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不同品种鸡腹脂游离脂肪酸差异比较及转录组分析

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中国家禽 2025年第2期47卷 1-11页

作者：赵国玺符蓉李秋梅邹佳佳雷芷琳张细权华南农业大学动物科学学院广东广州510642 农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室广东广州510642

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因,试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象,测定其游离脂肪酸的组成及含量,并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示:胡须鸡腹脂中... 详细信息

为挖掘鸡腹脂中游离脂肪酸的候选基因,试验以上市日龄的杏花鸡、沙栏鸡、清远麻鸡、胡须鸡、怀乡鸡、文昌鸡和固始鸡为研究对象,测定其游离脂肪酸的组成及含量,并选取游离脂肪酸差异较大的鸡进行转录组测序分析。结果显示:胡须鸡腹脂中的C18∶1n9c、C16∶0和C18∶0显著高于其它6个品种鸡(P<0.05);清远麻鸡腹脂中的C18∶2n6c显著高于其它6个品种鸡(P<0.05);沙栏鸡腹脂中的C16∶1n7显著高于固始鸡、杏花鸡和清远麻鸡(P<0.05)。此外,杏花鸡腹脂中的C20∶4n6不仅显著高于固始鸡、怀乡鸡、文昌鸡、沙栏鸡(P<0.05),且杏花鸡腹脂中的C20∶4n6与固始鸡差异最大,C18∶3n3与固始鸡差异倍数也较大(P<0.05),其差异游离脂肪酸与差异基因显著富集在α-亚麻酸代谢等通路中(P<0.05)。ABHD3、PINK1、ACOX1、OSBPL2、GPD2、STAU1、ALDH2、CIDEA、TLCD1、IGFBP2、IRS2基因的下调与C18∶3n3/C20∶4n6的含量极显著负相关(P<0.01)。结果表明,不同品种鸡腹脂中主要的脂肪酸含量存在差异,通过对固始鸡与杏花鸡进行代谢组与转录组联合分析,在腹脂中发现11个与风味有关的C20∶4n6和C18∶3n3的形成有关基因,为后续研究与风味有关的游离脂肪酸提供理论依据。

关键词：鸡腹脂游离脂肪酸风味候选基因

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花生种子不同发育阶段的转录因子调控网络鉴定

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中国油料作物学报 2025年

作者：孙志辉鲁清李海芬黄璐李少雄陈小平王润风余倩霞徐杨玉洪彦彬王键宽汪文毅刘浩广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室广东省农垦南亚热带作物科技中心广东兆华航天育种创新研究院华南农业大学农学院

为了对花生种子发育过程中的转录因子调控网络进行全面解析，本研究首先对花生果针入土后3个不同发育时期（5 d、25 d、45 d）的种子与荚果进行表型数据测定。随后利用转录组测序进行基因表达量分析，共检测到71 044个基因，其中5198个... 详细信息

为了对花生种子发育过程中的转录因子调控网络进行全面解析，本研究首先对花生果针入土后3个不同发育时期（5 d、25 d、45 d）的种子与荚果进行表型数据测定。随后利用转录组测序进行基因表达量分析，共检测到71 044个基因，其中5198个为新鉴定的转录本。本研究分别于3个不同发育时期鉴定到5159(25vs5)、7714(45vs5)、1712(45vs25)个差异表达基因。差异基因参与的生物学代谢通路富集分析表明，果针入土后25 d的花生种子涉及的代谢通路最多，而果针入土后45 d的花生种子中代谢通路减少，油脂合成占主导地位。此外，基于差异基因谱共筛选出544个转录因子，并以此构建了转录调控网络，结果表明这些转录调控网络主要涉及植物激素信号转导、昼夜节律调控、MAPK信号途径等种子发育相关的重要途径。进一步的研究表明，18个转录因子在种子内特异高表达，且与种子油脂积累相关的转录因子家族ABI、NFYB与WRI的基因表达趋势与种子发育速率呈正相关性，并用qPCR进行验证。本研究基于3个不同发育时期的转录组测序数据构建了花生种子基因表达谱与转录因子互作网络，为探究花生种子发育的分子调控机制提供了参考。

关键词：花生种子发育时期转录组测序转录因子

小麦穗部性状近等基因系的创制及穗粒数候选基因分析

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植物遗传资源学报 2025年

作者：陈旺王殿宋波刘易科朱展望卫波宁强青岛农业大学农学院湖北省农业科学院粮食作物研究所/农业农村部作物分子育种重点实验室/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室北京大学现代农业研究院/小麦育种全国重点实验室/潍坊现代农业山东省实验室

为创制具有育种利用价值的遗传材料，定位影响小麦穗粒数的候选区间，本研究以八倍体小偃麦与普通小麦品种衡观35和科农199杂交构建的近等基因系作为研究材料，对株高、有效分蘖数、穗长、小穗数、每穗粒数、单株产量、千粒重7个性状进... 详细信息

为创制具有育种利用价值的遗传材料，定位影响小麦穗粒数的候选区间，本研究以八倍体小偃麦与普通小麦品种衡观35和科农199杂交构建的近等基因系作为研究材料，对株高、有效分蘖数、穗长、小穗数、每穗粒数、单株产量、千粒重7个性状进行表型鉴定。利用660K SNP芯片对表型差异显著的近等基因系进行全基因组扫描，分析两对近等基因系间的多态性SNPs位点及一致性的物理区间。结合候选区间的基因功能注释和基因表达分析，预测影响小麦穗粒数的重要候选基因。结果表明，N81和N82、N86和N87是两对在小麦穗部性状具有显著差异的近等基因系，其遗传相似度分别为98.02%和98.78%。通过660K SNP芯片分析，确定两对近等基因系分别在1B染色体上662-669 Mb、3B染色体上19-25 Mb和5B染色体上541-548 Mb的物理区间存在明显的遗传多态性，表明这些物理区间可能作为影响小麦穗部相关性状的候选区间。通过整合前人研究的QTL定位区间、基因功能注释、基因表达分析和同源基因功能分析，筛选出3个可能影响小麦穗粒数的重要候选基因，分别是：1B染色体上TraesCS1B02G443200，编码苹果酸脱氢酶；3B染色体上TraesCS3B02G042400，编码AP2/ERF转录因子；5B染色体上TraesCS5B02G366500，编码C2H2类型的锌指蛋白。本研究结果为挖掘小麦穗粒数基因提供理论参考。

关键词：小麦 660K SNP芯片近等基因系穗部相关性状候选基因

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甘蔗近缘野生种蔗茅的研究进展和利用潜力

植物遗传资源学报 2025年

作者：钱禛锋赵昌祖万慧兰何丽莲王先宏李富生云南农业大学农学与生物技术学院云南农业大学甘蔗研究所云南省作物生产与智慧农业重点实验室

现代甘蔗栽培品种主要是甘蔗属里2-5个甘蔗原种的少数无性系的杂交后代，遗传背景狭窄，血缘相近，致使近30年来甘蔗品种的产量、糖分和抗性等方面一直难有较大突破。充分利用甘蔗近缘野生种，是拓宽甘蔗遗传背景和加速甘蔗高贵化育种... 详细信息

现代甘蔗栽培品种主要是甘蔗属里2-5个甘蔗原种的少数无性系的杂交后代，遗传背景狭窄，血缘相近，致使近30年来甘蔗品种的产量、糖分和抗性等方面一直难有较大突破。充分利用甘蔗近缘野生种，是拓宽甘蔗遗传背景和加速甘蔗高贵化育种的重要基础。蔗茅属于甘蔗的近缘野生种，是甘蔗育种的重要野生种质，也是甘蔗属复合体基因组演化和功能基因解析的重要资源。自20世纪80年代以来，蔗茅种质资源的采集和研究，以及甘蔗与蔗茅的属间远缘杂交和抗旱耐冷甘蔗新品种培育取得重要进展。另外，蔗茅的许多优异性状，包括高糖、耐冷和抗旱等的生理及分子响应机制也逐渐被解析。为更好探索蔗茅优异性状的分子基础及其在甘蔗育种中的应用价值，本文系统综述蔗茅的研究进展和利用现状，分析蔗茅的遗传多样性和基因组演化特性，解析蔗茅中蔗糖合成和转运的主要通路及其关键基因的转录模式，并进一步提出蔗茅作为模式植物和生物燃料植物的应用潜力；同时，分析了蔗茅对低温和干旱胁迫的分子响应特征，讨论了蔗茅在甘蔗育种研究和利用中存在的问题，展望了未来发展方向。

关键词：甘蔗蔗茅种质创新遗传多样性高糖育种抗逆性

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中国蚁巢伞类真菌的分类修订

菌物研究 2025年

作者：杨坤龙林嘉莹李光梅李晓艳刘振超华南农业大学林学与风景园林学院华南农业大学植物保护学院中国科学院昆明植物研究所云南省真菌多样性与绿色发展重点实验室广州粤华物业有限公司

对收集自中国蚁巢伞类真菌主产地的野外或市场上的108份有关标本进行了形态学和分子系统学研究，共鉴定出2属、8种，含1新属、3新种和1个中国新记录种。结合标本研究和文献记载，中国已知的蚁巢伞类真菌更新为3属13种，含金龟伞属Scarab... 详细信息

对收集自中国蚁巢伞类真菌主产地的野外或市场上的108份有关标本进行了形态学和分子系统学研究，共鉴定出2属、8种，含1新属、3新种和1个中国新记录种。结合标本研究和文献记载，中国已知的蚁巢伞类真菌更新为3属13种，含金龟伞属Scarabaeocybe 1种（金龟伞S. cordycipitoides）、灰顶伞属Tephrocybe 1种（灰顶伞Tp. rancida）及蚁巢伞属Termitomyces 11种（白柄蚁巢伞Tr. albiceps、菠萝山蚁巢伞Tr. boluoshanensis、球根蚁巢伞Tr. bulborhizus、柱状蚁巢伞Tr. cylindricus、黄皮蚁巢伞Tr. flavus、脆蚁巢伞Tr. fragilis、海姆蚁巢伞Tr. heimii、红皮蚁巢伞Tr. hongpijizong、间型蚁巢伞Tr. intermedius、乳突蚁巢伞Tr. mammiformis和叉囊蚁巢伞Tr. upsilocystidiatus）。基于现有证据，过去在中国报道的10个蚁巢伞属物种，即金黄蚁巢伞Tr. aurantiacus、盾尖蚁巢伞Tr. clypeatus、类粉褶蕈蚁巢伞Tr. entolomoides、真根蚁巢伞Tr. eurrhizus、球形蚁巢伞Tr. globulus、小果蚁巢伞Tr. microcarpus、条纹蚁巢伞Tr. striatus、环纹盖蚁巢伞Tr. tigrinus、端圆蚁巢伞Tr. tylerianus和云南蚁巢伞Tr. yunnanensis，应为上述11种的误定或晚出异名。

关键词：蚁巢伞属金龟伞属系统发育系统学新属新种异名

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玉米START基因家族的鉴定及表达分析

分子植物育种 2025年

作者：常红娟刘霞刘彤彤王凤茹河北农业大学生命科学学院河北省植物生理和分子病理学重点实验室

为明确START结构域在调控玉米生长发育中的功能，本研究以玉米START基因家族为研究对象，对其进行了系统进化、理化性质、启动子元件预测等生物信息学分析，通过qPCR分析了Zm PH-START1基因对BR和ABA相关基因表达量的影响。结果表明，玉... 详细信息

为明确START结构域在调控玉米生长发育中的功能，本研究以玉米START基因家族为研究对象，对其进行了系统进化、理化性质、启动子元件预测等生物信息学分析，通过qPCR分析了Zm PH-START1基因对BR和ABA相关基因表达量的影响。结果表明，玉米START基因家族有33个成员，依据结构域的不同可以分为四个亚家族：第一类亚家族序列中仅含有START结构域，第二类亚家族序列中含有PH、START及DUF1336结构域，第三类亚家族含有START、HD-Zip(HOX-BRLZ)及MEKHLA结构域，第四类亚家族含有START及HD-Zip(HOX-BRLZ)结构域。除Zm PH-START1和仅含START结构域亚家族成员为碱性外，其余均呈酸性，对其启动子元件预测分析显示存在多种与激素响应和胁迫响应相关的顺式作用元件，qPCR结果显示Zm PH-START1基因影响着BR和ABA相关基因的表达水平，推测该基因家族易受到激素信号的调控对植物生长发育起作用，本研究为开展玉米START基因家族对玉米生长发育的功能和作用机制研究提供了参考。

关键词：玉米 START结构域生长发育生物信息学分析

水稻γ-氨基丁酸合成关键基因OsGADs响应砷毒害分析

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分子植物育种 2025年

作者：柴梦莹张艳丽陈萱唐海洋徐志鹏周慧曾凡荣陈光覃元邓锋林长江大学农学院涝渍灾害与湿地农业湖北省重点实验室农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建) 浙江省农业科学院数字农业研究所湖北洪山实验室

γ-氨基丁酸(GABA)是动植物中广泛存在的一种天然的非蛋白氨基酸。在植物中，GABA作为一种代谢物或信号分子在各种非生物胁迫响应过程中发挥重要作用。本研究发现，外源添加GABA能够显著缓解五价砷[As(V)]对水稻根系伸长的抑制作用，而... 详细信息

γ-氨基丁酸(GABA)是动植物中广泛存在的一种天然的非蛋白氨基酸。在植物中，GABA作为一种代谢物或信号分子在各种非生物胁迫响应过程中发挥重要作用。本研究发现，外源添加GABA能够显著缓解五价砷[As(V)]对水稻根系伸长的抑制作用，而三价砷[As(III)]对水稻根系伸长的抑制作用不明显，为了进一步阐明GABA在砷解毒过程中的作用机制，选择水稻内源GABA合成的关键酶谷氨酸脱羧酶(GAD)进行后续相关分析。从粳稻日本晴基因组中鉴定到5个谷氨酸脱羧酶(GAD)编码基因，即OsGAD1～OsGAD4和OsGDCi。转录组分析表明OsGAD1、OsGAD3和OsGDCi在根系中有较高丰度的表达，且其在根系中的表达受As(III)和As(V)诱导。在此基础上，通过Transgene Killer CRISPR基因编辑系统分别获得了OsGAD1、OsGAD3和OsGDCi的基因敲除纯合突变体株系各3个，还筛选到了3个纯合双突变体osgad3/osgdci和3个三突变体osgad1/osgad3/osgdci。通过比较2个OsGAD1突变体(osgad1-1， osgad1-2)与野生型在As(V)和GABA处理下的种子根伸长情况，发现敲除OsGAD1不会影响As(V)对的水稻根系的毒害作用，但OsGAD1的功能丧失抑制了外源GABA对As(V)毒害的缓解作用。总的来说，本研究发现GABA可有效缓解As(V)对植物的毒害作用，GABA合成关键酶GAD可能参与了内源与外源GABA协同缓解As(V)毒害的生理过程。

关键词： γ-氨基丁酸氨酸脱羧酶基因敲除根伸长砷

多铜氧化酶和3-磷酸甘油醛脱氢酶基因强化表达对植物乳杆菌降解组胺的影响

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食品与发酵工业 2025年第2期51卷 25-34页

作者：杜晓仪徐玉娟吴继军余元善彭健杨继国李璐华南理工大学食品科学与工程学院广东广州510641 广东省农业科学院蚕业与农产品加工研究所农业农村部功能食品重点实验室广东省农产品加工重点实验室广东广州510610 岭南现代农业科学与技术广东省实验室河源分中心广东河源517000

植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)是降解发酵食品组胺的常见菌株之一,但其降解组胺的关键基因尚未明晰,阻碍组胺降解***的分子育种。为揭示***降解组胺的关键基因,该研究从发酵蔬菜中筛选出一株具有组胺降解能力的***,对其进... 详细信息

植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)是降解发酵食品组胺的常见菌株之一,但其降解组胺的关键基因尚未明晰,阻碍组胺降解***的分子育种。为揭示***降解组胺的关键基因,该研究从发酵蔬菜中筛选出一株具有组胺降解能力的***,对其进行菌株特性和全基因组分析,并通过强化表达挖掘***降解组胺的关键基因。结果表明,筛选菌株对组胺的降解率在48 h达到最高(20.16%)。形态学和分子生物学鉴定结果表明该菌株为***,命名为*** CY087。该菌株对高组胺环境具有较好的耐受性,而对低酸、高盐环境的耐受性较差。多铜氧化酶基因(mcO)和3-磷酸甘油醛脱氢酶基因(gapdH)在*** CY087中的强化表达均能提高其组胺降解率。与菌株CY087-36e相比,CY087-gapdH与CY087-mcO的组胺降解率分别提高了31.94%和16.14%,说明gapdH基因在*** CY087降解组胺的过程中发挥了较为关键的作用。研究为组胺降解***的分子改造提供潜在靶点。

关键词：菌株筛选植物乳杆菌组胺降解强化表达

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苗草专用型大麦品种鉴定及全基因组关联分析

作物学报 2025年第1期51卷 91-102页

作者：马敏虎常华瑜陈朝燕仁增刘廷辉邢国芳郭刚刚山西农业大学农学院/杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室山西晋中030801 中国农业科学院作物科学研究所/农业农村部粮食作物基因资源评价利用重点实验室/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程北京100081 甘孜藏族自治州农业科学研究所四川甘孜626000

苗草工厂为实现草食动物的饲草周年供应提供了新的解决方案。针对苗草生产的品种需求,本研究对124份中国大麦育成品种(系)与种质开展了苗草转化率鉴定和生物量调控位点发掘。结果显示,大麦种子萌动后,水培条件下苗草生物量呈指数增长趋... 详细信息

苗草工厂为实现草食动物的饲草周年供应提供了新的解决方案。针对苗草生产的品种需求,本研究对124份中国大麦育成品种(系)与种质开展了苗草转化率鉴定和生物量调控位点发掘。结果显示,大麦种子萌动后,水培条件下苗草生物量呈指数增长趋势并在7 d后进入平台期。在植物工厂条件下,鉴定出冬青16、扎青6号等10个高苗草转化率品种且分析发现苗草生物量与籽粒千粒重呈一定的负相关。进一步通过全基因组关联分析,共鉴定到12个苗草生物量相关QTL位点,从中预测出8个调控苗草生物量的候选基因。本研究不仅为大麦苗草工厂化生产筛选出高转化率品种,同时也为苗草专用型大麦品种的遗传改良奠定了基础。

关键词：大麦苗草生物量调控位点全基因组关联分析

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