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土壤Cr含量高光谱反演模型组合优化研究

光谱学与光谱分析 2024年第11期44卷 3273-3279页

作者：郭洪旭王龙杨凯吴凡邓一荣唐长城陈志良肖荣波广东工业大学广东省环境科学研究院生态环境部华南环境科学研究所

土壤重金属污染高光谱反演的特征波段提取方法和反演模型的选择是影响反演精度的关键；二者如何优化组合，提高反演精度是目前亟需解决的难题。在华南典型铬（Cr）污染区，采集了92组土壤样品，使用电感耦合等离子体质谱（inductively c... 详细信息

土壤重金属污染高光谱反演的特征波段提取方法和反演模型的选择是影响反演精度的关键；二者如何优化组合，提高反演精度是目前亟需解决的难题。在华南典型铬（Cr）污染区，采集了92组土壤样品，使用电感耦合等离子体质谱（inductively coupled plasma mass spectrometry,ICP-MS）检测Cr含量，并使用ASD Field Spec4地物光谱仪在实验室收集其高光谱信息。光谱信息预处理采用平滑滤波（SG）+标准正态化（SNV）+二阶微分（SD）变换组合，减弱土壤散射和噪声的影响。选择竞争性自适应重加权采样（CARS）、逐步投影算法（SPA）、无信息变量消除（UVE）、遗传算法（GA）四种算法提取特征波段。选择多元线性回归（MLR）、偏最小二乘法（PLSR）、支持向量回归（SVR）和人工神经网络（ANN）四种反演模型建立特征波段与Cr含量之间的关系。通过对比不同特征波段提取方法和反演模型组合对土壤Cr含量反演的结果发现：采用CARS和UVE特征波段提取方法可以显著提高PLSR、 MLR和SVR模型的预测效果；SPA方法能够提高ANN模型的预测效果；通过SG+SNV+SD+CARS+PLSR组合方式，提取位于800～1 000、 1 400～1 700以及2 100～2 450 nm之间的98个特征波段，建模后模型验证，决定系数R2为0.97,均方根误差RMSE为5.25 mg·kg-1,平均绝对误差MAE为4.35 mg·kg-1,相对分析误差RPD为3.94,表明该模型在预测土壤Cr含量具有优异的性能。以土壤Cr污染高光谱反演为例，通过比较不同特征波段提取方法与反演模型组合的反演精度，确定最优模型，为小样本土壤重金属污染反演的建模提供了思路。

关键词：高光谱模型组合优化特征波段选择反演模型

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宁夏枸杞新品种‘科杞6082’

园艺学报 2024年第S1期 237-238页

作者：秦垦张波王丹青高燕戴国礼黄婷何昕孺周旋段淋渊焦恩宁宁夏农林科学院枸杞科学研究所

‘科杞6082’是通过系统选择，自优势单株中筛选获得的宁夏枸杞新品种。鲜果果粒大、深红色，口感较好。平均单果质量1.02 g,2～5龄平均株产干果0.55 kg,4龄株产干果0.67 kg。多糖含量38.3 g·kg-1。自交不亲和，建园需配置授粉树。二... 详细信息

‘科杞6082’是通过系统选择，自优势单株中筛选获得的宁夏枸杞新品种。鲜果果粒大、深红色，口感较好。平均单果质量1.02 g,2～5龄平均株产干果0.55 kg,4龄株产干果0.67 kg。多糖含量38.3 g·kg-1。自交不亲和，建园需配置授粉树。二年生枝花量小，夏果、秋果果期均较迟，耐热、耐瘠薄、耐盐碱，适宜一季少雨产区种植，可作为锁鲜、鲜食专用品种予以推广使用。

关键词：宁夏枸杞系统选择品种

“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和结构分析中的应用效力研究

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遗传 2024年第8期46卷 640-648页

作者：王梦燏周成浩薛倩殷建玫蒋一秀张会永李国辉韩威中国农业科学院家禽研究所扬州225125 江苏省家禽科学研究所扬州225125 江苏省家禽科学研究所科技创新有限公司扬州225125

我国地方鸡品种资源丰富,且在长期的选择进化过程中形成了各异的种质特性。科学评估群体遗传多样性,明确品种间遗传结构,对地方鸡品种资源的保护与创新利用具有重要价值。为了评估23K SNP芯片“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和遗传结构... 详细信息

我国地方鸡品种资源丰富,且在长期的选择进化过程中形成了各异的种质特性。科学评估群体遗传多样性,明确品种间遗传结构,对地方鸡品种资源的保护与创新利用具有重要价值。为了评估23K SNP芯片“酉芯一号”在地方鸡遗传多样性和遗传结构分析中的应用效力,本文利用RADseq鉴定21个地方鸡种基因组遗传变异,并研发23K芯片“酉芯一号”。基于两组SNP数据集计算各品种的遗传统计量,开展相关性、拟合及系统发育分析,以评估芯片的应用效力。结果表明,基于两组SNP数据集计算的观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、近交系数(F_(ROH))和遗传分化系数(F_(st)),在21个地方鸡种中趋势基本一致。琅琊鸡(LA)、瓢鸡(PJ)、文昌鸡(WC)的遗传多样性较为丰富;边鸡(BJ)、狼山鸡(LS)、固始鸡(GS)、东乡绿壳蛋鸡(DX)和北京油鸡(BY)的遗传多样性相对匮乏,两组Ho、PIC、F_(ROH)和平均Fst的相关系数分别为0.794、0.901、0.926和0.984,均达到极显著水平(P<0.01),且拟合度较高(P<0.001),R^(2)分别为0.644、0.827、0.916和0.927。针对两组SNP数据集,采用邻接法(NJ)和极大似然法(ML)构建的进化树较为合理,将21个地方鸡种总体上分为6大类,与品种的形成历史和地理分布相吻合;23K芯片对5个新增品种亦实现有效聚类,没有出现个体偏离。利用不同密度的SNP估算遗传统计量会存在一定差异,需要进行数据和分析方法的标准化,23K芯片在地方鸡遗传多样性和结构分析中具有较好的效力。

关键词： RADseq SNP芯片遗传多样性遗传结构

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基于表型性状与SSR标记的冬瓜、节瓜种质资源遗传多样性分析

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中国农业科学 2024年第17期57卷 3440-3467页

作者：翟彩娇葛礼姣程玉静仇亮王小秋刘水东江苏沿江地区农业科学研究所

【目的】分析冬瓜、节瓜种质的遗传多样性，构建综合评价体系，筛选优异种质，为冬瓜、节瓜种质创新和新品种选育提供理论支撑。【方法】以148份不同来源的冬瓜、节瓜种质为供试材料，利用28个表型性状和19对SSR标记进行遗传多样性分析... 详细信息

【目的】分析冬瓜、节瓜种质的遗传多样性，构建综合评价体系，筛选优异种质，为冬瓜、节瓜种质创新和新品种选育提供理论支撑。【方法】以148份不同来源的冬瓜、节瓜种质为供试材料，利用28个表型性状和19对SSR标记进行遗传多样性分析。综合运用变异系数、Shannon-Wiener多样性指数、相关性分析、主成分分析结合隶属函数法、逐步回归和聚类分析等多元统计方法，对冬瓜、节瓜种质进行遗传多样性分析和综合评价。【结果】148份冬瓜、节瓜种质具有较高的表型遗传多样性，11个质量性状的遗传多样指数变幅为0.39（性型）—1.45（瓜形状），17个数量性状的遗传多样性指数变幅为1.89（首雄花节位）—2.09（叶柄长度），变异系数变幅为9.76%（种形指数）—63.95%（老瓜单瓜重），其中首雌花节位（42.32%）、老瓜纵径（42.95%）、瓜形指数（47.05%）、首雄花节位（47.48%）、老瓜单瓜重（63.95%）的变异系数均大于40%，进行遗传改良的潜力较大；主成分分析将18个主要表型性状转换为6个独立的综合指标，贡献率为6.427%—29.605%，累计贡献率为81.236%；结合隶属函数值计算表型综合值（F值）鉴选出新西洲冬瓜BR12(1.47)、兴蔬粉地龙冬瓜BR25(1.14)等综合性状表现较好的优异种质；18个主要表型性状中有15个性状与F值极显著相关。利用逐步回归分析建立表型评价数学模型，筛选出9个表型综合评价指标。19对SSR标记在供试材料中扩增出的等位位点数2—6个，多态性信息含量的变幅为0.02—0.70,Shannon’s多样性指数变幅为0.06—1.48,148份冬瓜、节瓜种质具有较为丰富的遗传多样性，且节瓜群体的遗传多样性相对略高于冬瓜群体，个体内的遗传变异是导致冬瓜、节瓜整体遗传多样性的主要原因；基于表型性状和SSR分子标记的聚类分析分别将148份冬瓜、节瓜种质资源划分为6大类和3大类，两种方法的聚类结果均没有将冬瓜和节瓜聚成两大类，且与地理位置来源没有明显的相关性。【结论】148份冬瓜、节瓜种质表型性状遗传变异较为丰富，遗传多样性高；叶片长度、首雌花节位、老瓜纵径、老瓜肉厚、瓜梗长度、种子宽度、瓜面蜡粉、瓜形状和种子类型可以作为冬瓜、节瓜种质资源综合评价和亲本选择的关键指标；基于主要表型性状和SSR分子标记的聚类分析结果具有一定的一致性，聚类和群体划分与地理位置来源没有明显的相关性。

关键词：冬瓜节瓜表型性状 SSR标记遗传多样性综合评价

育成期能量限饲对6~24周龄蛋鸡生长发育、激素水平和卵巢类固醇激素生成关键基因表达的影响

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动物营养学报 2024年第8期36卷 4925-4943页

作者：卢建王强王星果郭军马猛李永峰窦套存胡玉萍邵丹童海兵曲亮江苏省家禽科学研究所扬州225125

本试验旨在研究育成期(6~17周龄)能量限饲对6~24周龄蛋鸡生长发育、激素水平和卵巢类固醇激素生成关键基因表达的影响。试验选用6周龄海兰褐蛋鸡720只,随机分成3组,每组6个重复,每个重复40只。6~17周龄,3组试验鸡分别饲喂代谢能(ME)水平... 详细信息

本试验旨在研究育成期(6~17周龄)能量限饲对6~24周龄蛋鸡生长发育、激素水平和卵巢类固醇激素生成关键基因表达的影响。试验选用6周龄海兰褐蛋鸡720只,随机分成3组,每组6个重复,每个重复40只。6~17周龄,3组试验鸡分别饲喂代谢能(ME)水平为12.34(对照组)、11.11(90%能量限饲组)和9.87 MJ/kg(80%能量限饲组)且其他营养水平相同的试验饲粮。18~24周龄,各组试验鸡均饲喂相同的试验饲粮。试验期18周。结果表明:1)随着6~17周龄能量限饲强度增加,17周龄体重、腹脂率、心脏指数和胫骨重以及20周龄体重、腹脂率、股骨重、胫骨重和跖骨重均呈显著线性降低(P0.05)。2)随着6~17周龄能量限饲强度增加,24周龄血清尿素氮(UN)含量呈显著线性降低(P0.05)。3)80%能量限饲组24周龄血浆孕酮水平显著高于对照组和90%能量限饲组(P<0.05)。4)在卵巢基质部,17、20和24周龄80%和90%能量限饲组36个基因中,26个基因的mRNA相对表达量显著下调(P<0.05),7个基因的mRNA相对表达量显著上调(P<0.05),上调基因分别为17周龄80%和90%能量限饲组的环磷酸腺苷反应元件结合蛋白1(CREB1)和细胞色素P450羟化酶1B1(CYP1B1),24周龄90%能量限饲组的CREB1,以及20和24周龄80%能量限饲组的3β-羟基类固醇脱氢酶(3β-HSD)。在大白卵泡膜层,20周龄80%和90%能量限饲组12个基因的mRNA相对表达量均显著上调(P<0.05);24周龄80%和90%能量限饲组12个基因中,9个基因的mRNA相对表达量显著下调(P<0.05),1个基因的mRNA相对表达量显著上调(P<0.05),上调基因为24周龄80%能量限饲组的CREB1。在小黄卵泡膜层,24周龄80%和90%能量限饲组12个基因中,5个基因的mRNA相对表达量显著下调(P<0.05),3个基因的mRNA相对表达量显著上调(P<0.05),上调基因为80%能量限饲组的细胞色素P450羟化酶17A1(CYP17A1)、3β-HSD和CYP1B1。由此可见,6~17周龄能量限饲显著影响了17和20周龄蛋鸡体重、腹脂和骨骼发育,但对24周龄屠体、内脏器官和骨骼发育均无显著影响,且在一定程度上改善了24周龄蛋白质代谢和脂肪代谢相关的生化指标;6~17周龄80%能量限饲增加了血浆孕酮水平,上调了卵巢基质部3β-HSD、大白卵泡膜层CREB1和小黄卵泡膜层CYP17A1、3β-HSD和CYP1B1的mRNA相对表达量。

关键词：蛋鸡育成期能量限饲生长发育生化指标激素水平卵巢类固醇激素生成基因

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不同干燥方式对羊肚菌品质特性及复水性能的影响

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农业工程学报 2024年

作者：马佳佳董明辉全鑫瑶邵千朔金梅娟王毓宁江苏太湖地区农业科学研究所

为探究羊肚菌在不同干燥方式及复水后的品质变化与成因，以六妹羊肚菌为试材，采用自然干燥（natural drying,ND），恒温干燥（constant temperature drying,CTD），真空冷冻干燥方式（vacuum freeze-drying,VFD）对羊肚菌进行干制，探... 详细信息

为探究羊肚菌在不同干燥方式及复水后的品质变化与成因，以六妹羊肚菌为试材，采用自然干燥（natural drying,ND），恒温干燥（constant temperature drying,CTD），真空冷冻干燥方式（vacuum freeze-drying,VFD）对羊肚菌进行干制，探讨3种干燥方式对微观结构、滋味、营养品质及复水性能的影响，并研究羊肚菌复水前后质地、色泽、风味的差异分析，分析判断不同方式的干燥特性。结果表明：VFD羊肚菌氨基酸、粗多糖与甜味值分别为944 mg/100 g、6.26 g/100 g、19.73，显著（P研究结果为羊肚菌干制品加工方式优选提供参考。

关键词：羊肚菌干燥方式复水性能感官品质营养品质

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衔接“三线一单”的流域综合规划环评设计

长江科学院院报 2024年

作者：毕雪杨梦斐杨寅群林国俊田志福长江水资源保护科学研究所

“三线一单”生态环境分区管控体系是目前我国推动生态文明建设和实现高质量发展的关键手段，流域综合规划环境影响评价技术导则明确提出了，评价应充分衔接已发布实施的“三线一单”成果。本文阐述了流域综合规划体系及主要环境影响特... 详细信息

“三线一单”生态环境分区管控体系是目前我国推动生态文明建设和实现高质量发展的关键手段，流域综合规划环境影响评价技术导则明确提出了，评价应充分衔接已发布实施的“三线一单”成果。本文阐述了流域综合规划体系及主要环境影响特性，提出衔接“三线一单”的流域综合规划环评设计框架，可实现“三线一单”成果贯穿流域综合规划的全过程，在此框架下流域“三线一单”的制定成为流域综合规划环评的重点，文章提出了流域“三线一单”的制定方法，以赣江流域为研究对象阐述了应用过程。本文对流域综合规划环境影响评价和“三线一单”成果落地等工作具有指导作用。

关键词：流域综合规划规划环评三线一单环境影响评价

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百度搜索数据在传染病暴发监测上的应用

复杂系统与复杂性科学 2024年

作者：孟子琳赵继军青岛大学复杂性科学研究所

百度搜索引擎能够实时从人群中收集大量数据，这些免费且易于获取的数据可以为国家乃至国际范围内的传染病监测提供新的视角。分析了中国2022年2月1日至2023年1月17日COVID-19报告病例数和百度搜索数据间的相关性，并构建隔离和解封两... 详细信息

百度搜索引擎能够实时从人群中收集大量数据，这些免费且易于获取的数据可以为国家乃至国际范围内的传染病监测提供新的视角。分析了中国2022年2月1日至2023年1月17日COVID-19报告病例数和百度搜索数据间的相关性，并构建隔离和解封两种防控措施下纳入提前时间百度搜索数据的COVID-19动力学模型，通过与未纳入提前时间百度搜索数据等不同的模型进行比较评估百度搜索趋势对模型仿真感染者数量变化的影响。结果发现，隔离阶段和解封阶段分别纳入提前13天和6天的百度搜索数据的动力学模型具有最小的AIC值，表现最优。综上所述，百度搜索数据可以应用于动力学模型，以提高模型模拟和监测COVID-19发病数变化的能力。

关键词：传染病监测新冠病毒百度指数随机动力学模型

基于UPLC-MS/MS的不同植物生长调节剂处理的猕猴桃果实中代谢物差异分析

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江苏农业学报 2024年第8期40卷 1542-1551页

作者：王前菊王宇仲伟敏徐特唐冬梅贵州省果树科学研究所贵州贵阳550006

本研究以金猕为试验材料,探究氯吡脲(CPPU)和赤霉素(GA_(3))对果实中次生代谢物的影响。基于超高效液相色谱-串联质谱技术(UPLC-MS/MS)对代谢组进行分析,共检测到代谢物411种,包括氨基酸及其衍生物、糖及醇类、核苷酸及其衍生物等。5 mg... 详细信息

本研究以金猕为试验材料,探究氯吡脲(CPPU)和赤霉素(GA_(3))对果实中次生代谢物的影响。基于超高效液相色谱-串联质谱技术(UPLC-MS/MS)对代谢组进行分析,共检测到代谢物411种,包括氨基酸及其衍生物、糖及醇类、核苷酸及其衍生物等。5 mg/L CPPU处理、10 mg/L CPPU处理果实中水平下调代谢物数量高于水平上调代谢物数量,而50 mg/L GA_(3)处理、10 mg/L CPPU+50 mg/L GA_(3)处理果实中水平上调代谢物数量高于水平下调代谢物数量。与对照相比,5 mg/L CPPU处理、10 mg/L CPPU处理、50 mg/L GA_(3)处理、10 mg/L CPPU+50 mg/L GA_(3)处理果实单果重、横径、侧径显著提高(P所述,10 mg/L CPPU+50 mg/L GA_(3)处理金猕产量和品质相对更佳,本研究结果可为金猕栽培及品质评价提供参考。

关键词：猕猴桃 UPLC-MS/MS 氯吡脲(CPPU) 赤霉素(GA_(3)) 代谢物品质

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