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采自珠穆朗玛峰冻土的螺旋聚孢霉属1新种

菌物研究 2025年

作者：姜宁王永鹏薛寒李永中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室日喀则市生态环境监测中心

螺旋聚孢霉属Clonostachys隶属于肉座菌目Hypocreales生赤壳科Bionectriaceae，是常见的土栖真菌。该属真菌主要是内生菌、附生菌和腐生菌，一些种类被用作生防菌。极端生境中分离获得的螺旋聚孢霉菌株可能具有较强的抗逆性，更适用于... 详细信息

螺旋聚孢霉属Clonostachys隶属于肉座菌目Hypocreales生赤壳科Bionectriaceae，是常见的土栖真菌。该属真菌主要是内生菌、附生菌和腐生菌，一些种类被用作生防菌。极端生境中分离获得的螺旋聚孢霉菌株可能具有较强的抗逆性，更适用于商业生产。本研究从我国西藏珠穆朗玛峰自然保护区采集的冻土样品中分离获得2株土壤真菌菌株，通过形态学特征结合ITS-LSU-rpb2-tef1-tub2多基因片段系统发育分析鉴定为螺旋聚孢霉属新物种，定名为西藏螺旋聚孢霉Clonostachys tibetensis。

关键词：子囊菌极端环境真菌分类分子系统学

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中国海南岛生物区系起源的新认识

中国科学:地球科学 2025年第1期 52-61页

作者：朱华中国科学院西双版纳热带植物园综合保护中心云南省东南亚生物多样性保护国际联合实验室云南省热带雨林与亚洲象保护重点实验室

中国海南岛的生物区系起源是一个引人探索的基本科学问题.地质学、古地磁学和生物区系比较研究曾提出“海南岛在始新世时连接着越南和广西,后来发生了向东南的移动,最终到达了现在位置”的观点.本文从海南岛生物类群的分子系统发育和古... 详细信息

中国海南岛的生物区系起源是一个引人探索的基本科学问题.地质学、古地磁学和生物区系比较研究曾提出“海南岛在始新世时连接着越南和广西,后来发生了向东南的移动,最终到达了现在位置”的观点.本文从海南岛生物类群的分子系统发育和古植物学研究例证,支持海南岛在始新世时可能连接着越南和广西.海南岛生物类群的基因组、系统发育和分子生物地理学研究揭示的生物地理格局显示,分化时间较早(中新世以前)的属和种,用海南岛在始新世时连接着越南和广西能较好地解释.根据东南亚地质板块重建理论,中新世中期(约15Ma前),海南岛已向东南移动到了现在的位置,对分化时间较晚的类群,如物种的种群和遗传分化,可用海南岛已与大陆的雷州半岛接近以及有了密切的陆地连接合理解释,但并不都是如此.古植物学研究揭示在始新世-渐新世时中国西南部和海南岛具有一个亚热带性质的植被和植物区系,但中国东南部(茂名)晚始新世群显示了具有热带雨林植被和植物区系,暗示海南岛在古近纪时可能位于靠近或接壤广西西南部和越南北部的位置.植物区系研究揭示了海南的植物区系分区基本上呈东北-西南倾斜分布格局,这与古地磁学研究提出的海南岛向东南移动过程中发生了逆时针旋转可以互为印证.本文是在地质学和生物区系比较研究提出的海南岛起源观点的基础上,从分子系统发育、古植物学研究及海南植物多样性分布格局多学科结合上进一步论证海南岛生物区系的起源与演化,提出了演化的时间节点是在中新世,为深入探讨海南岛生物区系的起源与演化提供依据.

关键词：分子系统发育生物地理古植物学生物区系起源海南岛

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葡萄牙栖盐田菌LLJ914的全基因组测序和比较基因组分析

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2025年第1期55卷 51-65页

作者：李娟娟刘子涵王雅楠刘莉君张晓华于敏中国海洋大学海洋生命学院山东青岛266003 青岛海洋科技中心海洋生态与环境科学功能实验室山东青岛266237 中国海洋大学进化与海洋生物多样性研究所山东青岛266003

栖盐田菌属细菌因具有较强渗透压耐受能力而备受关注。然而,目前对其适应高盐或其他海洋极端环境的机制尚未探明。为揭示分离自冲绳海槽热液区的葡萄牙栖盐田菌(Salinicola lusitanus)LLJ914与其同属菌株之间的遗传特征及代谢潜力的差异... 详细信息

栖盐田菌属细菌因具有较强渗透压耐受能力而备受关注。然而,目前对其适应高盐或其他海洋极端环境的机制尚未探明。为揭示分离自冲绳海槽热液区的葡萄牙栖盐田菌(Salinicola lusitanus)LLJ914与其同属菌株之间的遗传特征及代谢潜力的差异,探究其在极端海洋生境下的适应机制。通过全基因组测序获得葡萄牙栖盐田菌LLJ914全基因组序列,选取同属其他菌株的基因组进行比较基因组学分析,探究栖盐田菌属各菌株及不同环境来源的葡萄牙栖盐田菌代谢潜力的差异。菌株LLJ914基因组大小为4781556 bp,GC含量为64.0%,共编码4229个蛋白,69个tRNA,12个rRNA。通过构建系统发育树,并进行平均核苷酸和平均氨基酸一致性分析,发现该菌株与马齿苋(Halimione portulacoides)内共生的葡萄牙栖盐田菌CR50^(T)亲缘关系最近。通过功能基因注释分析,发现葡萄牙栖盐田菌具有抵抗各种重金属的相关基因和利用甲基膦酸产生甲烷的phn基因簇;相比于植物内共生菌CR50^(T),菌株LLJ914基因组中包含更多与氨基酸和碳水化合物的运输代谢、能量生产和转换以及转录相关的功能基因。此外,菌株LLJ914基因组中还包含特有的与重金属抵抗、免疫防御及有氧呼吸相关的基因,这可能与其适应复杂极端的深海热液环境有关。本研究揭示了葡萄牙栖盐田菌LLJ914适应深海热液环境的遗传特征及代谢潜力,为更好地认识热液微生物的生态功能提供了参考。

关键词：葡萄牙栖盐田菌极端环境热液区冲绳海槽全基因组测序比较基因组分析

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杭州市蘑菇纲大型真菌4个中国新记录种

菌物研究 2025年

作者：刘树彬郑紫薇李婉莹张丽荣金世超盖宇鹏吴芳北京林业大学生态与自然保护学院林木资源高效生产全国重点实验室生态环境部环境规划院生物多样性与自然保护地研究中心鲁东大学农学院

本研究通过对杭州市大型真菌资源进行调查和标本采集，利用形态学和分子系统发育学方法对采集的标本进行物种鉴定，基于ITS序列进行系统发育学分析，共发现了蘑菇纲的4个中国新记录种：淡黄盖蘑菇Agaricus luteopallidus Linda J. Chen... 详细信息

本研究通过对杭州市大型真菌资源进行调查和标本采集，利用形态学和分子系统发育学方法对采集的标本进行物种鉴定，基于ITS序列进行系统发育学分析，共发现了蘑菇纲的4个中国新记录种：淡黄盖蘑菇Agaricus luteopallidus Linda J. Chen， Karun.， R.L. Zhao & K.D. Hyde、拟乌黑粉褶菌Entoloma pseudosubcorvinum Kumla， Suwannar. & S. Lumyong、双色裸脚伞Gymnopus bicolor A.W. Wilson， Desjardin & E. Horak、狭孢棱孔菌Favolus gracilisporus H. Lee， N.K. Kim & Y.W. Lim，对上述4个中国新记录种进行了详细形态描述，补充了分布和生境信息。

关键词：蘑菇纲蘑菇目多孔菌目形态学系统发育

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松材线虫胁迫对5种松树的代谢组共性表达

东北林业大学学报 2025年第2期53卷 158-170页

作者：游丰黄瑞芬张歆逢吴思琪于海英刘雨晴国家林业和草原局生物灾害防控中心沈阳110034 基因赛奥(大连)生物科技发展有限公司

为研究松树在松材线虫胁迫下的分子防御机制,分别选取15~20年生的辽宁抚顺的油松(LY)、辽宁抚顺的红松(LH)、山东威海的赤松(SC)、山东威海的黑松(SH)、湖南长沙的马尾松(HM)5种代表性松树作为研究对象,运用液相色谱-质谱联用技术的非... 详细信息

为研究松树在松材线虫胁迫下的分子防御机制,分别选取15~20年生的辽宁抚顺的油松(LY)、辽宁抚顺的红松(LH)、山东威海的赤松(SC)、山东威海的黑松(SH)、湖南长沙的马尾松(HM)5种代表性松树作为研究对象,运用液相色谱-质谱联用技术的非靶向代谢组学,将以上5种松树分为健康组和感病组,分别对5组松树样本的差异代谢物分布情况、差异代谢物的共性特征、共有差异代谢物的表达显著性、代谢通路富集分布情况、差异性代谢通路的共性特征等进行研究。结果表明:5种松树感染松材线虫后的代谢产物在苯和取代衍生物、羧酸及其衍生物、脂肪酰基、酚类、孕烯醇酮脂类、类固醇及其衍生物、其他类等7类化合物中分布较为集中;HM、LH、LY和SC,HM、LY、SC和SH这两种组合,只有1种共有的显著性差异代谢物,分别是百里酚和6-姜酮酚,5种松树以及剩下的其他4种松树的组合都没有共有的显著性差异代谢物;HM、LY、SC和SH感染松材线虫后,6-姜酮酚表达量显著升高,LH感染松材线虫后,6-姜酮酚表达量无显著性差异;HM、SC、LY和LH感染松材线虫后,百里酚表达量显著升高,SC感染松材线虫后,百里酚表达量无显著性差异;HM、LH、LY、SC、SH分别富集到51、55、46、71、43条差异显著的信号通路,5种松树共有的差异显著的信号通路共有19条,主要反映在植物的抗逆相关信号通路上,包括花生四烯酸代谢、亚油酸代谢、苯丙烷生物合成、多种氨基酸代谢等。

关键词：松材线虫代谢组百里酚 6-姜酮酚

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泰顺县中华穿山甲栖息地适宜性评价

浙江师范大学学报（自然科学版） 2025年第1期48卷 60-67页

作者：刘雷雷余盛武王诗丰章书声程宏毅浙江乌岩岭国家级自然保护区管理中心浙江温州325500 钱江源-百山祖国家公园龙泉保护中心浙江丽水323700 青田县林业局浙江青田323900 浙江师范大学野生动物生物技术与保护利用省重点实验室浙江金华321004

通过构建中华穿山甲在泰顺县的潜在分布预测模型,评估模型的预测精度,识别影响中华穿山甲分布的关键环境因子,预测泰顺县内中华穿山甲的潜在适宜分布区域.采用最大熵模型(MaxEnt)构建中华穿山甲的潜在分布预测模型,利用AUC值评估模型的... 详细信息

通过构建中华穿山甲在泰顺县的潜在分布预测模型,评估模型的预测精度,识别影响中华穿山甲分布的关键环境因子,预测泰顺县内中华穿山甲的潜在适宜分布区域.采用最大熵模型(MaxEnt)构建中华穿山甲的潜在分布预测模型,利用AUC值评估模型的预测精度以分析环境变量的贡献率和重要性排序,并识别关键影响因子;基于响应曲线分析中华穿山甲的生境偏好,根据MaxEnt模型的预测结果,确定泰顺县内的潜在适宜分布区域.结果表明:训练集AUC值为0.838,模型预测结果达到“好”的标准,可信度较高,坡度、距道路距离和距居民点距离是影响中华穿山甲分布的前三大关键因子,累计贡献率高达84.8%;中华穿山甲最适宜的生境条件为:海拔低于600 m、距离居民点和道路超过100 m、距离水源100~800 m、坡度大于30°、南坡及西南坡方向;泰顺县内中华穿山甲的高中适宜分布区总面积约为459.5 km^(2),占县域面积的28.5%;中华穿山甲偏好相对封闭、远离人类干扰活动的生境,具体为较低海拔、地形平缓、不受人为干扰的常绿阔叶林或针阔混交林.研究为中华穿山甲的保护管理提供了科学依据,如优先保护高中适宜区域、限制人类活动干扰等,未来可进一步开展穿山甲种群动态监测,了解其实际分布状况,并采取针对性的保护措施.

关键词：适宜栖息地 MaxEnt模型中华穿山甲环境因子贡献率

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三江源国家公园功能分区与目标管理

生物多样性 2017年第1期25卷 71-79页

作者：付梦娣田俊量朱彦鹏田瑜赵志平李俊生中国环境科学研究院生物多样性研究中心北京100012 三江源国家公园管理局西宁810007

功能分区是国家公园总体规划和科学管理的重要环节。本研究以三江源国家公园黄河源园区为研究对象,在综合分析区域生态环境基本特征的基础上,选择生态系统服务、重要物种潜在生境、生态敏感性、生态压力4大类13项评价指标,构建了国家公... 详细信息

功能分区是国家公园总体规划和科学管理的重要环节。本研究以三江源国家公园黄河源园区为研究对象,在综合分析区域生态环境基本特征的基础上,选择生态系统服务、重要物种潜在生境、生态敏感性、生态压力4大类13项评价指标,构建了国家公园功能分区评价指标体系,运用层次分析法(AHP)和专家打分法,结合管控目标需求,将黄河源园区划分为核心保育区、生态保育修复区、传统利用区、居住和游憩服务区4个功能区,保护程度依次降低,利用程度及公众可进入性依次增强。该功能分区不仅可为三江源国家公园合理规划打下理论基础,同时也对同类型的国家公园具有可借鉴性。

关键词：国家公园三江源功能分区指标体系管控措施

增进城市地区生物多样性——以新加坡模式为例

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风景园林 2019年第8期26卷 25-34页

作者：林良任[新加坡] 陈莉娜[新加坡] 鲁·艾德里安·福铭[新加坡] 邢子博(译) 张天洁(校) 李天娇[新加坡](校) 新加坡国家公园局国家生物多样性中心新加坡国家公园局国际生物多样性保护司新加坡国家公园局保护和野生动物管理部门天津大学建筑学院

自1963年以来,新加坡开展实施了绿化计划,并经历了从“花园城市”到“花园中的亲生态城市”的演变。为了在新加坡实现生物多样性保护,国家公园局制定了自然保护蓝图,重点介绍该规划实施的关键是利用技术创新。新加坡城市生物多样性指数... 详细信息

自1963年以来,新加坡开展实施了绿化计划,并经历了从“花园城市”到“花园中的亲生态城市”的演变。为了在新加坡实现生物多样性保护,国家公园局制定了自然保护蓝图,重点介绍该规划实施的关键是利用技术创新。新加坡城市生物多样性指数是一种评价生物多样性成效的自我评估工具,已在全球范围内的多个城市得到应用。

关键词：风景园林城市生物多样性保护亲生态城市自然保护蓝图监测工具新加坡

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类器官技术在医疗领域的应用和监管挑战

中国组织工程研究 2025年第1期29卷 202-210页

作者：程玮璐王泽华张译丹刘英慧国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心临床与生物统计一部北京市100081 国家药品监督管理局医疗器械技术审评检查大湾区分中心广东省深圳市518045

背景:3D类器官具有类似于生理组织并在一定程度上模仿器官功能的特点,使其成为从基础发育/干细胞研究到个性化医疗等应用的出色模型。目的:综述并讨论类器官可应用的疾病类型和肿瘤建模等应用领域,以及其监管现状和挑战。方法:以“类器... 详细信息

背景:3D类器官具有类似于生理组织并在一定程度上模仿器官功能的特点,使其成为从基础发育/干细胞研究到个性化医疗等应用的出色模型。目的:综述并讨论类器官可应用的疾病类型和肿瘤建模等应用领域,以及其监管现状和挑战。方法:以“类器官,干细胞,疾病模型,3D打印技术,医疗领域”为中文检索词,以“organoid,stem cell,disease model,3D printing technology,medical field”为英文检索词,检索PubMed、Elsevier、万方、中国知网等数据库,对国内外类器官产品进行汇总分析,总结出类器官技术在医疗领域中的应用情况,并对类器官产品在医疗领域的未来发展进行展望。结果与结论:类器官组织可以打破传统细胞和动物模型的局限性,规避临床研究中存在的伦理问题,与源器官具有高度相似性,与人类系统的生理和病理具有更加相似的表现且遗传稳定,在当前研究中具有极大的优势。类器官在以下领域已得到应用:药效评价研究(临床前模型),包括肠道类器官、肾脏类器官、肝脏类器官、胆囊类器官、肺类器官、脑类器官、心脏类器官、皮肤类器官、生殖系统类器官等;传染病研究;肿瘤研究及精准治疗;再生医学;免疫类器官。美国、欧盟和中国虽暂无完善的监管规定,但均在努力推进类器官监管法律法规的制定。在国内,类器官医疗器械产品虽暂无已上市产品,但与其相关的再生医学产品已有突破性进展。

关键词：类器官干细胞疾病模型 3D打印技术医疗领域综述