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西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型及地区分布特征研究

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中华地方病学杂志 2024年第2期43卷 98-103页

作者：杨晓艳李胜靳娟何建辛有全柏吉祥吴海莲金泳张晓璐代瑞霞青海省地方病预防控制所鼠疫菌专业实验室西宁810021

目的探究西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)基因型及其地区分布特征。方法选取西藏自治区鼠疫自然疫源地内不同时... 详细信息

目的探究西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)基因型及其地区分布特征。方法选取西藏自治区鼠疫自然疫源地内不同时间、地区、宿主、媒介体内分离的125株代表性鼠疫菌株作为实验菌株,采用苯酚-氯仿混合抽提法提取鼠疫菌DNA。应用3对CRISPR引物(针对YPa、YPb、YPc 3个位点)分别对实验菌株DNA进行PCR扩增,经测序确定鼠疫菌CRISPR基因型。结果125株鼠疫菌均具有YPa、YPb、YPc 3个CRISPR位点,共发现18种间区序列(spacer),其中YPa位点8种、YPb位点6种、YPc位点4种;新发现spacer 2种,分别为b52、c14。经CRISPR基因分型,共有G1、G7、G7-b4′′′、G7-b52、G7-c2^(-)、G8、G22、G22-a4^(-)、G22-b4′′′、G22-c1410种基因型,其中6种为新发现基因型。125株实验菌株中,以G7型为主要基因型,占65.6%(82/125),在西藏自治区下辖的6个地级市和1个地区均有分布;其次为G22、G7-c2^(-)型,分别占14.4%(18/125)、11.2%(14/125),其中G22型分布于那曲市、昌都市、拉萨市及阿里地区,G7-c2^(-)型分布于日喀则市和山南市。结论西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫菌CRISPR位点遗传多态性较高,不同基因型的鼠疫菌株具有明显的地区分布特征。

关键词：鼠疫耶尔森菌规律成簇间隔短回文重复序列基因分型

基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法检测玉树藏族自治州鼠疫耶尔森菌rpsL基因耐药突变

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中华地方病学杂志 2024年第1期43卷 68-70页

作者：靳娟李胜何建杨晓艳张琪辛有全柏吉祥张丽张晓璐代瑞霞青海省地方病预防控制所鼠疫菌专业实验室，西宁810021

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)引起的一种烈性传染病,发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行,导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势,2000-2018年,世界卫生组织(WHO)共收到来自美洲、非洲和亚洲2... 详细信息

鼠疫是由鼠疫耶尔森菌(以下简称鼠疫菌)引起的一种烈性传染病,发病急、传播快且病死率极高。历史上发生过3次鼠疫大流行,导致上亿人口死亡。近20年来全球鼠疫疫情呈上升趋势,2000-2018年,世界卫生组织(WHO)共收到来自美洲、非洲和亚洲21个国家报告的2万多起鼠疫病例[1]。我国动物间鼠疫一直较为活跃,且除个别年份外,几乎每年都有人间鼠疫发生。2019年11月,北京市首先出现2例内蒙古自治区输入性肺鼠疫病例,随后内蒙古自治区又报道2例腺鼠疫病例,提示这一甲类传染病仍对人们的生命安全具有极大的潜在威胁[2,3,4]。链霉素是WHO鼠疫手册[5]和我国《鼠疫诊疗方案(试行)》(卫办应急发[2011]第18号)[6]中治疗鼠疫的首选药物。但值得注意的是,2021年Dai等[7]发现国内1株鼠疫菌因编码核糖体蛋白S12的rpsL基因第128 bp位点的碱基发生了突变,从而产生了对链霉素的高度耐药性。为此,本研究应用基于TaqMan-MGB荧光探针的实时荧光PCR法(简称MGB荧光探针法),选取鼠疫流行较为严重的玉树藏族自治州(以下简称玉树州)鼠疫自然疫源地内分离的鼠疫菌,检测链霉素耐药位点rpsL基因第128 bp位点碱基的突变情况,判断当地菌株的耐药情况,为鼠疫疫情的防控提供参考。

关键词：鼠疫 rpsL基因耐药

Barnesiella intestinihominis菌的安全性评价

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海南医学院学报 2024年第10期30卷 762-768页

作者：王玲黄冰关亚群热比亚·努力新疆医科大学基础医学院新疆乌鲁木齐830017 新疆地方病分子生物学重点实验室新疆乌鲁木齐830017

目的:对分离自健康成人粪便中且在代谢性疾病发生状态下生长可能受到抑制的Barnesiella(巴恩斯氏菌属)厌氧菌进行体内外生物安全性评价,为今后代谢性疾病的微生态制剂的研发与应用提供基础。方法:通过急性毒性试验,连续14 d给昆明鼠灌... 详细信息

目的:对分离自健康成人粪便中且在代谢性疾病发生状态下生长可能受到抑制的Barnesiella(巴恩斯氏菌属)厌氧菌进行体内外生物安全性评价,为今后代谢性疾病的微生态制剂的研发与应用提供基础。方法:通过急性毒性试验,连续14 d给昆明鼠灌胃不同剂量的Barnesiella intestinihominis(***)菌培养液,观察动物是否出现死亡、中毒现象以及观察体重、生化指标的变化进行体内安全性评价。通过溶血性实验,胃酸和肠液的耐受性实验,以及其对9种抗生素的敏感性实验来进行体外评价。结果:实验组均未出现***菌灌胃导致的死亡,中毒现象,其体重和脏器指数同对照组相比差异无统计学意义(P>0.05),各脏器也未出现任何病理学变化。***菌在哥伦比亚血琼脂平板上不产生溶血环,属于γ溶血;其胃酸耐受性不强,但肠液耐受性良好,对氯霉素、氨苄西林、万古霉素和四环素敏感,但是对链霉素、红霉素、卡那霉素、庆大霉素、克林霉素耐药。结论:口服***菌株对小鼠无毒性作用,具有良好的体内安全性,其胃酸耐受性不强,对革兰阴性菌有作用的抗生素敏感,若作为微生态制剂还需要验证对不同疾病的有益效果以及需要制作保护剂。

关键词：有益菌急性毒性实验安全性评价药敏实验 Barnesiella intestinihominis菌

基于转录组测序对GULP1下游靶基因筛选及分析

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遗传 2024年第10期46卷 860-870页

作者：温馨梅锦钱美玉蒋一丹王娟许士博王翠喆张君石河子大学医学院新疆地方病与民族高发病教育部重点实验室石河子832000

GULP1是一种含磷酸化酪氨酸结合(phosphotyrosine-binding,PTB)结构域的吞噬衔接蛋白,已有的研究表明它可促进脂肪细胞3T3-L1的糖摄取。为进一步挖掘GULP1下游关键的代谢相关差异基因,本研究对过表达GULP1的脂肪细胞和骨骼肌细胞进行转... 详细信息

GULP1是一种含磷酸化酪氨酸结合(phosphotyrosine-binding,PTB)结构域的吞噬衔接蛋白,已有的研究表明它可促进脂肪细胞3T3-L1的糖摄取。为进一步挖掘GULP1下游关键的代谢相关差异基因,本研究对过表达GULP1的脂肪细胞和骨骼肌细胞进行转录组分析,然后对表达异常基因进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,qRT-PCR)与转录组测序进行相互验证。结果表明:以P<0.05和|Log_(2)Foldchange|≥1为阈值筛选差异表达基因,发现与对照细胞相比,过表达GULP1的脂肪细胞中有278个上调基因和263个下调基因,与代谢相关的GO(Gene Ontology)条目包括胆固醇生物合成过程、胆固醇代谢过程、对脂多糖的反应、脂质代谢过程等,有52个代谢相关差异表达基因富集到10条KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路,其中脂质代谢被高度富集;过表达GULP1的骨骼肌细胞有280个上调基因和302个下调基因,与代谢相关的GO条目包括激素代谢过程、对脂多糖的反应、单碳代谢过程等,有86个代谢相关差异表达基因富集到10条KEGG通路,其中氨基酸代谢、脂质代谢、碳水化合物代谢被高度富集。GULP1的生物学功能涉及广泛,包括脂代谢、肿瘤等方面。本研究通过转录组学以及生物信息学分析,筛选出GULP1下游关键的代谢相关差异基因,获得了过表达GULP1后的代谢相关差异基因及信号通路,为今后GULP1下游靶基因的研究提供了重要的理论依据。

关键词： GULP1 转录组差异表达基因代谢生物信息学

CD147通过Akt/mTOR信号通路调控脂肪酸合成对子宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响

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临床与实验病理学杂志 2024年第3期40卷 261-267页

作者：李金秋尚香玉严怡然艾丽努尔·艾尼阿仙姑·哈斯木新疆医科大学基础医学院/新疆地方病分子生物学重点实验室乌鲁木齐836001

目的探讨CD147的表达对子宫颈癌细胞增殖、侵袭、迁移的影响和潜在的分子机制。方法分析UCSC数据库BSG基因(编码CD147蛋白)在子宫颈癌中的表达,采用Log-rank test法评估各组表达的预后差异。应用Western blot法检测CD147在Siha、Hela和H... 详细信息

目的探讨CD147的表达对子宫颈癌细胞增殖、侵袭、迁移的影响和潜在的分子机制。方法分析UCSC数据库BSG基因(编码CD147蛋白)在子宫颈癌中的表达,采用Log-rank test法评估各组表达的预后差异。应用Western blot法检测CD147在Siha、Hela和H8细胞中的表达,通过慢病毒转染Hela细胞下调CD147表达,并验证其转染效率。运用Western blot法检测各组细胞中p-Akt、p-mTOR、ACC1、FASN、E-cadherin和N-cadherin的表达;使用BODIPY染色和脂肪酸试剂盒检测细胞中脂肪酸含量;利用CCK-8、平板克隆和Transwell实验检测细胞增殖、侵袭和迁移能力。sh-CD147组经Akt激动剂(SC79)处理后,Western blot法检测细胞中p-Akt、p-mTOR、ACC1、FASN、E-cadherin和N-cadherin的表达;选用BODIPY染色和脂肪酸试剂盒检测细胞中脂肪酸含量;利用平板克隆实验和Transwell实验分别检测细胞增殖、侵袭和迁移能力。结果UCSC数据库显示CD147在子宫颈癌中的表达高于正常子宫颈组织(P<0.01);CD147过表达的患者预后不良。Western blot检测结果显示,与H8细胞相比,Siha和Hela细胞中CD147蛋白表达增高(P=0.011)。下调CD147表达后,与Hela组相比,sh-CD147组细胞中CD147、ACC1和FASN蛋白表达降低(P<0.001);BODIPY荧光染色减弱,脂肪酸含量下降(P<0.001);细胞集落形成能力、侵袭和迁移能力降低;sh-CD147组细胞中E-cadherin蛋白表达升高,N-cadherin、p-Akt和p-mTOR表达降低。与sh-CD147相比,经Akt激动剂SC-79剂处理后(sh-CD147-SC79)细胞内p-Akt、p-mTOR、ACC1、FASN和N-cadherin表达升高,E-cadherin表达降低,脂质染色和脂肪酸含量检测结果与关键酶表达一致(P<0.01),细胞增殖、侵袭迁移能力显著增强。结论CD147通过Akt/mTOR信号通路调控脂肪酸合成,促进子宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移。

关键词：子宫颈肿瘤脂肪酸合成增殖侵袭迁移 CD147

ULK3基因在前列腺癌中的生物信息学分析及其在DU145中的表达

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基因组学与应用生物学 2024年

作者：邹雨轩张云博孙梦李梦佳韩洋洋新疆医科大学基础医学院生物学教研室新疆地方病分子生物学重点实验室

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌（prostate cancer，PCa）中的潜在作用，并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145，探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况；... 详细信息

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌（prostate cancer，PCa）中的潜在作用，并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145，探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况；利用STRING数据库分析ULK3相关的互作蛋白，并对ULK3差异表达基因进行GSEA富集分析；通过GO、KEGG分析，探讨ULK3的潜在作用机制；通过miRNet平台预测了调控ULK3的微RNA（miRNA），并构建PCa中潜在的 ULK3-miRNA-mRNA调控网络；利用TIMER 2.0数据库分析了ULK3在PCa中与免疫浸润的关系。基于上述生物信息学分析，对PCa细胞DU145进行ULK3敲降处理，并通过实时定量PCR（(real-time quantitative PCR，RT-qPCR）和蛋白印迹（Western blot）检测ULK3下调效率；通过划痕实验和MTT法检测ULK3稳定下调对前列腺癌细胞增殖的影响。结果显示，ULK3在PCa癌组织中较正常前列腺组织高表达；通过富集分析，发现ULK3的表达与多种生物学功能有关，其中主要作用的通路有范可尼贫血途径和Notch信号通路；通过免疫浸润分析，发现ULK3高表达时多种免疫细胞的浸润水平显著下降。此外，成功构建敲降ULK3的前列腺癌细胞系DU145，经过划痕实验和MTT法发现敲降ULK3后对DU145细胞的迁移和增殖起到抑制作用。以上结果表明ULK3在前列腺癌中发挥重要生物学作用，敲降其对PCa可能存在抑制作用，这为后续PCa的基础研究与临床治疗提供了新的思路。

关键词： ULK3 前列腺癌(PCa) 生物信息学慢病毒增殖

2017-2021年吉林省克山病年报数据分析

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中华地方病学杂志 2024年第3期43卷 197-201页

作者：梁鹤王主祥万晓艳王婧吉林省地方病第二防治研究所克山病研究室吉林132001

目的掌握吉林省克山病病区范围及病情转归变化,为调整克山病防治工作重点提供科学依据。方法回顾性分析2017-2021年吉林省38个克山病病区县(市、区)上报的克山病年报数据,对克山病病区范围、人口数、现症患者一般情况及转归等进行描述... 详细信息

目的掌握吉林省克山病病区范围及病情转归变化,为调整克山病防治工作重点提供科学依据。方法回顾性分析2017-2021年吉林省38个克山病病区县(市、区)上报的克山病年报数据,对克山病病区范围、人口数、现症患者一般情况及转归等进行描述性分析。结果截至2021年底,吉林省克山病病区范围总体无变化,病区县、乡、村常住人口数较2017年分别减少了11.77%、26.77%、35.55%;克山病现症患者共1092例,其中潜在型克山病926例、慢型克山病166例,男女性别比为0.38∶1.00(303∶789),≥60岁者占79.76%(871/1092),且有部分患者合并其他慢性病。2021年克山病患者较2017年减少1020例,死亡、迁出(入)、失访、重新诊断分别占转归总数的34.29%(500/1458)、27.85%(406/1458)、25.51%(372/1458)、12.35%(180/1458);60岁以下中青年死亡患者共57例;5年间新发现克山病患者24例,包括潜在型克山病4例、慢型克山病20例,且有6例慢型克山病患者在确诊2年内死亡。结论吉林省克山病病区范围总体无变化,常住人口数明显减少,现症患者老龄化,部分患者存在慢性病共病,死亡、迁出(入)、失访是现症患者转归的主要原因。

关键词：克山病年报病情转归慢性病共病

吉林省孕妇碘营养状况及其与外环境水碘分布相关性分析

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中华地方病学杂志 2024年第8期43卷 657-660页

作者：杨丽芬赵景深赵鑫蕊石楠冯宝香孙慧陈慧欣吉林省地方病第二防治研究所碘缺乏病研究室吉林132001

目的了解吉林省孕妇碘营养状况及其与外环境水碘分布特征的相关性,为科学补碘防治碘缺乏病提供依据。方法采用资料回顾性分析,对吉林省2017年居民饮用水水碘调查资料和2021年碘缺乏病病情监测数据进行水碘、盐碘和孕妇尿碘含量分析。结... 详细信息

目的了解吉林省孕妇碘营养状况及其与外环境水碘分布特征的相关性,为科学补碘防治碘缺乏病提供依据。方法采用资料回顾性分析,对吉林省2017年居民饮用水水碘调查资料和2021年碘缺乏病病情监测数据进行水碘、盐碘和孕妇尿碘含量分析。结果全省9个市(自治州)、60个县(市、区)873个乡镇(街道,以下简称乡镇)的8866份水样中,水碘中位数为4.60μg/L,范围为0.00~81.30μg/L;其中,水碘中位数95%,碘盐合格率、合格碘盐食用率均>90%。6000份孕妇尿样中,尿碘中位数为169.05μg/L;除白山市为碘缺乏外,其他8个市(自治州)均为碘适宜。相关性分析结果显示,市(自治州)级孕妇尿碘水平与外环境水碘分布未见相关性(r=0.60,P=0.089)。结论吉林省大部分乡镇外环境缺碘,无水源性高碘地区;碘盐覆盖率、碘盐合格率、合格碘盐食用率均达到国家标准;孕妇碘营养总体处于适宜水平,但仍有个别地区孕妇碘营养缺乏,且与水碘分布无相关性。

关键词：碘饮用水盐类孕妇尿

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山西省水源性高碘危害防控效果分析

中华地方病学杂志 2024年第4期43卷 323-328页

作者：张向东郭百锁李红杰吴赵明冀晶武敏王永平贾清珍山西省地方病防治研究所碘缺乏病克山病研究室临汾041000 山西省地方病防治研究所业务办临汾041000 山西省地方病防治研究所临汾041000

目的评价山西省水源性高碘地区防控措施实施效果,为制定水源性高碘危害控制标准提供依据和建议。方法分别于2019年3-6月(改水前)和2020年3-6月(改水后)在山西省选择2019年拟改水的44个高碘行政村作为调查点,开展横断面调查。采集各调查... 详细信息

目的评价山西省水源性高碘地区防控措施实施效果,为制定水源性高碘危害控制标准提供依据和建议。方法分别于2019年3-6月(改水前)和2020年3-6月(改水后)在山西省选择2019年拟改水的44个高碘行政村作为调查点,开展横断面调查。采集各调查村居民饮用水水样、6~12周岁儿童家中食用盐盐样及尿样进行碘含量测定,并检查儿童甲状腺肿大情况;根据改水前水碘含量,以100μg/L为组距进行分组,比较各水碘含量组未加碘食盐覆盖情况及儿童尿碘和甲状腺肿大情况。结果改水前,44个调查村的水碘中位数为260.6μg/L,水碘均>100μg/L;改水后,水碘中位数为50.3μg/L,有32个村的水碘≤100μg/L,12个村>100μg/L。未加碘食盐覆盖率由改水前的50.0%(806/1612)上升至改水后61.8%(922/1492),二者比较差异有统计学意义(χ^(2)=65.10,P100~200、>400~500μg/L组改水前后尿碘比较差异均有统计学意义(Z=8.11、-9.25,P=0.005、0.003)。儿童甲状腺肿大率由改水前的7.8%(126/1612)下降至改水后的4.3%(64/1492),二者比较差异有统计学意义(χ^(2)=16.77,P100μg/L调查村的儿童甲状腺肿大率分别为3.7%(41/1117)、6.1%(23/375),二者比较差异有统计学意义(χ^(2)=4.15,P=0.042)。结论山西省水源性高碘地区防控效果较好,居民饮用水水碘和儿童甲状腺肿大率均显著降低;但未加碘食盐覆盖率仍较低,人群碘营养过量。建议以饮用水碘含量、儿童尿碘中位数和甲状腺肿大率为技术指标,制定国家水源性高碘危害控制标准。

关键词：饮用水碘过量防控效果