检索结果-南通市图书馆

中草药 2024年第17期55卷 5991-5998页

作者：何庆元周芯雨孙武徐荣华朱军军王传文何克勤周成李正鹏安徽科技学院安徽凤阳233100 潜山市农业科学研究所安徽潜山246300 潜山市传文瓜子有限公司安徽潜山246300

目的开发SSR分子标记,分析不同产地瓜蒌Trichosanthis Fructus药材的遗传结构和进化及不同种质资源的遗传多样性。方法提取瓜蒌RNA,反转录获得cDNA,PCR富集得到cDNA文库,经高通量测序,组装后,获得高质量Unigene后,用MISA(MicroSatellite... 详细信息

目的开发SSR分子标记,分析不同产地瓜蒌Trichosanthis Fructus药材的遗传结构和进化及不同种质资源的遗传多样性。方法提取瓜蒌RNA,反转录获得cDNA,PCR富集得到cDNA文库,经高通量测序,组装后,获得高质量Unigene后,用MISA(MicroSatellite identification tool)鉴定简单重复序列(simple sequence repeat,SSR),设计两端引物,从中选取64对引物对13个来源于3个地理居群的瓜蒌资源进行群体结构和遗传多样性分析。结果所开发的SSR标记具有良好的功效,在选用的整个群体中,其多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)、观察等位基因数(number of observed alleles,Na)、有效等位基因数(number of effective alleles,Ne)、香农信息指数(Shannon information index,I)和Nei遗传距离(Nei genetic distance,GD)依次为0.7587、3.5312、2.5883、1.0006和0.5592,3个自然群体之间,合肥和潜山自然群体的遗传相似性高,达到0.9417,与其他野生资源之间存在较大的遗传差异。经聚类分析,将13个品种资源分成2个亚群,其中2个长萼瓜蒌资源单独组成1个亚群,其余11个双边瓜蒌Trichosanthes rosthornii资源被分为另外1个亚群,而双边瓜蒌又被分为2个亚群,并且4个合肥育成品种分别在不同的亚群中,表明合肥育成品种来源较丰富。其他地区瓜蒌种质资源与安徽原产地瓜蒌遗传差异较大,能够为安徽瓜蒌育种拓宽种质资源基础。

关键词：瓜蒌双边栝楼长萼瓜蒌 SSR 标记开发遗传多样性

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