检索结果-南通市图书馆

一种基于树的集成学习方法新思路在中老年人消化系统疾病相关因素研究中的应用

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中国卫生统计 2023年第2期40卷 242-245页

作者：张蕊郭维恒王世伟冯彦成王添郭志旺王立芹河北医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室 050017 河北省环境与人群健康重点实验室西安医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的本研究借鉴深度森林(deep forest)的思想,提出一种基于树的集成学习方法新思路,为以后相关的研究提供分析策略和思路。方法使用2015年中国健康与养老追踪调查数据库,筛选与消化系统疾病有关的变量,通过“人工地”建立多层随机森... 详细信息

目的本研究借鉴深度森林(deep forest)的思想,提出一种基于树的集成学习方法新思路,为以后相关的研究提供分析策略和思路。方法使用2015年中国健康与养老追踪调查数据库,筛选与消化系统疾病有关的变量,通过“人工地”建立多层随机森林模型,对人群进行分类,再分别建立模型筛选变量,通过计算评价指标评价模型效果,从而选择更优的模型解释与消化系统疾病相关的变量。结果本研究发现通过建立多层随机森林模型对人群分为两类后,再分别建立模型,各评价指标都有很大幅度提高。另外对两类人群分别构建随机森林模型后,根据变量重要性评分筛选出与消化系统疾病有关的重要变量,再建立logistic模型,结果显示,一类人群筛选出15个有统计学意义的变量,其中有13个危险因素,OR值由1.871至35.917,关联最强的是关节炎和风湿病,其次为肾脏疾病、过去一个月生过病、头痛或者颈部痛、胸背部或者腰臀部疼痛、心脏病等;2个保护因素为晚上的睡眠时间、血红蛋白值。另一类人群筛选出的相关变量与第一类人群大部分相同,但作用相反,OR值由0.067至0.771,并且对第一类人群危害最大的因素对第二类保护也最大。结论对于病因复杂的疾病,可通过对人群细分,再分别进行分析。本研究提出的基于树的集成学习新算法,通过叠加多层随机森林模型,可用于以上数据中进行人群分类,使模型更优。

关键词：消化系统疾病集成学习胃病相关因素随机森林

乌鲁木齐市男同性恋浴池与艾滋病自愿咨询检测门诊的MSM感染HPV情况比较

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中华流行病学杂志 2017年第1期38卷 53-57页

作者：田恬蔡爱杰黄冰雪阿比旦·艾尼瓦尔王辉戴江红新疆医科大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学教研室乌鲁木齐830011

目的了解乌鲁木齐市男同性恋浴池和艾滋病自愿咨询检测（VCT）门诊招募的MSM的HPV感染情况及其危险因素。方法 2016年3-5月采用滚雪球抽样方法在男同性恋浴池和VCT门诊招募200名MSM，采用问卷调查收集其人口学和性行为特征资料，采集... 详细信息

目的了解乌鲁木齐市男同性恋浴池和艾滋病自愿咨询检测（VCT）门诊招募的MSM的HPV感染情况及其危险因素。方法 2016年3-5月采用滚雪球抽样方法在男同性恋浴池和VCT门诊招募200名MSM，采用问卷调查收集其人口学和性行为特征资料，采集其肛周脱落细胞进行37型HPV DNA分型检测。结果 200名MSM肛周HPV感染率为54.0%（108/200），其中男同性恋浴池和VCT门诊来源者HPV感染率分别为66.7%（74/111）与38.2%（34/89），高危型HPV感染率分别为39.6%（44/111）与14.6%（13/89），男同性恋浴池的这两项指标均明显高于VCT门诊，差异有统计学意义（χ^2=16.112，P〈0.05；χ^2=15.190，P〈0.05）。多因素logistic回归分析显示，来自男同性恋浴池、被插入式性行为方式为主是肛周HPV感染的主要危险因素（OR=3.732，95% CI：1.950-7.141；OR=2.555，95% CI：1.329-4.912）。结论与VCT门诊比较，男同性恋浴池的MSM HPV感染率更高，MSM干预工作应给予特别关注。

关键词：男男性行为者人乳头瘤病毒男同性恋浴池艾滋病自愿咨询检测室

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生物学年龄量化方法研究进展

中华流行病学杂志 2023年第3期44卷 516-520页

作者：曹利美陈淑婷王彤山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

生物学年龄已被证明优于时序年龄衡量个体间衰老的真实差异,但生物学年龄的量化方法在衰老研究领域至今未达成共识。本文对目前常用的一些生物学年龄的量化方法进行概述,并提出展望。

关键词：生物学年龄衰老量化

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环境与职业医学 2023年第12期40卷 1403-1410页

作者：赵丽君丁关鑫黄菲迪丽娜尔·亚尔麦麦提吴顺华新疆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室新疆乌鲁木齐830011

[背景]无机砷在肝脏内蓄积易导致肝纤维化。溶质载体家族7成员11(SLC7A11)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A(CDKN1A)是铁死亡相关基因,在肝脏及纤维化疾病中异常表达,但其在无机砷致肝纤维化的作用尚未见报道。[目的]探究不同剂量的... 详细信息

[背景]无机砷在肝脏内蓄积易导致肝纤维化。溶质载体家族7成员11(SLC7A11)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A(CDKN1A)是铁死亡相关基因,在肝脏及纤维化疾病中异常表达,但其在无机砷致肝纤维化的作用尚未见报道。[目的]探究不同剂量的亚砷酸钠对人肝星状细胞(LX-2)迁移能力的影响及亚砷酸钠致LX-2细胞活化中的SLC7A11、CDKN1A DNA甲基化和表达的变化。[方法]体外培养LX-2细胞株,用不同剂量的亚砷酸钠处理LX-2细胞24 h,实验分为对照组(0μmol·L^(−1))、低剂量组(5μmol·L^(−1))、中剂量组(10μmol·L^(−1))、高剂量组(15μmol·L^(−1))。倒置显微镜观察各组细胞形态变化;划痕实验检测细胞迁移运动情况;透射电镜观察对照组和高剂量组线粒体超微结构;FerroOrange荧光探针检测细胞Fe^(2+);运用Illumina 850K甲基化芯片对差异甲基化位点进行筛查;实时荧光定量PCR和Western blot检测铁死亡指标(SLC7A11、CDKN1A)及人肝星状细胞活化指标[转化生长因子β1(TGF-β1)、Ⅲ型胶原(CollagenⅢ)]。[结果]随着染毒剂量的升高,细胞触角回缩逐渐变为圆形,且细胞划痕愈合情况逐渐变差。透射电镜观察到高剂量组部分细胞线粒体膜完整性破坏、线粒体嵴断裂。激光共聚焦显微镜观察到Fe^(2+)荧光强度随着染毒剂量的升高而逐渐升高。甲基化芯片结果显示,与对照组相比,高剂量组SLC7A11在启动子区cg22659014位点高甲基化,CDKN1A在启动子区cg17964532位点高甲基化。随染毒剂量的增加,SLC7A11 mRNA及蛋白表达水平降低(P0.05),低、中、高剂量组CDKN1A蛋白表达水平均高于对照组(P<0.001);中、高剂量组TGF-β1 mRNA表达水平均高于对照组(P<0.001),TGF-β1蛋白表达水平随染毒剂量的增加而升高(P<0.001);CollagenⅢmRNA表达水平随染毒剂量的增加而升高(P<0.001),仅高剂量组CollagenⅢ蛋白表达水平高于对照组(P<0.001)。[结论]亚砷酸钠染毒可减弱LX-2细胞迁移能力,铁死亡相关基因SLC7A11、CDKN1A参与亚砷酸钠诱导LX-2细胞活化的过程。

关键词：亚砷酸钠人肝星状细胞 DNA甲基化溶质载体家族7成员11 铁死亡

孕妇血红蛋白浓度与早产关联强度剂量反应关系

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中华流行病学杂志 2019年第4期40卷 471-474页

作者：韦良家刘顺黄东萍郭雪峰王娜盛勇红莫美乐梁军宋妍烨仇小强广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室南宁530021

目的探讨孕妇血红蛋白浓度与早产关联强度的剂量反应关系。方法选取广西壮族自治区武鸣、平果、靖西、德保、隆安、田东等县级医院2015年1月至2017年12月入院的12 780例壮族孕妇及其分娩的新生儿作为研究对象,回顾性地收集研究对象的一... 详细信息

目的探讨孕妇血红蛋白浓度与早产关联强度的剂量反应关系。方法选取广西壮族自治区武鸣、平果、靖西、德保、隆安、田东等县级医院2015年1月至2017年12月入院的12 780例壮族孕妇及其分娩的新生儿作为研究对象,回顾性地收集研究对象的一般人口学资料、孕期产检资料以及出生结局资料。采用非条件logistic回归方法初步分析孕期贫血对早产的影响,采用限制性立方样条模型分析孕期血红蛋白浓度与早产关联强度剂量反应关系。结果排除2 053例高血压或年龄≥35岁的孕妇,非条件logistic回归分析显示,孕早期贫血组发生早产的风险是非贫血组的1.29倍(OR=1.29,95%CI:1.04~1.59,P=0.019);限制性立方样条模型显示,孕早期血红蛋白浓度与早产的关联呈非线性"L"形剂量反应关系(非线性检验:P<0.001),孕晚期血红蛋白浓度与早产的关联呈非线性"U"形剂量反应关系(非线性检验:P<0.001)。结论孕妇孕早期和孕晚期血红蛋白浓度与早产的关联呈非线性剂量反应关系。

关键词：血红蛋白早产剂量反应关系限制性立方样条

基于cis-SNP的多位点关联性分析方法比较及其在基因表达中的应用

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中国卫生统计 2018年第5期35卷 695-698页

作者：王鸣岐安书仪黄林玉曾平黄水平徐州医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室 221004

目的比较不同SNP集合方法检验常见变异和罕见变异与基因表达的关联,期望找到高效和稳健的统计方法。方法对比Burden、SKAT、SKAT-O、MiST、Re LRT和GGRF等方法,通过GEUVADIS数据基因型和基因表达数据建立模拟研究,比较不同方法的一类错... 详细信息

目的比较不同SNP集合方法检验常见变异和罕见变异与基因表达的关联,期望找到高效和稳健的统计方法。方法对比Burden、SKAT、SKAT-O、MiST、Re LRT和GGRF等方法,通过GEUVADIS数据基因型和基因表达数据建立模拟研究,比较不同方法的一类错误率、统计效能及运算时间。基于常见和罕见cis-SNP,进一步通过GEUVADIS数据比较各种方法鉴别表达基因的能力。结果模拟显示各种方法在不同变异位点个数下均能很好控制第一类错误,其中Re LRT和MiST的统计效能最高,MiST运算时间最短。在GEUVADIS数据分析中,Re LRT找到的表达基因最多。结论各种检验方法基本都能有效控制第一类错误。模拟和实例数据显示Re LRT具有更高的检验效能,但计算速度较慢。

关键词：全基因组关联研究遗传变异关联性分析测序数据基因表达

中老年女性初潮年龄与高尿酸血症的关系及BMI的中介作用

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重庆医科大学学报 2023年第3期48卷 310-315页

作者：张换想邱洪斌张艺潆佳木斯大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室佳木斯157000

目的:探讨中老年女性月经初潮年龄与高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)患病的关系以及体质指数(body mass index,BMI)的介导作用。方法:以中国健康与养老追踪调查前瞻性研究项目2011年和2015年调查中,具有完整月经初潮与尿酸等信息的5322... 详细信息

目的:探讨中老年女性月经初潮年龄与高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)患病的关系以及体质指数(body mass index,BMI)的介导作用。方法:以中国健康与养老追踪调查前瞻性研究项目2011年和2015年调查中,具有完整月经初潮与尿酸等信息的5322名年龄≥45岁女性为研究对象。采用多因素logistic回归模型分析初潮年龄对HUA的影响,采用限制性立方样条函数分析初潮年龄与HUA的关系类型。通过中介分析探讨BMI在初潮年龄与HUA关系中的作用。结果:在5322名女性中,274名(5.15%)患有HUA。调整混杂因素后,与月经初潮为8~13岁的女性相比,16~17岁及18~22岁组HUA的比值比(odds ra⁃tio,OR)与95%置信区间(confidence interval,CI)分别为0.643(0.429,0.964)、0.634(0.411,0.979)。初潮年龄与HUA存在线性负相关,初潮年龄每增加1岁,HUA风险降低6%。BMI部分介导了年龄和HUA的关系,直接效应和间接效应的OR与95%CI分别为0.936(0.878,0.999)和0.992(0.987,0.997)。结论:较晚的初潮年龄可降低HUA患病风险,初潮年龄过早与HUA风险增加相关。BMI在月经初潮年龄与HUA的关系中起部分中介作用。

关键词：初潮年龄高尿酸血症体质指数中介效应中老年女性

特征选择结合模型可解释性方法在代谢综合征风险预测模型中的应用研究

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现代预防医学 2021年第19期48卷 3632-3637页

作者：张燕加依娜·拉兹别克夏文俊刘亚洁李德洋曹明芹新疆医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的基于特征选择和模型可解释方法构建易于理解的代谢综合征风险预测模型,探讨其在代谢综合征防控中的应用价值,为代谢综合征的早期防控提供方法学参考。方法收集和清洗乌鲁木齐市某健康体检机构2018年体检数据,采用RFE、mRMR、Lasso... 详细信息

目的基于特征选择和模型可解释方法构建易于理解的代谢综合征风险预测模型,探讨其在代谢综合征防控中的应用价值,为代谢综合征的早期防控提供方法学参考。方法收集和清洗乌鲁木齐市某健康体检机构2018年体检数据,采用RFE、mRMR、Lasso三种特征选择方法结合变量重要性、LIME两种模型可解释方法对代谢综合征风险预测模型建模前后进行处理。结果综合RFE、mRMR、Lasso三种特征选择方法的结果筛选出21个变量;基于特征选择结果构建的预测模型均具有较好的分类性能,其中XGBoost模型性能最优;利用变量重要性、LIME对XGBoost模型的解释可得,除传统的危险因素外,代谢综合征还与白细胞计数、高尿酸血症、谷氨酰转肽酶、丙氨酸氨基转移酶相关。结论特征选择结合模型可解释方法运用于代谢综合征风险预测模型构建流程中,可辅助构建高分类性能及易于理解的代谢综合征风险预测模型,对代谢综合征的早期防制具有重要的实践意义。

关键词：特征选择机器学习代谢综合征可解释性

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同方期刊数据库

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基于大数据的肝癌血管侵袭标志物分析

中华流行病学杂志 2017年第4期38卷 522-527页

作者：陈谦仇小强广西医科大学公共卫生学院流行病学与卫生统计学教研室南宁530021

目的通过对GEO（Gene Expression Omnibus）与TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库分析，挖掘肝癌血管侵袭相关的microRNA，并分析其预后和可能机制。方法利用GEO数据库获得肝癌血管侵袭microRNA芯片数据（GSE67140），对5种侵袭... 详细信息

目的通过对GEO（Gene Expression Omnibus）与TCGA（The Cancer Genome Atlas）数据库分析，挖掘肝癌血管侵袭相关的microRNA，并分析其预后和可能机制。方法利用GEO数据库获得肝癌血管侵袭microRNA芯片数据（GSE67140），对5种侵袭能力不同的细胞系（SNU423、SNU449、HepG2、Hep3B、SNU398）表达谱进行差异分析，并在81份血管侵袭阳性组织样本与91份血管侵袭阴性组织样本中验证差异分析结果。结合TCGA数据库中362例肝癌病例数据分析其预后，并对microRNA所调控的基因进行GO与KEGG分析。结果 hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940在侵袭能力强的肝癌细胞和有血管侵袭的肝癌组织中表达上调（logFC〉 1，P〈 0.05）。生存分析显示，hsa-mir-1180（HR=1.623，95%CI：1.114～2.365，P=0.012）、hsa-mir-149（HR=2.400，95%CI：1.639～3.514，P〈 0.001）、hsa-mir-744（HR=1.679，95%CI：1.161～2.427，P=0.006）、hsa-mir-940（HR=1.704，95%CI：1.188～2.443，P=0.004）是肝癌病例预后独立危险因素，高表达与患者生存期缩短显著相关（P〈 0.05）。GO与KEGG分析其机制可能与免疫反应、细胞黏附、紧密连接等信号通路有关。结论通过对TCGA与GEO数据库的挖掘，初步发现hsa-mir-1180、hsa-mir-149、hsa-mir-744、hsa-mir-940对肝癌的预后有影响，可作为肝癌预后的生物标志物。

关键词：肝癌血管侵袭标志物 microRNA 大数据