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副干酪乳杆菌TK1501后生元的制备及对幽门螺旋杆菌的抑制作用

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南方医科大学学报 2024年第5期44卷 867-875页

作者：聂金蕊吴亚慧韩雪梅李亚琪王海宽张会图天津科技大学生物工程学院天津300457 天津创源生物技术有限公司天津300457

目的对副干酪乳杆菌(*** TK1501)发酵大豆产物中的后生元进行分离提取和体内外抑菌活性进行研究,评估该后生元在治疗幽门螺旋杆菌(Hp)感染的作用。方法*** TK1501在无氧密闭的环境内以37℃、固态发酵参数中料水比1∶1.5,接种量5×107 CF... 详细信息

目的对副干酪乳杆菌(*** TK1501)发酵大豆产物中的后生元进行分离提取和体内外抑菌活性进行研究,评估该后生元在治疗幽门螺旋杆菌(Hp)感染的作用。方法*** TK1501在无氧密闭的环境内以37℃、固态发酵参数中料水比1∶1.5,接种量5×107 CFU/mL,培养发酵32 h后,通过大孔树脂XAD-16N吸附法、阳离子交换色谱法、高效液相色谱法分离纯化,对*** TK1501后生元进行稳定性及抗菌效果分析。将50只C57雄性小鼠随机分为空白组、模型组、阴性对照组、低剂量组(0.02 mL/只)和高剂量组(0.1 mL/只),10只/组,连续灌胃4周。取血清观察胃部炎症因子TNF-α、IL-1β表达水平变化,取小鼠胃组织进行HE染色。结果*** TK1501后生元易被蛋白酶降解,热稳定性好,对酸碱、有机溶剂等不利因素有较好的耐受性(P生元高剂量组明显改善Hp感染(P生元对Hp、金黄色葡萄球菌等具有较好的抑制和杀灭效果,而在相同条件下对肠道中的正常菌群则无明显影响。

关键词：副干酪乳杆菌TK1501 分离抗幽门螺旋杆菌

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基于目标颜色基及梯度方向匹配的菌落分割计数算法

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微生物学报 2024年第3期64卷 953-967页

作者：何健郡李子印马咸莹中国计量大学浙江杭州310018 杭州大微生物技术有限公司浙江杭州310000

【目的】通过菌落测试片提取菌落并计数,在农业、食品业、医疗卫生等领域中是一项常用且重要的工作。目前,菌落自动计数算法大都是以菌落培养皿为主要工作对象,对菌落测试片适用性较差。另外,目前相关技术在常规的粘连物体分割中有着较... 详细信息

【目的】通过菌落测试片提取菌落并计数,在农业、食品业、医疗卫生等领域中是一项常用且重要的工作。目前,菌落自动计数算法大都是以菌落培养皿为主要工作对象,对菌落测试片适用性较差。另外,目前相关技术在常规的粘连物体分割中有着较好的效果,但在菌落分割计数中,由于菌落本身的形态特征,对粘连菌落分割计数的效果尚不够精准。【方法】为解决此类问题,本文提出一种基于目标颜色基及梯度方向匹配的菌落分割计数算法。首先利用图像中菌落的颜色特征作为基,将图像转换到基空间内,以增强菌落与背景之间的差异,其次利用菌落图像的梯度幅值特征对梯度方向进行滤波,然后通过梯度方向进行匹配,进而将粘连的菌落分割,最后利用非极大值抑制的方法筛选出菌落并计数。【结果】经试验,本研究算法的计数精度可达98.00%,能够满足实际需求。【结论】在针对菌落的目标分割计数中,本研究算法不仅计数精度高,而且具有较好的鲁棒性,在对不同厂家的菌落总数测试片菌落分割计数中均有优异效果;然而在对大面积目标的检测分割中算法的准确率会有所下降,因此,该算法更适合于菌落等小目标的检测分割。

关键词：颜色基微生物梯度空间粘连分割菌落计数

木薯多孔淀粉基止血粉的止血性能及生物相容性研究

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分析化学 2024年第3期52卷 398-408页

作者：胡倩李兆丰顾正彪夏润宸班宵逢洪雁程力李才明江南大学合成与生物胶体教育部重点实验室江南大学食品学院宜兴食品与生物技术研究院有限公司

酶改性淀粉在可生物降解止血材料的应用中表现出巨大潜力。本研究利用α-淀粉酶和糖化酶的水解作用得到木薯多孔淀粉（ECS），并通过负载钙离子和单宁酸制备木薯多孔淀粉基止血粉（ECS-Ca-T）。利用扫描电子显微镜（SEM）、红外（FTIR... 详细信息

酶改性淀粉在可生物降解止血材料的应用中表现出巨大潜力。本研究利用α-淀粉酶和糖化酶的水解作用得到木薯多孔淀粉（ECS），并通过负载钙离子和单宁酸制备木薯多孔淀粉基止血粉（ECS-Ca-T）。利用扫描电子显微镜（SEM）、红外（FTIR）光谱、X射线衍射（XRD）和比表面积分析仪（BET）对ECS及其止血粉的微观结构、孔径分布、结晶结构和成分进行了详细分析。通过溶血实验和创伤愈合实验探究了ECSCa-T的生物相容性，通过体外凝血测试、大鼠创伤止血实验探究ECS-Ca-T的止血性能，并考察了ECS-Ca-T的生物降解性。结果表明，ECS-Ca-T具有较好的止血效果、生物相容性和可降解性。与市售颗粒止血粉相比，ECS-Ca-T在大鼠断尾持续性出血和肝脏损伤止血方面具有优势，止血时间分别缩短了4.86 min和8.6 s，并能够在5 s内实现大鼠背部肌肉组织的快速止血；同时，在伤口愈合过程中，ECS-Ca-T不会对机体造成不良影响，在第7天降解达到94.5%。

关键词：木薯多孔淀粉钙离子单宁酸止血生物相容性

用ELISA法检测血清中抗TNF-α单克隆抗体药物浓度的方法开发与验证

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中国临床药理学杂志 2024年第11期40卷 1642-1645页

作者：胡振湘何丽秀王博陈曦刘桂丽秦玉敏珠海市丽珠单抗生物技术有限公司广东珠海519090

目的建立检测一种测定血清中抗肿瘤坏死因子α(TNF-α)单克隆抗体浓度的间接酶联免疫吸附测定(ELISA)方法。方法对TNF-α包被浓度及酶标抗体种类、存放稳定性和浓度等进行考察,确定关键试验参数。考察优化后方法的专属性、精密度与回收... 详细信息

目的建立检测一种测定血清中抗肿瘤坏死因子α(TNF-α)单克隆抗体浓度的间接酶联免疫吸附测定(ELISA)方法。方法对TNF-α包被浓度及酶标抗体种类、存放稳定性和浓度等进行考察,确定关键试验参数。考察优化后方法的专属性、精密度与回收率、标准曲线与定量下限。结果TNF-α包被浓度为400 ng·mL^(-1),选择Sigma辣根过氧化物酶标记羊抗人免疫球蛋白G,以1∶3.0×10^(5)倍进行稀释;稀释后的酶标抗体4℃保存3 d稳定性良好。同时确认了方法专属性良好,回收率为84.00%~10^(6).82%,不同浓度样品精密度的变异系数均≤10%,方法线性良好,曲线方程为y=(-8.37×10^(3)-2.37×10^(6))/[1+(x/29.80)1.06]+2.37×10^(6)(R^(2)=0.999),定量下限:1 ng·mL^(-1),均符合要求。结论本研究建立了一种准确、可靠的ELISA法测定血清中抗TNF-α单克隆抗体药物的浓度。

关键词：肿瘤坏死因子α 酶联免疫吸附测定法单克隆抗体血清药物浓度

Des(rhamnosyl)verbascoside抗HBV作用的定量蛋白质组学研究

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广西科学 2024年第1期31卷 197-204页

作者：邓洁赵童诗尧牟俊飞梁成钦周先丽桂林医学院智能医学与生物技术学院广西桂林541004 桂林医学院药学院广西桂林541004

为探究des(rhamnosyl)verbascoside体外抗乙型肝炎病毒(HBV)的活性作用和机制,本研究以des(rhamnosyl)verbascoside为实验药物对HepG2.2.15细胞进行干预,实验分为药物干预组和对照组,采用串联质谱标签(Tandem Mass Tag,TMT)蛋白质组学方法对提取的总蛋白进行分析。结果表明,共筛选得到300个差异表达蛋白,其中有109个上调蛋白,191个下调蛋白。基因本体论(Gene Ontology,GO)分析结果显示,差异蛋白主要参与DNA复制(DNA replication)、鞘糖脂代谢(Glycosphingolipid metabolic process)、细胞增殖(Cell proliferation)、寡糖分解代谢(Oligosaccharide catabolic process)等生物学过程,以及DNA聚合酶活性(DNA polymerase activity)、丝氨酸型羧肽酶活性(Serine type carboxypeptidase activity)、DNA引物酶活性(DNA primase activity)等分子功能。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析结果显示,差异蛋白主要参与细胞代谢(Metabolism)、遗传信息传导(Genetic information processing)、生物系统通路(Organismal systems)等相关信号通路。亚细胞定位分析表明,差异蛋白大多定位在细胞质和细胞核。本研究共筛选出13个与抗HBV密切相关的蛋白。通过定量蛋白组学初步揭示des(rhamnosyl)verbascoside可能通过增加HGF、SORT1、MAN2B1,减少PRIM1、PRIM2、POLA1、POLD3、POLD2、POLD1、POLE、ERCC2、LAMC1、SDC1等蛋白表达来起到体外抗HBV的作用。

关键词： des(rhamnosyl)verbascoside 蛋白组学乙型肝炎病毒生物信息学旱田草

肠道微生物代谢产物对畜禽肠黏膜屏障的影响及调控机制

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动物营养学报 2024年第2期36卷 805-813页

作者：邓雄张云常王文欢刘明北京农学院动物科学技术学院北京102206 山东弘科福莱生物技术有限公司济南250003

肠道微生物与宿主的互作可以通过微生物代谢产物来实现。目前,已有研究报道,肠道微生物代谢产物在调控宿主肠黏膜屏障中发挥重要作用,是维持肠道稳态和肠道健康的关键因素。为了更好地研究肠道微生物代谢产物与肠黏膜屏障之间的关联效... 详细信息

肠道微生物与宿主的互作可以通过微生物代谢产物来实现。目前,已有研究报道,肠道微生物代谢产物在调控宿主肠黏膜屏障中发挥重要作用,是维持肠道稳态和肠道健康的关键因素。为了更好地研究肠道微生物代谢产物与肠黏膜屏障之间的关联效应与作用机制,本文针对当前研究的热点——肠道微生物代谢产物,如短链脂肪酸、次级胆汁酸和色氨酸代谢物,通过阐明其体内代谢途径及其对动物肠黏膜屏障功能的调控机制,旨在为通过调节肠道微生物及其代谢产物的天然功能成分的开发应用提供参考。

关键词：畜禽肠道微生物代谢产物肠黏膜屏障

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一种新的泛素化-铁死亡相关基因特征用于肝细胞癌患者预后分析

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基因组学与应用生物学 2024年第2期43卷 298-310页

作者：张豪郭泽皓曹骏莫之婧金荣仲桂林医学院智能医学与生物技术学院桂林541199 广西高校生物化学与分子生物学重点实验室桂林541199

本研究通过筛选泛素化-铁死亡相关基因构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后模型,并探究泛素化-铁死亡相关基因对HCC预后的影响。使用R包DESeq2对TCGA-LIHC数据集进行差异分析,获取HCC差异表达基因(HCC_DEGs)。将HCC_DEGs、... 详细信息

本研究通过筛选泛素化-铁死亡相关基因构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后模型,并探究泛素化-铁死亡相关基因对HCC预后的影响。使用R包DESeq2对TCGA-LIHC数据集进行差异分析,获取HCC差异表达基因(HCC_DEGs)。将HCC_DEGs、泛素化相关基因(ubiquitination related genes,URGs)和铁死亡差异表达基因(ferroptosis_differentially expressed genes,FERR_EDGs)取交集获得泛素化和铁死亡相关基因(UBFE_EDGs),将UBFE_EDGs依次进行LASSO回归分析、单因素Cox回归分析和多因素Cox回归分析以筛选出最佳独立预后基因用于构建HCC预后模型(ubiquitination and ferroptosis-related prognostic model,UBFE)。由生存曲线、ROC曲线和校正曲线评估UBFE的预测准确性。单因素Cox回归分析、多因素Cox回归分析评估UBFE风险评分是否为HCC的预后独立危险因素,并构建列线图模型。ssGSEA分析和单细胞测序数据分析用于评估UBFE与泛素化及铁死亡的相关性。结果显示,HCC_DEGs、URGs和FERR_EDGs取交集得到45个UBFE_EDGs,依次进行LASSO回归分析、单因素Cox回归分析和多因素Cox回归分析筛选出2个UBFE_EDGs(DCAF13和UBE2C)用于构建HCC预后模型UBFE。生存曲线、ROC曲线和校准曲线分析显示UBFE高风险评分组(HighUBFE)与HCC患者预后差显著相关,UBFE具有较好的预测准确性。单因素Cox回归分析和多因素Cox回归分析结果显示UBFE风险评分是HCC患者预后的独立危险因素,UBFE联合TNM分期的预测准确性更高,列线图预测HCC患者的1年、2年和3年生存率与实际生存率的一致性较高。ssGSEA分析和单细胞分析的结果均显示UBFE风险评分与泛素化呈正相关性,与铁死亡呈负相关性,UBFE高风险评分组的铁死亡拮抗反应高于UBFE低风险评分组的。本研究构建的UBFE在预测HCC患者的预后方面具有较好的表现,DCAF13和UBE2C可能通过泛素化和铁死亡通路影响肝细胞癌的进展及患者预后。

关键词：肝细胞癌铁死亡泛素化预后

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基于活体计算机断层扫描的猪胴体组成性状遗传参数估计

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中国畜牧杂志 2024年

作者：韩贺张振洋赵伟何永奇侯小亮王建兰傅衍张哲潘玉春浙江大学动物科学学院史记生物技术有限公司

瘦肉率（LMP）、脂肪率（FP）和骨率（BP）是种猪生产中重要的经济性状，常规情况下需进行屠宰分割才能准确度量，测定难度大且屠宰后无法留种，近年来计算机断层扫描（CT）等图像技术的广泛使用使得活体精准测量表型成为可能。本研究... 详细信息

瘦肉率（LMP）、脂肪率（FP）和骨率（BP）是种猪生产中重要的经济性状，常规情况下需进行屠宰分割才能准确度量，测定难度大且屠宰后无法留种，近年来计算机断层扫描（CT）等图像技术的广泛使用使得活体精准测量表型成为可能。本研究以史记生物技术有限公司广西贵港核心育种场饲养的杜洛克、长白、大白和皮特兰猪为研究对象，利用HIBLUP软件对4个品种猪CT测得的LMP、FP和BP性状进行遗传参数估计，同时选取20头经过CT测定的杜洛克猪进行屠宰分割，评估CT测定结果的准确性。结果表明，FP和BP性状的CT测定结果与屠宰测定结果呈强相关性，相关系数（r）分别为0.946和0.790，LMP性状的相关性较低，r为0.584。4个品种猪LMP、FP和BP性状的遗传力在0.59～0.80之间，均为高遗传力性状，LMP与FP性状均呈强负相关，LMP与BP性状呈弱正相关，FP与BP性状呈弱负相关。本研究基于大规模活体测定数据初步确定了LMP、FP、BP等性状的遗传基础，为后续开展精准育种提供了有效支撑。

关键词：计算机断层扫描胴体性状遗传参数

碱性农田土壤冬小麦不同生育期镉的迁移转化研究

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生态环境学报 2024年第3期33卷 450-459页

作者：张腾云王静高健磊葛文静王宗耀韩龙郑州大学生态与环境学院河南郑州450001 河南元光科技有限公司河南濮阳457000 鹤壁市人元生物技术发展有限公司河南鹤壁458030

目前,农田土壤镉污染导致的农业生态环境安全问题引起了极大的关注,然而与酸性土壤相比,针对碱性土壤镉污染导致小麦籽粒镉超标的相关研究进展缓慢。为探明镉在碱性土壤-作物系统中的迁移转化规律,以河南省济源市碱性镉污染农田土壤及... 详细信息

目前,农田土壤镉污染导致的农业生态环境安全问题引起了极大的关注,然而与酸性土壤相比,针对碱性土壤镉污染导致小麦籽粒镉超标的相关研究进展缓慢。为探明镉在碱性土壤-作物系统中的迁移转化规律,以河南省济源市碱性镉污染农田土壤及冬小麦为例,通过分析小麦不同生育期土壤和小麦植株各器官镉含量的分布变化,阐明了土壤镉随小麦生长发育的富集及迁移转化规律,揭示了根际效应和土壤理化性质对该过程的影响。结果显示:1)随着小麦生长发育,相较于非根际,根际土壤理化性质的变化更为明显,有机质向根际环境的富集趋势显著(P灌浆期0.600>成熟期0.559),向地上部分迁移转运则集中在灌浆期(灌浆期1.04>分蘖期0.277>成熟期0.260);4)小麦根部对镉的富集能力随根际土壤pH的升高而增强(r=0.690,P<0.05),茎叶对镉的富集能力随根际土壤CEC的升高而降低(r=-0.697,P<0.05)。由此,在碱性土壤镉污染修复治理中,针对性地在镉向小麦富集迁移的关键期(分蘖期、灌浆期)采取阻控措施,调节关键影响因素(土壤有机质、CEC),可控制小麦籽粒镉超标风险。研究结果可为碱性镉污染农田土壤的修复治理及风险防控提供理论基础。

关键词：碱性农田土壤镉污染冬小麦土壤理化性质富集迁移特性