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中国百日咳实验室检测及质量管理专家共识

中华检验医学杂志 2024年第5期47卷 498-505页

作者：中国妇幼保健协会临床诊断与实验医学分会柯江维冉飞钟龙青不详江西省儿童医院检验科贵州省人民医院检验科

百日咳是一种由百日咳杆菌通过飞沫传播,感染人类引起的急性呼吸道传染病。百日咳的规范化治疗的前提是早期、及时、准确识别感染者,实验室检测及质量管理对诊断和监测百日咳感染具有重要的临床价值。为提高百日咳实验室检测效率及质量... 详细信息

百日咳是一种由百日咳杆菌通过飞沫传播,感染人类引起的急性呼吸道传染病。百日咳的规范化治疗的前提是早期、及时、准确识别感染者,实验室检测及质量管理对诊断和监测百日咳感染具有重要的临床价值。为提高百日咳实验室检测效率及质量,为临床百日咳的诊断和治疗提供规范化数据支持和应用,中国妇幼保健协会临床诊断与实验医学分会组织专家参考国内外相关文献指南,总结梳理百日咳实验室检测及质量管理研究进展,形成本共识。重点阐述实验室检测方法及质量管理在百日咳诊疗方面的临床应用,使百日咳的实验室检测更有效地服务于百日咳患者诊疗和预后评估。

关键词：百日咳传染病实验室质量管理

海南类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌（***）临床分离株的基因岛（genomicisland，GI）特征和毒力因子差异，为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株，PCR检测和测序分析毒力相关GI，在Islandviewr4平台上提交全基因组序列注释... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌（***）临床分离株的基因岛（genomicisland，GI）特征和毒力因子差异，为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株，PCR检测和测序分析毒力相关GI，在Islandviewr4平台上提交全基因组序列注释格式文件，整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI，通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株***临床分离株，结果显示，52个基因组按进化距离分为3个分枝，其中82.69%（43/52）菌株集中在分枝1。52个***基因组共识别出828个GI，按序列相似性聚类为157个GIcluster。GI在基因组中占比达2.05%～6.38%。GIcluster1和2存在全部菌株中，但84个（53.50%）GIcluster只聚类到单个基因组。10个GIcluster很可能是特有的，其中5个来源同属细菌，2个来源其他属，3个来源不确定。25个GIcluster与毒力相关，*** BP76和BP169含有其中8个，是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株***的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异，其余都表现一致。与泰国和澳大利亚***临床菌株比较，boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现显著差异，同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现显著差异。结论海南地区B. pseudomallei GI具有保守性和独特性，通过特有GI和毒力因子研究，可以发现菌株水平基因转移（Horizontal gene transfer，HGT）的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移

基于全基因组测序的耐多黏菌素和替加环素肺炎克雷伯菌特征研究

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中国抗生素杂志 2024年第6期49卷 700-704页

作者：周燕霞郭辉金华市人民医院检验科金华321000

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina... 详细信息

目的分析1株多黏菌素和替加环素均耐药的肺炎克雷伯菌基因组特征。方法肺炎克雷伯菌KP2016分离自我院临床痰液标本。采用微量肉汤稀释法测定KP2016对亚胺培南、美罗培南、多黏菌素和替加环素的最低抑菌浓度。对菌株进行第二代Illumina和第三代Oxford Nanopore全基因组测序。通过Unicycler对第二代和第三代序列进行混合拼接。通过ABRicate v0.8.13调用Resfinder数据库分析耐药基因。通过ISFinder分析移动元件。利用CGE(Center for Genomic Epidemiology)网站分析菌株的ST型和质粒复制子类型。利用Proksee对质粒结构进行可视化。结果KP2016菌株对多黏菌素和替加环素均耐药,MIC分别为512和16 mg/L。MLST分析显示KP2016属于ST656,携带多黏菌素耐药相关mcr-1和mcr-8基因和替加环素耐药相关tmexCD1-toprJ1基因簇。KP2016携带1个染色体和5个环形质粒,质粒大小3,991~275,345bp,GC含量44.35%~52.20%。mcr-1基因位于约44kb的质粒p1上,上下游环境为ISKpn26-mcr-1-pap2-ISApl1;mcr-8基因位于IncR/IncN型质粒p2上,遗传结构为ISEcl1-mcr-8-orf-ISKpn26;tmexCD1-toprJ1基因簇结构为IS26-tnfxB1-tmexC1-tmexcD1-toprJ1。此外,菌株还携带多黏菌素耐药相关的染色体介导的CrrB突变(L204V、V237I)。结论肺炎克雷伯菌KP2016多黏菌素耐药由mcr-1、mcr-8和crrB突变介导,替加环素耐药由tmexCD1-toprJ1基因簇介导。应加强合理监测,防止其在医疗机构中进一步传播。

关键词：肺炎克雷伯菌全基因组测序多黏菌素替加环素质粒结构

Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡中的表达及其与病情严重程度及预后的关系

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中国糖尿病杂志 2024年第2期32卷 108-112页

作者：王少娜王娇华吴毓斌苏永焕詹文丽海口市骨科与糖尿病医院检验科 570100 海口市人民医院检验科

目的探讨Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡(DFU)中的表达及其与病情严重程度及预后的关系。方法选取2020年1月至2022年12月于我院内分泌科收治的DFU患者113例,按照感染严重程度分为1级19例(无感染)、2级40例(轻度感染)、3级20例(中度感... 详细信息

目的探讨Hsa_circ_0003928在糖尿病足溃疡(DFU)中的表达及其与病情严重程度及预后的关系。方法选取2020年1月至2022年12月于我院内分泌科收治的DFU患者113例,按照感染严重程度分为1级19例(无感染)、2级40例(轻度感染)、3级20例(中度感染)及4级34例(重度感染)。根据DFU患者预后情况分为预后良好组(GP,n=63)和预后不良组(PP,n=50)。比较各组基线资料及IL-6、C-RP、Hsa_circ_0003928。Logistic回归分析DFU患者预后不良的影响因素。受试者工作特征(ROC)曲线分析Hsa_circ_0003928、C-RP及IL-6预测DFU患者预后不良的价值。结果PP组DFU病程、感染程度3~4级、血肌酐、BUN、血尿酸、C-RP、IL-6及Hsa_circ_0003928高于GP组(P<0.05或P<0.01)。3~4级DFU患者Hsa_circ_0003928表达高于1~2级(P<0.01)。Logistic回归分析显示,DFU病程长、感染程度3~4级以及BUN、C-RP、IL-6、Hsa_circ_0003928升高是DFU患者预后不良的影响因素。ROC曲线分析显示,Hsa_circ_0003928预测DFU患者预后不良的曲线下面积最大(0.882,95%CI 0.819~0.942),敏感度为87.5%,特异度为85.6%。结论 Hsa_circ_0003928升高与DFU患者病情严重程度及预后不良相关,对DFU患者预后不良有较好的预测价值。

关键词：糖尿病足溃疡 Hsa_circ_0003928 病情严重程度预后

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多学科携手共克微生物耐药性

中华检验医学杂志 2024年第6期47卷 589-591页

作者：张雅薇王辉北京大学人民医院检验科北京100044

抗微生物耐药是21世纪全球面临的重大公共卫生挑战。“超级细菌”和“超级真菌”引起的严重感染病死率高,使临床治疗陷入困境。多学科携手动态监测新发、高发耐药菌的耐药演化规律、快速检测和早期诊断技术、建立有效防控和遏制细菌耐... 详细信息

抗微生物耐药是21世纪全球面临的重大公共卫生挑战。“超级细菌”和“超级真菌”引起的严重感染病死率高,使临床治疗陷入困境。多学科携手动态监测新发、高发耐药菌的耐药演化规律、快速检测和早期诊断技术、建立有效防控和遏制细菌耐药快速发展的综合防控策略迫在眉睫。

关键词：流行病学多重耐药细菌真菌抗生素

血清外泌体circRPS6在结直肠癌患者诊断及预后评估中的临床价值

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中华检验医学杂志 2024年第3期47卷 272-277页

作者：郑留昌李俊蒙郑培明河南省人民医院检验科郑州450003 河南省人民医院胃肠外科郑州450003

目的探讨外泌体环状RNA circRPS6(hsacirc0086471)在结直肠癌(CRC)患者血清中的表达水平及其临床应用价值。方法收集河南省人民医院2019年1月15日至2020年12月31日就诊的115例CRC患者血清标本, 其中男性68例, 女性47例, 年龄(63.0±9.5)... 详细信息

目的探讨外泌体环状RNA circRPS6(hsacirc0086471)在结直肠癌(CRC)患者血清中的表达水平及其临床应用价值。方法收集河南省人民医院2019年1月15日至2020年12月31日就诊的115例CRC患者血清标本, 其中男性68例, 女性47例, 年龄(63.0±9.5)岁;收集同时期120名健康体检者外周血清标本, 其中男性70名, 女性50名, 年龄(61.0±10.7)岁。此外收集60例接受手术治疗的CRC患者癌及癌旁组织标本。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测血清外泌体及组织中circRPS6的相对表达水平, 并分析其与患者临床病理特征及预后的相关性。电化学发光法检测血清中CEA及CA19-9水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价不同血清学指标的诊断效能。采用Cox比例风险模型进行多变量回归分析。结果 CRC患者癌组织中circRPS6的相对表达水平(3.14±0.11)高于癌旁组织(1.97±0.09)(Z=5.38, P<0.001), 血清外泌体中circRPS6的相对表达水平(4.28±0.13)高于健康对照组(2.04±0.09)(t=14.52, P<0.001)。ROC曲线分析结果显示, 血清外泌体circRPS6诊断CRC的曲线下面积(AUC)为0.882, 高于CEA、CA19-9检测对 CRC 患者的诊断效能。血清外泌体circRPS6相对表达量与TNM分期、淋巴结转移以及远处转移呈正相关(P均<0.05)。生存曲线分析显示血清外泌体circRPS6低表达患者平均生存时间明显优于高表达患者, 进一步多变量回归分析发现血清外泌体circRPS6高表达是CRC患者预后不良的独立危险因素。结论外泌体circRPS6在CRC患者血清中高表达, 且与恶性进展和不良预后相关, 有望成为CRC患者诊断和预后评估的潜在标志物。

关键词：结直肠肿瘤外泌体环状RNA circRPS6 分子标志物

AML化疗期间不同时间点流式细胞术MRD检测对预后的影响

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中国实验血液学杂志 2024年第4期32卷 1051-1057页

作者：居瑞雪孙凤强王育慧潍坊市人民医院检验科山东潍坊261041

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病(MRD)检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者,用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析,log-rank检验进行差异性... 详细信息

目的:探讨AML化疗期间不同时间点流式细胞术微小残留病(MRD)检测对预后的影响。方法:回顾性分析2018年3月到2022年3月确诊并规范化疗的130例成人原发AML患者,用流式细胞术检测MRD,Kaplan-Meier曲线进行生存分析,log-rank检验进行差异性分析,Cox比例风险回归模型进行影响患者生存的单因素和多因素分析。竞争风险模型进行影响患者累计复发率(CIR)的分析,Fine-Gray进行差异性分析。结果:130例患者中,CR181例,CR226例,PR 14例,NR 9例。CR1组OS高于CR2、PR、NR组。CR2组OS高于PR组,但与NR组比较无统计学差异;PR组OS与NR组比较无统计学差异。CR1和CR2的107例患者根据流式细胞术检测的MRD分组,第一次诱导化疗后MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为65.3%和27.9%,4年预期OS率分别为58.7%和41.4%,4年预计CIR率分别为34.7%和69.7%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=6.639,P=0.010;χ^(2)=6.131,P=0.013;χ^(2)=6.637,P=0.010);第二次化疗后MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为50.8%和37.9%,4年预期OS率分别为49.2%和44.5%,4年预计CIR率分别为49.2%和59.5%,2组比较差异均无统计学意义(χ^(2)=1.475,P=0.225;χ^(2)=2.432,P=0.119;χ^(2)=1.416,P=0.234);巩固治疗期间MRD~-和MRD~+组患者的4年预期RFS率分别为51.9%和29.6%,4年预期OS率分别为67.5%和24.6%,4年预计CIR率分别为48.1%和70.4%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=20.982,P<0.001;χ^(2)=17.794,P<0.001;χ^(2)=19.879,P<0.001);3个时间点MRD均为阴性和任一时间点为阳性患者的4年预期RFS率分别为69.9%和33.3%,4年预期OS率分别为59.1%和44.7%,4年预计CIR率分别为30.1%和65.1%,2组比较差异均有统计学意义(χ^(2)=7.367,P=0.007;χ^(2)=6.042,P=0.014;χ^(2)=7.662,P=0.006)。单因素分析结果显示,染色体高危核型是影响患者RFS和OS的不利因素,诱导化疗2个疗程达CR、第一次诱导化疗后MRD~-和第二次化疗MRD~-是患者RFS和OS的保护因素;巩固治疗期间MRD~-和3个时间点MRD~-是患者RFS、OS和CIR的保护因素。多因素分析结果显示,诱导化疗2个疗程达CR是患者RFS和CIR的保护因素,巩固治疗期间MRD~-是RFS、OS和CIR的保护因素。结论:成人AML患者早期获得CR和MRD~-,特别是巩固治疗期间的MRD~-是预后良好的标志,流式细胞术是AML患者MRD检测最常用的方法。

关键词：急性髓系白血病成人化疗微小残留病预后

实体恶性肿瘤相关性静脉血栓患者的临床特征及实验室指标分析

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中国实验血液学杂志 2024年第3期32卷 847-851页

作者：周永梅张海燕郭青青娄方方周湘红冉飞贵州省人民医院检验科贵州贵阳550002

目的:分析实体恶性肿瘤相关静脉血栓栓塞症(Ta-VTE)患者的临床特征和实验室指标,研究其危险因素。方法:收集2020年1月至12月在本院住院的静脉血栓患者,根据是否患有实体恶性肿瘤,分为Ta-VET组和单纯VTE组,分析两组患者间的临床资料和实... 详细信息

目的:分析实体恶性肿瘤相关静脉血栓栓塞症(Ta-VTE)患者的临床特征和实验室指标,研究其危险因素。方法:收集2020年1月至12月在本院住院的静脉血栓患者,根据是否患有实体恶性肿瘤,分为Ta-VET组和单纯VTE组,分析两组患者间的临床资料和实验室指标的差异,将有显著差异的指标纳入logistic回归,分析Ta-VTE的危险因素。结果:本研究共纳入288例静脉血栓患者,其中Ta-VTE组64例,单纯VTE组224例。两组患者间住院时长(14.20±15.29 d vs 10.05±6.90 d,t=3.112,P=0.002)、疼痛患者比例(35.94%vs 65.18%,χ^(2)=17.554,P=0.000)、近期手术史患者比例(75.00%vs 37.50%,χ^(2)=28.196,P=0.000)、D-D[2.8(0.92,7.55)μg/ml vs 5.69(2.25,13.91)μg/ml,Z=-2.710,P=0.007]、PLR[198.59(139.54,312.16)vs 149.76(114.08,233.66),Z=-2.924,P=0.003]、TBIL[10.90(7.63,15.68)μmol/L vs 12.90(9.33,18.28)μmol/L,Z=-2.066,P=0.039]具有显著统计学差异,其余各指标均无明显差异(P>0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,PLR水平升高(OR=1.003,95%CI:1.000-1.006,P=0.027)、近期手术史(OR=4.312,95%CI:2.093-8.885,P=0.000)和住院时间延长(OR=1.037,95%CI:1.002-1.074,P=0.038)是恶性实体肿瘤相关静脉血栓栓塞症的独立危险因素;而疼痛(OR=0.274,95%CI:0.133-0.564,P=0.000)是一项保护性因素。结论:PLR水平升高、近期手术史和住院时间延长是Ta-VTE患者的独立危险因素,合理利用这些指标有助于Ta-VTE患者的临床诊疗。

关键词：肿瘤相关静脉血栓临床特征实验室指标危险因素

海南省类鼻疽伯克霍尔德菌临床分离株的基因岛特征和毒力因子分析

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中国人兽共患病学报 2024年第4期40卷 359-368,390页

作者：符晓莹李欢李沙王立程王崇圳黎元莉陈海朱雄三亚市人民医院检验科三亚572000

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全... 详细信息

目的分析类鼻疽伯克霍尔德菌(Burkholderia pseudomallei)临床分离株的基因岛(genomic island,GI)特征和毒力因子差异,为类鼻疽病的诊疗研究提供依据。方法收集***临床分离株,PCR检测和测序分析毒力相关GI,在Islandviewr 4平台上提交全基因组序列注释格式文件,整合SIGI-HMM与IslandPath-DIMOB两种算法预测GI,通过序列比对分析GI独特性和毒力因子差异。结果共收集到52株***临床分离株,结果显示,52个基因组按进化距离分为3个分枝,其中82.69%(43/52)菌株集中在分枝1。52个***基因组共识别出828个GI,按序列相似性聚类为157个GI cluster。GI在基因组中占比达2.05%~6.38%。GI cluster1和2存在全部菌株中,但84个(53.50%)GI cluster只聚类到单个基因组。10个GI cluster很可能是特有的,其中5个来源同属细菌,2个来源其他属,3个来源不确定。25个GI cluster与毒力相关,*** BP76和BP169含有其中8个,是所有菌株中毒力相关GI最多的。52株***的毒力基因除了fhaB1、fhaB2、BPSL1661、cheY1、wzM、tssH-5/clpV、tssA-5、boaA和boaB存在差异,其余都表现一致。与泰国和澳大利亚***临床菌株比较,boaA、boaB、cheY1和chbp在两个国家的菌株中都表现出差异,同时fhaB1、fhaB3和bimA在澳大利亚菌株中表现出差异。结论海南地区*** GI具有保守性和独特性,通过特有GI和毒力因子研究,可以发现菌株水平基因转移(Horizontal gene transfer,HGT)的来源和分子水平的毒力差异。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌基因组基因岛毒力因子水平基因转移