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基于O-PIRTAS翻转课堂探讨我校《免疫与感染基础》模块教学新模式

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细胞与分子免疫学杂志 2024年第8期40卷 761-766页

作者：刘赫张惠马宏炜吕欣雷迎峰王芳张芳琳程林峰空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室陕西西安710032

《医学微生物学》和《医学免疫学》是我校《免疫与感染基础》模块化教学中的重要组成部分。其中,《细菌的感染与免疫》是连接《医学微生物学》与《医学免疫学》的桥梁章节。该章节主要介绍致病菌如何侵入机体导致感染,以及机体免疫系统... 详细信息

《医学微生物学》和《医学免疫学》是我校《免疫与感染基础》模块化教学中的重要组成部分。其中,《细菌的感染与免疫》是连接《医学微生物学》与《医学免疫学》的桥梁章节。该章节主要介绍致病菌如何侵入机体导致感染,以及机体免疫系统如何抵抗细菌感染,通过学习可以帮助学生构建“感染-免疫”知识框架。然而,该章节内容庞杂,课程时长有限,传统教学模式难以帮助学生理清知识脉络,教学效果较差,急需进行变革。作者以《细菌的感染与免疫》章节为例,探讨基于通用教学环节(O-PIRTAS)翻转课堂模式下的《免疫与感染基础》模块教学改革,为后续教学改革提供宝贵的经验。

关键词： O-PIRTAS翻转课堂细菌的感染与免疫教学设计教学模式

外泌体来源microRNA在微生物感染中的作用研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第6期19卷 729-732页

作者：杜文雅马枫茜代禹美陈瑞枫王国富吴利先大理大学基础医学院微生物学与免疫学教研室云南大理671000

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产... 详细信息

外泌体包含母细胞来源的蛋白质、脂质和核酸等多种成分,其中核酸中的miRNA起到越来越重要的作用,miRNA通过靶向mRNA 3′端非翻译区结合导致mRNA降解或翻译抑制。许多疾病的发生都伴随着miRNA表达失调,这对宿主基因调控和某些分子机制产生影响。越来越多研究证明miRNA可以作为疾病的潜在生物标志物、治疗靶点,参与炎症反应的过程等。本文就外泌体中的miRNA在病毒,细菌等微生物导致的感染性疾病,如流感病毒、肝炎病毒、HIV、结核分枝杆菌、梅毒螺旋体和支原体中的作用进行综述。

关键词：外泌体 miRNA 微生物感染性疾病综述

基于幽门螺杆菌hp0169基因三维结构的生物信息学分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第3期50卷 739-748页

作者：林玲辉李娜尹晓燕王晓凌胡亚平刘威费瑞田新利邢台医学高等专科学校病原生物学与免疫学教研室河北邢台054000 陆军军医大学基础医学院全军免疫学研究所重庆400038 吉林大学基础医学院细胞生物学系吉林长春130021

目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNASt... 详细信息

目的:克隆幽门螺杆菌(Hp) hp0169基因并进行晶体学研究,分析其二级结构和三维结构。方法:由UniProt数据库中检索Hp NCTC26695菌株hp0169基因及其编码蛋白序列,采用生物信息学方法分析Hp重组胶原蛋白酶(HpPrtC)蛋白理化性质,SOPMA和DNAStrar软件预测HpPrtC蛋白二级结构特征,SWISS-MOPEL软件构建HpPrtC蛋白三维结构,IEDB和ABCpred软件预测HpPrtC蛋白B淋巴细胞抗原表位,SYFPEITHI网站预测T淋巴细胞抗原表位,专家库(EP)算法和随机森林(RF)算法预测HpPrtC蛋白可结晶性。原核表达HpPrtC重组蛋白,经Ni^(2+)亲和层析和分子筛技术纯化蛋白,结晶试剂盒筛选HpPrtC的结晶条件。结果:hp0169基因共包含1 269个碱基配对,编码蛋白全长422个氨基酸,理论等电点为7.64,相对分子质量为47 300。HpPrtC蛋白为亲水性、可溶性蛋白。HpPrtC蛋白α螺旋的氨基酸数量占全部氨基酸数量百分率为35.78%,β片层为18.72%,β转角为6.87%,无规则卷曲为38.63%。抗原表位分析,HpPrtC蛋白含有B淋巴细胞的5个优势线性表位和3个构象表位及多个T淋巴细胞潜在优势抗原表位。同源建模,HpPrtC蛋白呈二聚体,单体由β折叠围成桶状结构,周围被α螺旋和无规则卷曲围绕。HpPrtC蛋白为中等难度结晶,且无信号肽和跨膜螺旋,在0.2 mol·L^(-1)氯化镁、 0.1 mol·L^(-1)三羟甲基氨基甲烷(Tris)、3.4 mol·L^(-1)己二醇和pH 8.5条件下出现细小成簇的针状晶体。结论:HpPrtC是一种亲水型蛋白,呈二聚体构造,在适宜条件下呈细小成簇针状晶体,其具有T淋巴细胞和B淋巴细胞优势抗原表位,可作为Hp疫苗设计的抗原,用于构建多价融合疫苗或多表位疫苗,本研究结果为Hp的防治提供了实验基础。

关键词：幽门螺杆菌 hp0169基因抗原表位蛋白结晶生物信息学

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基于网络药理学和动物体内试验验证云实感冒合剂对呼吸道合胞病毒作用

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第2期44卷 170-182页

作者：徐庆胜李玉迁蒋立娜魏洪迟茜文廖思睿陈维娇贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州省普通高校学校病原生物学特色重点实验室贵阳550025 贵州医科大学基础医学院国家级实验教学中心贵阳550025

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1... 详细信息

目的基于网络药理学和体内试验探讨云实感冒合剂抗呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)的作用机制。方法网络药理学预测:运用TCMSP、GeneCards等数据库预测云实感冒合剂干预RSV的活性成分及作用靶点。利用Cytoscape 3.2.1软件构建中药成分-疾病靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质相互作用关系。借助Metascape数据库进行富集分析。采用分子对接技术分析验证网络药理学结果。云实感冒合剂干预RSV感染验证试验:滴鼻法建立RSV小鼠模型,灌胃合剂后检测血常规、肺指数,观察肺组织病理变化,流式细胞术检测外周血T细胞亚群,ELISA检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β含量,RT-PCR检测肺组织中TLR4、NF-κB和RSV-N基因mRNA相对水平。结果分析获得云实感冒合剂有效活性成分41个,抗RSV靶点111个,富集得到167条信号通路,主要是PI3K/AKT、MAPK、Toll-like等信号通路。分子对接结果显示,云实感冒合剂活性成分木犀草素、山奈酚、槲皮素与RSV-G、RSV-F、PI3K、AKT1、Bcl-2结合能均小于0 kcal/mol。体内试验结果显示,与RSV组相比,云实感冒合剂高剂量组白细胞、淋巴细胞计数升高、肺指数降低,差异有统计学意义(P学意义(P<0.05)。结论云实感冒合剂通过多成分、多靶点、多通路发挥调控RSV感染,主要通过缓解肺组织病理损伤,减轻炎症反应,其机制可能与抑制TLR4/NF-κB通路激活有关。

关键词：云实感冒合剂网络药理学呼吸道合胞病毒体内试验分子对接

志贺氏杆菌分泌蛋白Dnak的表达纯化与多克隆抗体的制备及应用

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中国人兽共患病学报 2024年第3期40卷 236-242页

作者：贾雪娇刘梦琦刘洋刘长城李小凤胡屹硕李香雨李润林李永刚赵微锦州医科大学基础医学院病原生物学实验室锦州121001

目的表达轮状病毒感染的乳鼠体内志贺氏杆菌分泌蛋白Dnak(Hsp70),并制备Dnak多克隆抗体。方法以提取的志贺氏杆菌基因组为模板PCR扩增Dnak片段,与pET-24a(+)和PCDNA3.1分别连接构建原核表达质粒pET24a(+)-Dnak和真核表达质粒PCDNA3.1-Dn... 详细信息

目的表达轮状病毒感染的乳鼠体内志贺氏杆菌分泌蛋白Dnak(Hsp70),并制备Dnak多克隆抗体。方法以提取的志贺氏杆菌基因组为模板PCR扩增Dnak片段,与pET-24a(+)和PCDNA3.1分别连接构建原核表达质粒pET24a(+)-Dnak和真核表达质粒PCDNA3.1-Dnak;pET24a(+)-Dnak原核表达质粒转化至*** BL21(DE3)感受态细胞,IPTG诱导表达,经镍柱纯化Dnak蛋白。以纯化后的重组蛋白为免疫原免疫C57BL/6小鼠制备多克隆抗体,采用间接ELISA检测效价,Western Blot法检测灵敏度和特异性。利用制备的多克隆抗体在GST Pull-down实验中检测Dnak与轮状病毒非结构蛋白Nsp2的相互作用。真核表达质粒PCDNA3.1-Dnak转染至HEK293T细胞,以制备的DnaK多克隆抗体为一抗,Western blot法检测Dnak在细胞中的表达。利用MEGA11及Genedoc软件分析此志贺氏杆菌与志贺菌属其他细菌Dnak氨基酸序列同源性。结果重组质粒pET24a(+)-Dnak与PCDNA3.1-Dnak经测序比对包含与此志贺氏杆菌(Shigella:PRJNA804371)序列一致的基因,证明质粒构建成功。诱导表达的重组Dnak蛋白主要以可溶性形式存在,相对分子质量约为75 kDa,浓度可达0.62 mg/mL;Dnak鼠多克隆抗体可与重组Dnak蛋白发生特异性反应,效价为1∶32000,至少可以在1∶6000稀释度下检测到Dnak蛋白。GST Pull-down实验可以检测到Dnak与轮状病毒非结构蛋白Nsp2发生相互作用。转染PCDNA3.1-Dnak重组质粒的HEK293T细胞可以表达Dnak蛋白。经MEGA11和Genedoc软件比对PRJNA804371株与宋内志贺菌(Shigella sonnei)、痢疾志贺菌(Shigella dysenteriae)、鲍氏志贺菌(Shigella boydii)、福氏志贺菌(Shigella flexneri)Dnak氨基酸序列同源性较高。结论成功表达志贺氏杆菌Dnak蛋白,具有良好反应性与免疫原性;制备的鼠多克隆抗体效价及灵敏度较高可满足后续实验需要。

关键词：志贺氏杆菌 Dnak 蛋白表达与纯化多克隆抗体轮状病毒

新型肠炎沙门菌菌影候选疫苗在小鼠免疫应答和保护功效的评估

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第4期44卷 295-303页

作者：杨慧韩雪杜小春焦红梅郑国军常州市第三人民医院检验科常州213000 扬州大学医学院/转化医学研究院病原生物学教研室扬州225001

目的比较肠炎沙门菌制备的菌影(SE-ghost)通过肌肉注射(肌注)和口服不同免疫途径接种雌性BALB/c小鼠诱导体液和细胞免疫应答的功效。方法用SE-ghost接种BALB/c小鼠,间接ELISA检测小鼠血清中IgG抗体水平和阴道灌洗液IgA抗体水平;流式细... 详细信息

目的比较肠炎沙门菌制备的菌影(SE-ghost)通过肌肉注射(肌注)和口服不同免疫途径接种雌性BALB/c小鼠诱导体液和细胞免疫应答的功效。方法用SE-ghost接种BALB/c小鼠,间接ELISA检测小鼠血清中IgG抗体水平和阴道灌洗液IgA抗体水平;流式细胞仪检测小鼠脾脏CD3^(+)CD4^(+)T、CD3^(+)CD8^(+)T细胞百分比变化和脾脏内细胞因子IL-4、IFN-γ分泌;三次免疫后所有小鼠口服半数致死量肠炎沙门菌进行强毒攻击。用SE-ghost刺激小鼠骨髓来源树突状细胞(BMDCs),流式细胞仪检测表面分子抗体APC-CD11c、FITC-MHC ClassⅡ、PE-CD40、FITC-CD86、PE-CD80表达量;双抗体夹心ELISA测定BMDCs上清液IL-1β、IL-6、IL-10和IL-12p70的产量。结果与PBS组相比,SE-ghost(口服)和SE-ghost(肌注)免疫组小鼠体内肠炎沙门菌特异性抗体IgG和IgA水平明显增高;脾脏CD3^(+)CD4^(+)T细胞百分比上调、高分泌细胞因子IL-4、IFN-γ。肌肉注射SE-ghost比口服可诱导更强的体液和细胞免疫应答。致病菌肠炎沙门菌强毒攻击后,SE-ghost(口服)和SE-ghost(肌注)免疫组生存率高达80%。与对照组相比,BMDCs经SE-ghost刺激后高表达表面成熟分子抗体CD86、CD80、CD40、MHCⅡ,高分泌细胞因子IL-1β、IL-6、IL-10、IL-12p70。结论通过肌肉注射SE-ghost进行免疫,可在小鼠中引发更强大的抗原特异性免疫应答,以防止沙门菌感染。SE-ghost是一种有用的沙门菌候选疫苗。

关键词：肠炎沙门菌细菌菌影灭活疫苗免疫应答保护功效

耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌裂解性噬菌体PA103的生物学特性及全基因组分析

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中国病原生物学杂志 2024年第10期19卷 1182-1188,1193页

作者：张改靳静陈松建王书伟李振江刘肖李亚辉张欢欢王山梅河南医学高等专科学校病原生物学与免疫学教研室河南郑州451191 河南省人民医院检验科

目的探讨耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)噬菌体PA103的生物学特性及全基因组信息。方法以CRAB临床菌株A103为宿主菌,采用双层平板法在市政污水中分离得到1株裂解性噬菌体PA103;通过双... 详细信息

目的探讨耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii,CRAB)噬菌体PA103的生物学特性及全基因组信息。方法以CRAB临床菌株A103为宿主菌,采用双层平板法在市政污水中分离得到1株裂解性噬菌体PA103;通过双层平板法观察噬菌斑形态;通过透射电镜观察噬菌体形态特征;调查PA103的噬菌谱、一步生长曲线及对温度和酸碱的稳定性;应用蛋白酶K/SDS法提取噬菌体基因组DNA;对PA103进行基因组测序、拼装;用RAST在线预测软件对基因组中可能存在的开放读码框进行预测;用MEGA 11.0软件以末端酶大亚基构建进化树,用Mauve软件进行比较基因组学分析。结果试验分离得到1株可以裂解CRAB的裂解性噬菌体,命名为PA103;它可以在宿主菌A103的菌苔上形成直径约2 mm完全透明的噬菌斑,周围环绕宽为3~4 mm的半透明晕环;透射电镜显示PA103属于有尾噬菌体,头部和尾部直径长度约64 nm和120 nm;一步生长曲线显示PA103的潜伏期约为40 min,爆发期约为15 min,爆发量约为17 PFU/cell;噬菌体PA103在50、60℃,pH 5.0~9.0的环境下,均能保持相对稳定的活性;PA103的基因组全长45 225 bp, G+C含量为37.82%,全基因组预测含86个开放阅读框,其中29个为功能蛋白,其余57个被注释为假定蛋白;共线性分析结果显示噬菌体PA103与噬菌体LZ35的局部共线性区域的数目、方向、排列顺序和长度非常相似;进化树构建结果显示噬菌体PA103应属于Obolenskviru属成员。结论新型噬菌体PA103具有较强的鲍曼不动杆菌裂解能力,可为噬菌体防治耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌的感染提供参考。

关键词：耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌噬菌体生物学特性基因组分析

固有免疫受体NLRX1在中枢神经系统疾病中作用的研究进展

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神经解剖学杂志 2024年第1期40卷 127-131页

作者：高保青曹碗君高小川吴兴安刘蓉蓉陈雅慧邝芳延安大学医学院生理学教研室延安716000 空军军医大学基础医学院神经生物学教研室西安710032 空军军医大学基础医学院微生物与病原生物学教研室西安710032

中枢神经系统(CNS)正常功能的发挥高度依赖细胞能量供给与固有免疫体系提供的内环境稳定。NOD样受体家族成员X1(NLRX1)是定位于线粒体的固有免疫模式识别受体,具有调节线粒体自噬、炎性反应、活性氧的生成等多种功能,因而可影响炎症、... 详细信息

中枢神经系统(CNS)正常功能的发挥高度依赖细胞能量供给与固有免疫体系提供的内环境稳定。NOD样受体家族成员X1(NLRX1)是定位于线粒体的固有免疫模式识别受体,具有调节线粒体自噬、炎性反应、活性氧的生成等多种功能,因而可影响炎症、肿瘤等多种疾病的进展。近年来的研究表明,NLRX1通过抑制炎性反应、调节神经细胞线粒体自噬、线粒体动力变化和氧化应激反应等机制,在自身免疫性脱髓鞘疾病、缺血缺氧性疾病、创伤等CNS疾病中发挥神经保护作用。了解NLRX1参与CNS疾病过程的机制,可加深对CNS固有免疫分子的认识,并可望为CNS疾病的治疗提供新的思路与靶点。

关键词：中枢神经系统疾病 NLRX1 神经炎症线粒体调节细胞凋亡

基于cGAS-STING通路探讨中药对心血管疾病的炎症反应的作用及其研究进展

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中国病原生物学杂志 2024年第11期19卷 1381-1384页

作者：张曼琳刘贞麟刘奇王聪大理大学基础医学院病原生物学综合实验室云南大理671000

心血管疾病是由多种原因造成的,是一种复杂的临床疾病。心血管疾病的病程中由于心肌的损伤会导致无菌性炎症,并且也会伴随着多种炎症因子的产生。cGAS-STING通路是连接自然免疫疾病和炎症的重要通路,但该通路的异常激活也是多种疾病发... 详细信息

心血管疾病是由多种原因造成的,是一种复杂的临床疾病。心血管疾病的病程中由于心肌的损伤会导致无菌性炎症,并且也会伴随着多种炎症因子的产生。cGAS-STING通路是连接自然免疫疾病和炎症的重要通路,但该通路的异常激活也是多种疾病发展的重要原因,且与心肌损伤也密切相关。通过靶向抑制或阻断cGAS-STING通路对多种疾病的治疗具有重要的价值。而多种中药中的许多成分已经被证实可以治疗心肌相关的疾病,并且已经进入到临床使用,并取得了良好的治疗效果。本文综述心血管疾病与cGAS-STING的关系及进展,对中药通过调节cGAS-STING通路发挥抗炎作用从而治疗心血管疾病进行整理综述。

关键词： cGAS-STING 心血管疾病中药炎症反应综述