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依赖于端粒延长替代机制的胶质瘤临床前模型及应用现状

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生物化学与生物物理进展 2024年第2期51卷 269-275页

作者：仝津恺闫思翔张艳多侯凯龙张科张昊楠常顺贾舒婷昆明理工大学医学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室昆明650500 云南省第一人民医院神经外科昆明650032

胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,主要起源于神经胶质细胞。由于胶质瘤具有高度侵袭性的特点,其死亡率在各种癌症中名列前茅。因此,新的治疗方法和新的药物开发对于胶质瘤的治疗意义十分重大。在大约30%的胶质瘤中,端粒的维持并... 详细信息

胶质瘤是中枢神经系统最常见的恶性肿瘤,主要起源于神经胶质细胞。由于胶质瘤具有高度侵袭性的特点,其死亡率在各种癌症中名列前茅。因此,新的治疗方法和新的药物开发对于胶质瘤的治疗意义十分重大。在大约30%的胶质瘤中,端粒的维持并不是通过端粒酶的激活延长的,而是通过端粒延长替代机制(ALT)来维持和延长端粒。然而,由于目前对于ALT胶质瘤细胞系以及临床前的ALT胶质瘤模型的研究还比较匮乏,从而制约了ALT胶质瘤的机制研究。因此,本篇综述在此探讨了目前发现的ALT胶质瘤细胞系及ALT胶质瘤动物模型,以及这些模型在临床前研究中发挥的作用和最新的进展。

关键词：胶质瘤端粒延长替代机制临床前模型

单分子荧光原位杂交(smFISH)技术及应用

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生物化学与生物物理进展 2024年第6期51卷 1239-1255页

作者：芮涵孙正龙关淼昆明理工大学省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室昆明650500 深圳湾实验室生物影像实验室深圳518107 昆明理工大学生命科学与技术学院昆明650500

单分子荧光原位杂交(single-molecule fluorescence in situ hybridization,smFISH)技术是一种通过用偶联荧光基团的寡核苷酸探针,对固定细胞或组织中单个mRNA分子进行成像的方法。smFISH可对RNA进行定位、定量,以此对目标转录本进行实... 详细信息

单分子荧光原位杂交(single-molecule fluorescence in situ hybridization,smFISH)技术是一种通过用偶联荧光基团的寡核苷酸探针,对固定细胞或组织中单个mRNA分子进行成像的方法。smFISH可对RNA进行定位、定量,以此对目标转录本进行实时研究。sm FISH适用于细胞、组织切片等多种类型生物样本。近年来,多种基于基础smFISH的改进技术被发明,进一步促进了该技术的实际应用。smFISH良好的RNA单分子可视化能力,使得其在发育生物学、神经生物学及肿瘤生物学等基础生物学科中得到了广泛的应用。本文综述了smFISH技术基本原理、smFISH技术的局限性、smFISH衍生技术方法、smFISH在不同生物学科中的应用进展,并对smFISH技术的发展前景做出展望。

关键词：单分子荧光原位杂交寡核苷酸探针 RNA 成像

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HMGCR表达及活性调控的研究进展

中国细胞生物学学报 2023年第6期45卷 990-996页

作者：张硕杰王辉张彤彤贾舒婷旦菊花昆明理工大学医学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室昆明650500

胆固醇稳态对机体正常的生命活动至关重要,3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methyl glutaryl coenzyme A reductase,HMGCR)介导的甲羟戊酸途径是机体胆固醇从头合成的关键步骤,因此,HMGCR的表达及调控对机体胆固醇稳态... 详细信息

胆固醇稳态对机体正常的生命活动至关重要,3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(3-hydroxy-3-methyl glutaryl coenzyme A reductase,HMGCR)介导的甲羟戊酸途径是机体胆固醇从头合成的关键步骤,因此,HMGCR的表达及调控对机体胆固醇稳态的维持十分重要。在机体内,HMGCR从转录到发挥其还原酶的功能这一过程受到了严格的调控,包括转录、翻译、蛋白稳定性及酶活性、表观遗传调控等方面。该文较全面地梳理和综述了该关键酶表达和调控的研究进展,为针对HMGCR调控胆固醇代谢的研究提供理论参考及思路。

关键词：胆固醇 HMGCR miRNA lncRNA

STAT3通路在肿瘤相关成纤维细胞调节肿瘤微环境中的作用

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中国细胞生物学学报 2022年第12期44卷 2345-2353页

作者：李浩邱磊马泽龙吴晓明昆明理工大学医学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室昆明650500

目前各种肿瘤的发病率和死亡率仍高居不下,肿瘤的治疗还是临床医学的一大难题。肿瘤的发展离不开它的“摇篮”,即肿瘤微环境,因此探索肿瘤与肿瘤微环境相互作用的调控机制有利于肿瘤治疗。研究显示,STAT3通路在肿瘤微环境的调控中发挥... 详细信息

目前各种肿瘤的发病率和死亡率仍高居不下,肿瘤的治疗还是临床医学的一大难题。肿瘤的发展离不开它的“摇篮”,即肿瘤微环境,因此探索肿瘤与肿瘤微环境相互作用的调控机制有利于肿瘤治疗。研究显示,STAT3通路在肿瘤微环境的调控中发挥重要作用。因此,该文针对STAT3通路促进肿瘤相关成纤维细胞(cancer associated fibroblasts,CAFs)激活,调节CAFs与肿瘤细胞,CAFs与免疫细胞的相互作用等方面进行了综述,并对靶向STAT3通路的肿瘤治疗药物进行了总结。

关键词： STAT3通路肿瘤微环境靶向治疗

基于TCGA数据库构建恶性胸膜间皮瘤基因预后模型及其生物信息学分析

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昆明理工大学学报（自然科学版） 2024年第1期49卷 127-136页

作者：杨玺李彬刘如爱王播勇普元倩自加吉周佳奇余敏熊伟大理大学基础医学院云南大理671000 云南省昆虫生物医药研发重点实验室云南大理671000 云南省高校临床生物化学检验重点实验室云南大理671000 云南大学生命科学学院生物化学与分子生物学实验室云南昆明650091

基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库构建恶性胸膜间皮瘤患者的基因预后风险模型及其验证分析.通过TCGA数据库获取恶性胸膜间皮瘤的基因表达数据以及临床信息,将数据集分为训练集和测试集,对训练集进行单因素Cox... 详细信息

基于癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库构建恶性胸膜间皮瘤患者的基因预后风险模型及其验证分析.通过TCGA数据库获取恶性胸膜间皮瘤的基因表达数据以及临床信息,将数据集分为训练集和测试集,对训练集进行单因素Cox分析、单因素鲁棒性分析以及多因素Cox回归分析,建立风险预后模型,计算每个患者的风险评分,将数据集分成高风险组和低风险组,通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征(Receiver Operating Characteristic, ROC)曲线评估模型的预测效能和准确性,利用TCGA数据库和GTEx数据库中的样本对预后模型中的基因进行表达验证,最后通过UALCAN数据库探索预后模型中基因的表达模式.本研究构建了一个由UHRF1、KIF4A和NEK2这三个基因组成的预后风险评估模型,预后风险模型风险评分=UHRF1表达量×1.452 5-KIF4A表达量×1.327+NEK2表达量×1.416 7.ROC曲线显示,该模型的ROC曲线下面积(Area Under the Curve, AUC)值为0.91,基于ROC曲线对截断值进行优化,最佳截止点为1.149,此时达到最大灵敏度和特异性.在最佳截止点处,患者被进一步分为高风险组和低风险组,Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险组和低风险组之间的生存时间存在显著差异,与高风险组患者相比,低风险组患者总生存期显著延长.通过森林图对模型进行可视化,整个模型的Log-Rank p-value肿瘤亚型、年龄和转移状态中表达有明显差异.本研究构建的恶性胸膜间皮瘤基因预后风险模型,能够有效地预测恶性胸膜间皮瘤患者预后,并且可以作为恶性胸膜间皮瘤的独立预后预测因子.预后模型中基因UHRF1、KIF4A和NEK2的表达与恶性胸膜间皮瘤患者的多个临床特征显著相关,提示其在恶性胸膜间皮瘤发生发展过程中的潜在作用.

关键词：恶性胸膜间皮瘤预后风险模型生物信息学 TCGA数据库

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毛兰素的药理学作用研究进展

中国细胞生物学学报 2022年第2期44卷 399-404页

作者：李明赵远马萍袁红军唐文如盛苗苗昆明理工大学衰老与肿瘤分子遗传学实验室昆明650500

毛兰素是从兰科石斛属植物中提取的小分子联苄类化合物,现已发现其具有诱导细胞程序性死亡、抑制血管生成、抗氧化等多种生物学功能,并且具有治疗包括肿瘤在内的多种疾病的潜力,该文就近年来毛兰素药理活性的研究进展作一综述。

关键词：毛兰素药理作用分子机制

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补体系统在肿瘤免疫中的双重作用

中国免疫学杂志 2022年第14期38卷 1777-1782页

作者：秦子一唐文如谢晓丽(指导) 昆明理工大学衰老与肿瘤分子遗传实验室昆明650500

补体系统是先天免疫系统的重要组成部分,连接先天免疫和适应性免疫。最近研究表明补体在肿瘤微环境中起主要作用。本综述讨论补体系统在调节癌症免疫力方面的双重作用,及其在癌症患者新疗法设计中的潜在应用方面的最新进展。

关键词：补体系统肿瘤免疫肿瘤微环境

原癌基因Ras诱导的衰老与逃逸衰老机制的研究进展

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生物化学与生物物理进展 2016年第7期43卷 652-660页

作者：郭雨声张如意贾舒婷罗瑛昆明理工大学医学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室昆明650500

在体内和细胞内由癌基因诱导的衰老(oncogene-induced senescence,OIS)是一种重要的癌症抑制机制.原癌基因Ras是人类癌症中最易突变的癌基因之一,尽管有OIS的存在,但是Ras诱导的恶性转化还是时有发生,这提示Ras基因可能存在着能够逃逸... 详细信息

在体内和细胞内由癌基因诱导的衰老(oncogene-induced senescence,OIS)是一种重要的癌症抑制机制.原癌基因Ras是人类癌症中最易突变的癌基因之一,尽管有OIS的存在,但是Ras诱导的恶性转化还是时有发生,这提示Ras基因可能存在着能够逃逸衰老的机制.本文以Ras的信号通路为线索,着重阐述和总结了Ras是如何激活一些OIS过程中的关键分子从而诱导衰老的,并且描述了几种Ras通过抑制OIS的关键因子从而逃逸衰老的机制.

关键词： Ras p53 Rb OIS MAPK 原癌基因诱导的衰老

CRISPR／Cas9基因编辑／修饰系统的应用研究进展

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中华病理学杂志 2016年第2期45卷 138-141页

作者：王芳盛苗苗赵月光李珊珊罗瑛唐文如昆明理工大学医学院衰老与肿瘤分子遗传学实验室 650500

成簇、规律间隔短回文重复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats，CRISPR）／CRISPR相关序列（CRISPR associated sequences，Cas）9基因编辑／修饰系统是源于细菌及古细菌中的一种后天免疫系统，其介导的... 详细信息

关键词：免疫系统编辑基因修饰应用重复序列相关序列古细菌