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DNA甲基化检测在肺癌早期诊断和预后判断中的应用

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中华检验医学杂志 2024年第4期47卷 371-378页

作者：张鑫雯彭诗璇杨清周佳婷张玄谢子兰龙梦乐文清央贺忆李智吴勇军南华大学衡阳医学院湘潭市第一人民医院研究生协同培养基地衡阳421001 湖南省湘潭市第一人民医院骨科湘潭411100 中南大学湘雅医院临床药理研究所长沙410000 湖南省第二人民医院普通外科长沙410000 湖南省湘潭市第一人民医院病理科湘潭411100

肺癌是癌症死亡的主要类型,大多数肺癌患者在诊断时就已为晚期,预后相当差。虽然低剂量计算机断层扫描已经进入临床作为肺癌筛查的工具,但是其假阳性率超过90%。作为研究热点的表观修饰之一,DNA甲基化在包括癌症在内的多种疾病中起着关... 详细信息

肺癌是癌症死亡的主要类型,大多数肺癌患者在诊断时就已为晚期,预后相当差。虽然低剂量计算机断层扫描已经进入临床作为肺癌筛查的工具,但是其假阳性率超过90%。作为研究热点的表观修饰之一,DNA甲基化在包括癌症在内的多种疾病中起着关键作用。抑癌基因的高甲基化和原癌基因的低甲基化是肿瘤发生发展中的重要事件。因此,DNA甲基化分析可以为肺癌的早筛、诊断、治疗和预后中提供一些有用的信息。尽管组织活检等侵入性方法仍然是肿瘤诊断和监测的金标准,但也存在取样不便等局限性。近年来,液体活检发展迅速,它可以检测原发性或转移性恶性肿瘤,并能反映肿瘤的异质性。此外,它可以微创或无创的形式进行样本收集,年老体弱患者也具有良好的耐受性。本文探讨了一些用于DNA甲基化分析的新兴技术并概述了DNA甲基化在肺癌诊疗中的应用。

关键词： DNA甲基化后成说遗传肺肿瘤液体活检

基于双样本孟德尔随机化分析探索人肠道菌群与增生性瘢痕之间的因果关系

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中华烧伤与创面修复杂志 2024年第4期40卷 333-341页

作者：陈文涛王小祥郑文炼张伟强毛璐佳卓佳楠周思彤杨荣华广东医科大学第一临床医学院湛江524023 中山大学附属第一医院烧伤外科广州510030 韶关市第一人民医院烧伤整形外科韶关512000 广州市第一人民医院烧伤整形美容与创面修复科广州510180 佛山市第一人民医院皮肤科佛山528000

目的探究人肠道菌群与增生性瘢痕(HS)之间的因果关系。方法该研究为基于双样本孟德尔随机化(TSMR)分析的研究。从全基因组关联分析数据库获得人肠道菌群(18473个样本)和HS(208248个样本)的数据。提取已知肠道菌群门、纲、目、科和属5个... 详细信息

目的探究人肠道菌群与增生性瘢痕(HS)之间的因果关系。方法该研究为基于双样本孟德尔随机化(TSMR)分析的研究。从全基因组关联分析数据库获得人肠道菌群(18473个样本)和HS(208248个样本)的数据。提取已知肠道菌群门、纲、目、科和属5个水平的遗传变异基因,即单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量,并进行连锁不平衡(LD)分析。使用PhenoScanner V2数据库进行人类基因型-表型关联分析,排除与HS不相关的肠道菌群SNP并分析获得的SNP是否为弱工具变量。采用TSMR分析的4种方法,即逆方差加权(IVW)、MR-Egger回归、加权中位数和加权模式,对肠道菌群SNP与HS之间的因果关系进行分析。绘制前述4种分析方法得出重要结果的散布图,分析肠道菌群SNP与HS的相关性。采用IVW检验和MR-Egger回归检验评估肠道菌群SNP的异质性,采用MR-Egger回归检验和MR-PRESSO离群值检验评估肠道菌群SNP的水平多效性,采用留一敏感性分析确定HS是否由肠道菌群中的单个SNP引起。对HS SNP与肠杆菌属或HS SNP与瘤胃球菌2属分别进行逆向TSMR分析,检测它们之间是否存在反向因果关系。结果共获得196个已知肠道菌群,属于9门、16纲、20目、32科、119属,从每个菌群中均获得多个SNP作为工具变量。LD分析显示,除rs1000888、rs12566247、rs994794外,其余肠道菌群SNP均符合遗传变异与暴露因素密切相关的假设。人类基因型-表型关联分析显示,经LD分析后获得的SNP均未被排除且均不是弱工具变量。IVW、MR-Egger回归、加权中位数和加权模式的TSMR分析显示,肠杆菌属及瘤胃球菌2属均与HS存在因果关系。其中,IVW和MR-Egger回归的森林图分析还显示,肠杆菌属的16个SNP(该菌属SNP个数下同)和瘤胃球菌2属的15个SNP(该菌属SNP个数下同)均为HS的保护因素。进一步地,IVW分析显示肠杆菌属SNP(比值比为0.62,95%置信区间为0.41~0.93,P0.05)和瘤胃球菌2属SNP(Q值分别为13.67、15.61,P>0.05)均无异质性。MR-Egger回归检验显示,肠杆菌属和瘤胃球菌2属的SNP均无水平多效性(截距分别为0.01、0.06,P>0.05);MR-PRESSO离群值检验显示,肠杆菌属和瘤胃球菌2属的SNP均无水平多效性(P>0.05)。留一敏感性分析显示,无单个肠道菌群SNP驱动HS的发生。逆向TSMR分析显示,HS SNP与肠杆菌属之间、HS SNP与瘤胃球菌2属之间均不存在任何反向因果关系(比值比分别为1.01、0.99,95%置信区间分别为0.97~1.06、0.96~1.04,P>0.05)。结论人肠道菌群与HS之间存在一定因果关系,肠杆菌属及瘤胃球菌2属对抑制HS有一定作用。

关键词：孟德尔随机化分析数据库,遗传学因果律胃肠道微生物组增生性瘢痕

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原发性心脏滑膜肉瘤5例临床病理学分析

中华病理学杂志 2024年第4期53卷 358-363页

作者：刘驯骅刘艳辉李智张明辉南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)病理科广州510080

目的探讨原发性心脏滑膜肉瘤(primary cardiac synovial sarcoma,PCSS)的临床病理学特征、免疫表型、分子改变和鉴别诊断要点。方法收集广东省人民医院2008—2023年诊断的5例PCSS,总结其临床病理学参数,行免疫组织化学染色、荧光原位杂... 详细信息

目的探讨原发性心脏滑膜肉瘤(primary cardiac synovial sarcoma,PCSS)的临床病理学特征、免疫表型、分子改变和鉴别诊断要点。方法收集广东省人民医院2008—2023年诊断的5例PCSS,总结其临床病理学参数,行免疫组织化学染色、荧光原位杂交(FISH)检测和二代测序,并复习相关文献。结果患者中男性4例,女性1例;年龄范围16~51岁(中位年龄30岁);2例位于心包,2例位于右心室,1例位于左心室。4例获得随访资料,4例患者分别于确诊后3、7、13和26个月死亡。肿瘤最大径6.0~14.0 cm(平均10.0 cm)。镜下检查3例为单相型,2例为双相型。免疫组织化学检测显示所有病例均表达上皮细胞膜抗原、波形蛋白、bcl-2和CD56;肿瘤细胞不同程度表达广谱细胞角蛋白、SS18-SSX、SOX2、TLE1、CD99、突触素、Calretinin和Calponin。5例均行FISH检测,结果显示所有病例SS18基因出现断裂易位。二代测序检测显示3例存在SS18-SSX基因融合:1例为SS18-SSX1;2例为SS18-SSX2。结论PCSS是一种极其罕见的心脏恶性肿瘤。在掌握临床病史和组织学特征的基础上,同时结合免疫组织化学和分子检测综合分析,才能作出PCSS的准确诊断。

关键词：心脏肿瘤肉瘤,滑膜免疫组织化学基因融合

个性化3D打印头枕对头颈部肿瘤放疗计划剂量学的影响

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中国医学物理学杂志 2024年第3期41卷 294-298页

作者：潘搌鹏史颂琪李思妹陈小君甘庆权曹小飞广州市第一人民医院南沙肿瘤科广东广州511468 广州市第一人民医院肿瘤科广东广州510180

目的:评估不同材料的3D打印头枕对头颈部肿瘤放疗计划剂量学的影响。通过比较放疗计划靶区剂量、均匀性指数(HI)、适形度指数(CI)、机器跳数(MU)、危及器官剂量等参数的差异,评估3D打印个性化头枕在计划中是否可被忽略。方法:选择10例... 详细信息

目的:评估不同材料的3D打印头枕对头颈部肿瘤放疗计划剂量学的影响。通过比较放疗计划靶区剂量、均匀性指数(HI)、适形度指数(CI)、机器跳数(MU)、危及器官剂量等参数的差异,评估3D打印个性化头枕在计划中是否可被忽略。方法:选择10例头颈部肿瘤患者,包括5例鼻咽癌患者和5例其他头颈部肿瘤患者。使用医科达Monaco计划系统勾画头枕轮廓,并在相同的计算参数下,计算忽略头枕、普通头枕、10%填充的聚乳酸(PLA)和聚氨酯弹性体(TPU)材料3D打印头枕对应的放疗计划。记录靶区剂量、危及器官剂量和MU等结果,并进行统计学分析。结果:在D_(95)、D_(5)、D_(mean)、HI、CI、MU、危及器官剂量(脊髓最大剂量)等参数上,忽略头枕、普通头枕、PLA和TPU材料3D打印头枕4组数据之间均无统计学意义(P>0.05)。在考虑头枕存在的情况下,对于鼻咽癌和其他头颈部肿瘤的分析结果显示,CI有统计学意义(P<0.05)。结论:在计划设计阶段,可以忽略3D打印个性化头枕的存在,但考虑到头枕的存在会降低放疗计划的MU。在考虑头枕的情况下,其他头颈部肿瘤患者的CI平均值显著高于鼻咽癌患者。

关键词： 3D打印头枕头颈部肿瘤剂量学

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四川省绵阳市3例重症恙虫病患者的实验室诊断和临床特征

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中国热带医学 2024年第9期 1074-1079+1111页

作者：何松余程森中朱文鸵李嘉晋绵阳市人民医院绵阳市第一人民医院

目的对四川省绵阳市3例重症恙虫病（scrub typhus）患者的致病原进行分析，了解其临床特征，为该地区恙虫病的防治提供依据。方法在2021年6月至2022年8月期间，收集四川省绵阳市3例重症恙虫病患者的血液标本和临床数据。对患者进行流... 详细信息

目的对四川省绵阳市3例重症恙虫病（scrub typhus）患者的致病原进行分析，了解其临床特征，为该地区恙虫病的防治提供依据。方法在2021年6月至2022年8月期间，收集四川省绵阳市3例重症恙虫病患者的血液标本和临床数据。对患者进行流行病学史的调查，对收集的临床数据进行分析；采集患者入院时的急性期全血、血清和2周后的恢复期血清样本，使用间接免疫荧光法检测血清中的抗体滴度；提取全血样本的总DNA，使用巢式PCR的方法扩增立克次氏体目病原菌的标志性基因，运用最大似然法构建系统进化树，确定该恙虫病东方体（Orientia tsutsugamushi）基因型。结果此3例患者一般的症状与其他感染性发热疾病极其相似，其中2例查体可见明显焦痂，3例均引起肺炎；流行病学调查显示均有野生动物接触史或野外劳作史；恙虫病东方体IgG抗体实验显示患者恢复期血清相较于急性期血清抗体均有4倍及以上升高；PCR扩增获得了TSA56基因序列片段，使用BLASTN在NCBI网站上比对结果显示，这些序列与恙虫病东方体TA763基因型和Karp基因型具有相近的亲缘关系。结果表明此3例重症患者确为恙虫病东方体感染。结论对3例临床诊断的重症恙虫病患者进行了实验室确诊，提供了确切的病原学依据，为绵阳市首次报道病原学确诊的恙虫病病例，并分析其临床特征以及基因型，对该地区该类疾病的早期诊断、鉴别诊断、辅助治疗具有指导意义。

关键词：恙虫病东方体焦痂肺炎病原学诊断重症恙虫病绵阳市

腋窝小切口盲视下皮瓣修剪术联合搔刮术治疗腋臭

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中华整形外科杂志 2024年第5期40卷 530-536页

作者：李习荣王玉龙袁朝永张宏图李岩张志华山东省第一医科大学附属济宁市第一人民医院整形科济宁272000

目的探讨腋窝小切口盲视下腋部皮瓣修剪联合搔刮术治疗腋臭的临床效果。方法从2021年6月至2022年12月济宁市第一人民医院整形科就诊的双侧腋臭患者中选取研究对象,采用左、右侧腋窝自身对照的方法进行研究,两侧术式采用随机数表法分配,... 详细信息

目的探讨腋窝小切口盲视下腋部皮瓣修剪联合搔刮术治疗腋臭的临床效果。方法从2021年6月至2022年12月济宁市第一人民医院整形科就诊的双侧腋臭患者中选取研究对象,采用左、右侧腋窝自身对照的方法进行研究,两侧术式采用随机数表法分配,一侧采用腋窝上下两侧小切口盲视下腋部皮瓣修剪联合搔刮术(A组),一侧采用腋窝中部切口直视下腋部皮瓣修剪术(B组)。A组于腋窝上下两侧设计2条长0.5~1.0 cm切口线,切开皮肤全层并分离,通过2个切口盲视下交叉修剪腋部皮瓣顶泌汗腺和浅层脂肪组织,再用腋臭刮匙紧贴真皮深层刮除残存汗腺,术区留2个引流口,使2根引流条与手术切口贯穿;B组于腋窝中部设计2条长3~4 cm切口线,切开分离后直视下修剪腋部皮瓣顶泌汗腺和浅层脂肪组织,术区留置4根引流条。疗效评估:(1)术后1个月评价近期疗效,包括治愈、显效、无效3个等级;(2)术后6个月统计腋臭复发情况;(3)统计并发症情况。应用SPSS 25.0软件处理数据,2组间有效率、复发率、并发症发生率比较采用χ^(2)检验,P<0.05为差异有统计学意义。结果共纳入62例双侧腋臭患者,其中男38例,女24例,年龄16~35岁。A组治愈55例,显效7例,有效率为100%;术后6个月复发5例,复发率为8.1%;发生皮瓣下血肿1例、皮瓣表皮糜烂2例、瘢痕增生1例,并发症发生率为6.5%;B组治愈58例,显效4例,有效率为100%;术后6个月复发3例,复发率为4.8%;发生皮瓣下血肿4例、皮瓣表皮糜烂4例、皮瓣坏死2例、瘢痕增生4例,并发症发生率为22.6%。A、B 2组治疗有效率(χ^(2)=0.34,P=0.559)、术后复发率(χ^(2)=0.53,P=1.000)比较,差异均无统计学意义;A组并发症发生率明显低于B组(χ^(2)=6.50,P=0.011)。结论腋窝小切口盲视下腋部皮瓣修剪术联合搔刮术治疗腋臭临床效果好,可以达到较高的有效率,且并发症比腋窝中部切口直视下腋部皮瓣修剪术少。

关键词：外科手术腋臭小切口盲视搔刮

Taqi位点多态性与骨密度降低现象相关性的荟萃分析

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中国骨质疏松杂志 2024年第2期30卷 187-191,215页

作者：李自豪盛楠丰攀峰姜嘉伟徐冠华南通市第一人民医院江苏南通226001

目的探讨维生素D受体(Vitamin D receptor,VDR)基因位点Taqi多态性与骨密度(bone mineral density,BMD)的关系。方法通过计算机检索数据库,文献时间为建库至2021年12月31日。由2名不同研究员各自进行文献检索、筛选以及数据的提取。运用... 详细信息

目的探讨维生素D受体(Vitamin D receptor,VDR)基因位点Taqi多态性与骨密度(bone mineral density,BMD)的关系。方法通过计算机检索数据库,文献时间为建库至2021年12月31日。由2名不同研究员各自进行文献检索、筛选以及数据的提取。运用Review Manager 5.3分析软件进行统计学分析,计算OR值和95%置信区间评估Taqi多态性和BMD的关系。结果最终纳入5项符合标准的研究,Meta分析最终结果表明VDR基因位点Taqi多态性与人群骨密度降低的发生风险具有相关性,其等位基因t是骨密度降低发生的危险因素(OR=1.51,95%CI:1.32~1.72)。结论在人群中VDR基因位点Taqi多态性与骨密度降低的发生风险具有相关性,其等位基因t可能是预测人群骨密度降低发生风险的遗传指标。

关键词：维生素D受体基因多态性骨密度 Meta分析

清肺排毒汤对大鼠慢性支气管肺炎气道炎症及免疫功能改善作用机制

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中华中医药学刊 2024年第3期42卷 225-228,I0036页

作者：古欣李嫦红刘燕明肇庆市第一人民医院广东肇庆526040

目的探究清肺排毒汤对慢性支气管肺炎大鼠气道炎症及免疫功能的影响,并分析可能的机制。方法 50只大鼠随机分为对照组、模型组、清肺排毒汤低、高剂量组及阳性对照组,每组10只。其中清肺排毒汤低、高剂量组于模型建立成功后分别给予清... 详细信息

目的探究清肺排毒汤对慢性支气管肺炎大鼠气道炎症及免疫功能的影响,并分析可能的机制。方法 50只大鼠随机分为对照组、模型组、清肺排毒汤低、高剂量组及阳性对照组,每组10只。其中清肺排毒汤低、高剂量组于模型建立成功后分别给予清肺排毒汤0.75、1.50 g·kg^(-1)·d^(-1)灌胃给药(连续4周),阳性对照组同时间给予胸腺肽混悬液灌胃处理,模型组及对照组于同时间分别给予等量生理盐水灌胃处理。酶联免疫吸附(enzyme-linked immunosorbent assay, ELISA)法检测大鼠血清、肺泡灌洗液中白介素-13(interleukin-13,IL-13)、白介素-8(interleukin-8,IL-8)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平;苏木精-伊红(hematoxylin-eosin, HE)染色观察大鼠肺组织病理学变化;测定大鼠脾脏指数、胸腺指数;免疫印迹法检测大鼠肺组织中通路蛋白水平兔抗鼠Toll样受体4(Toll-like receptor4,TLR4)、髓样细胞分化蛋白88(Myeloid differentiation primary response gene 88,MyD88)水平变化。结果慢性支气管肺炎大鼠模型建立成功;与对照组比较,模型组大鼠血清IL-13、IL-8、TNF-α水平及TLR4、MyD88蛋白水平均升高,肺活量(forced vital capacity, FVC)、肺动态顺应性(Dynamic compliance, Cdyn)、血氧饱和度(SaO2)、动脉氧分压(PaO2)水平及脾脏指数、胸腺指数均降低(均P<0.05);与模型组比较,清肺排毒汤低、高剂量组及阳性对照组大鼠血清IL-13、IL-8、TNF-α水平及TLR4、MyD88蛋白水平均降低,FVC、Cdyn、SaO2、PaO2水平及脾脏指数、胸腺指数均升高(均P<0.05);且清肺排毒汤高剂量组、阳性对照组大鼠血清IL-13、IL-8、TNF-α水平及TLR4、MyD88蛋白水平均低于低剂量组,FVC、Cdyn、SaO2、PaO2水平及脾脏指数、胸腺指数均高于低剂量组(均P<0.05)。结论清肺排毒汤对大鼠慢性支气管肺炎气道炎症及免疫功能具有改善作用,可能是通过抑制TLR4/MyD88通路的活化实现的。

关键词：慢性支气管肺炎清肺排毒汤气道炎症免疫功能

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MED15-TFE3易位肾细胞癌1例

临床与实验病理学杂志 2024年第4期40卷 445-446页

作者：李富裕濮晓红史炯徐月梅付尧樊祥山南京大学医学院附属鼓楼医院病理科南京210008 山东省临沂市郯城县第一人民医院病理科临沂276199

患者女性,27岁,体检发现右肾囊性占位2周余。泌尿系统CTU示右肾囊实性占位(图1),Bosniak分级Ⅳ级,囊性肾瘤可能,肾癌不排除;左肾囊肿。肾脏彩超示右肾囊性占位,MRI-肾脏平扫+增强示右肾囊实性占位,考虑肾癌可能。临床以右肾囊性占位入院... 详细信息

患者女性,27岁,体检发现右肾囊性占位2周余。泌尿系统CTU示右肾囊实性占位(图1),Bosniak分级Ⅳ级,囊性肾瘤可能,肾癌不排除;左肾囊肿。肾脏彩超示右肾囊性占位,MRI-肾脏平扫+增强示右肾囊实性占位,考虑肾癌可能。临床以右肾囊性占位入院,临床行腹腔镜下肾部分切除术送检。

关键词：肾肿瘤 TFE3 MED15 病例报道