检索结果-南通市图书馆

通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2023年

作者：沈敏徐道博彭美玲卢嘉怡李一博苏元彭雪艳刘云峰广西大学生命科学与技术学院

拟南芥（Arabidopsisthaliana）DSP1蛋白是DSP复合物的主要成员，其参与snRNA转录和剪切成熟，并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质，并预测了DSP1蛋白的二级结构和高级结构。在全长D... 详细信息

拟南芥（Arabidopsisthaliana）DSP1蛋白是DSP复合物的主要成员，其参与snRNA转录和剪切成熟，并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质，并预测了DSP1蛋白的二级结构和高级结构。在全长DSP1蛋白无法在细菌表达系统中诱导的情况下，通过无缝克隆技术成功构建包含DSP1蛋白N端两个保守ARM结构域（DSP1-N）的重组蛋白表达载体，并且成功纯化了GST-DSP1-N重组蛋白，进一步制备了DSP1的特异性多克隆抗体。通过免疫共沉淀和液相色谱串联技术，共鉴定出45个潜在的与DSP1互作的蛋白，后续的功能聚类分析结果暗示DSP1蛋白可能通过蛋白质代谢、核酸结合活性等方面发挥生物学功能。本研究可为进一步揭示DSP1蛋白在植物中的功能提供研究目标和方向。

关键词： DSP1蛋白重组蛋白免疫共沉淀液相色谱串联质谱互作蛋白

水稻OsDOF23的结构功能及其互作蛋白的初步分析

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2023年

作者：彭雪艳沈敏徐道博刘云峰苏元广西大学生命科学与技术学院

水稻（Oryza sativa L.）OsDOF23是植物特异性转录因子DOF(DNA binding with one finger)蛋白家族的一员，但其具体的生物学功能不明。因此，本研究以OsDOF23为研究对象，预测了OsDOF23蛋白的理化性质和结构特性，分析了OsDOF23基因的... 详细信息

水稻（Oryza sativa L.）OsDOF23是植物特异性转录因子DOF(DNA binding with one finger)蛋白家族的一员，但其具体的生物学功能不明。因此，本研究以OsDOF23为研究对象，预测了OsDOF23蛋白的理化性质和结构特性，分析了OsDOF23基因的组织表达图谱，及其在水稻群体中的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms， SNP)和插入缺失标记(Insertion-Deletion， InDel)。此外，成功克隆并在大肠杆菌中表达纯化了OsDOF23蛋白的C末端，并以其为抗原制作了OsDOF23的多克隆抗体，用于后续的免疫沉淀实验。经免疫沉淀和液相色谱串联质谱技术检测分析从水稻总蛋白中得到与OsDOF23共沉淀的蛋白质组信息。经筛选得到37个可能与DOF23互作的蛋白，对这些蛋白进行功能富集分析发现有17和15个蛋白分别富集在蛋白质代谢和运输功能方面，从分子功能来说，其主要富集于核酸结合活性和转运活性方面。这些结果表明OsDOF23蛋白可能通过与蛋白质代谢、核酸结合和转运等相关功能蛋白互作发挥其生物学功能。

关键词：水稻 DOF蛋白原核表达液相色谱串联质谱

海洋枯草芽孢杆菌产纤溶酶的诱变育种与发酵工艺优化

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物工程杂志 2022年第12期42卷 27-36页

作者：庞光武梁智群广西大学生命科学与技术学院南宁530004

目的:对海洋来源的具有产纤溶酶能力的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)LC6-1进行紫外诱变,得到高产且稳定的突变株PW6-3,对该突变株发酵产酶的条件进行优化。方法:采用单因素和正交试验进行发酵培养基组分和培养条件的优化。结果:突变... 详细信息

目的:对海洋来源的具有产纤溶酶能力的枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)LC6-1进行紫外诱变,得到高产且稳定的突变株PW6-3,对该突变株发酵产酶的条件进行优化。方法:采用单因素和正交试验进行发酵培养基组分和培养条件的优化。结果:突变株PW6-3的酶活力为(6960.21±85.51)U/mL,较原始菌株提高了30.48%。以PW6-3为出发菌株,采用单因素及正交试验的方法对菌株进行发酵培养基组分与培养条件优化,最终得到的最佳培养基组分是:玉米淀粉30 g/L,玉米浆干粉40 g/L,CaCl23 g/L;最佳发酵培养条件是:32℃,转速200 r/min,接种量3%,pH 6.5,种龄18 h,发酵培养时间66 h,最终菌株的酶活力稳定在(9203.63±67.85)U/mL。结论:发酵工艺优化后,菌株PW6-3纤溶酶产量较诱变之前的菌株LC6-1提高72.53%,且发酵工艺成本较低,具有较好的经济效益。

关键词：枯草芽孢杆菌纤溶酶诱变发酵优化

通过免疫共沉淀和蛋白质谱鉴定与拟南芥DSP1互作的蛋白

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2024年第3期43卷 387-399页

作者：沈敏徐道博彭美玲卢嘉怡李一博苏元彭雪艳刘云峰广西大学生命科学与技术学院南宁530004

拟南芥(Arabidopsis thaliana)DSP1(defective in snRNA processing 1)蛋白是DSP复合物的主要成员,其参与snRNA转录和剪切成熟,并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质,并预测了DSP1蛋白... 详细信息

拟南芥(Arabidopsis thaliana)DSP1(defective in snRNA processing 1)蛋白是DSP复合物的主要成员,其参与snRNA转录和剪切成熟,并在植物生长发育的多个方面发挥重要作用。本研究利用在线平台分析了DSP1蛋白的理化性质,并预测了DSP1蛋白的二级结构和高级结构。在全长DSP1蛋白无法在细菌表达系统中诱导的情况下,通过无缝克隆技术成功构建包含DSP1蛋白N端(DSP1-N)的重组蛋白表达载体,并且成功纯化了GST-DSP1-N重组蛋白,进一步制备了DSP1的特异性多克隆抗体。通过免疫共沉淀和液相色谱串联技术,共鉴定出45个潜在的与DSP1互作的蛋白,后续的功能聚类分析结果暗示DSP1蛋白可能通过蛋白质代谢、核酸结合活性等方面发挥生物学功能。本研究可为进一步揭示DSP1蛋白在植物中的功能提供研究目标和方向。

关键词： DSP1蛋白重组蛋白免疫共沉淀液相色谱-串联质谱法互作蛋白

水稻OsDOF23的结构和功能分析及其结合蛋白的质谱分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2024年第4期43卷 579-592页

作者：彭雪艳沈敏徐道博刘云峰苏元广西大学生命科学与技术学院南宁530004

水稻(Oryza sativa L.)OsDOF23是植物特异性转录因子DOF(DNA binding with one finger)蛋白家族的一员,但其具体的生物学功能和调节机制不明。本研究以OsDOF23为研究对象,预测了OsDOF23蛋白的理化性质和结构特性,分析了OsDOF23基因的组... 详细信息

水稻(Oryza sativa L.)OsDOF23是植物特异性转录因子DOF(DNA binding with one finger)蛋白家族的一员,但其具体的生物学功能和调节机制不明。本研究以OsDOF23为研究对象,预测了OsDOF23蛋白的理化性质和结构特性,分析了OsDOF23基因的组织表达图谱,及其在水稻群体中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)和插入缺失标记(insertion-deletion,InDel)。此外,成功克隆并在大肠杆菌(Escherichia coli)中表达纯化了OsDOF23蛋白的C末端,并以其为抗原制作了OsDOF23的多克隆抗体,用于后续的免疫沉淀实验。经免疫沉淀和液相色谱串联质谱技术检测分析,从水稻总蛋白中得到与OsDOF23共沉淀的蛋白质组信息。经筛选得到37个可能与DOF23互作的蛋白,对这些蛋白进行功能富集分析发现,从生物过程来说,其主要富集于蛋白质代谢和运输功能方面;从分子功能来说,其主要富集于核酸结合活性和转运活性方面。这些结果表明OsDOF23蛋白可能通过与蛋白质代谢、核酸结合和转运等相关功能蛋白互作发挥其生物学功能。

关键词：水稻 DOF蛋白原核表达液相色谱串联质谱

红边龙血树叶绿体基因组特征及其系统发育分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物工程学报 2023年第7期39卷 2926-2938页

作者：王子豪郭佳乐范琪田泽园王雪晴郑维黄罗冬广西大学生命科学与技术学院广西南宁530004

红边龙血树(Dracaena marginata)是一种在全球广泛种植的龙血树属园艺植物,具有较高的观赏价值和药用价值。本研究首次利用高通量测序技术对红边龙血树叶片进行全基因组测序,组装得到完整的叶绿体基因组序列,并进行注释、序列特征比较... 详细信息

红边龙血树(Dracaena marginata)是一种在全球广泛种植的龙血树属园艺植物,具有较高的观赏价值和药用价值。本研究首次利用高通量测序技术对红边龙血树叶片进行全基因组测序,组装得到完整的叶绿体基因组序列,并进行注释、序列特征比较和系统发育分析。结果表明,红边龙血树叶绿体基因组包含一个典型的四分体结构,长度为154926 bp,是目前已报道的龙血树属中叶绿体基因组最小的物种;共拥有132个基因,包含86个编码蛋白基因、38个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因;密码子偏好性分析发现存在偏好使用A/U碱基结尾的现象,整体上密码子偏好性较低;共鉴定出46个简单重复序列位点和54个长重复序列,分别在大单拷贝区与反向重复区有最大检出率;种间边界分析发现边界区域基因存在相对位置差异,扩张收缩情况总体较为相似;与近缘种进行系统发育分析,红边龙血树与细枝龙血树聚为一类,关系最近,符合形态学分类特征。对红边龙血树叶绿体基因组的解析为龙血树属植物的物种鉴定、遗传多样性和叶绿体转基因工程等提供了重要数据基础。

关键词：红边龙血树叶绿体基因组简单重复序列位点分析系统发育比较基因组学分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

花卉植物基因组学研究进展与展望

基因组学与应用生物学 2023年第3期42卷 223-232页

作者：高敏陈玲玲广西大学生命科学与技术学院南宁530004

花卉是园艺植物的重要组成部分,具有丰富的种质资源。随着高通量测序技术的发展,基因组学研究已成为花卉植物的研究热点之一。高质量的基因组序列为研究花卉植物基因组的结构与功能、起源与进化、基因定位和遗传改良等提供了重要的信息... 详细信息

花卉是园艺植物的重要组成部分,具有丰富的种质资源。随着高通量测序技术的发展,基因组学研究已成为花卉植物的研究热点之一。高质量的基因组序列为研究花卉植物基因组的结构与功能、起源与进化、基因定位和遗传改良等提供了重要的信息基础。本综述介绍了蔷薇科(Rosaceae)、菊科(Asteraceae)和兰科(Orchidaceae)等花卉植物基因组研究进展及应用,并对花卉植物基因组的发展前景进行了展望。

关键词：花卉植物高通量测序基因组组装

孜然主要成分枯茗醛对吲哚美辛致胃溃疡大鼠的保护作用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

现代食品科技 2023年第9期39卷 15-22页

作者：邓红雨周慧英康瑞萍艾菲热·阿布都艾尼黄罗冬索菲娅广西大学生命科学与技术学院广西南宁530004 新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046

为探讨孜然活性物质枯茗醛对吲哚美辛胃溃疡模型大鼠的保护作用及机制,该实验设置空白组(CK)、吲哚美辛模型组(Model)、奥美拉唑阳性对照组(Positive)和枯茗醛低(CUM2)、中(CUM4)、高(CUM6)剂量组,每组6只。连续给药7 d后用吲哚美辛构... 详细信息

为探讨孜然活性物质枯茗醛对吲哚美辛胃溃疡模型大鼠的保护作用及机制,该实验设置空白组(CK)、吲哚美辛模型组(Model)、奥美拉唑阳性对照组(Positive)和枯茗醛低(CUM2)、中(CUM4)、高(CUM6)剂量组,每组6只。连续给药7 d后用吲哚美辛构建大鼠胃溃疡模型,观察大鼠胃组织形态、检测胃溃疡指数和胃蛋白酶活性、胃组织抗氧化性能等指标。结果显示,与模型组相比,随枯茗醛剂量增加,大鼠胃组织溃疡条带和出血点逐步减少,整体无水肿、糜烂,腺体排列趋于整齐,炎症细胞浸润减轻;逐步降低溃疡指数和胃蛋白酶活性(P<0.01),增加溃疡抑制率,CUM6溃疡抑制率达到最高(58.48%);不同程度增加胃组织SOD、CAT活性和GSH、NO含量,降低MDA含量(P<0.05或P<0.01);降低血清TNF-α、IL-1β含量及MPO活性,增加IL-10、PGE2含量。综上说明,枯茗醛可显著减少大鼠溃疡面积,降低胃蛋白酶活性,提高抗氧化和抗炎活性,从而增强胃黏膜防御能力,改善胃黏膜的健康状态,降低吲哚美辛对胃组织的伤害,具有作为胃溃疡治疗药物的潜力。

关键词：枯茗醛胃溃疡吲哚美辛抗氧化炎症因子

基于常压室温等离子体诱变技术选育耐高温马克斯克鲁维酵母菌株及其代谢机制解析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

食品与发酵工业 2024年

作者：张名帆张立飞马婷李树波庞宗文广西大学轻工与食品工程学院广西大学生命科学与技术学院

为达到同步糖化发酵(simultaneous saccharification and fermentation，SSF)中菌株高温耐受能力提升的目的，该文以实验室保藏的马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus)GX-UN120为出发菌株，采用常压室温等离子体(atmospheric and room temperature plasma，ARTP)诱变技术，结合高温胁迫筛选获得1株具有较好耐高温能力和产乙醇能力的菌株GX-UN127。结果表明，诱变菌株GX-UN127在48 ℃培养72 h，OD600可达到1.27(原始菌株无法生长)。同时，当以100 g/L麸皮为原料，45 ℃同步糖化发酵12 h，诱变菌株GX-UN127发酵乙醇的产量可达7.6 g/L，较出发菌株提升15.2%。在此基础上，结合生理指标和代谢组学进一步探究诱变菌株耐受高温的生理机制，研究表明半胱氨酸和蛋氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、甘油磷脂代谢等代谢途径与诱变菌株GX-UN127的更强高温耐受性密切相关。此诱变选育耐高温马克斯克鲁维酵母菌株的方案可行，为该类菌株进行同步糖化发酵生产燃料乙醇提供理论支持。

关键词：马克斯克鲁维酵母常压室温等离子体高温胁迫代谢组学同步糖化发酵