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普通野生稻早抽穗基因OsEHD8的鉴定与进化分析

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中国农业科学 2024年第14期57卷 2703-2725页

作者：鄢柳慧钟琦马增凤韦敏益刘驰秦媛媛周小龙黄大辉卢颖萍秦钢张月雄广西农业科学院水稻研究所/广西水稻遗传育种重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室广西农业科学院柳州分院/柳州市农业科学研究中心广西农业科学院农业科技信息研究所

【目的】抽穗期是影响水稻（Oryza sativa L.）区域适应性和产量的关键性状。鉴定早抽穗期基因对于丰富和完善水稻抽穗期调控网络，为品种适应性改良提供重要信息。【方法】以早抽穗的染色体片段代换系CL33和晚抽穗的受体亲本93-11为研... 详细信息

【目的】抽穗期是影响水稻（Oryza sativa L.）区域适应性和产量的关键性状。鉴定早抽穗期基因对于丰富和完善水稻抽穗期调控网络，为品种适应性改良提供重要信息。【方法】以早抽穗的染色体片段代换系CL33和晚抽穗的受体亲本93-11为研究材料，对其主要农艺性状进行调查分析；构建2个极早抽穗和极晚抽穗的DNA混合池；对其进行全基因组重测序和BSA-Seq分析定位抽穗期关联的区域，开发该区域内InDel标记进行精细定位，对定位区间进行基因预测和候选基因分析，确定LOC＿Os08g07740为目标候选基因；随后对该基因进行克隆和等位基因分析。此外，还利用生物信息学软件对LOC＿Os08g07740上下游约40 kb范围内的基因组数据进行分析，确定该基因在Indica、Japonica和O. rufipogon 3个水稻亚群间的遗传和系统进化关系。【结果】在南宁自然长日照和自然短日照条件下，CL33的抽穗期均比受体亲本93-11短20—25 d；此外，在自然长日照条件下，CL33植株除了穗长变短和每穗粒数减少之外，其他农艺性状与93-11无显著差异。遗传分析表明，CL33早抽穗性状受1对隐性基因控制。该基因被精细定位于水稻第8染色体短臂PSM8-6与PSM8-8标记间约100 kb区间内，该区域内有15个预测的候选基因。其中，ORF13(LOC＿Os08g07740)与已知抽穗期基因DTH8/Ghd8等位；通过对ORF13基因的测序及序列比对，该基因全长888 bp，无内含子，编码295个氨基酸；与受体亲本93-11相比，CL33中的LOC＿Os08g07740在第535—536位碱基和第820—821位碱基之间分别有6 bp的插入和9 bp的缺失，导致编码的氨基酸序列改变。因此，确定其为目标候选基因，暂命名为Os EHD8。进化分析表明，LOC＿Os08g07740内，相较于O. rufipogon,Indica和Japonica的遗传多样性显著下降，其中，Indica减少了62.53%,Japonica减少了53.76%，而Indica和Japonica之间的差异不显著。该基因共有13个单倍型，其中Hap＿2单倍型可能是3个亚群共同的祖先，不同的单倍型可能由于地理隔离或环境差异被分别固定在Indica和Japonica亚群内，以上结果表明，LOC＿Os08g07740在3个亚群中经历了定向选择。【结论】Os EHD8是DTH8/Ghd8的功能性等位基因，在自然长日照和短日照条件下均促进水稻提前抽穗。此外，携带Os EHD8的染色体片段代换系CL33在自然长日照条件下，除了穗长变短和每穗粒数减少之外，其他农艺性状与受体亲本93-11均无显著差异。

关键词：水稻抽穗期 DTH8/Ghd8 BSA-seq 进化

圆叶葡萄和欧亚种葡萄叶片提取物对葡萄霜霉病的防治作用

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中国南方果树 2024年第3期53卷 185-191页

作者：郭泽西韦淑梅李旭东刘露露潘凤英孙大运尹玲黄羽曲俊杰广西壮族自治区农业科学院广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 广西壮族自治区农业科学院葡萄与葡萄酒研究所南宁530007

为了明确不同抗性葡萄的叶片提取物对葡萄霜霉病的防治作用,以对葡萄霜霉病免疫的圆叶葡萄品种Noble及感病的欧亚种葡萄品种赤霞珠的幼叶和成龄叶乙醇提取物(叶片经干燥、粉碎后,以95%乙醇进行超声提取)为试材,设置不同浓度梯度,检测其... 详细信息

为了明确不同抗性葡萄的叶片提取物对葡萄霜霉病的防治作用,以对葡萄霜霉病免疫的圆叶葡萄品种Noble及感病的欧亚种葡萄品种赤霞珠的幼叶和成龄叶乙醇提取物(叶片经干燥、粉碎后,以95%乙醇进行超声提取)为试材,设置不同浓度梯度,检测其对葡萄霜霉病菌(Plasmopara viticola,葡萄生单轴霉)孢子囊和游动孢子萌发的影响,同时测定其对霜霉病的室内防治作用。结果表明,两种抗性葡萄的叶提取物对葡萄霜霉病菌孢子囊和游动孢子的萌发均具有抑制作用。1 mg/mL叶片提取物处理下孢子囊萌发率即显著低于对照(无菌水和5%乙醇),而且叶片提取物浓度从10 mg/mL增加到50 mg/mL时孢子囊萌发率显著下降。在10 mg/mL叶片提取物处理下游动孢子萌发率即显著低于对照。两种抗性葡萄幼叶和成龄叶提取物浓度为10、25和50 mg/mL时,仅10 mg/mL“赤霞珠”成龄叶提取物对葡萄霜霉病的室内防治效果为95.0%,其余处理均为100.0%。“Noble”和“赤霞珠”叶提取物具有抑制霜霉病菌孢子囊和游动孢子萌发的作用,其室内防治效果显著。

关键词：葡萄霜霉病叶片提取物圆叶葡萄欧亚种葡萄预防

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“东桑西移”促进中西部蚕桑产业发展的机理及实证研究

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蚕业科学 2024年

作者：李春华邹凌峰韦伟于永霞广西民族大学经济学院广西民族大学数字经济与人口发展研究中心广西壮族自治区蚕业技术推广站广西壮族自治区蚕业科学研究院广西蚕桑遗传改良与高效种养重点实验室

“东桑西移”工程的实施对中西部蚕桑产业发展具有重要意义。为评估“东桑西移”工程对中西部蚕桑产业发展的影响，采用1999—2021年我国16个蚕茧主产区的数据，并运用双重差分法进行政策效应的检验。研究发现，“东桑西移”工程的提出... 详细信息

“东桑西移”工程的实施对中西部蚕桑产业发展具有重要意义。为评估“东桑西移”工程对中西部蚕桑产业发展的影响，采用1999—2021年我国16个蚕茧主产区的数据，并运用双重差分法进行政策效应的检验。研究发现，“东桑西移”工程的提出显著促进了中西部蚕桑产业的发展，且随着年份的推移影响效果愈加明显；在短期效应和长期效应方面，政策的实施对于蚕茧产量、生丝产量和丝绸类商品出口均有正向影响，但对丝绸类商品出口的影响并不显著。基于此，本文从政策评估效应、政策跟随与预判、主要影响因素3个方面提出助推我国蚕桑产业高质量发展的对策建议。

关键词：东桑西移蚕桑产业双重差分

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荔枝、龙眼育种研究进展

中国南方果树 2024年第3期53卷 1-6,15页

作者：卿昊炜黎明易晨歆张树伟郭慧勤彭宏祥丁峰广西壮族自治区农业科学院/广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 广西大学农学院南宁530004 广西壮族自治区农业科学院园艺研究所南宁530007

我国是荔枝、龙眼原产国,荔枝、龙眼栽培历史悠久,野生荔枝、龙眼资源丰富.随着社会的发展,原有的荔枝、龙眼品种难以满足市场需求,选育符合市场需求的优良品种是荔枝、龙眼产业发展的迫切要求.本文综述了不同育种方法,即常规实生育种... 详细信息

我国是荔枝、龙眼原产国,荔枝、龙眼栽培历史悠久,野生荔枝、龙眼资源丰富.随着社会的发展,原有的荔枝、龙眼品种难以满足市场需求,选育符合市场需求的优良品种是荔枝、龙眼产业发展的迫切要求.本文综述了不同育种方法,即常规实生育种、杂交育种、分子标记辅助育种和生物技术育种运用于荔枝、龙眼的情况,并对今后荔枝、龙眼的育种发展进行了展望.

关键词：荔枝龙眼常规育种杂交育种分子标记辅助育种生物技术育种

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家蚕追寄蝇虾红素样精液蛋白酶EsSemp的基因克隆与特性分析

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蚕业科学 2024年第3期50卷 222-231页

作者：王耒耒王闪闪浦月霞刘吉银王梅仙朱娟沈兴家沈中元唐顺明江苏科技大学生物技术学院江苏省蚕桑与畜禽生物技术重点实验室江苏镇江212100 广西壮族自治区蚕业技术推广站南宁530007 农业农村部蚕桑遗传改良重点实验室中国农业科学院桑蚕科学研究中心江苏镇江212100

虾红素样金属蛋白酶广泛存在于各种昆虫中,参与受精繁殖、孵化及消化等生理功能。为鉴定家蚕追寄蝇生殖繁育相关基因,利用RACE技术克隆获得家蚕追寄蝇虾红素样精液蛋白酶基因全长cDNA序列,命名为EsSemp(GenBank登录号:OP777491),其全长... 详细信息

虾红素样金属蛋白酶广泛存在于各种昆虫中,参与受精繁殖、孵化及消化等生理功能。为鉴定家蚕追寄蝇生殖繁育相关基因,利用RACE技术克隆获得家蚕追寄蝇虾红素样精液蛋白酶基因全长cDNA序列,命名为EsSemp(GenBank登录号:OP777491),其全长为985 bp,ORF为771 bp,编码256个氨基酸残基。以染色体步移技术克隆获得EsSemp完整基因结构,由1个内含子和2个外显子组成。系统发生树结果显示,EsSemp与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)精液蛋白酶基因副本的产物CG15254高度同源。qRT-PCR结果显示,EsSemp在雄蝇副性腺表达较弱,在蝇蛆和成蝇的中肠和马氏管表达较强,在卵期0 h和卵后期大量表达,推测EsSemp参与了受精、孵化与消化代谢等过程。体外表达EsSemp蛋白,结果显示EDTA可抑制EsSemp酶活。以上研究结果为进一步阐明家蚕追寄蝇繁殖发育相关分子机制提供了参考,为开发家蚕蝇蛆病防治新途径提供了基础信息。

关键词：家蚕追寄蝇虾红素样蛋白酶基因 RACE 繁殖发育蛋白质表达

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六堡茶香气成分及检测技术研究进展

中南农业科技 2024年第8期45卷 247-249页

作者：杨桂强李吉生莫璋红吴玉钧吕敏陆燕梧州市农产品质量安全综合检测中心广西梧州543002 广西智标云信息科技有限公司南宁530007 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室南宁530007 广西-东盟食品检验检测中心南宁530025 广西壮族自治区绿色食品发展站南宁530022

综述了六堡茶香气成分提取及检测方法以及香气影响因素的研究进展,分析探讨了六堡茶香气研究的难点和未来研究的方向,旨在为提升六堡茶的加工品质提供思路。

关键词：六堡茶香气成分检测技术研究进展

穿心莲不同生长发育期穿心莲内酯积累与碳氮代谢特征

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西南农业学报 2024年第5期37卷 1038-1046页

作者：简少芬钟楚万斯林杨陈东亮广西壮族自治区药用植物国家中医药传承创新中心/广西药用资源保护与遗传改良重点实验室/广西中药资源智慧创制工程研究中心南宁530023 广西农业科学院经济作物研究所南宁530007

【目的】明确穿心莲(Andrographis paniculata)不同生长发育期主要活性成分穿心莲内酯的积累和碳、氮代谢特征及其关系,为穿心莲优质高产栽培管理提供理论依据。【方法】根据穿心莲生长发育特点,将其物候期划分为塔型期、团棵期、拔节... 详细信息

【目的】明确穿心莲(Andrographis paniculata)不同生长发育期主要活性成分穿心莲内酯的积累和碳、氮代谢特征及其关系,为穿心莲优质高产栽培管理提供理论依据。【方法】根据穿心莲生长发育特点,将其物候期划分为塔型期、团棵期、拔节期、现蕾期、盛花期和花果期,分析大田条件下各生长发育期的生物量及穿心莲内酯积累和碳、氮代谢特征。【结果】穿心莲全株和茎秆生物量在盛花期开始稳定,叶片生物量在拔节期开始趋于稳定,相对生长速率和叶片生物量占比随着生长进程逐渐下降。叶片的穿心莲内酯含量在塔型期至现蕾期(营养生长期)逐渐上升,在现蕾期达峰值且保持稳定,单株穿心莲内酯产量在盛花期达最大。穿心莲内酯合成关键酶基因ApDXS、ApDXR、ApGGPS和ApCPS的表达量在团棵期上升,随后下降并趋于平稳,而基因ApHMGS和ApHMGR1在现蕾期后维持在高表达水平。穿心莲内酯合成可能主要受甲羟戊酸(MEP)途径调控,且穿心莲内酯积累滞后于基因表达。叶片和茎秆的氮含量随着穿心莲的生长进程逐渐下降,植株地上部氮积累量和茎秆氮积累量在现蕾期达最大值,而叶片的氮在现蕾期后向果实转移其积累量逐渐下降。塔型期和团棵期叶片氮同化相关酶中的谷氨酰胺合成酶(GS)、谷氨酸脱氢酶(NAD-GDH)和异柠檬酸脱氢酶(ICDH)活性较高,同时叶片蔗糖和可溶性总糖含量也较高,随后氮同化酶活性及蔗糖和可溶性总糖含量下降,淀粉含量的变化则相反。叶片穿心莲内酯含量和单株穿心莲内酯产量与株高、生物量、地上部氮积累量和淀粉含量呈极显著正相关(P<0.01,下同),与叶片氮含量呈极显著负相关,说明促进穿心莲营养生长期生物量积累有利于提高穿心莲内酯含量和产量。【结论】现蕾期至盛花期是采收穿心莲药材的最佳时期;营养生长期是穿心莲氮同化和积累的主要时期,在该时期适当增施氮肥促进穿心莲生物量积累可提高穿心莲内酯含量和产量。

关键词：穿心莲生育时期碳氮代谢穿心莲内酯

基于转录组测序的巴马香猪和杜洛克猪骨骼肌差异lncRNA分析

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南方农业学报 2024年第3期55卷 650-659页

作者：胡梦灵范新浩姚一龙闫超谢炳坤兰干球梁晶唐中林广西大学动物科学技术学院/广西畜禽繁育与疾病防控重点实验室广西南宁530004 佛山鲲鹏现代农业研究院广东佛山528226 中国农业科学院深圳农业基因组研究所/岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心广东深圳518124 广西巴马香猪资源开发工程研究中心广西河池547599 广西农业职业技术大学畜牧研究院/广西家畜遗传改良重点实验室广西南宁530001 中国农业科学院深圳农业基因组研究所MARA畜禽多密克戎重点实验室广东深圳518124

【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进... 详细信息

【目的】通过对巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序鉴定差异表达lncRNA,筛选与骨骼肌发育形成相关的候选基因,为明确lncRNA对骨骼肌生长发育的调控机制提供理论基础。【方法】采集12月龄的巴马香猪和杜洛克猪背最长肌组织进行转录组测序,以错误发现率(FDR)1为标准筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达lncRNA,并进行实时荧光定量PCR验证,预测差异表达lncRNA靶基因并进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,选取表达差异最大的lncRNA构建其与靶基因互作网络。【结果】在巴马香猪和杜洛克猪背肌间共鉴定出6316个DEGs和675个差异表达lncRNA;GO功能注释分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因主要涉及代谢过程、肌肉组织发育及骨骼肌细胞增殖和分化等生物过程;KEGG信号通路富集分析结果表明,差异表达lncRNA靶基因在Hippo和Wnt信号通路显著富集(P<0.05),说明差异表达lncRNA与骨骼肌细胞的增殖、自噬和分化相关;对表达差异最大的lncRNA-MSTRG.16703进行实时荧光定量PCR验证,发现其在巴马香猪中的相对表达量极显著高于杜洛克猪(P<0.01),与转录组测序结果一致。lncRNA-MSTRG.16703与靶基因互作网络分析结果表明,上调靶基因包括QKI、MBNL1和YBX2,QKI和MBNL1在均与可变剪接相关。【结论】在巴马香猪和杜洛克猪间发现的差异表达lncRNA是调控骨骼肌发育的候选基因,其靶基因主要富集在Hippo和Wnt等骨骼肌发育相关信号通路。lncRNA-MSTRG.16703的表达差异最大且在巴马香猪中上调,其靶基因在骨骼肌细胞增殖分化和肌纤维形成中有重要调控作用。

关键词：巴马香猪杜洛克猪背最长肌转录组测序 lncRNA

晒田环境胁迫对克氏原螯虾卵巢组织、卵黄蛋白原及营养物质代谢的影响

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西南农业学报 2024年第2期37卷 436-445页

作者：袁畅李蔚黄玉英何苹萍郑玉斯李鑫卢智发张圣杰李文红彭金霞王大鹏广西水产科学研究院/广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室南宁530021 广西大学动物科学技术学院南宁530004

【目的】研究克氏原螯虾在晒田环境胁迫条件下卵巢组织学特点、卵黄蛋白原浓度及营养物质代谢水平的变化,探索其性成熟过程中体内营养物质变化相关机制,为晒田环境胁迫促进克氏原螯虾卵巢成熟这一生产操作的改良和标准化提供参考依据。... 详细信息

【目的】研究克氏原螯虾在晒田环境胁迫条件下卵巢组织学特点、卵黄蛋白原浓度及营养物质代谢水平的变化,探索其性成熟过程中体内营养物质变化相关机制,为晒田环境胁迫促进克氏原螯虾卵巢成熟这一生产操作的改良和标准化提供参考依据。【方法】试验对象分为晒田组与对照组克氏原螯虾,在晒田胁迫0、3、7、10 d时分别采集30只雌性克氏原螯虾,取卵巢进行石蜡切片和HE染色,并采集试验组的卵巢、肝胰腺和血清,检测卵黄蛋白原mRNA表达水平和浓度及营养物质代谢水平。【结果】雌性克氏原螯虾在晒田胁迫期间共鉴定出4个卵巢发育阶段,包括卵黄发生前阶段(Ⅰ期,卵巢为黄色,卵母细胞直径150~250μm)、初级卵黄发生阶段(Ⅱ期,卵巢为橙色,卵母细胞直径250~600μm)、次级卵黄发生阶段(Ⅲ期,卵巢为棕色,卵母细胞直径高于600μm)、成熟阶段(Ⅳ期,卵巢为黑褐色,卵母细胞直径高于1000μm)。晒田胁迫0 d时,晒田组与对照组雌性克氏原螯虾卵巢成熟率相似;晒田胁迫10 d时,晒田组雌性克氏原螯虾卵巢成熟率升至96.67%,而对照组仅升至60.00%。随着胁迫时间增加,晒田组和对照组雌性克氏原螯虾的卵巢与肝胰腺的卵黄蛋白原mRNA相对表达量均呈上升趋势,且卵黄蛋白原mRNA在肝胰腺的相对表达量大于卵巢;试验期间,晒田组和对照组雌性克氏原螯虾卵黄蛋白原在肝胰腺的表达总量均大于在卵巢的表达总量,且卵黄蛋白原在肝胰腺的贡献率均大于在卵巢的贡献率。晒田组与对照组雌性克氏原螯虾卵巢、肝胰腺和血液中的卵黄蛋白原浓度均随时间增加呈上升趋势;晒田组浓度上升幅度大于对照组,肝胰腺卵黄蛋白原浓度与卵巢卵黄蛋白原浓度、肝胰腺卵黄蛋白原浓度与血清卵黄蛋白原浓度、卵巢卵黄蛋白原浓度与血清卵黄蛋白原浓度呈极显著正相关(P<0.01)。随着晒田胁迫时间增加,晒田组和对照组雌性克氏原螯虾血蓝蛋白(Hem)、总蛋白(TP)、乳酸(LA)和葡萄糖(Glu)含量均呈下降趋势,晒田组的下降幅度大于对照组;晒田组和对照组雌性克氏原螯虾甘油三酯(TG)和胆固醇(TC)含量呈上升趋势,晒田组的上升幅度大于对照组。【结论】晒田环境胁迫期间共鉴定出4个克氏原螯虾卵巢发育阶段。随胁迫时间增加,克氏原螯虾不同组织卵黄蛋白原mRNA相对表达量和浓度均呈上升趋势,卵黄蛋白原的肝胰腺贡献率大于卵巢贡献率。克氏原螯虾体内Hem、TP、LA和Glu含量降低,TG和TC含量升高,表明晒田环境胁迫对卵巢发育具有积极作用。

关键词：克氏原螯虾晒田环境胁迫卵巢发育卵黄蛋白原营养物质代谢卵巢组织学