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基于蛋白质组学的慢性阻塞性肺疾病合并肺癌的关键靶点筛选与验证

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中国临床研究 2024年第1期37卷 39-45页

作者：马红霞李风森新疆医科大学第四临床医学院呼吸科新疆乌鲁木齐830000 新疆医科大学附属中医医院新疆乌鲁木齐830000

目的采用蛋白质组学分析联合生物信息学技术,初步预测慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关肺癌(COPD-LC)的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点,并进行验证。方法收集2018年12月至2021年8月新疆医科大学第四临床医学院门诊就诊的COPD、肺癌患者... 详细信息

目的采用蛋白质组学分析联合生物信息学技术,初步预测慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关肺癌(COPD-LC)的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点,并进行验证。方法收集2018年12月至2021年8月新疆医科大学第四临床医学院门诊就诊的COPD、肺癌患者以及体检的健康人员的尿液标本,并进行高通量测序。筛选差异蛋白并构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图,进行功能富集分析,进一步预测COPD-LC的关键靶点,最后采用基因表达数据库(GEO)对上述分子进行验证。结果蛋白质组学结果显示,与正常对照组相比,COPD组存在157个差异蛋白,其中上调67个,下调90个;与正常对照组相比,肺癌组存在306个差异蛋白,其中上调132个,下调174个;此外,本研究基于相互作用基因检索工具(STRING)平台,将上述差异蛋白进行PPI分析。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,COPD-LC主要富集在细胞外区域、溶酶体、细胞外空间、淀粉酶活性、蛋白酶抑制剂活性、防御/免疫蛋白活性等方面。在GEO数据库中搜索关于COPD和肺癌患者微阵列数据,最终纳入GSE8581和GSE43346共2个数据集,在GSE8581数据集中共识别出13 605个差异基因,在GSE43346数据集中识别出3 403个差异基因,进一步分析GSE8581、GSE43346数据集与COPD-LC中差异基因的重叠程度,发现潜在转化生长因子β结合蛋白(LTBP)4、N-乙酰α-D-氨基葡萄糖苷酶(NAGLU)、泛素蛋白连接酶E3成分N-识别蛋白4(UBR4)、DNA损伤结合蛋白1-CUL4相关因子(DCAF)5等4个重叠蛋白,最后在GEO数据集中获得验证。结论本研究初步揭示了LTBP4、NAGLU、UBR4、DCAF5等4个COPD-LC的潜在治疗靶点,其中靶点NAGLU、UBR4、DCAF5在COPD和肺癌中鲜有报道。上述蛋白在COPD和肺癌中均显著低表达,或可成为COPD-LC的重要诊断与治疗的生物标志物。

关键词：肺癌慢性阻塞性肺疾病蛋白质组学潜在性转化生长因子β结合蛋白4 N-乙酰α-D-氨基葡萄糖苷酶泛素蛋白连接酶E3成分N-识别蛋白4 DNA损伤结合蛋白1-CUL 4相关因子5

减量利妥昔单抗治疗ANCA相关性血管炎的单中心观察研究

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中国医院药学杂志 2024年第14期44卷 1669-1674页

作者：单慧亭王钰博吉鹏徐跃洳王轶睿陈迹杨建华新疆医科大学药学院新疆乌鲁木齐830017 新疆医科大学第一附属医院药学部新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学第一附属医院风湿免疫科新疆乌鲁木齐830011 新疆药物临床研究重点实验室新疆乌鲁木齐830011

目的:比较减量利妥昔单抗(rituximab,RTX)与环磷酰胺(cyclophosphamide,CYC)治疗抗中性粒细胞胞浆抗体相关性血管炎[antineutrophil cytoplasmic antibody(ANCA)-associated vasculitis,AAV]的有效性和安全性。方法:回顾性分析新疆医科大学第一附属医院2017年1月至2023年4月新诊断和复发AAV患者的临床资料,根据治疗方案分为RTX组和CYC组。同时收集2组基线及3、6、12个月患者的伯明翰血管炎评分(Birmingham Vasculitis Activity Score,BVAS)、糖皮质激素用量、白蛋白、血肌酐(serum creatinine,Scr)、24 h尿蛋白定量,并记录药物使用期间发生的不良反应,比较2组缓解率、复发率和不良反应发生率的差异。结果:共纳入RTX组患者41例和CYC组患者81例,治疗后6个月,2组患者缓解率无明显差异(P>0.05),RTX组的BVAS评分、糖皮质激素用量低于CYC组(P0.05)。安全性方面,RTX组低丙种球蛋白发生率高于CYC组(P<0.05),CYC组治疗期间出现胃肠道反应,其余不良事件2组间无显著差异。结论:减量RTX联合糖皮质激素治疗AAV可明显缓解疾病活动度,减少激素剂量,延缓疾病进展。

关键词：利妥昔单抗环磷酰胺 ANCA相关性血管炎疗效安全性

基于入院指标的细菌性肝脓肿液化成熟度贝叶斯统计预测模型构建

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中国普通外科杂志 2024年第1期33卷 52-60页

作者：王一鸣张誉李岩王海阿斯哈提·库万太陈凯新疆医科大学第五附属医院肝胆胰腺外科新疆乌鲁木齐830000

背景和目的:脓肿的液化成熟度是影响细菌性肝脓肿(PLA)患者早期治疗、有创引流及预后康复的一个重要因素。在疾病早期能够有效诊断PLA并及时给予相应的评估与治疗是临床诊疗的重点和难点。目前,国内外的诊疗策略是通过增强CT、MRI检查... 详细信息

背景和目的:脓肿的液化成熟度是影响细菌性肝脓肿(PLA)患者早期治疗、有创引流及预后康复的一个重要因素。在疾病早期能够有效诊断PLA并及时给予相应的评估与治疗是临床诊疗的重点和难点。目前,国内外的诊疗策略是通过增强CT、MRI检查及手术情况确定脓肿性质,缺乏快速确定脓肿性质的手段。本研究利用入院常规检查指标,通过采用贝叶斯统计方法,构建PLA液化成熟度的预测模型,为PLA的早期诊断和治疗提供科学依据。方法:收集2018年1月—2022年12月期间新疆医科大学第五附属医院收治的116例PLA患者资料。根据增强CT、手术情况明确的脓肿成熟度,将患者分完全液化组(59例)与未完全液化组(57例),比较两组患者入院常规检查指标和临床特征。对原始资料进行二分类,经筛选后得出诊断价值较大的指标。采用贝叶斯统计法建立PLA液化成熟度预测模型,并选取2023年1月—2023年11月期间新疆医科大学第五附属医院接诊的23例PLA患者对模型进行验证,并生成受试者工作曲线(ROC)评估本预测模型的预测效能。结果:筛选结果显示,发病时间、白细胞计数、中性粒细胞计数、中性粒细胞百分比、中性粒细胞与淋巴细胞比值、血小板计数、血清降钙素原、天门冬氨酸氨基转移酶、平扫CT值等因素与PLA的脓肿液化成熟度明显相关(均P院常规检查指标和临床特征进行使用,具有良好的敏感度和特异度。

关键词：肝脓肿,化脓性/诊断贝叶斯定理液化程度

基于网络药理学、分子对接及实验验证探讨清心宁神汤治疗心不藏神不寐的作用机制

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海南医学院学报 2024年

作者：吴金鸿张星平梁政亭梁瑞宁陈旭贾宏林李振辉胡燕玲崔文军胡龙涛新疆医科大学第四临床医学院/附属中医医院

目的：基于网络药理学、分子对接技术探讨清心宁神汤治疗心不藏神不寐的作用机制，并进行实验验证。方法：采用中药系统药理学数据库分析平台对清心宁神汤的药物活性成分及其靶点进行检索，接着在disgenet、OMIM和GeneCards数据库中查... 详细信息

目的：基于网络药理学、分子对接技术探讨清心宁神汤治疗心不藏神不寐的作用机制，并进行实验验证。方法：采用中药系统药理学数据库分析平台对清心宁神汤的药物活性成分及其靶点进行检索，接着在disgenet、OMIM和GeneCards数据库中查询并筛选出与失眠相关的靶点。随后，构建蛋白相互作用网络（PPI）数据库，并将药物与疾病相关的交集基因上传至DAVID数据库以进行KEGG和GO通路的富集分析，从而预测清心宁神汤治疗失眠的潜在作用靶点和信号通路。此外，对清心宁神汤的主要活性成分与核心靶点蛋白进行分子对接分析，并通过动物实验来验证这些活性成分与蛋白靶点对治疗心不藏神失眠大鼠模型的相关指标的影响。结果：在药物作用靶点与失眠相关靶点基因的交集分析中，共识别出181个同时与失眠和药物相关的靶点基因。其中AKT1、TNF、TP53、IL-6、IL-1β为核心靶点，GO分析共筛选条目1052条，清心宁神汤治疗失眠富集的生物功能（BP）主要条目789条，细胞成分（CC）相关的有103条，分子功能（MF）相关的有160条；KEGG通路富集分析揭示了PI3K/AKT等170条信号通路的显著富集；而分子对接分析表明，AKT、NRF2、SOD等关键靶点与治疗失眠药物的亲和力较强。动物实验结果显示，清心宁神汤可改善GSH-Px、SOD及NRF2的表达，改善体内的氧化应激反应。结论：清心宁神汤能够通过作用于多个靶点和多条信号通路，对人体的氧化应激反应产生影响，从而改善GSH-Px、SOD及NRF2的表达水平，并调节PI3K/AKT信号通路中关键蛋白的表达，实现治疗心不藏神不寐的效果。

关键词：清心宁神汤心不藏神不寐网络药理学分子对接机制研究

钙结合蛋白S100A4通过TLR4/NF-κB信号通路调控胶质瘤细胞增殖、存活及迁移功能

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中国免疫学杂志 2024年第5期40卷 910-917页

作者：张丁山陶甜莫诗卉吴通前何菁菁余芳贵州医科大学附属医院临床检验中心贵州医科大学医学检验学院贵阳550004 贵州医科大学附属医院临床医学研究中心贵阳550004

目的:探索外源性钙结合蛋白S100A4对胶质瘤细胞增殖、存活及迁移功能的影响及机制。方法:利用UCSC数据库下载泛癌数据集,进行S100A4在泛癌中的表达及预后分析;从CGGA数据库中下载胶质瘤患者的转录组数据和临床数据,利用R软件进行分析S10... 详细信息

目的:探索外源性钙结合蛋白S100A4对胶质瘤细胞增殖、存活及迁移功能的影响及机制。方法:利用UCSC数据库下载泛癌数据集,进行S100A4在泛癌中的表达及预后分析;从CGGA数据库中下载胶质瘤患者的转录组数据和临床数据,利用R软件进行分析S100A4表达在胶质瘤患者中的预后与进展;利用在线分析工具GEPIA与STRING进行胶质瘤患者的S100A4蛋白质网络互作分析。体外培养人胶质瘤细胞系(U87与U251),实验分为3组:PBS组、S100A4组、S100A4+TAK242组[瑞沙托维(TAK242)为Toll-样受体4(TLR4)特异性抑制剂]。流式细胞术检测胶质瘤细胞的增殖与凋亡;细胞划痕实验、Transwell实验及克隆形成实验检测U87与U251细胞的迁移及增殖能力;Western blot检测TLR4蛋白、NF-κB相关信号分子蛋白水平。结果:生物信息学结果显示,S100A4在多种肿瘤中显著上调(P及存活功能。

关键词：胶质瘤 S100A4 增殖迁移 TLR-4/NF-κB信号通路

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SACS基因新发纯合突变致Charlevoix-Saguenay型常染色体隐性痉挛性共济失调一家系研究

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中华神经科杂志 2024年第6期57卷 593-599页

作者：李海江庞爱兰张艳兰韩雁冰昆明医科大学第一附属医院神经内科云南省神经系统疾病临床医学研究中心昆明650032

目的:报道 SACS基因新发纯合突变致Charlevoix-Saguenay型常染色体隐性痉挛性共济失调(ARSACS)患者的临床及遗传学特点,提高临床医师对该病的认识。方法:对2022年3月就诊于昆明医科大学第一附属医院神经内科遗传代谢专病门诊的1个近亲... 详细信息

目的:报道 SACS基因新发纯合突变致Charlevoix-Saguenay型常染色体隐性痉挛性共济失调(ARSACS)患者的临床及遗传学特点,提高临床医师对该病的认识。方法:对2022年3月就诊于昆明医科大学第一附属医院神经内科遗传代谢专病门诊的1个近亲结婚家系中的患者和父母进行详细的神经系统体格检查,提取患者及其父母外周血DNA,应用二代测序技术对患者及其父母进行全外显子测序(WES),变异位点经Sanger测序验证,并应用软件对突变位点进行分析。结果:患者为18岁汉族男性,3岁起病,表现为进行性双下肢发僵、行走不稳,体检发现双下肢锥体束征、小脑性共济失调、高足弓和锤状趾。其头颅磁共振成像(MRI)T 2WI和T 2液体衰减反转恢复序列(FLAIR)示双侧脑桥对称性低信号,小脑萎缩,胼胝体变薄。神经电生理检查结果显示感觉运动性周围神经病。眼科检查发现患者双眼共同性外斜视、双眼屈光不正。WES结果显示患者 SACS基因第10号外显子c.6958T>C(***2320His)纯合变异,父母为杂合变异,并经Sanger测序验证。根据美国医学遗传学与基因组学学会指南该变异评级为疑似致病变异(PM1+PM2+PP3+PP4)。故该患者明确诊断为 SACS基因纯合突变c.6958T>C导致的ARSACS。结论:本研究发现 SACS基因1个新的致病变异(c.6958T>C),导致了ARSACS,其主要临床特征为小脑性共济失调、锥体束征和感觉运动性周围神经病,头颅MRI检查T 2WI和T 2FLAIR双侧脑桥对称性低信号有助于缩小鉴别诊断范围。

关键词：共济失调 SACS基因突变全外显子测序

单侧双通道脊柱内镜与单通道脊柱内镜下经椎间孔腰椎椎间融合术治疗单节段退行性腰椎管狭窄症伴腰椎滑脱的前瞻性对比研究

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中国修复重建外科杂志 2024年第5期38卷 521-528页

作者：吴帝求舒涛卢黔威沈茂贵州医科大学临床医学院贵阳550004 贵州医科大学附属医院骨科贵阳550004

目的比较单侧双通道脊柱内镜下经椎间孔腰椎椎间融合术(unilateral biportal endoscopic transforaminal lumbar interbody fusion,UBE-TLIF)与单通道脊柱内镜下经椎间孔腰椎椎间融合术(endoscopic transforaminal lumbar interbody fusion,Endo-TLIF)对单节段退行性腰椎管狭窄症伴腰椎滑脱的治疗效果。方法纳入2019年11月—2023年5月收治且符合选择标准的81例单节段退行性腰椎管狭窄症伴腰椎滑脱患者,随机分为UBE-TLIF组(39例)和Endo-TLIF组(42例)。两组患者性别、年龄、身体质量指数、手术节段及术前腰、腿痛疼痛视觉模拟评分(VAS)、Oswestry功能障碍指数(ODI)、血清学指标肌酸激酶(creatine kinase,CK)和C反应蛋白(C reactive protein,CRP)水平等基线资料比较差异均无统计学意义(P>0.05)。记录并比较两组患者总失血量(total blood loss,TBL)、术中失血量、隐性失血量(hidden blood loss,HBL)、术后引流量、手术时间;比较两组术前1 d及术后1、3、5 d血清学指标CK、CRP水平,术前1 d及术后1 d、3个月、6个月、12个月腰、腿痛VAS评分、ODI及术后12个月椎间融合率。结果所有手术均顺利完成,无切口感染、血管神经损伤、硬膜外血肿、硬脑膜撕裂和术后截瘫等情况发生。UBE-TLIF组手术时间少于Endo-TLIF组,但术中失血量、TBL、HBL均多于Endo-TLIF组,差异均有统计学意义(P0.05)。UBE-TLIF组术后1、3 d CK水平及术后1、3、5 d CRP水平均高于Endo-TLIF组(P0.05)。两组患者均获随访12个月。两组术后各时间点腰、腿痛VAS评分及ODI均较术前显著改善(P及ODI比较差异均无统计学意义(P>0.05)。术后12个月两组椎间融合率比较差异亦无统计学意义(P>0.05)。结论UBE-TLIF与Endo-TLIF均为治疗退行性腰椎管狭窄症伴腰椎滑脱的有效方法,但与Endo-TLIF相比,UBE-TLIF需在微创技术上进一步改进,以减少组织创伤与失血量。

关键词：腰椎管狭窄症腰椎滑脱单侧双通道脊柱内镜技术经椎间孔腰椎椎间融合术

PCID2在胃癌组织中高表达并通过调控细胞周期进程和增殖影响患者预后

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南方医科大学学报 2024年第2期44卷 324-332页

作者：张诺张震张雨路宋雪张小凤李静左芦根胡建国蚌埠医科大学第一附属医院检验科安徽蚌埠233000 蚌埠医科大学第一附属医院胃肠外科安徽蚌埠233000 蚌埠医科大学第一附属医院炎症相关性疾病基础与转化研究安徽省重点实验室安徽蚌埠233000 蚌埠医科大学第一附属医院中心实验室安徽蚌埠233000 蚌埠医科大学临床医学院安徽蚌埠233000

目的探讨扩增基因PCI结构域2(PCID2)在胃癌中的表达情况及其对细胞周期进程和增殖的影响,并分析其可能的分子机制。方法纳入2012年1月~2016年12月在我院接受胃癌根治术的患者100例,检测胃癌和癌旁组织中PCID2的表达差异;统计学分析PCID... 详细信息

目的探讨扩增基因PCI结构域2(PCID2)在胃癌中的表达情况及其对细胞周期进程和增殖的影响,并分析其可能的分子机制。方法纳入2012年1月~2016年12月在我院接受胃癌根治术的患者100例,检测胃癌和癌旁组织中PCID2的表达差异;统计学分析PCID2表达水平对胃癌进展及术后5年生存率的影响;采用GO富集分析预测PCID2参与胃癌恶性进展的可能作用途径;体外采用慢病毒转染特异性敲低和过表达胃癌细胞系(MGC-803)中PCID2表达,并分析其对细胞增殖及周期的影响;进一步通过裸鼠移植瘤模型进行在体验证;最后通过组织样本分析结合体内外研究,分析PCID2影响胃癌细胞的分子机制。结果相较于癌旁组织,PCID2在胃癌组织中高表达(P及CEA水平呈正相关(P研究的患者分为PCID2高表达组(n=50)和PCID2低表达组(n=50),PCID2高表达组患者术后5年生存率显著低于PCID2低表达组(P研究表明,胃癌组织中p27、p16蛋白表达水平较癌旁组织均明显降低(P<0.05)。此外,PCID2过表达抑制细胞周期调控蛋白p27、p16的表达,敲低则相反(P<0.05)。结论PCID2在胃癌组织中高表达且与患者预后不良密切相关,其可能通过抑制p27、p16表达促进胃癌细胞增殖和细胞周期进程。

关键词：胃癌 PCID2 预后细胞周期增殖

三阴性乳腺癌新辅助化疗病理完全缓解的影响因素

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中国临床研究 2024年第3期37卷 354-358页

作者：段帅地力木拉提·艾斯木吐拉王海燕郭晨明新疆医科大学第一附属医院乳腺外科新疆乌鲁木齐830054

目的分析影响三阴性乳腺癌(TNBC)新辅助化疗(NAC)后病理完全缓解(pCR)的临床与病理因素。方法收集2018年1月至2023年9月于新疆医科大学第一附属医院行NAC及手术治疗的78例TNBC患者的临床与病理资料行回顾性分析,按其是否达到pCR分为pC... 详细信息

目的分析影响三阴性乳腺癌(TNBC)新辅助化疗(NAC)后病理完全缓解(pCR)的临床与病理因素。方法收集2018年1月至2023年9月于新疆医科大学第一附属医院行NAC及手术治疗的78例TNBC患者的临床与病理资料行回顾性分析,按其是否达到pCR分为pCR组(n=28)和non-pCR组(n=50),采用logistic回归分析影响pCR的临床与病理因素,并比较TP方案(紫杉类+铂类)与TAC方案(紫杉类+蒽环类+环磷酰胺)NAC后pCR率和不良反应发生率。结果总体pCR率为35.9%,两组患者在瘤体直径、化疗周期、化疗方案、紫杉醇类型、人类表皮生长因子受体2 (HER-2)表达、Ki-67表达及雄激素受体(AR)阳性表达方面差异均具有统计学意义(P0.05)。结论 TNBC新辅助化疗采用TP或TAC方案并选用白蛋白结合型紫杉醇均有利于达到pCR状态,但TP方案的pCR率优于TAC方案,且不良反应发生率相当。而瘤体直径≤3 cm的pCR率更高,HER-2低表达,或Ki-67低表达,或AR阳性表达均预示较低的pCR率,且AR阳性表达是pCR的独立不利影响因素。

关键词：三阴性乳腺癌新辅助化疗病理完全缓解临床病理特征紫杉醇雄激素受体人类表皮生长因子受体2