细胞分群鉴定及差异基因表达谱、相关性、GO富集、PPI、细胞间通讯和拟时序分析等。【结果】根据基因表达相关性及标志性基因共鉴定出4个具有独特转录特征的细胞群Myoblasts、Myocytes、Fibroblasts和FAPs,通过Myoblasts亚群的基因表达谱比较及拟时序分化轨迹分析发现,各亚群之间异质性很强,其中Myoblasts_1为分化轨迹起点,Myoblasts_0和3处于分化早期阶段,而Myoblasts_2是肌肉特征表现最为明显的亚群,可能是临近形成Myocytes的后期阶段的Myoblasts;Myoblasts_2和Myocytes差异基因富集的肌肉相关GO term存在差异,各基因间存在复杂的蛋白互作关系;Myoblasts_0-5、Myocytes、Fibroblasts和FAPs同型或异型细胞间的通讯机制,涉及到PTN-NCL、IGF2-IGF2R和ANGPTL2-(ITGA5+ITGB1)等多种不同的配体-受体作用。【结论】肌源性细胞在分化过程中存在不断变化的基因表达谱和细胞间通讯,反映了复杂的动态异质性及分子调控机制。

关键词：牛肌源性细胞单细胞转录组测序细胞亚群异质性基因表达谱细胞间通讯

基于网络药理学和动物体内试验验证云实感冒合剂对呼吸道合胞病毒作用

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第2期44卷 170-182页

作者：徐庆胜李玉迁蒋立娜魏洪迟茜文廖思睿陈维娇贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心贵阳550025

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1... 详细信息

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1软件构建中药成分-疾病靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质相互作用关系。借助Metascape数据库进行富集分析。采用分子对接技术分析验证网络药理学结果。云实感冒合剂干预RSV感染验证试验:滴鼻法建立RSV小鼠模型,灌胃合剂后检测血常规、肺指数,观察肺组织病理变化,流式细胞术检测外周血T细胞亚群,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量,RT-PCR检测肺组织中TLR4、NF-κB和RSV-N基因mRNA相对水平。结果分析获得云实感冒合剂有效活性成分41个,抗RSV靶点111个,富集得到167条信号通路,主要是PI3K/AKT、MAPK、Toll-like等信号通路。分子对接结果显示,云实感冒合剂活性成分木犀草素、山奈酚、槲皮素与RSV-G、RSV-F、PI3K、AKT1、Bcl-2结合能均小于0 kcal/mol。体内试验结果显示,与RSV组相比,云实感冒合剂高剂量组白细胞、淋巴细胞计数升高、肺指数降低,差异有统计学意义(P<0.05)。HE染色显示RSV组肺组织增生,肺泡壁变厚,间质内有炎性细胞浸润,利巴韦林组和云实感冒合剂低、中、高剂量组中肺泡大小趋向均匀,肺泡壁厚度均一。与RSV组相比,云实感冒合剂低、中、高剂量组的CD3^(+)、CD4^(+)、CD8^(+)T淋巴细胞数量明显升高,CD4^(+)/CD8^(+)T细胞数量比值降低,血清中TNF-α、IL-6、IL-1β含量下降,肺组织中病毒载量和TLR4、NF-κB mRNA水平降低,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论云实感冒合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥调控RSV感染,主要通过缓解肺组织病理损伤,减轻炎症反应,其机制可能与抑制TLR4/NF-κB通路激活有关。

关键词：云实感冒合剂网络药理学呼吸道合胞病毒体内试验分子对接

基于GEO芯片数据探究DEHP致雄性生殖发育障碍的作用机制

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生物信息学 2024年

作者：周靖刚贺庆芝桂林医学院智能医学与生物技术学院桂林医学院广西高校分子医学工程重点实验室

为探索内分泌干扰物DEHP在母鼠怀孕期间暴露后对子鼠生殖系统的影响，为DEHP诱导雄性生殖毒性机制提供生物信息学参考。采用美国国立生物技术信息中心的GEO(Gene expression omnibus)数据库筛选DEHP组与对照组差异表达的mRNA并进行GO和 ... 详细信息

为探索内分泌干扰物DEHP在母鼠怀孕期间暴露后对子鼠生殖系统的影响，为DEHP诱导雄性生殖毒性机制提供生物信息学参考。采用美国国立生物技术信息中心的GEO(Gene expression omnibus)数据库筛选DEHP组与对照组差异表达的mRNA并进行GO和 KEGG通路富集分析。使用STRING数据库、Cytoscape软件对差异表达基因构建蛋白质互作网络(PPI)并根据CytoHubba插件的MCC算法筛选出前十个关键基因。利用GSEA软件对基因集进行基因集富集分析(Gene set enrichment analysis，GSEA)，筛选在DEHP暴露后有统计学意义的基因集。本研究首先基于差异表达筛选出Cyp51，Sqle，Sc5d，Fdps，Dhcr7，Acss2，Insig1，Idi1，Scd1等关键基因。富集分析显示这些mRNA可能通过影响胆固醇合成代谢、类固醇合成代谢等相关途径发挥作用。此外，GSEA分析结果也清楚地表明DEHP暴露后会诱导小鼠胆固醇合成、mTORC1通路、雄性激素响应相关途径发生改变。研究发现，在母鼠怀孕期间暴露DEHP可能会影响雄性子鼠mTORC1通路，胆固醇合成相关途径引起小鼠雄性激素紊乱导致精子发生障碍，干扰小鼠生殖系统。

关键词：邻苯二甲酸二乙己基酯基因富集分析睾丸生殖毒性内分泌干扰物