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昆明市一起聚集性发热疫情中腺病毒3型Penton base、Hexon和Fiber基因遗传进化分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2024年第3期44卷 241-248页

作者：刘艳艳古文鹏段忠文王钰龚娇茶琦雁吴林蔚侯敏昆明市疾病预防控制中心微生物检验科昆明650228 云南省疾病预防控制中心急性传染病防制所昆明650022 昆明市呈贡区疾病预防控制中心检验科昆明650500 玉溪市疾病预防控制中心卫生监测检验科玉溪678400

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton bas... 详细信息

目的对昆明市一起聚集性发热疫情样本进行腺病毒检测和遗传进化分析。方法采集典型发热患者咽拭子标本,使用微流体芯片技术进行30种常见呼吸道传染病病原体核酸检测。对腺病毒核酸阳性标本使用Nanopore三代高通量测序技术进行Penton base、Hexon和Fiber三个重要基因全长序列扩增、测定和分型鉴定,构建系统进化树,开展分子变异、遗传进化等分析。结果共采集5份标本,均检出呼吸道腺病毒及流感嗜血杆菌。对腺病毒进行Nanopore三代基因测序最终均获得Penton base、Hexon和Fiber基因全长编码区核苷酸序列,5份标本之间3个基因核苷酸相似性依次为100.0%、99.9%~100.0%和100.0%,氨基酸同源性均为100.0%;与HAdV3原型株(AY599834)核苷酸相似性最高,分别为98.6%、98.7%和98.9%。系统发育分析表明,3个基因系统进化树分析结果基本一致,人腺病毒3型(HAdV3)原型株单独一支,本研究中HAdV3序列均划分在同一进化分支上,与较早年份国外及中国台湾毒株亲缘关系较远,与近年国内外毒株亲缘关系较近,与2019年日本株(LC703523)和中国广州株(MZ540961)高度同源。与原型株比较分析昆明HAdV3氨基酸突变位点,Penton base有5处变异;Hexon有10处变异;Fiber有11处变异。结论本起疫情中的腺病毒在Penton base、Hexon和Fiber基因全长序列中型别分型结果一致,为P3H3F3型,与包括原型株在内的国内外HAdV3毒株显示出非常小的遗传变异。与原型株相比发生了多处氨基酸位点突变,并且多数氨基酸位点变异发生在蛋白质的高变区或功能区,其中Hexon蛋白中M7L为昆明序列独有氨基酸突变位点。

关键词：人腺病毒3型五邻体基座蛋白六邻体蛋白纤维蛋白遗传进化

2022—2023年深圳污水中诺如病毒的监测分析

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现代预防医学 2024年第13期51卷 2348-2353页

作者：潘荣玲旷翠萍陈仕菊张海龙万佳王礼法黄志刚深圳市罗湖区疾病预防控制中心广东医科大学公共卫生学院深圳市疾病预防控制中心

目的为了探索诺如病毒的分布和时间动态变化特征，初步量化污水中诺如病毒基因I型和II型(GI和GII)RNA浓度，以构建污水中诺如病毒定量检测数据库，为进一步开展基于污水流行病学诺如病毒监测预测人群感染的研究提供基本资料与数据支撑... 详细信息

目的为了探索诺如病毒的分布和时间动态变化特征，初步量化污水中诺如病毒基因I型和II型(GI和GII)RNA浓度，以构建污水中诺如病毒定量检测数据库，为进一步开展基于污水流行病学诺如病毒监测预测人群感染的研究提供基本资料与数据支撑。方法在深圳市设立5个污水采样点，进行为期一年的定性定量监测。从2022年8月—2023年8月，每周规律采样。采用逆转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR)方法，对诺如病毒(GI和GII)进行检测和定性分析；采用圆盘电泳过滤器和聚乙二醇沉淀法，提取核酸；采用定量逆转录-聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-qPCR)进行定量分析。诺如病毒RNA载量进行log10转化，数值归一化处理；率的比较采用χ2检验或Fisher确切概率法；对定量数据（不符合正态分布）比较采用Wilcoxon符号秩和检验。结果在5个污水处理厂采集的260份污水中，诺如病毒GI型、GII型的总检出率分别为88.85%、91.15%，其中，96.5%样品同时检测出GI、GII型。研究期间，诺如病毒在2月和3月达到高峰，GI、GII型最高值达到108.67GC/L和108.06GC/L。诺如病毒在原始废水样品中广泛分布，GI、GII型分别为83.3%～100%和91.6%～100%，其中，诺如病毒GI、GII型RNA载量范围分别为3.8～6.66 log10 GC/L、3.8～7.3 log10 GC/L，均值为106.11GC/L、106.15GC/L。结论通过污水中诺如病毒的监测，证实诺如病毒常年存在，全年四季的病毒浓度差异及其趋势特征符合诺如病毒季节性流行病学特征。探索利用污水流行病学方法来提示诺如病毒在人群中的流行病学特征，是对目前主要基于确诊病例被动监测的重要补充。

关键词：污水诺如病毒定量逆转录聚合酶链反应(q-PCR) 多重实时荧光(RT-PCR) 病毒载量

2023年杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素分布特征及风险评估

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中国公共卫生 2024年第1期40卷 75-81页

作者：洪宇伟李江波姜丽丹刘丹丹王军淋富阳区疾病预防控制中心检验科杭州311400 杭州医学院杭州310053 浙江省疾病预防控制中心杭州310051

目的了解浙江省杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素的分布特征,评估抗生素对生态和人体的健康风险。方法2023年2—3月,在富春江流域19个采样点,采集水样,平行采样各2份,共38份。在某区29个采样点,采集相应的市政自来水厂的出厂水和... 详细信息

目的了解浙江省杭州市某区地表水和城市管网水中抗生素的分布特征,评估抗生素对生态和人体的健康风险。方法2023年2—3月,在富春江流域19个采样点,采集水样,平行采样各2份,共38份。在某区29个采样点,采集相应的市政自来水厂的出厂水和管网末梢水,平行采样各2份,共58份。利用固相萃取-超高效液相色谱串联质谱法(SPE-UPLC-MS/MS)分析杭州某区地表水和城市管网水中6类52种抗生素的浓度水平和分布特征,并采用风险熵值法评估水体中抗生素对生态环境和人体健康的潜在风险。结果在杭州某区地表水中检出25种抗生素,总抗生素浓度水平为ND~463.66 ng/L。在城市管网水中检出6种抗生素分别为磺胺吡啶(检出浓度ND~0.72 ng/L,检出率93.10%)、磺胺氯哒嗪(检出浓度ND~1.16 ng/L,检出率86.21%)、红霉素(检出浓度ND~0.60 ng/L,检出率6.90%)、克拉霉素(检出浓度ND~0.75 ng/L,检出率27.59%)、罗红霉素(检出浓度ND~0.68 ng/L,检出率34.48%)、脱水红霉素(检出浓度ND~0.96 ng/L,检出率86.21%)。生态风险评估表明,杭州市某区地表水中抗生素的生态风险熵值范围为0~10.56。其中磺胺嘧啶、氧氟沙星、红霉素、克拉霉素和脱水红霉素对该流域生态系统具有较高风险,其余抗生素则处于低风险或无风险暴露状态。人体健康风险评估表明,城市管网末梢水中6种抗生素的人体健康风险熵值为4.45×10^(-7)~1.68×10^(-4),均市某区地表水中具有较高风险,对生活在该水域的敏感水生生物存在潜在的生态风险,应予以关注。城市管网末梢水中仅检出痕量抗生素,不会对人体产生健康风险。

关键词：抗生素地表水管网水风险评估杭州市

福建省南部九龙江漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群多样性调查

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中国血吸虫病防治杂志 2024年第1期36卷 44-51页

作者：吴文勇罗鋆黄明松蔡茂荣程由注福建省云霄县疾病预防控制中心福建云霄363300 福建省漳州市疾病预防控制中心福建漳州363000 福建省漳州市龙海区疾病预防控制中心福建省疾病预防控制中心

目的调查福建省南部博平岭山脉九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群分布,为寄生虫病防治研究和寄生虫资源库样本扩充提供基础资料。方法2020年11月—2023年3月,选择福建省漳州市境内九龙江、漳江和东溪流域8个县(区)23个... 详细信息

目的调查福建省南部博平岭山脉九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺及蟹种群分布,为寄生虫病防治研究和寄生虫资源库样本扩充提供基础资料。方法2020年11月—2023年3月,选择福建省漳州市境内九龙江、漳江和东溪流域8个县(区)23个村作为调查点,在每个村居民区附近选择1~3条山涧水沟采集螺、溪蟹标本。根据所采集标本螺壳外部形态特征进行形态学鉴定,并对采集自漳州市云霄县卫氏并殖吸虫病自然疫源地的待定螺种进行线粒体细胞色素氧化酶1(cytochrome oxidase 1,CO1)基因序列分析。观察雄蟹第一腹肢末节形态特征并进行蟹种分类,检测部分调查点螺并殖吸虫尾蚴、蟹并殖吸虫囊蚴感染情况。结果采集自云霄县卫氏并殖吸虫病自然疫源地的待定螺种壳高逾50 mm、壳宽18 mm,壳质厚、坚固,外形呈长塔锥形,有8~10个螺层,经CO1基因序列分析鉴定为海南沟蜷螺。在23个调查点共查见淡水螺6种,隶属3科5属,包括黑贝螺科短沟蜷属放逸短沟蜷、沼蜷属漳州沼蜷、沟蜷属海南沟蜷,盖口螺科拟钉螺亚科拟钉螺属福建拟钉螺和华安拟钉螺,蜷科拟黑螺属瘤拟黑螺。共查见淡水蟹类11种,隶属两科5属,包括溪蟹科华溪属将乐华溪蟹、平和华溪蟹和漳州华溪蟹,华南溪蟹属平肢华南溪蟹和漳州华南溪蟹,南海溪蟹属华安南海溪蟹和龙海南海溪蟹,闽溪蟹属鼻肢闽溪蟹和耳肢闽溪蟹;束腹蟹科束腰蟹属华安束腰蟹和漳浦束腰蟹。漳州市长泰区丹岩村漳州沼蜷和云霄县金坑村海南沟蜷卫氏并殖吸虫尾蚴感染率分别为0.08%(2/2317)和0.09%(1/1039),长泰区丹岩村将乐华溪蟹和云霄县金坑村漳州华溪蟹卫氏并殖吸虫囊蚴感染率分别为25.81%(8/31)和26.31%(5/19)。结论福建省南部九龙江、漳江和东溪流域并殖吸虫中间宿主螺、蟹具有种群多样性,首次证实漳州沼蜷和海南沟蜷可作为卫氏并殖吸虫第一中间宿主。

关键词：并殖吸虫卫氏并殖吸虫中间宿主淡水螺溪蟹种群多样性福建省

2014—2021年云南省水产品病原生物监测结果分析

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中国食品卫生杂志 2024年第1期36卷 49-55页

作者：陈志辉汤晓召杨祖顺杨菁马妮范璐昆明市疾病预防控制中心云南昆明650028 云南省疾病预防控制中心云南昆明650022

目的分析云南省水产品病原生物污染情况,为食源性疾病防控策略提供依据。方法2014—2021年,按年度对云南省16个州市水产品开展随机抽样监测,以统计学方法分析不同病原生物在水产品类型、地区、季节分布上的差异以及可能的污染途径。结果... 详细信息

目的分析云南省水产品病原生物污染情况,为食源性疾病防控策略提供依据。方法2014—2021年,按年度对云南省16个州市水产品开展随机抽样监测,以统计学方法分析不同病原生物在水产品类型、地区、季节分布上的差异以及可能的污染途径。结果在3540份生鲜、冷鲜、冷冻(糜制品)、即食4类水产样品中,检出9种致病菌、1种寄生虫,总检出率为10.8%(383/3540),致病菌中检出较多的为副溶血性弧菌(10.3%,139/1347)、单核细胞增生李斯特菌(4.2%,41/980)、沙门菌(3.3%,32/980);寄生虫中广州管圆线虫在中间宿主中感染较为普遍(9.0%,167/1861),其他病原生物检出率较低。病原生物在不同类型水产品中检出率差异有统计学意义(χ^(2)=34.077,P检验显示,部分病原生物在地区分布、产地及采样场所存在有检出差异;副溶血性弧菌(χ^(2)=15.850,P=0.001)、溶藻弧菌(χ^(2)=8.400,P=0.029)检出率在季度分布上差异有统计学意义。结论云南省水产品病原生物污染较普遍,存在引发食源性疾病的风险。改变饮食习惯、改善水产品储运条件及加强病原生物监测是降低食源性疾病发病率的有效途径。

关键词：水产品病原生物云南省风险监测污染食源性致病菌寄生虫

浙江省≥60岁老年人呼吸道疾病相关疫苗接种现状及相关因素分析

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中华预防医学杂志 2024年第9期58卷 1360-1366页

作者：徐一文丁林玲叶莉霞孙烨祥王一迪王慎玉台州市疾病预防控制中心免疫规划科台州318000 浙江省疾病预防控制中心免疫规划所杭州310000 宁波市疾病预防控制中心免疫规划所宁波315000 宁波市鄞州区疾病预防控制中心免疫规划科宁波315010 浙江省疾病预防控制中心科研信息部杭州310000

了解浙江省≥60岁老年人呼吸道疾病相关疫苗的接种现状,并从服务对象和服务方两个层面分析老年人疫苗接种的相关因素。采用分层随机抽样方法,于2022年9月至2023年1月对浙江省30个乡镇/街道选择≥60岁老年人以及省、市、县/区、乡镇/街道... 详细信息

了解浙江省≥60岁老年人呼吸道疾病相关疫苗的接种现状,并从服务对象和服务方两个层面分析老年人疫苗接种的相关因素。采用分层随机抽样方法,于2022年9月至2023年1月对浙江省30个乡镇/街道选择≥60岁老年人以及省、市、县/区、乡镇/街道4级免疫规划工作人员开展问卷调查,采用logistic回归模型分析浙江省老年人疫苗接种的相关因素。结果显示,浙江省≥60岁老年人流感疫苗和肺炎疫苗系统接种率分别为21.76%和4.57%。多因素分析结果显示,高龄(OR=1.74,95%CI:1.51~1.99)、知晓流感比普通感冒重(OR=1.67,95%CI:1.37~2.04)、听说过流感疫苗(OR=9.78,95%CI:7.03~13.59)是老年人接种流感疫苗的促进因素;高龄(OR=1.71,95%CI:1.43~2.06)、知晓老年人得肺炎后果严重(OR=1.93,95%CI:1.47~2.55)、知晓肺炎疫苗可以预防肺炎(OR=6.36,95%CI:4.84~8.36)是老年人接种肺炎疫苗的促进因素。浙江省免疫规划工作人员认为≥60岁老年人未接种流感疫苗和肺炎疫苗最主要因素是觉得自己不会得病(55.52%和56.35%)、觉得得病不会太严重(47.73%和37.46%)以及对疫苗效果和安全性不信任(38.31%和41.69%)。综上,浙江省≥60岁老年人流感疫苗和肺炎疫苗整体接种率不高,高龄、知晓患呼吸道疾病的严重性以及对呼吸道疾病疫苗的知晓情况是老年人接种流感疫苗和肺炎疫苗的相关因素。

关键词：流感疫苗肺炎疫苗相关因素老年人横断面研究

2017-2021年菏泽市1543例布鲁氏菌病病例的流行病学特征分析

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中华地方病学杂志 2024年第2期43卷 113-117页

作者：刘雅娟付宗坤雷霁山东省菏泽市疾病预防控制中心检验科菏泽274000

目的了解菏泽市布鲁氏菌病(简称布病)疫情分布情况及流行特征,为今后制定防控措施提供依据。方法自中国疾病预防控制信息系统收集2017年1月1日至2021年12月31日菏泽市布病报告数据信息;自各市、县、区疾病预防控制中心收集2017年1月1日... 详细信息

目的了解菏泽市布鲁氏菌病(简称布病)疫情分布情况及流行特征,为今后制定防控措施提供依据。方法自中国疾病预防控制信息系统收集2017年1月1日至2021年12月31日菏泽市布病报告数据信息;自各市、县、区疾病预防控制中心收集2017年1月1日至2021年12月31日菏泽市布病流行病学个案调查表。采用回顾性分析方法,对2017-2021年菏泽市布病病例的三间分布、临床表现及发病前3周内流行病学史进行描述性分析。结果2017-2021年,菏泽市累计报告1543例布病病例,无死亡病例,2018年发病率最高(5.16/10万)。每年3-6月为发病高峰期(759例)。全市各县区均有病例报告,报告病例数较集中的县区分别为牡丹区(386例)、曹县(271例)、郓城县(251例)、单县(138例)和巨野县(132例)。发病年龄最小为11个月、最大为84岁,主要集中在20~69岁(1381例);男女性别比为2.50∶1.00(1102∶441)。农民发病人数最多(1329例)。病例临床表现主要为发热、多汗、乏力、肌肉和关节酸痛。发病前3周内流行病学史调查,与动物有密切接触史的有1124例,其中接触羊的有1044例。结论2017-2021年菏泽市布病发病率呈先升后降趋势,疫情波及全市各县区,以男性中老年发病为主。今后应严把病畜流入关口,加大免疫接种与检疫力度,阻断传播途径。

关键词：布鲁氏菌病流行特征防控措施

2010―2022年广东省肾综合征出血热流行特征及时空聚集性分析

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中华疾病控制杂志 2024年第6期28卷 629-635,663页

作者：韩啸宇谭小华罗傲杨宇威张萌中国疾病预防控制中心中国现场流行病学培训项目北京100050 天津市滨海新区疾病预防控制中心传染病防控科天津300453 广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所广州511430

目的回顾性分析2010—2022年广东省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)流行特征和时空聚集性,为探索HFRS高危地区和制定防控措施提供参考。方法HFRS数据来源于中国疾病预防控制信息系统,运用Joinpoint 4.6.0.... 详细信息

目的回顾性分析2010—2022年广东省肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome,HFRS)流行特征和时空聚集性,为探索HFRS高危地区和制定防控措施提供参考。方法HFRS数据来源于中国疾病预防控制信息系统,运用Joinpoint 4.***.0.0软件对HFRS报告病例数据进行趋势分析,运用GeoDa 1.16软件开展全局和局部空间自相关分析,使用SaTScan 10.1软件进行时空扫描,通过计算对数似然比(log-likelihood ratio,LLR)分析HFRS时空聚集性。结果2010—2022年广东省累计报告HFRS病例4322例,年均发病率为0.31/10万,利用平均年度变化百分比(average annual percent change,AAPC)来评价整体趋势性变化,发病率整体呈下降趋势(AAPC=-8.4%,95%CI:-12.6%~-3.9%)。3—4月为HFRS高发月份(RR=1.61,LLR=82.78,P=0.001)。珠三角地区、男性、30~69岁人群发病率最高。职业以家务及待业(973例,占22.51%)、商业服务(726例,占16.80%)、工人(645例,占14.92%)和农民(638例,占14.76%)居多。HFRS发病存在空间聚集性,“高-高”聚集区主要分布在珠三角地区的广州市和佛山市。时空扫描分析结果显示,1个一类聚集区位于广州市、佛山市的9个县(区),发生在2013年2—3月;2个二类聚集区主要涉及珠三角地区的7个地级市和粤西地区的阳江市的25个县(区),发生在2015年1—2月和2017年5—6月。每年的聚集区均出现在珠三角地区,不同年份涉及的地级市和县(区)有所不同,主要集中在广州市、佛山市,主要发生在冬春季,少数年份在夏季初。结论2010—2022年广东省HFRS发病率呈下降趋势,发病存在季节性和空间聚集性,冬春季为高发季节,珠三角地区为高发区域,中老年为主要高发人群。

关键词：肾综合征出血热空间自相关时空聚集性

2023年江苏省苏中地区男男性行为者猴痘知识知晓率现状及影响因素分析

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现代预防医学 2024年第16期51卷 3016-3021页

作者：李锦成许纯杨文彬姜艳戴翔王正光杨开玺扬州市疾病预防控制中心江都区疾病预防控制中心高邮市疾病预防控制中心泰州市疾病预防控制中心

目的了解2023年江苏省苏中地区男男性行为者（Men who have sex with men, MSM）猴痘知识知晓情况，为制定该人群猴痘防治措施提供依据。方法利用江苏省疾控中心设计的猴痘调查表，对苏中地区艾滋病自愿咨询检测（HIV Voluntary Couns... 详细信息

目的了解2023年江苏省苏中地区男男性行为者（Men who have sex with men, MSM）猴痘知识知晓情况，为制定该人群猴痘防治措施提供依据。方法利用江苏省疾控中心设计的猴痘调查表，对苏中地区艾滋病自愿咨询检测（HIV Voluntary Counseling&Testing, VCT）门诊和社会组织MSM进行问卷调查，采用单因素和多因素logistic回归分析影响猴痘知识知晓率的因素。采用χ2检验比较不同特征人群对猴痘关注程度的差异。结果本次调查共回收有效问卷1 290份。年龄以26～50岁为主，占比65.04%（839/1 290）;文化程度以大学专科、本科及以上为主，占比64.26%（829/1 290）。猴痘知识知晓率26.12%,完全知晓率15.27%。多因素logistic回归分析结果显示：猴痘知晓率较高的相关因素包括地区为泰州市（OR=6.710,95%CI:4.309～10.447）,文化程度为高中/中专/技校（OR=2.461,95%CI:1.270～4.769）、大学专科（OR=2.515,95%CI:1.311～4.825）、本科及以上（OR=2.253,95%CI:1.184～4.288）,对于猴痘疫情及相关情况比较关注（OR=1.684,95%CI:1.188～2.387）(均P预防措施和传播途径正确率分别为30.78%、42.25%和27.75%。1 186人（91.94%）从微信、微博等网络新媒体关注猴痘的疫情和防治知识。不同地区（χ2=65.348,P预防控制措施正确率均偏低，所以后期需要在微信、微博、抖音、百度等新媒体采用投放广告、信息推送等形式开展猴痘症状和传播途径等知识的宣传。

关键词：猴痘知晓率影响因素